logo

Genes within 1Mb (chr1:62474843:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000088035 ALG6 -892732 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0395 0.144 0.079 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 -213543 sc-eQTL 9.24e-01 0.0137 0.144 0.079 B L1
ENSG00000125703 ATG4C -309289 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0901 0.0999 0.079 B L1
ENSG00000132849 PATJ 732437 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0467 0.121 0.079 B L1
ENSG00000162604 TM2D1 749420 sc-eQTL 2.23e-01 0.148 0.121 0.079 B L1
ENSG00000162607 USP1 38546 sc-eQTL 5.32e-01 0.0864 0.138 0.079 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -892732 sc-eQTL 6.36e-02 0.242 0.13 0.079 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -213543 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0423 0.132 0.079 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C -309289 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0694 0.107 0.079 CD4T L1
ENSG00000132849 PATJ 732437 sc-eQTL 4.83e-01 0.0609 0.0867 0.079 CD4T L1
ENSG00000162604 TM2D1 749420 sc-eQTL 5.48e-01 0.0635 0.105 0.079 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 38546 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000549 0.104 0.079 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -892732 sc-eQTL 1.41e-01 0.212 0.143 0.079 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -213543 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00386 0.146 0.079 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C -309289 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00847 0.138 0.079 CD8T L1
ENSG00000132849 PATJ 732437 sc-eQTL 7.40e-01 0.0281 0.0844 0.079 CD8T L1
ENSG00000162604 TM2D1 749420 sc-eQTL 7.25e-01 0.0447 0.127 0.079 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 38546 sc-eQTL 4.67e-01 0.0877 0.12 0.079 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -892732 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0146 0.151 0.081 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 -213543 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0649 0.154 0.081 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C -309289 sc-eQTL 2.01e-01 0.154 0.12 0.081 DC L1
ENSG00000162604 TM2D1 749420 sc-eQTL 4.70e-02 -0.279 0.139 0.081 DC L1
ENSG00000162607 USP1 38546 sc-eQTL 8.88e-01 0.0208 0.147 0.081 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -892732 sc-eQTL 5.82e-01 0.0817 0.148 0.079 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 -213543 sc-eQTL 2.69e-01 0.158 0.143 0.079 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C -309289 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0532 0.0968 0.079 Mono L1
ENSG00000162604 TM2D1 749420 sc-eQTL 2.35e-01 -0.128 0.107 0.079 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 38546 sc-eQTL 7.77e-01 0.0357 0.126 0.079 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 279994 sc-eQTL 2.97e-01 0.122 0.117 0.079 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -892732 sc-eQTL 9.16e-02 0.242 0.143 0.079 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 -213543 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0532 0.118 0.079 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C -309289 sc-eQTL 7.28e-01 0.0443 0.127 0.079 NK L1
ENSG00000132849 PATJ 732437 sc-eQTL 2.32e-01 0.149 0.124 0.079 NK L1
ENSG00000162604 TM2D1 749420 sc-eQTL 2.07e-01 0.161 0.127 0.079 NK L1
ENSG00000162607 USP1 38546 sc-eQTL 2.77e-01 0.153 0.141 0.079 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -892732 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0489 0.141 0.079 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -213543 sc-eQTL 7.62e-01 0.0438 0.144 0.079 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C -309289 sc-eQTL 3.48e-01 -0.117 0.124 0.079 Other_T L1
ENSG00000132849 PATJ 732437 sc-eQTL 7.64e-01 0.0349 0.116 0.079 Other_T L1
ENSG00000162604 TM2D1 749420 sc-eQTL 4.36e-01 -0.106 0.136 0.079 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 38546 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00253 0.0959 0.079 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000088035 ALG6 -892732 sc-eQTL 3.65e-01 -0.154 0.17 0.082 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 -213543 sc-eQTL 4.33e-02 0.319 0.157 0.082 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C -309289 sc-eQTL 2.50e-01 0.192 0.166 0.082 B_Activated L2
ENSG00000132849 PATJ 732437 sc-eQTL 7.10e-01 0.0528 0.142 0.082 B_Activated L2
ENSG00000162604 TM2D1 749420 sc-eQTL 6.54e-01 0.0808 0.18 0.082 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 38546 sc-eQTL 4.57e-02 0.351 0.175 0.082 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -892732 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0337 0.174 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 -213543 sc-eQTL 8.58e-02 -0.285 0.165 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C -309289 sc-eQTL 7.63e-01 0.0425 0.141 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000132849 PATJ 732437 sc-eQTL 6.41e-01 0.071 0.152 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000162604 TM2D1 749420 sc-eQTL 7.77e-01 0.0453 0.16 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 38546 sc-eQTL 1.22e-01 0.258 0.166 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -892732 sc-eQTL 3.22e-01 0.168 0.17 0.08 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 -213543 sc-eQTL 8.95e-02 0.27 0.158 0.08 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C -309289 sc-eQTL 3.26e-01 0.149 0.151 0.08 B_Memory L2
ENSG00000132849 PATJ 732437 sc-eQTL 3.49e-01 -0.142 0.151 0.08 B_Memory L2
ENSG00000162604 TM2D1 749420 sc-eQTL 2.00e-01 0.218 0.169 0.08 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 38546 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0312 0.175 0.08 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -892732 sc-eQTL 1.87e-01 -0.222 0.168 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 -213543 sc-eQTL 2.25e-01 0.196 0.161 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C -309289 sc-eQTL 3.26e-01 -0.122 0.124 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000132849 PATJ 732437 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0854 0.16 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000162604 TM2D1 749420 sc-eQTL 6.07e-01 0.0759 0.147 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 38546 sc-eQTL 2.88e-01 0.154 0.145 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -892732 sc-eQTL 9.19e-01 0.0178 0.174 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 -213543 sc-eQTL 4.15e-01 0.137 0.167 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C -309289 sc-eQTL 4.08e-01 -0.133 0.161 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000132849 PATJ 732437 sc-eQTL 2.23e-01 0.201 0.164 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000162604 TM2D1 749420 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0354 0.167 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 38546 sc-eQTL 1.82e-01 -0.222 0.166 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -892732 sc-eQTL 3.73e-01 -0.158 0.177 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 -213543 sc-eQTL 4.96e-01 -0.105 0.155 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C -309289 sc-eQTL 9.26e-01 0.0149 0.16 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000132849 PATJ 732437 sc-eQTL 3.48e-01 -0.12 0.128 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000162604 TM2D1 749420 sc-eQTL 4.43e-01 -0.126 0.164 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 38546 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0387 0.163 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -892732 sc-eQTL 6.25e-02 0.27 0.144 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 -213543 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0599 0.143 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C -309289 sc-eQTL 8.28e-01 0.0275 0.126 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000132849 PATJ 732437 sc-eQTL 2.60e-01 0.0998 0.0883 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000162604 TM2D1 749420 sc-eQTL 4.76e-01 0.0909 0.127 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 38546 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0457 0.118 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -892732 sc-eQTL 4.25e-01 0.128 0.161 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -213543 sc-eQTL 1.30e-01 0.215 0.142 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C -309289 sc-eQTL 1.92e-01 -0.181 0.138 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000132849 PATJ 732437 sc-eQTL 6.82e-01 0.0457 0.111 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000162604 TM2D1 749420 sc-eQTL 3.08e-01 0.133 0.13 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 38546 sc-eQTL 8.00e-01 -0.034 0.134 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -892732 sc-eQTL 7.79e-01 0.0458 0.163 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -213543 sc-eQTL 3.87e-01 -0.138 0.159 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C -309289 sc-eQTL 1.77e-02 -0.365 0.152 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000132849 PATJ 732437 sc-eQTL 9.04e-01 0.0174 0.144 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000162604 TM2D1 749420 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0964 0.151 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 38546 sc-eQTL 4.10e-01 0.125 0.151 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -892732 sc-eQTL 9.46e-01 0.0109 0.16 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 -213543 sc-eQTL 5.06e-01 -0.101 0.152 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C -309289 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0197 0.162 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000132849 PATJ 732437 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0307 0.153 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000162604 TM2D1 749420 sc-eQTL 4.58e-01 0.104 0.14 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 38546 sc-eQTL 3.86e-01 -0.131 0.15 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -892732 sc-eQTL 2.99e-01 0.163 0.157 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 -213543 sc-eQTL 5.41e-01 0.0994 0.162 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C -309289 sc-eQTL 6.46e-01 0.0718 0.156 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000132849 PATJ 732437 sc-eQTL 2.86e-01 0.127 0.119 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000162604 TM2D1 749420 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0363 0.146 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 38546 sc-eQTL 5.12e-01 0.0877 0.133 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -892732 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0702 0.171 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -213543 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0595 0.167 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C -309289 sc-eQTL 2.01e-01 -0.218 0.17 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000132849 PATJ 732437 sc-eQTL 4.90e-01 -0.109 0.157 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000162604 TM2D1 749420 sc-eQTL 8.79e-01 0.0243 0.16 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 38546 sc-eQTL 9.62e-01 0.00761 0.16 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -892732 sc-eQTL 6.18e-01 0.0882 0.176 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -213543 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0912 0.171 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C -309289 sc-eQTL 3.90e-01 -0.142 0.164 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000132849 PATJ 732437 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0321 0.167 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000162604 TM2D1 749420 sc-eQTL 6.85e-02 -0.308 0.168 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 38546 sc-eQTL 4.80e-01 0.12 0.17 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -892732 sc-eQTL 9.71e-01 0.00581 0.158 0.08 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 -213543 sc-eQTL 5.87e-02 0.285 0.15 0.08 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C -309289 sc-eQTL 1.22e-01 -0.246 0.159 0.08 MAIT L2
ENSG00000132849 PATJ 732437 sc-eQTL 9.30e-01 0.0119 0.135 0.08 MAIT L2
ENSG00000162604 TM2D1 749420 sc-eQTL 3.27e-01 -0.15 0.153 0.08 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 38546 sc-eQTL 9.71e-01 0.00584 0.159 0.08 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -892732 sc-eQTL 4.49e-01 0.125 0.165 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 -213543 sc-eQTL 1.92e-01 0.186 0.142 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C -309289 sc-eQTL 1.01e-01 0.261 0.158 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000132849 PATJ 732437 sc-eQTL 7.45e-01 0.0509 0.156 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000162604 TM2D1 749420 sc-eQTL 9.63e-01 0.0074 0.159 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 38546 sc-eQTL 9.05e-01 0.0204 0.171 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -892732 sc-eQTL 6.49e-02 0.3 0.161 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 -213543 sc-eQTL 3.98e-01 -0.12 0.141 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C -309289 sc-eQTL 4.24e-01 0.115 0.144 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000132849 PATJ 732437 sc-eQTL 7.90e-01 0.0417 0.156 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000162604 TM2D1 749420 sc-eQTL 3.12e-01 0.15 0.148 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 38546 sc-eQTL 2.11e-01 0.198 0.158 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -892732 sc-eQTL 4.48e-01 0.137 0.18 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 -213543 sc-eQTL 3.25e-01 -0.136 0.137 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C -309289 sc-eQTL 4.09e-01 -0.132 0.16 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000132849 PATJ 732437 sc-eQTL 7.17e-01 0.054 0.149 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000162604 TM2D1 749420 sc-eQTL 8.77e-02 -0.288 0.168 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 38546 sc-eQTL 1.19e-01 0.274 0.175 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -892732 sc-eQTL 9.08e-01 0.0185 0.161 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 -213543 sc-eQTL 5.29e-01 0.0938 0.149 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C -309289 sc-eQTL 2.75e-01 -0.166 0.152 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000132849 PATJ 732437 sc-eQTL 2.69e-01 0.178 0.16 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000162604 TM2D1 749420 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00593 0.157 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 38546 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0931 0.166 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -892732 sc-eQTL 1.26e-01 0.291 0.189 0.089 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 -213543 sc-eQTL 8.94e-02 -0.345 0.201 0.089 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C -309289 sc-eQTL 4.03e-02 -0.362 0.175 0.089 PB L2
ENSG00000132849 PATJ 732437 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0613 0.185 0.089 PB L2
ENSG00000162604 TM2D1 749420 sc-eQTL 6.12e-01 0.0911 0.179 0.089 PB L2
ENSG00000162607 USP1 38546 sc-eQTL 7.13e-01 0.0653 0.177 0.089 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -892732 sc-eQTL 3.44e-01 0.146 0.154 0.078 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 -213543 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0671 0.155 0.078 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C -309289 sc-eQTL 8.52e-01 0.0253 0.135 0.078 Pro_T L2
ENSG00000132849 PATJ 732437 sc-eQTL 3.92e-01 0.127 0.148 0.078 Pro_T L2
ENSG00000162604 TM2D1 749420 sc-eQTL 3.75e-01 0.147 0.165 0.078 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 38546 sc-eQTL 5.15e-01 0.0609 0.0933 0.078 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -892732 sc-eQTL 5.19e-01 0.111 0.171 0.079 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 -213543 sc-eQTL 2.35e-01 -0.187 0.157 0.079 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C -309289 sc-eQTL 9.26e-01 0.015 0.161 0.079 Treg L2
ENSG00000132849 PATJ 732437 sc-eQTL 3.83e-01 0.13 0.149 0.079 Treg L2
ENSG00000162604 TM2D1 749420 sc-eQTL 9.70e-02 -0.272 0.163 0.079 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 38546 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00779 0.163 0.079 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -892732 sc-eQTL 6.51e-01 0.0728 0.161 0.078 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 -213543 sc-eQTL 5.06e-01 -0.105 0.158 0.078 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C -309289 sc-eQTL 5.80e-01 0.0759 0.137 0.078 cDC L2
ENSG00000162604 TM2D1 749420 sc-eQTL 7.85e-02 -0.3 0.17 0.078 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 38546 sc-eQTL 8.31e-01 -0.033 0.155 0.078 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -892732 sc-eQTL 3.94e-01 0.126 0.148 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 -213543 sc-eQTL 4.68e-02 0.309 0.155 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C -309289 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0785 0.11 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000162604 TM2D1 749420 sc-eQTL 5.16e-01 0.0735 0.113 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 38546 sc-eQTL 5.22e-01 0.0879 0.137 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 279994 sc-eQTL 8.27e-01 0.0302 0.138 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -892732 sc-eQTL 3.97e-01 -0.14 0.165 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 -213543 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0466 0.153 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C -309289 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0627 0.133 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000162604 TM2D1 749420 sc-eQTL 5.79e-02 -0.256 0.134 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 38546 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0487 0.154 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 279994 sc-eQTL 3.98e-01 -0.108 0.128 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -892732 sc-eQTL 5.27e-01 -0.129 0.204 0.07 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 -213543 sc-eQTL 5.59e-01 -0.117 0.2 0.07 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C -309289 sc-eQTL 6.14e-01 0.0964 0.191 0.07 gdT L2
ENSG00000132849 PATJ 732437 sc-eQTL 6.40e-01 0.0873 0.187 0.07 gdT L2
ENSG00000162604 TM2D1 749420 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0406 0.197 0.07 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 38546 sc-eQTL 9.92e-01 0.00184 0.192 0.07 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -892732 sc-eQTL 6.40e-01 0.0724 0.155 0.078 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 -213543 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0762 0.158 0.078 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C -309289 sc-eQTL 4.63e-02 0.3 0.15 0.078 intMono L2
ENSG00000162604 TM2D1 749420 sc-eQTL 4.14e-01 -0.131 0.16 0.078 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 38546 sc-eQTL 1.99e-01 -0.217 0.169 0.078 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 279994 sc-eQTL 2.88e-01 0.132 0.124 0.078 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -892732 sc-eQTL 6.87e-01 0.0674 0.167 0.075 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 -213543 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0184 0.165 0.075 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C -309289 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0747 0.154 0.075 ncMono L2
ENSG00000162604 TM2D1 749420 sc-eQTL 7.18e-01 -0.06 0.166 0.075 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 38546 sc-eQTL 3.22e-01 -0.163 0.164 0.075 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 279994 sc-eQTL 1.40e-01 0.172 0.116 0.075 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -892732 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0654 0.183 0.071 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 -213543 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0805 0.187 0.071 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C -309289 sc-eQTL 2.73e-01 0.184 0.168 0.071 pDC L2
ENSG00000162604 TM2D1 749420 sc-eQTL 4.34e-01 -0.129 0.164 0.071 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 38546 sc-eQTL 1.12e-01 0.305 0.191 0.071 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000088035 ALG6 -892732 sc-eQTL 6.87e-01 0.0705 0.175 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -213543 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0608 0.151 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -309289 sc-eQTL 2.01e-01 0.156 0.122 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 732437 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0914 0.136 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 749420 sc-eQTL 3.72e-01 0.138 0.154 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 38546 sc-eQTL 2.74e-01 0.171 0.156 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -892732 sc-eQTL 3.75e-01 -0.149 0.168 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -213543 sc-eQTL 2.68e-01 0.174 0.156 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -309289 sc-eQTL 9.35e-02 -0.2 0.119 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 732437 sc-eQTL 9.00e-01 0.0181 0.143 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 749420 sc-eQTL 8.16e-01 0.0319 0.137 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 38546 sc-eQTL 8.69e-01 0.024 0.145 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -892732 sc-eQTL 9.82e-01 0.0034 0.146 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -213543 sc-eQTL 1.23e-01 0.227 0.147 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -309289 sc-eQTL 1.93e-01 -0.133 0.102 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 749420 sc-eQTL 4.30e-01 -0.084 0.106 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 38546 sc-eQTL 3.78e-01 0.114 0.129 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 279994 sc-eQTL 8.30e-01 0.03 0.14 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -892732 sc-eQTL 7.26e-01 0.0575 0.164 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -213543 sc-eQTL 9.70e-01 0.00608 0.162 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -309289 sc-eQTL 1.55e-01 0.196 0.137 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 749420 sc-eQTL 3.56e-01 -0.149 0.161 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 38546 sc-eQTL 2.28e-01 -0.182 0.15 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 279994 sc-eQTL 9.84e-02 0.17 0.102 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -892732 sc-eQTL 7.60e-02 0.265 0.149 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -213543 sc-eQTL 2.91e-01 -0.142 0.134 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -309289 sc-eQTL 7.09e-01 0.0501 0.134 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 732437 sc-eQTL 1.58e-01 0.204 0.144 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 749420 sc-eQTL 3.88e-01 0.114 0.132 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 38546 sc-eQTL 1.47e-01 0.209 0.143 0.08 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116641 DOCK7 -213525 eQTL 0.000513 0.155 0.0445 0.0 0.0 0.0618

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116641 DOCK7 -213525 2.78e-06 2.62e-06 3.47e-07 1.98e-06 5.96e-07 8.09e-07 1.82e-06 8.27e-07 1.95e-06 1.03e-06 2.51e-06 1.31e-06 3.54e-06 1.44e-06 9.01e-07 1.64e-06 1.26e-06 2.18e-06 1.29e-06 1.39e-06 1.38e-06 3.02e-06 2.14e-06 1.17e-06 3.4e-06 1.33e-06 1.47e-06 1.81e-06 1.94e-06 1.9e-06 1.8e-06 3.98e-07 6.01e-07 1.28e-06 1.33e-06 9.27e-07 9.23e-07 4.24e-07 1.09e-06 4.17e-07 2.38e-07 3e-06 6.14e-07 1.67e-07 3.52e-07 3.61e-07 8.94e-07 2.33e-07 1.76e-07