logo

Genes within 1Mb (chr1:62529592:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000088035 ALG6 -837983 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0234 0.115 0.128 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 -158794 sc-eQTL 3.60e-03 -0.331 0.112 0.128 B L1
ENSG00000125703 ATG4C -254540 sc-eQTL 5.59e-01 0.0466 0.0796 0.128 B L1
ENSG00000132849 PATJ 787186 sc-eQTL 9.76e-02 0.16 0.0961 0.128 B L1
ENSG00000162604 TM2D1 804169 sc-eQTL 5.46e-02 0.185 0.0957 0.128 B L1
ENSG00000162607 USP1 93295 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0285 0.11 0.128 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -993780 sc-eQTL 8.50e-01 0.0246 0.13 0.128 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -837983 sc-eQTL 7.77e-01 0.0301 0.106 0.128 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -158794 sc-eQTL 3.77e-02 -0.222 0.106 0.128 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C -254540 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0168 0.0868 0.128 CD4T L1
ENSG00000132849 PATJ 787186 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0432 0.0704 0.128 CD4T L1
ENSG00000162604 TM2D1 804169 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0201 0.0856 0.128 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 93295 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0524 0.0841 0.128 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -993780 sc-eQTL 5.95e-01 0.0589 0.11 0.128 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -837983 sc-eQTL 2.56e-01 0.132 0.116 0.128 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -158794 sc-eQTL 1.91e-01 -0.154 0.118 0.128 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C -254540 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0225 0.112 0.128 CD8T L1
ENSG00000132849 PATJ 787186 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0309 0.0684 0.128 CD8T L1
ENSG00000162604 TM2D1 804169 sc-eQTL 8.60e-01 0.0182 0.103 0.128 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 93295 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00208 0.0978 0.128 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -993780 sc-eQTL 5.21e-01 0.0804 0.125 0.128 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -837983 sc-eQTL 9.31e-01 0.0105 0.121 0.126 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 -158794 sc-eQTL 9.12e-01 0.0137 0.124 0.126 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C -254540 sc-eQTL 5.08e-02 -0.189 0.0962 0.126 DC L1
ENSG00000162604 TM2D1 804169 sc-eQTL 9.19e-01 0.0115 0.113 0.126 DC L1
ENSG00000162607 USP1 93295 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0855 0.118 0.126 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -993780 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0691 0.118 0.126 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -837983 sc-eQTL 2.79e-01 0.129 0.119 0.128 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 -158794 sc-eQTL 1.95e-01 -0.15 0.115 0.128 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C -254540 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0447 0.0782 0.128 Mono L1
ENSG00000162604 TM2D1 804169 sc-eQTL 5.72e-02 0.165 0.0861 0.128 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 93295 sc-eQTL 5.73e-01 0.0572 0.101 0.128 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 334743 sc-eQTL 3.53e-01 0.0881 0.0946 0.128 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -837983 sc-eQTL 1.65e-01 0.161 0.116 0.127 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 -158794 sc-eQTL 1.12e-02 -0.242 0.0944 0.127 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C -254540 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00837 0.103 0.127 NK L1
ENSG00000132849 PATJ 787186 sc-eQTL 1.08e-01 0.162 0.1 0.127 NK L1
ENSG00000162604 TM2D1 804169 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0107 0.103 0.127 NK L1
ENSG00000162607 USP1 93295 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0513 0.114 0.127 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -993780 sc-eQTL 9.39e-01 0.0107 0.139 0.127 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -837983 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0874 0.11 0.128 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -158794 sc-eQTL 1.47e-01 -0.163 0.112 0.128 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C -254540 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0971 0.0975 0.128 Other_T L1
ENSG00000132849 PATJ 787186 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0934 0.0908 0.128 Other_T L1
ENSG00000162604 TM2D1 804169 sc-eQTL 9.18e-01 0.011 0.107 0.128 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 93295 sc-eQTL 3.96e-01 0.0638 0.075 0.128 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -993780 sc-eQTL 2.02e-01 -0.17 0.133 0.128 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000088035 ALG6 -837983 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0252 0.143 0.125 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 -158794 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00743 0.133 0.125 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C -254540 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0182 0.14 0.125 B_Activated L2
ENSG00000132849 PATJ 787186 sc-eQTL 1.07e-01 -0.191 0.118 0.125 B_Activated L2
ENSG00000162604 TM2D1 804169 sc-eQTL 4.82e-01 -0.106 0.151 0.125 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 93295 sc-eQTL 1.71e-01 -0.203 0.148 0.125 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -993780 sc-eQTL 7.17e-01 -0.047 0.129 0.125 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -837983 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00769 0.135 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 -158794 sc-eQTL 2.10e-02 -0.297 0.128 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C -254540 sc-eQTL 7.76e-01 0.0312 0.109 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000132849 PATJ 787186 sc-eQTL 4.30e-01 0.0934 0.118 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000162604 TM2D1 804169 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0472 0.124 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 93295 sc-eQTL 8.66e-01 -0.022 0.13 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -993780 sc-eQTL 2.23e-01 0.157 0.129 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -837983 sc-eQTL 4.31e-01 -0.104 0.132 0.127 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 -158794 sc-eQTL 2.23e-02 -0.282 0.123 0.127 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C -254540 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0649 0.118 0.127 B_Memory L2
ENSG00000132849 PATJ 787186 sc-eQTL 1.02e-01 0.192 0.117 0.127 B_Memory L2
ENSG00000162604 TM2D1 804169 sc-eQTL 4.98e-02 0.259 0.131 0.127 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 93295 sc-eQTL 3.29e-01 -0.133 0.136 0.127 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -993780 sc-eQTL 1.58e-01 -0.189 0.133 0.127 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -837983 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0356 0.132 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 -158794 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0916 0.126 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C -254540 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0299 0.0975 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000132849 PATJ 787186 sc-eQTL 6.36e-01 0.0593 0.125 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000162604 TM2D1 804169 sc-eQTL 6.06e-01 0.0594 0.115 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 93295 sc-eQTL 9.01e-01 0.0142 0.114 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -993780 sc-eQTL 3.79e-01 0.121 0.138 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -837983 sc-eQTL 2.36e-01 0.16 0.135 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 -158794 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0595 0.13 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C -254540 sc-eQTL 2.94e-01 0.131 0.125 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000132849 PATJ 787186 sc-eQTL 3.58e-01 0.118 0.128 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000162604 TM2D1 804169 sc-eQTL 1.50e-02 0.314 0.128 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 93295 sc-eQTL 4.60e-01 0.0957 0.129 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -993780 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00144 0.135 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -837983 sc-eQTL 2.48e-01 0.159 0.137 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 -158794 sc-eQTL 7.63e-02 -0.212 0.119 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C -254540 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00467 0.124 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000132849 PATJ 787186 sc-eQTL 5.79e-01 0.0552 0.0993 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000162604 TM2D1 804169 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0354 0.127 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 93295 sc-eQTL 1.85e-01 -0.167 0.126 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -993780 sc-eQTL 6.81e-01 0.0519 0.126 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -837983 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0304 0.117 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 -158794 sc-eQTL 3.53e-01 -0.107 0.115 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C -254540 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0803 0.102 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000132849 PATJ 787186 sc-eQTL 9.67e-01 0.00296 0.0715 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000162604 TM2D1 804169 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0656 0.103 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 93295 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0191 0.0951 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -993780 sc-eQTL 4.26e-01 0.0985 0.123 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -837983 sc-eQTL 1.12e-01 0.207 0.13 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -158794 sc-eQTL 8.87e-02 -0.197 0.115 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C -254540 sc-eQTL 4.33e-01 0.0885 0.113 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000132849 PATJ 787186 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0827 0.0904 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000162604 TM2D1 804169 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0372 0.106 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 93295 sc-eQTL 9.30e-01 0.00957 0.109 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -993780 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0533 0.129 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -837983 sc-eQTL 4.02e-01 -0.112 0.134 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -158794 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0641 0.13 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C -254540 sc-eQTL 3.81e-01 0.111 0.126 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000132849 PATJ 787186 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0496 0.118 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000162604 TM2D1 804169 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0827 0.124 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 93295 sc-eQTL 4.90e-02 -0.243 0.123 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -993780 sc-eQTL 4.69e-01 0.0981 0.135 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -837983 sc-eQTL 3.65e-01 -0.116 0.128 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 -158794 sc-eQTL 1.66e-01 -0.168 0.121 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C -254540 sc-eQTL 2.21e-01 -0.158 0.129 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000132849 PATJ 787186 sc-eQTL 1.50e-01 -0.176 0.122 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000162604 TM2D1 804169 sc-eQTL 3.40e-01 0.107 0.112 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 93295 sc-eQTL 9.80e-01 0.00308 0.12 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -993780 sc-eQTL 7.57e-01 0.0426 0.138 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -837983 sc-eQTL 7.59e-02 0.223 0.125 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 -158794 sc-eQTL 1.95e-01 0.168 0.13 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C -254540 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0132 0.125 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000132849 PATJ 787186 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0314 0.0955 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000162604 TM2D1 804169 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0714 0.117 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 93295 sc-eQTL 5.63e-01 -0.062 0.107 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -993780 sc-eQTL 7.82e-01 -0.033 0.119 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -837983 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0321 0.141 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -158794 sc-eQTL 2.13e-01 -0.171 0.137 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C -254540 sc-eQTL 3.20e-01 0.14 0.14 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000132849 PATJ 787186 sc-eQTL 7.95e-01 0.0336 0.129 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000162604 TM2D1 804169 sc-eQTL 1.72e-01 -0.18 0.131 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 93295 sc-eQTL 5.76e-01 0.0737 0.131 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -993780 sc-eQTL 8.18e-02 0.242 0.138 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -837983 sc-eQTL 5.52e-01 -0.081 0.136 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -158794 sc-eQTL 8.90e-02 0.224 0.131 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C -254540 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0926 0.127 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000132849 PATJ 787186 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0152 0.128 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000162604 TM2D1 804169 sc-eQTL 3.08e-01 0.133 0.13 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 93295 sc-eQTL 7.64e-01 0.0394 0.131 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -993780 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0583 0.133 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -837983 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0425 0.125 0.13 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 -158794 sc-eQTL 2.90e-01 -0.127 0.119 0.13 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C -254540 sc-eQTL 6.46e-02 -0.232 0.125 0.13 MAIT L2
ENSG00000132849 PATJ 787186 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00699 0.107 0.13 MAIT L2
ENSG00000162604 TM2D1 804169 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00896 0.121 0.13 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 93295 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0848 0.125 0.13 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -993780 sc-eQTL 1.42e-01 -0.191 0.129 0.13 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -837983 sc-eQTL 1.17e-01 0.208 0.132 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 -158794 sc-eQTL 2.49e-01 -0.133 0.115 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C -254540 sc-eQTL 4.84e-01 0.0902 0.129 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000132849 PATJ 787186 sc-eQTL 6.79e-02 0.23 0.125 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000162604 TM2D1 804169 sc-eQTL 6.19e-01 0.0639 0.128 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 93295 sc-eQTL 2.12e-01 -0.173 0.138 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -993780 sc-eQTL 1.23e-01 0.204 0.132 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -837983 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0108 0.131 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 -158794 sc-eQTL 1.98e-01 -0.147 0.114 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C -254540 sc-eQTL 3.39e-01 0.111 0.116 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000132849 PATJ 787186 sc-eQTL 1.06e-02 0.319 0.124 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000162604 TM2D1 804169 sc-eQTL 7.20e-01 0.0428 0.119 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 93295 sc-eQTL 1.72e-01 -0.174 0.127 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -993780 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00982 0.142 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -837983 sc-eQTL 3.01e-02 0.306 0.14 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 -158794 sc-eQTL 2.54e-01 -0.124 0.108 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C -254540 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0195 0.126 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000132849 PATJ 787186 sc-eQTL 7.60e-01 0.0358 0.117 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000162604 TM2D1 804169 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0486 0.133 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 93295 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0729 0.138 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -993780 sc-eQTL 3.69e-01 -0.113 0.126 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -837983 sc-eQTL 6.77e-01 0.053 0.127 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 -158794 sc-eQTL 2.55e-03 -0.351 0.115 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C -254540 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0962 0.12 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000132849 PATJ 787186 sc-eQTL 1.50e-01 -0.182 0.126 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000162604 TM2D1 804169 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0947 0.124 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 93295 sc-eQTL 4.50e-01 0.0989 0.131 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -993780 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0614 0.133 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -837983 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0852 0.153 0.152 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 -158794 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0499 0.164 0.152 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C -254540 sc-eQTL 1.48e-01 0.206 0.142 0.152 PB L2
ENSG00000132849 PATJ 787186 sc-eQTL 5.85e-01 0.0811 0.148 0.152 PB L2
ENSG00000162604 TM2D1 804169 sc-eQTL 6.60e-02 0.263 0.142 0.152 PB L2
ENSG00000162607 USP1 93295 sc-eQTL 9.40e-01 0.0107 0.142 0.152 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -993780 sc-eQTL 3.33e-01 -0.152 0.156 0.152 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -837983 sc-eQTL 2.16e-01 -0.153 0.123 0.126 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 -158794 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0612 0.124 0.126 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C -254540 sc-eQTL 5.97e-01 0.0575 0.109 0.126 Pro_T L2
ENSG00000132849 PATJ 787186 sc-eQTL 3.48e-01 -0.111 0.119 0.126 Pro_T L2
ENSG00000162604 TM2D1 804169 sc-eQTL 9.52e-01 0.0081 0.133 0.126 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 93295 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0171 0.0751 0.126 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -993780 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0629 0.127 0.126 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -837983 sc-eQTL 6.63e-02 -0.247 0.134 0.128 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 -158794 sc-eQTL 1.14e-01 -0.196 0.123 0.128 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C -254540 sc-eQTL 3.17e-01 -0.127 0.126 0.128 Treg L2
ENSG00000132849 PATJ 787186 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0341 0.117 0.128 Treg L2
ENSG00000162604 TM2D1 804169 sc-eQTL 6.55e-01 0.0578 0.129 0.128 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 93295 sc-eQTL 5.67e-01 0.0735 0.128 0.128 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -993780 sc-eQTL 9.70e-01 0.00472 0.127 0.128 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -837983 sc-eQTL 7.04e-01 0.05 0.131 0.124 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 -158794 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0564 0.129 0.124 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C -254540 sc-eQTL 2.75e-01 -0.122 0.112 0.124 cDC L2
ENSG00000162604 TM2D1 804169 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0328 0.14 0.124 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 93295 sc-eQTL 9.26e-01 0.0117 0.126 0.124 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -993780 sc-eQTL 7.63e-01 0.0344 0.114 0.124 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -837983 sc-eQTL 7.91e-01 0.0317 0.12 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 -158794 sc-eQTL 1.65e-01 -0.175 0.126 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C -254540 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0275 0.0888 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000162604 TM2D1 804169 sc-eQTL 1.31e-01 0.138 0.0911 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 93295 sc-eQTL 3.48e-01 0.104 0.111 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 334743 sc-eQTL 9.72e-01 0.00386 0.111 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -837983 sc-eQTL 3.77e-01 0.119 0.135 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 -158794 sc-eQTL 4.01e-01 -0.105 0.125 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C -254540 sc-eQTL 9.94e-01 0.000874 0.108 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000162604 TM2D1 804169 sc-eQTL 2.78e-01 0.12 0.11 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 93295 sc-eQTL 3.07e-01 -0.129 0.125 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 334743 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0262 0.105 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -837983 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0117 0.166 0.133 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 -158794 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0137 0.163 0.133 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C -254540 sc-eQTL 3.72e-01 0.139 0.155 0.133 gdT L2
ENSG00000132849 PATJ 787186 sc-eQTL 3.79e-01 -0.134 0.152 0.133 gdT L2
ENSG00000162604 TM2D1 804169 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0332 0.16 0.133 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 93295 sc-eQTL 6.51e-02 0.287 0.155 0.133 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -993780 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0162 0.163 0.133 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -837983 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0951 0.125 0.127 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 -158794 sc-eQTL 3.65e-01 0.116 0.128 0.127 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C -254540 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0564 0.122 0.127 intMono L2
ENSG00000162604 TM2D1 804169 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0115 0.13 0.127 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 93295 sc-eQTL 6.68e-01 0.0589 0.137 0.127 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 334743 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0304 0.101 0.127 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -837983 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0126 0.136 0.12 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 -158794 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0756 0.134 0.12 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C -254540 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0705 0.125 0.12 ncMono L2
ENSG00000162604 TM2D1 804169 sc-eQTL 2.82e-01 0.146 0.135 0.12 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 93295 sc-eQTL 6.15e-01 0.0675 0.134 0.12 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 334743 sc-eQTL 8.78e-02 0.162 0.0944 0.12 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -837983 sc-eQTL 9.57e-01 0.00772 0.145 0.119 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 -158794 sc-eQTL 5.58e-01 0.0867 0.148 0.119 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C -254540 sc-eQTL 2.64e-01 -0.148 0.132 0.119 pDC L2
ENSG00000162604 TM2D1 804169 sc-eQTL 9.87e-01 0.0021 0.13 0.119 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 93295 sc-eQTL 1.68e-01 -0.209 0.151 0.119 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -993780 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0705 0.132 0.119 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000088035 ALG6 -837983 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0674 0.137 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -158794 sc-eQTL 6.28e-03 -0.323 0.117 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -254540 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0153 0.0961 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 787186 sc-eQTL 1.39e-01 0.157 0.106 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 804169 sc-eQTL 8.14e-01 0.0284 0.121 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 93295 sc-eQTL 3.64e-01 -0.111 0.122 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -993780 sc-eQTL 8.96e-01 0.0173 0.132 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -837983 sc-eQTL 7.66e-01 0.0393 0.132 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -158794 sc-eQTL 3.63e-01 -0.112 0.123 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -254540 sc-eQTL 6.62e-01 0.0411 0.0939 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 787186 sc-eQTL 4.37e-01 0.0875 0.112 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 804169 sc-eQTL 9.24e-02 0.18 0.107 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 93295 sc-eQTL 9.54e-01 0.00659 0.114 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -993780 sc-eQTL 8.06e-01 0.0328 0.134 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -837983 sc-eQTL 3.88e-01 0.102 0.118 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -158794 sc-eQTL 2.07e-01 -0.15 0.119 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -254540 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0319 0.0825 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 804169 sc-eQTL 5.11e-02 0.167 0.0853 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 93295 sc-eQTL 9.89e-01 0.00138 0.104 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 334743 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0347 0.113 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -837983 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00729 0.135 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -158794 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00218 0.134 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -254540 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0852 0.114 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 804169 sc-eQTL 3.25e-01 0.131 0.133 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 93295 sc-eQTL 7.00e-02 0.225 0.123 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 334743 sc-eQTL 2.79e-01 0.0919 0.0846 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -837983 sc-eQTL 3.83e-01 0.106 0.121 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -158794 sc-eQTL 3.63e-02 -0.226 0.107 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -254540 sc-eQTL 9.50e-01 0.00676 0.108 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 787186 sc-eQTL 1.99e-01 0.15 0.116 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 804169 sc-eQTL 9.96e-01 0.000514 0.107 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 93295 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00886 0.116 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -993780 sc-eQTL 4.71e-01 -0.102 0.141 0.127 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116641 DOCK7 -158776 eQTL 3.6e-24 -0.333 0.032 0.0 0.0 0.11
ENSG00000125703 ATG4C -254540 eQTL 0.0255 -0.0572 0.0256 0.0 0.0 0.11
ENSG00000132855 ANGPTL3 -67895 pQTL 4.73e-13 -0.319 0.0437 0.0 0.0 0.116
ENSG00000162607 USP1 93295 eQTL 2.78e-10 -0.123 0.0192 0.0 0.0 0.11

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116641 DOCK7 -158776 4.57e-06 5.32e-06 9.68e-07 3.8e-06 1.6e-06 1.52e-06 7.69e-06 1.17e-06 4.8e-06 2.82e-06 6.77e-06 2.98e-06 9e-06 1.97e-06 1.02e-06 3.99e-06 1.84e-06 3.87e-06 1.55e-06 1.55e-06 3.12e-06 4.98e-06 4.49e-06 1.81e-06 8.59e-06 1.97e-06 2.64e-06 1.55e-06 5.61e-06 4.97e-06 2.72e-06 4.81e-07 5.21e-07 1.87e-06 2.03e-06 1.11e-06 9.52e-07 5.45e-07 8.97e-07 7.22e-07 7.46e-07 5.98e-06 5.26e-07 1.7e-07 6.1e-07 1.05e-06 1e-06 7.08e-07 4.78e-07
ENSG00000162607 USP1 93295 7.62e-06 9.82e-06 1.59e-06 6.77e-06 2.25e-06 4.15e-06 1.14e-05 2.08e-06 1e-05 4.92e-06 1.24e-05 5.85e-06 1.5e-05 3.85e-06 2.66e-06 6.44e-06 3.83e-06 7.75e-06 2.55e-06 2.83e-06 4.67e-06 9e-06 7.38e-06 3.2e-06 1.42e-05 3.49e-06 5.24e-06 3.88e-06 1.12e-05 7.94e-06 5.69e-06 1.06e-06 1.19e-06 3.06e-06 4.76e-06 2.53e-06 1.4e-06 1.82e-06 2.12e-06 9.85e-07 1e-06 1.17e-05 1.4e-06 2.22e-07 6.99e-07 1.75e-06 1.75e-06 6.92e-07 4.59e-07