Genes within 1Mb (chr1:51046428:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000078618 NRDC -832509 sc-eQTL 3.05e-01 0.0998 0.097 0.06 B L1
ENSG00000085832 EPS15 -472838 sc-eQTL 7.73e-01 0.0276 0.0956 0.06 B L1
ENSG00000117859 OSBPL9 -530751 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0476 0.13 0.06 B L1
ENSG00000123080 CDKN2C 85683 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0343 0.12 0.06 B L1
ENSG00000123091 RNF11 -189845 sc-eQTL 3.69e-04 0.395 0.109 0.06 B L1
ENSG00000185104 FAF1 86161 sc-eQTL 7.88e-02 -0.222 0.126 0.06 B L1
ENSG00000198841 KTI12 -987382 sc-eQTL 4.46e-01 0.103 0.135 0.06 B L1
ENSG00000078618 NRDC -832509 sc-eQTL 4.31e-01 0.0833 0.105 0.06 CD4T L1
ENSG00000085832 EPS15 -472838 sc-eQTL 5.18e-02 -0.148 0.0757 0.06 CD4T L1
ENSG00000117859 OSBPL9 -530751 sc-eQTL 5.73e-01 0.0763 0.135 0.06 CD4T L1
ENSG00000123080 CDKN2C 85683 sc-eQTL 6.70e-01 0.0628 0.147 0.06 CD4T L1
ENSG00000123091 RNF11 -189845 sc-eQTL 1.39e-01 -0.166 0.112 0.06 CD4T L1
ENSG00000185104 FAF1 86161 sc-eQTL 8.88e-01 -0.015 0.106 0.06 CD4T L1
ENSG00000198841 KTI12 -987382 sc-eQTL 5.22e-01 0.0609 0.095 0.06 CD4T L1
ENSG00000078618 NRDC -832509 sc-eQTL 1.39e-01 0.178 0.12 0.06 CD8T L1
ENSG00000085832 EPS15 -472838 sc-eQTL 8.01e-01 0.0177 0.0703 0.06 CD8T L1
ENSG00000117859 OSBPL9 -530751 sc-eQTL 1.77e-01 0.201 0.148 0.06 CD8T L1
ENSG00000123080 CDKN2C 85683 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0378 0.161 0.06 CD8T L1
ENSG00000123091 RNF11 -189845 sc-eQTL 5.03e-02 -0.241 0.123 0.06 CD8T L1
ENSG00000185104 FAF1 86161 sc-eQTL 3.63e-01 0.111 0.122 0.06 CD8T L1
ENSG00000198841 KTI12 -987382 sc-eQTL 5.57e-01 0.0755 0.128 0.06 CD8T L1
ENSG00000078618 NRDC -832509 sc-eQTL 5.77e-01 0.0857 0.153 0.059 DC L1
ENSG00000085831 TTC39A -298688 sc-eQTL 3.62e-01 -0.102 0.112 0.059 DC L1
ENSG00000085832 EPS15 -472838 sc-eQTL 4.72e-01 -0.127 0.177 0.059 DC L1
ENSG00000117859 OSBPL9 -530751 sc-eQTL 1.16e-01 0.257 0.163 0.059 DC L1
ENSG00000123080 CDKN2C 85683 sc-eQTL 8.83e-01 0.0262 0.178 0.059 DC L1
ENSG00000123091 RNF11 -189845 sc-eQTL 1.88e-01 -0.174 0.132 0.059 DC L1
ENSG00000185104 FAF1 86161 sc-eQTL 3.07e-01 -0.167 0.163 0.059 DC L1
ENSG00000198841 KTI12 -987382 sc-eQTL 2.49e-01 0.211 0.182 0.059 DC L1
ENSG00000078618 NRDC -832509 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0321 0.104 0.06 Mono L1
ENSG00000085832 EPS15 -472838 sc-eQTL 3.82e-01 0.0971 0.111 0.06 Mono L1
ENSG00000117859 OSBPL9 -530751 sc-eQTL 2.02e-01 -0.17 0.133 0.06 Mono L1
ENSG00000123080 CDKN2C 85683 sc-eQTL 4.91e-01 -0.104 0.151 0.06 Mono L1
ENSG00000123091 RNF11 -189845 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00478 0.0952 0.06 Mono L1
ENSG00000185104 FAF1 86161 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00197 0.126 0.06 Mono L1
ENSG00000198841 KTI12 -987382 sc-eQTL 5.53e-01 0.102 0.171 0.06 Mono L1
ENSG00000078618 NRDC -832509 sc-eQTL 6.29e-01 0.0641 0.132 0.06 NK L1
ENSG00000085832 EPS15 -472838 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0068 0.0839 0.06 NK L1
ENSG00000117859 OSBPL9 -530751 sc-eQTL 2.79e-01 -0.144 0.133 0.06 NK L1
ENSG00000123080 CDKN2C 85683 sc-eQTL 1.53e-01 -0.195 0.136 0.06 NK L1
ENSG00000123091 RNF11 -189845 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0582 0.125 0.06 NK L1
ENSG00000185104 FAF1 86161 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0671 0.111 0.06 NK L1
ENSG00000198841 KTI12 -987382 sc-eQTL 3.59e-01 -0.138 0.151 0.06 NK L1
ENSG00000078618 NRDC -832509 sc-eQTL 2.13e-01 -0.158 0.127 0.06 Other_T L1
ENSG00000085832 EPS15 -472838 sc-eQTL 2.22e-01 0.185 0.151 0.06 Other_T L1
ENSG00000117859 OSBPL9 -530751 sc-eQTL 4.67e-01 -0.111 0.152 0.06 Other_T L1
ENSG00000123080 CDKN2C 85683 sc-eQTL 2.02e-01 0.16 0.125 0.06 Other_T L1
ENSG00000123091 RNF11 -189845 sc-eQTL 1.76e-01 -0.179 0.132 0.06 Other_T L1
ENSG00000185104 FAF1 86161 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0121 0.124 0.06 Other_T L1
ENSG00000198841 KTI12 -987382 sc-eQTL 8.70e-02 0.283 0.164 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000078618 NRDC -832509 sc-eQTL 5.98e-02 -0.412 0.217 0.056 B_Activated L2
ENSG00000085832 EPS15 -472838 sc-eQTL 4.52e-01 -0.157 0.208 0.056 B_Activated L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -530751 sc-eQTL 6.59e-01 0.0958 0.217 0.056 B_Activated L2
ENSG00000123080 CDKN2C 85683 sc-eQTL 9.45e-02 -0.263 0.157 0.056 B_Activated L2
ENSG00000123091 RNF11 -189845 sc-eQTL 4.28e-01 -0.155 0.195 0.056 B_Activated L2
ENSG00000185104 FAF1 86161 sc-eQTL 5.50e-01 -0.118 0.196 0.056 B_Activated L2
ENSG00000198841 KTI12 -987382 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0281 0.175 0.056 B_Activated L2
ENSG00000078618 NRDC -832509 sc-eQTL 1.43e-01 0.252 0.171 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000085832 EPS15 -472838 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0698 0.142 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -530751 sc-eQTL 2.37e-01 -0.228 0.193 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000123080 CDKN2C 85683 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0264 0.158 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000123091 RNF11 -189845 sc-eQTL 2.91e-02 0.308 0.14 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000185104 FAF1 86161 sc-eQTL 7.67e-01 0.0466 0.157 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000198841 KTI12 -987382 sc-eQTL 4.31e-01 0.14 0.177 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000078618 NRDC -832509 sc-eQTL 3.88e-01 -0.15 0.174 0.058 B_Memory L2
ENSG00000085832 EPS15 -472838 sc-eQTL 3.93e-01 0.123 0.143 0.058 B_Memory L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -530751 sc-eQTL 2.33e-01 -0.214 0.179 0.058 B_Memory L2
ENSG00000123080 CDKN2C 85683 sc-eQTL 4.55e-01 0.121 0.162 0.058 B_Memory L2
ENSG00000123091 RNF11 -189845 sc-eQTL 5.04e-01 0.108 0.161 0.058 B_Memory L2
ENSG00000185104 FAF1 86161 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0725 0.163 0.058 B_Memory L2
ENSG00000198841 KTI12 -987382 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0198 0.179 0.058 B_Memory L2
ENSG00000078618 NRDC -832509 sc-eQTL 8.02e-01 0.0355 0.142 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000085832 EPS15 -472838 sc-eQTL 6.09e-01 0.0642 0.125 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -530751 sc-eQTL 3.64e-01 0.159 0.175 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000123080 CDKN2C 85683 sc-eQTL 1.97e-01 -0.215 0.166 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000123091 RNF11 -189845 sc-eQTL 6.71e-05 0.545 0.134 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000185104 FAF1 86161 sc-eQTL 7.29e-02 -0.241 0.134 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000198841 KTI12 -987382 sc-eQTL 2.16e-02 0.335 0.145 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000078618 NRDC -832509 sc-eQTL 7.29e-01 0.0565 0.162 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000085832 EPS15 -472838 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0847 0.154 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -530751 sc-eQTL 3.92e-01 0.151 0.176 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000123080 CDKN2C 85683 sc-eQTL 1.41e-01 0.201 0.136 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000123091 RNF11 -189845 sc-eQTL 5.33e-03 0.45 0.16 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000185104 FAF1 86161 sc-eQTL 3.51e-01 -0.14 0.149 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000198841 KTI12 -987382 sc-eQTL 5.82e-01 0.0912 0.166 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000078618 NRDC -832509 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00923 0.186 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000085832 EPS15 -472838 sc-eQTL 8.20e-01 0.0377 0.165 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -530751 sc-eQTL 9.55e-01 -0.0108 0.192 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000123080 CDKN2C 85683 sc-eQTL 4.79e-01 -0.13 0.184 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000123091 RNF11 -189845 sc-eQTL 6.06e-02 -0.324 0.172 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000185104 FAF1 86161 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0418 0.155 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000198841 KTI12 -987382 sc-eQTL 7.73e-01 0.0508 0.176 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000078618 NRDC -832509 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0108 0.124 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000085832 EPS15 -472838 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0223 0.115 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -530751 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0316 0.151 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000123080 CDKN2C 85683 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00148 0.154 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000123091 RNF11 -189845 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0913 0.109 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000185104 FAF1 86161 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0819 0.11 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000198841 KTI12 -987382 sc-eQTL 8.48e-01 0.0192 0.101 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000078618 NRDC -832509 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00789 0.14 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000085832 EPS15 -472838 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0661 0.108 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -530751 sc-eQTL 1.76e-01 0.221 0.162 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000123080 CDKN2C 85683 sc-eQTL 2.58e-01 0.188 0.166 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000123091 RNF11 -189845 sc-eQTL 1.61e-01 -0.189 0.134 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000185104 FAF1 86161 sc-eQTL 8.48e-01 0.0266 0.138 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000198841 KTI12 -987382 sc-eQTL 6.05e-01 0.0724 0.14 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000078618 NRDC -832509 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00804 0.171 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000085832 EPS15 -472838 sc-eQTL 1.78e-01 -0.191 0.141 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -530751 sc-eQTL 9.89e-01 0.0025 0.181 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000123080 CDKN2C 85683 sc-eQTL 8.44e-01 0.0354 0.18 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000123091 RNF11 -189845 sc-eQTL 6.45e-02 -0.266 0.143 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000185104 FAF1 86161 sc-eQTL 5.95e-01 0.0752 0.141 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000198841 KTI12 -987382 sc-eQTL 1.07e-02 0.428 0.166 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000078618 NRDC -832509 sc-eQTL 6.46e-01 0.0705 0.153 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000085832 EPS15 -472838 sc-eQTL 5.03e-01 0.0881 0.131 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -530751 sc-eQTL 8.66e-01 0.0296 0.176 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000123080 CDKN2C 85683 sc-eQTL 8.98e-01 0.022 0.171 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000123091 RNF11 -189845 sc-eQTL 1.41e-01 -0.225 0.152 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000185104 FAF1 86161 sc-eQTL 4.65e-01 0.103 0.14 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000198841 KTI12 -987382 sc-eQTL 6.46e-01 0.0763 0.166 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000078618 NRDC -832509 sc-eQTL 8.92e-02 0.25 0.147 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000085832 EPS15 -472838 sc-eQTL 3.38e-01 0.128 0.133 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -530751 sc-eQTL 2.58e-01 0.183 0.162 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000123080 CDKN2C 85683 sc-eQTL 4.74e-01 -0.128 0.178 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000123091 RNF11 -189845 sc-eQTL 2.27e-01 -0.163 0.134 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000185104 FAF1 86161 sc-eQTL 8.33e-01 0.0292 0.138 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000198841 KTI12 -987382 sc-eQTL 2.47e-01 0.174 0.15 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000078618 NRDC -832509 sc-eQTL 7.53e-01 0.0555 0.176 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000085832 EPS15 -472838 sc-eQTL 2.41e-01 0.203 0.173 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -530751 sc-eQTL 1.29e-01 0.285 0.187 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000123080 CDKN2C 85683 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0172 0.167 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000123091 RNF11 -189845 sc-eQTL 7.79e-01 0.0492 0.175 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000185104 FAF1 86161 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0146 0.157 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000198841 KTI12 -987382 sc-eQTL 2.68e-01 0.198 0.178 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000078618 NRDC -832509 sc-eQTL 6.22e-01 0.0862 0.175 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000085832 EPS15 -472838 sc-eQTL 3.04e-01 -0.164 0.159 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -530751 sc-eQTL 7.16e-01 0.0683 0.187 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000123080 CDKN2C 85683 sc-eQTL 7.79e-01 0.0497 0.177 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000123091 RNF11 -189845 sc-eQTL 2.66e-01 -0.2 0.179 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000185104 FAF1 86161 sc-eQTL 3.14e-01 0.178 0.177 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000198841 KTI12 -987382 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00823 0.175 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000078618 NRDC -832509 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0934 0.176 0.058 MAIT L2
ENSG00000085832 EPS15 -472838 sc-eQTL 3.86e-01 0.135 0.155 0.058 MAIT L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -530751 sc-eQTL 5.59e-01 0.108 0.184 0.058 MAIT L2
ENSG00000123080 CDKN2C 85683 sc-eQTL 1.43e-01 0.27 0.184 0.058 MAIT L2
ENSG00000123091 RNF11 -189845 sc-eQTL 2.90e-01 -0.172 0.162 0.058 MAIT L2
ENSG00000185104 FAF1 86161 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0407 0.158 0.058 MAIT L2
ENSG00000198841 KTI12 -987382 sc-eQTL 5.90e-02 0.335 0.176 0.058 MAIT L2
ENSG00000078618 NRDC -832509 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0242 0.158 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000085832 EPS15 -472838 sc-eQTL 7.99e-01 0.04 0.157 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -530751 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0918 0.173 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000123080 CDKN2C 85683 sc-eQTL 9.74e-01 0.00529 0.162 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000123091 RNF11 -189845 sc-eQTL 9.48e-02 0.269 0.16 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000185104 FAF1 86161 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0936 0.15 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000198841 KTI12 -987382 sc-eQTL 4.20e-01 -0.131 0.162 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000078618 NRDC -832509 sc-eQTL 3.44e-01 0.132 0.139 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000085832 EPS15 -472838 sc-eQTL 8.38e-01 0.0225 0.11 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -530751 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0327 0.152 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000123080 CDKN2C 85683 sc-eQTL 3.43e-01 -0.142 0.149 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000123091 RNF11 -189845 sc-eQTL 3.89e-01 -0.131 0.152 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000185104 FAF1 86161 sc-eQTL 1.23e-01 -0.203 0.131 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000198841 KTI12 -987382 sc-eQTL 2.74e-01 -0.191 0.174 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000078618 NRDC -832509 sc-eQTL 2.00e-01 -0.234 0.182 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000085832 EPS15 -472838 sc-eQTL 2.95e-01 -0.146 0.139 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -530751 sc-eQTL 1.73e-01 -0.23 0.168 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000123080 CDKN2C 85683 sc-eQTL 8.41e-01 0.0336 0.167 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000123091 RNF11 -189845 sc-eQTL 2.36e-01 -0.196 0.164 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000185104 FAF1 86161 sc-eQTL 1.25e-02 0.39 0.155 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000198841 KTI12 -987382 sc-eQTL 7.18e-01 0.0624 0.173 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000078618 NRDC -832509 sc-eQTL 4.05e-01 0.131 0.156 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000085832 EPS15 -472838 sc-eQTL 3.19e-01 0.121 0.121 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -530751 sc-eQTL 4.14e-01 -0.136 0.166 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000123080 CDKN2C 85683 sc-eQTL 2.40e-01 -0.173 0.147 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000123091 RNF11 -189845 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00417 0.159 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000185104 FAF1 86161 sc-eQTL 2.51e-01 -0.147 0.128 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000198841 KTI12 -987382 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0393 0.151 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000078618 NRDC -832509 sc-eQTL 4.07e-01 0.14 0.168 0.052 PB L2
ENSG00000085832 EPS15 -472838 sc-eQTL 7.94e-01 0.0632 0.241 0.052 PB L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -530751 sc-eQTL 5.47e-01 -0.121 0.201 0.052 PB L2
ENSG00000123080 CDKN2C 85683 sc-eQTL 4.09e-01 0.142 0.171 0.052 PB L2
ENSG00000123091 RNF11 -189845 sc-eQTL 6.66e-01 0.102 0.235 0.052 PB L2
ENSG00000185104 FAF1 86161 sc-eQTL 9.41e-01 -0.017 0.23 0.052 PB L2
ENSG00000198841 KTI12 -987382 sc-eQTL 8.44e-01 0.0434 0.22 0.052 PB L2
ENSG00000078618 NRDC -832509 sc-eQTL 5.71e-02 -0.29 0.151 0.059 Pro_T L2
ENSG00000085832 EPS15 -472838 sc-eQTL 8.37e-01 0.037 0.179 0.059 Pro_T L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -530751 sc-eQTL 3.53e-01 -0.16 0.172 0.059 Pro_T L2
ENSG00000123080 CDKN2C 85683 sc-eQTL 8.84e-02 0.235 0.137 0.059 Pro_T L2
ENSG00000123091 RNF11 -189845 sc-eQTL 1.44e-01 0.256 0.174 0.059 Pro_T L2
ENSG00000185104 FAF1 86161 sc-eQTL 1.36e-01 -0.214 0.143 0.059 Pro_T L2
ENSG00000198841 KTI12 -987382 sc-eQTL 3.18e-01 0.176 0.176 0.059 Pro_T L2
ENSG00000078618 NRDC -832509 sc-eQTL 3.54e-01 0.147 0.158 0.06 Treg L2
ENSG00000085832 EPS15 -472838 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0937 0.13 0.06 Treg L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -530751 sc-eQTL 9.83e-01 0.00381 0.18 0.06 Treg L2
ENSG00000123080 CDKN2C 85683 sc-eQTL 3.27e-01 0.155 0.158 0.06 Treg L2
ENSG00000123091 RNF11 -189845 sc-eQTL 6.83e-01 0.0689 0.168 0.06 Treg L2
ENSG00000185104 FAF1 86161 sc-eQTL 6.22e-01 0.0746 0.151 0.06 Treg L2
ENSG00000198841 KTI12 -987382 sc-eQTL 3.86e-01 -0.132 0.151 0.06 Treg L2
ENSG00000078618 NRDC -832509 sc-eQTL 7.58e-01 0.0548 0.178 0.056 cDC L2
ENSG00000085831 TTC39A -298688 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0404 0.058 0.056 cDC L2
ENSG00000085832 EPS15 -472838 sc-eQTL 2.97e-01 0.207 0.198 0.056 cDC L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -530751 sc-eQTL 8.95e-01 0.024 0.182 0.056 cDC L2
ENSG00000123080 CDKN2C 85683 sc-eQTL 9.04e-02 0.317 0.186 0.056 cDC L2
ENSG00000123091 RNF11 -189845 sc-eQTL 2.14e-01 -0.24 0.193 0.056 cDC L2
ENSG00000185104 FAF1 86161 sc-eQTL 5.06e-01 -0.116 0.175 0.056 cDC L2
ENSG00000198841 KTI12 -987382 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0424 0.184 0.056 cDC L2
ENSG00000078618 NRDC -832509 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0399 0.13 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000085832 EPS15 -472838 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0731 0.127 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -530751 sc-eQTL 9.40e-02 -0.243 0.145 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000123080 CDKN2C 85683 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0392 0.159 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000123091 RNF11 -189845 sc-eQTL 2.22e-01 -0.127 0.103 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000185104 FAF1 86161 sc-eQTL 3.85e-01 0.126 0.144 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000198841 KTI12 -987382 sc-eQTL 4.02e-01 0.141 0.167 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000078618 NRDC -832509 sc-eQTL 3.15e-01 -0.139 0.138 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000085832 EPS15 -472838 sc-eQTL 8.83e-02 0.252 0.147 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -530751 sc-eQTL 3.99e-01 0.136 0.161 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000123080 CDKN2C 85683 sc-eQTL 2.85e-01 -0.188 0.175 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000123091 RNF11 -189845 sc-eQTL 3.63e-01 0.126 0.138 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000185104 FAF1 86161 sc-eQTL 1.70e-01 -0.228 0.166 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000198841 KTI12 -987382 sc-eQTL 6.32e-01 0.087 0.181 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000078618 NRDC -832509 sc-eQTL 9.41e-01 0.0134 0.182 0.07 gdT L2
ENSG00000085832 EPS15 -472838 sc-eQTL 6.70e-01 0.0851 0.199 0.07 gdT L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -530751 sc-eQTL 8.43e-01 0.0397 0.2 0.07 gdT L2
ENSG00000123080 CDKN2C 85683 sc-eQTL 7.07e-01 0.0746 0.198 0.07 gdT L2
ENSG00000123091 RNF11 -189845 sc-eQTL 5.39e-01 0.121 0.196 0.07 gdT L2
ENSG00000185104 FAF1 86161 sc-eQTL 7.63e-01 0.0577 0.191 0.07 gdT L2
ENSG00000198841 KTI12 -987382 sc-eQTL 7.15e-01 0.0681 0.186 0.07 gdT L2
ENSG00000078618 NRDC -832509 sc-eQTL 5.11e-01 -0.109 0.165 0.058 intMono L2
ENSG00000085832 EPS15 -472838 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0408 0.165 0.058 intMono L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -530751 sc-eQTL 7.14e-02 -0.338 0.186 0.058 intMono L2
ENSG00000123080 CDKN2C 85683 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0462 0.164 0.058 intMono L2
ENSG00000123091 RNF11 -189845 sc-eQTL 2.65e-01 0.18 0.161 0.058 intMono L2
ENSG00000185104 FAF1 86161 sc-eQTL 8.58e-02 -0.294 0.17 0.058 intMono L2
ENSG00000198841 KTI12 -987382 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0814 0.184 0.058 intMono L2
ENSG00000078618 NRDC -832509 sc-eQTL 3.01e-01 0.172 0.166 0.059 ncMono L2
ENSG00000085832 EPS15 -472838 sc-eQTL 5.36e-01 0.0948 0.153 0.059 ncMono L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -530751 sc-eQTL 6.25e-01 0.084 0.172 0.059 ncMono L2
ENSG00000123080 CDKN2C 85683 sc-eQTL 9.90e-01 0.00212 0.169 0.059 ncMono L2
ENSG00000123091 RNF11 -189845 sc-eQTL 5.54e-01 -0.095 0.16 0.059 ncMono L2
ENSG00000185104 FAF1 86161 sc-eQTL 5.54e-02 0.274 0.142 0.059 ncMono L2
ENSG00000198841 KTI12 -987382 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0378 0.181 0.059 ncMono L2
ENSG00000078618 NRDC -832509 sc-eQTL 4.13e-01 0.126 0.154 0.065 pDC L2
ENSG00000085831 TTC39A -298688 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0821 0.149 0.065 pDC L2
ENSG00000085832 EPS15 -472838 sc-eQTL 1.45e-01 -0.278 0.19 0.065 pDC L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -530751 sc-eQTL 1.53e-01 0.265 0.185 0.065 pDC L2
ENSG00000123080 CDKN2C 85683 sc-eQTL 8.06e-01 -0.039 0.158 0.065 pDC L2
ENSG00000123091 RNF11 -189845 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0826 0.138 0.065 pDC L2
ENSG00000185104 FAF1 86161 sc-eQTL 6.73e-01 -0.08 0.189 0.065 pDC L2
ENSG00000198841 KTI12 -987382 sc-eQTL 3.02e-02 0.379 0.173 0.065 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000078618 NRDC -832509 sc-eQTL 9.30e-01 0.014 0.159 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000085832 EPS15 -472838 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0458 0.126 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000117859 OSBPL9 -530751 sc-eQTL 4.96e-02 -0.343 0.173 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000123080 CDKN2C 85683 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0636 0.167 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000123091 RNF11 -189845 sc-eQTL 9.12e-02 0.201 0.118 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185104 FAF1 86161 sc-eQTL 3.99e-01 -0.126 0.149 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198841 KTI12 -987382 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0365 0.167 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000078618 NRDC -832509 sc-eQTL 6.84e-01 0.0517 0.127 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000085832 EPS15 -472838 sc-eQTL 6.96e-01 0.0465 0.119 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000117859 OSBPL9 -530751 sc-eQTL 3.06e-01 0.169 0.165 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000123080 CDKN2C 85683 sc-eQTL 4.93e-01 -0.112 0.163 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000123091 RNF11 -189845 sc-eQTL 6.43e-06 0.603 0.13 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185104 FAF1 86161 sc-eQTL 3.98e-02 -0.27 0.13 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198841 KTI12 -987382 sc-eQTL 3.22e-02 0.309 0.143 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000078618 NRDC -832509 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0811 0.117 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000085832 EPS15 -472838 sc-eQTL 4.77e-01 0.0834 0.117 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000117859 OSBPL9 -530751 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0565 0.134 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000123080 CDKN2C 85683 sc-eQTL 3.70e-01 -0.137 0.153 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000123091 RNF11 -189845 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0168 0.1 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000185104 FAF1 86161 sc-eQTL 9.27e-01 0.0129 0.14 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198841 KTI12 -987382 sc-eQTL 3.07e-01 0.172 0.167 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000078618 NRDC -832509 sc-eQTL 2.20e-01 0.178 0.145 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000085832 EPS15 -472838 sc-eQTL 4.85e-01 0.0996 0.142 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000117859 OSBPL9 -530751 sc-eQTL 1.70e-01 -0.238 0.173 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000123080 CDKN2C 85683 sc-eQTL 7.85e-01 0.0456 0.167 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000123091 RNF11 -189845 sc-eQTL 7.31e-01 0.05 0.145 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000185104 FAF1 86161 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0402 0.132 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198841 KTI12 -987382 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0189 0.18 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000078618 NRDC -832509 sc-eQTL 4.86e-01 0.0916 0.131 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000085832 EPS15 -472838 sc-eQTL 8.92e-01 0.0117 0.0862 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000117859 OSBPL9 -530751 sc-eQTL 4.52e-01 -0.103 0.136 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000123080 CDKN2C 85683 sc-eQTL 2.42e-01 -0.164 0.14 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000123091 RNF11 -189845 sc-eQTL 3.89e-01 -0.111 0.129 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185104 FAF1 86161 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0468 0.114 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198841 KTI12 -987382 sc-eQTL 4.68e-01 -0.114 0.157 0.06 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000085831 TTC39A -298688 eQTL 0.0994 0.0776 0.047 0.00115 0.0 0.0716
ENSG00000123091 RNF11 -189845 eQTL 0.00024 -0.0927 0.0252 0.0 0.0 0.0716
ENSG00000232027 AL671986.1 -325842 eQTL 0.153 0.0985 0.0689 0.00105 0.0 0.0716


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000078618 \N -832509 2.67e-07 1.3e-07 5.49e-08 1.81e-07 9.87e-08 9.91e-08 1.6e-07 5.53e-08 1.45e-07 5.67e-08 1.52e-07 1.01e-07 1.53e-07 7.13e-08 6.18e-08 7.49e-08 4.12e-08 1.4e-07 6.07e-08 4.21e-08 1.22e-07 1.26e-07 1.45e-07 2.64e-08 1.5e-07 1.26e-07 1.1e-07 9.74e-08 1.2e-07 1e-07 9.92e-08 2.99e-08 3.73e-08 8.23e-08 4.84e-08 3.2e-08 5.31e-08 8.76e-08 6.86e-08 4.47e-08 5.41e-08 1.33e-07 5.21e-08 1.2e-08 3.84e-08 1.87e-08 1.2e-07 1.89e-09 4.99e-08
ENSG00000123091 RNF11 -189845 2.02e-06 2.46e-06 3.19e-07 1.58e-06 4.78e-07 7.82e-07 1.38e-06 6.43e-07 1.69e-06 8.28e-07 1.93e-06 1.3e-06 3.35e-06 9.45e-07 6.96e-07 1.49e-06 9.71e-07 1.92e-06 8.06e-07 1.15e-06 9.86e-07 2.67e-06 2.02e-06 1.07e-06 2.84e-06 1.37e-06 1.22e-06 1.42e-06 1.89e-06 1.67e-06 1.16e-06 3.1e-07 5.24e-07 1.27e-06 9.89e-07 8.79e-07 8.47e-07 3.86e-07 1.11e-06 3.75e-07 2.1e-07 2.89e-06 3.95e-07 1.81e-07 2.97e-07 2.98e-07 7.57e-07 2.32e-07 1.53e-07