logo

Genes within 1Mb (chr1:62728547:CAT:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -864864 sc-eQTL 5.44e-01 0.0764 0.126 0.109 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -639028 sc-eQTL 6.32e-01 0.0624 0.13 0.109 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 40161 sc-eQTL 2.33e-01 0.155 0.13 0.109 B L1
ENSG00000125703 ATG4C -55585 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0595 0.0905 0.109 B L1
ENSG00000132849 PATJ 986141 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0824 0.11 0.109 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -865174 sc-eQTL 4.29e-01 0.114 0.144 0.109 B L1
ENSG00000162607 USP1 292250 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0516 0.125 0.109 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -794825 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0595 0.148 0.109 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -864864 sc-eQTL 5.44e-01 0.0649 0.107 0.109 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -639028 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0777 0.118 0.109 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 40161 sc-eQTL 4.78e-02 0.236 0.118 0.109 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C -55585 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0489 0.0964 0.109 CD4T L1
ENSG00000132849 PATJ 986141 sc-eQTL 8.70e-02 -0.134 0.0778 0.109 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -865174 sc-eQTL 6.07e-01 0.0705 0.137 0.109 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 292250 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0687 0.0935 0.109 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -794825 sc-eQTL 8.15e-01 0.0289 0.123 0.109 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -864864 sc-eQTL 1.36e-01 0.177 0.118 0.109 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -639028 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0574 0.131 0.109 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 40161 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0122 0.133 0.109 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C -55585 sc-eQTL 3.80e-03 -0.362 0.124 0.109 CD8T L1
ENSG00000132849 PATJ 986141 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0651 0.0767 0.109 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -865174 sc-eQTL 3.28e-01 0.138 0.141 0.109 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 292250 sc-eQTL 1.71e-01 -0.15 0.109 0.109 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -794825 sc-eQTL 4.27e-01 -0.112 0.14 0.109 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -864864 sc-eQTL 1.65e-01 0.184 0.132 0.11 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -639028 sc-eQTL 7.93e-01 -0.036 0.137 0.11 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 40161 sc-eQTL 6.08e-01 0.0722 0.141 0.11 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C -55585 sc-eQTL 3.13e-01 0.111 0.11 0.11 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -865174 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0658 0.154 0.11 DC L1
ENSG00000162607 USP1 292250 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0622 0.134 0.11 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -794825 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0669 0.134 0.11 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -864864 sc-eQTL 2.73e-01 0.141 0.128 0.109 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -639028 sc-eQTL 2.21e-02 0.305 0.132 0.109 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 40161 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0324 0.129 0.109 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C -55585 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0318 0.0874 0.109 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -865174 sc-eQTL 5.99e-01 0.0728 0.138 0.109 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 292250 sc-eQTL 7.83e-01 0.0313 0.113 0.109 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 533698 sc-eQTL 5.13e-01 0.0693 0.106 0.109 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -864864 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0245 0.11 0.109 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -639028 sc-eQTL 1.69e-01 -0.178 0.129 0.109 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 40161 sc-eQTL 9.97e-02 0.175 0.106 0.109 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C -55585 sc-eQTL 3.55e-02 -0.24 0.113 0.109 NK L1
ENSG00000132849 PATJ 986141 sc-eQTL 7.25e-01 0.0395 0.112 0.109 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -865174 sc-eQTL 8.55e-02 0.244 0.141 0.109 NK L1
ENSG00000162607 USP1 292250 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0727 0.127 0.109 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -794825 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0186 0.154 0.109 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -864864 sc-eQTL 7.46e-02 0.223 0.124 0.109 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -639028 sc-eQTL 3.99e-01 -0.106 0.126 0.109 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 40161 sc-eQTL 8.15e-01 0.0302 0.128 0.109 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C -55585 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0519 0.111 0.109 Other_T L1
ENSG00000132849 PATJ 986141 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0745 0.103 0.109 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -865174 sc-eQTL 1.19e-01 0.153 0.098 0.109 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 292250 sc-eQTL 1.03e-01 -0.139 0.0849 0.109 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -794825 sc-eQTL 6.01e-01 0.0796 0.152 0.109 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -864864 sc-eQTL 4.74e-01 0.122 0.169 0.107 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -639028 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0365 0.163 0.107 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 40161 sc-eQTL 2.96e-01 0.158 0.151 0.107 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C -55585 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0801 0.159 0.107 B_Activated L2
ENSG00000132849 PATJ 986141 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0769 0.135 0.107 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -865174 sc-eQTL 8.01e-01 0.0393 0.156 0.107 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 292250 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000993 0.169 0.107 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -794825 sc-eQTL 9.75e-01 0.00457 0.147 0.107 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -864864 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0183 0.149 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -639028 sc-eQTL 8.36e-02 0.261 0.15 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 40161 sc-eQTL 4.78e-03 0.404 0.142 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C -55585 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0127 0.122 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000132849 PATJ 986141 sc-eQTL 1.09e-01 -0.212 0.132 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -865174 sc-eQTL 5.39e-01 0.0894 0.145 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 292250 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0983 0.145 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -794825 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0789 0.144 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -864864 sc-eQTL 9.07e-01 0.0169 0.144 0.11 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -639028 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0198 0.147 0.11 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 40161 sc-eQTL 2.45e-01 0.16 0.137 0.11 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C -55585 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0694 0.131 0.11 B_Memory L2
ENSG00000132849 PATJ 986141 sc-eQTL 6.73e-01 0.0552 0.13 0.11 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -865174 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0176 0.15 0.11 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 292250 sc-eQTL 3.13e-01 -0.152 0.15 0.11 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -794825 sc-eQTL 2.20e-01 0.182 0.148 0.11 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -864864 sc-eQTL 3.04e-01 0.153 0.148 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -639028 sc-eQTL 3.08e-01 0.152 0.149 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 40161 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0298 0.143 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C -55585 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0466 0.11 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000132849 PATJ 986141 sc-eQTL 3.19e-01 -0.141 0.141 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -865174 sc-eQTL 7.46e-01 0.0473 0.146 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 292250 sc-eQTL 5.69e-01 0.0732 0.128 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -794825 sc-eQTL 3.79e-01 -0.137 0.156 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -864864 sc-eQTL 2.24e-01 0.176 0.145 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -639028 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0345 0.151 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 40161 sc-eQTL 4.30e-01 -0.115 0.145 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C -55585 sc-eQTL 3.23e-01 0.138 0.14 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000132849 PATJ 986141 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0275 0.143 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -865174 sc-eQTL 9.60e-01 0.00756 0.152 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 292250 sc-eQTL 6.40e-01 0.0677 0.145 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -794825 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0497 0.151 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -864864 sc-eQTL 6.47e-01 0.0683 0.149 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -639028 sc-eQTL 8.20e-01 0.0358 0.157 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 40161 sc-eQTL 2.00e-01 -0.176 0.137 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C -55585 sc-eQTL 8.27e-02 -0.246 0.141 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000132849 PATJ 986141 sc-eQTL 2.44e-01 0.133 0.114 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -865174 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0237 0.152 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 292250 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0308 0.145 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -794825 sc-eQTL 2.14e-01 0.179 0.144 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -864864 sc-eQTL 2.74e-01 0.132 0.12 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -639028 sc-eQTL 1.35e-02 -0.321 0.129 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 40161 sc-eQTL 3.58e-02 0.269 0.127 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C -55585 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00306 0.114 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000132849 PATJ 986141 sc-eQTL 3.42e-02 -0.168 0.0789 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -865174 sc-eQTL 6.95e-01 0.0545 0.139 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 292250 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0658 0.106 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -794825 sc-eQTL 9.84e-01 -0.0028 0.138 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -864864 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0894 0.125 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -639028 sc-eQTL 2.93e-02 0.315 0.143 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 40161 sc-eQTL 1.27e-01 0.196 0.128 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C -55585 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0927 0.125 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000132849 PATJ 986141 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0486 0.1 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -865174 sc-eQTL 8.78e-01 0.0228 0.147 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 292250 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0403 0.121 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -794825 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0506 0.143 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -864864 sc-eQTL 9.86e-01 0.00254 0.148 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -639028 sc-eQTL 2.05e-01 0.189 0.148 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 40161 sc-eQTL 1.45e-01 0.211 0.145 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C -55585 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0339 0.141 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000132849 PATJ 986141 sc-eQTL 2.00e-01 -0.168 0.131 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -865174 sc-eQTL 6.73e-01 0.0615 0.146 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 292250 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0826 0.138 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -794825 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0971 0.151 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -864864 sc-eQTL 2.39e-01 0.157 0.133 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -639028 sc-eQTL 6.80e-01 0.0584 0.141 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 40161 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0449 0.134 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C -55585 sc-eQTL 3.76e-02 -0.296 0.142 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000132849 PATJ 986141 sc-eQTL 6.04e-01 0.0702 0.135 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -865174 sc-eQTL 2.71e-01 0.163 0.148 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 292250 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0898 0.133 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -794825 sc-eQTL 6.32e-01 -0.073 0.152 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -864864 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0824 0.138 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -639028 sc-eQTL 3.41e-01 -0.136 0.143 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 40161 sc-eQTL 2.96e-01 0.154 0.147 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C -55585 sc-eQTL 4.51e-02 -0.283 0.141 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000132849 PATJ 986141 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0385 0.108 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -865174 sc-eQTL 6.44e-01 0.0664 0.144 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 292250 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0779 0.121 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -794825 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0276 0.135 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -864864 sc-eQTL 2.19e-01 0.186 0.151 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -639028 sc-eQTL 7.25e-01 0.0542 0.154 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 40161 sc-eQTL 8.00e-01 0.038 0.15 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C -55585 sc-eQTL 7.75e-01 0.0439 0.153 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000132849 PATJ 986141 sc-eQTL 7.22e-01 0.0503 0.141 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -865174 sc-eQTL 4.05e-02 0.304 0.147 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 292250 sc-eQTL 1.16e-01 -0.225 0.143 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -794825 sc-eQTL 2.61e-01 -0.171 0.151 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -864864 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0686 0.155 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -639028 sc-eQTL 3.99e-01 -0.131 0.155 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 40161 sc-eQTL 7.35e-01 -0.051 0.15 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C -55585 sc-eQTL 1.59e-01 -0.204 0.144 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000132849 PATJ 986141 sc-eQTL 3.39e-01 -0.14 0.146 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -865174 sc-eQTL 2.47e-01 -0.181 0.156 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 292250 sc-eQTL 5.84e-01 0.082 0.149 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -794825 sc-eQTL 4.61e-01 0.112 0.152 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -864864 sc-eQTL 1.17e-02 0.369 0.145 0.108 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -639028 sc-eQTL 3.46e-01 -0.137 0.145 0.108 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 40161 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0566 0.14 0.108 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C -55585 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0572 0.147 0.108 MAIT L2
ENSG00000132849 PATJ 986141 sc-eQTL 1.62e-01 -0.174 0.124 0.108 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -865174 sc-eQTL 1.86e-01 0.195 0.147 0.108 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 292250 sc-eQTL 8.98e-01 0.0188 0.146 0.108 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -794825 sc-eQTL 3.50e-01 0.142 0.152 0.108 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -864864 sc-eQTL 4.59e-01 0.107 0.144 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -639028 sc-eQTL 8.42e-01 0.0296 0.148 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 40161 sc-eQTL 2.17e-02 0.293 0.127 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C -55585 sc-eQTL 2.97e-01 -0.15 0.143 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000132849 PATJ 986141 sc-eQTL 7.73e-01 0.0406 0.141 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -865174 sc-eQTL 6.22e-01 0.0738 0.149 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 292250 sc-eQTL 5.11e-01 0.101 0.154 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -794825 sc-eQTL 6.84e-01 0.06 0.147 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -864864 sc-eQTL 1.45e-01 0.166 0.114 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -639028 sc-eQTL 9.88e-01 0.00211 0.145 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 40161 sc-eQTL 8.86e-01 0.0181 0.126 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C -55585 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0976 0.128 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000132849 PATJ 986141 sc-eQTL 3.95e-01 0.118 0.139 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -865174 sc-eQTL 3.60e-02 0.305 0.144 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 292250 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0848 0.141 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -794825 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0475 0.158 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -864864 sc-eQTL 1.34e-01 -0.23 0.153 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -639028 sc-eQTL 4.43e-02 -0.319 0.158 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 40161 sc-eQTL 5.45e-01 0.0738 0.122 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C -55585 sc-eQTL 1.95e-01 -0.183 0.141 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000132849 PATJ 986141 sc-eQTL 1.50e-01 0.189 0.131 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -865174 sc-eQTL 2.19e-02 0.339 0.147 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 292250 sc-eQTL 3.60e-01 -0.142 0.155 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -794825 sc-eQTL 8.83e-01 0.0208 0.142 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -864864 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0658 0.126 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -639028 sc-eQTL 1.23e-02 -0.353 0.14 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 40161 sc-eQTL 2.48e-01 0.152 0.131 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C -55585 sc-eQTL 1.18e-01 -0.21 0.134 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000132849 PATJ 986141 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0882 0.142 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -865174 sc-eQTL 4.18e-01 0.113 0.139 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 292250 sc-eQTL 5.48e-01 0.0881 0.146 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -794825 sc-eQTL 2.86e-01 -0.158 0.148 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -864864 sc-eQTL 5.03e-01 0.123 0.184 0.1 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -639028 sc-eQTL 4.26e-01 -0.154 0.193 0.1 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 40161 sc-eQTL 9.47e-01 -0.0138 0.207 0.1 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C -55585 sc-eQTL 4.01e-01 -0.152 0.18 0.1 PB L2
ENSG00000132849 PATJ 986141 sc-eQTL 5.85e-01 0.102 0.187 0.1 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -865174 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0404 0.18 0.1 PB L2
ENSG00000162607 USP1 292250 sc-eQTL 1.04e-01 -0.291 0.177 0.1 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -794825 sc-eQTL 2.72e-01 0.217 0.197 0.1 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -864864 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0245 0.134 0.111 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -639028 sc-eQTL 1.82e-01 0.182 0.136 0.111 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 40161 sc-eQTL 1.95e-01 -0.177 0.136 0.111 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C -55585 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0268 0.12 0.111 Pro_T L2
ENSG00000132849 PATJ 986141 sc-eQTL 1.87e-01 0.173 0.13 0.111 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -865174 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0101 0.12 0.111 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 292250 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0939 0.0825 0.111 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -794825 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0187 0.14 0.111 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -864864 sc-eQTL 8.83e-01 0.0216 0.146 0.109 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -639028 sc-eQTL 4.27e-01 0.124 0.156 0.109 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 40161 sc-eQTL 3.01e-01 0.148 0.143 0.109 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C -55585 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0145 0.146 0.109 Treg L2
ENSG00000132849 PATJ 986141 sc-eQTL 4.68e-01 0.0985 0.135 0.109 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -865174 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0907 0.153 0.109 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 292250 sc-eQTL 8.97e-01 0.0192 0.148 0.109 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -794825 sc-eQTL 1.94e-01 0.19 0.146 0.109 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -864864 sc-eQTL 1.40e-01 0.211 0.142 0.115 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -639028 sc-eQTL 4.97e-01 0.0987 0.145 0.115 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 40161 sc-eQTL 9.87e-01 0.00234 0.142 0.115 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C -55585 sc-eQTL 6.06e-01 0.0638 0.124 0.115 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -865174 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0742 0.157 0.115 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 292250 sc-eQTL 5.92e-01 0.0749 0.139 0.115 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -794825 sc-eQTL 2.26e-01 -0.152 0.125 0.115 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -864864 sc-eQTL 3.68e-01 0.121 0.134 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -639028 sc-eQTL 7.36e-02 0.24 0.134 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 40161 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0743 0.142 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C -55585 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0242 0.0998 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -865174 sc-eQTL 8.88e-01 -0.02 0.141 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 292250 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0856 0.125 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 533698 sc-eQTL 3.92e-01 0.107 0.125 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -864864 sc-eQTL 2.58e-01 0.169 0.149 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -639028 sc-eQTL 1.61e-03 0.473 0.148 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 40161 sc-eQTL 5.05e-01 0.0937 0.14 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C -55585 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0261 0.122 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -865174 sc-eQTL 8.61e-01 -0.024 0.137 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 292250 sc-eQTL 1.74e-02 0.334 0.139 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 533698 sc-eQTL 1.93e-01 -0.153 0.117 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -864864 sc-eQTL 6.70e-01 0.0691 0.162 0.112 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -639028 sc-eQTL 2.80e-01 0.186 0.172 0.112 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 40161 sc-eQTL 4.87e-01 0.118 0.169 0.112 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C -55585 sc-eQTL 3.65e-01 0.146 0.161 0.112 gdT L2
ENSG00000132849 PATJ 986141 sc-eQTL 9.23e-01 0.0153 0.158 0.112 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -865174 sc-eQTL 7.65e-01 0.0514 0.171 0.112 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 292250 sc-eQTL 4.83e-01 -0.114 0.162 0.112 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -794825 sc-eQTL 4.63e-01 0.124 0.168 0.112 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -864864 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0999 0.149 0.109 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -639028 sc-eQTL 1.39e-01 -0.205 0.138 0.109 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 40161 sc-eQTL 2.70e-01 -0.157 0.141 0.109 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C -55585 sc-eQTL 1.37e-01 -0.201 0.135 0.109 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -865174 sc-eQTL 2.91e-01 0.158 0.149 0.109 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 292250 sc-eQTL 1.14e-01 0.239 0.151 0.109 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 533698 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0762 0.111 0.109 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -864864 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0705 0.131 0.115 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -639028 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0655 0.144 0.115 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 40161 sc-eQTL 5.59e-01 -0.083 0.142 0.115 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C -55585 sc-eQTL 8.16e-01 0.031 0.133 0.115 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -865174 sc-eQTL 8.57e-01 0.025 0.139 0.115 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 292250 sc-eQTL 9.94e-01 0.00111 0.142 0.115 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 533698 sc-eQTL 6.62e-01 0.044 0.1 0.115 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -864864 sc-eQTL 8.32e-01 0.033 0.155 0.124 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -639028 sc-eQTL 1.35e-01 -0.226 0.15 0.124 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 40161 sc-eQTL 5.75e-01 0.0867 0.154 0.124 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C -55585 sc-eQTL 5.76e-01 0.0774 0.138 0.124 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -865174 sc-eQTL 6.16e-01 -0.078 0.155 0.124 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 292250 sc-eQTL 1.36e-01 -0.236 0.157 0.124 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -794825 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0168 0.138 0.124 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -864864 sc-eQTL 8.36e-01 0.0288 0.139 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -639028 sc-eQTL 1.59e-01 0.216 0.153 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 40161 sc-eQTL 2.48e-02 0.298 0.132 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -55585 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0498 0.108 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 986141 sc-eQTL 2.45e-01 -0.139 0.119 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -865174 sc-eQTL 3.60e-01 0.13 0.141 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 292250 sc-eQTL 1.03e-01 -0.224 0.137 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -794825 sc-eQTL 9.14e-01 0.016 0.148 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -864864 sc-eQTL 1.95e-01 0.187 0.144 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -639028 sc-eQTL 7.48e-01 0.0479 0.149 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 40161 sc-eQTL 9.08e-01 -0.016 0.139 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -55585 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0164 0.106 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 986141 sc-eQTL 3.80e-01 -0.111 0.127 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -865174 sc-eQTL 6.09e-01 0.0769 0.15 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 292250 sc-eQTL 6.81e-01 0.053 0.129 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -794825 sc-eQTL 3.58e-01 -0.139 0.151 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -864864 sc-eQTL 1.66e-01 0.19 0.137 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -639028 sc-eQTL 1.33e-03 0.422 0.13 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 40161 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0186 0.134 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -55585 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00428 0.0926 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -865174 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0269 0.137 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 292250 sc-eQTL 3.55e-01 0.108 0.117 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 533698 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0216 0.127 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -864864 sc-eQTL 4.23e-01 -0.104 0.13 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -639028 sc-eQTL 2.48e-01 -0.171 0.147 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 40161 sc-eQTL 2.82e-01 -0.157 0.146 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -55585 sc-eQTL 2.57e-01 -0.141 0.124 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -865174 sc-eQTL 2.20e-01 0.177 0.144 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 292250 sc-eQTL 8.42e-01 0.0271 0.136 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 533698 sc-eQTL 5.80e-01 0.0513 0.0927 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -864864 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0101 0.112 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -639028 sc-eQTL 9.01e-02 -0.227 0.133 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 40161 sc-eQTL 4.91e-01 0.0829 0.12 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -55585 sc-eQTL 4.88e-02 -0.236 0.119 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 986141 sc-eQTL 7.26e-01 0.0454 0.129 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -865174 sc-eQTL 5.03e-02 0.277 0.141 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 292250 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0831 0.129 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -794825 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00916 0.157 0.11 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116641 DOCK7 40179 eQTL 0.0241 -0.0775 0.0343 0.0 0.0 0.113
ENSG00000125703 ATG4C -55585 eQTL 0.00595 -0.0718 0.026 0.0 0.0 0.113
ENSG00000132855 ANGPTL3 131060 pQTL 0.00983 0.117 0.0452 0.0 0.0 0.112
ENSG00000203965 EFCAB7 -794825 eQTL 2.24e-02 0.0852 0.0372 0.00108 0.0 0.113

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000230798 \N -595894 1.44e-06 1.07e-06 2.93e-07 1.26e-06 1.19e-07 4.53e-07 1.53e-06 1.01e-07 1.14e-06 3.12e-07 1.41e-06 3.68e-07 1.96e-06 2.54e-07 2.57e-07 3.68e-07 8.37e-07 5.33e-07 3.26e-07 2.25e-07 2.5e-07 6.27e-07 9.28e-07 1.94e-07 1.92e-06 2.54e-07 5.76e-07 4.94e-07 1.28e-06 9.73e-07 4.61e-07 3.87e-08 6.08e-08 6.24e-07 5.65e-07 7.57e-08 1.42e-07 9.03e-08 4.44e-08 7.92e-08 5.34e-08 1.48e-06 5.81e-08 1.68e-07 1.78e-07 1.44e-08 7.8e-08 3.99e-09 4.79e-08