logo

Genes within 1Mb (chr1:62532065:CAG:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000088035 ALG6 -835510 sc-eQTL 9.82e-01 0.00223 0.0966 0.207 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 -156321 sc-eQTL 9.53e-02 -0.161 0.096 0.207 B L1
ENSG00000125703 ATG4C -252067 sc-eQTL 8.21e-01 0.0153 0.0672 0.207 B L1
ENSG00000132849 PATJ 789659 sc-eQTL 6.81e-01 0.0336 0.0815 0.207 B L1
ENSG00000162604 TM2D1 806642 sc-eQTL 1.16e-01 0.128 0.0809 0.207 B L1
ENSG00000162607 USP1 95768 sc-eQTL 6.92e-01 0.0368 0.0927 0.207 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -991307 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0199 0.109 0.207 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -835510 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0411 0.0878 0.207 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -156321 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0695 0.0888 0.207 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C -252067 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00458 0.0718 0.207 CD4T L1
ENSG00000132849 PATJ 789659 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0566 0.0581 0.207 CD4T L1
ENSG00000162604 TM2D1 806642 sc-eQTL 1.83e-01 -0.0942 0.0705 0.207 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 95768 sc-eQTL 8.85e-01 0.0101 0.0696 0.207 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -991307 sc-eQTL 1.84e-01 0.121 0.0911 0.207 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -835510 sc-eQTL 8.80e-01 0.0147 0.0975 0.207 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -156321 sc-eQTL 1.43e-01 -0.144 0.0983 0.207 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C -252067 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0991 0.0936 0.207 CD8T L1
ENSG00000132849 PATJ 789659 sc-eQTL 4.88e-02 -0.112 0.0567 0.207 CD8T L1
ENSG00000162604 TM2D1 806642 sc-eQTL 5.77e-01 -0.048 0.0858 0.207 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 95768 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00878 0.0818 0.207 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -991307 sc-eQTL 8.23e-01 0.0234 0.105 0.207 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -835510 sc-eQTL 9.95e-01 0.000659 0.1 0.207 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 -156321 sc-eQTL 5.99e-01 -0.054 0.102 0.207 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C -252067 sc-eQTL 3.68e-02 -0.167 0.0794 0.207 DC L1
ENSG00000162604 TM2D1 806642 sc-eQTL 9.06e-01 0.0111 0.0935 0.207 DC L1
ENSG00000162607 USP1 95768 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0819 0.0978 0.207 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -991307 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0952 0.0974 0.207 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -835510 sc-eQTL 8.37e-02 0.172 0.0991 0.207 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 -156321 sc-eQTL 8.86e-03 -0.251 0.0949 0.207 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C -252067 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0477 0.0651 0.207 Mono L1
ENSG00000162604 TM2D1 806642 sc-eQTL 2.21e-02 0.165 0.0715 0.207 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 95768 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0335 0.0846 0.207 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 337216 sc-eQTL 4.80e-01 0.0558 0.0789 0.207 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -835510 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0252 0.0954 0.206 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 -156321 sc-eQTL 1.31e-02 -0.194 0.0774 0.206 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C -252067 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0352 0.0843 0.206 NK L1
ENSG00000132849 PATJ 789659 sc-eQTL 2.84e-02 0.18 0.0818 0.206 NK L1
ENSG00000162604 TM2D1 806642 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0776 0.0845 0.206 NK L1
ENSG00000162607 USP1 95768 sc-eQTL 5.21e-01 0.0601 0.0936 0.206 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -991307 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0155 0.114 0.206 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -835510 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0773 0.0934 0.207 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -156321 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0657 0.0954 0.207 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C -252067 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0408 0.0826 0.207 Other_T L1
ENSG00000132849 PATJ 789659 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0763 0.0768 0.207 Other_T L1
ENSG00000162604 TM2D1 806642 sc-eQTL 2.57e-01 0.102 0.09 0.207 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 95768 sc-eQTL 8.92e-01 0.00861 0.0635 0.207 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -991307 sc-eQTL 3.57e-01 -0.104 0.113 0.207 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000088035 ALG6 -835510 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0985 0.12 0.202 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 -156321 sc-eQTL 8.29e-01 0.0242 0.112 0.202 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C -252067 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0782 0.118 0.202 B_Activated L2
ENSG00000132849 PATJ 789659 sc-eQTL 2.38e-02 -0.226 0.099 0.202 B_Activated L2
ENSG00000162604 TM2D1 806642 sc-eQTL 6.89e-02 -0.231 0.126 0.202 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 95768 sc-eQTL 1.60e-01 -0.176 0.124 0.202 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -991307 sc-eQTL 9.10e-01 0.0123 0.109 0.202 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -835510 sc-eQTL 5.09e-01 0.0752 0.114 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 -156321 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0747 0.109 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C -252067 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0447 0.0921 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000132849 PATJ 789659 sc-eQTL 9.12e-01 0.0111 0.0998 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000162604 TM2D1 806642 sc-eQTL 8.25e-01 0.0231 0.105 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 95768 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0251 0.11 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -991307 sc-eQTL 6.65e-01 0.0471 0.109 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -835510 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0413 0.111 0.207 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 -156321 sc-eQTL 2.50e-01 -0.12 0.104 0.207 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C -252067 sc-eQTL 9.56e-01 0.00552 0.0991 0.207 B_Memory L2
ENSG00000132849 PATJ 789659 sc-eQTL 1.58e-02 0.237 0.0976 0.207 B_Memory L2
ENSG00000162604 TM2D1 806642 sc-eQTL 7.94e-02 0.195 0.11 0.207 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 95768 sc-eQTL 2.87e-01 -0.122 0.114 0.207 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -991307 sc-eQTL 2.92e-01 -0.119 0.112 0.207 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -835510 sc-eQTL 6.51e-01 0.0503 0.111 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 -156321 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0353 0.106 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C -252067 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0328 0.0819 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000132849 PATJ 789659 sc-eQTL 7.98e-01 -0.027 0.105 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000162604 TM2D1 806642 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00898 0.0969 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 95768 sc-eQTL 3.36e-01 0.0919 0.0954 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -991307 sc-eQTL 8.83e-01 0.0172 0.116 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -835510 sc-eQTL 2.72e-01 0.125 0.113 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 -156321 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0971 0.109 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C -252067 sc-eQTL 1.60e-01 0.148 0.105 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000132849 PATJ 789659 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00425 0.108 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000162604 TM2D1 806642 sc-eQTL 4.99e-03 0.303 0.107 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 95768 sc-eQTL 2.10e-01 0.136 0.108 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -991307 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00416 0.114 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -835510 sc-eQTL 4.64e-01 0.0853 0.116 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 -156321 sc-eQTL 1.25e-01 -0.156 0.101 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C -252067 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0438 0.105 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000132849 PATJ 789659 sc-eQTL 1.84e-01 0.112 0.0839 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000162604 TM2D1 806642 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0676 0.108 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 95768 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0989 0.107 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -991307 sc-eQTL 3.20e-01 0.106 0.107 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -835510 sc-eQTL 1.92e-01 -0.126 0.0963 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 -156321 sc-eQTL 8.38e-01 0.0194 0.095 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C -252067 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0417 0.0839 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000132849 PATJ 789659 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0217 0.0589 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000162604 TM2D1 806642 sc-eQTL 1.34e-01 -0.127 0.0844 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 95768 sc-eQTL 6.47e-01 0.036 0.0784 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -991307 sc-eQTL 2.59e-01 0.115 0.102 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -835510 sc-eQTL 1.07e-01 0.173 0.107 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -156321 sc-eQTL 2.60e-01 -0.108 0.0952 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C -252067 sc-eQTL 9.86e-01 0.00165 0.0929 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000132849 PATJ 789659 sc-eQTL 1.43e-01 -0.109 0.0742 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000162604 TM2D1 806642 sc-eQTL 1.76e-01 -0.118 0.0866 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 95768 sc-eQTL 6.13e-01 0.0454 0.0898 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -991307 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0215 0.106 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -835510 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0161 0.112 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -156321 sc-eQTL 7.20e-01 0.0391 0.109 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C -252067 sc-eQTL 3.51e-01 0.0988 0.106 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000132849 PATJ 789659 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0304 0.0987 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000162604 TM2D1 806642 sc-eQTL 2.36e-01 -0.123 0.104 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 95768 sc-eQTL 1.13e-01 -0.164 0.103 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -991307 sc-eQTL 7.82e-01 0.0314 0.113 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -835510 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0433 0.107 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 -156321 sc-eQTL 2.84e-02 -0.223 0.101 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C -252067 sc-eQTL 1.16e-02 -0.272 0.107 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000132849 PATJ 789659 sc-eQTL 1.47e-01 -0.149 0.102 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000162604 TM2D1 806642 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00697 0.0943 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 95768 sc-eQTL 4.15e-01 0.0824 0.101 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -991307 sc-eQTL 6.58e-01 0.0513 0.116 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -835510 sc-eQTL 9.35e-01 0.00853 0.105 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 -156321 sc-eQTL 1.27e-01 0.166 0.108 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C -252067 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0508 0.104 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000132849 PATJ 789659 sc-eQTL 7.70e-02 -0.141 0.0791 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000162604 TM2D1 806642 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0208 0.0973 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 95768 sc-eQTL 7.88e-01 -0.024 0.0892 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -991307 sc-eQTL 8.80e-01 -0.015 0.0995 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -835510 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00902 0.116 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -156321 sc-eQTL 3.00e-01 -0.117 0.113 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C -252067 sc-eQTL 4.92e-01 0.0795 0.115 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000132849 PATJ 789659 sc-eQTL 5.58e-01 0.0624 0.106 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000162604 TM2D1 806642 sc-eQTL 2.56e-02 -0.24 0.107 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 95768 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0549 0.108 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -991307 sc-eQTL 9.20e-01 0.0115 0.115 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -835510 sc-eQTL 1.69e-01 -0.161 0.116 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -156321 sc-eQTL 4.63e-01 0.0833 0.113 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C -252067 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0385 0.109 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000132849 PATJ 789659 sc-eQTL 1.19e-01 -0.172 0.11 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000162604 TM2D1 806642 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00445 0.112 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 95768 sc-eQTL 3.39e-01 -0.108 0.112 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -991307 sc-eQTL 2.38e-01 -0.135 0.114 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -835510 sc-eQTL 9.60e-01 -0.0053 0.105 0.208 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 -156321 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0693 0.101 0.208 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C -252067 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0642 0.106 0.208 MAIT L2
ENSG00000132849 PATJ 789659 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0602 0.09 0.208 MAIT L2
ENSG00000162604 TM2D1 806642 sc-eQTL 5.83e-01 0.0563 0.102 0.208 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 95768 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00204 0.106 0.208 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -991307 sc-eQTL 2.70e-01 -0.121 0.11 0.208 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -835510 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00598 0.111 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 -156321 sc-eQTL 2.81e-01 0.104 0.0959 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C -252067 sc-eQTL 4.28e-01 0.0852 0.107 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000132849 PATJ 789659 sc-eQTL 1.68e-01 0.145 0.105 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000162604 TM2D1 806642 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0397 0.107 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 95768 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0978 0.115 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -991307 sc-eQTL 1.02e-01 0.18 0.11 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -835510 sc-eQTL 1.00e+00 -7.01e-06 0.108 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 -156321 sc-eQTL 1.05e-02 -0.239 0.0924 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C -252067 sc-eQTL 5.18e-01 0.0617 0.0952 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000132849 PATJ 789659 sc-eQTL 1.29e-03 0.329 0.101 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000162604 TM2D1 806642 sc-eQTL 6.54e-01 -0.044 0.0981 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 95768 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0241 0.105 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -991307 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0603 0.117 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -835510 sc-eQTL 7.22e-01 0.0422 0.119 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 -156321 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0715 0.0906 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C -252067 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0316 0.105 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000132849 PATJ 789659 sc-eQTL 2.93e-01 0.103 0.0976 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000162604 TM2D1 806642 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0395 0.111 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 95768 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0599 0.116 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -991307 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0974 0.105 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -835510 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0987 0.104 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 -156321 sc-eQTL 3.71e-04 -0.34 0.094 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C -252067 sc-eQTL 2.82e-01 -0.107 0.0988 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000132849 PATJ 789659 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0662 0.104 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000162604 TM2D1 806642 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0685 0.102 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 95768 sc-eQTL 4.66e-02 0.214 0.107 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -991307 sc-eQTL 1.83e-01 -0.146 0.109 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -835510 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0938 0.133 0.226 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 -156321 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0249 0.143 0.226 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C -252067 sc-eQTL 2.83e-01 0.134 0.124 0.226 PB L2
ENSG00000132849 PATJ 789659 sc-eQTL 2.28e-01 0.156 0.129 0.226 PB L2
ENSG00000162604 TM2D1 806642 sc-eQTL 4.57e-01 0.0936 0.125 0.226 PB L2
ENSG00000162607 USP1 95768 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0733 0.124 0.226 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -991307 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0375 0.136 0.226 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -835510 sc-eQTL 3.69e-01 -0.094 0.104 0.207 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 -156321 sc-eQTL 1.41e-01 -0.154 0.104 0.207 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C -252067 sc-eQTL 3.42e-01 0.0874 0.0918 0.207 Pro_T L2
ENSG00000132849 PATJ 789659 sc-eQTL 5.57e-01 -0.059 0.1 0.207 Pro_T L2
ENSG00000162604 TM2D1 806642 sc-eQTL 8.45e-01 0.022 0.112 0.207 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 95768 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0515 0.0633 0.207 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -991307 sc-eQTL 9.63e-01 0.00495 0.107 0.207 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -835510 sc-eQTL 3.53e-01 -0.105 0.112 0.207 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 -156321 sc-eQTL 2.04e-01 -0.131 0.103 0.207 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C -252067 sc-eQTL 2.95e-01 -0.111 0.105 0.207 Treg L2
ENSG00000132849 PATJ 789659 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00475 0.0979 0.207 Treg L2
ENSG00000162604 TM2D1 806642 sc-eQTL 9.18e-01 0.0111 0.108 0.207 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 95768 sc-eQTL 9.80e-01 0.00263 0.107 0.207 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -991307 sc-eQTL 3.93e-01 0.0905 0.106 0.207 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -835510 sc-eQTL 3.79e-01 0.0969 0.11 0.2 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 -156321 sc-eQTL 2.31e-01 -0.129 0.108 0.2 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C -252067 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0972 0.0935 0.2 cDC L2
ENSG00000162604 TM2D1 806642 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0362 0.117 0.2 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 95768 sc-eQTL 5.17e-01 0.0686 0.106 0.2 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -991307 sc-eQTL 9.49e-01 0.00608 0.0955 0.2 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -835510 sc-eQTL 2.56e-01 0.114 0.1 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 -156321 sc-eQTL 6.63e-03 -0.286 0.104 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C -252067 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0222 0.0746 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000162604 TM2D1 806642 sc-eQTL 4.40e-01 0.0594 0.0769 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 95768 sc-eQTL 6.50e-01 0.0424 0.0932 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 337216 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0109 0.0937 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -835510 sc-eQTL 3.59e-02 0.237 0.112 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 -156321 sc-eQTL 5.91e-02 -0.198 0.104 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C -252067 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00554 0.0912 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000162604 TM2D1 806642 sc-eQTL 9.58e-02 0.155 0.0924 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 95768 sc-eQTL 2.50e-01 -0.122 0.106 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 337216 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0148 0.0881 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -835510 sc-eQTL 6.49e-01 0.0617 0.135 0.209 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 -156321 sc-eQTL 9.13e-01 0.0146 0.133 0.209 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C -252067 sc-eQTL 3.89e-01 0.109 0.126 0.209 gdT L2
ENSG00000132849 PATJ 789659 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0425 0.124 0.209 gdT L2
ENSG00000162604 TM2D1 806642 sc-eQTL 7.04e-01 0.0495 0.13 0.209 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 95768 sc-eQTL 3.12e-01 0.129 0.127 0.209 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -991307 sc-eQTL 7.78e-01 0.0374 0.132 0.209 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -835510 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0777 0.106 0.202 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 -156321 sc-eQTL 9.58e-01 0.00572 0.109 0.202 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C -252067 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0933 0.104 0.202 intMono L2
ENSG00000162604 TM2D1 806642 sc-eQTL 5.04e-01 0.0735 0.11 0.202 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 95768 sc-eQTL 1.57e-01 0.164 0.116 0.202 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 337216 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0414 0.0855 0.202 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -835510 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0876 0.111 0.201 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 -156321 sc-eQTL 2.66e-01 -0.121 0.109 0.201 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C -252067 sc-eQTL 4.05e-01 -0.085 0.102 0.201 ncMono L2
ENSG00000162604 TM2D1 806642 sc-eQTL 2.38e-01 0.13 0.11 0.201 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 95768 sc-eQTL 4.20e-01 0.0879 0.109 0.201 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 337216 sc-eQTL 1.68e-01 0.107 0.077 0.201 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -835510 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0413 0.118 0.203 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 -156321 sc-eQTL 8.95e-01 0.0161 0.121 0.203 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C -252067 sc-eQTL 2.34e-01 -0.129 0.108 0.203 pDC L2
ENSG00000162604 TM2D1 806642 sc-eQTL 5.06e-01 0.0707 0.106 0.203 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 95768 sc-eQTL 8.07e-02 -0.216 0.123 0.203 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -991307 sc-eQTL 3.36e-01 -0.104 0.108 0.203 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000088035 ALG6 -835510 sc-eQTL 7.89e-01 0.0307 0.115 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -156321 sc-eQTL 2.72e-01 -0.11 0.0995 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -252067 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0309 0.0806 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 789659 sc-eQTL 3.63e-01 0.0812 0.0891 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 806642 sc-eQTL 6.37e-01 0.048 0.101 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 95768 sc-eQTL 9.71e-02 -0.17 0.102 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -991307 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0379 0.11 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -835510 sc-eQTL 6.03e-01 0.0577 0.111 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -156321 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0609 0.103 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -252067 sc-eQTL 6.38e-01 0.0372 0.0788 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 789659 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0359 0.0943 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 806642 sc-eQTL 1.05e-01 0.146 0.0895 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 95768 sc-eQTL 2.84e-01 0.103 0.0956 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -991307 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0297 0.112 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -835510 sc-eQTL 2.61e-02 0.22 0.0984 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -156321 sc-eQTL 3.93e-03 -0.287 0.0983 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -252067 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0257 0.0692 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 806642 sc-eQTL 4.61e-02 0.144 0.0715 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 95768 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0502 0.0875 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 337216 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0393 0.0949 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -835510 sc-eQTL 3.12e-01 -0.112 0.11 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -156321 sc-eQTL 3.59e-01 -0.1 0.109 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -252067 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0875 0.0931 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 806642 sc-eQTL 1.28e-01 0.166 0.108 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 95768 sc-eQTL 6.87e-02 0.185 0.101 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 337216 sc-eQTL 3.87e-01 0.0601 0.0693 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -835510 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0349 0.0994 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -156321 sc-eQTL 4.54e-04 -0.308 0.0865 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -252067 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0491 0.0888 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 789659 sc-eQTL 3.83e-02 0.198 0.0948 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 806642 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0644 0.0877 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 95768 sc-eQTL 2.03e-01 0.122 0.0953 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -991307 sc-eQTL 3.77e-01 -0.103 0.116 0.205 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116641 DOCK7 -156303 eQTL 6.14e-41 -0.325 0.0231 0.00675 0.00728 0.222
ENSG00000125703 ATG4C -252067 eQTL 0.00731 -0.0517 0.0192 0.0 0.0 0.222
ENSG00000132855 ANGPTL3 -65422 pQTL 5.28e-09 -0.197 0.0335 0.0 0.0 0.221
ENSG00000162607 USP1 95768 eQTL 2.54e-12 -0.102 0.0144 0.00483 0.00459 0.222

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116641 DOCK7 -156303 4.04e-06 4.13e-06 6.49e-07 3.49e-06 1.35e-06 1.19e-06 6.35e-06 3.95e-07 4.92e-06 1.46e-06 4.13e-06 2e-06 7.58e-06 1.81e-06 9.36e-07 1.98e-06 1.58e-06 2.89e-06 1.42e-06 9.88e-07 1.92e-06 3.7e-06 4.59e-06 1.56e-06 5.08e-06 1.28e-06 1.8e-06 1.78e-06 4.36e-06 2.49e-06 1.93e-06 3.22e-07 5.2e-07 1.74e-06 2.13e-06 9.33e-07 1.06e-06 4.21e-07 1.35e-06 5.33e-07 4.94e-07 5.69e-06 4.38e-07 1.8e-07 4.38e-07 1.01e-06 8.59e-07 2.15e-07 2.46e-07
ENSG00000162607 USP1 95768 7.89e-06 9.51e-06 1.56e-06 6.74e-06 2.36e-06 3.46e-06 1.14e-05 1.17e-06 7.82e-06 4.24e-06 1.06e-05 3.93e-06 1.36e-05 3.91e-06 2.54e-06 5.1e-06 3.71e-06 5.33e-06 1.81e-06 2.64e-06 4.21e-06 7.96e-06 7.98e-06 3.08e-06 1.18e-05 2.35e-06 4.33e-06 3.89e-06 7.5e-06 7.05e-06 3.36e-06 5.12e-07 1.19e-06 3.49e-06 4.09e-06 2.12e-06 1.85e-06 1.84e-06 1.38e-06 1.03e-06 8.79e-07 1.51e-05 1.4e-06 1.54e-07 7.16e-07 2.44e-06 9.03e-07 6.95e-07 5.83e-07