logo

Genes within 1Mb (chr1:62883365:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -710046 sc-eQTL 6.49e-01 0.0492 0.108 0.126 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -484210 sc-eQTL 1.58e-01 -0.158 0.111 0.126 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 194979 sc-eQTL 6.71e-01 0.0476 0.112 0.126 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 99233 sc-eQTL 4.07e-01 0.0646 0.0777 0.126 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -710356 sc-eQTL 2.05e-01 -0.157 0.123 0.126 B L1
ENSG00000162607 USP1 447068 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0728 0.107 0.126 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -640007 sc-eQTL 3.78e-01 -0.112 0.127 0.126 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -710046 sc-eQTL 3.97e-01 0.0784 0.0925 0.126 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -484210 sc-eQTL 3.82e-03 -0.293 0.1 0.126 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 194979 sc-eQTL 9.45e-01 0.00716 0.103 0.126 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 99233 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0537 0.0835 0.126 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -710356 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0215 0.119 0.126 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 447068 sc-eQTL 2.27e-01 -0.0979 0.0808 0.126 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -640007 sc-eQTL 7.41e-01 0.0353 0.106 0.126 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -710046 sc-eQTL 1.70e-01 -0.14 0.102 0.126 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -484210 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00565 0.112 0.126 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 194979 sc-eQTL 1.83e-01 -0.151 0.113 0.126 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 99233 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0775 0.108 0.126 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -710356 sc-eQTL 2.46e-01 -0.14 0.121 0.126 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 447068 sc-eQTL 1.50e-01 0.135 0.0938 0.126 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -640007 sc-eQTL 2.03e-01 -0.153 0.12 0.126 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -710046 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0898 0.119 0.122 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -484210 sc-eQTL 2.51e-01 -0.141 0.122 0.122 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 194979 sc-eQTL 8.62e-01 0.0219 0.126 0.122 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 99233 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0802 0.0981 0.122 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -710356 sc-eQTL 4.73e-01 0.0986 0.137 0.122 DC L1
ENSG00000162607 USP1 447068 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0956 0.12 0.122 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -640007 sc-eQTL 6.12e-01 0.0607 0.119 0.122 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -710046 sc-eQTL 1.76e-02 -0.259 0.108 0.126 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -484210 sc-eQTL 1.61e-03 -0.358 0.112 0.126 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 194979 sc-eQTL 2.54e-01 -0.126 0.111 0.126 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 99233 sc-eQTL 9.36e-01 0.006 0.0749 0.126 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -710356 sc-eQTL 9.79e-01 0.00318 0.118 0.126 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 447068 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00923 0.0973 0.126 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 688516 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00626 0.0908 0.126 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -710046 sc-eQTL 3.30e-01 0.095 0.0974 0.122 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -484210 sc-eQTL 6.28e-01 0.0554 0.114 0.122 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 194979 sc-eQTL 3.38e-02 -0.199 0.0932 0.122 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 99233 sc-eQTL 5.51e-01 0.0603 0.101 0.122 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -710356 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0427 0.126 0.122 NK L1
ENSG00000162607 USP1 447068 sc-eQTL 7.46e-02 -0.2 0.112 0.122 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -640007 sc-eQTL 1.73e-01 -0.186 0.136 0.122 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -710046 sc-eQTL 3.04e-01 -0.11 0.107 0.126 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -484210 sc-eQTL 2.73e-01 0.118 0.107 0.126 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 194979 sc-eQTL 3.38e-01 0.105 0.109 0.126 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 99233 sc-eQTL 5.49e-01 0.0569 0.0947 0.126 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -710356 sc-eQTL 1.04e-01 -0.136 0.0836 0.126 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 447068 sc-eQTL 1.90e-01 0.0955 0.0726 0.126 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -640007 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0673 0.13 0.126 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -710046 sc-eQTL 4.43e-01 0.115 0.149 0.12 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -484210 sc-eQTL 9.42e-01 0.0105 0.143 0.12 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 194979 sc-eQTL 6.45e-02 -0.246 0.132 0.12 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 99233 sc-eQTL 2.61e-01 -0.157 0.14 0.12 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -710356 sc-eQTL 2.99e-01 -0.142 0.137 0.12 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 447068 sc-eQTL 1.63e-01 -0.207 0.148 0.12 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -640007 sc-eQTL 7.52e-01 0.0411 0.13 0.12 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -710046 sc-eQTL 3.51e-01 -0.125 0.133 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -484210 sc-eQTL 6.12e-01 -0.069 0.136 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 194979 sc-eQTL 5.03e-01 -0.087 0.13 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 99233 sc-eQTL 4.17e-01 0.0892 0.11 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -710356 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0228 0.131 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 447068 sc-eQTL 9.94e-01 0.00101 0.131 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -640007 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0479 0.13 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -710046 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00557 0.128 0.127 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -484210 sc-eQTL 4.09e-02 -0.264 0.128 0.127 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 194979 sc-eQTL 6.13e-01 0.0615 0.122 0.127 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 99233 sc-eQTL 7.83e-01 0.0319 0.116 0.127 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -710356 sc-eQTL 5.40e-01 0.0811 0.132 0.127 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 447068 sc-eQTL 8.34e-01 -0.028 0.134 0.127 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -640007 sc-eQTL 8.66e-01 0.0221 0.131 0.127 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -710046 sc-eQTL 9.00e-01 0.0162 0.129 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -484210 sc-eQTL 8.45e-02 -0.223 0.128 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 194979 sc-eQTL 3.60e-01 0.113 0.124 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 99233 sc-eQTL 1.24e-01 0.147 0.0949 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -710356 sc-eQTL 3.14e-01 -0.127 0.126 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 447068 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0987 0.111 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -640007 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00367 0.135 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -710046 sc-eQTL 5.78e-01 0.0709 0.127 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -484210 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00878 0.133 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 194979 sc-eQTL 6.51e-01 0.0578 0.128 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 99233 sc-eQTL 3.91e-01 -0.105 0.123 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -710356 sc-eQTL 9.93e-01 0.00115 0.133 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 447068 sc-eQTL 4.42e-01 0.0975 0.127 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -640007 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0138 0.133 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -710046 sc-eQTL 3.53e-01 0.126 0.136 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -484210 sc-eQTL 4.22e-01 -0.115 0.143 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 194979 sc-eQTL 4.70e-02 0.249 0.124 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 99233 sc-eQTL 5.15e-01 0.0847 0.13 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -710356 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0583 0.139 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 447068 sc-eQTL 1.31e-01 0.199 0.131 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -640007 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0258 0.132 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -710046 sc-eQTL 6.11e-01 0.0531 0.104 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -484210 sc-eQTL 3.83e-02 -0.233 0.112 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 194979 sc-eQTL 9.68e-01 0.00446 0.111 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 99233 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0503 0.0982 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -710356 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0336 0.12 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 447068 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0736 0.0916 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -640007 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00572 0.119 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -710046 sc-eQTL 2.82e-01 0.117 0.108 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -484210 sc-eQTL 1.14e-02 -0.317 0.124 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 194979 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0594 0.112 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 99233 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0844 0.109 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -710356 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0125 0.128 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 447068 sc-eQTL 2.33e-01 -0.126 0.105 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -640007 sc-eQTL 5.05e-01 0.0829 0.124 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -710046 sc-eQTL 4.86e-01 0.0894 0.128 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -484210 sc-eQTL 2.42e-01 -0.151 0.128 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 194979 sc-eQTL 6.97e-01 -0.049 0.125 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 99233 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0377 0.122 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -710356 sc-eQTL 4.23e-01 -0.101 0.126 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 447068 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0385 0.119 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -640007 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0297 0.13 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -710046 sc-eQTL 4.10e-01 -0.096 0.116 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -484210 sc-eQTL 5.19e-01 0.08 0.124 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 194979 sc-eQTL 3.73e-01 -0.105 0.117 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 99233 sc-eQTL 1.07e-01 -0.202 0.124 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -710356 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0757 0.13 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 447068 sc-eQTL 7.31e-01 0.0401 0.117 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -640007 sc-eQTL 3.75e-01 -0.118 0.133 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -710046 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0554 0.121 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -484210 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0858 0.125 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 194979 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0607 0.129 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 99233 sc-eQTL 9.31e-01 0.0108 0.124 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -710356 sc-eQTL 1.70e-01 -0.172 0.125 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 447068 sc-eQTL 3.40e-01 0.101 0.106 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -640007 sc-eQTL 9.84e-01 0.00243 0.118 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -710046 sc-eQTL 2.26e-02 -0.309 0.134 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -484210 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0383 0.138 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 194979 sc-eQTL 3.81e-01 0.118 0.134 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 99233 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0193 0.138 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -710356 sc-eQTL 3.10e-01 -0.136 0.133 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 447068 sc-eQTL 5.50e-01 0.077 0.129 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -640007 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0175 0.136 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -710046 sc-eQTL 6.45e-01 0.0619 0.134 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -484210 sc-eQTL 5.89e-01 0.0728 0.135 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 194979 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00444 0.131 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 99233 sc-eQTL 5.26e-01 0.0797 0.125 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -710356 sc-eQTL 8.97e-01 0.0177 0.136 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 447068 sc-eQTL 7.51e-01 0.0411 0.13 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -640007 sc-eQTL 4.31e-02 -0.265 0.13 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -710046 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0961 0.126 0.126 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -484210 sc-eQTL 2.12e-01 0.156 0.125 0.126 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 194979 sc-eQTL 7.11e-02 0.216 0.119 0.126 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 99233 sc-eQTL 2.74e-01 0.139 0.126 0.126 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -710356 sc-eQTL 1.48e-01 -0.183 0.126 0.126 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 447068 sc-eQTL 3.41e-01 -0.12 0.126 0.126 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -640007 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0156 0.131 0.126 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -710046 sc-eQTL 3.51e-01 -0.12 0.128 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -484210 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0261 0.132 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 194979 sc-eQTL 1.80e-02 -0.269 0.113 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 99233 sc-eQTL 1.20e-01 -0.198 0.127 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -710356 sc-eQTL 3.01e-02 -0.287 0.131 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 447068 sc-eQTL 3.21e-01 -0.136 0.137 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -640007 sc-eQTL 3.30e-02 -0.279 0.13 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -710046 sc-eQTL 5.79e-01 0.0565 0.102 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -484210 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0877 0.129 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 194979 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0646 0.112 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 99233 sc-eQTL 3.22e-01 -0.113 0.114 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -710356 sc-eQTL 8.99e-01 0.0164 0.13 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 447068 sc-eQTL 2.16e-01 -0.155 0.125 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -640007 sc-eQTL 7.79e-02 -0.247 0.139 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -710046 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0334 0.137 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -484210 sc-eQTL 3.75e-01 -0.126 0.142 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 194979 sc-eQTL 6.58e-01 0.0482 0.109 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 99233 sc-eQTL 2.22e-01 0.154 0.126 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -710356 sc-eQTL 8.62e-01 0.0232 0.133 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 447068 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0232 0.139 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -640007 sc-eQTL 3.54e-01 -0.117 0.126 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -710046 sc-eQTL 2.67e-01 0.123 0.111 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -484210 sc-eQTL 9.33e-02 0.21 0.125 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 194979 sc-eQTL 4.03e-02 -0.238 0.115 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 99233 sc-eQTL 1.56e-02 0.286 0.117 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -710356 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0725 0.123 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 447068 sc-eQTL 1.04e-01 -0.21 0.129 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -640007 sc-eQTL 5.01e-01 0.0886 0.131 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -710046 sc-eQTL 2.52e-01 -0.185 0.16 0.119 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -484210 sc-eQTL 8.60e-01 0.0299 0.169 0.119 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 194979 sc-eQTL 4.84e-01 0.127 0.181 0.119 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 99233 sc-eQTL 3.53e-03 0.453 0.152 0.119 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -710356 sc-eQTL 2.51e-01 -0.181 0.157 0.119 PB L2
ENSG00000162607 USP1 447068 sc-eQTL 3.56e-01 -0.145 0.156 0.119 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -640007 sc-eQTL 5.29e-01 -0.109 0.173 0.119 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -710046 sc-eQTL 2.79e-01 -0.126 0.117 0.126 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -484210 sc-eQTL 9.33e-01 0.00994 0.119 0.126 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 194979 sc-eQTL 7.03e-01 0.0454 0.119 0.126 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 99233 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0117 0.104 0.126 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -710356 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0288 0.105 0.126 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 447068 sc-eQTL 8.23e-01 0.0161 0.072 0.126 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -640007 sc-eQTL 6.13e-01 0.0616 0.122 0.126 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -710046 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0909 0.126 0.126 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -484210 sc-eQTL 1.18e-01 -0.21 0.134 0.126 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 194979 sc-eQTL 1.06e-01 -0.199 0.123 0.126 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 99233 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0536 0.126 0.126 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -710356 sc-eQTL 3.95e-01 0.112 0.132 0.126 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 447068 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0088 0.128 0.126 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -640007 sc-eQTL 2.33e-01 -0.151 0.126 0.126 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -710046 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0538 0.128 0.117 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -484210 sc-eQTL 3.48e-01 -0.122 0.129 0.117 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 194979 sc-eQTL 7.49e-01 0.0408 0.127 0.117 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 99233 sc-eQTL 2.12e-01 -0.138 0.11 0.117 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -710356 sc-eQTL 1.04e-01 0.227 0.139 0.117 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 447068 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0805 0.125 0.117 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -640007 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0687 0.112 0.117 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -710046 sc-eQTL 9.62e-03 -0.295 0.113 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -484210 sc-eQTL 6.99e-03 -0.307 0.113 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 194979 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0531 0.121 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 99233 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0105 0.0851 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -710356 sc-eQTL 5.00e-02 -0.235 0.119 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 447068 sc-eQTL 9.62e-01 0.0051 0.106 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 688516 sc-eQTL 9.51e-01 0.00652 0.107 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -710046 sc-eQTL 1.26e-01 -0.194 0.126 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -484210 sc-eQTL 4.30e-02 -0.26 0.128 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 194979 sc-eQTL 4.49e-02 -0.239 0.118 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 99233 sc-eQTL 4.05e-01 0.0862 0.103 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -710356 sc-eQTL 2.68e-02 0.257 0.115 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 447068 sc-eQTL 9.72e-01 0.00421 0.12 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 688516 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0379 0.0998 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -710046 sc-eQTL 3.14e-01 0.15 0.148 0.118 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -484210 sc-eQTL 2.75e-01 0.173 0.158 0.118 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 194979 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00561 0.156 0.118 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 99233 sc-eQTL 8.60e-01 0.0262 0.149 0.118 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -710356 sc-eQTL 7.71e-01 -0.046 0.158 0.118 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 447068 sc-eQTL 6.77e-01 0.0623 0.149 0.118 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -640007 sc-eQTL 1.19e-01 -0.241 0.154 0.118 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -710046 sc-eQTL 3.04e-01 -0.135 0.13 0.127 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -484210 sc-eQTL 7.17e-02 -0.219 0.121 0.127 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 194979 sc-eQTL 2.59e-01 0.14 0.124 0.127 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 99233 sc-eQTL 7.30e-01 -0.041 0.119 0.127 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -710356 sc-eQTL 3.82e-01 0.114 0.131 0.127 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 447068 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0968 0.133 0.127 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 688516 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0369 0.0978 0.127 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -710046 sc-eQTL 7.77e-01 0.0331 0.116 0.124 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -484210 sc-eQTL 4.54e-02 0.255 0.127 0.124 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 194979 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0991 0.126 0.124 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 99233 sc-eQTL 1.08e-01 0.188 0.117 0.124 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -710356 sc-eQTL 8.12e-01 0.0293 0.123 0.124 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 447068 sc-eQTL 2.45e-01 -0.146 0.125 0.124 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 688516 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00847 0.0892 0.124 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -710046 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0843 0.141 0.13 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -484210 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0319 0.137 0.13 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 194979 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0202 0.14 0.13 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 99233 sc-eQTL 7.45e-01 0.0411 0.126 0.13 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -710356 sc-eQTL 4.15e-01 0.115 0.141 0.13 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 447068 sc-eQTL 8.47e-01 0.0279 0.144 0.13 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -640007 sc-eQTL 5.14e-01 0.0817 0.125 0.13 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -710046 sc-eQTL 2.81e-01 -0.132 0.122 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -484210 sc-eQTL 3.79e-02 -0.279 0.134 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 194979 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00241 0.117 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 99233 sc-eQTL 7.98e-01 0.0243 0.0948 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -710356 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0365 0.125 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 447068 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0212 0.121 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -640007 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0882 0.13 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -710046 sc-eQTL 6.47e-01 0.0575 0.125 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -484210 sc-eQTL 1.54e-01 -0.184 0.128 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 194979 sc-eQTL 4.14e-01 0.0984 0.12 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 99233 sc-eQTL 4.58e-01 0.0683 0.0918 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -710356 sc-eQTL 3.85e-01 -0.113 0.13 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 447068 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0415 0.112 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -640007 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0684 0.131 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -710046 sc-eQTL 1.24e-02 -0.292 0.116 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -484210 sc-eQTL 4.31e-04 -0.395 0.111 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 194979 sc-eQTL 2.28e-01 -0.138 0.114 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 99233 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000857 0.0792 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -710356 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0335 0.117 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 447068 sc-eQTL 8.77e-01 0.0155 0.1 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 688516 sc-eQTL 9.93e-01 0.00102 0.109 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -710046 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0957 0.115 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -484210 sc-eQTL 7.46e-01 0.0424 0.131 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 194979 sc-eQTL 7.08e-01 0.0485 0.129 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 99233 sc-eQTL 2.39e-01 0.13 0.11 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -710356 sc-eQTL 1.49e-01 0.185 0.128 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 447068 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0921 0.12 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 688516 sc-eQTL 6.40e-01 0.0385 0.0821 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -710046 sc-eQTL 4.08e-01 0.0821 0.0991 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -484210 sc-eQTL 8.26e-01 0.0262 0.119 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 194979 sc-eQTL 1.40e-01 -0.157 0.106 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 99233 sc-eQTL 4.20e-01 0.0859 0.106 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -710356 sc-eQTL 7.76e-01 -0.036 0.126 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 447068 sc-eQTL 3.71e-02 -0.238 0.113 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -640007 sc-eQTL 4.08e-01 -0.115 0.139 0.123 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000125703 ATG4C 99233 eQTL 0.0101 0.0648 0.0251 0.0 0.0 0.119

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000125703 ATG4C 99233 5.97e-06 8.97e-06 9.81e-07 4.02e-06 1.87e-06 2.7e-06 9.34e-06 1.28e-06 5.86e-06 4.1e-06 9.93e-06 4.6e-06 1.16e-05 3.9e-06 1.47e-06 5.46e-06 3.77e-06 4.1e-06 2.19e-06 2.07e-06 3.37e-06 7.67e-06 5.84e-06 2.21e-06 1.24e-05 2.41e-06 4.04e-06 2.38e-06 7.01e-06 7.73e-06 4.13e-06 5.83e-07 7.23e-07 2.74e-06 2.96e-06 2.1e-06 1.35e-06 9.96e-07 1.36e-06 8.53e-07 8.27e-07 9.56e-06 8.89e-07 1.58e-07 7.64e-07 9.44e-07 9.03e-07 6.61e-07 6.14e-07