Genes within 1Mb (chr1:50992337:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000078618 NRDC -886600 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0183 0.0711 0.141 B L1
ENSG00000085832 EPS15 -526929 sc-eQTL 1.08e-01 0.112 0.0695 0.141 B L1
ENSG00000117859 OSBPL9 -584842 sc-eQTL 1.83e-01 -0.126 0.0947 0.141 B L1
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00972 0.0876 0.141 B L1
ENSG00000123091 RNF11 -243936 sc-eQTL 3.80e-01 0.0723 0.0821 0.141 B L1
ENSG00000185104 FAF1 32070 sc-eQTL 3.28e-01 0.0904 0.0923 0.141 B L1
ENSG00000078618 NRDC -886600 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0591 0.076 0.141 CD4T L1
ENSG00000085832 EPS15 -526929 sc-eQTL 7.34e-01 0.0187 0.055 0.141 CD4T L1
ENSG00000117859 OSBPL9 -584842 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0183 0.0975 0.141 CD4T L1
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 sc-eQTL 2.58e-01 -0.12 0.106 0.141 CD4T L1
ENSG00000123091 RNF11 -243936 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0738 0.0806 0.141 CD4T L1
ENSG00000185104 FAF1 32070 sc-eQTL 4.97e-01 0.0518 0.0761 0.141 CD4T L1
ENSG00000078618 NRDC -886600 sc-eQTL 3.59e-01 0.0791 0.086 0.141 CD8T L1
ENSG00000085832 EPS15 -526929 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00445 0.0502 0.141 CD8T L1
ENSG00000117859 OSBPL9 -584842 sc-eQTL 4.93e-01 0.0729 0.106 0.141 CD8T L1
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 sc-eQTL 2.28e-01 -0.138 0.114 0.141 CD8T L1
ENSG00000123091 RNF11 -243936 sc-eQTL 8.78e-01 0.0136 0.0883 0.141 CD8T L1
ENSG00000185104 FAF1 32070 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0147 0.0872 0.141 CD8T L1
ENSG00000078618 NRDC -886600 sc-eQTL 1.12e-01 0.17 0.106 0.137 DC L1
ENSG00000085831 TTC39A -352779 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0143 0.0782 0.137 DC L1
ENSG00000085832 EPS15 -526929 sc-eQTL 4.65e-01 0.0902 0.123 0.137 DC L1
ENSG00000117859 OSBPL9 -584842 sc-eQTL 2.17e-01 -0.141 0.114 0.137 DC L1
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 sc-eQTL 6.14e-02 -0.231 0.123 0.137 DC L1
ENSG00000123091 RNF11 -243936 sc-eQTL 1.65e-02 0.22 0.0908 0.137 DC L1
ENSG00000185104 FAF1 32070 sc-eQTL 8.89e-01 0.0159 0.114 0.137 DC L1
ENSG00000078618 NRDC -886600 sc-eQTL 7.11e-01 0.0276 0.0743 0.141 Mono L1
ENSG00000085832 EPS15 -526929 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0534 0.0792 0.141 Mono L1
ENSG00000117859 OSBPL9 -584842 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0408 0.0952 0.141 Mono L1
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00599 0.108 0.141 Mono L1
ENSG00000123091 RNF11 -243936 sc-eQTL 7.53e-02 -0.12 0.0674 0.141 Mono L1
ENSG00000185104 FAF1 32070 sc-eQTL 3.64e-02 -0.187 0.0888 0.141 Mono L1
ENSG00000078618 NRDC -886600 sc-eQTL 4.93e-01 0.0641 0.0934 0.142 NK L1
ENSG00000085832 EPS15 -526929 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0511 0.0592 0.142 NK L1
ENSG00000117859 OSBPL9 -584842 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00978 0.0941 0.142 NK L1
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 sc-eQTL 1.57e-01 0.136 0.0959 0.142 NK L1
ENSG00000123091 RNF11 -243936 sc-eQTL 7.62e-01 0.0267 0.0881 0.142 NK L1
ENSG00000185104 FAF1 32070 sc-eQTL 3.28e-02 0.167 0.0779 0.142 NK L1
ENSG00000078618 NRDC -886600 sc-eQTL 9.47e-01 0.00606 0.0904 0.141 Other_T L1
ENSG00000085832 EPS15 -526929 sc-eQTL 4.68e-01 0.0781 0.107 0.141 Other_T L1
ENSG00000117859 OSBPL9 -584842 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0438 0.108 0.141 Other_T L1
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 sc-eQTL 2.80e-01 0.0959 0.0886 0.141 Other_T L1
ENSG00000123091 RNF11 -243936 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0669 0.0942 0.141 Other_T L1
ENSG00000185104 FAF1 32070 sc-eQTL 9.64e-03 0.227 0.087 0.141 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000078618 NRDC -886600 sc-eQTL 7.18e-01 0.0523 0.145 0.148 B_Activated L2
ENSG00000085832 EPS15 -526929 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0275 0.137 0.148 B_Activated L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -584842 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0224 0.143 0.148 B_Activated L2
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 sc-eQTL 7.93e-01 0.0274 0.104 0.148 B_Activated L2
ENSG00000123091 RNF11 -243936 sc-eQTL 3.55e-01 0.119 0.129 0.148 B_Activated L2
ENSG00000185104 FAF1 32070 sc-eQTL 3.74e-02 0.269 0.128 0.148 B_Activated L2
ENSG00000078618 NRDC -886600 sc-eQTL 4.31e-01 -0.096 0.122 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000085832 EPS15 -526929 sc-eQTL 8.60e-01 0.0178 0.101 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -584842 sc-eQTL 6.27e-01 0.0665 0.137 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0853 0.112 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000123091 RNF11 -243936 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0398 0.1 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000185104 FAF1 32070 sc-eQTL 6.03e-01 -0.058 0.111 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000078618 NRDC -886600 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0367 0.123 0.142 B_Memory L2
ENSG00000085832 EPS15 -526929 sc-eQTL 1.91e-01 0.132 0.101 0.142 B_Memory L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -584842 sc-eQTL 1.46e-01 -0.184 0.126 0.142 B_Memory L2
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 sc-eQTL 8.15e-01 0.0269 0.115 0.142 B_Memory L2
ENSG00000123091 RNF11 -243936 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0202 0.113 0.142 B_Memory L2
ENSG00000185104 FAF1 32070 sc-eQTL 3.15e-01 0.116 0.115 0.142 B_Memory L2
ENSG00000078618 NRDC -886600 sc-eQTL 3.47e-01 0.0982 0.104 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000085832 EPS15 -526929 sc-eQTL 9.09e-02 0.156 0.0919 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -584842 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0896 0.129 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 sc-eQTL 1.95e-01 0.159 0.122 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000123091 RNF11 -243936 sc-eQTL 4.52e-01 0.0773 0.102 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000185104 FAF1 32070 sc-eQTL 3.66e-01 -0.09 0.0993 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000078618 NRDC -886600 sc-eQTL 1.00e+00 2.9e-05 0.119 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000085832 EPS15 -526929 sc-eQTL 8.86e-01 0.0162 0.112 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -584842 sc-eQTL 9.06e-02 -0.217 0.128 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 sc-eQTL 1.25e-01 -0.153 0.0994 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000123091 RNF11 -243936 sc-eQTL 9.18e-02 0.2 0.118 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000185104 FAF1 32070 sc-eQTL 2.63e-01 0.122 0.109 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000078618 NRDC -886600 sc-eQTL 5.52e-01 0.0795 0.134 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000085832 EPS15 -526929 sc-eQTL 2.87e-01 -0.126 0.118 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -584842 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0306 0.138 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 sc-eQTL 5.96e-01 0.0702 0.132 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000123091 RNF11 -243936 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0247 0.125 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000185104 FAF1 32070 sc-eQTL 2.77e-01 0.121 0.111 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000078618 NRDC -886600 sc-eQTL 2.72e-01 -0.098 0.089 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000085832 EPS15 -526929 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0154 0.0831 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -584842 sc-eQTL 9.91e-01 0.00117 0.109 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 sc-eQTL 1.47e-02 -0.269 0.11 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000123091 RNF11 -243936 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0642 0.0786 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000185104 FAF1 32070 sc-eQTL 2.63e-01 0.0894 0.0796 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000078618 NRDC -886600 sc-eQTL 1.59e-01 0.143 0.101 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000085832 EPS15 -526929 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0238 0.0786 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -584842 sc-eQTL 8.75e-01 0.0187 0.119 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 sc-eQTL 8.31e-01 0.0259 0.121 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000123091 RNF11 -243936 sc-eQTL 1.71e-01 -0.134 0.0975 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000185104 FAF1 32070 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0364 0.1 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000078618 NRDC -886600 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0187 0.122 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000085832 EPS15 -526929 sc-eQTL 2.19e-01 0.124 0.101 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -584842 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0615 0.129 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 sc-eQTL 7.52e-01 0.0405 0.128 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000123091 RNF11 -243936 sc-eQTL 8.36e-01 0.0213 0.103 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000185104 FAF1 32070 sc-eQTL 8.57e-02 0.173 0.1 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000078618 NRDC -886600 sc-eQTL 1.15e-01 0.169 0.107 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000085832 EPS15 -526929 sc-eQTL 6.88e-01 -0.037 0.0921 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -584842 sc-eQTL 7.16e-01 0.0448 0.123 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0326 0.12 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000123091 RNF11 -243936 sc-eQTL 7.39e-01 0.0357 0.107 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000185104 FAF1 32070 sc-eQTL 8.59e-02 0.169 0.0977 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000078618 NRDC -886600 sc-eQTL 9.58e-01 0.00566 0.108 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000085832 EPS15 -526929 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0591 0.0972 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -584842 sc-eQTL 3.25e-01 0.116 0.118 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 sc-eQTL 4.78e-01 -0.092 0.13 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000123091 RNF11 -243936 sc-eQTL 7.65e-01 0.0294 0.0983 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000185104 FAF1 32070 sc-eQTL 7.01e-02 -0.182 0.1 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000078618 NRDC -886600 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00896 0.128 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000085832 EPS15 -526929 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0333 0.126 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -584842 sc-eQTL 5.79e-01 -0.076 0.137 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 sc-eQTL 2.05e-01 0.154 0.121 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000123091 RNF11 -243936 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0487 0.127 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000185104 FAF1 32070 sc-eQTL 1.10e-01 -0.182 0.113 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000078618 NRDC -886600 sc-eQTL 5.39e-02 -0.256 0.132 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000085832 EPS15 -526929 sc-eQTL 1.91e-01 0.158 0.121 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -584842 sc-eQTL 1.41e-01 0.21 0.142 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 sc-eQTL 8.33e-01 0.0284 0.135 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000123091 RNF11 -243936 sc-eQTL 2.55e-01 -0.156 0.136 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000185104 FAF1 32070 sc-eQTL 6.27e-01 0.0655 0.135 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000078618 NRDC -886600 sc-eQTL 6.49e-01 0.0559 0.123 0.143 MAIT L2
ENSG00000085832 EPS15 -526929 sc-eQTL 1.27e-01 0.165 0.108 0.143 MAIT L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -584842 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0834 0.128 0.143 MAIT L2
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 sc-eQTL 4.53e-01 0.0967 0.129 0.143 MAIT L2
ENSG00000123091 RNF11 -243936 sc-eQTL 7.78e-01 -0.032 0.113 0.143 MAIT L2
ENSG00000185104 FAF1 32070 sc-eQTL 6.83e-01 0.0451 0.11 0.143 MAIT L2
ENSG00000078618 NRDC -886600 sc-eQTL 1.31e-01 -0.18 0.119 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000085832 EPS15 -526929 sc-eQTL 3.14e-01 0.12 0.119 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -584842 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0278 0.131 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 sc-eQTL 1.98e-01 0.158 0.122 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000123091 RNF11 -243936 sc-eQTL 2.79e-01 -0.132 0.122 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000185104 FAF1 32070 sc-eQTL 5.24e-01 0.0726 0.114 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000078618 NRDC -886600 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0244 0.101 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000085832 EPS15 -526929 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0541 0.0795 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -584842 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0244 0.11 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 sc-eQTL 9.41e-01 0.00805 0.108 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000123091 RNF11 -243936 sc-eQTL 5.87e-01 0.0599 0.11 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000185104 FAF1 32070 sc-eQTL 1.04e-02 0.243 0.0938 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000078618 NRDC -886600 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0476 0.136 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000085832 EPS15 -526929 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00867 0.104 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -584842 sc-eQTL 3.89e-02 0.259 0.125 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 sc-eQTL 2.20e-01 0.152 0.124 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000123091 RNF11 -243936 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0708 0.123 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000185104 FAF1 32070 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00263 0.117 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000078618 NRDC -886600 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0317 0.112 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000085832 EPS15 -526929 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00898 0.0867 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -584842 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0712 0.119 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 sc-eQTL 3.57e-01 0.0971 0.105 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000123091 RNF11 -243936 sc-eQTL 1.44e-01 -0.167 0.114 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000185104 FAF1 32070 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00576 0.0919 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000078618 NRDC -886600 sc-eQTL 5.46e-01 0.0673 0.111 0.156 PB L2
ENSG00000085832 EPS15 -526929 sc-eQTL 3.52e-02 -0.333 0.156 0.156 PB L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -584842 sc-eQTL 7.33e-01 0.0453 0.133 0.156 PB L2
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0259 0.113 0.156 PB L2
ENSG00000123091 RNF11 -243936 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0474 0.155 0.156 PB L2
ENSG00000185104 FAF1 32070 sc-eQTL 5.35e-01 0.0941 0.151 0.156 PB L2
ENSG00000078618 NRDC -886600 sc-eQTL 8.09e-01 0.0266 0.11 0.137 Pro_T L2
ENSG00000085832 EPS15 -526929 sc-eQTL 1.39e-01 -0.191 0.128 0.137 Pro_T L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -584842 sc-eQTL 4.06e-01 -0.103 0.124 0.137 Pro_T L2
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00245 0.0997 0.137 Pro_T L2
ENSG00000123091 RNF11 -243936 sc-eQTL 2.48e-01 -0.146 0.126 0.137 Pro_T L2
ENSG00000185104 FAF1 32070 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0231 0.104 0.137 Pro_T L2
ENSG00000078618 NRDC -886600 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0344 0.113 0.141 Treg L2
ENSG00000085832 EPS15 -526929 sc-eQTL 7.45e-02 0.165 0.0923 0.141 Treg L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -584842 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0842 0.128 0.141 Treg L2
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0562 0.113 0.141 Treg L2
ENSG00000123091 RNF11 -243936 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0888 0.12 0.141 Treg L2
ENSG00000185104 FAF1 32070 sc-eQTL 9.04e-01 0.0131 0.108 0.141 Treg L2
ENSG00000078618 NRDC -886600 sc-eQTL 8.87e-01 0.0174 0.122 0.146 cDC L2
ENSG00000085831 TTC39A -352779 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0393 0.0397 0.146 cDC L2
ENSG00000085832 EPS15 -526929 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0509 0.136 0.146 cDC L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -584842 sc-eQTL 4.16e-01 -0.102 0.125 0.146 cDC L2
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 sc-eQTL 7.36e-02 -0.23 0.128 0.146 cDC L2
ENSG00000123091 RNF11 -243936 sc-eQTL 1.29e-01 0.201 0.132 0.146 cDC L2
ENSG00000185104 FAF1 32070 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0393 0.12 0.146 cDC L2
ENSG00000078618 NRDC -886600 sc-eQTL 3.55e-01 0.0872 0.094 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000085832 EPS15 -526929 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0477 0.0917 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -584842 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0226 0.105 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0284 0.115 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000123091 RNF11 -243936 sc-eQTL 1.93e-02 -0.175 0.0742 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000185104 FAF1 32070 sc-eQTL 8.84e-02 -0.178 0.104 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000078618 NRDC -886600 sc-eQTL 2.50e-01 -0.114 0.0991 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000085832 EPS15 -526929 sc-eQTL 2.56e-01 0.121 0.106 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -584842 sc-eQTL 8.21e-01 0.0264 0.116 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 sc-eQTL 6.58e-01 0.0562 0.127 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000123091 RNF11 -243936 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00333 0.0998 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000185104 FAF1 32070 sc-eQTL 2.31e-01 -0.144 0.12 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000078618 NRDC -886600 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0587 0.145 0.13 gdT L2
ENSG00000085832 EPS15 -526929 sc-eQTL 6.30e-01 0.077 0.159 0.13 gdT L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -584842 sc-eQTL 3.26e-01 0.157 0.159 0.13 gdT L2
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 sc-eQTL 5.60e-01 0.0926 0.158 0.13 gdT L2
ENSG00000123091 RNF11 -243936 sc-eQTL 8.14e-02 -0.272 0.155 0.13 gdT L2
ENSG00000185104 FAF1 32070 sc-eQTL 1.24e-01 0.235 0.152 0.13 gdT L2
ENSG00000078618 NRDC -886600 sc-eQTL 3.82e-01 0.102 0.117 0.14 intMono L2
ENSG00000085832 EPS15 -526929 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0817 0.117 0.14 intMono L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -584842 sc-eQTL 3.30e-01 -0.13 0.133 0.14 intMono L2
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 sc-eQTL 1.63e-01 -0.162 0.116 0.14 intMono L2
ENSG00000123091 RNF11 -243936 sc-eQTL 3.67e-01 -0.103 0.114 0.14 intMono L2
ENSG00000185104 FAF1 32070 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0504 0.121 0.14 intMono L2
ENSG00000078618 NRDC -886600 sc-eQTL 3.51e-01 0.111 0.119 0.138 ncMono L2
ENSG00000085832 EPS15 -526929 sc-eQTL 2.72e-01 -0.12 0.109 0.138 ncMono L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -584842 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0634 0.123 0.138 ncMono L2
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0168 0.121 0.138 ncMono L2
ENSG00000123091 RNF11 -243936 sc-eQTL 1.70e-01 -0.158 0.114 0.138 ncMono L2
ENSG00000185104 FAF1 32070 sc-eQTL 1.57e-01 -0.145 0.102 0.138 ncMono L2
ENSG00000078618 NRDC -886600 sc-eQTL 2.74e-01 0.129 0.117 0.144 pDC L2
ENSG00000085831 TTC39A -352779 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0397 0.114 0.144 pDC L2
ENSG00000085832 EPS15 -526929 sc-eQTL 3.00e-01 0.152 0.146 0.144 pDC L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -584842 sc-eQTL 2.10e-01 -0.178 0.141 0.144 pDC L2
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 sc-eQTL 3.43e-01 -0.115 0.121 0.144 pDC L2
ENSG00000123091 RNF11 -243936 sc-eQTL 2.20e-01 0.129 0.105 0.144 pDC L2
ENSG00000185104 FAF1 32070 sc-eQTL 2.28e-01 0.174 0.144 0.144 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000078618 NRDC -886600 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00648 0.114 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000085832 EPS15 -526929 sc-eQTL 9.13e-02 0.153 0.0903 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000117859 OSBPL9 -584842 sc-eQTL 9.31e-01 -0.011 0.126 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 sc-eQTL 9.78e-01 0.00337 0.121 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000123091 RNF11 -243936 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0336 0.0857 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185104 FAF1 32070 sc-eQTL 4.03e-01 0.0899 0.107 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000078618 NRDC -886600 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00469 0.0927 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000085832 EPS15 -526929 sc-eQTL 9.46e-02 0.145 0.0863 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000117859 OSBPL9 -584842 sc-eQTL 1.31e-01 -0.182 0.12 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 sc-eQTL 5.54e-01 0.0706 0.119 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000123091 RNF11 -243936 sc-eQTL 3.89e-01 0.0861 0.0997 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185104 FAF1 32070 sc-eQTL 8.24e-01 0.0214 0.0963 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000078618 NRDC -886600 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00561 0.0839 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000085832 EPS15 -526929 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00703 0.0842 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000117859 OSBPL9 -584842 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0374 0.0965 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 sc-eQTL 7.20e-01 0.0395 0.11 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000123091 RNF11 -243936 sc-eQTL 9.42e-02 -0.12 0.0714 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000185104 FAF1 32070 sc-eQTL 2.39e-02 -0.227 0.0996 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000078618 NRDC -886600 sc-eQTL 5.35e-01 0.064 0.103 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000085832 EPS15 -526929 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0839 0.101 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000117859 OSBPL9 -584842 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0519 0.123 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0992 0.118 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000123091 RNF11 -243936 sc-eQTL 3.19e-01 -0.103 0.103 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000185104 FAF1 32070 sc-eQTL 2.27e-01 -0.113 0.0935 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000078618 NRDC -886600 sc-eQTL 4.79e-01 0.0659 0.0928 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000085832 EPS15 -526929 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0432 0.0609 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000117859 OSBPL9 -584842 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0283 0.0964 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 sc-eQTL 1.57e-01 0.14 0.0987 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000123091 RNF11 -243936 sc-eQTL 8.16e-01 0.0212 0.0911 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185104 FAF1 32070 sc-eQTL 2.11e-02 0.185 0.0795 0.142 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000117859 OSBPL9 -584842 eQTL 0.028 -0.0461 0.0209 0.0 0.0 0.115
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 eQTL 3.9699999999999997e-54 0.592 0.0358 0.0 0.0 0.115
ENSG00000185104 FAF1 32070 eQTL 0.00351 -0.062 0.0212 0.0 0.0 0.115


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000123080 CDKN2C 31592 1.4e-05 1.53e-05 2.67e-06 8.87e-06 2.48e-06 6.64e-06 1.98e-05 2.46e-06 1.45e-05 7.35e-06 1.87e-05 7.38e-06 2.55e-05 5.77e-06 4.38e-06 9.01e-06 7.72e-06 1.2e-05 4.02e-06 3.86e-06 7.22e-06 1.39e-05 1.4e-05 4.78e-06 2.45e-05 5.14e-06 7.69e-06 6.17e-06 1.53e-05 1.43e-05 1.03e-05 9.94e-07 1.45e-06 4.08e-06 6.33e-06 3.63e-06 1.72e-06 2.39e-06 2.7e-06 1.74e-06 1.12e-06 1.88e-05 2.34e-06 2.1e-07 1.29e-06 2.32e-06 2.18e-06 8.83e-07 6.24e-07
ENSG00000185104 FAF1 32070 1.39e-05 1.52e-05 2.64e-06 8.75e-06 2.51e-06 6.55e-06 1.96e-05 2.45e-06 1.45e-05 7.3e-06 1.84e-05 7.34e-06 2.53e-05 5.63e-06 4.35e-06 8.97e-06 7.67e-06 1.18e-05 3.79e-06 3.83e-06 7.14e-06 1.37e-05 1.39e-05 4.69e-06 2.43e-05 5.17e-06 7.6e-06 6.08e-06 1.53e-05 1.42e-05 1.01e-05 9.64e-07 1.43e-06 4.02e-06 6.28e-06 3.58e-06 1.77e-06 2.38e-06 2.66e-06 1.72e-06 1.12e-06 1.88e-05 2.35e-06 1.96e-07 1.27e-06 2.35e-06 2.15e-06 8.65e-07 6.26e-07