logo

Genes within 1Mb (chr1:62502762:A:AT):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000088035 ALG6 -864813 sc-eQTL 7.81e-01 0.0313 0.113 0.137 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 -185624 sc-eQTL 4.63e-03 -0.317 0.111 0.137 B L1
ENSG00000125703 ATG4C -281370 sc-eQTL 3.88e-01 0.0677 0.0783 0.137 B L1
ENSG00000132849 PATJ 760356 sc-eQTL 9.25e-02 0.16 0.0945 0.137 B L1
ENSG00000162604 TM2D1 777339 sc-eQTL 7.77e-02 0.167 0.0943 0.137 B L1
ENSG00000162607 USP1 66465 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0225 0.108 0.137 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -864813 sc-eQTL 6.27e-01 0.0507 0.104 0.137 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -185624 sc-eQTL 4.53e-02 -0.21 0.104 0.137 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C -281370 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0238 0.0851 0.137 CD4T L1
ENSG00000132849 PATJ 760356 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0681 0.0689 0.137 CD4T L1
ENSG00000162604 TM2D1 777339 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0268 0.0839 0.137 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 66465 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0509 0.0825 0.137 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -864813 sc-eQTL 1.86e-01 0.151 0.114 0.137 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -185624 sc-eQTL 2.80e-01 -0.125 0.116 0.137 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C -281370 sc-eQTL 8.34e-01 0.0231 0.11 0.137 CD8T L1
ENSG00000132849 PATJ 760356 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0467 0.0672 0.137 CD8T L1
ENSG00000162604 TM2D1 777339 sc-eQTL 9.03e-01 0.0123 0.101 0.137 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 66465 sc-eQTL 7.15e-01 0.0351 0.0961 0.137 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -864813 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0201 0.119 0.135 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 -185624 sc-eQTL 8.72e-01 0.0196 0.122 0.135 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C -281370 sc-eQTL 7.37e-02 -0.17 0.0945 0.135 DC L1
ENSG00000162604 TM2D1 777339 sc-eQTL 9.31e-01 0.00957 0.111 0.135 DC L1
ENSG00000162607 USP1 66465 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0881 0.116 0.135 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -864813 sc-eQTL 3.97e-01 0.0994 0.117 0.137 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 -185624 sc-eQTL 5.57e-02 -0.216 0.112 0.137 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C -281370 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0586 0.0765 0.137 Mono L1
ENSG00000162604 TM2D1 777339 sc-eQTL 8.06e-02 0.148 0.0845 0.137 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 66465 sc-eQTL 6.79e-01 0.0412 0.0994 0.137 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 307913 sc-eQTL 3.48e-01 0.087 0.0926 0.137 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -864813 sc-eQTL 2.51e-01 0.131 0.114 0.135 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 -185624 sc-eQTL 2.19e-03 -0.285 0.092 0.135 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C -281370 sc-eQTL 8.09e-01 0.0244 0.101 0.135 NK L1
ENSG00000132849 PATJ 760356 sc-eQTL 1.20e-01 0.154 0.0985 0.135 NK L1
ENSG00000162604 TM2D1 777339 sc-eQTL 6.43e-01 -0.047 0.101 0.135 NK L1
ENSG00000162607 USP1 66465 sc-eQTL 9.54e-01 0.00643 0.112 0.135 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -864813 sc-eQTL 3.33e-01 -0.105 0.108 0.137 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -185624 sc-eQTL 1.24e-01 -0.17 0.11 0.137 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C -281370 sc-eQTL 2.86e-01 -0.102 0.0956 0.137 Other_T L1
ENSG00000132849 PATJ 760356 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0826 0.0891 0.137 Other_T L1
ENSG00000162604 TM2D1 777339 sc-eQTL 6.53e-01 0.0471 0.105 0.137 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 66465 sc-eQTL 1.86e-01 0.0975 0.0734 0.137 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000088035 ALG6 -864813 sc-eQTL 9.14e-01 0.0151 0.14 0.135 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 -185624 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0838 0.131 0.135 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C -281370 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0465 0.137 0.135 B_Activated L2
ENSG00000132849 PATJ 760356 sc-eQTL 5.38e-02 -0.224 0.116 0.135 B_Activated L2
ENSG00000162604 TM2D1 777339 sc-eQTL 2.31e-01 -0.178 0.148 0.135 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 66465 sc-eQTL 2.70e-01 -0.161 0.145 0.135 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -864813 sc-eQTL 6.34e-01 0.0633 0.133 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 -185624 sc-eQTL 1.58e-02 -0.304 0.125 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C -281370 sc-eQTL 8.93e-01 0.0145 0.107 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000132849 PATJ 760356 sc-eQTL 3.64e-01 0.105 0.116 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000162604 TM2D1 777339 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0377 0.122 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 66465 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0176 0.128 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -864813 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0592 0.13 0.136 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 -185624 sc-eQTL 2.46e-02 -0.272 0.12 0.136 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C -281370 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0368 0.116 0.136 B_Memory L2
ENSG00000132849 PATJ 760356 sc-eQTL 1.87e-02 0.27 0.114 0.136 B_Memory L2
ENSG00000162604 TM2D1 777339 sc-eQTL 4.16e-02 0.263 0.128 0.136 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 66465 sc-eQTL 3.62e-01 -0.122 0.133 0.136 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -864813 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0123 0.13 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 -185624 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0347 0.124 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C -281370 sc-eQTL 9.40e-01 0.00716 0.0958 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000132849 PATJ 760356 sc-eQTL 6.27e-01 0.0598 0.123 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000162604 TM2D1 777339 sc-eQTL 7.15e-01 0.0413 0.113 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 66465 sc-eQTL 8.77e-01 0.0173 0.112 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -864813 sc-eQTL 1.62e-01 0.186 0.132 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 -185624 sc-eQTL 6.12e-01 -0.065 0.128 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C -281370 sc-eQTL 2.03e-01 0.156 0.123 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000132849 PATJ 760356 sc-eQTL 3.04e-01 0.13 0.126 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000162604 TM2D1 777339 sc-eQTL 1.66e-02 0.304 0.126 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 66465 sc-eQTL 4.78e-01 0.0902 0.127 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -864813 sc-eQTL 2.62e-01 0.151 0.134 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 -185624 sc-eQTL 6.34e-02 -0.218 0.117 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C -281370 sc-eQTL 7.03e-01 0.0466 0.122 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000132849 PATJ 760356 sc-eQTL 4.19e-01 0.079 0.0975 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000162604 TM2D1 777339 sc-eQTL 9.93e-01 0.00116 0.125 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 66465 sc-eQTL 3.33e-01 -0.12 0.124 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -864813 sc-eQTL 8.91e-01 0.0158 0.115 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 -185624 sc-eQTL 3.23e-01 -0.112 0.113 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C -281370 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0916 0.1 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000132849 PATJ 760356 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0255 0.0703 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000162604 TM2D1 777339 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0668 0.101 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 66465 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0401 0.0935 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -864813 sc-eQTL 3.25e-01 0.127 0.128 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -185624 sc-eQTL 1.01e-01 -0.187 0.113 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C -281370 sc-eQTL 5.73e-01 0.0626 0.111 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000132849 PATJ 760356 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0794 0.0888 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000162604 TM2D1 777339 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0822 0.104 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 66465 sc-eQTL 8.47e-01 0.0207 0.107 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -864813 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0696 0.131 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -185624 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0499 0.128 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C -281370 sc-eQTL 2.60e-01 0.14 0.124 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000132849 PATJ 760356 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00823 0.116 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000162604 TM2D1 777339 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0924 0.122 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 66465 sc-eQTL 4.75e-02 -0.24 0.12 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -864813 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0714 0.126 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 -185624 sc-eQTL 2.61e-01 -0.134 0.119 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C -281370 sc-eQTL 2.28e-01 -0.153 0.127 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000132849 PATJ 760356 sc-eQTL 2.01e-01 -0.154 0.12 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000162604 TM2D1 777339 sc-eQTL 4.05e-01 0.0921 0.11 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 66465 sc-eQTL 8.29e-01 0.0257 0.118 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -864813 sc-eQTL 1.07e-01 0.199 0.123 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 -185624 sc-eQTL 9.80e-02 0.211 0.127 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C -281370 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00431 0.123 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000132849 PATJ 760356 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0761 0.0936 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000162604 TM2D1 777339 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0751 0.114 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 66465 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0231 0.105 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -864813 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0305 0.139 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -185624 sc-eQTL 1.69e-01 -0.187 0.135 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C -281370 sc-eQTL 2.46e-01 0.161 0.139 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000132849 PATJ 760356 sc-eQTL 5.56e-01 0.0754 0.128 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000162604 TM2D1 777339 sc-eQTL 3.27e-01 -0.127 0.13 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 66465 sc-eQTL 6.88e-01 0.0523 0.13 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -864813 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0935 0.134 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -185624 sc-eQTL 5.71e-02 0.246 0.129 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C -281370 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0299 0.125 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000132849 PATJ 760356 sc-eQTL 9.60e-01 0.00633 0.127 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000162604 TM2D1 777339 sc-eQTL 5.49e-01 0.0773 0.129 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 66465 sc-eQTL 7.11e-01 0.0479 0.129 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -864813 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0528 0.123 0.139 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 -185624 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0762 0.117 0.139 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C -281370 sc-eQTL 9.69e-02 -0.205 0.123 0.139 MAIT L2
ENSG00000132849 PATJ 760356 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00448 0.105 0.139 MAIT L2
ENSG00000162604 TM2D1 777339 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0106 0.119 0.139 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 66465 sc-eQTL 8.72e-01 -0.02 0.123 0.139 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -864813 sc-eQTL 1.39e-01 0.193 0.13 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 -185624 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0709 0.113 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C -281370 sc-eQTL 2.33e-01 0.151 0.126 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000132849 PATJ 760356 sc-eQTL 7.55e-02 0.22 0.123 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000162604 TM2D1 777339 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0563 0.126 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 66465 sc-eQTL 1.77e-01 -0.183 0.135 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -864813 sc-eQTL 6.76e-01 -0.054 0.129 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 -185624 sc-eQTL 5.73e-02 -0.212 0.111 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C -281370 sc-eQTL 4.03e-01 0.0953 0.114 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000132849 PATJ 760356 sc-eQTL 1.83e-02 0.29 0.122 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000162604 TM2D1 777339 sc-eQTL 9.00e-01 0.0148 0.117 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 66465 sc-eQTL 3.29e-01 -0.123 0.125 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -864813 sc-eQTL 9.32e-02 0.233 0.138 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 -185624 sc-eQTL 7.79e-02 -0.187 0.106 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C -281370 sc-eQTL 7.94e-01 0.0323 0.124 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000132849 PATJ 760356 sc-eQTL 6.94e-01 0.0452 0.115 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000162604 TM2D1 777339 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0836 0.13 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 66465 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00703 0.136 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -864813 sc-eQTL 5.27e-01 0.079 0.125 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 -185624 sc-eQTL 7.13e-04 -0.387 0.113 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C -281370 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0562 0.118 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000132849 PATJ 760356 sc-eQTL 2.51e-01 -0.143 0.124 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000162604 TM2D1 777339 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0582 0.122 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 66465 sc-eQTL 2.22e-01 0.157 0.128 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -864813 sc-eQTL 9.20e-01 0.0152 0.151 0.159 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 -185624 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00466 0.161 0.159 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C -281370 sc-eQTL 2.44e-01 0.164 0.14 0.159 PB L2
ENSG00000132849 PATJ 760356 sc-eQTL 5.52e-01 0.0869 0.146 0.159 PB L2
ENSG00000162604 TM2D1 777339 sc-eQTL 1.29e-01 0.214 0.14 0.159 PB L2
ENSG00000162607 USP1 66465 sc-eQTL 8.83e-01 0.0206 0.14 0.159 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -864813 sc-eQTL 1.05e-01 -0.196 0.12 0.135 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 -185624 sc-eQTL 2.27e-01 -0.147 0.121 0.135 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C -281370 sc-eQTL 7.09e-01 0.0398 0.106 0.135 Pro_T L2
ENSG00000132849 PATJ 760356 sc-eQTL 1.96e-01 -0.15 0.116 0.135 Pro_T L2
ENSG00000162604 TM2D1 777339 sc-eQTL 9.64e-01 0.0059 0.13 0.135 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 66465 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0185 0.0734 0.135 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -864813 sc-eQTL 9.48e-02 -0.221 0.132 0.137 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 -185624 sc-eQTL 2.81e-01 -0.131 0.121 0.137 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C -281370 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0978 0.124 0.137 Treg L2
ENSG00000132849 PATJ 760356 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0375 0.115 0.137 Treg L2
ENSG00000162604 TM2D1 777339 sc-eQTL 5.59e-01 0.0742 0.127 0.137 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 66465 sc-eQTL 5.50e-01 0.0754 0.126 0.137 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -864813 sc-eQTL 4.16e-01 0.105 0.129 0.132 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 -185624 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0639 0.127 0.132 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C -281370 sc-eQTL 2.84e-01 -0.118 0.11 0.132 cDC L2
ENSG00000162604 TM2D1 777339 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0385 0.138 0.132 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 66465 sc-eQTL 7.81e-01 0.0347 0.124 0.132 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -864813 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0216 0.117 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 -185624 sc-eQTL 6.73e-02 -0.226 0.123 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C -281370 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00801 0.087 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000162604 TM2D1 777339 sc-eQTL 3.95e-01 0.0764 0.0895 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 66465 sc-eQTL 4.03e-01 0.0908 0.108 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 307913 sc-eQTL 8.65e-01 0.0186 0.109 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -864813 sc-eQTL 3.03e-01 0.136 0.132 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 -185624 sc-eQTL 1.81e-01 -0.163 0.122 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C -281370 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0392 0.106 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000162604 TM2D1 777339 sc-eQTL 2.10e-01 0.136 0.108 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 66465 sc-eQTL 3.75e-01 -0.109 0.123 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 307913 sc-eQTL 9.37e-01 0.00806 0.102 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -864813 sc-eQTL 9.29e-01 0.0149 0.166 0.145 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 -185624 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0316 0.162 0.145 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C -281370 sc-eQTL 4.26e-01 0.124 0.155 0.145 gdT L2
ENSG00000132849 PATJ 760356 sc-eQTL 2.91e-01 -0.16 0.151 0.145 gdT L2
ENSG00000162604 TM2D1 777339 sc-eQTL 9.81e-01 0.00378 0.16 0.145 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 66465 sc-eQTL 3.71e-02 0.323 0.154 0.145 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -864813 sc-eQTL 3.80e-01 -0.108 0.123 0.136 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 -185624 sc-eQTL 5.56e-01 0.0739 0.125 0.136 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C -281370 sc-eQTL 3.10e-01 -0.121 0.119 0.136 intMono L2
ENSG00000162604 TM2D1 777339 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0434 0.127 0.136 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 66465 sc-eQTL 6.38e-01 0.0631 0.134 0.136 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 307913 sc-eQTL 5.98e-01 -0.052 0.0986 0.136 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -864813 sc-eQTL 9.39e-01 0.0102 0.133 0.129 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 -185624 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0873 0.131 0.129 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C -281370 sc-eQTL 3.18e-01 -0.122 0.122 0.129 ncMono L2
ENSG00000162604 TM2D1 777339 sc-eQTL 2.31e-01 0.158 0.132 0.129 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 66465 sc-eQTL 7.02e-01 0.0502 0.131 0.129 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 307913 sc-eQTL 6.35e-02 0.172 0.0922 0.129 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -864813 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0635 0.141 0.13 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 -185624 sc-eQTL 4.86e-01 0.101 0.144 0.13 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C -281370 sc-eQTL 3.49e-01 -0.122 0.129 0.13 pDC L2
ENSG00000162604 TM2D1 777339 sc-eQTL 7.46e-01 0.0413 0.127 0.13 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 66465 sc-eQTL 8.88e-02 -0.252 0.147 0.13 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000088035 ALG6 -864813 sc-eQTL 8.95e-01 0.0178 0.134 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -185624 sc-eQTL 4.50e-03 -0.329 0.114 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -281370 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0426 0.0942 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 760356 sc-eQTL 9.95e-02 0.172 0.104 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 777339 sc-eQTL 8.49e-01 0.0226 0.119 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 66465 sc-eQTL 2.61e-01 -0.135 0.12 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -864813 sc-eQTL 6.21e-01 0.0641 0.13 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -185624 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0709 0.121 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -281370 sc-eQTL 3.48e-01 0.0868 0.0922 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 760356 sc-eQTL 4.29e-01 0.0874 0.11 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 777339 sc-eQTL 9.41e-02 0.176 0.105 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 66465 sc-eQTL 8.80e-01 0.0169 0.112 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -864813 sc-eQTL 5.63e-01 0.0672 0.116 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -185624 sc-eQTL 6.48e-02 -0.215 0.116 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -281370 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0298 0.0808 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 777339 sc-eQTL 9.21e-02 0.142 0.0837 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 66465 sc-eQTL 9.67e-01 -0.0042 0.102 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 307913 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00971 0.111 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -864813 sc-eQTL 9.66e-01 0.00556 0.132 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -185624 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0284 0.13 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -281370 sc-eQTL 1.74e-01 -0.151 0.111 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 777339 sc-eQTL 3.31e-01 0.126 0.13 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 66465 sc-eQTL 9.10e-02 0.204 0.12 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 307913 sc-eQTL 2.33e-01 0.0985 0.0824 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -864813 sc-eQTL 5.06e-01 0.0791 0.119 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -185624 sc-eQTL 2.97e-03 -0.313 0.104 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -281370 sc-eQTL 8.11e-01 0.0255 0.106 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 760356 sc-eQTL 2.01e-01 0.146 0.114 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 777339 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0102 0.105 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 66465 sc-eQTL 6.42e-01 0.0532 0.114 0.136 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116641 DOCK7 -185606 eQTL 3.13e-33 -0.36 0.0288 0.0 0.0144 0.133
ENSG00000132855 ANGPTL3 -94725 pQTL 2.1e-16 -0.335 0.0402 0.0172 0.0173 0.138
ENSG00000162607 USP1 66465 eQTL 1.68e-10 -0.114 0.0177 0.0 0.0 0.133

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina