logo

Genes within 1Mb (chr1:62731481:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -861930 sc-eQTL 4.66e-02 -0.222 0.111 0.122 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -636094 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0483 0.116 0.122 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 43095 sc-eQTL 1.94e-02 -0.27 0.115 0.122 B L1
ENSG00000125703 ATG4C -52651 sc-eQTL 2.24e-01 0.0982 0.0805 0.122 B L1
ENSG00000132849 PATJ 989075 sc-eQTL 5.17e-02 0.19 0.0971 0.122 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -862240 sc-eQTL 7.71e-01 0.0374 0.128 0.122 B L1
ENSG00000162607 USP1 295184 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0297 0.112 0.122 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -791891 sc-eQTL 9.01e-01 0.0164 0.132 0.122 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -861930 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0359 0.0964 0.122 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -636094 sc-eQTL 7.50e-01 0.034 0.106 0.122 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 43095 sc-eQTL 4.73e-02 -0.213 0.107 0.122 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C -52651 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0131 0.087 0.122 CD4T L1
ENSG00000132849 PATJ 989075 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00474 0.0706 0.122 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -862240 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0529 0.123 0.122 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 295184 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0625 0.0843 0.122 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -791891 sc-eQTL 9.32e-01 0.00949 0.111 0.122 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -861930 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0712 0.107 0.122 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -636094 sc-eQTL 3.32e-01 0.114 0.118 0.122 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 43095 sc-eQTL 2.06e-01 -0.151 0.119 0.122 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C -52651 sc-eQTL 3.42e-01 -0.108 0.113 0.122 CD8T L1
ENSG00000132849 PATJ 989075 sc-eQTL 8.82e-01 0.0102 0.0691 0.122 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -862240 sc-eQTL 2.74e-01 -0.139 0.126 0.122 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 295184 sc-eQTL 3.77e-01 0.0873 0.0986 0.122 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -791891 sc-eQTL 7.60e-01 0.0387 0.126 0.122 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -861930 sc-eQTL 4.69e-01 0.0858 0.118 0.119 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -636094 sc-eQTL 8.70e-01 0.02 0.122 0.119 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 43095 sc-eQTL 4.98e-01 0.085 0.125 0.119 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C -52651 sc-eQTL 7.35e-02 -0.175 0.0973 0.119 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -862240 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0331 0.137 0.119 DC L1
ENSG00000162607 USP1 295184 sc-eQTL 1.64e-01 -0.166 0.119 0.119 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -791891 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00712 0.119 0.119 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -861930 sc-eQTL 8.08e-01 -0.028 0.115 0.122 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -636094 sc-eQTL 1.63e-01 0.168 0.12 0.122 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 43095 sc-eQTL 2.32e-01 -0.139 0.116 0.122 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C -52651 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0524 0.0786 0.122 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -862240 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0152 0.124 0.122 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 295184 sc-eQTL 9.66e-01 -0.0043 0.102 0.122 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 536632 sc-eQTL 3.52e-01 0.0887 0.0951 0.122 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -861930 sc-eQTL 7.56e-01 -0.031 0.0994 0.12 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -636094 sc-eQTL 4.57e-01 0.0868 0.116 0.12 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 43095 sc-eQTL 9.56e-03 -0.247 0.0945 0.12 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C -52651 sc-eQTL 7.92e-01 0.0273 0.103 0.12 NK L1
ENSG00000132849 PATJ 989075 sc-eQTL 2.25e-01 0.123 0.101 0.12 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -862240 sc-eQTL 1.82e-01 -0.171 0.128 0.12 NK L1
ENSG00000162607 USP1 295184 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0657 0.114 0.12 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -791891 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0562 0.139 0.12 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -861930 sc-eQTL 1.84e-01 -0.147 0.111 0.122 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -636094 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0766 0.111 0.122 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 43095 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0579 0.114 0.122 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C -52651 sc-eQTL 1.48e-01 -0.143 0.0981 0.122 Other_T L1
ENSG00000132849 PATJ 989075 sc-eQTL 3.78e-01 -0.081 0.0917 0.122 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -862240 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0562 0.0874 0.122 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 295184 sc-eQTL 4.05e-01 0.0632 0.0757 0.122 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -791891 sc-eQTL 2.45e-01 -0.157 0.135 0.122 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -861930 sc-eQTL 5.15e-01 0.0991 0.152 0.12 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -636094 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000876 0.146 0.12 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 43095 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0765 0.136 0.12 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C -52651 sc-eQTL 7.98e-01 0.0365 0.143 0.12 B_Activated L2
ENSG00000132849 PATJ 989075 sc-eQTL 2.36e-01 -0.144 0.121 0.12 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -862240 sc-eQTL 4.99e-01 0.0944 0.139 0.12 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 295184 sc-eQTL 1.61e-01 -0.212 0.15 0.12 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -791891 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0626 0.132 0.12 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -861930 sc-eQTL 3.52e-01 -0.126 0.135 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -636094 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0576 0.137 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 43095 sc-eQTL 6.31e-02 -0.243 0.13 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C -52651 sc-eQTL 9.46e-01 0.00751 0.111 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000132849 PATJ 989075 sc-eQTL 4.64e-01 0.0882 0.12 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -862240 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0188 0.132 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 295184 sc-eQTL 1.79e-01 -0.177 0.132 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -791891 sc-eQTL 7.86e-02 0.23 0.13 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -861930 sc-eQTL 9.98e-01 0.000334 0.132 0.121 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -636094 sc-eQTL 2.36e-01 -0.159 0.134 0.121 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 43095 sc-eQTL 3.35e-02 -0.267 0.125 0.121 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C -52651 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00229 0.12 0.121 B_Memory L2
ENSG00000132849 PATJ 989075 sc-eQTL 3.74e-02 0.248 0.119 0.121 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -862240 sc-eQTL 1.68e-01 0.189 0.137 0.121 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 295184 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0976 0.138 0.121 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -791891 sc-eQTL 7.04e-02 -0.246 0.135 0.121 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -861930 sc-eQTL 8.24e-02 -0.231 0.132 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -636094 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0492 0.134 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 43095 sc-eQTL 5.96e-01 -0.068 0.128 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C -52651 sc-eQTL 9.91e-01 0.00113 0.0987 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000132849 PATJ 989075 sc-eQTL 3.15e-01 0.127 0.127 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -862240 sc-eQTL 6.48e-01 0.0599 0.131 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 295184 sc-eQTL 8.12e-01 0.0274 0.115 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -791891 sc-eQTL 4.20e-01 0.113 0.139 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -861930 sc-eQTL 6.71e-02 -0.24 0.13 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -636094 sc-eQTL 3.25e-01 0.135 0.137 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 43095 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0353 0.132 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C -52651 sc-eQTL 1.39e-01 0.187 0.126 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000132849 PATJ 989075 sc-eQTL 6.22e-01 0.064 0.13 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -862240 sc-eQTL 5.03e-01 0.0923 0.137 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 295184 sc-eQTL 7.00e-01 0.0505 0.131 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -791891 sc-eQTL 6.09e-01 -0.07 0.137 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -861930 sc-eQTL 3.51e-04 0.458 0.126 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -636094 sc-eQTL 8.55e-02 0.236 0.137 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 43095 sc-eQTL 1.12e-01 -0.191 0.12 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C -52651 sc-eQTL 9.88e-01 -0.0019 0.124 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000132849 PATJ 989075 sc-eQTL 4.60e-01 0.0737 0.0995 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -862240 sc-eQTL 9.68e-02 -0.221 0.132 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 295184 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0794 0.127 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -791891 sc-eQTL 8.36e-01 0.0263 0.126 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -861930 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0777 0.108 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -636094 sc-eQTL 9.26e-01 -0.011 0.118 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 43095 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0632 0.116 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C -52651 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0758 0.102 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000132849 PATJ 989075 sc-eQTL 5.52e-01 0.0427 0.0717 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -862240 sc-eQTL 5.37e-01 0.0772 0.125 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 295184 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0227 0.0955 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -791891 sc-eQTL 6.49e-01 0.0566 0.124 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -861930 sc-eQTL 7.38e-01 0.0378 0.113 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -636094 sc-eQTL 4.64e-01 0.0961 0.131 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 43095 sc-eQTL 1.96e-02 -0.27 0.115 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C -52651 sc-eQTL 5.73e-01 0.0638 0.113 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000132849 PATJ 989075 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0705 0.0907 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -862240 sc-eQTL 8.01e-02 -0.233 0.132 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 295184 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0493 0.109 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -791891 sc-eQTL 7.22e-01 -0.046 0.129 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -861930 sc-eQTL 3.46e-01 -0.125 0.133 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -636094 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0924 0.134 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 43095 sc-eQTL 3.27e-01 -0.128 0.13 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C -52651 sc-eQTL 2.00e-01 0.162 0.126 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000132849 PATJ 989075 sc-eQTL 7.20e-01 0.0424 0.118 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -862240 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0431 0.131 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 295184 sc-eQTL 1.46e-01 -0.179 0.123 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -791891 sc-eQTL 4.33e-01 0.106 0.135 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -861930 sc-eQTL 7.04e-01 -0.046 0.121 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -636094 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0673 0.129 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 43095 sc-eQTL 1.50e-01 -0.176 0.122 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C -52651 sc-eQTL 2.34e-02 -0.293 0.128 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000132849 PATJ 989075 sc-eQTL 3.88e-01 -0.106 0.123 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -862240 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0594 0.135 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 295184 sc-eQTL 8.37e-01 0.025 0.121 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -791891 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00567 0.139 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -861930 sc-eQTL 7.37e-01 0.0415 0.123 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -636094 sc-eQTL 1.48e-01 0.185 0.127 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 43095 sc-eQTL 1.63e-01 0.184 0.131 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C -52651 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0461 0.127 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000132849 PATJ 989075 sc-eQTL 9.77e-01 0.00276 0.097 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -862240 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0534 0.128 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 295184 sc-eQTL 8.05e-01 0.0268 0.109 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -791891 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0628 0.121 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -861930 sc-eQTL 8.91e-01 0.0196 0.142 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -636094 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0651 0.144 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 43095 sc-eQTL 2.49e-01 -0.162 0.14 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C -52651 sc-eQTL 6.50e-01 0.0652 0.144 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000132849 PATJ 989075 sc-eQTL 7.81e-01 0.0369 0.132 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -862240 sc-eQTL 2.08e-01 -0.176 0.139 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 295184 sc-eQTL 8.40e-01 0.0271 0.134 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -791891 sc-eQTL 2.25e-01 0.173 0.142 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -861930 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000648 0.137 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -636094 sc-eQTL 3.26e-01 -0.135 0.138 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 43095 sc-eQTL 2.97e-01 0.139 0.133 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C -52651 sc-eQTL 3.82e-01 -0.112 0.128 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000132849 PATJ 989075 sc-eQTL 5.79e-01 0.0723 0.13 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -862240 sc-eQTL 4.29e-01 -0.11 0.139 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 295184 sc-eQTL 5.31e-01 0.0831 0.133 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -791891 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0613 0.135 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -861930 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0132 0.128 0.123 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -636094 sc-eQTL 8.97e-01 0.0164 0.126 0.123 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 43095 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0209 0.121 0.123 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C -52651 sc-eQTL 4.87e-02 -0.251 0.126 0.123 MAIT L2
ENSG00000132849 PATJ 989075 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0304 0.108 0.123 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -862240 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0463 0.128 0.123 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 295184 sc-eQTL 9.34e-02 -0.212 0.126 0.123 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -791891 sc-eQTL 6.40e-02 -0.243 0.131 0.123 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -861930 sc-eQTL 4.65e-01 0.0963 0.132 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -636094 sc-eQTL 4.29e-01 0.107 0.135 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 43095 sc-eQTL 2.86e-01 -0.125 0.117 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C -52651 sc-eQTL 7.13e-01 0.0481 0.131 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000132849 PATJ 989075 sc-eQTL 1.62e-01 0.179 0.128 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -862240 sc-eQTL 7.97e-01 -0.035 0.136 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 295184 sc-eQTL 1.91e-01 -0.184 0.14 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -791891 sc-eQTL 3.04e-01 0.138 0.134 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -861930 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0647 0.103 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -636094 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0315 0.131 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 43095 sc-eQTL 2.64e-01 -0.127 0.114 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C -52651 sc-eQTL 4.92e-01 0.0797 0.116 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000132849 PATJ 989075 sc-eQTL 1.60e-02 0.301 0.124 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -862240 sc-eQTL 1.47e-01 -0.191 0.131 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 295184 sc-eQTL 1.21e-01 -0.198 0.127 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -791891 sc-eQTL 4.19e-01 -0.115 0.142 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -861930 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0549 0.137 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -636094 sc-eQTL 4.99e-02 0.277 0.14 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 43095 sc-eQTL 2.27e-01 -0.131 0.108 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C -52651 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0514 0.126 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000132849 PATJ 989075 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0293 0.117 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -862240 sc-eQTL 2.67e-01 -0.147 0.132 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 295184 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0637 0.138 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -791891 sc-eQTL 3.72e-01 -0.113 0.126 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -861930 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0243 0.113 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -636094 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0159 0.128 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 43095 sc-eQTL 5.15e-04 -0.405 0.115 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C -52651 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0178 0.121 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000132849 PATJ 989075 sc-eQTL 8.64e-02 -0.218 0.127 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -862240 sc-eQTL 9.94e-01 0.000934 0.125 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 295184 sc-eQTL 5.78e-01 0.0734 0.131 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -791891 sc-eQTL 7.19e-01 -0.048 0.133 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -861930 sc-eQTL 9.53e-01 0.00872 0.148 0.144 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -636094 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0361 0.155 0.144 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 43095 sc-eQTL 9.27e-01 0.0153 0.166 0.144 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C -52651 sc-eQTL 1.39e-01 0.213 0.143 0.144 PB L2
ENSG00000132849 PATJ 989075 sc-eQTL 8.96e-01 0.0196 0.15 0.144 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -862240 sc-eQTL 4.08e-01 -0.119 0.144 0.144 PB L2
ENSG00000162607 USP1 295184 sc-eQTL 8.73e-01 0.023 0.144 0.144 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -791891 sc-eQTL 3.17e-01 -0.159 0.158 0.144 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -861930 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0845 0.122 0.12 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -636094 sc-eQTL 1.96e-01 -0.161 0.124 0.12 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 43095 sc-eQTL 4.62e-01 -0.092 0.125 0.12 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C -52651 sc-eQTL 9.52e-01 0.00654 0.11 0.12 Pro_T L2
ENSG00000132849 PATJ 989075 sc-eQTL 2.17e-01 -0.148 0.119 0.12 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -862240 sc-eQTL 3.21e-01 0.109 0.11 0.12 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 295184 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0401 0.0755 0.12 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -791891 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0412 0.128 0.12 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -861930 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0266 0.128 0.122 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -636094 sc-eQTL 1.22e-01 -0.212 0.136 0.122 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 43095 sc-eQTL 1.54e-01 -0.179 0.125 0.122 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C -52651 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0864 0.128 0.122 Treg L2
ENSG00000132849 PATJ 989075 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0254 0.119 0.122 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -862240 sc-eQTL 5.75e-01 0.0755 0.134 0.122 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 295184 sc-eQTL 7.03e-01 0.0497 0.13 0.122 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -791891 sc-eQTL 3.49e-01 -0.121 0.128 0.122 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -861930 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0297 0.13 0.12 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -636094 sc-eQTL 3.05e-01 0.135 0.131 0.12 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 43095 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0277 0.129 0.12 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C -52651 sc-eQTL 3.16e-01 -0.113 0.112 0.12 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -862240 sc-eQTL 7.15e-01 -0.052 0.142 0.12 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 295184 sc-eQTL 3.82e-01 -0.111 0.126 0.12 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -791891 sc-eQTL 4.66e-01 0.0834 0.114 0.12 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -861930 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0705 0.12 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -636094 sc-eQTL 4.65e-01 0.0878 0.12 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 43095 sc-eQTL 1.22e-01 -0.196 0.126 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C -52651 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0728 0.0889 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -862240 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0426 0.126 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 295184 sc-eQTL 7.10e-01 0.0414 0.111 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 536632 sc-eQTL 7.35e-01 0.0379 0.112 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -861930 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0469 0.134 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -636094 sc-eQTL 4.35e-01 0.106 0.135 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 43095 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0596 0.126 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C -52651 sc-eQTL 6.17e-01 0.0545 0.109 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -862240 sc-eQTL 3.19e-01 0.122 0.122 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 295184 sc-eQTL 2.74e-01 -0.138 0.126 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 536632 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0156 0.105 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -861930 sc-eQTL 8.75e-02 -0.268 0.156 0.127 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -636094 sc-eQTL 9.89e-01 0.00223 0.168 0.127 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 43095 sc-eQTL 9.90e-01 0.00208 0.164 0.127 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C -52651 sc-eQTL 4.83e-01 0.11 0.157 0.127 gdT L2
ENSG00000132849 PATJ 989075 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0893 0.153 0.127 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -862240 sc-eQTL 8.77e-01 0.0258 0.167 0.127 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 295184 sc-eQTL 4.13e-02 0.32 0.156 0.127 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -791891 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0401 0.164 0.127 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -861930 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0969 0.137 0.12 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -636094 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0275 0.127 0.12 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 43095 sc-eQTL 1.63e-01 0.181 0.129 0.12 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C -52651 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0798 0.124 0.12 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -862240 sc-eQTL 4.34e-01 -0.107 0.137 0.12 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 295184 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0365 0.139 0.12 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 536632 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0174 0.102 0.12 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -861930 sc-eQTL 3.27e-01 0.123 0.125 0.113 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -636094 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0549 0.138 0.113 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 43095 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0949 0.136 0.113 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C -52651 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0677 0.127 0.113 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -862240 sc-eQTL 7.53e-01 0.0418 0.133 0.113 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 295184 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00523 0.136 0.113 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 536632 sc-eQTL 1.80e-01 0.129 0.0958 0.113 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -861930 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0171 0.149 0.113 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -636094 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0267 0.145 0.113 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 43095 sc-eQTL 3.28e-01 0.145 0.148 0.113 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C -52651 sc-eQTL 2.11e-01 -0.166 0.132 0.113 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -862240 sc-eQTL 3.40e-02 0.315 0.147 0.113 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 295184 sc-eQTL 2.86e-01 -0.163 0.152 0.113 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -791891 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0704 0.132 0.113 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -861930 sc-eQTL 7.14e-01 -0.046 0.125 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -636094 sc-eQTL 3.40e-01 -0.132 0.138 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 43095 sc-eQTL 1.09e-02 -0.304 0.118 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -52651 sc-eQTL 9.22e-01 0.00952 0.0972 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 989075 sc-eQTL 8.04e-02 0.188 0.107 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -862240 sc-eQTL 2.69e-01 0.141 0.127 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 295184 sc-eQTL 1.69e-01 -0.17 0.123 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -791891 sc-eQTL 8.04e-01 0.0331 0.133 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -861930 sc-eQTL 8.92e-03 -0.337 0.128 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -636094 sc-eQTL 8.63e-01 0.023 0.134 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 43095 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0866 0.125 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -52651 sc-eQTL 4.39e-01 0.0736 0.095 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 989075 sc-eQTL 3.18e-01 0.114 0.114 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -862240 sc-eQTL 6.41e-01 0.0627 0.134 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 295184 sc-eQTL 9.45e-01 0.00793 0.116 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -791891 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00413 0.135 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -861930 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0412 0.123 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -636094 sc-eQTL 2.63e-01 0.133 0.118 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 43095 sc-eQTL 2.27e-01 -0.144 0.119 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -52651 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0318 0.0826 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -862240 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0148 0.122 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 295184 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0367 0.104 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 536632 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0177 0.113 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -861930 sc-eQTL 7.01e-01 0.046 0.12 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -636094 sc-eQTL 9.97e-01 0.000536 0.136 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 43095 sc-eQTL 7.52e-01 0.0426 0.135 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -52651 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0905 0.115 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -862240 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0501 0.133 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 295184 sc-eQTL 3.54e-01 0.116 0.125 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 536632 sc-eQTL 2.72e-01 0.0937 0.0852 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -861930 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0532 0.101 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -636094 sc-eQTL 7.43e-01 0.0398 0.121 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 43095 sc-eQTL 2.73e-02 -0.239 0.107 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -52651 sc-eQTL 6.86e-01 0.0438 0.108 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 989075 sc-eQTL 3.70e-01 0.105 0.117 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -862240 sc-eQTL 9.35e-02 -0.215 0.128 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 295184 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0279 0.117 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -791891 sc-eQTL 2.27e-01 -0.171 0.141 0.121 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116641 DOCK7 43113 eQTL 1.13e-21 -0.324 0.0331 0.0 0.0 0.103
ENSG00000132855 ANGPTL3 133994 pQTL 7.97e-13 -0.324 0.0449 0.0 0.0 0.11
ENSG00000162607 USP1 295184 eQTL 2.73e-11 -0.133 0.0197 0.00137 0.00328 0.103

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116641 DOCK7 43113 8.18e-06 9.43e-06 1.34e-06 4.56e-06 2.21e-06 3.93e-06 9.65e-06 1.54e-06 7.29e-06 4.28e-06 1.05e-05 5.02e-06 1.29e-05 3.95e-06 2.24e-06 5.82e-06 3.85e-06 5.78e-06 2.56e-06 2.53e-06 4.24e-06 8.17e-06 7.18e-06 2.85e-06 1.25e-05 3.36e-06 4.54e-06 3.16e-06 8.33e-06 7.9e-06 4.61e-06 5.57e-07 8.38e-07 2.98e-06 3.55e-06 2.12e-06 1.56e-06 1.46e-06 1.32e-06 8.9e-07 8.6e-07 1.16e-05 1.26e-06 1.59e-07 6.81e-07 1.53e-06 1.06e-06 7.28e-07 5.83e-07
ENSG00000162607 USP1 295184 1.32e-06 9.23e-07 2.62e-07 5.11e-07 2.05e-07 4.51e-07 1.15e-06 3.24e-07 1.13e-06 3.87e-07 1.35e-06 5.97e-07 1.68e-06 2.55e-07 4.38e-07 6.35e-07 8.28e-07 5.8e-07 4.24e-07 5.62e-07 3.07e-07 1.08e-06 7.52e-07 4.87e-07 1.95e-06 3.28e-07 6.19e-07 5.67e-07 9.81e-07 1.08e-06 5.39e-07 3.85e-08 1.7e-07 5.24e-07 3.92e-07 3.36e-07 3.96e-07 1.59e-07 1.54e-07 2.99e-08 2.32e-07 1.5e-06 6.58e-08 1.24e-08 1.93e-07 8.76e-08 1.9e-07 8.51e-08 5.55e-08