Genes within 1Mb (chr1:62272883:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116641 DOCK7 -415503 sc-eQTL 1.80e-01 -0.158 0.118 0.13 B L1
ENSG00000125703 ATG4C -511249 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0305 0.082 0.13 B L1
ENSG00000132849 PATJ 530477 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0812 0.0994 0.13 B L1
ENSG00000162604 TM2D1 547460 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00152 0.0995 0.13 B L1
ENSG00000162607 USP1 -163414 sc-eQTL 6.58e-01 0.0503 0.113 0.13 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 -415503 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0807 0.109 0.13 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C -511249 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0204 0.0885 0.13 CD4T L1
ENSG00000132849 PATJ 530477 sc-eQTL 6.35e-01 0.0341 0.0718 0.13 CD4T L1
ENSG00000162604 TM2D1 547460 sc-eQTL 6.03e-01 0.0455 0.0872 0.13 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 -163414 sc-eQTL 9.22e-01 0.00841 0.0859 0.13 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -415503 sc-eQTL 8.07e-03 0.313 0.117 0.13 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C -511249 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0354 0.113 0.13 CD8T L1
ENSG00000132849 PATJ 530477 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0263 0.069 0.13 CD8T L1
ENSG00000162604 TM2D1 547460 sc-eQTL 3.89e-01 0.0893 0.103 0.13 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 -163414 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0351 0.0986 0.13 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -415503 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00638 0.126 0.128 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C -511249 sc-eQTL 3.89e-01 0.0852 0.0987 0.128 DC L1
ENSG00000162604 TM2D1 547460 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0579 0.115 0.128 DC L1
ENSG00000162607 USP1 -163414 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0199 0.121 0.128 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 -415503 sc-eQTL 7.76e-01 0.0341 0.12 0.13 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C -511249 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00113 0.0809 0.13 Mono L1
ENSG00000162604 TM2D1 547460 sc-eQTL 1.00e+00 -1.92e-05 0.0898 0.13 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 -163414 sc-eQTL 3.58e-01 0.0966 0.105 0.13 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 78034 sc-eQTL 3.32e-03 0.285 0.096 0.13 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 -415503 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0546 0.0964 0.131 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C -511249 sc-eQTL 8.03e-01 0.0259 0.104 0.131 NK L1
ENSG00000132849 PATJ 530477 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0518 0.102 0.131 NK L1
ENSG00000162604 TM2D1 547460 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0503 0.104 0.131 NK L1
ENSG00000162607 USP1 -163414 sc-eQTL 6.13e-02 0.215 0.114 0.131 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 -415503 sc-eQTL 2.09e-01 0.145 0.115 0.13 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C -511249 sc-eQTL 9.25e-02 0.168 0.0996 0.13 Other_T L1
ENSG00000132849 PATJ 530477 sc-eQTL 9.68e-01 0.00379 0.0934 0.13 Other_T L1
ENSG00000162604 TM2D1 547460 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0701 0.109 0.13 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 -163414 sc-eQTL 4.71e-03 0.216 0.0756 0.13 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116641 DOCK7 -415503 sc-eQTL 6.57e-01 -0.062 0.139 0.133 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C -511249 sc-eQTL 5.98e-01 0.0775 0.147 0.133 B_Activated L2
ENSG00000132849 PATJ 530477 sc-eQTL 1.05e-01 -0.201 0.124 0.133 B_Activated L2
ENSG00000162604 TM2D1 547460 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0144 0.158 0.133 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 -163414 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0535 0.155 0.133 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415503 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00195 0.132 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C -511249 sc-eQTL 2.29e-01 0.134 0.111 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000132849 PATJ 530477 sc-eQTL 9.78e-01 0.00333 0.121 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000162604 TM2D1 547460 sc-eQTL 1.08e-01 -0.204 0.126 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 -163414 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0205 0.133 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415503 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0891 0.127 0.127 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C -511249 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00927 0.121 0.127 B_Memory L2
ENSG00000132849 PATJ 530477 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0552 0.121 0.127 B_Memory L2
ENSG00000162604 TM2D1 547460 sc-eQTL 8.02e-02 -0.237 0.135 0.127 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 -163414 sc-eQTL 3.19e-01 -0.139 0.139 0.127 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415503 sc-eQTL 1.83e-01 -0.173 0.13 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C -511249 sc-eQTL 9.45e-01 0.00688 0.1 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000132849 PATJ 530477 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0781 0.129 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000162604 TM2D1 547460 sc-eQTL 4.13e-01 0.0972 0.118 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 -163414 sc-eQTL 3.73e-02 0.243 0.116 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415503 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0152 0.133 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C -511249 sc-eQTL 2.69e-01 -0.141 0.128 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000132849 PATJ 530477 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0839 0.131 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000162604 TM2D1 547460 sc-eQTL 5.07e-01 -0.088 0.133 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 -163414 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0583 0.132 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415503 sc-eQTL 3.26e-01 -0.121 0.123 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C -511249 sc-eQTL 2.90e-01 0.135 0.127 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000132849 PATJ 530477 sc-eQTL 2.97e-01 0.106 0.102 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000162604 TM2D1 547460 sc-eQTL 1.88e-01 -0.172 0.13 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 -163414 sc-eQTL 4.06e-01 0.108 0.129 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415503 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0801 0.117 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C -511249 sc-eQTL 5.90e-01 0.056 0.104 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000132849 PATJ 530477 sc-eQTL 2.58e-01 0.0825 0.0727 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000162604 TM2D1 547460 sc-eQTL 1.36e-01 0.156 0.104 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 -163414 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0955 0.0968 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415503 sc-eQTL 6.31e-01 0.0567 0.118 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C -511249 sc-eQTL 2.29e-01 -0.138 0.114 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000132849 PATJ 530477 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0544 0.092 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000162604 TM2D1 547460 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0331 0.107 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 -163414 sc-eQTL 7.25e-01 -0.039 0.111 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415503 sc-eQTL 3.70e-01 -0.118 0.132 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C -511249 sc-eQTL 2.46e-01 -0.149 0.128 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000132849 PATJ 530477 sc-eQTL 2.57e-01 -0.135 0.119 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000162604 TM2D1 547460 sc-eQTL 1.29e-01 0.191 0.125 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 -163414 sc-eQTL 1.52e-01 0.179 0.125 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415503 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0207 0.123 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C -511249 sc-eQTL 5.84e-01 0.0716 0.131 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000132849 PATJ 530477 sc-eQTL 8.48e-01 0.0237 0.124 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000162604 TM2D1 547460 sc-eQTL 3.18e-01 0.113 0.113 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 -163414 sc-eQTL 6.40e-01 -0.057 0.122 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415503 sc-eQTL 6.28e-02 0.246 0.132 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C -511249 sc-eQTL 8.13e-01 0.0302 0.127 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000132849 PATJ 530477 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0375 0.0974 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000162604 TM2D1 547460 sc-eQTL 1.25e-01 0.182 0.118 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 -163414 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0544 0.109 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415503 sc-eQTL 4.46e-01 0.104 0.137 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C -511249 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00953 0.14 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000132849 PATJ 530477 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0238 0.129 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000162604 TM2D1 547460 sc-eQTL 3.81e-01 -0.115 0.131 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 -163414 sc-eQTL 3.70e-01 -0.117 0.131 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415503 sc-eQTL 2.87e-01 0.141 0.132 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C -511249 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0285 0.127 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000132849 PATJ 530477 sc-eQTL 3.15e-01 -0.129 0.128 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000162604 TM2D1 547460 sc-eQTL 8.35e-01 0.0273 0.131 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 -163414 sc-eQTL 2.69e-01 0.145 0.131 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415503 sc-eQTL 3.41e-01 0.118 0.124 0.132 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C -511249 sc-eQTL 2.00e-01 0.168 0.13 0.132 MAIT L2
ENSG00000132849 PATJ 530477 sc-eQTL 6.68e-01 0.0476 0.111 0.132 MAIT L2
ENSG00000162604 TM2D1 547460 sc-eQTL 9.10e-01 0.0143 0.126 0.132 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 -163414 sc-eQTL 7.35e-01 0.0441 0.13 0.132 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415503 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00342 0.116 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C -511249 sc-eQTL 2.51e-01 -0.149 0.129 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000132849 PATJ 530477 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0991 0.127 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000162604 TM2D1 547460 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0233 0.129 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 -163414 sc-eQTL 2.45e-02 0.312 0.138 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415503 sc-eQTL 1.38e-01 -0.17 0.115 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C -511249 sc-eQTL 1.63e-01 -0.163 0.116 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000132849 PATJ 530477 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0106 0.127 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000162604 TM2D1 547460 sc-eQTL 4.47e-01 0.0917 0.12 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 -163414 sc-eQTL 1.18e-01 0.202 0.128 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415503 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0174 0.112 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C -511249 sc-eQTL 1.02e-01 0.212 0.129 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000132849 PATJ 530477 sc-eQTL 3.73e-01 -0.108 0.12 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000162604 TM2D1 547460 sc-eQTL 3.35e-02 -0.29 0.135 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 -163414 sc-eQTL 6.90e-04 0.478 0.139 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415503 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00694 0.122 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C -511249 sc-eQTL 2.97e-01 0.13 0.124 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000132849 PATJ 530477 sc-eQTL 1.84e-01 -0.174 0.131 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000162604 TM2D1 547460 sc-eQTL 3.15e-01 -0.129 0.128 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 -163414 sc-eQTL 8.98e-01 0.0173 0.135 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415503 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00711 0.173 0.148 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C -511249 sc-eQTL 2.13e-01 -0.188 0.15 0.148 PB L2
ENSG00000132849 PATJ 530477 sc-eQTL 2.42e-01 -0.184 0.156 0.148 PB L2
ENSG00000162604 TM2D1 547460 sc-eQTL 8.11e-02 -0.265 0.15 0.148 PB L2
ENSG00000162607 USP1 -163414 sc-eQTL 2.09e-01 0.188 0.149 0.148 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415503 sc-eQTL 9.05e-01 0.0153 0.128 0.128 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C -511249 sc-eQTL 7.15e-01 0.041 0.112 0.128 Pro_T L2
ENSG00000132849 PATJ 530477 sc-eQTL 3.33e-02 -0.259 0.121 0.128 Pro_T L2
ENSG00000162604 TM2D1 547460 sc-eQTL 2.18e-02 -0.312 0.135 0.128 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 -163414 sc-eQTL 2.98e-01 0.0803 0.0769 0.128 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415503 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00401 0.128 0.13 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C -511249 sc-eQTL 4.96e-01 0.089 0.13 0.13 Treg L2
ENSG00000132849 PATJ 530477 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0136 0.121 0.13 Treg L2
ENSG00000162604 TM2D1 547460 sc-eQTL 2.83e-01 -0.143 0.133 0.13 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 -163414 sc-eQTL 9.97e-04 0.43 0.129 0.13 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415503 sc-eQTL 4.90e-01 -0.09 0.13 0.124 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C -511249 sc-eQTL 2.46e-01 0.131 0.113 0.124 cDC L2
ENSG00000162604 TM2D1 547460 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0207 0.141 0.124 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 -163414 sc-eQTL 9.58e-01 0.00672 0.128 0.124 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415503 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0431 0.128 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C -511249 sc-eQTL 5.98e-02 0.169 0.0893 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000162604 TM2D1 547460 sc-eQTL 4.44e-01 0.0711 0.0928 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 -163414 sc-eQTL 5.59e-01 0.0658 0.112 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 78034 sc-eQTL 2.91e-02 0.246 0.112 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415503 sc-eQTL 5.55e-01 0.0747 0.127 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C -511249 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0913 0.109 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000162604 TM2D1 547460 sc-eQTL 3.53e-01 -0.104 0.112 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 -163414 sc-eQTL 3.54e-01 0.118 0.127 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 78034 sc-eQTL 1.26e-01 0.162 0.105 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415503 sc-eQTL 3.79e-01 -0.14 0.159 0.121 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C -511249 sc-eQTL 6.89e-01 -0.061 0.152 0.121 gdT L2
ENSG00000132849 PATJ 530477 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0227 0.149 0.121 gdT L2
ENSG00000162604 TM2D1 547460 sc-eQTL 6.92e-01 0.0621 0.157 0.121 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 -163414 sc-eQTL 3.39e-01 0.146 0.153 0.121 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415503 sc-eQTL 3.06e-01 0.134 0.13 0.127 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C -511249 sc-eQTL 2.38e-01 -0.147 0.124 0.127 intMono L2
ENSG00000162604 TM2D1 547460 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0689 0.132 0.127 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 -163414 sc-eQTL 1.08e-01 -0.224 0.139 0.127 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 78034 sc-eQTL 1.94e-02 0.239 0.101 0.127 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415503 sc-eQTL 5.76e-01 0.0759 0.135 0.127 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C -511249 sc-eQTL 8.13e-01 0.0301 0.127 0.127 ncMono L2
ENSG00000162604 TM2D1 547460 sc-eQTL 9.06e-01 0.0162 0.137 0.127 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 -163414 sc-eQTL 2.34e-01 0.161 0.135 0.127 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 78034 sc-eQTL 9.33e-02 0.161 0.0953 0.127 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 -415503 sc-eQTL 9.32e-02 0.257 0.152 0.113 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C -511249 sc-eQTL 4.66e-01 0.1 0.137 0.113 pDC L2
ENSG00000162604 TM2D1 547460 sc-eQTL 7.52e-01 0.0426 0.135 0.113 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 -163414 sc-eQTL 6.62e-01 0.0689 0.157 0.113 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116641 DOCK7 -415503 sc-eQTL 7.49e-01 0.0389 0.122 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -511249 sc-eQTL 2.95e-01 0.103 0.098 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 530477 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0519 0.109 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 547460 sc-eQTL 1.09e-01 -0.197 0.123 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 -163414 sc-eQTL 1.60e-01 -0.176 0.125 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -415503 sc-eQTL 2.83e-01 -0.137 0.127 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -511249 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0732 0.0969 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 530477 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0878 0.116 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 547460 sc-eQTL 6.66e-01 0.0478 0.111 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 -163414 sc-eQTL 1.23e-01 0.181 0.117 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -415503 sc-eQTL 8.10e-01 0.029 0.12 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -511249 sc-eQTL 7.05e-01 0.0315 0.0832 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 547460 sc-eQTL 7.94e-01 0.0227 0.0868 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 -163414 sc-eQTL 2.19e-01 0.129 0.105 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 78034 sc-eQTL 2.94e-03 0.336 0.112 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -415503 sc-eQTL 5.92e-01 0.0728 0.136 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -511249 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0675 0.116 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 547460 sc-eQTL 8.73e-01 0.0217 0.135 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 -163414 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0357 0.126 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 78034 sc-eQTL 7.42e-02 0.153 0.0854 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -415503 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0593 0.109 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -511249 sc-eQTL 8.75e-01 0.0172 0.109 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 530477 sc-eQTL 2.76e-01 -0.128 0.117 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 547460 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0568 0.108 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 -163414 sc-eQTL 1.58e-01 0.166 0.117 0.131 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000240563 L1TD1 78034 eQTL 1.57e-11 0.363 0.0532 0.00383 0.00513 0.129


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000240563 L1TD1 78034 4.53e-06 5.64e-06 7.09e-07 3.09e-06 1.51e-06 1.66e-06 5.25e-06 9.6e-07 5.07e-06 2.48e-06 6.14e-06 3.25e-06 7.51e-06 1.76e-06 1.33e-06 3.81e-06 1.92e-06 3.8e-06 1.55e-06 1.15e-06 2.78e-06 4.78e-06 4.49e-06 1.39e-06 7.68e-06 2e-06 2.47e-06 1.6e-06 4.44e-06 4.97e-06 2.83e-06 5.4e-07 5.2e-07 1.46e-06 1.98e-06 1.13e-06 9.44e-07 4.36e-07 8.5e-07 5.01e-07 4.96e-07 6.52e-06 3.47e-07 1.58e-07 5.95e-07 7.95e-07 9.63e-07 5.52e-07 4.54e-07