logo

Genes within 1Mb (chr1:62797335:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -796076 sc-eQTL 8.61e-01 0.0249 0.142 0.077 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -570240 sc-eQTL 5.47e-02 0.282 0.146 0.077 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 108949 sc-eQTL 4.91e-01 -0.102 0.147 0.077 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 13203 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00779 0.102 0.077 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -796386 sc-eQTL 6.02e-01 0.085 0.163 0.077 B L1
ENSG00000162607 USP1 361038 sc-eQTL 6.56e-01 0.0631 0.141 0.077 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -726037 sc-eQTL 4.92e-02 -0.327 0.165 0.077 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -796076 sc-eQTL 6.73e-02 -0.224 0.122 0.077 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -570240 sc-eQTL 6.31e-01 0.0652 0.136 0.077 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 108949 sc-eQTL 1.60e-01 0.193 0.137 0.077 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 13203 sc-eQTL 2.82e-01 0.119 0.111 0.077 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -796386 sc-eQTL 5.65e-01 0.0908 0.157 0.077 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 361038 sc-eQTL 1.32e-02 0.265 0.106 0.077 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -726037 sc-eQTL 2.10e-01 0.177 0.141 0.077 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -796076 sc-eQTL 9.83e-02 0.224 0.135 0.077 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -570240 sc-eQTL 9.07e-01 0.0176 0.15 0.077 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 108949 sc-eQTL 9.19e-01 0.0154 0.152 0.077 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 13203 sc-eQTL 9.90e-01 0.00189 0.144 0.077 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -796386 sc-eQTL 3.31e-01 0.157 0.161 0.077 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 361038 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0328 0.126 0.077 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -726037 sc-eQTL 9.70e-01 0.00595 0.161 0.077 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -796076 sc-eQTL 6.51e-02 -0.287 0.154 0.079 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -570240 sc-eQTL 2.95e-01 0.168 0.16 0.079 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 108949 sc-eQTL 9.29e-01 0.0148 0.165 0.079 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 13203 sc-eQTL 6.94e-01 0.0508 0.129 0.079 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -796386 sc-eQTL 4.82e-01 0.127 0.18 0.079 DC L1
ENSG00000162607 USP1 361038 sc-eQTL 3.16e-01 0.158 0.157 0.079 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -726037 sc-eQTL 1.51e-01 0.225 0.156 0.079 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -796076 sc-eQTL 1.14e-01 0.237 0.15 0.077 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -570240 sc-eQTL 9.21e-02 -0.264 0.156 0.077 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 108949 sc-eQTL 1.24e-01 0.234 0.151 0.077 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 13203 sc-eQTL 4.50e-01 0.0776 0.103 0.077 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -796386 sc-eQTL 2.01e-01 0.208 0.162 0.077 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 361038 sc-eQTL 1.76e-01 -0.18 0.133 0.077 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 602486 sc-eQTL 2.55e-01 -0.142 0.124 0.077 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -796076 sc-eQTL 4.14e-01 -0.103 0.126 0.077 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -570240 sc-eQTL 7.01e-01 0.0569 0.148 0.077 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 108949 sc-eQTL 7.55e-01 -0.038 0.122 0.077 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 13203 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0437 0.131 0.077 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -796386 sc-eQTL 2.15e-02 -0.372 0.161 0.077 NK L1
ENSG00000162607 USP1 361038 sc-eQTL 1.19e-01 0.226 0.145 0.077 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -726037 sc-eQTL 2.74e-01 0.193 0.176 0.077 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -796076 sc-eQTL 3.76e-01 0.126 0.142 0.077 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -570240 sc-eQTL 5.18e-01 0.0926 0.143 0.077 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 108949 sc-eQTL 4.49e-01 -0.111 0.146 0.077 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 13203 sc-eQTL 1.83e-01 0.168 0.126 0.077 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -796386 sc-eQTL 9.82e-01 0.00256 0.112 0.077 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 361038 sc-eQTL 1.96e-01 0.126 0.0969 0.077 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -726037 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0571 0.173 0.077 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -796076 sc-eQTL 3.52e-01 -0.193 0.206 0.071 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -570240 sc-eQTL 3.85e-01 -0.172 0.198 0.071 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 108949 sc-eQTL 3.38e-01 0.177 0.184 0.071 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 13203 sc-eQTL 3.18e-01 -0.194 0.194 0.071 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -796386 sc-eQTL 2.09e-01 -0.238 0.189 0.071 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 361038 sc-eQTL 4.56e-01 0.154 0.205 0.071 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -726037 sc-eQTL 3.26e-01 -0.177 0.179 0.071 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -796076 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0232 0.17 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -570240 sc-eQTL 7.17e-01 0.0628 0.173 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 108949 sc-eQTL 2.82e-01 0.178 0.165 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 13203 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0128 0.14 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -796386 sc-eQTL 7.46e-01 0.054 0.167 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 361038 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0228 0.166 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -726037 sc-eQTL 2.66e-01 -0.183 0.165 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -796076 sc-eQTL 3.77e-01 -0.149 0.168 0.075 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -570240 sc-eQTL 8.47e-01 0.0331 0.171 0.075 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 108949 sc-eQTL 1.11e-01 -0.256 0.16 0.075 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 13203 sc-eQTL 7.86e-01 0.0416 0.153 0.075 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -796386 sc-eQTL 6.80e-01 0.0722 0.175 0.075 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 361038 sc-eQTL 2.81e-01 0.19 0.176 0.075 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -726037 sc-eQTL 6.33e-02 -0.321 0.172 0.075 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -796076 sc-eQTL 9.78e-01 0.00455 0.167 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -570240 sc-eQTL 7.76e-03 0.443 0.165 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 108949 sc-eQTL 1.07e-01 -0.258 0.16 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 13203 sc-eQTL 8.52e-01 0.0231 0.124 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -796386 sc-eQTL 9.98e-01 0.000457 0.164 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 361038 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0426 0.144 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -726037 sc-eQTL 3.76e-01 -0.155 0.175 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -796076 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0989 0.166 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -570240 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0127 0.173 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 108949 sc-eQTL 7.09e-01 0.062 0.166 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 13203 sc-eQTL 5.94e-01 0.0854 0.16 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -796386 sc-eQTL 2.72e-01 0.19 0.173 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 361038 sc-eQTL 2.73e-01 0.181 0.165 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -726037 sc-eQTL 4.43e-01 -0.133 0.172 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -796076 sc-eQTL 3.82e-02 -0.345 0.165 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -570240 sc-eQTL 6.48e-01 0.0807 0.176 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 108949 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0576 0.154 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 13203 sc-eQTL 8.70e-01 0.0262 0.16 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -796386 sc-eQTL 3.79e-02 0.353 0.169 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 361038 sc-eQTL 1.72e-01 -0.222 0.162 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -726037 sc-eQTL 4.29e-01 0.128 0.162 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -796076 sc-eQTL 2.54e-01 -0.157 0.137 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -570240 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0705 0.149 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 108949 sc-eQTL 1.99e-01 0.188 0.146 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 13203 sc-eQTL 5.21e-01 0.0833 0.129 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -796386 sc-eQTL 7.61e-01 0.0482 0.158 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 361038 sc-eQTL 5.35e-02 0.233 0.12 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -726037 sc-eQTL 2.96e-01 0.164 0.157 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -796076 sc-eQTL 7.93e-02 -0.252 0.143 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -570240 sc-eQTL 2.02e-01 0.213 0.166 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 108949 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0113 0.148 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 13203 sc-eQTL 2.37e-01 0.17 0.144 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -796386 sc-eQTL 4.62e-01 0.125 0.17 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 361038 sc-eQTL 1.62e-02 0.333 0.137 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -726037 sc-eQTL 7.85e-02 0.288 0.163 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -796076 sc-eQTL 1.96e-02 0.387 0.164 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -570240 sc-eQTL 3.98e-01 0.141 0.167 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 108949 sc-eQTL 7.57e-01 0.0506 0.163 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 13203 sc-eQTL 8.60e-01 -0.028 0.158 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -796386 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00569 0.164 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 361038 sc-eQTL 9.16e-01 0.0164 0.155 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -726037 sc-eQTL 9.14e-01 0.0183 0.169 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -796076 sc-eQTL 1.21e-01 0.236 0.152 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -570240 sc-eQTL 4.31e-01 0.128 0.162 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 108949 sc-eQTL 5.76e-02 0.291 0.152 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 13203 sc-eQTL 3.41e-01 -0.156 0.163 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -796386 sc-eQTL 1.54e-01 0.242 0.169 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 361038 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0432 0.152 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -726037 sc-eQTL 7.63e-01 0.0526 0.174 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -796076 sc-eQTL 3.01e-01 0.16 0.155 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -570240 sc-eQTL 9.92e-01 -0.0016 0.161 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 108949 sc-eQTL 4.21e-01 -0.134 0.166 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 13203 sc-eQTL 6.79e-01 -0.066 0.159 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -796386 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0974 0.161 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 361038 sc-eQTL 5.86e-01 0.0744 0.136 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -726037 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0269 0.152 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -796076 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0699 0.171 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -570240 sc-eQTL 9.81e-01 -0.0041 0.173 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 108949 sc-eQTL 3.39e-01 -0.161 0.168 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 13203 sc-eQTL 8.31e-01 0.0368 0.173 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -796386 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00587 0.168 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 361038 sc-eQTL 9.93e-01 0.00132 0.161 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -726037 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00287 0.171 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -796076 sc-eQTL 7.28e-01 0.0593 0.17 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -570240 sc-eQTL 3.32e-01 0.166 0.171 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 108949 sc-eQTL 5.14e-01 -0.108 0.166 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 13203 sc-eQTL 1.61e-01 0.223 0.159 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -796386 sc-eQTL 5.04e-01 0.115 0.172 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 361038 sc-eQTL 6.78e-01 0.0685 0.165 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -726037 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0164 0.167 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -796076 sc-eQTL 3.76e-01 0.144 0.162 0.078 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -570240 sc-eQTL 9.98e-01 0.000443 0.161 0.078 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 108949 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0931 0.154 0.078 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 13203 sc-eQTL 4.50e-01 0.123 0.162 0.078 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -796386 sc-eQTL 9.90e-01 0.00195 0.163 0.078 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 361038 sc-eQTL 3.55e-02 0.338 0.16 0.078 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -726037 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0723 0.167 0.078 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -796076 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0186 0.173 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -570240 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0145 0.178 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 108949 sc-eQTL 1.54e-01 -0.22 0.153 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 13203 sc-eQTL 9.12e-01 -0.019 0.172 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -796386 sc-eQTL 7.98e-01 0.0459 0.179 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 361038 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0882 0.185 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -726037 sc-eQTL 7.40e-01 0.0588 0.177 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -796076 sc-eQTL 9.05e-01 -0.016 0.134 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -570240 sc-eQTL 5.88e-01 0.0921 0.17 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 108949 sc-eQTL 4.53e-01 -0.111 0.148 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 13203 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00889 0.15 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -796386 sc-eQTL 1.57e-02 -0.41 0.168 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 361038 sc-eQTL 4.41e-01 0.128 0.165 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -726037 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0902 0.184 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -796076 sc-eQTL 9.26e-01 0.0164 0.176 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -570240 sc-eQTL 3.93e-01 -0.156 0.182 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 108949 sc-eQTL 7.64e-01 0.042 0.14 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 13203 sc-eQTL 5.76e-01 -0.091 0.162 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -796386 sc-eQTL 5.53e-01 -0.101 0.171 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 361038 sc-eQTL 6.13e-01 0.0905 0.179 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -726037 sc-eQTL 3.98e-01 0.138 0.162 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -796076 sc-eQTL 4.15e-01 -0.116 0.142 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -570240 sc-eQTL 3.68e-01 0.144 0.16 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 108949 sc-eQTL 5.35e-01 0.0922 0.149 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 13203 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00716 0.152 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -796386 sc-eQTL 3.40e-01 -0.15 0.157 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 361038 sc-eQTL 1.15e-01 0.261 0.165 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -726037 sc-eQTL 3.75e-01 0.149 0.168 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -796076 sc-eQTL 8.65e-01 0.037 0.217 0.07 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -570240 sc-eQTL 2.91e-01 -0.241 0.227 0.07 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 108949 sc-eQTL 7.79e-02 -0.429 0.241 0.07 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 13203 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0249 0.213 0.07 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -796386 sc-eQTL 5.49e-01 -0.127 0.212 0.07 PB L2
ENSG00000162607 USP1 361038 sc-eQTL 5.18e-01 0.137 0.211 0.07 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -726037 sc-eQTL 5.07e-01 -0.155 0.233 0.07 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -796076 sc-eQTL 5.74e-01 0.0877 0.156 0.076 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -570240 sc-eQTL 5.03e-01 0.106 0.159 0.076 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 108949 sc-eQTL 5.42e-02 0.306 0.158 0.076 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 13203 sc-eQTL 9.44e-01 0.00988 0.139 0.076 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -796386 sc-eQTL 2.57e-01 -0.159 0.139 0.076 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 361038 sc-eQTL 2.30e-01 0.115 0.0958 0.076 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -726037 sc-eQTL 7.96e-01 0.0421 0.162 0.076 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -796076 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0307 0.161 0.077 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -570240 sc-eQTL 3.39e-01 -0.165 0.172 0.077 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 108949 sc-eQTL 9.39e-01 0.012 0.158 0.077 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 13203 sc-eQTL 6.98e-01 0.0628 0.161 0.077 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -796386 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0534 0.169 0.077 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 361038 sc-eQTL 8.05e-01 0.0405 0.163 0.077 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -726037 sc-eQTL 5.32e-01 -0.101 0.162 0.077 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -796076 sc-eQTL 2.57e-01 -0.188 0.166 0.076 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -570240 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0683 0.169 0.076 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 108949 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0427 0.166 0.076 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 13203 sc-eQTL 2.26e-01 -0.174 0.143 0.076 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -796386 sc-eQTL 9.44e-01 0.0129 0.182 0.076 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 361038 sc-eQTL 3.53e-01 0.151 0.162 0.076 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -726037 sc-eQTL 1.24e-02 0.364 0.144 0.076 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -796076 sc-eQTL 1.15e-01 0.243 0.154 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -570240 sc-eQTL 1.84e-01 -0.205 0.154 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 108949 sc-eQTL 2.47e-01 0.189 0.163 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 13203 sc-eQTL 7.21e-01 0.041 0.115 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -796386 sc-eQTL 3.35e-02 0.344 0.161 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 361038 sc-eQTL 4.70e-01 -0.103 0.143 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 602486 sc-eQTL 9.19e-01 0.0146 0.144 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -796076 sc-eQTL 1.79e-01 0.23 0.171 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -570240 sc-eQTL 5.27e-02 -0.336 0.172 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 108949 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0505 0.161 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 13203 sc-eQTL 4.17e-01 0.113 0.139 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -796386 sc-eQTL 5.89e-01 0.0852 0.157 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 361038 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0725 0.162 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 602486 sc-eQTL 4.18e-01 -0.109 0.135 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -796076 sc-eQTL 6.87e-02 -0.348 0.19 0.079 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -570240 sc-eQTL 5.63e-01 0.119 0.205 0.079 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 108949 sc-eQTL 2.65e-01 -0.224 0.2 0.079 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 13203 sc-eQTL 5.07e-01 0.127 0.192 0.079 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -796386 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0176 0.204 0.079 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 361038 sc-eQTL 4.46e-02 -0.385 0.19 0.079 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -726037 sc-eQTL 4.36e-01 0.156 0.2 0.079 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -796076 sc-eQTL 8.62e-01 0.0297 0.171 0.08 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -570240 sc-eQTL 4.34e-02 0.32 0.157 0.08 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 108949 sc-eQTL 7.67e-01 0.0482 0.162 0.08 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 13203 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0483 0.155 0.08 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -796386 sc-eQTL 6.83e-01 0.0699 0.171 0.08 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 361038 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0774 0.174 0.08 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 602486 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0649 0.128 0.08 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -796076 sc-eQTL 7.66e-01 0.0462 0.155 0.077 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -570240 sc-eQTL 1.31e-01 -0.257 0.17 0.077 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 108949 sc-eQTL 3.50e-01 0.157 0.168 0.077 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 13203 sc-eQTL 3.88e-01 0.135 0.157 0.077 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -796386 sc-eQTL 4.30e-01 0.13 0.164 0.077 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 361038 sc-eQTL 5.03e-01 -0.112 0.167 0.077 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 602486 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0874 0.119 0.077 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -796076 sc-eQTL 6.49e-02 -0.354 0.19 0.079 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -570240 sc-eQTL 2.08e-02 0.431 0.184 0.079 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 108949 sc-eQTL 8.69e-01 0.0317 0.192 0.079 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 13203 sc-eQTL 2.03e-01 0.218 0.171 0.079 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -796386 sc-eQTL 9.53e-01 0.0115 0.193 0.079 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 361038 sc-eQTL 2.05e-01 0.249 0.196 0.079 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -726037 sc-eQTL 8.36e-01 0.0354 0.171 0.079 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -796076 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0943 0.158 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -570240 sc-eQTL 6.14e-01 0.088 0.174 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 108949 sc-eQTL 6.28e-01 0.0734 0.151 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 13203 sc-eQTL 5.89e-01 0.0663 0.122 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -796386 sc-eQTL 8.36e-01 0.0334 0.161 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 361038 sc-eQTL 7.21e-01 0.0559 0.156 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -726037 sc-eQTL 5.91e-02 -0.316 0.166 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -796076 sc-eQTL 8.71e-01 0.0265 0.163 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -570240 sc-eQTL 2.58e-02 0.373 0.166 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 108949 sc-eQTL 3.73e-01 -0.14 0.157 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 13203 sc-eQTL 7.52e-01 0.038 0.12 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -796386 sc-eQTL 5.04e-01 0.113 0.169 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 361038 sc-eQTL 5.84e-01 0.0798 0.146 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -726037 sc-eQTL 2.79e-01 -0.184 0.17 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -796076 sc-eQTL 1.06e-01 0.255 0.157 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -570240 sc-eQTL 8.44e-02 -0.264 0.152 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 108949 sc-eQTL 3.06e-01 0.158 0.154 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 13203 sc-eQTL 5.99e-01 0.0561 0.107 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -796386 sc-eQTL 1.23e-01 0.243 0.157 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 361038 sc-eQTL 3.75e-01 -0.12 0.135 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 602486 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0247 0.146 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -796076 sc-eQTL 4.85e-01 0.105 0.15 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -570240 sc-eQTL 7.51e-01 0.0543 0.171 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 108949 sc-eQTL 4.26e-01 0.135 0.169 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 13203 sc-eQTL 5.83e-01 0.0793 0.144 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -796386 sc-eQTL 3.65e-01 0.152 0.167 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 361038 sc-eQTL 3.82e-01 -0.138 0.157 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 602486 sc-eQTL 2.23e-01 -0.131 0.107 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -796076 sc-eQTL 5.91e-01 -0.069 0.128 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -570240 sc-eQTL 5.84e-01 0.0845 0.154 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 108949 sc-eQTL 7.88e-01 0.0371 0.138 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 13203 sc-eQTL 8.62e-01 -0.024 0.138 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -796386 sc-eQTL 2.48e-02 -0.365 0.161 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 361038 sc-eQTL 1.00e-01 0.243 0.147 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -726037 sc-eQTL 3.79e-01 0.159 0.18 0.078 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116641 DOCK7 108967 eQTL 6.09e-05 0.156 0.0388 0.0 0.0 0.0834

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116641 DOCK7 108967 4.49e-06 4.68e-06 7.62e-07 2.46e-06 1.32e-06 1.19e-06 3.23e-06 9.78e-07 4.55e-06 2.08e-06 4.52e-06 3.37e-06 7.77e-06 2.04e-06 1.39e-06 3.05e-06 1.92e-06 2.76e-06 1.39e-06 1.04e-06 2.66e-06 4.53e-06 3.47e-06 1.4e-06 5.16e-06 1.65e-06 2.66e-06 1.73e-06 4.26e-06 3.64e-06 2.19e-06 5.76e-07 6.12e-07 1.73e-06 2.01e-06 8.84e-07 9.24e-07 4.74e-07 1.05e-06 3.42e-07 4.4e-07 5.31e-06 3.82e-07 1.79e-07 5.95e-07 7.77e-07 7.75e-07 2.87e-07 3.41e-07