logo

Genes within 1Mb (chr1:62736922:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -856489 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0897 0.0908 0.229 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -630653 sc-eQTL 9.66e-01 0.00401 0.0943 0.229 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 48536 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0944 0.0941 0.229 B L1
ENSG00000125703 ATG4C -47210 sc-eQTL 6.41e-01 0.0306 0.0655 0.229 B L1
ENSG00000132849 PATJ 994516 sc-eQTL 2.63e-01 0.0889 0.0793 0.229 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -856799 sc-eQTL 4.44e-01 0.0799 0.104 0.229 B L1
ENSG00000162607 USP1 300625 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0368 0.0905 0.229 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -786450 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0186 0.107 0.229 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -856489 sc-eQTL 8.34e-01 0.0162 0.077 0.229 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -630653 sc-eQTL 8.05e-01 -0.021 0.085 0.229 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 48536 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0104 0.0861 0.229 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C -47210 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0352 0.0694 0.229 CD4T L1
ENSG00000132849 PATJ 994516 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0574 0.0563 0.229 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -856799 sc-eQTL 9.36e-01 0.00797 0.0986 0.229 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 300625 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0583 0.0673 0.229 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -786450 sc-eQTL 7.59e-01 0.0272 0.0885 0.229 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -856489 sc-eQTL 5.55e-01 0.0511 0.0864 0.229 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -630653 sc-eQTL 7.19e-01 0.0343 0.0953 0.229 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 48536 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0998 0.0963 0.229 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C -47210 sc-eQTL 3.86e-03 -0.263 0.0899 0.229 CD8T L1
ENSG00000132849 PATJ 994516 sc-eQTL 6.04e-01 -0.029 0.0559 0.229 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -856799 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00374 0.103 0.229 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 300625 sc-eQTL 8.12e-01 -0.019 0.0799 0.229 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -786450 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0334 0.102 0.229 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -856489 sc-eQTL 1.28e-01 0.145 0.0951 0.227 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -630653 sc-eQTL 9.57e-01 0.00528 0.0987 0.227 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 48536 sc-eQTL 3.48e-01 0.0949 0.101 0.227 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C -47210 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0705 0.079 0.227 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -856799 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0753 0.111 0.227 DC L1
ENSG00000162607 USP1 300625 sc-eQTL 1.53e-01 -0.138 0.0961 0.227 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -786450 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0277 0.0963 0.227 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -856489 sc-eQTL 4.92e-01 0.064 0.093 0.229 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -630653 sc-eQTL 7.03e-03 0.26 0.0955 0.229 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 48536 sc-eQTL 2.19e-01 -0.115 0.0936 0.229 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C -47210 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0574 0.0634 0.229 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -856799 sc-eQTL 6.29e-01 0.0485 0.1 0.229 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 300625 sc-eQTL 9.08e-01 0.00953 0.0824 0.229 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 542073 sc-eQTL 2.53e-01 0.0879 0.0767 0.229 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -856489 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0233 0.079 0.227 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -630653 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0351 0.0926 0.227 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 48536 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0687 0.0762 0.227 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C -47210 sc-eQTL 2.21e-01 -0.1 0.0817 0.227 NK L1
ENSG00000132849 PATJ 994516 sc-eQTL 2.34e-01 0.0957 0.0801 0.227 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -856799 sc-eQTL 8.45e-01 0.02 0.102 0.227 NK L1
ENSG00000162607 USP1 300625 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0682 0.0909 0.227 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -786450 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0442 0.111 0.227 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -856489 sc-eQTL 8.09e-01 0.0219 0.0904 0.229 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -630653 sc-eQTL 2.50e-01 -0.104 0.0906 0.229 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 48536 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0249 0.0927 0.229 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C -47210 sc-eQTL 1.65e-01 -0.111 0.0799 0.229 Other_T L1
ENSG00000132849 PATJ 994516 sc-eQTL 2.25e-01 -0.0907 0.0745 0.229 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -856799 sc-eQTL 5.50e-01 0.0426 0.0712 0.229 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 300625 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0361 0.0617 0.229 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -786450 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0611 0.11 0.229 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -856489 sc-eQTL 3.56e-01 0.114 0.123 0.224 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -630653 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0274 0.118 0.224 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 48536 sc-eQTL 7.86e-01 0.0299 0.11 0.224 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C -47210 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0148 0.116 0.224 B_Activated L2
ENSG00000132849 PATJ 994516 sc-eQTL 1.84e-01 -0.13 0.0977 0.224 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856799 sc-eQTL 4.13e-01 0.0924 0.113 0.224 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 300625 sc-eQTL 2.97e-01 -0.128 0.122 0.224 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786450 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0412 0.107 0.224 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -856489 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0867 0.109 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -630653 sc-eQTL 3.40e-01 0.106 0.11 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 48536 sc-eQTL 5.90e-01 0.057 0.106 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C -47210 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00917 0.0895 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000132849 PATJ 994516 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0539 0.0968 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856799 sc-eQTL 6.65e-01 0.0463 0.107 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 300625 sc-eQTL 1.28e-01 -0.162 0.106 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786450 sc-eQTL 2.95e-01 0.111 0.105 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -856489 sc-eQTL 8.38e-01 0.0218 0.106 0.228 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -630653 sc-eQTL 2.90e-01 -0.114 0.108 0.228 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 48536 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0922 0.101 0.228 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C -47210 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0459 0.0962 0.228 B_Memory L2
ENSG00000132849 PATJ 994516 sc-eQTL 6.16e-02 0.179 0.0953 0.228 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856799 sc-eQTL 3.19e-01 0.11 0.11 0.228 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 300625 sc-eQTL 1.86e-01 -0.147 0.111 0.228 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786450 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0583 0.109 0.228 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -856489 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0543 0.108 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -630653 sc-eQTL 6.79e-01 0.0449 0.108 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 48536 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0655 0.104 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C -47210 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0206 0.0799 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000132849 PATJ 994516 sc-eQTL 8.71e-01 0.0167 0.103 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856799 sc-eQTL 5.59e-01 0.062 0.106 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 300625 sc-eQTL 4.97e-01 0.0634 0.0932 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786450 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00212 0.113 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -856489 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0505 0.107 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -630653 sc-eQTL 4.86e-01 0.0775 0.111 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 48536 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0777 0.107 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C -47210 sc-eQTL 6.35e-02 0.191 0.102 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000132849 PATJ 994516 sc-eQTL 7.25e-01 0.0371 0.105 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856799 sc-eQTL 5.63e-01 0.0646 0.112 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 300625 sc-eQTL 4.71e-01 0.0767 0.106 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786450 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0744 0.111 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -856489 sc-eQTL 9.31e-04 0.35 0.104 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -630653 sc-eQTL 1.15e-01 0.178 0.112 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 48536 sc-eQTL 2.53e-02 -0.22 0.0977 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C -47210 sc-eQTL 1.86e-01 -0.135 0.102 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000132849 PATJ 994516 sc-eQTL 1.34e-01 0.123 0.0815 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856799 sc-eQTL 1.32e-01 -0.165 0.109 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 300625 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0571 0.104 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786450 sc-eQTL 2.81e-01 0.112 0.104 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -856489 sc-eQTL 7.40e-01 0.0288 0.0864 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -630653 sc-eQTL 6.95e-02 -0.17 0.0932 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 48536 sc-eQTL 2.42e-01 0.108 0.092 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C -47210 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0574 0.0815 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000132849 PATJ 994516 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0425 0.0572 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856799 sc-eQTL 4.04e-01 0.0831 0.0995 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 300625 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0307 0.0761 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786450 sc-eQTL 6.55e-01 0.0443 0.0989 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -856489 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0137 0.0898 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -630653 sc-eQTL 3.83e-02 0.215 0.103 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 48536 sc-eQTL 5.10e-01 -0.061 0.0923 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C -47210 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00182 0.09 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000132849 PATJ 994516 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0702 0.0721 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856799 sc-eQTL 2.79e-01 -0.115 0.106 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 300625 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0459 0.0869 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786450 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0567 0.103 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -856489 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0719 0.107 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -630653 sc-eQTL 7.83e-01 0.0297 0.108 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 48536 sc-eQTL 9.27e-01 0.00968 0.105 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C -47210 sc-eQTL 3.05e-01 0.105 0.102 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000132849 PATJ 994516 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0534 0.095 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856799 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00774 0.105 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 300625 sc-eQTL 8.75e-02 -0.17 0.099 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786450 sc-eQTL 7.72e-01 0.0316 0.109 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -856489 sc-eQTL 5.19e-01 0.063 0.0977 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -630653 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0143 0.104 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 48536 sc-eQTL 1.81e-01 -0.132 0.0982 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C -47210 sc-eQTL 6.74e-04 -0.353 0.102 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000132849 PATJ 994516 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0321 0.0994 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856799 sc-eQTL 6.37e-01 0.0516 0.109 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 300625 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0275 0.0978 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786450 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0369 0.112 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -856489 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0137 0.0993 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -630653 sc-eQTL 5.81e-01 0.0568 0.103 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 48536 sc-eQTL 7.79e-02 0.187 0.105 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C -47210 sc-eQTL 1.03e-01 -0.166 0.101 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000132849 PATJ 994516 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0277 0.078 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856799 sc-eQTL 8.75e-01 0.0162 0.103 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 300625 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0209 0.0873 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786450 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0621 0.0973 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -856489 sc-eQTL 2.92e-01 0.118 0.112 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -630653 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0173 0.114 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 48536 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0633 0.111 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C -47210 sc-eQTL 7.75e-01 0.0325 0.114 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000132849 PATJ 994516 sc-eQTL 7.79e-01 0.0294 0.105 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856799 sc-eQTL 6.36e-01 0.0524 0.11 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 300625 sc-eQTL 2.60e-01 -0.12 0.106 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786450 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00535 0.113 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -856489 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0477 0.116 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -630653 sc-eQTL 1.13e-01 -0.185 0.116 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 48536 sc-eQTL 5.70e-01 0.0643 0.113 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C -47210 sc-eQTL 8.14e-02 -0.189 0.108 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000132849 PATJ 994516 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0214 0.11 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856799 sc-eQTL 1.56e-01 -0.166 0.117 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 300625 sc-eQTL 3.40e-01 0.107 0.112 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786450 sc-eQTL 8.82e-01 0.0169 0.114 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -856489 sc-eQTL 6.95e-02 0.19 0.104 0.229 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -630653 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0577 0.104 0.229 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 48536 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0427 0.0993 0.229 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C -47210 sc-eQTL 6.66e-02 -0.192 0.104 0.229 MAIT L2
ENSG00000132849 PATJ 994516 sc-eQTL 2.35e-01 -0.105 0.0883 0.229 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856799 sc-eQTL 5.66e-01 0.0602 0.105 0.229 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 300625 sc-eQTL 1.88e-01 -0.137 0.104 0.229 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786450 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0948 0.108 0.229 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -856489 sc-eQTL 2.89e-01 0.112 0.105 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -630653 sc-eQTL 3.76e-01 0.0954 0.108 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 48536 sc-eQTL 4.80e-01 0.0661 0.0933 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C -47210 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0391 0.104 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000132849 PATJ 994516 sc-eQTL 1.93e-01 0.133 0.102 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856799 sc-eQTL 8.49e-01 0.0207 0.109 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 300625 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0619 0.112 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786450 sc-eQTL 3.35e-01 0.103 0.107 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -856489 sc-eQTL 5.26e-01 0.0521 0.0821 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -630653 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0288 0.104 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 48536 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0651 0.0906 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C -47210 sc-eQTL 9.60e-01 0.00465 0.0921 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000132849 PATJ 994516 sc-eQTL 1.16e-02 0.251 0.0984 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856799 sc-eQTL 7.63e-01 0.0316 0.105 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 300625 sc-eQTL 1.11e-01 -0.162 0.101 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786450 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0949 0.113 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -856489 sc-eQTL 1.99e-01 -0.142 0.11 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -630653 sc-eQTL 7.79e-01 0.0323 0.115 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 48536 sc-eQTL 5.24e-01 -0.056 0.0878 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C -47210 sc-eQTL 2.03e-01 -0.13 0.102 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000132849 PATJ 994516 sc-eQTL 4.24e-01 0.0759 0.0947 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856799 sc-eQTL 4.34e-01 0.084 0.107 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 300625 sc-eQTL 3.40e-01 -0.107 0.112 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786450 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0652 0.102 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -856489 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0382 0.09 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -630653 sc-eQTL 7.04e-02 -0.184 0.101 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 48536 sc-eQTL 5.27e-02 -0.182 0.0934 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C -47210 sc-eQTL 2.01e-01 -0.123 0.096 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000132849 PATJ 994516 sc-eQTL 6.85e-02 -0.185 0.101 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856799 sc-eQTL 4.65e-01 0.0731 0.0997 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 300625 sc-eQTL 3.45e-01 0.0991 0.105 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786450 sc-eQTL 3.16e-01 -0.107 0.106 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -856489 sc-eQTL 6.04e-01 0.0667 0.128 0.241 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -630653 sc-eQTL 3.84e-01 -0.118 0.135 0.241 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 48536 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0354 0.144 0.241 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C -47210 sc-eQTL 4.16e-01 0.102 0.125 0.241 PB L2
ENSG00000132849 PATJ 994516 sc-eQTL 6.03e-01 0.0681 0.131 0.241 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856799 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0839 0.125 0.241 PB L2
ENSG00000162607 USP1 300625 sc-eQTL 3.10e-01 -0.127 0.124 0.241 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786450 sc-eQTL 9.42e-01 0.0101 0.138 0.241 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -856489 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0629 0.0985 0.228 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -630653 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00608 0.1 0.228 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 48536 sc-eQTL 9.89e-02 -0.166 0.1 0.228 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C -47210 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00442 0.0881 0.228 Pro_T L2
ENSG00000132849 PATJ 994516 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00511 0.0962 0.228 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856799 sc-eQTL 4.46e-01 0.0674 0.0883 0.228 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 300625 sc-eQTL 1.92e-01 -0.0793 0.0605 0.228 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786450 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0453 0.103 0.228 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -856489 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00578 0.103 0.229 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -630653 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0905 0.11 0.229 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 48536 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0606 0.101 0.229 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C -47210 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0576 0.104 0.229 Treg L2
ENSG00000132849 PATJ 994516 sc-eQTL 6.05e-01 0.0498 0.0961 0.229 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856799 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00354 0.109 0.229 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 300625 sc-eQTL 6.82e-01 0.0431 0.105 0.229 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786450 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00548 0.104 0.229 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -856489 sc-eQTL 3.98e-01 0.0884 0.104 0.232 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -630653 sc-eQTL 2.28e-01 0.128 0.106 0.232 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 48536 sc-eQTL 9.94e-01 0.000794 0.104 0.232 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C -47210 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0737 0.0902 0.232 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856799 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0969 0.114 0.232 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 300625 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0426 0.102 0.232 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786450 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0236 0.092 0.232 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -856489 sc-eQTL 8.16e-01 0.0224 0.0965 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -630653 sc-eQTL 7.74e-02 0.17 0.0959 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 48536 sc-eQTL 1.27e-01 -0.155 0.101 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C -47210 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0665 0.0715 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856799 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0094 0.101 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 300625 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0169 0.0895 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 542073 sc-eQTL 3.90e-01 0.0773 0.0897 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -856489 sc-eQTL 5.51e-01 0.0641 0.107 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -630653 sc-eQTL 2.68e-03 0.324 0.107 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 48536 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00787 0.101 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C -47210 sc-eQTL 9.06e-01 0.0103 0.0874 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856799 sc-eQTL 4.84e-01 0.069 0.0985 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 300625 sc-eQTL 3.76e-01 0.0899 0.101 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 542073 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0838 0.0843 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -856489 sc-eQTL 2.45e-01 -0.142 0.121 0.236 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -630653 sc-eQTL 4.23e-01 0.104 0.13 0.236 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 48536 sc-eQTL 5.20e-01 0.0822 0.127 0.236 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C -47210 sc-eQTL 1.97e-01 0.157 0.121 0.236 gdT L2
ENSG00000132849 PATJ 994516 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0403 0.119 0.236 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856799 sc-eQTL 6.87e-01 0.0522 0.129 0.236 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 300625 sc-eQTL 3.57e-01 0.113 0.122 0.236 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786450 sc-eQTL 6.49e-01 0.0581 0.127 0.236 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -856489 sc-eQTL 3.01e-01 -0.112 0.108 0.227 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -630653 sc-eQTL 1.88e-01 -0.133 0.1 0.227 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 48536 sc-eQTL 7.62e-01 0.0311 0.103 0.227 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C -47210 sc-eQTL 1.30e-01 -0.148 0.0976 0.227 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856799 sc-eQTL 7.72e-01 0.0314 0.108 0.227 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 300625 sc-eQTL 3.63e-01 0.1 0.11 0.227 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 542073 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0436 0.0809 0.227 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -856489 sc-eQTL 6.72e-01 0.0416 0.0981 0.226 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -630653 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0896 0.108 0.226 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 48536 sc-eQTL 2.78e-01 -0.115 0.106 0.226 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C -47210 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0269 0.0991 0.226 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856799 sc-eQTL 6.65e-01 0.045 0.104 0.226 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 300625 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0171 0.106 0.226 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 542073 sc-eQTL 1.98e-01 0.0967 0.0748 0.226 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -856489 sc-eQTL 9.52e-01 0.00717 0.119 0.234 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -630653 sc-eQTL 2.76e-01 -0.126 0.115 0.234 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 48536 sc-eQTL 2.94e-01 0.124 0.118 0.234 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C -47210 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0488 0.106 0.234 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -856799 sc-eQTL 2.18e-01 0.147 0.119 0.234 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 300625 sc-eQTL 6.67e-02 -0.222 0.12 0.234 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -786450 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0392 0.105 0.234 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -856489 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00992 0.101 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -630653 sc-eQTL 8.18e-01 0.0257 0.111 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 48536 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0425 0.0967 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -47210 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0272 0.0782 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 994516 sc-eQTL 6.19e-01 0.0431 0.0866 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -856799 sc-eQTL 1.14e-01 0.162 0.102 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 300625 sc-eQTL 2.45e-02 -0.223 0.0986 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -786450 sc-eQTL 7.53e-01 0.0337 0.107 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -856489 sc-eQTL 3.31e-01 -0.102 0.105 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -630653 sc-eQTL 6.65e-01 0.0468 0.108 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 48536 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0649 0.101 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -47210 sc-eQTL 6.09e-01 0.0394 0.0769 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 994516 sc-eQTL 7.89e-01 0.0246 0.092 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -856799 sc-eQTL 4.87e-01 0.0756 0.109 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 300625 sc-eQTL 6.65e-01 0.0405 0.0934 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -786450 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0748 0.109 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -856489 sc-eQTL 4.20e-01 0.0794 0.0983 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -630653 sc-eQTL 1.36e-03 0.302 0.093 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 48536 sc-eQTL 2.72e-01 -0.105 0.0957 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -47210 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0325 0.0663 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -856799 sc-eQTL 9.89e-01 0.00134 0.0981 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 300625 sc-eQTL 6.79e-01 0.0347 0.0838 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 542073 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0235 0.0909 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -856489 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0235 0.0951 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -630653 sc-eQTL 3.21e-01 -0.107 0.108 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 48536 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0677 0.107 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -47210 sc-eQTL 1.61e-01 -0.128 0.0907 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -856799 sc-eQTL 4.89e-01 0.0733 0.106 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 300625 sc-eQTL 4.57e-01 0.074 0.0993 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 542073 sc-eQTL 2.36e-01 0.0804 0.0676 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -856489 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0287 0.0803 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -630653 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0927 0.0962 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 48536 sc-eQTL 2.10e-01 -0.108 0.086 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -47210 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0905 0.086 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 994516 sc-eQTL 3.49e-01 0.0871 0.0927 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -856799 sc-eQTL 9.38e-01 0.00797 0.102 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 300625 sc-eQTL 5.83e-01 -0.051 0.0927 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -786450 sc-eQTL 3.30e-01 -0.11 0.113 0.228 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116641 \N 48554 1.21e-05 1.4e-05 1.9e-06 7.65e-06 2.38e-06 5.65e-06 1.59e-05 2.2e-06 1.2e-05 6.02e-06 1.68e-05 6.79e-06 2.28e-05 5.14e-06 3.87e-06 7.34e-06 6.8e-06 9.82e-06 3.29e-06 3.15e-06 6.66e-06 1.18e-05 1.2e-05 3.67e-06 2.22e-05 4.42e-06 6.68e-06 5.2e-06 1.35e-05 1.15e-05 8.36e-06 9.95e-07 1.22e-06 3.59e-06 5.44e-06 2.77e-06 1.82e-06 2.02e-06 2.05e-06 1.15e-06 9.92e-07 1.8e-05 1.79e-06 1.52e-07 7.57e-07 1.96e-06 1.86e-06 7.39e-07 4.39e-07
ENSG00000162607 \N 300625 1.43e-06 1.33e-06 3.12e-07 1.25e-06 3.45e-07 5.99e-07 1.48e-06 3.82e-07 1.66e-06 6.07e-07 2.1e-06 9.12e-07 2.49e-06 3.9e-07 5.36e-07 9.85e-07 9.64e-07 8e-07 8.3e-07 5.15e-07 8.02e-07 1.69e-06 1.14e-06 5.61e-07 2.45e-06 6.57e-07 9.45e-07 9.6e-07 1.63e-06 1.2e-06 8.17e-07 1.92e-07 1.88e-07 6.58e-07 5.6e-07 4.44e-07 5.61e-07 2.29e-07 4.94e-07 2.76e-07 2.84e-07 2.01e-06 1.93e-07 6.46e-08 2.98e-07 1.97e-07 2.18e-07 7e-08 9.42e-08