logo

Genes within 1Mb (chr1:62369813:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000088035 ALG6 -997762 sc-eQTL 3.07e-02 0.209 0.0961 0.239 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 -318573 sc-eQTL 3.69e-01 0.0873 0.097 0.239 B L1
ENSG00000125703 ATG4C -414319 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00752 0.0676 0.239 B L1
ENSG00000132849 PATJ 627407 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0171 0.082 0.239 B L1
ENSG00000162604 TM2D1 644390 sc-eQTL 8.47e-01 0.0158 0.0819 0.239 B L1
ENSG00000162607 USP1 -66484 sc-eQTL 3.37e-01 0.0897 0.0931 0.239 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -997762 sc-eQTL 1.34e-01 0.134 0.0889 0.239 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -318573 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0407 0.0904 0.239 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C -414319 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0604 0.0729 0.239 CD4T L1
ENSG00000132849 PATJ 627407 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0604 0.0592 0.239 CD4T L1
ENSG00000162604 TM2D1 644390 sc-eQTL 1.55e-01 -0.102 0.0717 0.239 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 -66484 sc-eQTL 3.34e-01 0.0685 0.0707 0.239 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -997762 sc-eQTL 8.83e-01 0.0144 0.0978 0.239 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -318573 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0481 0.0991 0.239 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C -414319 sc-eQTL 2.62e-02 -0.208 0.0931 0.239 CD8T L1
ENSG00000132849 PATJ 627407 sc-eQTL 7.04e-01 0.0218 0.0574 0.239 CD8T L1
ENSG00000162604 TM2D1 644390 sc-eQTL 4.46e-01 0.0657 0.0861 0.239 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 -66484 sc-eQTL 2.68e-01 0.0908 0.0818 0.239 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -997762 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0445 0.103 0.243 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 -318573 sc-eQTL 2.48e-01 -0.122 0.105 0.243 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C -414319 sc-eQTL 5.55e-01 0.0488 0.0825 0.243 DC L1
ENSG00000162604 TM2D1 644390 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0319 0.0962 0.243 DC L1
ENSG00000162607 USP1 -66484 sc-eQTL 3.39e-02 0.213 0.0997 0.243 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -997762 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0212 0.101 0.239 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 -318573 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0617 0.0978 0.239 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C -414319 sc-eQTL 8.29e-02 0.114 0.0657 0.239 Mono L1
ENSG00000162604 TM2D1 644390 sc-eQTL 7.11e-01 0.0272 0.0734 0.239 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 -66484 sc-eQTL 6.55e-01 0.0384 0.0858 0.239 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 174964 sc-eQTL 7.54e-01 0.0251 0.0801 0.239 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -997762 sc-eQTL 9.61e-01 0.00472 0.0958 0.238 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 -318573 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0943 0.0786 0.238 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C -414319 sc-eQTL 1.04e-01 -0.137 0.0842 0.238 NK L1
ENSG00000132849 PATJ 627407 sc-eQTL 2.19e-01 -0.102 0.0827 0.238 NK L1
ENSG00000162604 TM2D1 644390 sc-eQTL 1.96e-01 -0.11 0.0847 0.238 NK L1
ENSG00000162607 USP1 -66484 sc-eQTL 7.45e-01 0.0307 0.094 0.238 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -997762 sc-eQTL 6.84e-01 0.0386 0.0949 0.239 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -318573 sc-eQTL 8.05e-01 -0.024 0.0969 0.239 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C -414319 sc-eQTL 3.11e-01 0.085 0.0837 0.239 Other_T L1
ENSG00000132849 PATJ 627407 sc-eQTL 7.22e-01 0.0278 0.0781 0.239 Other_T L1
ENSG00000162604 TM2D1 644390 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0839 0.0915 0.239 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 -66484 sc-eQTL 7.91e-01 0.0171 0.0645 0.239 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000088035 ALG6 -997762 sc-eQTL 2.47e-01 0.138 0.119 0.235 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318573 sc-eQTL 8.23e-01 0.0248 0.111 0.235 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C -414319 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0591 0.116 0.235 B_Activated L2
ENSG00000132849 PATJ 627407 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0277 0.099 0.235 B_Activated L2
ENSG00000162604 TM2D1 644390 sc-eQTL 4.82e-01 0.0885 0.126 0.235 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 -66484 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0815 0.123 0.235 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -997762 sc-eQTL 7.54e-01 0.0358 0.114 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318573 sc-eQTL 9.53e-02 0.182 0.108 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C -414319 sc-eQTL 2.93e-01 0.097 0.092 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000132849 PATJ 627407 sc-eQTL 5.30e-01 0.0629 0.0999 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000162604 TM2D1 644390 sc-eQTL 3.08e-01 0.107 0.105 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 -66484 sc-eQTL 9.00e-01 0.0139 0.11 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -997762 sc-eQTL 1.17e-01 -0.176 0.112 0.237 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318573 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0758 0.105 0.237 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C -414319 sc-eQTL 7.33e-01 0.0343 0.1 0.237 B_Memory L2
ENSG00000132849 PATJ 627407 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0158 0.1 0.237 B_Memory L2
ENSG00000162604 TM2D1 644390 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00631 0.113 0.237 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 -66484 sc-eQTL 8.15e-01 0.0272 0.116 0.237 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -997762 sc-eQTL 9.00e-03 0.287 0.109 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318573 sc-eQTL 5.85e-01 0.058 0.106 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C -414319 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00388 0.0817 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000132849 PATJ 627407 sc-eQTL 3.02e-01 -0.108 0.105 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000162604 TM2D1 644390 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0786 0.0964 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 -66484 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000955 0.0953 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -997762 sc-eQTL 3.88e-01 0.0986 0.114 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318573 sc-eQTL 6.81e-01 0.0453 0.11 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C -414319 sc-eQTL 9.08e-01 0.0122 0.106 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000132849 PATJ 627407 sc-eQTL 7.54e-01 -0.034 0.108 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000162604 TM2D1 644390 sc-eQTL 7.00e-01 0.0422 0.109 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 -66484 sc-eQTL 1.27e-01 0.166 0.109 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -997762 sc-eQTL 1.03e-01 0.191 0.117 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318573 sc-eQTL 7.53e-02 0.182 0.102 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C -414319 sc-eQTL 5.23e-02 -0.206 0.105 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000132849 PATJ 627407 sc-eQTL 4.09e-01 0.0703 0.085 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000162604 TM2D1 644390 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0415 0.109 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 -66484 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0235 0.108 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -997762 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0761 0.0988 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318573 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0381 0.0972 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C -414319 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0774 0.0858 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000132849 PATJ 627407 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0495 0.0602 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000162604 TM2D1 644390 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0864 0.0866 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 -66484 sc-eQTL 5.25e-01 0.0511 0.0802 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -997762 sc-eQTL 2.83e-03 0.324 0.107 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318573 sc-eQTL 7.35e-01 0.0329 0.097 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C -414319 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0929 0.0942 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000132849 PATJ 627407 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0402 0.0757 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000162604 TM2D1 644390 sc-eQTL 6.61e-02 -0.162 0.0877 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 -66484 sc-eQTL 4.85e-01 0.0637 0.0912 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -997762 sc-eQTL 5.03e-02 0.217 0.11 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318573 sc-eQTL 1.73e-01 -0.148 0.108 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C -414319 sc-eQTL 4.77e-01 -0.075 0.105 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000132849 PATJ 627407 sc-eQTL 6.53e-02 -0.181 0.0975 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000162604 TM2D1 644390 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0308 0.103 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 -66484 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0935 0.103 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -997762 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0468 0.109 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318573 sc-eQTL 8.06e-01 0.0254 0.103 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C -414319 sc-eQTL 1.19e-01 -0.171 0.109 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000132849 PATJ 627407 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0768 0.104 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000162604 TM2D1 644390 sc-eQTL 8.82e-01 0.0142 0.0955 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 -66484 sc-eQTL 1.02e-01 0.167 0.102 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -997762 sc-eQTL 1.56e-01 0.151 0.106 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318573 sc-eQTL 5.23e-01 0.0702 0.11 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C -414319 sc-eQTL 3.64e-02 -0.22 0.104 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000132849 PATJ 627407 sc-eQTL 4.42e-01 0.0621 0.0806 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000162604 TM2D1 644390 sc-eQTL 1.26e-01 0.15 0.0981 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 -66484 sc-eQTL 4.47e-01 0.0687 0.0902 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -997762 sc-eQTL 5.41e-01 -0.07 0.114 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318573 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0198 0.112 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C -414319 sc-eQTL 2.02e-01 -0.146 0.114 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000132849 PATJ 627407 sc-eQTL 7.11e-01 -0.039 0.105 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000162604 TM2D1 644390 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0943 0.107 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 -66484 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0878 0.107 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -997762 sc-eQTL 3.08e-01 0.117 0.114 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318573 sc-eQTL 5.22e-02 -0.215 0.11 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C -414319 sc-eQTL 5.76e-01 0.0596 0.107 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000132849 PATJ 627407 sc-eQTL 2.68e-01 -0.119 0.108 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000162604 TM2D1 644390 sc-eQTL 3.27e-01 0.108 0.11 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 -66484 sc-eQTL 3.97e-02 0.226 0.109 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -997762 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00609 0.108 0.242 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318573 sc-eQTL 2.31e-01 -0.123 0.103 0.242 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C -414319 sc-eQTL 7.87e-01 0.0294 0.109 0.242 MAIT L2
ENSG00000132849 PATJ 627407 sc-eQTL 1.23e-01 0.141 0.0914 0.242 MAIT L2
ENSG00000162604 TM2D1 644390 sc-eQTL 9.03e-01 0.0128 0.104 0.242 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 -66484 sc-eQTL 3.50e-01 0.101 0.108 0.242 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -997762 sc-eQTL 1.21e-01 0.173 0.111 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318573 sc-eQTL 1.37e-02 -0.237 0.0953 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C -414319 sc-eQTL 1.02e-01 -0.176 0.107 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000132849 PATJ 627407 sc-eQTL 1.72e-01 -0.144 0.105 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000162604 TM2D1 644390 sc-eQTL 7.67e-01 -0.032 0.108 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 -66484 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0119 0.116 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -997762 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0757 0.108 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318573 sc-eQTL 8.59e-02 -0.161 0.0935 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C -414319 sc-eQTL 3.36e-01 -0.092 0.0954 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000132849 PATJ 627407 sc-eQTL 3.60e-01 -0.095 0.104 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000162604 TM2D1 644390 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0665 0.0983 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 -66484 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0832 0.105 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -997762 sc-eQTL 5.44e-01 0.0764 0.126 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318573 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0464 0.0961 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C -414319 sc-eQTL 7.95e-01 0.029 0.112 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000132849 PATJ 627407 sc-eQTL 2.80e-01 -0.112 0.104 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000162604 TM2D1 644390 sc-eQTL 2.44e-01 0.137 0.118 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 -66484 sc-eQTL 5.37e-01 0.076 0.123 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -997762 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0805 0.105 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318573 sc-eQTL 2.45e-01 0.113 0.097 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C -414319 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0466 0.0995 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000132849 PATJ 627407 sc-eQTL 8.93e-01 0.0141 0.105 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000162604 TM2D1 644390 sc-eQTL 2.25e-01 -0.124 0.102 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 -66484 sc-eQTL 2.80e-01 0.117 0.108 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -997762 sc-eQTL 5.52e-01 0.0887 0.149 0.222 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318573 sc-eQTL 3.52e-01 0.148 0.159 0.222 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C -414319 sc-eQTL 2.31e-01 -0.166 0.138 0.222 PB L2
ENSG00000132849 PATJ 627407 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0308 0.144 0.222 PB L2
ENSG00000162604 TM2D1 644390 sc-eQTL 7.72e-01 0.0407 0.14 0.222 PB L2
ENSG00000162607 USP1 -66484 sc-eQTL 6.44e-01 0.0639 0.138 0.222 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -997762 sc-eQTL 7.19e-01 0.0378 0.105 0.241 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318573 sc-eQTL 7.49e-01 0.0338 0.105 0.241 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C -414319 sc-eQTL 3.62e-01 -0.084 0.092 0.241 Pro_T L2
ENSG00000132849 PATJ 627407 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0546 0.101 0.241 Pro_T L2
ENSG00000162604 TM2D1 644390 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0981 0.112 0.241 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 -66484 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0199 0.0636 0.241 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -997762 sc-eQTL 8.67e-01 0.0193 0.115 0.239 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318573 sc-eQTL 8.78e-02 -0.18 0.105 0.239 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C -414319 sc-eQTL 1.53e-01 0.154 0.107 0.239 Treg L2
ENSG00000132849 PATJ 627407 sc-eQTL 1.91e-01 0.13 0.0994 0.239 Treg L2
ENSG00000162604 TM2D1 644390 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0945 0.11 0.239 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 -66484 sc-eQTL 2.84e-01 0.117 0.109 0.239 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -997762 sc-eQTL 9.88e-01 0.00165 0.111 0.239 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318573 sc-eQTL 4.03e-02 -0.223 0.108 0.239 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C -414319 sc-eQTL 4.60e-01 -0.07 0.0945 0.239 cDC L2
ENSG00000162604 TM2D1 644390 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00708 0.118 0.239 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 -66484 sc-eQTL 2.27e-01 0.129 0.106 0.239 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -997762 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0714 0.101 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318573 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0822 0.106 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C -414319 sc-eQTL 2.97e-01 0.0782 0.0748 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000162604 TM2D1 644390 sc-eQTL 8.84e-01 0.0113 0.0773 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 -66484 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0186 0.0936 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 174964 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00901 0.0941 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -997762 sc-eQTL 2.71e-01 0.125 0.114 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318573 sc-eQTL 6.97e-01 0.0412 0.106 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C -414319 sc-eQTL 5.43e-01 0.0556 0.0913 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000162604 TM2D1 644390 sc-eQTL 8.46e-01 0.0181 0.0933 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 -66484 sc-eQTL 8.26e-01 0.0234 0.106 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 174964 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0596 0.0882 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -997762 sc-eQTL 2.16e-01 0.17 0.137 0.236 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318573 sc-eQTL 6.74e-01 0.0567 0.135 0.236 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C -414319 sc-eQTL 4.58e-01 0.0957 0.129 0.236 gdT L2
ENSG00000132849 PATJ 627407 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0418 0.126 0.236 gdT L2
ENSG00000162604 TM2D1 644390 sc-eQTL 1.31e-01 -0.199 0.131 0.236 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 -66484 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0255 0.129 0.236 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -997762 sc-eQTL 3.00e-01 -0.109 0.105 0.242 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318573 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0863 0.107 0.242 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C -414319 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0218 0.103 0.242 intMono L2
ENSG00000162604 TM2D1 644390 sc-eQTL 7.72e-01 0.0316 0.109 0.242 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 -66484 sc-eQTL 1.35e-01 0.172 0.114 0.242 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 174964 sc-eQTL 5.71e-01 0.048 0.0846 0.242 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -997762 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0301 0.111 0.238 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318573 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0574 0.109 0.238 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C -414319 sc-eQTL 1.39e-02 0.249 0.1 0.238 ncMono L2
ENSG00000162604 TM2D1 644390 sc-eQTL 5.66e-02 0.209 0.109 0.238 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 -66484 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00995 0.109 0.238 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 174964 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0385 0.0772 0.238 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -997762 sc-eQTL 8.13e-01 0.0281 0.118 0.243 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 -318573 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0279 0.121 0.243 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C -414319 sc-eQTL 6.87e-02 0.196 0.107 0.243 pDC L2
ENSG00000162604 TM2D1 644390 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0596 0.106 0.243 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 -66484 sc-eQTL 1.46e-01 0.18 0.123 0.243 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000088035 ALG6 -997762 sc-eQTL 9.05e-01 0.0137 0.115 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -318573 sc-eQTL 4.26e-01 0.0794 0.0996 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -414319 sc-eQTL 4.28e-01 0.064 0.0805 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 627407 sc-eQTL 6.83e-01 0.0365 0.0893 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 644390 sc-eQTL 3.44e-01 0.096 0.101 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 -66484 sc-eQTL 5.86e-01 0.056 0.103 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -997762 sc-eQTL 5.21e-03 0.311 0.11 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -318573 sc-eQTL 4.85e-01 0.0732 0.105 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -414319 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0642 0.0797 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 627407 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0222 0.0955 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 644390 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0842 0.091 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 -66484 sc-eQTL 5.54e-01 0.0575 0.0969 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -997762 sc-eQTL 7.73e-01 0.0291 0.101 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -318573 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0585 0.101 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -414319 sc-eQTL 2.52e-01 0.0802 0.0698 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 644390 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0121 0.073 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 -66484 sc-eQTL 7.28e-01 0.0308 0.0885 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 174964 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0828 0.0958 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -997762 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0785 0.112 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -318573 sc-eQTL 3.42e-01 -0.105 0.11 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -414319 sc-eQTL 1.84e-01 0.125 0.0938 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 644390 sc-eQTL 9.48e-02 0.184 0.109 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 -66484 sc-eQTL 2.62e-01 0.115 0.102 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 174964 sc-eQTL 6.48e-01 0.0321 0.0701 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -997762 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0693 0.0997 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -318573 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0551 0.0894 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -414319 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0975 0.089 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 627407 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00869 0.0962 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 644390 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0693 0.0881 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 -66484 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0128 0.0961 0.239 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116641 DOCK7 -318555 eQTL 0.607 0.0135 0.0263 0.00142 0.0 0.237

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina