logo

Genes within 1Mb (chr1:62736973:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -856438 sc-eQTL 3.82e-02 -0.238 0.114 0.12 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -630602 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0433 0.12 0.12 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 48587 sc-eQTL 2.13e-02 -0.274 0.118 0.12 B L1
ENSG00000125703 ATG4C -47159 sc-eQTL 2.81e-01 0.0896 0.0829 0.12 B L1
ENSG00000132849 PATJ 994567 sc-eQTL 6.09e-02 0.189 0.1 0.12 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -856748 sc-eQTL 5.94e-01 0.0707 0.132 0.12 B L1
ENSG00000162607 USP1 300676 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0471 0.115 0.12 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -786399 sc-eQTL 9.10e-01 0.0153 0.136 0.12 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -856438 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00946 0.0992 0.12 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -630602 sc-eQTL 7.96e-01 0.0284 0.109 0.12 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 48587 sc-eQTL 4.24e-02 -0.224 0.11 0.12 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C -47159 sc-eQTL 8.58e-01 -0.016 0.0895 0.12 CD4T L1
ENSG00000132849 PATJ 994567 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0103 0.0726 0.12 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -856748 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0339 0.127 0.12 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 300676 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0754 0.0867 0.12 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -786399 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00746 0.114 0.12 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -856438 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0616 0.11 0.12 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -630602 sc-eQTL 3.57e-01 0.112 0.121 0.12 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 48587 sc-eQTL 2.43e-01 -0.143 0.122 0.12 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C -47159 sc-eQTL 3.57e-01 -0.107 0.116 0.12 CD8T L1
ENSG00000132849 PATJ 994567 sc-eQTL 8.00e-01 0.018 0.0711 0.12 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -856748 sc-eQTL 2.34e-01 -0.155 0.13 0.12 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 300676 sc-eQTL 3.62e-01 0.0926 0.101 0.12 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -786399 sc-eQTL 7.47e-01 0.0419 0.13 0.12 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -856438 sc-eQTL 3.35e-01 0.118 0.122 0.117 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -630602 sc-eQTL 7.65e-01 0.0378 0.126 0.117 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 48587 sc-eQTL 3.88e-01 0.112 0.129 0.117 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C -47159 sc-eQTL 1.01e-01 -0.165 0.1 0.117 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -856748 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0196 0.141 0.117 DC L1
ENSG00000162607 USP1 300676 sc-eQTL 1.98e-01 -0.159 0.123 0.117 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -786399 sc-eQTL 1.00e+00 -2.99e-05 0.123 0.117 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -856438 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0194 0.119 0.12 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -630602 sc-eQTL 1.89e-01 0.162 0.123 0.12 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 48587 sc-eQTL 1.81e-01 -0.16 0.119 0.12 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C -47159 sc-eQTL 4.89e-01 -0.056 0.0808 0.12 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -856748 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0373 0.128 0.12 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 300676 sc-eQTL 8.76e-01 0.0164 0.105 0.12 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 542124 sc-eQTL 4.16e-01 0.0798 0.0978 0.12 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -856438 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0361 0.102 0.118 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -630602 sc-eQTL 3.04e-01 0.123 0.12 0.118 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 48587 sc-eQTL 6.15e-03 -0.269 0.0971 0.118 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C -47159 sc-eQTL 9.49e-01 0.00678 0.106 0.118 NK L1
ENSG00000132849 PATJ 994567 sc-eQTL 2.15e-01 0.129 0.104 0.118 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -856748 sc-eQTL 1.97e-01 -0.17 0.131 0.118 NK L1
ENSG00000162607 USP1 300676 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0599 0.118 0.118 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -786399 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0582 0.143 0.118 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -856438 sc-eQTL 1.21e-01 -0.177 0.114 0.12 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -630602 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0785 0.115 0.12 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 48587 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0773 0.117 0.12 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C -47159 sc-eQTL 1.48e-01 -0.147 0.101 0.12 Other_T L1
ENSG00000132849 PATJ 994567 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0831 0.0944 0.12 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -856748 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0515 0.0899 0.12 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 300676 sc-eQTL 4.18e-01 0.0632 0.0779 0.12 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -786399 sc-eQTL 2.29e-01 -0.167 0.138 0.12 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -856438 sc-eQTL 4.28e-01 0.125 0.157 0.117 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -630602 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0206 0.151 0.117 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 48587 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0629 0.14 0.117 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C -47159 sc-eQTL 8.94e-01 0.0197 0.148 0.117 B_Activated L2
ENSG00000132849 PATJ 994567 sc-eQTL 2.43e-01 -0.146 0.125 0.117 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856748 sc-eQTL 3.63e-01 0.131 0.144 0.117 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 300676 sc-eQTL 1.97e-01 -0.201 0.156 0.117 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786399 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0497 0.136 0.117 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -856438 sc-eQTL 3.80e-01 -0.122 0.139 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -630602 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0639 0.141 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 48587 sc-eQTL 7.76e-02 -0.238 0.134 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C -47159 sc-eQTL 8.41e-01 0.023 0.114 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000132849 PATJ 994567 sc-eQTL 4.51e-01 0.0935 0.124 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856748 sc-eQTL 9.91e-01 0.00157 0.136 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 300676 sc-eQTL 2.32e-01 -0.163 0.136 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786399 sc-eQTL 1.23e-01 0.208 0.134 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -856438 sc-eQTL 9.76e-01 0.0041 0.136 0.119 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -630602 sc-eQTL 2.51e-01 -0.159 0.138 0.119 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 48587 sc-eQTL 5.08e-02 -0.252 0.128 0.119 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C -47159 sc-eQTL 9.31e-01 0.0107 0.123 0.119 B_Memory L2
ENSG00000132849 PATJ 994567 sc-eQTL 5.11e-02 0.239 0.122 0.119 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856748 sc-eQTL 9.54e-02 0.235 0.14 0.119 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 300676 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0915 0.142 0.119 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786399 sc-eQTL 7.47e-02 -0.249 0.139 0.119 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -856438 sc-eQTL 5.66e-02 -0.261 0.136 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -630602 sc-eQTL 7.44e-01 -0.045 0.138 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 48587 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0615 0.132 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C -47159 sc-eQTL 9.93e-01 0.000849 0.102 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000132849 PATJ 994567 sc-eQTL 3.94e-01 0.111 0.13 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856748 sc-eQTL 5.47e-01 0.0814 0.135 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 300676 sc-eQTL 8.51e-01 0.0224 0.119 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786399 sc-eQTL 4.26e-01 0.115 0.144 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -856438 sc-eQTL 6.07e-02 -0.253 0.134 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -630602 sc-eQTL 3.53e-01 0.131 0.141 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 48587 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0391 0.136 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C -47159 sc-eQTL 1.71e-01 0.178 0.13 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000132849 PATJ 994567 sc-eQTL 6.66e-01 0.0576 0.134 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856748 sc-eQTL 4.20e-01 0.114 0.141 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 300676 sc-eQTL 7.79e-01 0.0379 0.135 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786399 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0648 0.141 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -856438 sc-eQTL 5.07e-04 0.459 0.13 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -630602 sc-eQTL 7.68e-02 0.25 0.14 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 48587 sc-eQTL 1.44e-01 -0.181 0.123 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C -47159 sc-eQTL 9.47e-01 -0.0085 0.128 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000132849 PATJ 994567 sc-eQTL 4.17e-01 0.0832 0.102 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856748 sc-eQTL 9.54e-02 -0.228 0.136 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 300676 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0675 0.13 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786399 sc-eQTL 8.51e-01 0.0245 0.13 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -856438 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0535 0.111 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -630602 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0279 0.121 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 48587 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0795 0.119 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C -47159 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0786 0.105 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000132849 PATJ 994567 sc-eQTL 5.60e-01 0.0431 0.0738 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856748 sc-eQTL 4.55e-01 0.0962 0.128 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 300676 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0318 0.0982 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786399 sc-eQTL 7.71e-01 0.0372 0.128 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -856438 sc-eQTL 4.59e-01 0.0861 0.116 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -630602 sc-eQTL 3.65e-01 0.122 0.135 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 48587 sc-eQTL 2.12e-02 -0.274 0.118 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C -47159 sc-eQTL 5.65e-01 0.0671 0.116 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000132849 PATJ 994567 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0841 0.0933 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856748 sc-eQTL 9.28e-02 -0.23 0.136 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 300676 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0432 0.113 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786399 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0578 0.133 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -856438 sc-eQTL 2.96e-01 -0.143 0.137 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -630602 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0851 0.138 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 48587 sc-eQTL 3.80e-01 -0.118 0.134 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C -47159 sc-eQTL 2.30e-01 0.156 0.13 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000132849 PATJ 994567 sc-eQTL 6.76e-01 0.0508 0.122 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856748 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0207 0.135 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 300676 sc-eQTL 1.07e-01 -0.205 0.127 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786399 sc-eQTL 4.02e-01 0.117 0.139 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -856438 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0438 0.125 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -630602 sc-eQTL 6.03e-01 -0.069 0.133 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 48587 sc-eQTL 1.96e-01 -0.163 0.125 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C -47159 sc-eQTL 1.89e-02 -0.313 0.132 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000132849 PATJ 994567 sc-eQTL 3.80e-01 -0.111 0.127 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856748 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0568 0.139 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 300676 sc-eQTL 7.98e-01 0.032 0.125 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786399 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00888 0.143 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -856438 sc-eQTL 8.02e-01 0.0319 0.127 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -630602 sc-eQTL 1.61e-01 0.184 0.131 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 48587 sc-eQTL 2.67e-01 0.151 0.135 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C -47159 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0119 0.13 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000132849 PATJ 994567 sc-eQTL 9.23e-01 0.00971 0.0997 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856748 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0661 0.132 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 300676 sc-eQTL 8.35e-01 0.0234 0.112 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786399 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0927 0.124 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -856438 sc-eQTL 9.41e-01 0.0106 0.143 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -630602 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0815 0.145 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 48587 sc-eQTL 2.68e-01 -0.157 0.141 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C -47159 sc-eQTL 6.94e-01 0.0569 0.145 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000132849 PATJ 994567 sc-eQTL 7.72e-01 0.0385 0.133 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856748 sc-eQTL 2.11e-01 -0.176 0.14 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 300676 sc-eQTL 8.48e-01 0.0259 0.135 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786399 sc-eQTL 2.26e-01 0.173 0.143 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -856438 sc-eQTL 9.10e-01 0.016 0.142 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -630602 sc-eQTL 3.19e-01 -0.142 0.142 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 48587 sc-eQTL 2.40e-01 0.162 0.137 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C -47159 sc-eQTL 3.74e-01 -0.118 0.132 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000132849 PATJ 994567 sc-eQTL 5.20e-01 0.0865 0.134 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856748 sc-eQTL 3.62e-01 -0.131 0.143 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 300676 sc-eQTL 5.82e-01 0.0754 0.137 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786399 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0374 0.139 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -856438 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0436 0.131 0.121 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -630602 sc-eQTL 8.62e-01 0.0226 0.13 0.121 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 48587 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0359 0.124 0.121 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C -47159 sc-eQTL 4.57e-02 -0.261 0.13 0.121 MAIT L2
ENSG00000132849 PATJ 994567 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0249 0.111 0.121 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856748 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0185 0.131 0.121 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 300676 sc-eQTL 8.13e-02 -0.227 0.13 0.121 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786399 sc-eQTL 8.02e-02 -0.236 0.134 0.121 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -856438 sc-eQTL 4.90e-01 0.0937 0.136 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -630602 sc-eQTL 5.60e-01 0.0812 0.139 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 48587 sc-eQTL 2.69e-01 -0.133 0.12 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C -47159 sc-eQTL 7.01e-01 0.0518 0.135 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000132849 PATJ 994567 sc-eQTL 1.11e-01 0.21 0.131 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856748 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0588 0.14 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 300676 sc-eQTL 1.29e-01 -0.219 0.144 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786399 sc-eQTL 3.15e-01 0.139 0.138 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -856438 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0772 0.106 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -630602 sc-eQTL 9.43e-01 0.0096 0.135 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 48587 sc-eQTL 2.06e-01 -0.149 0.117 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C -47159 sc-eQTL 6.68e-01 0.0512 0.119 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000132849 PATJ 994567 sc-eQTL 1.79e-02 0.305 0.128 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856748 sc-eQTL 2.01e-01 -0.174 0.135 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 300676 sc-eQTL 2.23e-01 -0.16 0.131 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786399 sc-eQTL 4.23e-01 -0.117 0.146 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -856438 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0609 0.141 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -630602 sc-eQTL 8.10e-02 0.254 0.145 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 48587 sc-eQTL 2.39e-01 -0.131 0.111 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C -47159 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0634 0.13 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000132849 PATJ 994567 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0555 0.12 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856748 sc-eQTL 2.31e-01 -0.163 0.136 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 300676 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0604 0.142 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786399 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0883 0.13 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -856438 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00217 0.116 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -630602 sc-eQTL 8.44e-01 0.026 0.131 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 48587 sc-eQTL 4.48e-04 -0.422 0.118 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C -47159 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0191 0.125 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000132849 PATJ 994567 sc-eQTL 1.21e-01 -0.204 0.131 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856748 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00391 0.129 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 300676 sc-eQTL 6.71e-01 0.0576 0.136 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786399 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0623 0.137 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -856438 sc-eQTL 9.11e-01 0.0174 0.155 0.141 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -630602 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0279 0.162 0.141 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 48587 sc-eQTL 9.15e-01 0.0186 0.174 0.141 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C -47159 sc-eQTL 1.83e-01 0.201 0.15 0.141 PB L2
ENSG00000132849 PATJ 994567 sc-eQTL 7.54e-01 0.0494 0.157 0.141 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856748 sc-eQTL 4.79e-01 -0.107 0.151 0.141 PB L2
ENSG00000162607 USP1 300676 sc-eQTL 8.08e-01 0.0366 0.15 0.141 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786399 sc-eQTL 3.55e-01 -0.154 0.165 0.141 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -856438 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0948 0.126 0.117 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -630602 sc-eQTL 2.58e-01 -0.145 0.128 0.117 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 48587 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0991 0.128 0.117 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C -47159 sc-eQTL 9.87e-01 0.00186 0.113 0.117 Pro_T L2
ENSG00000132849 PATJ 994567 sc-eQTL 1.47e-01 -0.178 0.122 0.117 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856748 sc-eQTL 3.99e-01 0.0953 0.113 0.117 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 300676 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0574 0.0775 0.117 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786399 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0446 0.131 0.117 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -856438 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0158 0.132 0.12 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -630602 sc-eQTL 6.94e-02 -0.255 0.14 0.12 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 48587 sc-eQTL 2.00e-01 -0.166 0.129 0.12 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C -47159 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0714 0.132 0.12 Treg L2
ENSG00000132849 PATJ 994567 sc-eQTL 9.80e-01 0.00301 0.123 0.12 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856748 sc-eQTL 4.08e-01 0.115 0.138 0.12 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 300676 sc-eQTL 7.61e-01 0.0408 0.134 0.12 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786399 sc-eQTL 3.04e-01 -0.136 0.132 0.12 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -856438 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0151 0.134 0.117 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -630602 sc-eQTL 2.57e-01 0.154 0.136 0.117 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 48587 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00293 0.134 0.117 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C -47159 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0879 0.116 0.117 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856748 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0355 0.147 0.117 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 300676 sc-eQTL 3.88e-01 -0.113 0.131 0.117 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786399 sc-eQTL 3.74e-01 0.105 0.118 0.117 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -856438 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0506 0.123 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -630602 sc-eQTL 3.93e-01 0.106 0.123 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 48587 sc-eQTL 1.02e-01 -0.213 0.13 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C -47159 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0599 0.0916 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856748 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0635 0.13 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 300676 sc-eQTL 5.92e-01 0.0614 0.114 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 542124 sc-eQTL 8.65e-01 0.0196 0.115 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -856438 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0556 0.138 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -630602 sc-eQTL 5.22e-01 0.0894 0.139 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 48587 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0814 0.129 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C -47159 sc-eQTL 7.27e-01 0.0391 0.112 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856748 sc-eQTL 3.57e-01 0.116 0.126 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 300676 sc-eQTL 3.28e-01 -0.127 0.13 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 542124 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0469 0.108 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -856438 sc-eQTL 8.75e-02 -0.268 0.156 0.127 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -630602 sc-eQTL 9.89e-01 0.00223 0.168 0.127 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 48587 sc-eQTL 9.90e-01 0.00208 0.164 0.127 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C -47159 sc-eQTL 4.83e-01 0.11 0.157 0.127 gdT L2
ENSG00000132849 PATJ 994567 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0893 0.153 0.127 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856748 sc-eQTL 8.77e-01 0.0258 0.167 0.127 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 300676 sc-eQTL 4.13e-02 0.32 0.156 0.127 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786399 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0401 0.164 0.127 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -856438 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0862 0.141 0.118 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -630602 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0441 0.131 0.118 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 48587 sc-eQTL 1.77e-01 0.181 0.134 0.118 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C -47159 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0924 0.128 0.118 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856748 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0857 0.141 0.118 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 300676 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0561 0.144 0.118 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 542124 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0103 0.106 0.118 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -856438 sc-eQTL 4.44e-01 0.0994 0.13 0.111 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -630602 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0978 0.142 0.111 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 48587 sc-eQTL 3.70e-01 -0.126 0.14 0.111 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C -47159 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0621 0.131 0.111 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856748 sc-eQTL 9.22e-01 0.0135 0.137 0.111 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 300676 sc-eQTL 8.54e-01 0.0258 0.14 0.111 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 542124 sc-eQTL 2.04e-01 0.126 0.099 0.111 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -856438 sc-eQTL 9.52e-01 0.00937 0.156 0.11 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -630602 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00558 0.152 0.11 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 48587 sc-eQTL 2.79e-01 0.168 0.154 0.11 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C -47159 sc-eQTL 1.86e-01 -0.184 0.138 0.11 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856748 sc-eQTL 2.64e-02 0.344 0.154 0.11 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 300676 sc-eQTL 3.48e-01 -0.149 0.159 0.11 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786399 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0835 0.138 0.11 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -856438 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0293 0.129 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -630602 sc-eQTL 3.39e-01 -0.136 0.142 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 48587 sc-eQTL 2.13e-02 -0.283 0.122 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -47159 sc-eQTL 8.13e-01 0.0236 0.1 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 994567 sc-eQTL 8.76e-02 0.189 0.11 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -856748 sc-eQTL 1.71e-01 0.18 0.131 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 300676 sc-eQTL 2.28e-01 -0.154 0.127 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -786399 sc-eQTL 9.13e-01 0.0151 0.137 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -856438 sc-eQTL 5.87e-03 -0.365 0.131 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -630602 sc-eQTL 8.68e-01 0.0228 0.137 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 48587 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0809 0.128 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -47159 sc-eQTL 4.84e-01 0.0686 0.0978 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 994567 sc-eQTL 3.63e-01 0.107 0.117 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -856748 sc-eQTL 4.99e-01 0.0935 0.138 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 300676 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00347 0.119 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -786399 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00491 0.139 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -856438 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0311 0.126 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -630602 sc-eQTL 2.66e-01 0.136 0.122 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 48587 sc-eQTL 1.74e-01 -0.167 0.122 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -47159 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0363 0.0849 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -856748 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0341 0.126 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 300676 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0181 0.107 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 542124 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0453 0.116 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -856438 sc-eQTL 7.31e-01 0.0425 0.124 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -630602 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0337 0.14 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 48587 sc-eQTL 9.01e-01 0.0173 0.139 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -47159 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0941 0.118 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -856748 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0494 0.137 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 300676 sc-eQTL 3.20e-01 0.128 0.129 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 542124 sc-eQTL 2.89e-01 0.0933 0.0878 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -856438 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0568 0.104 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -630602 sc-eQTL 5.24e-01 0.0797 0.125 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 48587 sc-eQTL 1.73e-02 -0.265 0.11 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -47159 sc-eQTL 8.38e-01 0.0228 0.112 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 994567 sc-eQTL 3.95e-01 0.102 0.12 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -856748 sc-eQTL 1.13e-01 -0.21 0.132 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 300676 sc-eQTL 9.14e-01 -0.013 0.12 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -786399 sc-eQTL 2.28e-01 -0.176 0.146 0.119 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116641 \N 48605 1.08e-05 1.26e-05 1.25e-06 6.41e-06 2.28e-06 5.08e-06 1.19e-05 1.85e-06 1e-05 4.92e-06 1.35e-05 5.78e-06 1.81e-05 3.9e-06 2.82e-06 6.45e-06 5.17e-06 7.7e-06 2.66e-06 2.78e-06 5.16e-06 9.68e-06 8.65e-06 3.15e-06 1.58e-05 3.55e-06 4.8e-06 3.66e-06 1.12e-05 9.11e-06 6.59e-06 8.39e-07 1.29e-06 3.01e-06 4.55e-06 2.07e-06 1.72e-06 1.94e-06 1.94e-06 9.53e-07 8.2e-07 1.35e-05 1.39e-06 1.75e-07 6.94e-07 1.57e-06 1.35e-06 7.14e-07 5.82e-07
ENSG00000162607 \N 300676 1.3e-06 9.34e-07 3.41e-07 9.87e-07 1.77e-07 5.4e-07 1.32e-06 3.3e-07 1.2e-06 3.78e-07 1.39e-06 5.97e-07 2.01e-06 2.76e-07 4.35e-07 5.81e-07 8.9e-07 5.75e-07 5.88e-07 6.83e-07 4.39e-07 1.2e-06 8.26e-07 5.91e-07 2.05e-06 3.02e-07 7.55e-07 6.46e-07 1.04e-06 1.22e-06 5.77e-07 2.1e-07 2.19e-07 5.21e-07 5.34e-07 3.1e-07 5.1e-07 2.24e-07 3.93e-07 3.11e-07 2.59e-07 1.41e-06 9.66e-08 9.61e-08 1.64e-07 7.22e-08 2.26e-07 9.04e-08 7.91e-08