Genes within 1Mb (chr1:62201077:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116641 DOCK7 -487309 sc-eQTL 1.01e-01 0.224 0.136 0.092 B L1
ENSG00000125703 ATG4C -583055 sc-eQTL 8.15e-01 0.0222 0.0951 0.092 B L1
ENSG00000132849 PATJ 458671 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0317 0.115 0.092 B L1
ENSG00000162604 TM2D1 475654 sc-eQTL 1.02e-01 -0.188 0.114 0.092 B L1
ENSG00000162607 USP1 -235220 sc-eQTL 6.41e-02 0.242 0.13 0.092 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 -487309 sc-eQTL 3.40e-01 -0.121 0.127 0.092 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C -583055 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0866 0.102 0.092 CD4T L1
ENSG00000132849 PATJ 458671 sc-eQTL 6.41e-01 0.0388 0.0831 0.092 CD4T L1
ENSG00000162604 TM2D1 475654 sc-eQTL 4.26e-01 0.0805 0.101 0.092 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 -235220 sc-eQTL 3.60e-01 0.0911 0.0992 0.092 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -487309 sc-eQTL 3.92e-01 0.12 0.14 0.092 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C -583055 sc-eQTL 4.95e-02 -0.261 0.132 0.092 CD8T L1
ENSG00000132849 PATJ 458671 sc-eQTL 2.76e-01 0.0884 0.0809 0.092 CD8T L1
ENSG00000162604 TM2D1 475654 sc-eQTL 3.38e-01 0.117 0.122 0.092 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 -235220 sc-eQTL 6.86e-01 0.0469 0.116 0.092 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 -487309 sc-eQTL 2.61e-01 -0.165 0.146 0.097 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C -583055 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0895 0.114 0.097 DC L1
ENSG00000162604 TM2D1 475654 sc-eQTL 6.54e-01 0.06 0.133 0.097 DC L1
ENSG00000162607 USP1 -235220 sc-eQTL 4.31e-01 0.11 0.14 0.097 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 -487309 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0682 0.138 0.092 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C -583055 sc-eQTL 3.32e-02 0.198 0.0925 0.092 Mono L1
ENSG00000162604 TM2D1 475654 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0998 0.104 0.092 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 -235220 sc-eQTL 3.66e-01 0.11 0.121 0.092 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 6228 sc-eQTL 7.73e-03 -0.299 0.111 0.092 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 -487309 sc-eQTL 6.90e-01 -0.045 0.113 0.092 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C -583055 sc-eQTL 9.97e-01 0.000386 0.121 0.092 NK L1
ENSG00000132849 PATJ 458671 sc-eQTL 7.77e-02 -0.209 0.118 0.092 NK L1
ENSG00000162604 TM2D1 475654 sc-eQTL 7.52e-01 0.0384 0.121 0.092 NK L1
ENSG00000162607 USP1 -235220 sc-eQTL 4.24e-01 0.108 0.134 0.092 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 -487309 sc-eQTL 9.68e-01 0.0055 0.136 0.092 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C -583055 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0405 0.118 0.092 Other_T L1
ENSG00000132849 PATJ 458671 sc-eQTL 8.48e-01 0.0211 0.11 0.092 Other_T L1
ENSG00000162604 TM2D1 475654 sc-eQTL 4.32e-01 0.101 0.129 0.092 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 -235220 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0679 0.0906 0.092 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116641 DOCK7 -487309 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0168 0.165 0.097 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C -583055 sc-eQTL 1.29e-01 0.262 0.172 0.097 B_Activated L2
ENSG00000132849 PATJ 458671 sc-eQTL 2.09e-01 0.185 0.147 0.097 B_Activated L2
ENSG00000162604 TM2D1 475654 sc-eQTL 2.12e-01 -0.233 0.186 0.097 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 -235220 sc-eQTL 7.07e-01 0.0689 0.183 0.097 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 -487309 sc-eQTL 1.54e-01 0.217 0.152 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C -583055 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0196 0.129 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000132849 PATJ 458671 sc-eQTL 3.27e-01 -0.137 0.139 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000162604 TM2D1 475654 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0738 0.147 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 -235220 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00332 0.154 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 -487309 sc-eQTL 6.91e-01 0.0592 0.149 0.093 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C -583055 sc-eQTL 2.82e-01 0.152 0.141 0.093 B_Memory L2
ENSG00000132849 PATJ 458671 sc-eQTL 6.79e-01 0.0585 0.141 0.093 B_Memory L2
ENSG00000162604 TM2D1 475654 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0565 0.159 0.093 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 -235220 sc-eQTL 1.62e-01 -0.228 0.163 0.093 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 -487309 sc-eQTL 3.23e-01 0.149 0.15 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C -583055 sc-eQTL 7.26e-01 0.0408 0.116 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000132849 PATJ 458671 sc-eQTL 8.11e-01 0.0357 0.149 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000162604 TM2D1 475654 sc-eQTL 2.35e-02 -0.309 0.135 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 -235220 sc-eQTL 6.20e-02 0.252 0.134 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 -487309 sc-eQTL 4.54e-01 0.116 0.154 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C -583055 sc-eQTL 8.18e-01 0.0343 0.149 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000132849 PATJ 458671 sc-eQTL 4.56e-01 0.113 0.152 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000162604 TM2D1 475654 sc-eQTL 1.06e-01 0.248 0.153 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 -235220 sc-eQTL 4.21e-02 0.311 0.152 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 -487309 sc-eQTL 1.72e-01 0.2 0.146 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C -583055 sc-eQTL 4.48e-02 -0.302 0.15 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000132849 PATJ 458671 sc-eQTL 4.43e-01 -0.093 0.121 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000162604 TM2D1 475654 sc-eQTL 4.33e-01 0.122 0.155 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 -235220 sc-eQTL 2.21e-01 -0.188 0.153 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 -487309 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0859 0.136 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C -583055 sc-eQTL 3.16e-01 -0.121 0.12 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000132849 PATJ 458671 sc-eQTL 5.62e-01 0.049 0.0844 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000162604 TM2D1 475654 sc-eQTL 3.40e-01 0.116 0.121 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 -235220 sc-eQTL 3.22e-01 0.111 0.112 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 -487309 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0948 0.136 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C -583055 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0204 0.132 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000132849 PATJ 458671 sc-eQTL 3.34e-01 0.103 0.106 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000162604 TM2D1 475654 sc-eQTL 6.69e-01 0.0528 0.124 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 -235220 sc-eQTL 5.32e-01 0.0799 0.128 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -487309 sc-eQTL 3.89e-01 -0.13 0.151 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C -583055 sc-eQTL 7.04e-01 -0.056 0.147 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000132849 PATJ 458671 sc-eQTL 9.90e-01 -0.0018 0.137 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000162604 TM2D1 475654 sc-eQTL 8.59e-02 -0.247 0.143 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 -235220 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0342 0.144 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -487309 sc-eQTL 7.55e-01 0.045 0.144 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C -583055 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0887 0.153 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000132849 PATJ 458671 sc-eQTL 5.39e-01 0.0892 0.145 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000162604 TM2D1 475654 sc-eQTL 8.78e-01 0.0204 0.133 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 -235220 sc-eQTL 6.93e-01 0.0564 0.143 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 -487309 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0299 0.155 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C -583055 sc-eQTL 1.18e-02 -0.372 0.146 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000132849 PATJ 458671 sc-eQTL 3.83e-01 0.0991 0.113 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000162604 TM2D1 475654 sc-eQTL 5.71e-01 0.0788 0.139 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 -235220 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00245 0.127 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 -487309 sc-eQTL 1.09e-01 0.257 0.159 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C -583055 sc-eQTL 9.65e-01 0.00731 0.164 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000132849 PATJ 458671 sc-eQTL 9.98e-01 0.00035 0.151 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000162604 TM2D1 475654 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00404 0.154 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 -235220 sc-eQTL 1.52e-01 -0.219 0.153 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -487309 sc-eQTL 4.15e-01 -0.128 0.157 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C -583055 sc-eQTL 2.86e-01 0.161 0.151 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000132849 PATJ 458671 sc-eQTL 2.05e-02 0.352 0.151 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000162604 TM2D1 475654 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0773 0.156 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 -235220 sc-eQTL 3.21e-01 0.155 0.156 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 -487309 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0317 0.144 0.091 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C -583055 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0794 0.152 0.091 MAIT L2
ENSG00000132849 PATJ 458671 sc-eQTL 1.14e-01 -0.203 0.128 0.091 MAIT L2
ENSG00000162604 TM2D1 475654 sc-eQTL 6.94e-01 0.0575 0.146 0.091 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 -235220 sc-eQTL 8.93e-01 0.0204 0.151 0.091 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 -487309 sc-eQTL 2.39e-01 0.163 0.138 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C -583055 sc-eQTL 7.57e-01 0.0477 0.154 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000132849 PATJ 458671 sc-eQTL 4.14e-01 -0.124 0.151 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000162604 TM2D1 475654 sc-eQTL 4.21e-01 -0.124 0.154 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 -235220 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0484 0.166 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 -487309 sc-eQTL 1.64e-01 -0.187 0.134 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C -583055 sc-eQTL 8.64e-01 0.0234 0.136 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000132849 PATJ 458671 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0858 0.148 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000162604 TM2D1 475654 sc-eQTL 5.94e-01 0.0749 0.14 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 -235220 sc-eQTL 3.07e-01 0.154 0.15 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 -487309 sc-eQTL 1.23e-01 -0.202 0.13 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C -583055 sc-eQTL 5.57e-01 0.0896 0.152 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000132849 PATJ 458671 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0603 0.141 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000162604 TM2D1 475654 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0824 0.161 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 -235220 sc-eQTL 2.14e-01 0.208 0.167 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 -487309 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0424 0.139 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C -583055 sc-eQTL 3.62e-01 0.13 0.142 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000132849 PATJ 458671 sc-eQTL 3.28e-01 -0.147 0.15 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000162604 TM2D1 475654 sc-eQTL 4.86e-01 -0.102 0.147 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 -235220 sc-eQTL 4.10e-01 0.128 0.155 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 -487309 sc-eQTL 5.19e-01 -0.148 0.229 0.078 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C -583055 sc-eQTL 9.19e-01 0.0203 0.2 0.078 PB L2
ENSG00000132849 PATJ 458671 sc-eQTL 4.85e-01 -0.145 0.207 0.078 PB L2
ENSG00000162604 TM2D1 475654 sc-eQTL 2.06e-01 -0.255 0.2 0.078 PB L2
ENSG00000162607 USP1 -235220 sc-eQTL 5.09e-01 0.131 0.198 0.078 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 -487309 sc-eQTL 3.05e-01 -0.15 0.146 0.091 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C -583055 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0625 0.128 0.091 Pro_T L2
ENSG00000132849 PATJ 458671 sc-eQTL 2.36e-01 0.165 0.139 0.091 Pro_T L2
ENSG00000162604 TM2D1 475654 sc-eQTL 7.84e-01 -0.043 0.156 0.091 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 -235220 sc-eQTL 2.25e-01 -0.107 0.0878 0.091 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 -487309 sc-eQTL 8.79e-01 0.0225 0.147 0.092 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C -583055 sc-eQTL 4.71e-01 0.109 0.15 0.092 Treg L2
ENSG00000132849 PATJ 458671 sc-eQTL 3.51e-01 0.13 0.139 0.092 Treg L2
ENSG00000162604 TM2D1 475654 sc-eQTL 3.27e-01 -0.151 0.153 0.092 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 -235220 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0591 0.152 0.092 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 -487309 sc-eQTL 1.17e-01 -0.228 0.145 0.1 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C -583055 sc-eQTL 3.37e-01 -0.122 0.126 0.1 cDC L2
ENSG00000162604 TM2D1 475654 sc-eQTL 4.21e-01 -0.127 0.158 0.1 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 -235220 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0887 0.143 0.1 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 -487309 sc-eQTL 4.01e-01 -0.127 0.15 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C -583055 sc-eQTL 5.35e-02 0.204 0.105 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000162604 TM2D1 475654 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0368 0.109 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 -235220 sc-eQTL 9.45e-01 0.00919 0.132 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 6228 sc-eQTL 3.28e-02 -0.282 0.131 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 -487309 sc-eQTL 4.09e-01 0.123 0.149 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C -583055 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0327 0.129 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000162604 TM2D1 475654 sc-eQTL 1.91e-01 -0.172 0.131 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 -235220 sc-eQTL 8.06e-01 0.0368 0.15 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 6228 sc-eQTL 1.01e-03 -0.405 0.121 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 -487309 sc-eQTL 1.36e-01 0.259 0.173 0.103 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C -583055 sc-eQTL 3.33e-01 0.161 0.166 0.103 gdT L2
ENSG00000132849 PATJ 458671 sc-eQTL 4.43e-01 0.125 0.162 0.103 gdT L2
ENSG00000162604 TM2D1 475654 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0318 0.171 0.103 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 -235220 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0358 0.168 0.103 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 -487309 sc-eQTL 1.45e-01 -0.221 0.151 0.093 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C -583055 sc-eQTL 1.63e-01 0.202 0.144 0.093 intMono L2
ENSG00000162604 TM2D1 475654 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0395 0.153 0.093 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 -235220 sc-eQTL 3.07e-04 0.578 0.157 0.093 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 6228 sc-eQTL 8.87e-01 0.0169 0.119 0.093 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 -487309 sc-eQTL 9.28e-01 0.0138 0.153 0.093 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C -583055 sc-eQTL 3.48e-01 0.135 0.143 0.093 ncMono L2
ENSG00000162604 TM2D1 475654 sc-eQTL 8.01e-01 0.039 0.155 0.093 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 -235220 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0772 0.153 0.093 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 6228 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0979 0.108 0.093 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 -487309 sc-eQTL 8.39e-01 0.0351 0.172 0.102 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C -583055 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0706 0.154 0.102 pDC L2
ENSG00000162604 TM2D1 475654 sc-eQTL 5.39e-01 0.0929 0.151 0.102 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 -235220 sc-eQTL 1.28e-02 0.436 0.173 0.102 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116641 DOCK7 -487309 sc-eQTL 3.83e-01 0.122 0.14 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -583055 sc-eQTL 4.06e-01 0.0942 0.113 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 458671 sc-eQTL 3.83e-01 -0.11 0.125 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 475654 sc-eQTL 2.02e-01 -0.182 0.142 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 -235220 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0676 0.145 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -487309 sc-eQTL 1.25e-01 0.225 0.146 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -583055 sc-eQTL 9.27e-01 0.0102 0.112 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 458671 sc-eQTL 7.27e-01 0.0468 0.134 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 475654 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0956 0.127 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 -235220 sc-eQTL 2.68e-02 0.299 0.134 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -487309 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0234 0.142 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -583055 sc-eQTL 1.37e-01 0.146 0.0977 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 475654 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0812 0.102 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 -235220 sc-eQTL 9.48e-01 0.00805 0.124 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 6228 sc-eQTL 9.40e-04 -0.44 0.131 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -487309 sc-eQTL 2.69e-01 -0.172 0.155 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -583055 sc-eQTL 2.29e-01 0.16 0.132 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 475654 sc-eQTL 7.37e-01 0.0522 0.155 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 -235220 sc-eQTL 3.07e-02 0.312 0.143 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 6228 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0826 0.0988 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 -487309 sc-eQTL 2.23e-01 -0.155 0.127 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C -583055 sc-eQTL 8.11e-01 0.0305 0.128 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132849 PATJ 458671 sc-eQTL 1.78e-01 -0.185 0.137 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162604 TM2D1 475654 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000905 0.126 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 -235220 sc-eQTL 2.10e-01 0.172 0.137 0.093 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000240563 L1TD1 6228 eQTL 0.000155 -0.256 0.0675 0.0 0.0 0.0829


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000132849 \N 458671 7.87e-07 5.18e-07 1.03e-07 3.57e-07 1.05e-07 1.54e-07 4.93e-07 8.11e-08 3.17e-07 1.89e-07 5.29e-07 3.08e-07 6.47e-07 1.1e-07 1.71e-07 1.75e-07 2.34e-07 3.3e-07 1.69e-07 1.15e-07 1.91e-07 2.96e-07 3.19e-07 1.15e-07 5.75e-07 2.32e-07 1.97e-07 2.19e-07 2.78e-07 4.3e-07 2.6e-07 5.99e-08 4.74e-08 1.15e-07 2.15e-07 6.94e-08 1.15e-07 7.86e-08 6.29e-08 3.12e-08 8.75e-08 4.02e-07 2.63e-08 1.95e-08 1.27e-07 9.49e-09 9.73e-08 1.18e-08 5.19e-08