logo

Genes within 1Mb (chr1:62591465:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000088035 ALG6 -776110 sc-eQTL 8.13e-01 0.024 0.101 0.199 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 -96921 sc-eQTL 6.39e-02 -0.187 0.1 0.199 B L1
ENSG00000125703 ATG4C -192667 sc-eQTL 8.76e-01 0.011 0.0704 0.199 B L1
ENSG00000132849 PATJ 849059 sc-eQTL 4.67e-01 0.0622 0.0853 0.199 B L1
ENSG00000162604 TM2D1 866042 sc-eQTL 1.20e-01 0.132 0.0848 0.199 B L1
ENSG00000162607 USP1 155168 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0102 0.0972 0.199 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -931907 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0457 0.115 0.199 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -776110 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0121 0.092 0.199 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -96921 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0684 0.093 0.199 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C -192667 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00511 0.0752 0.199 CD4T L1
ENSG00000132849 PATJ 849059 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0532 0.0609 0.199 CD4T L1
ENSG00000162604 TM2D1 866042 sc-eQTL 1.15e-01 -0.117 0.0737 0.199 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 155168 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0114 0.073 0.199 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -931907 sc-eQTL 3.67e-01 0.0865 0.0956 0.199 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -776110 sc-eQTL 9.52e-01 0.00608 0.102 0.199 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -96921 sc-eQTL 1.68e-01 -0.142 0.103 0.199 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C -192667 sc-eQTL 2.40e-01 -0.115 0.0976 0.199 CD8T L1
ENSG00000132849 PATJ 849059 sc-eQTL 6.22e-02 -0.111 0.0592 0.199 CD8T L1
ENSG00000162604 TM2D1 866042 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0146 0.0896 0.199 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 155168 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0327 0.0853 0.199 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -931907 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0161 0.109 0.199 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -776110 sc-eQTL 1.00e+00 -5.9e-05 0.105 0.198 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 -96921 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0259 0.108 0.198 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C -192667 sc-eQTL 4.50e-02 -0.169 0.0837 0.198 DC L1
ENSG00000162604 TM2D1 866042 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0235 0.0984 0.198 DC L1
ENSG00000162607 USP1 155168 sc-eQTL 3.31e-01 -0.1 0.103 0.198 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -931907 sc-eQTL 3.17e-01 -0.103 0.103 0.198 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -776110 sc-eQTL 2.75e-02 0.227 0.102 0.199 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 -96921 sc-eQTL 9.85e-03 -0.257 0.0986 0.199 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C -192667 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0713 0.0675 0.199 Mono L1
ENSG00000162604 TM2D1 866042 sc-eQTL 6.62e-02 0.138 0.0746 0.199 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 155168 sc-eQTL 7.51e-01 0.028 0.0879 0.199 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 396616 sc-eQTL 2.19e-01 0.101 0.0817 0.199 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -776110 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0168 0.0995 0.197 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 -96921 sc-eQTL 6.23e-03 -0.223 0.0805 0.197 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C -192667 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0778 0.0879 0.197 NK L1
ENSG00000132849 PATJ 849059 sc-eQTL 1.15e-01 0.136 0.0858 0.197 NK L1
ENSG00000162604 TM2D1 866042 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0476 0.0883 0.197 NK L1
ENSG00000162607 USP1 155168 sc-eQTL 4.80e-01 0.069 0.0977 0.197 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -931907 sc-eQTL 8.90e-01 0.0164 0.119 0.197 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -776110 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0909 0.0978 0.199 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -96921 sc-eQTL 2.79e-01 -0.108 0.0998 0.199 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C -192667 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0312 0.0866 0.199 Other_T L1
ENSG00000132849 PATJ 849059 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0873 0.0805 0.199 Other_T L1
ENSG00000162604 TM2D1 866042 sc-eQTL 8.78e-02 0.161 0.094 0.199 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 155168 sc-eQTL 7.53e-01 0.021 0.0666 0.199 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -931907 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0831 0.118 0.199 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000088035 ALG6 -776110 sc-eQTL 6.07e-01 -0.066 0.128 0.194 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 -96921 sc-eQTL 8.67e-01 -0.02 0.119 0.194 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C -192667 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0974 0.125 0.194 B_Activated L2
ENSG00000132849 PATJ 849059 sc-eQTL 3.45e-02 -0.224 0.105 0.194 B_Activated L2
ENSG00000162604 TM2D1 866042 sc-eQTL 1.14e-01 -0.214 0.134 0.194 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 155168 sc-eQTL 1.76e-01 -0.179 0.132 0.194 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -931907 sc-eQTL 9.17e-01 0.0121 0.116 0.194 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -776110 sc-eQTL 4.33e-01 0.0935 0.119 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 -96921 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0807 0.114 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C -192667 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0636 0.0963 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000132849 PATJ 849059 sc-eQTL 9.96e-01 0.000471 0.104 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000162604 TM2D1 866042 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0244 0.11 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 155168 sc-eQTL 5.19e-01 -0.074 0.115 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -931907 sc-eQTL 6.27e-01 0.0553 0.114 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -776110 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0492 0.116 0.198 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 -96921 sc-eQTL 2.08e-01 -0.137 0.109 0.198 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C -192667 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0154 0.104 0.198 B_Memory L2
ENSG00000132849 PATJ 849059 sc-eQTL 1.51e-02 0.25 0.102 0.198 B_Memory L2
ENSG00000162604 TM2D1 866042 sc-eQTL 5.43e-02 0.223 0.115 0.198 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 155168 sc-eQTL 2.19e-01 -0.147 0.119 0.198 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -931907 sc-eQTL 3.30e-01 -0.115 0.117 0.198 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -776110 sc-eQTL 5.90e-01 0.0626 0.116 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 -96921 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0373 0.111 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C -192667 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0283 0.0857 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000132849 PATJ 849059 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0372 0.11 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000162604 TM2D1 866042 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0124 0.101 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 155168 sc-eQTL 4.45e-01 0.0764 0.0998 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -931907 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0091 0.121 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -776110 sc-eQTL 2.14e-01 0.148 0.119 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 -96921 sc-eQTL 3.93e-01 -0.098 0.115 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C -192667 sc-eQTL 1.16e-01 0.173 0.11 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000132849 PATJ 849059 sc-eQTL 6.93e-01 0.0448 0.113 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000162604 TM2D1 866042 sc-eQTL 4.88e-03 0.32 0.112 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 155168 sc-eQTL 2.22e-01 0.139 0.114 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -931907 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0356 0.119 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -776110 sc-eQTL 3.58e-01 0.112 0.121 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 -96921 sc-eQTL 6.75e-02 -0.194 0.106 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C -192667 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0623 0.11 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000132849 PATJ 849059 sc-eQTL 2.74e-01 0.0965 0.0879 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000162604 TM2D1 866042 sc-eQTL 6.71e-01 -0.048 0.113 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 155168 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0828 0.112 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -931907 sc-eQTL 2.58e-01 0.127 0.112 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -776110 sc-eQTL 2.50e-01 -0.116 0.101 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 -96921 sc-eQTL 8.05e-01 0.0246 0.0995 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C -192667 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0685 0.0879 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000132849 PATJ 849059 sc-eQTL 9.00e-01 -0.00777 0.0618 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000162604 TM2D1 866042 sc-eQTL 7.06e-02 -0.16 0.0882 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 155168 sc-eQTL 9.47e-01 0.00549 0.0821 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -931907 sc-eQTL 3.17e-01 0.107 0.107 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -776110 sc-eQTL 5.01e-02 0.22 0.112 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -96921 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0684 0.0998 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C -192667 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00201 0.0973 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000132849 PATJ 849059 sc-eQTL 8.22e-02 -0.135 0.0775 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000162604 TM2D1 866042 sc-eQTL 2.10e-01 -0.114 0.0907 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 155168 sc-eQTL 7.06e-01 0.0355 0.094 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -931907 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0737 0.111 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -776110 sc-eQTL 8.81e-01 0.0176 0.117 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -96921 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0337 0.114 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C -192667 sc-eQTL 1.26e-01 0.17 0.11 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000132849 PATJ 849059 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0189 0.104 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000162604 TM2D1 866042 sc-eQTL 2.74e-01 -0.119 0.109 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 155168 sc-eQTL 6.99e-02 -0.196 0.108 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -931907 sc-eQTL 8.86e-01 0.017 0.119 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -776110 sc-eQTL 3.61e-01 -0.103 0.112 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 -96921 sc-eQTL 7.38e-02 -0.19 0.106 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C -192667 sc-eQTL 5.45e-03 -0.313 0.111 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000132849 PATJ 849059 sc-eQTL 1.39e-01 -0.159 0.107 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000162604 TM2D1 866042 sc-eQTL 9.54e-01 0.00569 0.0986 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 155168 sc-eQTL 6.31e-01 0.0508 0.106 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -931907 sc-eQTL 7.22e-01 0.0431 0.121 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -776110 sc-eQTL 7.80e-01 0.0308 0.11 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 -96921 sc-eQTL 1.25e-01 0.174 0.113 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C -192667 sc-eQTL 4.75e-01 -0.078 0.109 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000132849 PATJ 849059 sc-eQTL 1.25e-01 -0.128 0.083 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000162604 TM2D1 866042 sc-eQTL 9.29e-01 0.00911 0.102 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 155168 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0811 0.0932 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -931907 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0667 0.104 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -776110 sc-eQTL 8.45e-01 -0.024 0.123 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -96921 sc-eQTL 2.75e-01 -0.131 0.119 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C -192667 sc-eQTL 2.68e-01 0.136 0.122 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000132849 PATJ 849059 sc-eQTL 4.96e-01 0.0767 0.113 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000162604 TM2D1 866042 sc-eQTL 4.27e-02 -0.231 0.113 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 155168 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0604 0.114 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -931907 sc-eQTL 7.66e-01 0.0361 0.121 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -776110 sc-eQTL 1.32e-01 -0.186 0.123 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -96921 sc-eQTL 2.05e-01 0.152 0.12 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C -192667 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0709 0.115 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000132849 PATJ 849059 sc-eQTL 2.24e-01 -0.142 0.116 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000162604 TM2D1 866042 sc-eQTL 8.45e-01 0.0232 0.119 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 155168 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0514 0.119 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -931907 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0948 0.121 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -776110 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0135 0.111 0.199 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 -96921 sc-eQTL 2.11e-01 -0.132 0.106 0.199 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C -192667 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0878 0.112 0.199 MAIT L2
ENSG00000132849 PATJ 849059 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0635 0.0944 0.199 MAIT L2
ENSG00000162604 TM2D1 866042 sc-eQTL 2.39e-01 0.127 0.107 0.199 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 155168 sc-eQTL 8.66e-01 0.0188 0.111 0.199 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -931907 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0971 0.115 0.199 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -776110 sc-eQTL 7.36e-01 0.0394 0.117 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 -96921 sc-eQTL 6.26e-01 0.0492 0.101 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C -192667 sc-eQTL 4.72e-01 0.0813 0.113 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000132849 PATJ 849059 sc-eQTL 1.60e-01 0.155 0.11 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000162604 TM2D1 866042 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0585 0.113 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 155168 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0916 0.121 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -931907 sc-eQTL 1.10e-01 0.185 0.115 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -776110 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0655 0.112 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 -96921 sc-eQTL 8.40e-03 -0.256 0.0963 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C -192667 sc-eQTL 6.76e-01 0.0416 0.0994 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000132849 PATJ 849059 sc-eQTL 4.97e-03 0.3 0.106 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000162604 TM2D1 866042 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0362 0.102 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 155168 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0423 0.11 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -931907 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0246 0.122 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -776110 sc-eQTL 5.45e-01 0.0754 0.124 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 -96921 sc-eQTL 4.24e-01 -0.076 0.0949 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C -192667 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0431 0.111 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000132849 PATJ 849059 sc-eQTL 2.45e-01 0.119 0.102 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000162604 TM2D1 866042 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0447 0.117 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 155168 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00705 0.121 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -931907 sc-eQTL 3.17e-01 -0.111 0.11 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -776110 sc-eQTL 6.02e-01 -0.057 0.109 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 -96921 sc-eQTL 1.84e-03 -0.312 0.0988 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C -192667 sc-eQTL 2.50e-01 -0.119 0.103 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000132849 PATJ 849059 sc-eQTL 1.75e-01 -0.148 0.109 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000162604 TM2D1 866042 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00925 0.107 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 155168 sc-eQTL 4.01e-02 0.23 0.112 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -931907 sc-eQTL 3.67e-01 -0.103 0.114 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -776110 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0298 0.139 0.215 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 -96921 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000513 0.149 0.215 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C -192667 sc-eQTL 3.48e-01 0.122 0.13 0.215 PB L2
ENSG00000132849 PATJ 849059 sc-eQTL 4.44e-01 0.104 0.135 0.215 PB L2
ENSG00000162604 TM2D1 866042 sc-eQTL 3.89e-01 0.113 0.131 0.215 PB L2
ENSG00000162607 USP1 155168 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0469 0.129 0.215 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -931907 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0874 0.142 0.215 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -776110 sc-eQTL 2.54e-01 -0.124 0.109 0.198 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 -96921 sc-eQTL 1.61e-01 -0.153 0.109 0.198 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C -192667 sc-eQTL 3.99e-01 0.0809 0.0957 0.198 Pro_T L2
ENSG00000132849 PATJ 849059 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0901 0.104 0.198 Pro_T L2
ENSG00000162604 TM2D1 866042 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00601 0.117 0.198 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 155168 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0531 0.066 0.198 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -931907 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0157 0.112 0.198 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -776110 sc-eQTL 2.45e-01 -0.137 0.118 0.199 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 -96921 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0966 0.108 0.199 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C -192667 sc-eQTL 2.77e-01 -0.12 0.11 0.199 Treg L2
ENSG00000132849 PATJ 849059 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0142 0.103 0.199 Treg L2
ENSG00000162604 TM2D1 866042 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00521 0.113 0.199 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 155168 sc-eQTL 8.73e-01 0.0179 0.112 0.199 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -931907 sc-eQTL 3.52e-01 0.103 0.111 0.199 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -776110 sc-eQTL 3.76e-01 0.101 0.114 0.198 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 -96921 sc-eQTL 3.55e-01 -0.104 0.112 0.198 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C -192667 sc-eQTL 2.65e-01 -0.109 0.0971 0.198 cDC L2
ENSG00000162604 TM2D1 866042 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0908 0.122 0.198 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 155168 sc-eQTL 5.66e-01 0.0631 0.11 0.198 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -931907 sc-eQTL 8.38e-01 0.0203 0.0992 0.198 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -776110 sc-eQTL 2.06e-01 0.131 0.103 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 -96921 sc-eQTL 4.77e-03 -0.306 0.107 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C -192667 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0462 0.0768 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000162604 TM2D1 866042 sc-eQTL 4.27e-01 0.063 0.0791 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 155168 sc-eQTL 6.33e-01 0.046 0.096 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 396616 sc-eQTL 7.33e-01 0.0329 0.0964 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -776110 sc-eQTL 1.01e-02 0.298 0.115 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 -96921 sc-eQTL 7.70e-02 -0.191 0.107 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C -192667 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0191 0.0936 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000162604 TM2D1 866042 sc-eQTL 2.12e-01 0.119 0.0952 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 155168 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0747 0.109 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 396616 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00507 0.0905 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -776110 sc-eQTL 6.70e-01 0.0625 0.146 0.203 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 -96921 sc-eQTL 8.19e-01 0.0329 0.144 0.203 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C -192667 sc-eQTL 1.97e-01 0.177 0.136 0.203 gdT L2
ENSG00000132849 PATJ 849059 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0953 0.134 0.203 gdT L2
ENSG00000162604 TM2D1 866042 sc-eQTL 6.54e-01 0.0634 0.141 0.203 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 155168 sc-eQTL 2.96e-01 0.144 0.137 0.203 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -931907 sc-eQTL 8.09e-01 0.0347 0.143 0.203 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -776110 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0823 0.108 0.196 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 -96921 sc-eQTL 6.65e-01 0.048 0.111 0.196 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C -192667 sc-eQTL 3.15e-01 -0.106 0.105 0.196 intMono L2
ENSG00000162604 TM2D1 866042 sc-eQTL 6.29e-01 0.0541 0.112 0.196 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 155168 sc-eQTL 1.15e-01 0.186 0.118 0.196 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 396616 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0234 0.087 0.196 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -776110 sc-eQTL 3.29e-01 -0.114 0.116 0.195 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 -96921 sc-eQTL 3.41e-01 -0.109 0.114 0.195 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C -192667 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0988 0.107 0.195 ncMono L2
ENSG00000162604 TM2D1 866042 sc-eQTL 3.00e-01 0.119 0.115 0.195 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 155168 sc-eQTL 3.12e-01 0.116 0.114 0.195 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 396616 sc-eQTL 6.37e-02 0.15 0.0803 0.195 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -776110 sc-eQTL 7.31e-01 -0.042 0.122 0.201 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 -96921 sc-eQTL 6.28e-01 0.0604 0.124 0.201 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C -192667 sc-eQTL 2.11e-01 -0.14 0.111 0.201 pDC L2
ENSG00000162604 TM2D1 866042 sc-eQTL 6.26e-01 0.0534 0.109 0.201 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 155168 sc-eQTL 1.18e-01 -0.2 0.127 0.201 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -931907 sc-eQTL 2.52e-01 -0.127 0.111 0.201 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000088035 ALG6 -776110 sc-eQTL 7.42e-01 0.0396 0.12 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -96921 sc-eQTL 2.67e-01 -0.116 0.104 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -192667 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0651 0.0842 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 849059 sc-eQTL 3.76e-01 0.0827 0.0932 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 866042 sc-eQTL 7.90e-01 0.0283 0.106 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 155168 sc-eQTL 3.89e-02 -0.221 0.107 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -931907 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0218 0.115 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -776110 sc-eQTL 5.19e-01 0.0748 0.116 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -96921 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0678 0.108 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -192667 sc-eQTL 5.26e-01 0.0525 0.0825 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 849059 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0192 0.0988 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 866042 sc-eQTL 1.14e-01 0.149 0.0938 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 155168 sc-eQTL 3.18e-01 0.1 0.1 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -931907 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0644 0.117 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -776110 sc-eQTL 9.33e-03 0.265 0.101 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -96921 sc-eQTL 4.71e-03 -0.289 0.101 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -192667 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0438 0.0713 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 866042 sc-eQTL 1.03e-01 0.121 0.0739 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 155168 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0191 0.0902 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 396616 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0115 0.0978 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -776110 sc-eQTL 3.59e-01 -0.106 0.115 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -96921 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0561 0.114 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -192667 sc-eQTL 1.84e-01 -0.129 0.0969 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 866042 sc-eQTL 2.77e-01 0.124 0.113 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 155168 sc-eQTL 1.98e-02 0.246 0.105 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 396616 sc-eQTL 1.78e-01 0.0974 0.0721 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -776110 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0418 0.104 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -96921 sc-eQTL 1.29e-03 -0.296 0.0906 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -192667 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0772 0.0926 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 849059 sc-eQTL 1.26e-01 0.153 0.0994 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 866042 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0271 0.0916 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 155168 sc-eQTL 2.04e-01 0.127 0.0994 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -931907 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0798 0.121 0.198 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116641 DOCK7 -96903 eQTL 6.79e-38 -0.327 0.0243 0.0 0.0 0.2
ENSG00000125703 ATG4C -192667 eQTL 0.00647 -0.0548 0.0201 0.0 0.0 0.2
ENSG00000132855 ANGPTL3 -6022 pQTL 2.37e-09 -0.209 0.0348 0.0 0.0 0.201
ENSG00000162607 USP1 155168 eQTL 1.07e-11 -0.104 0.0151 0.00153 0.00112 0.2

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116641 DOCK7 -96903 4.89e-06 5.79e-06 6.2e-07 3.57e-06 1.71e-06 1.55e-06 6.54e-06 1.18e-06 5.03e-06 2.99e-06 6.53e-06 3.22e-06 7.83e-06 1.79e-06 1.1e-06 3.99e-06 2.07e-06 3.98e-06 1.45e-06 1.37e-06 2.71e-06 5.53e-06 4.72e-06 1.65e-06 8.52e-06 2.23e-06 2.27e-06 1.8e-06 5.11e-06 4.87e-06 2.69e-06 4.15e-07 7.39e-07 1.96e-06 2e-06 1.26e-06 1.03e-06 5e-07 8.77e-07 5.93e-07 7.52e-07 7e-06 6.29e-07 1.51e-07 6.98e-07 1.12e-06 1.16e-06 7.43e-07 4.68e-07
ENSG00000162607 USP1 155168 3.24e-06 3.14e-06 4.93e-07 1.99e-06 6.17e-07 7.86e-07 2.29e-06 6.98e-07 2.17e-06 1.1e-06 2.48e-06 1.46e-06 3.69e-06 1.41e-06 8.88e-07 1.73e-06 1.61e-06 2.14e-06 1.17e-06 1.35e-06 1.37e-06 3.1e-06 2.7e-06 9.91e-07 4.15e-06 1.03e-06 1.36e-06 1.79e-06 2.77e-06 2e-06 1.93e-06 4.15e-07 5.7e-07 1.28e-06 1.45e-06 9.75e-07 8.05e-07 4.22e-07 1.18e-06 3.98e-07 2.11e-07 3.4e-06 6.51e-07 1.93e-07 2.87e-07 4.02e-07 8.09e-07 2.63e-07 2.06e-07