logo

Genes within 1Mb (chr1:62449802:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000088035 ALG6 -917773 sc-eQTL 9.25e-01 0.0105 0.111 0.147 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 -238584 sc-eQTL 5.64e-03 -0.305 0.109 0.147 B L1
ENSG00000125703 ATG4C -334330 sc-eQTL 4.52e-01 0.0581 0.0772 0.147 B L1
ENSG00000132849 PATJ 707396 sc-eQTL 1.92e-01 0.122 0.0934 0.147 B L1
ENSG00000162604 TM2D1 724379 sc-eQTL 1.83e-02 0.22 0.0924 0.147 B L1
ENSG00000162607 USP1 13505 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0332 0.107 0.147 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -917773 sc-eQTL 8.88e-01 0.0145 0.103 0.147 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -238584 sc-eQTL 1.40e-01 -0.154 0.104 0.147 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C -334330 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00792 0.0841 0.147 CD4T L1
ENSG00000132849 PATJ 707396 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0581 0.0681 0.147 CD4T L1
ENSG00000162604 TM2D1 724379 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0157 0.0829 0.147 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 13505 sc-eQTL 5.08e-01 -0.054 0.0815 0.147 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -917773 sc-eQTL 2.96e-01 0.118 0.113 0.147 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -238584 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0994 0.115 0.147 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C -334330 sc-eQTL 9.80e-01 0.00273 0.109 0.147 CD8T L1
ENSG00000132849 PATJ 707396 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00218 0.0665 0.147 CD8T L1
ENSG00000162604 TM2D1 724379 sc-eQTL 9.89e-01 0.00139 0.0998 0.147 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 13505 sc-eQTL 8.02e-01 0.0238 0.095 0.147 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -917773 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0653 0.116 0.146 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 -238584 sc-eQTL 3.16e-01 0.12 0.119 0.146 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C -334330 sc-eQTL 1.08e-01 -0.15 0.0928 0.146 DC L1
ENSG00000162604 TM2D1 724379 sc-eQTL 7.48e-01 0.035 0.109 0.146 DC L1
ENSG00000162607 USP1 13505 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0651 0.114 0.146 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -917773 sc-eQTL 5.12e-01 0.0761 0.116 0.147 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 -238584 sc-eQTL 1.83e-01 -0.149 0.112 0.147 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C -334330 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0907 0.0755 0.147 Mono L1
ENSG00000162604 TM2D1 724379 sc-eQTL 1.04e-01 0.136 0.0836 0.147 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 13505 sc-eQTL 9.04e-01 0.0119 0.0983 0.147 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 254953 sc-eQTL 2.24e-01 0.112 0.0914 0.147 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -917773 sc-eQTL 5.17e-01 0.0733 0.113 0.146 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 -238584 sc-eQTL 2.76e-03 -0.276 0.0912 0.146 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C -334330 sc-eQTL 9.85e-01 0.00192 0.1 0.146 NK L1
ENSG00000132849 PATJ 707396 sc-eQTL 7.74e-02 0.173 0.0974 0.146 NK L1
ENSG00000162604 TM2D1 724379 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0141 0.1 0.146 NK L1
ENSG00000162607 USP1 13505 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0298 0.111 0.146 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -917773 sc-eQTL 9.37e-02 -0.178 0.106 0.147 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -238584 sc-eQTL 1.03e-01 -0.177 0.108 0.147 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C -334330 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0877 0.0939 0.147 Other_T L1
ENSG00000132849 PATJ 707396 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0798 0.0875 0.147 Other_T L1
ENSG00000162604 TM2D1 724379 sc-eQTL 6.53e-01 0.0462 0.103 0.147 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 13505 sc-eQTL 4.34e-01 0.0566 0.0722 0.147 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000088035 ALG6 -917773 sc-eQTL 9.85e-01 -0.0026 0.138 0.145 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 -238584 sc-eQTL 3.87e-01 -0.111 0.129 0.145 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C -334330 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0738 0.135 0.145 B_Activated L2
ENSG00000132849 PATJ 707396 sc-eQTL 7.07e-02 -0.207 0.114 0.145 B_Activated L2
ENSG00000162604 TM2D1 724379 sc-eQTL 3.59e-01 -0.134 0.146 0.145 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 13505 sc-eQTL 1.31e-01 -0.216 0.143 0.145 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -917773 sc-eQTL 7.74e-01 0.0376 0.131 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 -238584 sc-eQTL 4.33e-02 -0.251 0.124 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C -334330 sc-eQTL 8.08e-01 0.0257 0.106 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000132849 PATJ 707396 sc-eQTL 2.80e-01 0.124 0.114 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000162604 TM2D1 724379 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0933 0.12 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 13505 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0163 0.126 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -917773 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0491 0.127 0.147 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 -238584 sc-eQTL 5.36e-03 -0.329 0.117 0.147 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C -334330 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0625 0.113 0.147 B_Memory L2
ENSG00000132849 PATJ 707396 sc-eQTL 2.39e-02 0.254 0.112 0.147 B_Memory L2
ENSG00000162604 TM2D1 724379 sc-eQTL 7.97e-02 0.222 0.126 0.147 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 13505 sc-eQTL 2.82e-01 -0.141 0.13 0.147 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -917773 sc-eQTL 9.38e-01 -0.01 0.128 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 -238584 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0662 0.123 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C -334330 sc-eQTL 9.63e-01 0.00435 0.0947 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000132849 PATJ 707396 sc-eQTL 9.04e-01 0.0147 0.122 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000162604 TM2D1 724379 sc-eQTL 2.05e-01 0.142 0.112 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 13505 sc-eQTL 9.43e-01 0.00797 0.11 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -917773 sc-eQTL 2.13e-01 0.164 0.131 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 -238584 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0282 0.127 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C -334330 sc-eQTL 1.85e-01 0.162 0.122 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000132849 PATJ 707396 sc-eQTL 5.84e-01 0.0685 0.125 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000162604 TM2D1 724379 sc-eQTL 2.15e-02 0.289 0.125 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 13505 sc-eQTL 4.66e-01 0.0919 0.126 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -917773 sc-eQTL 2.44e-01 0.154 0.132 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 -238584 sc-eQTL 1.55e-01 -0.165 0.115 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C -334330 sc-eQTL 9.13e-01 0.0131 0.12 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000132849 PATJ 707396 sc-eQTL 5.41e-01 0.0587 0.0959 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000162604 TM2D1 724379 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0304 0.123 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 13505 sc-eQTL 2.92e-01 -0.129 0.122 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -917773 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0137 0.114 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 -238584 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0506 0.112 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C -334330 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0684 0.0988 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000132849 PATJ 707396 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0244 0.0694 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000162604 TM2D1 724379 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0666 0.0998 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 13505 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0748 0.0922 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -917773 sc-eQTL 4.03e-01 0.106 0.126 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -238584 sc-eQTL 1.87e-01 -0.148 0.112 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C -334330 sc-eQTL 3.27e-01 0.107 0.109 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000132849 PATJ 707396 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0584 0.0876 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000162604 TM2D1 724379 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0616 0.102 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 13505 sc-eQTL 6.06e-01 0.0545 0.106 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -917773 sc-eQTL 9.74e-01 0.00417 0.129 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -238584 sc-eQTL 4.06e-01 -0.105 0.126 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C -334330 sc-eQTL 2.56e-01 0.139 0.122 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000132849 PATJ 707396 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0549 0.114 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000162604 TM2D1 724379 sc-eQTL 3.30e-01 -0.117 0.12 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 13505 sc-eQTL 9.84e-02 -0.198 0.119 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -917773 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0525 0.124 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 -238584 sc-eQTL 3.55e-01 -0.109 0.117 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C -334330 sc-eQTL 3.25e-01 -0.123 0.125 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000132849 PATJ 707396 sc-eQTL 3.66e-01 -0.107 0.118 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000162604 TM2D1 724379 sc-eQTL 6.36e-01 0.0514 0.109 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 13505 sc-eQTL 5.07e-01 0.0774 0.116 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -917773 sc-eQTL 2.47e-01 0.14 0.121 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 -238584 sc-eQTL 1.73e-01 0.171 0.125 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C -334330 sc-eQTL 6.25e-01 -0.059 0.12 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000132849 PATJ 707396 sc-eQTL 6.57e-01 -0.041 0.0921 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000162604 TM2D1 724379 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0789 0.112 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 13505 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0984 0.103 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -917773 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0641 0.136 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -238584 sc-eQTL 2.09e-01 -0.167 0.132 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C -334330 sc-eQTL 9.66e-02 0.225 0.135 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000132849 PATJ 707396 sc-eQTL 3.20e-01 0.124 0.125 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000162604 TM2D1 724379 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0961 0.127 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 13505 sc-eQTL 6.93e-01 0.0503 0.127 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -917773 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0864 0.132 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -238584 sc-eQTL 4.91e-02 0.251 0.127 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C -334330 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00985 0.123 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000132849 PATJ 707396 sc-eQTL 8.90e-01 0.0172 0.125 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000162604 TM2D1 724379 sc-eQTL 2.80e-01 0.137 0.127 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 13505 sc-eQTL 5.26e-01 0.0808 0.127 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -917773 sc-eQTL 3.80e-01 -0.106 0.12 0.149 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 -238584 sc-eQTL 2.90e-01 -0.122 0.115 0.149 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C -334330 sc-eQTL 9.05e-02 -0.205 0.121 0.149 MAIT L2
ENSG00000132849 PATJ 707396 sc-eQTL 9.89e-01 0.00137 0.103 0.149 MAIT L2
ENSG00000162604 TM2D1 724379 sc-eQTL 9.28e-01 0.0106 0.117 0.149 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 13505 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0851 0.121 0.149 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -917773 sc-eQTL 1.95e-01 0.166 0.128 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 -238584 sc-eQTL 3.10e-01 -0.113 0.111 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C -334330 sc-eQTL 4.45e-01 0.0947 0.124 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000132849 PATJ 707396 sc-eQTL 3.60e-02 0.254 0.12 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000162604 TM2D1 724379 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0366 0.124 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 13505 sc-eQTL 2.05e-01 -0.169 0.133 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -917773 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0748 0.128 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 -238584 sc-eQTL 1.69e-01 -0.153 0.111 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C -334330 sc-eQTL 6.52e-01 0.0509 0.113 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000132849 PATJ 707396 sc-eQTL 3.23e-02 0.261 0.121 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000162604 TM2D1 724379 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00476 0.116 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 13505 sc-eQTL 1.37e-01 -0.185 0.124 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -917773 sc-eQTL 1.53e-01 0.198 0.138 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 -238584 sc-eQTL 1.42e-01 -0.156 0.106 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C -334330 sc-eQTL 6.65e-01 0.0536 0.124 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000132849 PATJ 707396 sc-eQTL 5.20e-01 0.0738 0.115 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000162604 TM2D1 724379 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0594 0.13 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 13505 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00847 0.136 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -917773 sc-eQTL 6.65e-01 0.0539 0.125 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 -238584 sc-eQTL 1.39e-03 -0.365 0.113 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C -334330 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0658 0.118 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000132849 PATJ 707396 sc-eQTL 3.10e-01 -0.126 0.124 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000162604 TM2D1 724379 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0106 0.122 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 13505 sc-eQTL 2.52e-01 0.147 0.128 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -917773 sc-eQTL 9.79e-01 0.00383 0.146 0.17 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 -238584 sc-eQTL 9.74e-01 0.00519 0.157 0.17 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C -334330 sc-eQTL 3.27e-01 0.134 0.136 0.17 PB L2
ENSG00000132849 PATJ 707396 sc-eQTL 6.86e-01 0.0574 0.142 0.17 PB L2
ENSG00000162604 TM2D1 724379 sc-eQTL 1.25e-01 0.21 0.136 0.17 PB L2
ENSG00000162607 USP1 13505 sc-eQTL 9.95e-01 0.000922 0.136 0.17 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -917773 sc-eQTL 4.80e-02 -0.233 0.117 0.146 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 -238584 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0768 0.119 0.146 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C -334330 sc-eQTL 7.32e-01 0.0356 0.104 0.146 Pro_T L2
ENSG00000132849 PATJ 707396 sc-eQTL 3.38e-01 -0.109 0.113 0.146 Pro_T L2
ENSG00000162604 TM2D1 724379 sc-eQTL 9.25e-01 0.012 0.127 0.146 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 13505 sc-eQTL 5.04e-01 -0.048 0.0716 0.146 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -917773 sc-eQTL 3.72e-02 -0.27 0.129 0.147 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 -238584 sc-eQTL 2.77e-01 -0.13 0.119 0.147 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C -334330 sc-eQTL 4.02e-01 -0.102 0.122 0.147 Treg L2
ENSG00000132849 PATJ 707396 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0138 0.113 0.147 Treg L2
ENSG00000162604 TM2D1 724379 sc-eQTL 3.69e-01 0.112 0.125 0.147 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 13505 sc-eQTL 2.90e-01 0.131 0.123 0.147 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -917773 sc-eQTL 7.70e-01 0.0369 0.126 0.144 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 -238584 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00803 0.124 0.144 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C -334330 sc-eQTL 3.00e-01 -0.111 0.107 0.144 cDC L2
ENSG00000162604 TM2D1 724379 sc-eQTL 9.29e-01 0.0121 0.134 0.144 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 13505 sc-eQTL 4.07e-01 0.101 0.121 0.144 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -917773 sc-eQTL 9.24e-01 -0.011 0.116 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 -238584 sc-eQTL 1.33e-01 -0.184 0.122 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C -334330 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0448 0.0862 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000162604 TM2D1 724379 sc-eQTL 4.87e-01 0.0619 0.0889 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 13505 sc-eQTL 6.60e-01 0.0475 0.108 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 254953 sc-eQTL 5.40e-01 0.0665 0.108 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -917773 sc-eQTL 5.75e-01 0.0734 0.131 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 -238584 sc-eQTL 3.09e-01 -0.123 0.121 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C -334330 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0505 0.105 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000162604 TM2D1 724379 sc-eQTL 2.00e-01 0.137 0.107 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 13505 sc-eQTL 2.79e-01 -0.132 0.122 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 254953 sc-eQTL 5.97e-01 0.0536 0.101 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -917773 sc-eQTL 8.12e-01 0.0389 0.163 0.155 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 -238584 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0343 0.16 0.155 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C -334330 sc-eQTL 3.34e-01 0.148 0.152 0.155 gdT L2
ENSG00000132849 PATJ 707396 sc-eQTL 3.99e-01 -0.126 0.149 0.155 gdT L2
ENSG00000162604 TM2D1 724379 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0266 0.157 0.155 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 13505 sc-eQTL 6.83e-02 0.279 0.152 0.155 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -917773 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0941 0.122 0.147 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 -238584 sc-eQTL 2.32e-01 0.15 0.125 0.147 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C -334330 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0852 0.119 0.147 intMono L2
ENSG00000162604 TM2D1 724379 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00778 0.127 0.147 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 13505 sc-eQTL 4.30e-01 0.106 0.134 0.147 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 254953 sc-eQTL 5.30e-01 -0.062 0.0984 0.147 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -917773 sc-eQTL 9.06e-01 0.0155 0.13 0.14 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 -238584 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0397 0.128 0.14 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C -334330 sc-eQTL 2.64e-01 -0.134 0.119 0.14 ncMono L2
ENSG00000162604 TM2D1 724379 sc-eQTL 1.65e-01 0.179 0.128 0.14 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 13505 sc-eQTL 6.20e-01 0.0634 0.128 0.14 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 254953 sc-eQTL 6.24e-02 0.169 0.09 0.14 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -917773 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0988 0.137 0.144 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 -238584 sc-eQTL 4.78e-02 0.276 0.138 0.144 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C -334330 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0951 0.126 0.144 pDC L2
ENSG00000162604 TM2D1 724379 sc-eQTL 6.77e-01 0.0513 0.123 0.144 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 13505 sc-eQTL 5.26e-02 -0.278 0.142 0.144 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000088035 ALG6 -917773 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00483 0.133 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -238584 sc-eQTL 3.58e-03 -0.332 0.113 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -334330 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0354 0.093 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 707396 sc-eQTL 5.97e-02 0.193 0.102 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 724379 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0108 0.117 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 13505 sc-eQTL 1.92e-01 -0.155 0.118 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -917773 sc-eQTL 6.92e-01 0.0509 0.128 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -238584 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0756 0.12 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -334330 sc-eQTL 3.23e-01 0.0904 0.0912 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 707396 sc-eQTL 6.94e-01 0.043 0.109 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 724379 sc-eQTL 1.20e-02 0.261 0.103 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 13505 sc-eQTL 8.60e-01 0.0196 0.111 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -917773 sc-eQTL 7.38e-01 0.0384 0.115 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -238584 sc-eQTL 1.42e-01 -0.17 0.115 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -334330 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0665 0.0798 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 724379 sc-eQTL 1.36e-01 0.124 0.0829 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 13505 sc-eQTL 6.28e-01 -0.049 0.101 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 254953 sc-eQTL 6.70e-01 0.0468 0.11 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -917773 sc-eQTL 9.11e-01 0.0146 0.131 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -238584 sc-eQTL 8.36e-01 0.0269 0.129 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -334330 sc-eQTL 2.77e-01 -0.12 0.11 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 724379 sc-eQTL 2.05e-01 0.163 0.128 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 13505 sc-eQTL 6.74e-02 0.219 0.119 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 254953 sc-eQTL 2.58e-01 0.0927 0.0817 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -917773 sc-eQTL 7.58e-01 0.0364 0.118 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -238584 sc-eQTL 1.41e-02 -0.258 0.104 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -334330 sc-eQTL 8.79e-01 0.016 0.105 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 707396 sc-eQTL 2.26e-01 0.138 0.113 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 724379 sc-eQTL 8.64e-01 0.0178 0.104 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 13505 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00199 0.113 0.147 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116641 DOCK7 -238566 eQTL 8.13e-31 -0.342 0.0286 0.0 0.00286 0.138
ENSG00000132855 ANGPTL3 -147685 pQTL 3.43e-16 -0.328 0.0397 0.011 0.0106 0.143
ENSG00000162607 USP1 13505 eQTL 2.87e-10 -0.111 0.0175 0.0 0.0 0.138

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116641 DOCK7 -238566 4.79e-06 5.09e-06 7.5e-07 3.21e-06 1.62e-06 1.57e-06 5.17e-06 9.23e-07 5.13e-06 2.88e-06 5.68e-06 3.29e-06 7.43e-06 1.79e-06 1.09e-06 3.83e-06 1.87e-06 3.69e-06 1.54e-06 1.18e-06 2.73e-06 4.86e-06 4.6e-06 1.48e-06 8.44e-06 1.81e-06 2.35e-06 1.55e-06 4.48e-06 4.34e-06 2.89e-06 4.03e-07 6.11e-07 1.68e-06 1.95e-06 9.53e-07 9.63e-07 4.56e-07 1.06e-06 6.99e-07 6.18e-07 5.76e-06 6.81e-07 1.82e-07 6.1e-07 1.34e-06 1.06e-06 6.9e-07 4.23e-07
ENSG00000162607 USP1 13505 3.54e-05 3.34e-05 6.39e-06 1.59e-05 6.17e-06 1.48e-05 4.59e-05 4.92e-06 3.27e-05 1.64e-05 4.02e-05 1.85e-05 4.95e-05 1.45e-05 7.23e-06 1.98e-05 1.83e-05 2.61e-05 7.92e-06 7.1e-06 1.63e-05 3.5e-05 3.29e-05 9.54e-06 4.61e-05 8.34e-06 1.47e-05 1.34e-05 3.31e-05 2.57e-05 2.13e-05 1.65e-06 2.68e-06 7.37e-06 1.21e-05 5.9e-06 3.2e-06 3.17e-06 4.95e-06 3.48e-06 1.67e-06 3.84e-05 3.68e-06 3.63e-07 2.63e-06 4.04e-06 4.14e-06 1.69e-06 1.54e-06