logo

Genes within 1Mb (chr1:62403991:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000088035 ALG6 -963584 sc-eQTL 9.38e-03 0.393 0.15 0.079 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 -284395 sc-eQTL 8.82e-01 0.0226 0.152 0.079 B L1
ENSG00000125703 ATG4C -380141 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0883 0.106 0.079 B L1
ENSG00000132849 PATJ 661585 sc-eQTL 5.56e-01 0.0756 0.128 0.079 B L1
ENSG00000162604 TM2D1 678568 sc-eQTL 9.11e-01 0.0143 0.128 0.079 B L1
ENSG00000162607 USP1 -32306 sc-eQTL 3.06e-01 -0.149 0.146 0.079 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -963584 sc-eQTL 6.51e-01 0.0634 0.14 0.079 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -284395 sc-eQTL 3.78e-01 0.125 0.141 0.079 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C -380141 sc-eQTL 2.86e-01 -0.122 0.114 0.079 CD4T L1
ENSG00000132849 PATJ 661585 sc-eQTL 3.99e-03 -0.265 0.0911 0.079 CD4T L1
ENSG00000162604 TM2D1 678568 sc-eQTL 3.47e-01 -0.106 0.113 0.079 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 -32306 sc-eQTL 6.78e-01 0.0461 0.111 0.079 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -963584 sc-eQTL 7.82e-01 -0.042 0.151 0.079 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -284395 sc-eQTL 9.25e-01 0.0145 0.153 0.079 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C -380141 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0531 0.146 0.079 CD8T L1
ENSG00000132849 PATJ 661585 sc-eQTL 3.64e-01 0.0808 0.0887 0.079 CD8T L1
ENSG00000162604 TM2D1 678568 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0384 0.133 0.079 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 -32306 sc-eQTL 5.07e-02 0.247 0.126 0.079 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -963584 sc-eQTL 3.56e-01 -0.146 0.158 0.081 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 -284395 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0227 0.162 0.081 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C -380141 sc-eQTL 9.70e-02 0.21 0.126 0.081 DC L1
ENSG00000162604 TM2D1 678568 sc-eQTL 3.52e-01 0.138 0.148 0.081 DC L1
ENSG00000162607 USP1 -32306 sc-eQTL 6.42e-01 0.0722 0.155 0.081 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -963584 sc-eQTL 9.04e-01 0.0192 0.158 0.079 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 -284395 sc-eQTL 6.79e-01 0.0633 0.153 0.079 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C -380141 sc-eQTL 5.28e-01 0.0652 0.103 0.079 Mono L1
ENSG00000162604 TM2D1 678568 sc-eQTL 3.03e-01 -0.118 0.114 0.079 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 -32306 sc-eQTL 9.99e-01 0.000185 0.134 0.079 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 209142 sc-eQTL 5.77e-01 0.0697 0.125 0.079 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -963584 sc-eQTL 1.83e-01 0.198 0.149 0.079 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 -284395 sc-eQTL 4.73e-01 0.0882 0.123 0.079 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C -380141 sc-eQTL 6.20e-01 0.0654 0.132 0.079 NK L1
ENSG00000132849 PATJ 661585 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0611 0.129 0.079 NK L1
ENSG00000162604 TM2D1 678568 sc-eQTL 1.17e-01 -0.207 0.132 0.079 NK L1
ENSG00000162607 USP1 -32306 sc-eQTL 2.02e-01 -0.187 0.146 0.079 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -963584 sc-eQTL 4.39e-01 -0.115 0.148 0.079 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -284395 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0151 0.151 0.079 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C -380141 sc-eQTL 1.85e-01 -0.173 0.13 0.079 Other_T L1
ENSG00000132849 PATJ 661585 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0198 0.122 0.079 Other_T L1
ENSG00000162604 TM2D1 678568 sc-eQTL 6.89e-01 0.0572 0.143 0.079 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 -32306 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0142 0.101 0.079 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000088035 ALG6 -963584 sc-eQTL 2.65e-01 0.219 0.196 0.074 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 -284395 sc-eQTL 5.28e-01 0.115 0.183 0.074 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C -380141 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0967 0.192 0.074 B_Activated L2
ENSG00000132849 PATJ 661585 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0435 0.163 0.074 B_Activated L2
ENSG00000162604 TM2D1 678568 sc-eQTL 1.15e-01 0.326 0.206 0.074 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 -32306 sc-eQTL 5.76e-01 -0.114 0.203 0.074 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -963584 sc-eQTL 2.23e-03 0.541 0.175 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 -284395 sc-eQTL 8.67e-01 0.0286 0.171 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C -380141 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0513 0.144 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000132849 PATJ 661585 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00786 0.156 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000162604 TM2D1 678568 sc-eQTL 8.70e-01 0.0269 0.164 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 -32306 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0797 0.172 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -963584 sc-eQTL 4.32e-01 0.139 0.176 0.08 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 -284395 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0626 0.165 0.08 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C -380141 sc-eQTL 1.56e-01 -0.223 0.156 0.08 B_Memory L2
ENSG00000132849 PATJ 661585 sc-eQTL 5.57e-01 0.0923 0.157 0.08 B_Memory L2
ENSG00000162604 TM2D1 678568 sc-eQTL 8.30e-02 -0.305 0.175 0.08 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 -32306 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0698 0.181 0.08 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -963584 sc-eQTL 3.54e-01 0.163 0.175 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 -284395 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0364 0.168 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C -380141 sc-eQTL 9.26e-02 -0.217 0.129 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000132849 PATJ 661585 sc-eQTL 3.93e-01 0.142 0.166 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000162604 TM2D1 678568 sc-eQTL 7.27e-01 0.0534 0.153 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 -32306 sc-eQTL 8.87e-01 0.0215 0.151 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -963584 sc-eQTL 2.98e-01 0.188 0.18 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 -284395 sc-eQTL 7.48e-01 0.0558 0.173 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C -380141 sc-eQTL 2.24e-01 0.203 0.166 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000132849 PATJ 661585 sc-eQTL 1.00e+00 -8.38e-05 0.171 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000162604 TM2D1 678568 sc-eQTL 9.08e-01 0.02 0.173 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 -32306 sc-eQTL 2.23e-01 -0.21 0.172 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -963584 sc-eQTL 2.09e-01 0.229 0.182 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 -284395 sc-eQTL 4.16e-01 0.13 0.159 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C -380141 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0774 0.165 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000132849 PATJ 661585 sc-eQTL 4.92e-01 0.0911 0.132 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000162604 TM2D1 678568 sc-eQTL 2.07e-02 -0.389 0.167 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 -32306 sc-eQTL 7.03e-01 0.0643 0.168 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -963584 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0547 0.154 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 -284395 sc-eQTL 6.22e-01 0.0744 0.151 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C -380141 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0845 0.133 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000132849 PATJ 661585 sc-eQTL 8.56e-04 -0.309 0.0913 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000162604 TM2D1 678568 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0789 0.135 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 -32306 sc-eQTL 7.61e-01 0.038 0.125 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -963584 sc-eQTL 4.75e-01 0.122 0.17 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -284395 sc-eQTL 6.17e-01 0.0757 0.151 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C -380141 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0363 0.147 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000132849 PATJ 661585 sc-eQTL 6.33e-01 0.0565 0.118 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000162604 TM2D1 678568 sc-eQTL 2.93e-01 -0.145 0.137 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 -32306 sc-eQTL 7.49e-01 0.0455 0.142 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -963584 sc-eQTL 4.10e-01 0.144 0.174 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -284395 sc-eQTL 4.69e-01 0.123 0.17 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C -380141 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0925 0.165 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000132849 PATJ 661585 sc-eQTL 9.52e-02 -0.256 0.153 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000162604 TM2D1 678568 sc-eQTL 3.40e-01 0.154 0.162 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 -32306 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0152 0.161 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -963584 sc-eQTL 8.81e-01 -0.025 0.167 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 -284395 sc-eQTL 3.69e-01 0.143 0.158 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C -380141 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0341 0.169 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000132849 PATJ 661585 sc-eQTL 5.97e-01 0.0847 0.16 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000162604 TM2D1 678568 sc-eQTL 4.65e-01 -0.107 0.147 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 -32306 sc-eQTL 4.84e-02 0.31 0.156 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -963584 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00615 0.165 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 -284395 sc-eQTL 2.37e-02 0.385 0.169 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C -380141 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0764 0.164 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000132849 PATJ 661585 sc-eQTL 9.18e-01 0.013 0.125 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000162604 TM2D1 678568 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0249 0.153 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 -32306 sc-eQTL 7.76e-02 0.247 0.139 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -963584 sc-eQTL 2.06e-01 -0.217 0.171 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -284395 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0726 0.167 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C -380141 sc-eQTL 5.84e-01 0.0938 0.171 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000132849 PATJ 661585 sc-eQTL 1.70e-01 0.216 0.157 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000162604 TM2D1 678568 sc-eQTL 1.01e-01 0.262 0.159 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 -32306 sc-eQTL 4.15e-01 -0.131 0.16 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -963584 sc-eQTL 5.63e-01 0.106 0.183 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -284395 sc-eQTL 2.74e-01 -0.194 0.177 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C -380141 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0118 0.171 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000132849 PATJ 661585 sc-eQTL 4.33e-01 0.136 0.172 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000162604 TM2D1 678568 sc-eQTL 4.27e-01 -0.14 0.176 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 -32306 sc-eQTL 1.30e-02 0.435 0.173 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -963584 sc-eQTL 3.98e-01 -0.139 0.165 0.08 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 -284395 sc-eQTL 6.94e-01 0.0623 0.158 0.08 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C -380141 sc-eQTL 1.56e-01 -0.236 0.166 0.08 MAIT L2
ENSG00000132849 PATJ 661585 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0179 0.141 0.08 MAIT L2
ENSG00000162604 TM2D1 678568 sc-eQTL 2.14e-01 0.199 0.16 0.08 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 -32306 sc-eQTL 9.76e-01 0.00505 0.166 0.08 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -963584 sc-eQTL 6.47e-03 0.463 0.168 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 -284395 sc-eQTL 6.03e-01 0.0771 0.148 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C -380141 sc-eQTL 6.32e-01 0.0795 0.166 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000132849 PATJ 661585 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0328 0.162 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000162604 TM2D1 678568 sc-eQTL 9.10e-02 -0.279 0.164 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 -32306 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0241 0.178 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -963584 sc-eQTL 2.68e-01 0.185 0.167 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 -284395 sc-eQTL 2.79e-01 0.158 0.145 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C -380141 sc-eQTL 6.75e-01 0.0621 0.148 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000132849 PATJ 661585 sc-eQTL 3.19e-01 -0.16 0.16 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000162604 TM2D1 678568 sc-eQTL 2.48e-01 -0.176 0.152 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 -32306 sc-eQTL 1.56e-01 -0.231 0.162 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -963584 sc-eQTL 1.71e-01 -0.259 0.189 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 -284395 sc-eQTL 3.73e-01 -0.129 0.145 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C -380141 sc-eQTL 3.92e-01 -0.144 0.168 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000132849 PATJ 661585 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0233 0.156 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000162604 TM2D1 678568 sc-eQTL 5.12e-01 0.117 0.177 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 -32306 sc-eQTL 2.96e-01 -0.193 0.185 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -963584 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00159 0.166 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 -284395 sc-eQTL 7.66e-02 0.271 0.152 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C -380141 sc-eQTL 8.43e-01 0.0312 0.157 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000132849 PATJ 661585 sc-eQTL 5.70e-01 0.0943 0.166 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000162604 TM2D1 678568 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0999 0.162 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 -32306 sc-eQTL 9.21e-01 -0.017 0.171 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -963584 sc-eQTL 6.86e-01 0.088 0.217 0.081 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 -284395 sc-eQTL 9.68e-01 0.00928 0.232 0.081 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C -380141 sc-eQTL 1.31e-01 -0.305 0.2 0.081 PB L2
ENSG00000132849 PATJ 661585 sc-eQTL 7.72e-01 0.0609 0.21 0.081 PB L2
ENSG00000162604 TM2D1 678568 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0628 0.204 0.081 PB L2
ENSG00000162607 USP1 -32306 sc-eQTL 8.66e-02 -0.343 0.198 0.081 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -963584 sc-eQTL 5.25e-01 0.102 0.161 0.08 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 -284395 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0766 0.161 0.08 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C -380141 sc-eQTL 1.27e-02 -0.35 0.139 0.08 Pro_T L2
ENSG00000132849 PATJ 661585 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0582 0.154 0.08 Pro_T L2
ENSG00000162604 TM2D1 678568 sc-eQTL 3.62e-01 -0.157 0.172 0.08 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 -32306 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0356 0.0974 0.08 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -963584 sc-eQTL 6.64e-01 0.077 0.177 0.079 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 -284395 sc-eQTL 1.44e-01 0.237 0.162 0.079 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C -380141 sc-eQTL 2.48e-01 0.192 0.166 0.079 Treg L2
ENSG00000132849 PATJ 661585 sc-eQTL 6.45e-01 0.071 0.154 0.079 Treg L2
ENSG00000162604 TM2D1 678568 sc-eQTL 7.92e-01 0.0448 0.169 0.079 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 -32306 sc-eQTL 4.54e-01 0.126 0.168 0.079 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -963584 sc-eQTL 4.41e-01 0.135 0.175 0.076 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 -284395 sc-eQTL 3.28e-01 -0.168 0.171 0.076 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C -380141 sc-eQTL 5.91e-02 0.28 0.148 0.076 cDC L2
ENSG00000162604 TM2D1 678568 sc-eQTL 7.41e-01 0.0617 0.186 0.076 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 -32306 sc-eQTL 2.24e-01 0.204 0.168 0.076 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -963584 sc-eQTL 5.58e-01 -0.092 0.157 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 -284395 sc-eQTL 7.47e-01 0.0535 0.165 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C -380141 sc-eQTL 9.15e-02 0.196 0.115 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000162604 TM2D1 678568 sc-eQTL 1.87e-02 -0.28 0.118 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 -32306 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0485 0.145 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 209142 sc-eQTL 4.50e-01 0.11 0.146 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -963584 sc-eQTL 2.37e-01 0.208 0.176 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 -284395 sc-eQTL 1.13e-01 0.258 0.163 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C -380141 sc-eQTL 7.58e-02 -0.251 0.141 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000162604 TM2D1 678568 sc-eQTL 3.14e-01 0.145 0.144 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 -32306 sc-eQTL 3.10e-01 0.167 0.164 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 209142 sc-eQTL 4.34e-01 -0.107 0.137 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -963584 sc-eQTL 4.99e-01 -0.139 0.205 0.076 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 -284395 sc-eQTL 9.84e-01 0.00397 0.201 0.076 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C -380141 sc-eQTL 1.86e-01 0.254 0.191 0.076 gdT L2
ENSG00000132849 PATJ 661585 sc-eQTL 6.52e-01 0.0848 0.188 0.076 gdT L2
ENSG00000162604 TM2D1 678568 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0978 0.198 0.076 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 -32306 sc-eQTL 2.33e-01 0.23 0.192 0.076 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -963584 sc-eQTL 1.70e-01 -0.221 0.161 0.082 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 -284395 sc-eQTL 3.27e-01 -0.162 0.164 0.082 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C -380141 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0866 0.157 0.082 intMono L2
ENSG00000162604 TM2D1 678568 sc-eQTL 3.53e-01 0.155 0.166 0.082 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 -32306 sc-eQTL 5.01e-01 0.119 0.176 0.082 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 209142 sc-eQTL 3.62e-01 0.118 0.129 0.082 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -963584 sc-eQTL 6.73e-02 0.311 0.169 0.081 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 -284395 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0595 0.168 0.081 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C -380141 sc-eQTL 1.16e-01 0.246 0.156 0.081 ncMono L2
ENSG00000162604 TM2D1 678568 sc-eQTL 4.29e-01 -0.134 0.169 0.081 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 -32306 sc-eQTL 4.38e-01 0.13 0.167 0.081 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 209142 sc-eQTL 9.82e-01 0.00276 0.119 0.081 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -963584 sc-eQTL 3.55e-02 -0.383 0.181 0.082 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 -284395 sc-eQTL 1.95e-01 0.242 0.186 0.082 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C -380141 sc-eQTL 3.19e-01 0.167 0.167 0.082 pDC L2
ENSG00000162604 TM2D1 678568 sc-eQTL 7.15e-01 0.06 0.164 0.082 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 -32306 sc-eQTL 1.96e-01 -0.248 0.191 0.082 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000088035 ALG6 -963584 sc-eQTL 4.97e-04 0.625 0.177 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -284395 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00676 0.158 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -380141 sc-eQTL 1.04e-01 -0.207 0.127 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 661585 sc-eQTL 9.61e-01 0.00699 0.141 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 678568 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0362 0.16 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 -32306 sc-eQTL 4.95e-01 -0.111 0.163 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -963584 sc-eQTL 8.53e-02 0.302 0.175 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -284395 sc-eQTL 8.39e-01 0.0335 0.164 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -380141 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0565 0.125 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 661585 sc-eQTL 2.89e-01 0.159 0.15 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 678568 sc-eQTL 7.63e-01 0.0431 0.143 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 -32306 sc-eQTL 4.51e-01 -0.115 0.152 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -963584 sc-eQTL 7.62e-01 0.0472 0.156 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -284395 sc-eQTL 4.45e-01 0.12 0.156 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -380141 sc-eQTL 8.60e-01 0.0192 0.108 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 678568 sc-eQTL 2.31e-01 -0.135 0.113 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 -32306 sc-eQTL 7.69e-01 0.0403 0.137 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 209142 sc-eQTL 8.50e-01 0.028 0.148 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -963584 sc-eQTL 7.22e-01 0.061 0.172 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -284395 sc-eQTL 5.37e-01 -0.105 0.17 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -380141 sc-eQTL 6.29e-01 0.07 0.145 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 678568 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0908 0.169 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 -32306 sc-eQTL 9.11e-01 0.0176 0.158 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 209142 sc-eQTL 4.38e-01 0.0835 0.108 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -963584 sc-eQTL 5.40e-01 0.0954 0.156 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -284395 sc-eQTL 2.61e-01 0.157 0.139 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -380141 sc-eQTL 9.97e-01 0.000536 0.139 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 661585 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0564 0.15 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 678568 sc-eQTL 4.17e-01 -0.112 0.137 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 -32306 sc-eQTL 2.24e-02 -0.34 0.148 0.08 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116641 DOCK7 -284377 eQTL 0.0393 -0.0747 0.0362 0.0 0.0 0.0972

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000132849 \N 661585 3.92e-07 1.78e-07 7.16e-08 2.25e-07 1.03e-07 1.08e-07 2.74e-07 7.12e-08 1.98e-07 1.21e-07 2.18e-07 1.86e-07 2.74e-07 8.55e-08 7.79e-08 1.1e-07 7.3e-08 2.43e-07 7.76e-08 8e-08 1.33e-07 2.06e-07 1.81e-07 3.41e-08 2.48e-07 1.82e-07 1.33e-07 1.46e-07 1.48e-07 1.69e-07 1.35e-07 5.38e-08 4.76e-08 1.02e-07 6.35e-08 4.86e-08 6.14e-08 7.1e-08 5.59e-08 7.92e-08 4.73e-08 1.63e-07 3.59e-08 1.43e-08 5.32e-08 1.03e-08 9.1e-08 0.0 4.68e-08