logo

Genes within 1Mb (chr1:62370265:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000088035 ALG6 -997310 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0445 0.141 0.085 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 -318121 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0409 0.141 0.085 B L1
ENSG00000125703 ATG4C -413867 sc-eQTL 9.25e-01 0.00919 0.098 0.085 B L1
ENSG00000132849 PATJ 627859 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0957 0.119 0.085 B L1
ENSG00000162604 TM2D1 644842 sc-eQTL 1.90e-01 0.156 0.118 0.085 B L1
ENSG00000162607 USP1 -66032 sc-eQTL 4.02e-01 -0.114 0.135 0.085 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -997310 sc-eQTL 6.18e-01 0.0645 0.129 0.085 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -318121 sc-eQTL 6.74e-01 -0.055 0.131 0.085 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C -413867 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00184 0.106 0.085 CD4T L1
ENSG00000132849 PATJ 627859 sc-eQTL 1.17e-01 -0.134 0.0852 0.085 CD4T L1
ENSG00000162604 TM2D1 644842 sc-eQTL 1.02e-01 0.17 0.103 0.085 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 -66032 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0447 0.102 0.085 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -997310 sc-eQTL 2.42e-01 -0.166 0.142 0.085 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -318121 sc-eQTL 5.29e-02 0.278 0.143 0.085 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C -413867 sc-eQTL 4.14e-01 0.112 0.136 0.085 CD8T L1
ENSG00000132849 PATJ 627859 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0314 0.0833 0.085 CD8T L1
ENSG00000162604 TM2D1 644842 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0586 0.125 0.085 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 -66032 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0829 0.119 0.085 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -997310 sc-eQTL 1.81e-01 0.202 0.15 0.083 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 -318121 sc-eQTL 3.23e-01 0.153 0.154 0.083 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C -413867 sc-eQTL 3.21e-01 -0.12 0.121 0.083 DC L1
ENSG00000162604 TM2D1 644842 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00686 0.141 0.083 DC L1
ENSG00000162607 USP1 -66032 sc-eQTL 1.71e-01 -0.202 0.147 0.083 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -997310 sc-eQTL 5.17e-01 0.0953 0.147 0.085 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 -318121 sc-eQTL 7.47e-01 0.0458 0.142 0.085 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C -413867 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0861 0.0958 0.085 Mono L1
ENSG00000162604 TM2D1 644842 sc-eQTL 7.68e-01 0.0315 0.106 0.085 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 -66032 sc-eQTL 5.56e-01 0.0734 0.124 0.085 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 175416 sc-eQTL 9.29e-01 0.0104 0.116 0.085 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -997310 sc-eQTL 8.88e-01 0.0195 0.139 0.086 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 -318121 sc-eQTL 9.35e-01 0.00927 0.114 0.086 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C -413867 sc-eQTL 1.58e-01 0.173 0.122 0.086 NK L1
ENSG00000132849 PATJ 627859 sc-eQTL 4.77e-01 0.0857 0.12 0.086 NK L1
ENSG00000162604 TM2D1 644842 sc-eQTL 4.22e-01 0.0991 0.123 0.086 NK L1
ENSG00000162607 USP1 -66032 sc-eQTL 2.84e-01 -0.146 0.136 0.086 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -997310 sc-eQTL 8.60e-01 0.0241 0.137 0.085 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -318121 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0504 0.14 0.085 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C -413867 sc-eQTL 3.63e-01 -0.11 0.121 0.085 Other_T L1
ENSG00000132849 PATJ 627859 sc-eQTL 7.48e-01 0.0363 0.113 0.085 Other_T L1
ENSG00000162604 TM2D1 644842 sc-eQTL 8.06e-01 0.0325 0.132 0.085 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 -66032 sc-eQTL 8.87e-01 0.0133 0.0931 0.085 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000088035 ALG6 -997310 sc-eQTL 8.33e-01 0.0356 0.169 0.097 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318121 sc-eQTL 8.97e-01 0.0204 0.157 0.097 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C -413867 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0503 0.165 0.097 B_Activated L2
ENSG00000132849 PATJ 627859 sc-eQTL 7.98e-01 0.036 0.14 0.097 B_Activated L2
ENSG00000162604 TM2D1 644842 sc-eQTL 2.91e-01 0.189 0.178 0.097 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 -66032 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0843 0.175 0.097 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -997310 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000689 0.163 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318121 sc-eQTL 2.00e-01 -0.199 0.155 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C -413867 sc-eQTL 1.01e-01 0.215 0.131 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000132849 PATJ 627859 sc-eQTL 2.15e-01 -0.176 0.142 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000162604 TM2D1 644842 sc-eQTL 1.49e-01 -0.215 0.149 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 -66032 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0311 0.156 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -997310 sc-eQTL 1.97e-01 0.206 0.159 0.086 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318121 sc-eQTL 8.26e-01 0.0329 0.15 0.086 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C -413867 sc-eQTL 3.85e-01 -0.123 0.142 0.086 B_Memory L2
ENSG00000132849 PATJ 627859 sc-eQTL 4.34e-01 -0.111 0.142 0.086 B_Memory L2
ENSG00000162604 TM2D1 644842 sc-eQTL 3.07e-01 -0.163 0.159 0.086 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 -66032 sc-eQTL 2.08e-01 -0.207 0.163 0.086 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -997310 sc-eQTL 2.20e-01 -0.199 0.162 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318121 sc-eQTL 9.47e-01 0.0103 0.156 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C -413867 sc-eQTL 8.40e-01 0.0243 0.12 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000132849 PATJ 627859 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0711 0.154 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000162604 TM2D1 644842 sc-eQTL 2.73e-01 0.155 0.141 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 -66032 sc-eQTL 3.49e-01 0.131 0.14 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -997310 sc-eQTL 4.64e-01 0.121 0.165 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318121 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0938 0.158 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C -413867 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0475 0.152 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000132849 PATJ 627859 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0776 0.156 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000162604 TM2D1 644842 sc-eQTL 2.22e-01 0.193 0.157 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 -66032 sc-eQTL 2.17e-01 -0.194 0.157 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -997310 sc-eQTL 2.40e-01 0.197 0.167 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318121 sc-eQTL 1.68e-01 -0.202 0.146 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C -413867 sc-eQTL 1.61e-01 0.213 0.151 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000132849 PATJ 627859 sc-eQTL 2.26e-01 0.147 0.121 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000162604 TM2D1 644842 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00591 0.156 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 -66032 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0569 0.155 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -997310 sc-eQTL 1.75e-01 0.193 0.142 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318121 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00894 0.14 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C -413867 sc-eQTL 1.23e-01 -0.19 0.123 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000132849 PATJ 627859 sc-eQTL 1.34e-01 -0.13 0.0862 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000162604 TM2D1 644842 sc-eQTL 3.25e-01 0.123 0.124 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 -66032 sc-eQTL 8.78e-01 0.0177 0.115 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -997310 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0289 0.157 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318121 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0222 0.139 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C -413867 sc-eQTL 7.40e-02 0.241 0.134 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000132849 PATJ 627859 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0808 0.108 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000162604 TM2D1 644842 sc-eQTL 1.05e-01 0.205 0.126 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 -66032 sc-eQTL 3.99e-01 0.11 0.13 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -997310 sc-eQTL 4.35e-01 -0.126 0.161 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318121 sc-eQTL 5.03e-01 0.105 0.157 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C -413867 sc-eQTL 1.37e-01 0.227 0.152 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000132849 PATJ 627859 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0544 0.142 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000162604 TM2D1 644842 sc-eQTL 1.48e-01 0.217 0.149 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 -66032 sc-eQTL 7.71e-01 0.0436 0.149 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -997310 sc-eQTL 4.80e-01 -0.112 0.158 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318121 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0387 0.15 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C -413867 sc-eQTL 3.51e-01 0.149 0.159 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000132849 PATJ 627859 sc-eQTL 1.82e-01 -0.202 0.151 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000162604 TM2D1 644842 sc-eQTL 3.91e-01 0.119 0.139 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 -66032 sc-eQTL 8.53e-02 -0.255 0.148 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -997310 sc-eQTL 4.64e-01 -0.112 0.153 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318121 sc-eQTL 1.10e-01 0.252 0.157 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C -413867 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0304 0.152 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000132849 PATJ 627859 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0267 0.116 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000162604 TM2D1 644842 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0523 0.142 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 -66032 sc-eQTL 4.04e-01 -0.108 0.13 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -997310 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0681 0.16 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318121 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0663 0.156 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C -413867 sc-eQTL 1.04e-01 0.259 0.159 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000132849 PATJ 627859 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0119 0.147 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000162604 TM2D1 644842 sc-eQTL 2.49e-01 0.172 0.149 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 -66032 sc-eQTL 7.45e-01 0.0487 0.15 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -997310 sc-eQTL 3.71e-03 -0.475 0.162 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318121 sc-eQTL 3.65e-02 0.333 0.158 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C -413867 sc-eQTL 4.39e-01 -0.119 0.154 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000132849 PATJ 627859 sc-eQTL 3.32e-01 0.151 0.156 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000162604 TM2D1 644842 sc-eQTL 3.69e-01 -0.143 0.158 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 -66032 sc-eQTL 5.74e-01 0.0894 0.159 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -997310 sc-eQTL 3.55e-01 0.142 0.153 0.084 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318121 sc-eQTL 8.60e-01 0.026 0.147 0.084 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C -413867 sc-eQTL 3.58e-01 -0.143 0.155 0.084 MAIT L2
ENSG00000132849 PATJ 627859 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0695 0.131 0.084 MAIT L2
ENSG00000162604 TM2D1 644842 sc-eQTL 9.81e-01 -0.0036 0.149 0.084 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 -66032 sc-eQTL 6.13e-01 -0.078 0.154 0.084 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -997310 sc-eQTL 1.07e-01 -0.251 0.155 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318121 sc-eQTL 7.96e-01 0.035 0.135 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C -413867 sc-eQTL 6.78e-01 0.0627 0.151 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000132849 PATJ 627859 sc-eQTL 1.12e-01 0.235 0.147 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000162604 TM2D1 644842 sc-eQTL 4.75e-01 -0.108 0.15 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 -66032 sc-eQTL 5.13e-01 -0.106 0.162 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -997310 sc-eQTL 6.94e-01 0.0618 0.157 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318121 sc-eQTL 1.68e-01 0.188 0.136 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C -413867 sc-eQTL 4.28e-01 0.11 0.138 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000132849 PATJ 627859 sc-eQTL 4.23e-01 0.12 0.15 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000162604 TM2D1 644842 sc-eQTL 6.41e-01 0.0665 0.142 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 -66032 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0334 0.153 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -997310 sc-eQTL 8.80e-01 -0.028 0.185 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318121 sc-eQTL 3.60e-01 0.129 0.141 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C -413867 sc-eQTL 9.22e-01 -0.016 0.164 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000132849 PATJ 627859 sc-eQTL 8.84e-01 0.0223 0.153 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000162604 TM2D1 644842 sc-eQTL 4.99e-01 -0.117 0.173 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 -66032 sc-eQTL 7.83e-01 0.0498 0.181 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -997310 sc-eQTL 4.36e-01 0.12 0.153 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318121 sc-eQTL 2.69e-01 -0.157 0.142 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C -413867 sc-eQTL 5.10e-01 0.0959 0.145 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000132849 PATJ 627859 sc-eQTL 2.98e-01 -0.16 0.153 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000162604 TM2D1 644842 sc-eQTL 6.94e-01 0.0591 0.15 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 -66032 sc-eQTL 3.50e-01 -0.148 0.158 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -997310 sc-eQTL 9.20e-02 -0.322 0.189 0.089 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318121 sc-eQTL 7.20e-01 0.0736 0.205 0.089 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C -413867 sc-eQTL 2.66e-01 0.199 0.178 0.089 PB L2
ENSG00000132849 PATJ 627859 sc-eQTL 3.33e-01 -0.179 0.185 0.089 PB L2
ENSG00000162604 TM2D1 644842 sc-eQTL 3.70e-01 0.162 0.179 0.089 PB L2
ENSG00000162607 USP1 -66032 sc-eQTL 1.34e-02 -0.434 0.173 0.089 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -997310 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0741 0.151 0.085 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318121 sc-eQTL 8.26e-01 0.0333 0.151 0.085 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C -413867 sc-eQTL 6.17e-01 0.0663 0.132 0.085 Pro_T L2
ENSG00000132849 PATJ 627859 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0475 0.144 0.085 Pro_T L2
ENSG00000162604 TM2D1 644842 sc-eQTL 4.93e-01 -0.111 0.162 0.085 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 -66032 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00755 0.0913 0.085 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -997310 sc-eQTL 1.44e-01 -0.241 0.164 0.085 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318121 sc-eQTL 2.08e-01 0.191 0.151 0.085 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C -413867 sc-eQTL 2.29e-01 -0.186 0.154 0.085 Treg L2
ENSG00000132849 PATJ 627859 sc-eQTL 1.64e-02 -0.342 0.141 0.085 Treg L2
ENSG00000162604 TM2D1 644842 sc-eQTL 4.51e-01 0.119 0.158 0.085 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 -66032 sc-eQTL 6.19e-01 -0.078 0.156 0.085 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -997310 sc-eQTL 3.90e-01 0.133 0.154 0.088 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318121 sc-eQTL 1.80e-01 0.204 0.151 0.088 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C -413867 sc-eQTL 4.31e-01 -0.104 0.132 0.088 cDC L2
ENSG00000162604 TM2D1 644842 sc-eQTL 4.13e-01 -0.135 0.165 0.088 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 -66032 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0356 0.149 0.088 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -997310 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0502 0.146 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318121 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0401 0.154 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C -413867 sc-eQTL 7.37e-01 0.0365 0.108 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000162604 TM2D1 644842 sc-eQTL 9.58e-01 0.00594 0.112 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 -66032 sc-eQTL 4.22e-02 0.274 0.134 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 175416 sc-eQTL 9.82e-01 0.0031 0.136 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -997310 sc-eQTL 2.54e-01 0.19 0.166 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318121 sc-eQTL 6.97e-02 0.28 0.153 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C -413867 sc-eQTL 2.68e-01 -0.148 0.133 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000162604 TM2D1 644842 sc-eQTL 4.46e-01 0.104 0.136 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 -66032 sc-eQTL 2.69e-01 -0.172 0.155 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 175416 sc-eQTL 4.67e-01 0.0941 0.129 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -997310 sc-eQTL 4.13e-01 0.146 0.178 0.097 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318121 sc-eQTL 8.53e-01 0.0324 0.175 0.097 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C -413867 sc-eQTL 2.32e-01 0.199 0.166 0.097 gdT L2
ENSG00000132849 PATJ 627859 sc-eQTL 5.31e-01 0.102 0.163 0.097 gdT L2
ENSG00000162604 TM2D1 644842 sc-eQTL 5.49e-01 0.103 0.171 0.097 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 -66032 sc-eQTL 1.46e-01 0.243 0.167 0.097 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -997310 sc-eQTL 1.33e-01 -0.231 0.153 0.082 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318121 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00698 0.158 0.082 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C -413867 sc-eQTL 8.94e-01 0.0201 0.15 0.082 intMono L2
ENSG00000162604 TM2D1 644842 sc-eQTL 2.16e-01 -0.197 0.159 0.082 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 -66032 sc-eQTL 7.58e-01 0.052 0.169 0.082 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 175416 sc-eQTL 2.45e-01 -0.144 0.124 0.082 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -997310 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0244 0.159 0.086 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318121 sc-eQTL 8.79e-01 0.0239 0.157 0.086 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C -413867 sc-eQTL 3.96e-02 -0.3 0.145 0.086 ncMono L2
ENSG00000162604 TM2D1 644842 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0595 0.158 0.086 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 -66032 sc-eQTL 5.70e-01 0.0891 0.156 0.086 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 175416 sc-eQTL 1.64e-01 0.154 0.111 0.086 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -997310 sc-eQTL 1.69e-01 0.243 0.175 0.076 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318121 sc-eQTL 4.68e-01 0.131 0.18 0.076 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C -413867 sc-eQTL 4.69e-01 -0.117 0.162 0.076 pDC L2
ENSG00000162604 TM2D1 644842 sc-eQTL 4.88e-01 0.11 0.158 0.076 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 -66032 sc-eQTL 4.05e-01 -0.154 0.185 0.076 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000088035 ALG6 -997310 sc-eQTL 2.40e-01 0.194 0.164 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -318121 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0938 0.143 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -413867 sc-eQTL 4.57e-01 0.0862 0.116 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 627859 sc-eQTL 3.29e-01 -0.125 0.128 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 644842 sc-eQTL 8.38e-02 -0.251 0.145 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 -66032 sc-eQTL 4.67e-01 -0.107 0.148 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -997310 sc-eQTL 5.35e-01 -0.101 0.162 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -318121 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0369 0.152 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -413867 sc-eQTL 9.28e-01 0.0104 0.116 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 627859 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0891 0.138 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 644842 sc-eQTL 8.23e-02 0.229 0.131 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 -66032 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0159 0.14 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -997310 sc-eQTL 7.75e-01 0.042 0.147 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -318121 sc-eQTL 5.58e-01 0.0867 0.148 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -413867 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0357 0.102 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 644842 sc-eQTL 5.23e-01 0.068 0.106 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 -66032 sc-eQTL 7.83e-01 0.0356 0.129 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 175416 sc-eQTL 5.77e-01 0.0782 0.14 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -997310 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00233 0.162 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -318121 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0613 0.16 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -413867 sc-eQTL 1.76e-01 -0.184 0.136 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 644842 sc-eQTL 3.77e-01 -0.141 0.159 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 -66032 sc-eQTL 5.09e-01 0.0984 0.149 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 175416 sc-eQTL 9.91e-01 -0.0011 0.101 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -997310 sc-eQTL 5.38e-01 0.0893 0.145 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -318121 sc-eQTL 5.75e-01 0.073 0.13 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -413867 sc-eQTL 2.59e-01 0.146 0.129 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 627859 sc-eQTL 9.68e-01 0.00565 0.14 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 644842 sc-eQTL 4.17e-01 0.104 0.128 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 -66032 sc-eQTL 3.51e-01 -0.13 0.139 0.086 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116641 DOCK7 -318103 eQTL 0.0454 -0.0785 0.0392 0.0 0.0 0.0829
ENSG00000132855 ANGPTL3 -227222 pQTL 0.00413 -0.143 0.0497 0.0 0.0 0.0882
ENSG00000162607 USP1 -66032 eQTL 0.00834 -0.0602 0.0228 0.0 0.0 0.0829
ENSG00000240563 L1TD1 175416 eQTL 0.0115 0.173 0.0681 0.0 0.0 0.0829

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000240563 L1TD1 175416 2.91e-06 2.7e-06 3.61e-07 1.85e-06 4.68e-07 7.58e-07 2.22e-06 4.25e-07 1.67e-06 7.98e-07 2.35e-06 1.66e-06 3.25e-06 1.38e-06 6.96e-07 1.22e-06 1.27e-06 1.46e-06 1.05e-06 7.55e-07 6.5e-07 2.35e-06 2.02e-06 9.28e-07 4.2e-06 9.49e-07 1.17e-06 1.22e-06 1.98e-06 1.84e-06 1.45e-06 3e-07 4.8e-07 1e-06 1.61e-06 6.66e-07 6.72e-07 3.94e-07 4.87e-07 1.87e-07 3.53e-07 3.26e-06 4.62e-07 2.07e-07 3.56e-07 3.24e-07 5.17e-07 2.22e-07 2.75e-07