logo

Genes within 1Mb (chr1:62435572:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000088035 ALG6 -932003 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0334 0.0964 0.22 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 -252814 sc-eQTL 1.69e-01 -0.132 0.096 0.22 B L1
ENSG00000125703 ATG4C -348560 sc-eQTL 5.80e-01 0.0372 0.067 0.22 B L1
ENSG00000132849 PATJ 693166 sc-eQTL 9.65e-01 0.00362 0.0813 0.22 B L1
ENSG00000162604 TM2D1 710149 sc-eQTL 4.23e-02 0.164 0.0805 0.22 B L1
ENSG00000162607 USP1 -725 sc-eQTL 4.39e-01 0.0716 0.0924 0.22 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -932003 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0372 0.0876 0.22 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -252814 sc-eQTL 7.87e-01 -0.024 0.0887 0.22 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C -348560 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00361 0.0716 0.22 CD4T L1
ENSG00000132849 PATJ 693166 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0559 0.058 0.22 CD4T L1
ENSG00000162604 TM2D1 710149 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0787 0.0704 0.22 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 -725 sc-eQTL 8.27e-01 0.0152 0.0695 0.22 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -932003 sc-eQTL 9.99e-01 0.000157 0.0974 0.22 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -252814 sc-eQTL 3.03e-01 -0.102 0.0984 0.22 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C -348560 sc-eQTL 1.53e-01 -0.134 0.0933 0.22 CD8T L1
ENSG00000132849 PATJ 693166 sc-eQTL 1.52e-01 -0.0817 0.0569 0.22 CD8T L1
ENSG00000162604 TM2D1 710149 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0764 0.0856 0.22 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 -725 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00752 0.0817 0.22 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -932003 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0272 0.0993 0.221 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 -252814 sc-eQTL 7.94e-01 0.0267 0.102 0.221 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C -348560 sc-eQTL 4.81e-02 -0.157 0.0789 0.221 DC L1
ENSG00000162604 TM2D1 710149 sc-eQTL 9.61e-01 0.00459 0.0928 0.221 DC L1
ENSG00000162607 USP1 -725 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0609 0.0972 0.221 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -932003 sc-eQTL 7.99e-02 0.173 0.0985 0.22 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 -252814 sc-eQTL 1.71e-02 -0.228 0.0947 0.22 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C -348560 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0615 0.0647 0.22 Mono L1
ENSG00000162604 TM2D1 710149 sc-eQTL 3.78e-02 0.149 0.0713 0.22 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 -725 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0583 0.0841 0.22 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 240723 sc-eQTL 4.78e-01 0.0558 0.0785 0.22 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -932003 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0707 0.0955 0.219 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 -252814 sc-eQTL 1.29e-02 -0.195 0.0776 0.219 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C -348560 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0497 0.0845 0.219 NK L1
ENSG00000132849 PATJ 693166 sc-eQTL 1.25e-02 0.206 0.0817 0.219 NK L1
ENSG00000162604 TM2D1 710149 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0566 0.0848 0.219 NK L1
ENSG00000162607 USP1 -725 sc-eQTL 6.32e-01 0.045 0.0939 0.219 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -932003 sc-eQTL 1.45e-01 -0.135 0.0921 0.22 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -252814 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0945 0.0943 0.22 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C -348560 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0344 0.0818 0.22 Other_T L1
ENSG00000132849 PATJ 693166 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0874 0.0759 0.22 Other_T L1
ENSG00000162604 TM2D1 710149 sc-eQTL 2.74e-01 0.0977 0.0891 0.22 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 -725 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00248 0.0629 0.22 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000088035 ALG6 -932003 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0966 0.119 0.217 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 -252814 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0196 0.111 0.217 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C -348560 sc-eQTL 3.53e-01 -0.108 0.116 0.217 B_Activated L2
ENSG00000132849 PATJ 693166 sc-eQTL 4.77e-02 -0.195 0.0978 0.217 B_Activated L2
ENSG00000162604 TM2D1 710149 sc-eQTL 1.92e-01 -0.164 0.125 0.217 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 -725 sc-eQTL 1.17e-01 -0.193 0.122 0.217 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -932003 sc-eQTL 5.33e-01 0.0708 0.113 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 -252814 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0547 0.108 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C -348560 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0312 0.0916 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000132849 PATJ 693166 sc-eQTL 7.88e-01 0.0267 0.0992 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000162604 TM2D1 710149 sc-eQTL 7.66e-01 -0.031 0.104 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 -725 sc-eQTL 8.95e-01 0.0143 0.109 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -932003 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0549 0.11 0.22 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 -252814 sc-eQTL 1.54e-01 -0.147 0.103 0.22 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C -348560 sc-eQTL 8.52e-01 0.0184 0.0983 0.22 B_Memory L2
ENSG00000132849 PATJ 693166 sc-eQTL 3.59e-02 0.205 0.0971 0.22 B_Memory L2
ENSG00000162604 TM2D1 710149 sc-eQTL 5.31e-02 0.213 0.109 0.22 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 -725 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0881 0.113 0.22 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -932003 sc-eQTL 7.12e-01 0.0409 0.111 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 -252814 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0128 0.106 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C -348560 sc-eQTL 9.37e-01 0.0065 0.0818 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000132849 PATJ 693166 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0867 0.105 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000162604 TM2D1 710149 sc-eQTL 5.73e-01 0.0546 0.0966 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 -725 sc-eQTL 2.29e-01 0.115 0.0951 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -932003 sc-eQTL 4.89e-01 0.0788 0.114 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 -252814 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0702 0.109 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C -348560 sc-eQTL 1.05e-01 0.171 0.105 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000132849 PATJ 693166 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0189 0.108 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000162604 TM2D1 710149 sc-eQTL 8.33e-03 0.286 0.107 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 -725 sc-eQTL 1.69e-01 0.15 0.108 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -932003 sc-eQTL 3.75e-01 0.102 0.115 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 -252814 sc-eQTL 1.98e-01 -0.13 0.1 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C -348560 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0648 0.104 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000132849 PATJ 693166 sc-eQTL 1.72e-01 0.114 0.0831 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000162604 TM2D1 710149 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0469 0.107 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 -725 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0956 0.106 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -932003 sc-eQTL 2.61e-01 -0.109 0.0962 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 -252814 sc-eQTL 4.78e-01 0.0674 0.0948 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C -348560 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0333 0.0838 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000132849 PATJ 693166 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0239 0.0589 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000162604 TM2D1 710149 sc-eQTL 1.31e-01 -0.128 0.0842 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 -725 sc-eQTL 7.55e-01 0.0245 0.0783 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -932003 sc-eQTL 1.68e-01 0.148 0.107 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -252814 sc-eQTL 4.45e-01 -0.073 0.0953 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C -348560 sc-eQTL 7.89e-01 0.0249 0.0929 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000132849 PATJ 693166 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0807 0.0744 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000162604 TM2D1 710149 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0965 0.0867 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 -725 sc-eQTL 5.38e-01 0.0553 0.0897 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -932003 sc-eQTL 6.47e-01 0.0513 0.112 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -252814 sc-eQTL 8.39e-01 0.0222 0.109 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C -348560 sc-eQTL 3.39e-01 0.101 0.106 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000132849 PATJ 693166 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0616 0.0988 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000162604 TM2D1 710149 sc-eQTL 1.95e-01 -0.135 0.104 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 -725 sc-eQTL 2.89e-01 -0.11 0.103 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -932003 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0488 0.107 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 -252814 sc-eQTL 1.34e-01 -0.152 0.101 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C -348560 sc-eQTL 3.55e-02 -0.226 0.107 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000132849 PATJ 693166 sc-eQTL 3.54e-01 -0.095 0.102 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000162604 TM2D1 710149 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0723 0.0938 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 -725 sc-eQTL 3.74e-01 0.0894 0.1 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -932003 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0154 0.104 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 -252814 sc-eQTL 1.84e-01 0.143 0.108 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C -348560 sc-eQTL 2.45e-01 -0.12 0.103 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000132849 PATJ 693166 sc-eQTL 9.22e-02 -0.133 0.0788 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000162604 TM2D1 710149 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0486 0.0968 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 -725 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0715 0.0886 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -932003 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00645 0.115 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -252814 sc-eQTL 3.00e-01 -0.117 0.112 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C -348560 sc-eQTL 4.27e-01 0.0916 0.115 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000132849 PATJ 693166 sc-eQTL 3.27e-01 0.104 0.106 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000162604 TM2D1 710149 sc-eQTL 3.14e-02 -0.231 0.106 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 -725 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0286 0.108 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -932003 sc-eQTL 1.25e-01 -0.18 0.116 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -252814 sc-eQTL 2.88e-01 0.121 0.113 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C -348560 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0639 0.109 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000132849 PATJ 693166 sc-eQTL 2.24e-01 -0.134 0.11 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000162604 TM2D1 710149 sc-eQTL 7.57e-01 0.0349 0.113 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 -725 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0516 0.113 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -932003 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0385 0.105 0.221 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 -252814 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0937 0.1 0.221 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C -348560 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0634 0.106 0.221 MAIT L2
ENSG00000132849 PATJ 693166 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0689 0.0896 0.221 MAIT L2
ENSG00000162604 TM2D1 710149 sc-eQTL 5.67e-01 0.0584 0.102 0.221 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 -725 sc-eQTL 7.19e-01 -0.038 0.105 0.221 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -932003 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00155 0.11 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 -252814 sc-eQTL 5.89e-01 0.0516 0.0954 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C -348560 sc-eQTL 6.47e-01 0.049 0.107 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000132849 PATJ 693166 sc-eQTL 7.36e-02 0.187 0.104 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000162604 TM2D1 710149 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0619 0.106 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 -725 sc-eQTL 3.64e-01 -0.104 0.114 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -932003 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0362 0.108 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 -252814 sc-eQTL 2.39e-02 -0.211 0.0926 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C -348560 sc-eQTL 6.93e-01 0.0376 0.0952 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000132849 PATJ 693166 sc-eQTL 1.75e-03 0.32 0.101 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000162604 TM2D1 710149 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0649 0.0979 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 -725 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0405 0.105 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -932003 sc-eQTL 8.92e-01 0.016 0.118 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 -252814 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0683 0.0902 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C -348560 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0253 0.105 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000132849 PATJ 693166 sc-eQTL 1.54e-01 0.139 0.097 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000162604 TM2D1 710149 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0453 0.111 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 -725 sc-eQTL 6.53e-01 -0.052 0.115 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -932003 sc-eQTL 3.20e-01 -0.104 0.105 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 -252814 sc-eQTL 1.37e-03 -0.308 0.095 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C -348560 sc-eQTL 2.66e-01 -0.111 0.0993 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000132849 PATJ 693166 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0748 0.105 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000162604 TM2D1 710149 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0135 0.103 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 -725 sc-eQTL 8.69e-02 0.185 0.108 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -932003 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0734 0.131 0.241 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 -252814 sc-eQTL 7.93e-01 -0.037 0.14 0.241 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C -348560 sc-eQTL 3.19e-01 0.122 0.122 0.241 PB L2
ENSG00000132849 PATJ 693166 sc-eQTL 3.13e-01 0.128 0.127 0.241 PB L2
ENSG00000162604 TM2D1 710149 sc-eQTL 3.50e-01 0.115 0.123 0.241 PB L2
ENSG00000162607 USP1 -725 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0445 0.122 0.241 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -932003 sc-eQTL 2.73e-01 -0.113 0.103 0.22 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 -252814 sc-eQTL 1.36e-01 -0.155 0.103 0.22 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C -348560 sc-eQTL 3.76e-01 0.0805 0.0907 0.22 Pro_T L2
ENSG00000132849 PATJ 693166 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0275 0.0992 0.22 Pro_T L2
ENSG00000162604 TM2D1 710149 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00486 0.111 0.22 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 -725 sc-eQTL 2.46e-01 -0.0726 0.0625 0.22 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -932003 sc-eQTL 1.79e-01 -0.151 0.112 0.22 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 -252814 sc-eQTL 2.43e-01 -0.121 0.103 0.22 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C -348560 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0965 0.105 0.22 Treg L2
ENSG00000132849 PATJ 693166 sc-eQTL 9.17e-01 0.0102 0.0977 0.22 Treg L2
ENSG00000162604 TM2D1 710149 sc-eQTL 6.13e-01 0.0545 0.108 0.22 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 -725 sc-eQTL 6.62e-01 0.0467 0.107 0.22 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -932003 sc-eQTL 4.09e-01 0.09 0.109 0.215 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 -252814 sc-eQTL 3.40e-01 -0.102 0.107 0.215 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C -348560 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0879 0.0926 0.215 cDC L2
ENSG00000162604 TM2D1 710149 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0081 0.116 0.215 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 -725 sc-eQTL 5.16e-01 0.0681 0.105 0.215 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -932003 sc-eQTL 2.62e-01 0.112 0.0997 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 -252814 sc-eQTL 1.05e-02 -0.268 0.104 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C -348560 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0247 0.0741 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000162604 TM2D1 710149 sc-eQTL 5.91e-01 0.0411 0.0764 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 -725 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00789 0.0926 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 240723 sc-eQTL 7.98e-01 0.0239 0.093 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -932003 sc-eQTL 4.15e-02 0.229 0.112 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 -252814 sc-eQTL 5.02e-02 -0.204 0.104 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C -348560 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0177 0.0907 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000162604 TM2D1 710149 sc-eQTL 1.29e-01 0.14 0.092 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 -725 sc-eQTL 2.22e-01 -0.128 0.105 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 240723 sc-eQTL 9.37e-01 0.00693 0.0876 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -932003 sc-eQTL 5.65e-01 0.0772 0.134 0.221 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 -252814 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00752 0.132 0.221 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C -348560 sc-eQTL 2.88e-01 0.133 0.125 0.221 gdT L2
ENSG00000132849 PATJ 693166 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0375 0.123 0.221 gdT L2
ENSG00000162604 TM2D1 710149 sc-eQTL 9.47e-01 0.00854 0.129 0.221 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 -725 sc-eQTL 1.87e-01 0.166 0.126 0.221 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -932003 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0585 0.107 0.216 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 -252814 sc-eQTL 7.63e-01 0.0329 0.109 0.216 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C -348560 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0966 0.104 0.216 intMono L2
ENSG00000162604 TM2D1 710149 sc-eQTL 3.32e-01 0.107 0.11 0.216 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 -725 sc-eQTL 4.97e-02 0.228 0.115 0.216 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 240723 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0726 0.0855 0.216 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -932003 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0579 0.11 0.215 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 -252814 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0757 0.108 0.215 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C -348560 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0901 0.101 0.215 ncMono L2
ENSG00000162604 TM2D1 710149 sc-eQTL 1.48e-01 0.157 0.108 0.215 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 -725 sc-eQTL 4.85e-01 0.0753 0.108 0.215 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 240723 sc-eQTL 2.26e-01 0.0926 0.0762 0.215 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -932003 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0963 0.117 0.22 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 -252814 sc-eQTL 1.58e-01 0.168 0.119 0.22 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C -348560 sc-eQTL 1.76e-01 -0.145 0.106 0.22 pDC L2
ENSG00000162604 TM2D1 710149 sc-eQTL 6.50e-01 0.0477 0.105 0.22 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 -725 sc-eQTL 1.13e-01 -0.194 0.122 0.22 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000088035 ALG6 -932003 sc-eQTL 8.85e-01 0.0166 0.114 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -252814 sc-eQTL 2.23e-01 -0.121 0.0989 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -348560 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0262 0.0802 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 693166 sc-eQTL 3.72e-01 0.0794 0.0887 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 710149 sc-eQTL 7.06e-01 0.0381 0.101 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 -725 sc-eQTL 2.06e-01 -0.129 0.102 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -932003 sc-eQTL 8.47e-01 0.0214 0.111 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -252814 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0306 0.103 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -348560 sc-eQTL 3.27e-01 0.0774 0.0787 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 693166 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0698 0.0942 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 710149 sc-eQTL 3.03e-02 0.194 0.0891 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 -725 sc-eQTL 1.82e-01 0.128 0.0954 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -932003 sc-eQTL 3.48e-02 0.208 0.0977 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -252814 sc-eQTL 5.53e-03 -0.274 0.0977 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -348560 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0367 0.0687 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 710149 sc-eQTL 1.06e-01 0.116 0.0712 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 -725 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0902 0.0867 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 240723 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0065 0.0942 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -932003 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0833 0.11 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -252814 sc-eQTL 5.22e-01 -0.07 0.109 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -348560 sc-eQTL 3.72e-01 -0.083 0.0929 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 710149 sc-eQTL 5.96e-02 0.204 0.108 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 -725 sc-eQTL 4.30e-02 0.205 0.101 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 240723 sc-eQTL 5.09e-01 0.0458 0.0692 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -932003 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0729 0.0995 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -252814 sc-eQTL 2.19e-03 -0.271 0.0873 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -348560 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0521 0.089 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 693166 sc-eQTL 4.17e-02 0.195 0.0951 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 710149 sc-eQTL 6.42e-01 -0.041 0.088 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 -725 sc-eQTL 3.17e-01 0.096 0.0956 0.218 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116641 DOCK7 -252796 eQTL 2.7900000000000003e-37 -0.309 0.0232 0.0 0.0 0.228
ENSG00000125703 ATG4C -348560 eQTL 0.0182 -0.0452 0.0191 0.0 0.0 0.228
ENSG00000132855 ANGPTL3 -161915 pQTL 1.38e-08 -0.191 0.0334 0.0 0.0 0.228
ENSG00000162607 USP1 -725 eQTL 2.86e-12 -0.101 0.0143 0.00406 0.00407 0.228

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116641 DOCK7 -252796 4.33e-06 4.55e-06 6.55e-07 3.14e-06 1.32e-06 1.64e-06 2.41e-06 1.03e-06 4.94e-06 2.48e-06 3.21e-06 2.63e-06 7.22e-06 1.37e-06 1.33e-06 3.58e-06 2.06e-06 3.57e-06 1.49e-06 2.07e-06 2.71e-06 4.85e-06 3.53e-06 1.71e-06 4.62e-06 1.28e-06 2.62e-06 2.36e-06 3.82e-06 2.75e-06 2.28e-06 9.86e-07 5.74e-07 1.44e-06 2.15e-06 9.89e-07 1.02e-06 5.44e-07 8.11e-07 8.66e-07 5.7e-07 3.87e-06 5.08e-07 1.55e-07 6.85e-07 1.32e-06 1.24e-06 6.58e-07 5.02e-07
ENSG00000162607 USP1 -725 0.000259 0.000344 6.07e-05 0.000136 0.000106 0.000133 0.000353 9.7e-05 0.000342 0.0002 0.000403 0.000197 0.000445 0.000162 8.99e-05 0.000252 0.000164 0.000278 0.000114 0.000101 0.000208 0.000364 0.000295 0.000109 0.000401 0.000154 0.000195 0.000185 0.000294 0.000189 0.000226 4.74e-05 4.79e-05 7.94e-05 0.000101 7.42e-05 4.79e-05 5.68e-05 6.66e-05 5.11e-05 3.33e-05 0.00036 4.35e-05 1.08e-05 5.7e-05 7.06e-05 6.31e-05 4.83e-05 3.07e-05