logo

Genes within 1Mb (chr1:62727599:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -865812 sc-eQTL 4.66e-02 -0.222 0.111 0.122 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -639976 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0483 0.116 0.122 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 39213 sc-eQTL 1.94e-02 -0.27 0.115 0.122 B L1
ENSG00000125703 ATG4C -56533 sc-eQTL 2.24e-01 0.0982 0.0805 0.122 B L1
ENSG00000132849 PATJ 985193 sc-eQTL 5.17e-02 0.19 0.0971 0.122 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -866122 sc-eQTL 7.71e-01 0.0374 0.128 0.122 B L1
ENSG00000162607 USP1 291302 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0297 0.112 0.122 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -795773 sc-eQTL 9.01e-01 0.0164 0.132 0.122 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -865812 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0359 0.0964 0.122 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -639976 sc-eQTL 7.50e-01 0.034 0.106 0.122 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 39213 sc-eQTL 4.73e-02 -0.213 0.107 0.122 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C -56533 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0131 0.087 0.122 CD4T L1
ENSG00000132849 PATJ 985193 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00474 0.0706 0.122 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -866122 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0529 0.123 0.122 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 291302 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0625 0.0843 0.122 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -795773 sc-eQTL 9.32e-01 0.00949 0.111 0.122 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -865812 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0712 0.107 0.122 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -639976 sc-eQTL 3.32e-01 0.114 0.118 0.122 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 39213 sc-eQTL 2.06e-01 -0.151 0.119 0.122 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C -56533 sc-eQTL 3.42e-01 -0.108 0.113 0.122 CD8T L1
ENSG00000132849 PATJ 985193 sc-eQTL 8.82e-01 0.0102 0.0691 0.122 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -866122 sc-eQTL 2.74e-01 -0.139 0.126 0.122 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 291302 sc-eQTL 3.77e-01 0.0873 0.0986 0.122 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -795773 sc-eQTL 7.60e-01 0.0387 0.126 0.122 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -865812 sc-eQTL 4.69e-01 0.0858 0.118 0.119 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -639976 sc-eQTL 8.70e-01 0.02 0.122 0.119 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 39213 sc-eQTL 4.98e-01 0.085 0.125 0.119 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C -56533 sc-eQTL 7.35e-02 -0.175 0.0973 0.119 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -866122 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0331 0.137 0.119 DC L1
ENSG00000162607 USP1 291302 sc-eQTL 1.64e-01 -0.166 0.119 0.119 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -795773 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00712 0.119 0.119 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -865812 sc-eQTL 8.08e-01 -0.028 0.115 0.122 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -639976 sc-eQTL 1.63e-01 0.168 0.12 0.122 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 39213 sc-eQTL 2.32e-01 -0.139 0.116 0.122 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C -56533 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0524 0.0786 0.122 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -866122 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0152 0.124 0.122 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 291302 sc-eQTL 9.66e-01 -0.0043 0.102 0.122 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 532750 sc-eQTL 3.52e-01 0.0887 0.0951 0.122 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -865812 sc-eQTL 7.56e-01 -0.031 0.0994 0.12 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -639976 sc-eQTL 4.57e-01 0.0868 0.116 0.12 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 39213 sc-eQTL 9.56e-03 -0.247 0.0945 0.12 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C -56533 sc-eQTL 7.92e-01 0.0273 0.103 0.12 NK L1
ENSG00000132849 PATJ 985193 sc-eQTL 2.25e-01 0.123 0.101 0.12 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -866122 sc-eQTL 1.82e-01 -0.171 0.128 0.12 NK L1
ENSG00000162607 USP1 291302 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0657 0.114 0.12 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -795773 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0562 0.139 0.12 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -865812 sc-eQTL 1.84e-01 -0.147 0.111 0.122 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -639976 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0766 0.111 0.122 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 39213 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0579 0.114 0.122 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C -56533 sc-eQTL 1.48e-01 -0.143 0.0981 0.122 Other_T L1
ENSG00000132849 PATJ 985193 sc-eQTL 3.78e-01 -0.081 0.0917 0.122 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -866122 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0562 0.0874 0.122 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 291302 sc-eQTL 4.05e-01 0.0632 0.0757 0.122 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -795773 sc-eQTL 2.45e-01 -0.157 0.135 0.122 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -865812 sc-eQTL 5.15e-01 0.0991 0.152 0.12 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -639976 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000876 0.146 0.12 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 39213 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0765 0.136 0.12 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C -56533 sc-eQTL 7.98e-01 0.0365 0.143 0.12 B_Activated L2
ENSG00000132849 PATJ 985193 sc-eQTL 2.36e-01 -0.144 0.121 0.12 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -866122 sc-eQTL 4.99e-01 0.0944 0.139 0.12 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 291302 sc-eQTL 1.61e-01 -0.212 0.15 0.12 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -795773 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0626 0.132 0.12 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -865812 sc-eQTL 3.52e-01 -0.126 0.135 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -639976 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0576 0.137 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 39213 sc-eQTL 6.31e-02 -0.243 0.13 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C -56533 sc-eQTL 9.46e-01 0.00751 0.111 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000132849 PATJ 985193 sc-eQTL 4.64e-01 0.0882 0.12 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -866122 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0188 0.132 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 291302 sc-eQTL 1.79e-01 -0.177 0.132 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -795773 sc-eQTL 7.86e-02 0.23 0.13 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -865812 sc-eQTL 9.98e-01 0.000334 0.132 0.121 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -639976 sc-eQTL 2.36e-01 -0.159 0.134 0.121 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 39213 sc-eQTL 3.35e-02 -0.267 0.125 0.121 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C -56533 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00229 0.12 0.121 B_Memory L2
ENSG00000132849 PATJ 985193 sc-eQTL 3.74e-02 0.248 0.119 0.121 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -866122 sc-eQTL 1.68e-01 0.189 0.137 0.121 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 291302 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0976 0.138 0.121 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -795773 sc-eQTL 7.04e-02 -0.246 0.135 0.121 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -865812 sc-eQTL 8.24e-02 -0.231 0.132 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -639976 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0492 0.134 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 39213 sc-eQTL 5.96e-01 -0.068 0.128 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C -56533 sc-eQTL 9.91e-01 0.00113 0.0987 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000132849 PATJ 985193 sc-eQTL 3.15e-01 0.127 0.127 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -866122 sc-eQTL 6.48e-01 0.0599 0.131 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 291302 sc-eQTL 8.12e-01 0.0274 0.115 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -795773 sc-eQTL 4.20e-01 0.113 0.139 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -865812 sc-eQTL 6.71e-02 -0.24 0.13 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -639976 sc-eQTL 3.25e-01 0.135 0.137 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 39213 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0353 0.132 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C -56533 sc-eQTL 1.39e-01 0.187 0.126 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000132849 PATJ 985193 sc-eQTL 6.22e-01 0.064 0.13 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -866122 sc-eQTL 5.03e-01 0.0923 0.137 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 291302 sc-eQTL 7.00e-01 0.0505 0.131 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -795773 sc-eQTL 6.09e-01 -0.07 0.137 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -865812 sc-eQTL 3.51e-04 0.458 0.126 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -639976 sc-eQTL 8.55e-02 0.236 0.137 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 39213 sc-eQTL 1.12e-01 -0.191 0.12 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C -56533 sc-eQTL 9.88e-01 -0.0019 0.124 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000132849 PATJ 985193 sc-eQTL 4.60e-01 0.0737 0.0995 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -866122 sc-eQTL 9.68e-02 -0.221 0.132 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 291302 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0794 0.127 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -795773 sc-eQTL 8.36e-01 0.0263 0.126 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -865812 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0777 0.108 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -639976 sc-eQTL 9.26e-01 -0.011 0.118 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 39213 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0632 0.116 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C -56533 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0758 0.102 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000132849 PATJ 985193 sc-eQTL 5.52e-01 0.0427 0.0717 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -866122 sc-eQTL 5.37e-01 0.0772 0.125 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 291302 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0227 0.0955 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -795773 sc-eQTL 6.49e-01 0.0566 0.124 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -865812 sc-eQTL 7.38e-01 0.0378 0.113 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -639976 sc-eQTL 4.64e-01 0.0961 0.131 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 39213 sc-eQTL 1.96e-02 -0.27 0.115 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C -56533 sc-eQTL 5.73e-01 0.0638 0.113 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000132849 PATJ 985193 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0705 0.0907 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -866122 sc-eQTL 8.01e-02 -0.233 0.132 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 291302 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0493 0.109 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -795773 sc-eQTL 7.22e-01 -0.046 0.129 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -865812 sc-eQTL 3.46e-01 -0.125 0.133 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -639976 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0924 0.134 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 39213 sc-eQTL 3.27e-01 -0.128 0.13 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C -56533 sc-eQTL 2.00e-01 0.162 0.126 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000132849 PATJ 985193 sc-eQTL 7.20e-01 0.0424 0.118 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -866122 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0431 0.131 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 291302 sc-eQTL 1.46e-01 -0.179 0.123 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -795773 sc-eQTL 4.33e-01 0.106 0.135 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -865812 sc-eQTL 7.04e-01 -0.046 0.121 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -639976 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0673 0.129 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 39213 sc-eQTL 1.50e-01 -0.176 0.122 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C -56533 sc-eQTL 2.34e-02 -0.293 0.128 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000132849 PATJ 985193 sc-eQTL 3.88e-01 -0.106 0.123 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -866122 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0594 0.135 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 291302 sc-eQTL 8.37e-01 0.025 0.121 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -795773 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00567 0.139 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -865812 sc-eQTL 7.37e-01 0.0415 0.123 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -639976 sc-eQTL 1.48e-01 0.185 0.127 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 39213 sc-eQTL 1.63e-01 0.184 0.131 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C -56533 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0461 0.127 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000132849 PATJ 985193 sc-eQTL 9.77e-01 0.00276 0.097 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -866122 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0534 0.128 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 291302 sc-eQTL 8.05e-01 0.0268 0.109 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -795773 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0628 0.121 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -865812 sc-eQTL 8.91e-01 0.0196 0.142 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -639976 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0651 0.144 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 39213 sc-eQTL 2.49e-01 -0.162 0.14 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C -56533 sc-eQTL 6.50e-01 0.0652 0.144 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000132849 PATJ 985193 sc-eQTL 7.81e-01 0.0369 0.132 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -866122 sc-eQTL 2.08e-01 -0.176 0.139 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 291302 sc-eQTL 8.40e-01 0.0271 0.134 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -795773 sc-eQTL 2.25e-01 0.173 0.142 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -865812 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000648 0.137 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -639976 sc-eQTL 3.26e-01 -0.135 0.138 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 39213 sc-eQTL 2.97e-01 0.139 0.133 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C -56533 sc-eQTL 3.82e-01 -0.112 0.128 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000132849 PATJ 985193 sc-eQTL 5.79e-01 0.0723 0.13 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -866122 sc-eQTL 4.29e-01 -0.11 0.139 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 291302 sc-eQTL 5.31e-01 0.0831 0.133 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -795773 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0613 0.135 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -865812 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0132 0.128 0.123 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -639976 sc-eQTL 8.97e-01 0.0164 0.126 0.123 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 39213 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0209 0.121 0.123 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C -56533 sc-eQTL 4.87e-02 -0.251 0.126 0.123 MAIT L2
ENSG00000132849 PATJ 985193 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0304 0.108 0.123 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -866122 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0463 0.128 0.123 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 291302 sc-eQTL 9.34e-02 -0.212 0.126 0.123 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -795773 sc-eQTL 6.40e-02 -0.243 0.131 0.123 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -865812 sc-eQTL 4.65e-01 0.0963 0.132 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -639976 sc-eQTL 4.29e-01 0.107 0.135 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 39213 sc-eQTL 2.86e-01 -0.125 0.117 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C -56533 sc-eQTL 7.13e-01 0.0481 0.131 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000132849 PATJ 985193 sc-eQTL 1.62e-01 0.179 0.128 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -866122 sc-eQTL 7.97e-01 -0.035 0.136 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 291302 sc-eQTL 1.91e-01 -0.184 0.14 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -795773 sc-eQTL 3.04e-01 0.138 0.134 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -865812 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0647 0.103 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -639976 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0315 0.131 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 39213 sc-eQTL 2.64e-01 -0.127 0.114 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C -56533 sc-eQTL 4.92e-01 0.0797 0.116 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000132849 PATJ 985193 sc-eQTL 1.60e-02 0.301 0.124 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -866122 sc-eQTL 1.47e-01 -0.191 0.131 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 291302 sc-eQTL 1.21e-01 -0.198 0.127 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -795773 sc-eQTL 4.19e-01 -0.115 0.142 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -865812 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0549 0.137 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -639976 sc-eQTL 4.99e-02 0.277 0.14 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 39213 sc-eQTL 2.27e-01 -0.131 0.108 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C -56533 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0514 0.126 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000132849 PATJ 985193 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0293 0.117 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -866122 sc-eQTL 2.67e-01 -0.147 0.132 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 291302 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0637 0.138 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -795773 sc-eQTL 3.72e-01 -0.113 0.126 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -865812 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0243 0.113 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -639976 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0159 0.128 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 39213 sc-eQTL 5.15e-04 -0.405 0.115 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C -56533 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0178 0.121 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000132849 PATJ 985193 sc-eQTL 8.64e-02 -0.218 0.127 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -866122 sc-eQTL 9.94e-01 0.000934 0.125 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 291302 sc-eQTL 5.78e-01 0.0734 0.131 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -795773 sc-eQTL 7.19e-01 -0.048 0.133 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -865812 sc-eQTL 9.53e-01 0.00872 0.148 0.144 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -639976 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0361 0.155 0.144 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 39213 sc-eQTL 9.27e-01 0.0153 0.166 0.144 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C -56533 sc-eQTL 1.39e-01 0.213 0.143 0.144 PB L2
ENSG00000132849 PATJ 985193 sc-eQTL 8.96e-01 0.0196 0.15 0.144 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -866122 sc-eQTL 4.08e-01 -0.119 0.144 0.144 PB L2
ENSG00000162607 USP1 291302 sc-eQTL 8.73e-01 0.023 0.144 0.144 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -795773 sc-eQTL 3.17e-01 -0.159 0.158 0.144 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -865812 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0845 0.122 0.12 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -639976 sc-eQTL 1.96e-01 -0.161 0.124 0.12 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 39213 sc-eQTL 4.62e-01 -0.092 0.125 0.12 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C -56533 sc-eQTL 9.52e-01 0.00654 0.11 0.12 Pro_T L2
ENSG00000132849 PATJ 985193 sc-eQTL 2.17e-01 -0.148 0.119 0.12 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -866122 sc-eQTL 3.21e-01 0.109 0.11 0.12 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 291302 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0401 0.0755 0.12 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -795773 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0412 0.128 0.12 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -865812 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0266 0.128 0.122 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -639976 sc-eQTL 1.22e-01 -0.212 0.136 0.122 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 39213 sc-eQTL 1.54e-01 -0.179 0.125 0.122 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C -56533 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0864 0.128 0.122 Treg L2
ENSG00000132849 PATJ 985193 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0254 0.119 0.122 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -866122 sc-eQTL 5.75e-01 0.0755 0.134 0.122 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 291302 sc-eQTL 7.03e-01 0.0497 0.13 0.122 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -795773 sc-eQTL 3.49e-01 -0.121 0.128 0.122 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -865812 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0297 0.13 0.12 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -639976 sc-eQTL 3.05e-01 0.135 0.131 0.12 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 39213 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0277 0.129 0.12 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C -56533 sc-eQTL 3.16e-01 -0.113 0.112 0.12 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -866122 sc-eQTL 7.15e-01 -0.052 0.142 0.12 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 291302 sc-eQTL 3.82e-01 -0.111 0.126 0.12 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -795773 sc-eQTL 4.66e-01 0.0834 0.114 0.12 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -865812 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0705 0.12 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -639976 sc-eQTL 4.65e-01 0.0878 0.12 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 39213 sc-eQTL 1.22e-01 -0.196 0.126 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C -56533 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0728 0.0889 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -866122 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0426 0.126 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 291302 sc-eQTL 7.10e-01 0.0414 0.111 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 532750 sc-eQTL 7.35e-01 0.0379 0.112 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -865812 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0469 0.134 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -639976 sc-eQTL 4.35e-01 0.106 0.135 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 39213 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0596 0.126 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C -56533 sc-eQTL 6.17e-01 0.0545 0.109 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -866122 sc-eQTL 3.19e-01 0.122 0.122 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 291302 sc-eQTL 2.74e-01 -0.138 0.126 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 532750 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0156 0.105 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -865812 sc-eQTL 8.75e-02 -0.268 0.156 0.127 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -639976 sc-eQTL 9.89e-01 0.00223 0.168 0.127 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 39213 sc-eQTL 9.90e-01 0.00208 0.164 0.127 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C -56533 sc-eQTL 4.83e-01 0.11 0.157 0.127 gdT L2
ENSG00000132849 PATJ 985193 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0893 0.153 0.127 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -866122 sc-eQTL 8.77e-01 0.0258 0.167 0.127 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 291302 sc-eQTL 4.13e-02 0.32 0.156 0.127 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -795773 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0401 0.164 0.127 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -865812 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0969 0.137 0.12 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -639976 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0275 0.127 0.12 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 39213 sc-eQTL 1.63e-01 0.181 0.129 0.12 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C -56533 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0798 0.124 0.12 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -866122 sc-eQTL 4.34e-01 -0.107 0.137 0.12 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 291302 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0365 0.139 0.12 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 532750 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0174 0.102 0.12 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -865812 sc-eQTL 3.27e-01 0.123 0.125 0.113 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -639976 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0549 0.138 0.113 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 39213 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0949 0.136 0.113 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C -56533 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0677 0.127 0.113 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -866122 sc-eQTL 7.53e-01 0.0418 0.133 0.113 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 291302 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00523 0.136 0.113 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 532750 sc-eQTL 1.80e-01 0.129 0.0958 0.113 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -865812 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0171 0.149 0.113 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -639976 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0267 0.145 0.113 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 39213 sc-eQTL 3.28e-01 0.145 0.148 0.113 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C -56533 sc-eQTL 2.11e-01 -0.166 0.132 0.113 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -866122 sc-eQTL 3.40e-02 0.315 0.147 0.113 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 291302 sc-eQTL 2.86e-01 -0.163 0.152 0.113 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -795773 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0704 0.132 0.113 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -865812 sc-eQTL 7.14e-01 -0.046 0.125 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -639976 sc-eQTL 3.40e-01 -0.132 0.138 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 39213 sc-eQTL 1.09e-02 -0.304 0.118 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -56533 sc-eQTL 9.22e-01 0.00952 0.0972 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 985193 sc-eQTL 8.04e-02 0.188 0.107 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -866122 sc-eQTL 2.69e-01 0.141 0.127 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 291302 sc-eQTL 1.69e-01 -0.17 0.123 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -795773 sc-eQTL 8.04e-01 0.0331 0.133 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -865812 sc-eQTL 8.92e-03 -0.337 0.128 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -639976 sc-eQTL 8.63e-01 0.023 0.134 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 39213 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0866 0.125 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -56533 sc-eQTL 4.39e-01 0.0736 0.095 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 985193 sc-eQTL 3.18e-01 0.114 0.114 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -866122 sc-eQTL 6.41e-01 0.0627 0.134 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 291302 sc-eQTL 9.45e-01 0.00793 0.116 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -795773 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00413 0.135 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -865812 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0412 0.123 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -639976 sc-eQTL 2.63e-01 0.133 0.118 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 39213 sc-eQTL 2.27e-01 -0.144 0.119 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -56533 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0318 0.0826 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -866122 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0148 0.122 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 291302 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0367 0.104 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 532750 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0177 0.113 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -865812 sc-eQTL 7.01e-01 0.046 0.12 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -639976 sc-eQTL 9.97e-01 0.000536 0.136 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 39213 sc-eQTL 7.52e-01 0.0426 0.135 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -56533 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0905 0.115 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -866122 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0501 0.133 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 291302 sc-eQTL 3.54e-01 0.116 0.125 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 532750 sc-eQTL 2.72e-01 0.0937 0.0852 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -865812 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0532 0.101 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -639976 sc-eQTL 7.43e-01 0.0398 0.121 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 39213 sc-eQTL 2.73e-02 -0.239 0.107 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -56533 sc-eQTL 6.86e-01 0.0438 0.108 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 985193 sc-eQTL 3.70e-01 0.105 0.117 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -866122 sc-eQTL 9.35e-02 -0.215 0.128 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 291302 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0279 0.117 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -795773 sc-eQTL 2.27e-01 -0.171 0.141 0.121 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116641 DOCK7 39231 eQTL 1.08e-21 -0.324 0.0331 0.0 0.0 0.103
ENSG00000132855 ANGPTL3 130112 pQTL 7.82e-13 -0.325 0.0449 0.0 0.0 0.11
ENSG00000162607 USP1 291302 eQTL 2.4e-11 -0.133 0.0197 0.00142 0.00354 0.103

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116641 DOCK7 39231 6.67e-06 1.24e-05 6.31e-07 3.48e-06 1.62e-06 4.14e-06 1.09e-05 1.46e-06 8.75e-06 5.12e-06 2.74e-05 4.97e-06 2.18e-05 3.67e-06 3.49e-06 6.58e-06 3.71e-06 7.38e-06 1.65e-06 1.15e-06 5.71e-06 1.27e-05 1.17e-05 1.91e-06 1.31e-05 2.29e-06 3.61e-06 2.54e-06 1.02e-05 7.59e-06 1.54e-05 4.15e-07 5.42e-07 1.6e-06 2.8e-06 2.09e-06 1e-06 4.58e-07 1.32e-06 4.11e-07 3.04e-07 0.000112 6.86e-07 2.66e-08 2.89e-07 1.25e-06 9.92e-07 2.72e-07 3.6e-07
ENSG00000162607 USP1 291302 1.32e-06 2.52e-06 1.59e-07 3.96e-07 9.16e-08 6.06e-07 1.43e-06 3.46e-07 1.49e-06 4.48e-07 3e-06 7.5e-07 3.44e-06 5.86e-07 5.75e-07 9.37e-07 8.42e-07 1.1e-06 4.54e-07 1.91e-07 7.61e-07 2.17e-06 1.87e-06 3.24e-07 2.43e-06 2.94e-07 6.18e-07 7.81e-07 1.66e-06 1.21e-06 2.03e-06 7.49e-08 1.27e-07 1.79e-07 4.22e-07 4.56e-07 1.12e-07 7.64e-08 4.23e-08 3.09e-08 5.39e-08 1.65e-05 8.26e-08 1.11e-08 5.4e-08 4.53e-08 1.71e-07 1.11e-08 5.81e-08