logo

Genes within 1Mb (chr1:62818783:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -774628 sc-eQTL 4.87e-01 0.0853 0.122 0.105 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -548792 sc-eQTL 7.12e-01 0.0469 0.127 0.105 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 130397 sc-eQTL 2.20e-01 0.156 0.127 0.105 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 34651 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00612 0.0883 0.105 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -774938 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0138 0.14 0.105 B L1
ENSG00000162607 USP1 382486 sc-eQTL 7.51e-01 0.0387 0.122 0.105 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -704589 sc-eQTL 3.95e-01 -0.122 0.144 0.105 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -774628 sc-eQTL 2.18e-01 0.132 0.107 0.105 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -548792 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0931 0.118 0.105 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 130397 sc-eQTL 7.57e-03 0.318 0.118 0.105 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 34651 sc-eQTL 6.38e-01 0.0455 0.0967 0.105 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -774938 sc-eQTL 6.62e-01 0.06 0.137 0.105 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 382486 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0499 0.0938 0.105 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -704589 sc-eQTL 8.22e-01 0.0278 0.123 0.105 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -774628 sc-eQTL 1.19e-01 0.182 0.116 0.105 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -548792 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0167 0.129 0.105 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 130397 sc-eQTL 9.80e-01 0.00328 0.131 0.105 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 34651 sc-eQTL 3.70e-02 -0.258 0.123 0.105 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -774938 sc-eQTL 3.86e-01 0.12 0.139 0.105 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 382486 sc-eQTL 7.41e-02 -0.193 0.107 0.105 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -704589 sc-eQTL 8.90e-02 -0.235 0.137 0.105 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -774628 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00938 0.13 0.108 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -548792 sc-eQTL 8.53e-01 0.0249 0.135 0.108 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 130397 sc-eQTL 9.10e-01 0.0157 0.138 0.108 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 34651 sc-eQTL 5.91e-01 0.058 0.108 0.108 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -774938 sc-eQTL 4.91e-01 -0.104 0.151 0.108 DC L1
ENSG00000162607 USP1 382486 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0224 0.132 0.108 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -704589 sc-eQTL 6.70e-01 0.0561 0.131 0.108 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -774628 sc-eQTL 8.15e-02 0.22 0.126 0.105 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -548792 sc-eQTL 4.82e-02 0.26 0.131 0.105 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 130397 sc-eQTL 7.91e-01 -0.034 0.128 0.105 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 34651 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0127 0.0864 0.105 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -774938 sc-eQTL 4.45e-01 0.104 0.136 0.105 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 382486 sc-eQTL 7.56e-01 -0.035 0.112 0.105 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 623934 sc-eQTL 2.76e-01 0.114 0.104 0.105 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -774628 sc-eQTL 3.38e-01 -0.104 0.108 0.105 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -548792 sc-eQTL 2.34e-01 -0.151 0.127 0.105 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 130397 sc-eQTL 1.83e-01 0.139 0.104 0.105 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 34651 sc-eQTL 1.19e-01 -0.175 0.112 0.105 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -774938 sc-eQTL 1.42e-01 0.205 0.139 0.105 NK L1
ENSG00000162607 USP1 382486 sc-eQTL 3.74e-01 -0.111 0.125 0.105 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -704589 sc-eQTL 9.59e-01 0.00784 0.152 0.105 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -774628 sc-eQTL 8.00e-02 0.213 0.121 0.105 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -548792 sc-eQTL 3.16e-01 -0.123 0.122 0.105 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 130397 sc-eQTL 8.22e-01 0.0281 0.125 0.105 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 34651 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00653 0.108 0.105 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -774938 sc-eQTL 2.63e-01 0.108 0.0957 0.105 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 382486 sc-eQTL 1.52e-01 -0.119 0.0828 0.105 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -704589 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0738 0.148 0.105 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -774628 sc-eQTL 2.63e-01 0.185 0.165 0.105 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -548792 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0283 0.159 0.105 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 130397 sc-eQTL 5.53e-01 0.0877 0.148 0.105 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 34651 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0368 0.155 0.105 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -774938 sc-eQTL 3.70e-01 -0.136 0.151 0.105 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 382486 sc-eQTL 9.99e-01 0.000292 0.165 0.105 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -704589 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00147 0.144 0.105 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -774628 sc-eQTL 5.90e-01 0.0786 0.146 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -548792 sc-eQTL 3.46e-01 0.14 0.148 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 130397 sc-eQTL 1.61e-01 0.198 0.141 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 34651 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0115 0.12 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -774938 sc-eQTL 9.51e-01 0.00872 0.143 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 382486 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0609 0.143 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -704589 sc-eQTL 1.54e-01 -0.201 0.141 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -774628 sc-eQTL 3.86e-01 -0.123 0.142 0.106 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -548792 sc-eQTL 3.85e-01 0.126 0.144 0.106 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 130397 sc-eQTL 6.72e-01 0.0575 0.136 0.106 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 34651 sc-eQTL 7.37e-01 0.0433 0.129 0.106 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -774938 sc-eQTL 4.75e-01 -0.105 0.147 0.106 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 382486 sc-eQTL 4.31e-02 -0.3 0.147 0.106 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -704589 sc-eQTL 1.94e-01 0.19 0.146 0.106 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -774628 sc-eQTL 8.76e-02 0.247 0.144 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -548792 sc-eQTL 3.69e-01 0.131 0.145 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 130397 sc-eQTL 5.97e-01 0.0738 0.139 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 34651 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0952 0.107 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -774938 sc-eQTL 4.73e-01 -0.102 0.142 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 382486 sc-eQTL 2.85e-01 0.134 0.125 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -704589 sc-eQTL 2.41e-01 -0.178 0.152 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -774628 sc-eQTL 5.05e-01 0.0949 0.142 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -548792 sc-eQTL 2.78e-01 -0.161 0.148 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 130397 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0733 0.143 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 34651 sc-eQTL 2.98e-01 0.143 0.137 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -774938 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0493 0.149 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 382486 sc-eQTL 2.52e-01 0.163 0.142 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -704589 sc-eQTL 9.22e-01 0.0145 0.148 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -774628 sc-eQTL 7.79e-01 0.0406 0.144 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -548792 sc-eQTL 4.41e-01 0.118 0.152 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 130397 sc-eQTL 8.37e-01 0.0274 0.134 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 34651 sc-eQTL 1.84e-01 -0.183 0.138 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -774938 sc-eQTL 7.50e-01 0.0471 0.148 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 382486 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0407 0.141 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -704589 sc-eQTL 6.17e-02 0.261 0.139 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -774628 sc-eQTL 2.46e-01 0.139 0.12 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -548792 sc-eQTL 3.04e-02 -0.281 0.129 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 130397 sc-eQTL 2.28e-02 0.291 0.127 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 34651 sc-eQTL 5.31e-01 0.0711 0.113 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -774938 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00737 0.139 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 382486 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0298 0.106 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -704589 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0271 0.138 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -774628 sc-eQTL 9.09e-01 0.0142 0.124 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -548792 sc-eQTL 1.03e-01 0.235 0.143 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 130397 sc-eQTL 5.46e-02 0.245 0.127 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 34651 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0109 0.124 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -774938 sc-eQTL 3.27e-01 0.144 0.146 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 382486 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0652 0.12 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -704589 sc-eQTL 3.27e-01 -0.139 0.142 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -774628 sc-eQTL 3.32e-02 0.309 0.144 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -548792 sc-eQTL 1.65e-01 0.203 0.146 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 130397 sc-eQTL 1.30e-01 0.215 0.142 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 34651 sc-eQTL 8.38e-01 0.0283 0.138 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -774938 sc-eQTL 5.24e-01 0.0911 0.143 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 382486 sc-eQTL 7.01e-01 -0.052 0.135 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -704589 sc-eQTL 5.55e-01 0.0875 0.148 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -774628 sc-eQTL 2.09e-01 0.166 0.132 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -548792 sc-eQTL 6.55e-01 0.0628 0.141 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 130397 sc-eQTL 7.55e-01 0.0417 0.133 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 34651 sc-eQTL 1.62e-01 -0.199 0.141 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -774938 sc-eQTL 1.83e-01 0.197 0.147 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 382486 sc-eQTL 4.45e-01 -0.101 0.132 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -704589 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00736 0.151 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -774628 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0609 0.136 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -548792 sc-eQTL 8.82e-01 0.0209 0.141 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 130397 sc-eQTL 5.15e-01 0.0946 0.145 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 34651 sc-eQTL 7.97e-02 -0.244 0.139 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -774938 sc-eQTL 9.56e-01 0.0078 0.141 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 382486 sc-eQTL 2.63e-01 -0.134 0.119 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -704589 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0796 0.133 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -774628 sc-eQTL 2.44e-01 0.171 0.146 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -548792 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00966 0.149 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 130397 sc-eQTL 6.02e-01 0.0758 0.145 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 34651 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0617 0.148 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -774938 sc-eQTL 7.70e-02 0.255 0.143 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 382486 sc-eQTL 3.08e-02 -0.298 0.137 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -704589 sc-eQTL 4.96e-02 -0.288 0.146 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -774628 sc-eQTL 4.13e-01 -0.124 0.151 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -548792 sc-eQTL 4.18e-01 -0.123 0.152 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 130397 sc-eQTL 6.10e-02 -0.275 0.146 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 34651 sc-eQTL 2.56e-01 -0.161 0.141 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -774938 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0937 0.153 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 382486 sc-eQTL 4.59e-01 -0.108 0.146 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -704589 sc-eQTL 5.49e-01 0.0891 0.148 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -774628 sc-eQTL 4.25e-02 0.288 0.141 0.106 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -548792 sc-eQTL 2.20e-01 -0.173 0.141 0.106 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 130397 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0578 0.135 0.106 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 34651 sc-eQTL 8.43e-01 0.0284 0.143 0.106 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -774938 sc-eQTL 4.28e-01 0.113 0.143 0.106 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 382486 sc-eQTL 9.69e-01 0.00545 0.142 0.106 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -704589 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0777 0.147 0.106 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -774628 sc-eQTL 8.25e-01 0.0319 0.144 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -548792 sc-eQTL 8.95e-01 0.0196 0.148 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 130397 sc-eQTL 1.07e-01 0.206 0.127 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 34651 sc-eQTL 3.74e-01 -0.127 0.143 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -774938 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0324 0.149 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 382486 sc-eQTL 8.58e-01 0.0274 0.153 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -704589 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0618 0.147 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -774628 sc-eQTL 5.30e-01 0.0707 0.113 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -548792 sc-eQTL 7.64e-01 0.0429 0.143 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 130397 sc-eQTL 8.11e-01 0.0297 0.124 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 34651 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0291 0.126 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -774938 sc-eQTL 4.18e-02 0.291 0.142 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 382486 sc-eQTL 6.21e-01 -0.069 0.139 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -704589 sc-eQTL 8.91e-01 0.0212 0.155 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -774628 sc-eQTL 1.94e-01 -0.199 0.153 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -548792 sc-eQTL 2.11e-01 -0.198 0.158 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 130397 sc-eQTL 5.22e-01 0.0779 0.121 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 34651 sc-eQTL 3.20e-01 -0.14 0.141 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -774938 sc-eQTL 2.55e-02 0.33 0.146 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 382486 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0297 0.155 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -704589 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0292 0.141 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -774628 sc-eQTL 3.51e-01 -0.115 0.123 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -548792 sc-eQTL 2.16e-02 -0.319 0.138 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 130397 sc-eQTL 4.01e-01 0.109 0.129 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 34651 sc-eQTL 1.95e-01 -0.171 0.132 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -774938 sc-eQTL 2.40e-01 0.161 0.136 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 382486 sc-eQTL 9.78e-01 0.00393 0.144 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -704589 sc-eQTL 2.77e-01 -0.158 0.145 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -774628 sc-eQTL 9.66e-01 0.00866 0.201 0.078 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -548792 sc-eQTL 3.23e-01 -0.208 0.21 0.078 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 130397 sc-eQTL 4.18e-01 -0.182 0.225 0.078 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 34651 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0776 0.196 0.078 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -774938 sc-eQTL 1.27e-01 0.298 0.194 0.078 PB L2
ENSG00000162607 USP1 382486 sc-eQTL 1.67e-01 -0.269 0.194 0.078 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -704589 sc-eQTL 3.15e-01 0.216 0.214 0.078 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -774628 sc-eQTL 5.48e-01 -0.08 0.133 0.107 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -548792 sc-eQTL 1.24e-01 0.208 0.135 0.107 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 130397 sc-eQTL 2.14e-01 -0.169 0.135 0.107 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 34651 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0384 0.119 0.107 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -774938 sc-eQTL 6.00e-01 0.0626 0.119 0.107 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 382486 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00838 0.082 0.107 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -704589 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0155 0.139 0.107 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -774628 sc-eQTL 6.28e-01 0.0684 0.141 0.105 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -548792 sc-eQTL 8.76e-01 0.0236 0.151 0.105 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 130397 sc-eQTL 5.50e-02 0.265 0.137 0.105 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 34651 sc-eQTL 5.09e-01 0.0935 0.142 0.105 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -774938 sc-eQTL 3.67e-01 -0.134 0.148 0.105 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 382486 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0844 0.143 0.105 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -704589 sc-eQTL 2.72e-01 0.156 0.141 0.105 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -774628 sc-eQTL 7.39e-01 0.0471 0.141 0.11 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -548792 sc-eQTL 5.25e-01 0.0909 0.143 0.11 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 130397 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0178 0.14 0.11 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 34651 sc-eQTL 9.67e-01 0.00511 0.122 0.11 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -774938 sc-eQTL 4.11e-01 -0.127 0.154 0.11 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 382486 sc-eQTL 2.04e-01 0.174 0.137 0.11 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -704589 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0414 0.124 0.11 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -774628 sc-eQTL 1.71e-01 0.182 0.132 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -548792 sc-eQTL 1.11e-01 0.212 0.132 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 130397 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0492 0.14 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 34651 sc-eQTL 8.57e-01 0.0178 0.0986 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -774938 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0111 0.14 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 382486 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0973 0.123 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 623934 sc-eQTL 3.95e-01 0.105 0.124 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -774628 sc-eQTL 6.05e-02 0.277 0.147 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -548792 sc-eQTL 1.78e-02 0.354 0.148 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 130397 sc-eQTL 4.75e-01 0.0994 0.139 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 34651 sc-eQTL 6.26e-01 0.0588 0.12 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -774938 sc-eQTL 8.96e-01 0.0178 0.136 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 382486 sc-eQTL 9.34e-02 0.234 0.139 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 623934 sc-eQTL 3.15e-01 -0.117 0.116 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -774628 sc-eQTL 1.12e-01 0.249 0.156 0.112 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -548792 sc-eQTL 5.79e-01 0.0929 0.167 0.112 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 130397 sc-eQTL 1.98e-01 0.211 0.163 0.112 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 34651 sc-eQTL 2.95e-01 0.164 0.156 0.112 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -774938 sc-eQTL 6.25e-01 0.0815 0.166 0.112 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 382486 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0757 0.157 0.112 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -704589 sc-eQTL 1.32e-01 0.246 0.162 0.112 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -774628 sc-eQTL 5.17e-01 0.0963 0.148 0.104 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -548792 sc-eQTL 2.71e-01 -0.152 0.138 0.104 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 130397 sc-eQTL 3.57e-01 -0.13 0.141 0.104 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 34651 sc-eQTL 8.18e-02 -0.234 0.134 0.104 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -774938 sc-eQTL 3.69e-01 0.133 0.148 0.104 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 382486 sc-eQTL 3.92e-01 0.129 0.151 0.104 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 623934 sc-eQTL 8.89e-01 0.0155 0.111 0.104 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -774628 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0409 0.13 0.109 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -548792 sc-eQTL 9.01e-01 0.0178 0.143 0.109 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 130397 sc-eQTL 9.03e-01 0.0172 0.141 0.109 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 34651 sc-eQTL 8.33e-01 0.0277 0.131 0.109 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -774938 sc-eQTL 8.91e-01 0.0188 0.137 0.109 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 382486 sc-eQTL 9.25e-01 0.0133 0.14 0.109 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 623934 sc-eQTL 4.69e-01 0.0722 0.0995 0.109 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -774628 sc-eQTL 9.00e-01 0.0193 0.153 0.116 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -548792 sc-eQTL 1.76e-01 -0.202 0.149 0.116 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 130397 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0561 0.153 0.116 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 34651 sc-eQTL 5.39e-01 0.0843 0.137 0.116 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -774938 sc-eQTL 4.55e-01 -0.115 0.153 0.116 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 382486 sc-eQTL 1.66e-01 -0.217 0.156 0.116 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -704589 sc-eQTL 9.01e-01 0.0169 0.136 0.116 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -774628 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00497 0.136 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -548792 sc-eQTL 2.04e-01 0.191 0.15 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 130397 sc-eQTL 5.72e-01 0.074 0.131 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 34651 sc-eQTL 9.83e-01 0.00224 0.106 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -774938 sc-eQTL 8.86e-01 0.0199 0.139 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 382486 sc-eQTL 1.31e-01 -0.203 0.134 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -704589 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0736 0.145 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -774628 sc-eQTL 1.35e-01 0.211 0.141 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -548792 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0314 0.146 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 130397 sc-eQTL 7.41e-01 0.0449 0.136 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 34651 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0352 0.104 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -774938 sc-eQTL 6.09e-01 -0.075 0.147 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 382486 sc-eQTL 1.79e-01 0.169 0.125 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -704589 sc-eQTL 4.83e-01 -0.104 0.147 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -774628 sc-eQTL 4.08e-02 0.277 0.135 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -548792 sc-eQTL 8.36e-03 0.345 0.13 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 130397 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0192 0.133 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 34651 sc-eQTL 5.98e-01 0.0484 0.0916 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -774938 sc-eQTL 9.90e-01 0.00175 0.136 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 382486 sc-eQTL 7.38e-01 0.0387 0.116 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 623934 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00653 0.126 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -774628 sc-eQTL 9.01e-01 0.016 0.129 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -548792 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0893 0.146 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 130397 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0545 0.145 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 34651 sc-eQTL 1.34e-01 -0.184 0.123 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -774938 sc-eQTL 3.11e-01 0.145 0.143 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 382486 sc-eQTL 8.98e-01 0.0172 0.134 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 623934 sc-eQTL 1.89e-01 0.12 0.0913 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -774628 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0839 0.11 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -548792 sc-eQTL 2.09e-01 -0.166 0.132 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 130397 sc-eQTL 4.88e-01 0.082 0.118 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 34651 sc-eQTL 1.95e-01 -0.153 0.118 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -774938 sc-eQTL 6.01e-02 0.262 0.139 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 382486 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0834 0.127 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -704589 sc-eQTL 8.20e-01 0.0353 0.155 0.106 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000088035 ALG6 -548792 eQTL 0.0329 0.0422 0.0198 0.0028 0.0 0.122
ENSG00000116641 DOCK7 130415 eQTL 0.102 -0.054 0.033 0.00198 0.0 0.122
ENSG00000116652 DLEU2L -728299 eQTL 0.0616 -0.0724 0.0387 0.00107 0.0 0.122
ENSG00000125703 ATG4C 34651 eQTL 0.00236 -0.0762 0.025 0.0 0.0 0.122
ENSG00000132855 ANGPTL3 221296 pQTL 0.0259 0.0997 0.0447 0.0 0.0 0.118

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina