Genes within 1Mb (chr1:62272988:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116641 DOCK7 -415398 sc-eQTL 1.47e-01 -0.17 0.117 0.128 B L1
ENSG00000125703 ATG4C -511144 sc-eQTL 8.16e-01 -0.019 0.0817 0.128 B L1
ENSG00000132849 PATJ 530582 sc-eQTL 2.93e-01 -0.104 0.0989 0.128 B L1
ENSG00000162604 TM2D1 547565 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00927 0.099 0.128 B L1
ENSG00000162607 USP1 -163309 sc-eQTL 8.63e-01 0.0195 0.113 0.128 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 -415398 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0543 0.11 0.128 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C -511144 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0319 0.0891 0.128 CD4T L1
ENSG00000132849 PATJ 530582 sc-eQTL 4.85e-01 0.0506 0.0722 0.128 CD4T L1
ENSG00000162604 TM2D1 547565 sc-eQTL 4.60e-01 0.065 0.0878 0.128 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 -163309 sc-eQTL 6.60e-01 0.0381 0.0864 0.128 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -415398 sc-eQTL 1.25e-02 0.297 0.118 0.128 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C -511144 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0547 0.114 0.128 CD8T L1
ENSG00000132849 PATJ 530582 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0214 0.0693 0.128 CD8T L1
ENSG00000162604 TM2D1 547565 sc-eQTL 2.53e-01 0.119 0.104 0.128 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 -163309 sc-eQTL 9.18e-01 0.0102 0.099 0.128 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -415398 sc-eQTL 7.68e-01 0.0373 0.126 0.126 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C -511144 sc-eQTL 3.42e-01 0.094 0.0987 0.126 DC L1
ENSG00000162604 TM2D1 547565 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0421 0.115 0.126 DC L1
ENSG00000162607 USP1 -163309 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0244 0.121 0.126 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 -415398 sc-eQTL 7.83e-01 0.0331 0.12 0.128 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C -511144 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0125 0.081 0.128 Mono L1
ENSG00000162604 TM2D1 547565 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0055 0.0899 0.128 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 -163309 sc-eQTL 2.73e-01 0.115 0.105 0.128 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 78139 sc-eQTL 3.90e-03 0.281 0.0962 0.128 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 -415398 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0495 0.097 0.129 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C -511144 sc-eQTL 7.65e-01 0.0312 0.104 0.129 NK L1
ENSG00000132849 PATJ 530582 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0678 0.102 0.129 NK L1
ENSG00000162604 TM2D1 547565 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0539 0.105 0.129 NK L1
ENSG00000162607 USP1 -163309 sc-eQTL 6.93e-02 0.21 0.115 0.129 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 -415398 sc-eQTL 2.58e-01 0.132 0.116 0.128 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C -511144 sc-eQTL 4.99e-02 0.197 0.0999 0.128 Other_T L1
ENSG00000132849 PATJ 530582 sc-eQTL 8.22e-01 0.0212 0.0939 0.128 Other_T L1
ENSG00000162604 TM2D1 547565 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0682 0.11 0.128 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 -163309 sc-eQTL 2.92e-03 0.228 0.0759 0.128 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116641 DOCK7 -415398 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0373 0.14 0.13 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C -511144 sc-eQTL 6.21e-01 0.0728 0.147 0.13 B_Activated L2
ENSG00000132849 PATJ 530582 sc-eQTL 1.14e-01 -0.197 0.124 0.13 B_Activated L2
ENSG00000162604 TM2D1 547565 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0362 0.159 0.13 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 -163309 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0544 0.156 0.13 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415398 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0139 0.132 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C -511144 sc-eQTL 2.04e-01 0.142 0.112 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000132849 PATJ 530582 sc-eQTL 9.65e-01 -0.0054 0.121 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000162604 TM2D1 547565 sc-eQTL 8.84e-02 -0.217 0.127 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 -163309 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0302 0.133 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415398 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0891 0.127 0.127 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C -511144 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00927 0.121 0.127 B_Memory L2
ENSG00000132849 PATJ 530582 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0552 0.121 0.127 B_Memory L2
ENSG00000162604 TM2D1 547565 sc-eQTL 8.02e-02 -0.237 0.135 0.127 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 -163309 sc-eQTL 3.19e-01 -0.139 0.139 0.127 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415398 sc-eQTL 1.66e-01 -0.181 0.13 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C -511144 sc-eQTL 9.53e-01 0.00593 0.1 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000132849 PATJ 530582 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0888 0.129 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000162604 TM2D1 547565 sc-eQTL 4.38e-01 0.0921 0.119 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 -163309 sc-eQTL 3.82e-02 0.242 0.116 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415398 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0152 0.133 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C -511144 sc-eQTL 2.69e-01 -0.141 0.128 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000132849 PATJ 530582 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0839 0.131 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000162604 TM2D1 547565 sc-eQTL 5.07e-01 -0.088 0.133 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 -163309 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0583 0.132 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415398 sc-eQTL 2.63e-01 -0.139 0.123 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C -511144 sc-eQTL 3.41e-01 0.122 0.128 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000132849 PATJ 530582 sc-eQTL 2.56e-01 0.117 0.102 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000162604 TM2D1 547565 sc-eQTL 2.03e-01 -0.167 0.131 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 -163309 sc-eQTL 3.67e-01 0.118 0.13 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415398 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0479 0.118 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C -511144 sc-eQTL 5.41e-01 0.064 0.104 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000132849 PATJ 530582 sc-eQTL 1.69e-01 0.101 0.073 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000162604 TM2D1 547565 sc-eQTL 9.79e-02 0.174 0.105 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 -163309 sc-eQTL 7.13e-01 -0.036 0.0975 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415398 sc-eQTL 5.64e-01 0.0687 0.119 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C -511144 sc-eQTL 1.83e-01 -0.154 0.115 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000132849 PATJ 530582 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0664 0.0927 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000162604 TM2D1 547565 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0313 0.108 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 -163309 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0334 0.112 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415398 sc-eQTL 3.52e-01 -0.123 0.132 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C -511144 sc-eQTL 2.29e-01 -0.155 0.128 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000132849 PATJ 530582 sc-eQTL 2.48e-01 -0.139 0.12 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000162604 TM2D1 547565 sc-eQTL 1.33e-01 0.19 0.126 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 -163309 sc-eQTL 1.41e-01 0.185 0.125 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415398 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0408 0.124 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C -511144 sc-eQTL 6.76e-01 0.055 0.132 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000132849 PATJ 530582 sc-eQTL 8.09e-01 0.0302 0.125 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000162604 TM2D1 547565 sc-eQTL 2.88e-01 0.122 0.114 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 -163309 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0275 0.123 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415398 sc-eQTL 6.38e-02 0.246 0.132 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C -511144 sc-eQTL 9.31e-01 0.011 0.128 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000132849 PATJ 530582 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00772 0.0978 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000162604 TM2D1 547565 sc-eQTL 1.14e-01 0.189 0.119 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 -163309 sc-eQTL 9.82e-01 0.00254 0.109 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415398 sc-eQTL 4.46e-01 0.104 0.137 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C -511144 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00953 0.14 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000132849 PATJ 530582 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0238 0.129 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000162604 TM2D1 547565 sc-eQTL 3.81e-01 -0.115 0.131 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 -163309 sc-eQTL 3.70e-01 -0.117 0.131 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415398 sc-eQTL 3.13e-01 0.134 0.132 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C -511144 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0292 0.127 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000132849 PATJ 530582 sc-eQTL 3.32e-01 -0.125 0.129 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000162604 TM2D1 547565 sc-eQTL 7.27e-01 0.0459 0.131 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 -163309 sc-eQTL 2.10e-01 0.165 0.131 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415398 sc-eQTL 4.25e-01 0.0996 0.125 0.13 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C -511144 sc-eQTL 1.69e-01 0.181 0.131 0.13 MAIT L2
ENSG00000132849 PATJ 530582 sc-eQTL 7.00e-01 0.043 0.111 0.13 MAIT L2
ENSG00000162604 TM2D1 547565 sc-eQTL 9.67e-01 0.00532 0.127 0.13 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 -163309 sc-eQTL 6.92e-01 0.052 0.131 0.13 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415398 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0199 0.117 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C -511144 sc-eQTL 2.60e-01 -0.147 0.13 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000132849 PATJ 530582 sc-eQTL 3.41e-01 -0.122 0.128 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000162604 TM2D1 547565 sc-eQTL 9.17e-01 0.0136 0.13 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 -163309 sc-eQTL 2.76e-02 0.308 0.139 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415398 sc-eQTL 1.80e-01 -0.155 0.115 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C -511144 sc-eQTL 1.99e-01 -0.151 0.117 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000132849 PATJ 530582 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0223 0.128 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000162604 TM2D1 547565 sc-eQTL 4.81e-01 0.0854 0.121 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 -163309 sc-eQTL 1.21e-01 0.201 0.129 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415398 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0395 0.112 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C -511144 sc-eQTL 8.94e-02 0.22 0.129 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000132849 PATJ 530582 sc-eQTL 4.92e-01 -0.083 0.121 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000162604 TM2D1 547565 sc-eQTL 1.99e-02 -0.318 0.135 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 -163309 sc-eQTL 4.80e-04 0.492 0.138 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415398 sc-eQTL 9.12e-01 0.0135 0.122 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C -511144 sc-eQTL 2.55e-01 0.142 0.125 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000132849 PATJ 530582 sc-eQTL 2.17e-01 -0.163 0.132 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000162604 TM2D1 547565 sc-eQTL 2.78e-01 -0.14 0.129 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 -163309 sc-eQTL 8.62e-01 0.0237 0.136 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415398 sc-eQTL 5.56e-01 -0.102 0.173 0.144 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C -511144 sc-eQTL 3.02e-01 -0.156 0.151 0.144 PB L2
ENSG00000132849 PATJ 530582 sc-eQTL 2.50e-01 -0.181 0.156 0.144 PB L2
ENSG00000162604 TM2D1 547565 sc-eQTL 7.12e-02 -0.274 0.15 0.144 PB L2
ENSG00000162607 USP1 -163309 sc-eQTL 4.81e-01 0.106 0.15 0.144 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415398 sc-eQTL 9.96e-01 0.000657 0.129 0.126 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C -511144 sc-eQTL 6.70e-01 0.0482 0.113 0.126 Pro_T L2
ENSG00000132849 PATJ 530582 sc-eQTL 3.74e-02 -0.255 0.122 0.126 Pro_T L2
ENSG00000162604 TM2D1 547565 sc-eQTL 2.37e-02 -0.311 0.136 0.126 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 -163309 sc-eQTL 2.80e-01 0.084 0.0776 0.126 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415398 sc-eQTL 1.00e+00 -5.7e-05 0.128 0.128 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C -511144 sc-eQTL 4.95e-01 0.0892 0.13 0.128 Treg L2
ENSG00000132849 PATJ 530582 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0154 0.121 0.128 Treg L2
ENSG00000162604 TM2D1 547565 sc-eQTL 2.81e-01 -0.144 0.133 0.128 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 -163309 sc-eQTL 1.13e-03 0.425 0.129 0.128 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415398 sc-eQTL 5.61e-01 -0.076 0.131 0.122 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C -511144 sc-eQTL 2.11e-01 0.142 0.113 0.122 cDC L2
ENSG00000162604 TM2D1 547565 sc-eQTL 9.37e-01 0.0112 0.142 0.122 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 -163309 sc-eQTL 9.15e-01 0.0137 0.128 0.122 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415398 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0153 0.129 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C -511144 sc-eQTL 6.38e-02 0.168 0.0899 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000162604 TM2D1 547565 sc-eQTL 4.55e-01 0.0699 0.0934 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 -163309 sc-eQTL 5.56e-01 0.0667 0.113 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 78139 sc-eQTL 4.70e-02 0.225 0.113 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415398 sc-eQTL 7.76e-01 0.0364 0.127 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C -511144 sc-eQTL 3.22e-01 -0.109 0.11 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000162604 TM2D1 547565 sc-eQTL 2.98e-01 -0.117 0.112 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 -163309 sc-eQTL 3.47e-01 0.12 0.128 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 78139 sc-eQTL 1.84e-01 0.142 0.106 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415398 sc-eQTL 3.79e-01 -0.14 0.159 0.121 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C -511144 sc-eQTL 6.89e-01 -0.061 0.152 0.121 gdT L2
ENSG00000132849 PATJ 530582 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0227 0.149 0.121 gdT L2
ENSG00000162604 TM2D1 547565 sc-eQTL 6.92e-01 0.0621 0.157 0.121 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 -163309 sc-eQTL 3.39e-01 0.146 0.153 0.121 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415398 sc-eQTL 2.51e-01 0.151 0.131 0.124 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C -511144 sc-eQTL 2.06e-01 -0.159 0.125 0.124 intMono L2
ENSG00000162604 TM2D1 547565 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0626 0.133 0.124 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 -163309 sc-eQTL 1.08e-01 -0.226 0.14 0.124 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 78139 sc-eQTL 1.58e-02 0.248 0.102 0.124 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415398 sc-eQTL 7.55e-01 0.0426 0.137 0.124 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C -511144 sc-eQTL 6.87e-01 0.0515 0.128 0.124 ncMono L2
ENSG00000162604 TM2D1 547565 sc-eQTL 9.88e-01 0.00208 0.138 0.124 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 -163309 sc-eQTL 1.20e-01 0.212 0.136 0.124 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 78139 sc-eQTL 1.12e-01 0.154 0.0962 0.124 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415398 sc-eQTL 9.32e-02 0.257 0.152 0.113 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C -511144 sc-eQTL 4.66e-01 0.1 0.137 0.113 pDC L2
ENSG00000162604 TM2D1 547565 sc-eQTL 7.52e-01 0.0426 0.135 0.113 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 -163309 sc-eQTL 6.62e-01 0.0689 0.157 0.113 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116641 DOCK7 -415398 sc-eQTL 8.90e-01 0.0169 0.122 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -511144 sc-eQTL 2.68e-01 0.109 0.0984 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 530582 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0582 0.109 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 547565 sc-eQTL 5.27e-02 -0.24 0.123 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 -163309 sc-eQTL 1.39e-01 -0.186 0.125 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -415398 sc-eQTL 2.79e-01 -0.138 0.127 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -511144 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0754 0.0968 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 530582 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0935 0.116 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 547565 sc-eQTL 7.16e-01 0.0403 0.111 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 -163309 sc-eQTL 1.25e-01 0.18 0.117 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -415398 sc-eQTL 8.21e-01 0.0275 0.121 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -511144 sc-eQTL 8.08e-01 0.0204 0.0838 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 547565 sc-eQTL 8.44e-01 0.0172 0.0874 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 -163309 sc-eQTL 2.13e-01 0.132 0.106 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 78139 sc-eQTL 5.36e-03 0.317 0.113 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -415398 sc-eQTL 6.12e-01 0.0693 0.136 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -511144 sc-eQTL 5.70e-01 -0.066 0.116 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 547565 sc-eQTL 9.78e-01 0.00384 0.136 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 -163309 sc-eQTL 9.99e-01 0.000212 0.127 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 78139 sc-eQTL 7.86e-02 0.152 0.0858 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -415398 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0449 0.11 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -511144 sc-eQTL 8.25e-01 0.0244 0.11 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 530582 sc-eQTL 2.85e-01 -0.127 0.118 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 547565 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0725 0.109 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 -163309 sc-eQTL 1.76e-01 0.16 0.118 0.129 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000240563 L1TD1 78139 eQTL 9.09e-12 0.371 0.0537 0.0785 0.076 0.125


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000240563 L1TD1 78139 1.18e-05 1.4e-05 1.36e-06 7.07e-06 2.39e-06 5.16e-06 1.28e-05 2.19e-06 1.07e-05 5.4e-06 1.43e-05 5.9e-06 1.82e-05 4.08e-06 2.94e-06 6.69e-06 5.57e-06 8.13e-06 2.74e-06 2.78e-06 5.45e-06 1.08e-05 9.7e-06 3.35e-06 2.06e-05 3.91e-06 5.93e-06 4.58e-06 1.12e-05 8.58e-06 7.54e-06 9.96e-07 1.09e-06 2.97e-06 4.89e-06 2.07e-06 1.61e-06 1.97e-06 1.79e-06 9.77e-07 7.83e-07 1.54e-05 1.59e-06 1.32e-07 6.87e-07 1.67e-06 1.28e-06 7.58e-07 5.77e-07