logo

Genes within 1Mb (chr1:62440418:C:CAA):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000088035 ALG6 -927157 sc-eQTL 9.25e-01 0.0105 0.111 0.147 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 -247968 sc-eQTL 5.64e-03 -0.305 0.109 0.147 B L1
ENSG00000125703 ATG4C -343714 sc-eQTL 4.52e-01 0.0581 0.0772 0.147 B L1
ENSG00000132849 PATJ 698012 sc-eQTL 1.92e-01 0.122 0.0934 0.147 B L1
ENSG00000162604 TM2D1 714995 sc-eQTL 1.83e-02 0.22 0.0924 0.147 B L1
ENSG00000162607 USP1 4121 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0332 0.107 0.147 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -927157 sc-eQTL 8.88e-01 0.0145 0.103 0.147 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -247968 sc-eQTL 1.40e-01 -0.154 0.104 0.147 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C -343714 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00792 0.0841 0.147 CD4T L1
ENSG00000132849 PATJ 698012 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0581 0.0681 0.147 CD4T L1
ENSG00000162604 TM2D1 714995 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0157 0.0829 0.147 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 4121 sc-eQTL 5.08e-01 -0.054 0.0815 0.147 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -927157 sc-eQTL 2.96e-01 0.118 0.113 0.147 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -247968 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0994 0.115 0.147 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C -343714 sc-eQTL 9.80e-01 0.00273 0.109 0.147 CD8T L1
ENSG00000132849 PATJ 698012 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00218 0.0665 0.147 CD8T L1
ENSG00000162604 TM2D1 714995 sc-eQTL 9.89e-01 0.00139 0.0998 0.147 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 4121 sc-eQTL 8.02e-01 0.0238 0.095 0.147 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -927157 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0653 0.116 0.146 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 -247968 sc-eQTL 3.16e-01 0.12 0.119 0.146 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C -343714 sc-eQTL 1.08e-01 -0.15 0.0928 0.146 DC L1
ENSG00000162604 TM2D1 714995 sc-eQTL 7.48e-01 0.035 0.109 0.146 DC L1
ENSG00000162607 USP1 4121 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0651 0.114 0.146 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -927157 sc-eQTL 5.12e-01 0.0761 0.116 0.147 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 -247968 sc-eQTL 1.83e-01 -0.149 0.112 0.147 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C -343714 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0907 0.0755 0.147 Mono L1
ENSG00000162604 TM2D1 714995 sc-eQTL 1.04e-01 0.136 0.0836 0.147 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 4121 sc-eQTL 9.04e-01 0.0119 0.0983 0.147 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 245569 sc-eQTL 2.24e-01 0.112 0.0914 0.147 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -927157 sc-eQTL 5.17e-01 0.0733 0.113 0.146 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 -247968 sc-eQTL 2.76e-03 -0.276 0.0912 0.146 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C -343714 sc-eQTL 9.85e-01 0.00192 0.1 0.146 NK L1
ENSG00000132849 PATJ 698012 sc-eQTL 7.74e-02 0.173 0.0974 0.146 NK L1
ENSG00000162604 TM2D1 714995 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0141 0.1 0.146 NK L1
ENSG00000162607 USP1 4121 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0298 0.111 0.146 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -927157 sc-eQTL 9.37e-02 -0.178 0.106 0.147 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -247968 sc-eQTL 1.03e-01 -0.177 0.108 0.147 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C -343714 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0877 0.0939 0.147 Other_T L1
ENSG00000132849 PATJ 698012 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0798 0.0875 0.147 Other_T L1
ENSG00000162604 TM2D1 714995 sc-eQTL 6.53e-01 0.0462 0.103 0.147 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 4121 sc-eQTL 4.34e-01 0.0566 0.0722 0.147 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000088035 ALG6 -927157 sc-eQTL 9.85e-01 -0.0026 0.138 0.145 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 -247968 sc-eQTL 3.87e-01 -0.111 0.129 0.145 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C -343714 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0738 0.135 0.145 B_Activated L2
ENSG00000132849 PATJ 698012 sc-eQTL 7.07e-02 -0.207 0.114 0.145 B_Activated L2
ENSG00000162604 TM2D1 714995 sc-eQTL 3.59e-01 -0.134 0.146 0.145 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 4121 sc-eQTL 1.31e-01 -0.216 0.143 0.145 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -927157 sc-eQTL 7.74e-01 0.0376 0.131 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 -247968 sc-eQTL 4.33e-02 -0.251 0.124 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C -343714 sc-eQTL 8.08e-01 0.0257 0.106 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000132849 PATJ 698012 sc-eQTL 2.80e-01 0.124 0.114 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000162604 TM2D1 714995 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0933 0.12 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 4121 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0163 0.126 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -927157 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0491 0.127 0.147 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 -247968 sc-eQTL 5.36e-03 -0.329 0.117 0.147 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C -343714 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0625 0.113 0.147 B_Memory L2
ENSG00000132849 PATJ 698012 sc-eQTL 2.39e-02 0.254 0.112 0.147 B_Memory L2
ENSG00000162604 TM2D1 714995 sc-eQTL 7.97e-02 0.222 0.126 0.147 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 4121 sc-eQTL 2.82e-01 -0.141 0.13 0.147 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -927157 sc-eQTL 9.38e-01 -0.01 0.128 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 -247968 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0662 0.123 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C -343714 sc-eQTL 9.63e-01 0.00435 0.0947 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000132849 PATJ 698012 sc-eQTL 9.04e-01 0.0147 0.122 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000162604 TM2D1 714995 sc-eQTL 2.05e-01 0.142 0.112 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 4121 sc-eQTL 9.43e-01 0.00797 0.11 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -927157 sc-eQTL 2.13e-01 0.164 0.131 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 -247968 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0282 0.127 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C -343714 sc-eQTL 1.85e-01 0.162 0.122 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000132849 PATJ 698012 sc-eQTL 5.84e-01 0.0685 0.125 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000162604 TM2D1 714995 sc-eQTL 2.15e-02 0.289 0.125 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 4121 sc-eQTL 4.66e-01 0.0919 0.126 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -927157 sc-eQTL 2.44e-01 0.154 0.132 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 -247968 sc-eQTL 1.55e-01 -0.165 0.115 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C -343714 sc-eQTL 9.13e-01 0.0131 0.12 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000132849 PATJ 698012 sc-eQTL 5.41e-01 0.0587 0.0959 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000162604 TM2D1 714995 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0304 0.123 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 4121 sc-eQTL 2.92e-01 -0.129 0.122 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -927157 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0137 0.114 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 -247968 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0506 0.112 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C -343714 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0684 0.0988 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000132849 PATJ 698012 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0244 0.0694 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000162604 TM2D1 714995 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0666 0.0998 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 4121 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0748 0.0922 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -927157 sc-eQTL 4.03e-01 0.106 0.126 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -247968 sc-eQTL 1.87e-01 -0.148 0.112 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C -343714 sc-eQTL 3.27e-01 0.107 0.109 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000132849 PATJ 698012 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0584 0.0876 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000162604 TM2D1 714995 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0616 0.102 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 4121 sc-eQTL 6.06e-01 0.0545 0.106 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -927157 sc-eQTL 9.74e-01 0.00417 0.129 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -247968 sc-eQTL 4.06e-01 -0.105 0.126 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C -343714 sc-eQTL 2.56e-01 0.139 0.122 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000132849 PATJ 698012 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0549 0.114 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000162604 TM2D1 714995 sc-eQTL 3.30e-01 -0.117 0.12 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 4121 sc-eQTL 9.84e-02 -0.198 0.119 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -927157 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0525 0.124 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 -247968 sc-eQTL 3.55e-01 -0.109 0.117 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C -343714 sc-eQTL 3.25e-01 -0.123 0.125 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000132849 PATJ 698012 sc-eQTL 3.66e-01 -0.107 0.118 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000162604 TM2D1 714995 sc-eQTL 6.36e-01 0.0514 0.109 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 4121 sc-eQTL 5.07e-01 0.0774 0.116 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -927157 sc-eQTL 2.47e-01 0.14 0.121 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 -247968 sc-eQTL 1.73e-01 0.171 0.125 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C -343714 sc-eQTL 6.25e-01 -0.059 0.12 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000132849 PATJ 698012 sc-eQTL 6.57e-01 -0.041 0.0921 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000162604 TM2D1 714995 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0789 0.112 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 4121 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0984 0.103 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -927157 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0641 0.136 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -247968 sc-eQTL 2.09e-01 -0.167 0.132 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C -343714 sc-eQTL 9.66e-02 0.225 0.135 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000132849 PATJ 698012 sc-eQTL 3.20e-01 0.124 0.125 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000162604 TM2D1 714995 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0961 0.127 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 4121 sc-eQTL 6.93e-01 0.0503 0.127 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -927157 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0864 0.132 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -247968 sc-eQTL 4.91e-02 0.251 0.127 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C -343714 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00985 0.123 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000132849 PATJ 698012 sc-eQTL 8.90e-01 0.0172 0.125 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000162604 TM2D1 714995 sc-eQTL 2.80e-01 0.137 0.127 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 4121 sc-eQTL 5.26e-01 0.0808 0.127 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -927157 sc-eQTL 3.80e-01 -0.106 0.12 0.149 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 -247968 sc-eQTL 2.90e-01 -0.122 0.115 0.149 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C -343714 sc-eQTL 9.05e-02 -0.205 0.121 0.149 MAIT L2
ENSG00000132849 PATJ 698012 sc-eQTL 9.89e-01 0.00137 0.103 0.149 MAIT L2
ENSG00000162604 TM2D1 714995 sc-eQTL 9.28e-01 0.0106 0.117 0.149 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 4121 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0851 0.121 0.149 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -927157 sc-eQTL 1.95e-01 0.166 0.128 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 -247968 sc-eQTL 3.10e-01 -0.113 0.111 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C -343714 sc-eQTL 4.45e-01 0.0947 0.124 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000132849 PATJ 698012 sc-eQTL 3.60e-02 0.254 0.12 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000162604 TM2D1 714995 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0366 0.124 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 4121 sc-eQTL 2.05e-01 -0.169 0.133 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -927157 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0748 0.128 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 -247968 sc-eQTL 1.69e-01 -0.153 0.111 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C -343714 sc-eQTL 6.52e-01 0.0509 0.113 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000132849 PATJ 698012 sc-eQTL 3.23e-02 0.261 0.121 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000162604 TM2D1 714995 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00476 0.116 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 4121 sc-eQTL 1.37e-01 -0.185 0.124 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -927157 sc-eQTL 1.53e-01 0.198 0.138 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 -247968 sc-eQTL 1.42e-01 -0.156 0.106 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C -343714 sc-eQTL 6.65e-01 0.0536 0.124 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000132849 PATJ 698012 sc-eQTL 5.20e-01 0.0738 0.115 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000162604 TM2D1 714995 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0594 0.13 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 4121 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00847 0.136 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -927157 sc-eQTL 6.65e-01 0.0539 0.125 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 -247968 sc-eQTL 1.39e-03 -0.365 0.113 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C -343714 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0658 0.118 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000132849 PATJ 698012 sc-eQTL 3.10e-01 -0.126 0.124 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000162604 TM2D1 714995 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0106 0.122 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 4121 sc-eQTL 2.52e-01 0.147 0.128 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -927157 sc-eQTL 9.79e-01 0.00383 0.146 0.17 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 -247968 sc-eQTL 9.74e-01 0.00519 0.157 0.17 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C -343714 sc-eQTL 3.27e-01 0.134 0.136 0.17 PB L2
ENSG00000132849 PATJ 698012 sc-eQTL 6.86e-01 0.0574 0.142 0.17 PB L2
ENSG00000162604 TM2D1 714995 sc-eQTL 1.25e-01 0.21 0.136 0.17 PB L2
ENSG00000162607 USP1 4121 sc-eQTL 9.95e-01 0.000922 0.136 0.17 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -927157 sc-eQTL 4.80e-02 -0.233 0.117 0.146 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 -247968 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0768 0.119 0.146 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C -343714 sc-eQTL 7.32e-01 0.0356 0.104 0.146 Pro_T L2
ENSG00000132849 PATJ 698012 sc-eQTL 3.38e-01 -0.109 0.113 0.146 Pro_T L2
ENSG00000162604 TM2D1 714995 sc-eQTL 9.25e-01 0.012 0.127 0.146 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 4121 sc-eQTL 5.04e-01 -0.048 0.0716 0.146 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -927157 sc-eQTL 3.72e-02 -0.27 0.129 0.147 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 -247968 sc-eQTL 2.77e-01 -0.13 0.119 0.147 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C -343714 sc-eQTL 4.02e-01 -0.102 0.122 0.147 Treg L2
ENSG00000132849 PATJ 698012 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0138 0.113 0.147 Treg L2
ENSG00000162604 TM2D1 714995 sc-eQTL 3.69e-01 0.112 0.125 0.147 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 4121 sc-eQTL 2.90e-01 0.131 0.123 0.147 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -927157 sc-eQTL 7.70e-01 0.0369 0.126 0.144 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 -247968 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00803 0.124 0.144 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C -343714 sc-eQTL 3.00e-01 -0.111 0.107 0.144 cDC L2
ENSG00000162604 TM2D1 714995 sc-eQTL 9.29e-01 0.0121 0.134 0.144 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 4121 sc-eQTL 4.07e-01 0.101 0.121 0.144 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -927157 sc-eQTL 9.24e-01 -0.011 0.116 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 -247968 sc-eQTL 1.33e-01 -0.184 0.122 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C -343714 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0448 0.0862 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000162604 TM2D1 714995 sc-eQTL 4.87e-01 0.0619 0.0889 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 4121 sc-eQTL 6.60e-01 0.0475 0.108 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 245569 sc-eQTL 5.40e-01 0.0665 0.108 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -927157 sc-eQTL 5.75e-01 0.0734 0.131 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 -247968 sc-eQTL 3.09e-01 -0.123 0.121 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C -343714 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0505 0.105 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000162604 TM2D1 714995 sc-eQTL 2.00e-01 0.137 0.107 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 4121 sc-eQTL 2.79e-01 -0.132 0.122 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 245569 sc-eQTL 5.97e-01 0.0536 0.101 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -927157 sc-eQTL 8.12e-01 0.0389 0.163 0.155 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 -247968 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0343 0.16 0.155 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C -343714 sc-eQTL 3.34e-01 0.148 0.152 0.155 gdT L2
ENSG00000132849 PATJ 698012 sc-eQTL 3.99e-01 -0.126 0.149 0.155 gdT L2
ENSG00000162604 TM2D1 714995 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0266 0.157 0.155 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 4121 sc-eQTL 6.83e-02 0.279 0.152 0.155 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -927157 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0941 0.122 0.147 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 -247968 sc-eQTL 2.32e-01 0.15 0.125 0.147 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C -343714 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0852 0.119 0.147 intMono L2
ENSG00000162604 TM2D1 714995 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00778 0.127 0.147 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 4121 sc-eQTL 4.30e-01 0.106 0.134 0.147 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 245569 sc-eQTL 5.30e-01 -0.062 0.0984 0.147 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -927157 sc-eQTL 9.06e-01 0.0155 0.13 0.14 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 -247968 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0397 0.128 0.14 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C -343714 sc-eQTL 2.64e-01 -0.134 0.119 0.14 ncMono L2
ENSG00000162604 TM2D1 714995 sc-eQTL 1.65e-01 0.179 0.128 0.14 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 4121 sc-eQTL 6.20e-01 0.0634 0.128 0.14 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 245569 sc-eQTL 6.24e-02 0.169 0.09 0.14 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -927157 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0988 0.137 0.144 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 -247968 sc-eQTL 4.78e-02 0.276 0.138 0.144 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C -343714 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0951 0.126 0.144 pDC L2
ENSG00000162604 TM2D1 714995 sc-eQTL 6.77e-01 0.0513 0.123 0.144 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 4121 sc-eQTL 5.26e-02 -0.278 0.142 0.144 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000088035 ALG6 -927157 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00483 0.133 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -247968 sc-eQTL 3.58e-03 -0.332 0.113 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -343714 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0354 0.093 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 698012 sc-eQTL 5.97e-02 0.193 0.102 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 714995 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0108 0.117 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 4121 sc-eQTL 1.92e-01 -0.155 0.118 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -927157 sc-eQTL 6.92e-01 0.0509 0.128 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -247968 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0756 0.12 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -343714 sc-eQTL 3.23e-01 0.0904 0.0912 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 698012 sc-eQTL 6.94e-01 0.043 0.109 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 714995 sc-eQTL 1.20e-02 0.261 0.103 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 4121 sc-eQTL 8.60e-01 0.0196 0.111 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -927157 sc-eQTL 7.38e-01 0.0384 0.115 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -247968 sc-eQTL 1.42e-01 -0.17 0.115 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -343714 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0665 0.0798 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 714995 sc-eQTL 1.36e-01 0.124 0.0829 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 4121 sc-eQTL 6.28e-01 -0.049 0.101 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 245569 sc-eQTL 6.70e-01 0.0468 0.11 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -927157 sc-eQTL 9.11e-01 0.0146 0.131 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -247968 sc-eQTL 8.36e-01 0.0269 0.129 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -343714 sc-eQTL 2.77e-01 -0.12 0.11 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 714995 sc-eQTL 2.05e-01 0.163 0.128 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 4121 sc-eQTL 6.74e-02 0.219 0.119 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 245569 sc-eQTL 2.58e-01 0.0927 0.0817 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -927157 sc-eQTL 7.58e-01 0.0364 0.118 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -247968 sc-eQTL 1.41e-02 -0.258 0.104 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -343714 sc-eQTL 8.79e-01 0.016 0.105 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 698012 sc-eQTL 2.26e-01 0.138 0.113 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 714995 sc-eQTL 8.64e-01 0.0178 0.104 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 4121 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00199 0.113 0.147 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116641 DOCK7 -247950 eQTL 6.77e-31 -0.343 0.0287 0.0 0.00283 0.138
ENSG00000132855 ANGPTL3 -157069 pQTL 1.9e-16 -0.333 0.0399 0.0201 0.0192 0.143
ENSG00000162607 USP1 4121 eQTL 1.95e-10 -0.113 0.0175 0.0 0.0 0.138

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116641 DOCK7 -247950 3.99e-06 1.03e-06 2.86e-07 1.33e-06 2.79e-07 7.6e-07 1.53e-06 1.73e-07 1.29e-06 6.36e-07 1.73e-06 8.37e-07 2.16e-06 2.83e-07 4.55e-07 7.41e-07 6.37e-07 1.16e-06 5.83e-07 3.54e-07 3.5e-07 1.92e-06 8.92e-07 6.4e-07 1.95e-06 3.06e-07 7.66e-07 6.46e-07 1.29e-06 1.29e-06 6.73e-07 3.99e-08 2.84e-07 7.25e-07 4.05e-07 2.59e-07 2.94e-07 2.26e-07 4.18e-07 2.99e-08 8.42e-08 1.53e-06 1.09e-07 1.31e-07 1.34e-07 2.18e-07 1.41e-07 2.99e-09 4.55e-08
ENSG00000162607 USP1 4121 0.000112 3.3e-05 6.85e-06 1.32e-05 4.49e-06 2.15e-05 4.7e-05 2.9e-06 2.88e-05 1.13e-05 3.16e-05 1.07e-05 4.8e-05 1.17e-05 5.8e-06 1.79e-05 1.35e-05 2.86e-05 7.51e-06 4.47e-06 1.41e-05 3.53e-05 3.45e-05 7.73e-06 3.49e-05 6.95e-06 1.06e-05 9e-06 3.53e-05 2.5e-05 1.66e-05 1.4e-06 1.93e-06 5.89e-06 8.54e-06 4.37e-06 2.05e-06 2.7e-06 3.25e-06 2.42e-06 1.19e-06 4.33e-05 4.93e-06 1.54e-07 2.59e-06 2.59e-06 3.8e-06 1.2e-06 1.02e-06