logo

Genes within 1Mb (chr1:62371705:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000088035 ALG6 -995870 sc-eQTL 6.62e-02 0.181 0.0978 0.229 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 -316681 sc-eQTL 3.58e-01 0.0906 0.0984 0.229 B L1
ENSG00000125703 ATG4C -412427 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0329 0.0685 0.229 B L1
ENSG00000132849 PATJ 629299 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0103 0.0832 0.229 B L1
ENSG00000162604 TM2D1 646282 sc-eQTL 5.22e-01 0.0532 0.083 0.229 B L1
ENSG00000162607 USP1 -64592 sc-eQTL 2.81e-01 0.102 0.0944 0.229 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -995870 sc-eQTL 8.59e-02 0.155 0.0897 0.229 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -316681 sc-eQTL 5.05e-01 -0.061 0.0914 0.229 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C -412427 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0557 0.0738 0.229 CD4T L1
ENSG00000132849 PATJ 629299 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0335 0.0599 0.229 CD4T L1
ENSG00000162604 TM2D1 646282 sc-eQTL 9.09e-02 -0.123 0.0724 0.229 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 -64592 sc-eQTL 3.21e-01 0.0712 0.0715 0.229 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -995870 sc-eQTL 6.61e-01 0.0436 0.0992 0.229 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -316681 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0508 0.101 0.229 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C -412427 sc-eQTL 1.64e-02 -0.228 0.0942 0.229 CD8T L1
ENSG00000132849 PATJ 629299 sc-eQTL 5.35e-01 0.0361 0.0582 0.229 CD8T L1
ENSG00000162604 TM2D1 646282 sc-eQTL 3.17e-01 0.0875 0.0872 0.229 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 -64592 sc-eQTL 4.04e-01 0.0694 0.0831 0.229 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -995870 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0887 0.105 0.232 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 -316681 sc-eQTL 2.10e-01 -0.135 0.107 0.232 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C -412427 sc-eQTL 8.59e-01 0.015 0.0843 0.232 DC L1
ENSG00000162604 TM2D1 646282 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0309 0.0982 0.232 DC L1
ENSG00000162607 USP1 -64592 sc-eQTL 9.73e-02 0.17 0.102 0.232 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -995870 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0119 0.103 0.229 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 -316681 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0499 0.0996 0.229 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C -412427 sc-eQTL 7.79e-02 0.118 0.0668 0.229 Mono L1
ENSG00000162604 TM2D1 646282 sc-eQTL 6.16e-01 0.0375 0.0747 0.229 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 -64592 sc-eQTL 6.09e-01 0.0447 0.0873 0.229 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 176856 sc-eQTL 7.80e-01 0.0228 0.0815 0.229 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -995870 sc-eQTL 9.18e-01 0.01 0.0974 0.227 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 -316681 sc-eQTL 1.77e-01 -0.108 0.0799 0.227 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C -412427 sc-eQTL 7.30e-02 -0.154 0.0855 0.227 NK L1
ENSG00000132849 PATJ 629299 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0933 0.0842 0.227 NK L1
ENSG00000162604 TM2D1 646282 sc-eQTL 2.47e-01 -0.1 0.0862 0.227 NK L1
ENSG00000162607 USP1 -64592 sc-eQTL 7.53e-01 0.0302 0.0957 0.227 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -995870 sc-eQTL 7.05e-01 0.0364 0.096 0.229 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -316681 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0984 0.0978 0.229 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C -412427 sc-eQTL 6.09e-01 0.0434 0.0848 0.229 Other_T L1
ENSG00000132849 PATJ 629299 sc-eQTL 7.34e-01 0.0269 0.079 0.229 Other_T L1
ENSG00000162604 TM2D1 646282 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0744 0.0925 0.229 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 -64592 sc-eQTL 8.02e-01 0.0164 0.0652 0.229 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000088035 ALG6 -995870 sc-eQTL 1.94e-01 0.157 0.12 0.222 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 -316681 sc-eQTL 8.90e-01 0.0156 0.113 0.222 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C -412427 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0669 0.118 0.222 B_Activated L2
ENSG00000132849 PATJ 629299 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00491 0.101 0.222 B_Activated L2
ENSG00000162604 TM2D1 646282 sc-eQTL 4.29e-01 0.101 0.128 0.222 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 -64592 sc-eQTL 3.59e-01 -0.115 0.125 0.222 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -995870 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00633 0.116 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 -316681 sc-eQTL 9.03e-02 0.187 0.11 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C -412427 sc-eQTL 7.24e-01 0.0332 0.0937 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000132849 PATJ 629299 sc-eQTL 4.85e-01 0.0709 0.101 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000162604 TM2D1 646282 sc-eQTL 1.98e-01 0.137 0.106 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 -64592 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0218 0.111 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -995870 sc-eQTL 8.57e-02 -0.196 0.114 0.226 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 -316681 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0907 0.107 0.226 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C -412427 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0108 0.102 0.226 B_Memory L2
ENSG00000132849 PATJ 629299 sc-eQTL 7.76e-01 -0.029 0.102 0.226 B_Memory L2
ENSG00000162604 TM2D1 646282 sc-eQTL 5.21e-01 0.0736 0.114 0.226 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 -64592 sc-eQTL 7.01e-01 0.0452 0.118 0.226 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -995870 sc-eQTL 1.68e-02 0.267 0.111 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 -316681 sc-eQTL 5.57e-01 0.0633 0.108 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C -412427 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0057 0.083 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000132849 PATJ 629299 sc-eQTL 3.17e-01 -0.107 0.106 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000162604 TM2D1 646282 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0607 0.098 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 -64592 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00448 0.0968 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -995870 sc-eQTL 3.80e-01 0.102 0.116 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 -316681 sc-eQTL 6.08e-01 0.0573 0.112 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C -412427 sc-eQTL 9.79e-01 0.00284 0.108 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000132849 PATJ 629299 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00188 0.11 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000162604 TM2D1 646282 sc-eQTL 5.37e-01 0.0687 0.111 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 -64592 sc-eQTL 9.57e-02 0.185 0.11 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -995870 sc-eQTL 1.55e-01 0.169 0.118 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 -316681 sc-eQTL 1.27e-01 0.158 0.103 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C -412427 sc-eQTL 5.07e-02 -0.209 0.106 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000132849 PATJ 629299 sc-eQTL 4.72e-01 0.0619 0.0859 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000162604 TM2D1 646282 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0411 0.11 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 -64592 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0235 0.109 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -995870 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0704 0.0999 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 -316681 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0666 0.0982 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C -412427 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0751 0.0867 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000132849 PATJ 629299 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0318 0.0609 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000162604 TM2D1 646282 sc-eQTL 2.35e-01 -0.104 0.0874 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 -64592 sc-eQTL 4.66e-01 0.0592 0.081 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -995870 sc-eQTL 1.02e-03 0.361 0.108 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -316681 sc-eQTL 7.79e-01 0.0277 0.0984 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C -412427 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0958 0.0956 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000132849 PATJ 629299 sc-eQTL 8.47e-01 0.0148 0.0769 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000162604 TM2D1 646282 sc-eQTL 4.57e-02 -0.179 0.0889 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 -64592 sc-eQTL 4.33e-01 0.0727 0.0925 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -995870 sc-eQTL 2.45e-02 0.253 0.112 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -316681 sc-eQTL 1.76e-01 -0.149 0.11 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C -412427 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0679 0.107 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000132849 PATJ 629299 sc-eQTL 9.56e-02 -0.166 0.0991 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000162604 TM2D1 646282 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0571 0.105 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 -64592 sc-eQTL 2.55e-01 -0.119 0.104 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -995870 sc-eQTL 9.63e-01 -0.0051 0.11 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 -316681 sc-eQTL 6.00e-01 0.0551 0.105 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C -412427 sc-eQTL 2.03e-02 -0.258 0.11 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000132849 PATJ 629299 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0717 0.106 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000162604 TM2D1 646282 sc-eQTL 7.39e-01 0.0324 0.097 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 -64592 sc-eQTL 1.60e-01 0.146 0.103 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -995870 sc-eQTL 9.77e-02 0.179 0.107 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 -316681 sc-eQTL 4.56e-01 0.0833 0.112 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C -412427 sc-eQTL 4.82e-02 -0.211 0.106 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000132849 PATJ 629299 sc-eQTL 3.25e-01 0.0808 0.0818 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000162604 TM2D1 646282 sc-eQTL 8.65e-02 0.171 0.0995 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 -64592 sc-eQTL 3.30e-01 0.0895 0.0916 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -995870 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0922 0.117 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -316681 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0218 0.114 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C -412427 sc-eQTL 2.74e-01 -0.128 0.116 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000132849 PATJ 629299 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0509 0.107 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000162604 TM2D1 646282 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0815 0.109 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 -64592 sc-eQTL 3.40e-01 -0.104 0.109 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -995870 sc-eQTL 3.49e-01 0.109 0.116 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -316681 sc-eQTL 4.88e-02 -0.221 0.112 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C -412427 sc-eQTL 8.27e-01 0.0237 0.108 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000132849 PATJ 629299 sc-eQTL 1.79e-01 -0.147 0.109 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000162604 TM2D1 646282 sc-eQTL 3.48e-01 0.105 0.111 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 -64592 sc-eQTL 8.35e-02 0.193 0.111 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -995870 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0368 0.108 0.232 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 -316681 sc-eQTL 7.02e-02 -0.188 0.103 0.232 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C -412427 sc-eQTL 8.96e-01 0.0144 0.11 0.232 MAIT L2
ENSG00000132849 PATJ 629299 sc-eQTL 1.49e-01 0.134 0.0923 0.232 MAIT L2
ENSG00000162604 TM2D1 646282 sc-eQTL 8.54e-01 0.0194 0.105 0.232 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 -64592 sc-eQTL 1.48e-01 0.157 0.108 0.232 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -995870 sc-eQTL 8.80e-02 0.193 0.112 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 -316681 sc-eQTL 2.98e-02 -0.212 0.097 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C -412427 sc-eQTL 1.10e-01 -0.175 0.109 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000132849 PATJ 629299 sc-eQTL 3.20e-01 -0.107 0.107 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000162604 TM2D1 646282 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0914 0.109 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 -64592 sc-eQTL 9.38e-01 0.00912 0.118 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -995870 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0561 0.11 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 -316681 sc-eQTL 2.00e-01 -0.123 0.0955 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C -412427 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0913 0.0971 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000132849 PATJ 629299 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0679 0.105 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000162604 TM2D1 646282 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0549 0.1 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 -64592 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0969 0.107 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -995870 sc-eQTL 4.87e-01 0.0887 0.127 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 -316681 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0382 0.0974 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C -412427 sc-eQTL 8.73e-01 0.0181 0.113 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000132849 PATJ 629299 sc-eQTL 2.47e-01 -0.122 0.105 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000162604 TM2D1 646282 sc-eQTL 1.35e-01 0.178 0.119 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 -64592 sc-eQTL 3.27e-01 0.122 0.124 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -995870 sc-eQTL 2.26e-01 -0.129 0.106 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 -316681 sc-eQTL 4.09e-01 0.0816 0.0987 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C -412427 sc-eQTL 6.01e-01 -0.053 0.101 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000132849 PATJ 629299 sc-eQTL 9.65e-01 0.00466 0.107 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000162604 TM2D1 646282 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0605 0.104 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 -64592 sc-eQTL 3.85e-01 0.0957 0.11 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -995870 sc-eQTL 5.65e-01 0.0871 0.151 0.207 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 -316681 sc-eQTL 3.81e-01 0.142 0.161 0.207 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C -412427 sc-eQTL 3.55e-01 -0.13 0.14 0.207 PB L2
ENSG00000132849 PATJ 629299 sc-eQTL 9.48e-01 0.0095 0.146 0.207 PB L2
ENSG00000162604 TM2D1 646282 sc-eQTL 6.86e-01 0.0576 0.142 0.207 PB L2
ENSG00000162607 USP1 -64592 sc-eQTL 6.56e-01 0.0624 0.14 0.207 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -995870 sc-eQTL 8.34e-01 0.0223 0.106 0.23 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 -316681 sc-eQTL 6.66e-01 0.0461 0.107 0.23 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C -412427 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0849 0.0934 0.23 Pro_T L2
ENSG00000132849 PATJ 629299 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0362 0.102 0.23 Pro_T L2
ENSG00000162604 TM2D1 646282 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0585 0.114 0.23 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 -64592 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0124 0.0645 0.23 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -995870 sc-eQTL 6.96e-01 0.0457 0.117 0.229 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 -316681 sc-eQTL 1.56e-01 -0.152 0.107 0.229 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C -412427 sc-eQTL 3.35e-01 0.106 0.109 0.229 Treg L2
ENSG00000132849 PATJ 629299 sc-eQTL 4.15e-01 0.0829 0.101 0.229 Treg L2
ENSG00000162604 TM2D1 646282 sc-eQTL 3.13e-01 -0.113 0.112 0.229 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 -64592 sc-eQTL 5.41e-01 0.0679 0.111 0.229 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -995870 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0439 0.112 0.229 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 -316681 sc-eQTL 5.16e-02 -0.213 0.109 0.229 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C -412427 sc-eQTL 2.58e-01 -0.108 0.0949 0.229 cDC L2
ENSG00000162604 TM2D1 646282 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0516 0.119 0.229 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 -64592 sc-eQTL 1.35e-01 0.16 0.107 0.229 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -995870 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0331 0.103 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 -316681 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0862 0.108 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C -412427 sc-eQTL 3.22e-01 0.0755 0.0761 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000162604 TM2D1 646282 sc-eQTL 7.83e-01 0.0217 0.0786 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 -64592 sc-eQTL 9.02e-01 0.0117 0.0953 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 176856 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0315 0.0957 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -995870 sc-eQTL 4.01e-01 0.0974 0.116 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 -316681 sc-eQTL 8.03e-01 0.0268 0.107 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C -412427 sc-eQTL 4.90e-01 0.0642 0.093 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000162604 TM2D1 646282 sc-eQTL 5.67e-01 0.0544 0.0949 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 -64592 sc-eQTL 7.80e-01 0.0302 0.108 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 176856 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0833 0.0897 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -995870 sc-eQTL 1.02e-01 0.222 0.135 0.227 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 -316681 sc-eQTL 8.40e-01 0.0271 0.134 0.227 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C -412427 sc-eQTL 5.70e-01 0.0727 0.128 0.227 gdT L2
ENSG00000132849 PATJ 629299 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0397 0.125 0.227 gdT L2
ENSG00000162604 TM2D1 646282 sc-eQTL 1.40e-01 -0.193 0.13 0.227 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 -64592 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0477 0.128 0.227 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -995870 sc-eQTL 2.47e-01 -0.125 0.107 0.231 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 -316681 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0756 0.11 0.231 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C -412427 sc-eQTL 9.59e-01 0.00534 0.105 0.231 intMono L2
ENSG00000162604 TM2D1 646282 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00293 0.111 0.231 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 -64592 sc-eQTL 2.20e-01 0.144 0.117 0.231 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 176856 sc-eQTL 4.65e-01 0.0632 0.0863 0.231 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -995870 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0243 0.113 0.229 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 -316681 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0408 0.111 0.229 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C -412427 sc-eQTL 3.10e-02 0.223 0.103 0.229 ncMono L2
ENSG00000162604 TM2D1 646282 sc-eQTL 3.33e-02 0.237 0.111 0.229 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 -64592 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0214 0.111 0.229 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 176856 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0291 0.0786 0.229 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -995870 sc-eQTL 7.95e-01 0.0316 0.121 0.234 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 -316681 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0605 0.124 0.234 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C -412427 sc-eQTL 1.25e-01 0.17 0.11 0.234 pDC L2
ENSG00000162604 TM2D1 646282 sc-eQTL 5.89e-01 -0.059 0.109 0.234 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 -64592 sc-eQTL 3.06e-01 0.13 0.127 0.234 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000088035 ALG6 -995870 sc-eQTL 7.90e-01 -0.031 0.116 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -316681 sc-eQTL 4.05e-01 0.0842 0.101 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -412427 sc-eQTL 9.38e-01 0.00631 0.0817 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 629299 sc-eQTL 7.18e-01 0.0327 0.0904 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 646282 sc-eQTL 1.31e-01 0.155 0.102 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 -64592 sc-eQTL 6.08e-01 0.0534 0.104 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -995870 sc-eQTL 7.51e-03 0.302 0.112 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -316681 sc-eQTL 3.98e-01 0.0898 0.106 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -412427 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0727 0.081 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 629299 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00371 0.097 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 646282 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0579 0.0925 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 -64592 sc-eQTL 4.84e-01 0.069 0.0984 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -995870 sc-eQTL 7.36e-01 0.0346 0.102 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -316681 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0626 0.103 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -412427 sc-eQTL 2.38e-01 0.084 0.0711 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 646282 sc-eQTL 8.94e-01 0.00992 0.0743 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 -64592 sc-eQTL 6.24e-01 0.0442 0.0901 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 176856 sc-eQTL 2.74e-01 -0.107 0.0974 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -995870 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0855 0.114 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -316681 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0833 0.112 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -412427 sc-eQTL 1.64e-01 0.133 0.0956 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 646282 sc-eQTL 1.53e-01 0.16 0.112 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 -64592 sc-eQTL 4.93e-01 0.0718 0.105 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 176856 sc-eQTL 6.09e-01 0.0365 0.0714 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -995870 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0626 0.101 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -316681 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0515 0.0909 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -412427 sc-eQTL 2.39e-01 -0.107 0.0905 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 629299 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0136 0.0979 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 646282 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0438 0.0897 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 -64592 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0176 0.0977 0.228 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162607 \N -64592 7.08e-06 9.31e-06 1.31e-06 4.2e-06 2.25e-06 3.5e-06 9.62e-06 1.77e-06 6.66e-06 4.24e-06 1.03e-05 4.77e-06 1.15e-05 3.81e-06 2.07e-06 5.79e-06 3.99e-06 5.37e-06 2.65e-06 2.65e-06 4.44e-06 7.81e-06 6.91e-06 3.17e-06 1.14e-05 3.11e-06 4.46e-06 3.1e-06 8.01e-06 7.98e-06 4.24e-06 9.05e-07 1.29e-06 2.96e-06 3.55e-06 2.28e-06 1.71e-06 1.85e-06 1.57e-06 1.02e-06 9.92e-07 8.83e-06 1.28e-06 1.58e-07 7.53e-07 1.48e-06 1.26e-06 7.8e-07 4.19e-07