Genes within 1Mb (chr1:50984472:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000078618 NRDC -894465 sc-eQTL 9.48e-01 0.00577 0.088 0.09 B L1
ENSG00000085832 EPS15 -534794 sc-eQTL 1.79e-01 0.116 0.0862 0.09 B L1
ENSG00000117859 OSBPL9 -592707 sc-eQTL 4.83e-02 -0.232 0.117 0.09 B L1
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 sc-eQTL 2.03e-01 0.138 0.108 0.09 B L1
ENSG00000123091 RNF11 -251801 sc-eQTL 1.07e-01 0.164 0.101 0.09 B L1
ENSG00000185104 FAF1 24205 sc-eQTL 1.49e-01 0.165 0.114 0.09 B L1
ENSG00000078618 NRDC -894465 sc-eQTL 9.79e-02 -0.157 0.0942 0.09 CD4T L1
ENSG00000085832 EPS15 -534794 sc-eQTL 6.38e-01 0.0323 0.0685 0.09 CD4T L1
ENSG00000117859 OSBPL9 -592707 sc-eQTL 6.39e-01 -0.057 0.121 0.09 CD4T L1
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 sc-eQTL 3.48e-01 -0.124 0.132 0.09 CD4T L1
ENSG00000123091 RNF11 -251801 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0164 0.101 0.09 CD4T L1
ENSG00000185104 FAF1 24205 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0127 0.0949 0.09 CD4T L1
ENSG00000078618 NRDC -894465 sc-eQTL 7.06e-01 0.0406 0.108 0.09 CD8T L1
ENSG00000085832 EPS15 -534794 sc-eQTL 7.62e-01 0.019 0.0627 0.09 CD8T L1
ENSG00000117859 OSBPL9 -592707 sc-eQTL 3.57e-01 -0.122 0.133 0.09 CD8T L1
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 sc-eQTL 1.47e-01 -0.207 0.143 0.09 CD8T L1
ENSG00000123091 RNF11 -251801 sc-eQTL 8.52e-01 0.0206 0.11 0.09 CD8T L1
ENSG00000185104 FAF1 24205 sc-eQTL 9.96e-01 0.00053 0.109 0.09 CD8T L1
ENSG00000078618 NRDC -894465 sc-eQTL 1.30e-01 0.203 0.133 0.088 DC L1
ENSG00000085831 TTC39A -360644 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0666 0.0979 0.088 DC L1
ENSG00000085832 EPS15 -534794 sc-eQTL 8.33e-01 0.0327 0.155 0.088 DC L1
ENSG00000117859 OSBPL9 -592707 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0569 0.143 0.088 DC L1
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 sc-eQTL 3.35e-01 -0.15 0.155 0.088 DC L1
ENSG00000123091 RNF11 -251801 sc-eQTL 5.98e-02 0.217 0.115 0.088 DC L1
ENSG00000185104 FAF1 24205 sc-eQTL 9.83e-01 0.00298 0.143 0.088 DC L1
ENSG00000078618 NRDC -894465 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00553 0.0941 0.09 Mono L1
ENSG00000085832 EPS15 -534794 sc-eQTL 9.29e-02 -0.168 0.0997 0.09 Mono L1
ENSG00000117859 OSBPL9 -592707 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0212 0.12 0.09 Mono L1
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 sc-eQTL 7.70e-01 -0.04 0.137 0.09 Mono L1
ENSG00000123091 RNF11 -251801 sc-eQTL 8.51e-02 -0.148 0.0854 0.09 Mono L1
ENSG00000185104 FAF1 24205 sc-eQTL 9.14e-02 -0.191 0.113 0.09 Mono L1
ENSG00000078618 NRDC -894465 sc-eQTL 8.65e-01 0.0199 0.117 0.09 NK L1
ENSG00000085832 EPS15 -534794 sc-eQTL 6.47e-02 -0.136 0.0734 0.09 NK L1
ENSG00000117859 OSBPL9 -592707 sc-eQTL 3.19e-01 -0.117 0.117 0.09 NK L1
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 sc-eQTL 3.16e-02 0.257 0.119 0.09 NK L1
ENSG00000123091 RNF11 -251801 sc-eQTL 1.40e-01 0.162 0.109 0.09 NK L1
ENSG00000185104 FAF1 24205 sc-eQTL 9.03e-02 0.166 0.0976 0.09 NK L1
ENSG00000078618 NRDC -894465 sc-eQTL 3.19e-01 -0.113 0.113 0.09 Other_T L1
ENSG00000085832 EPS15 -534794 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000408 0.135 0.09 Other_T L1
ENSG00000117859 OSBPL9 -592707 sc-eQTL 1.08e-01 -0.218 0.135 0.09 Other_T L1
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 sc-eQTL 3.23e-01 0.11 0.111 0.09 Other_T L1
ENSG00000123091 RNF11 -251801 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0669 0.118 0.09 Other_T L1
ENSG00000185104 FAF1 24205 sc-eQTL 5.54e-02 0.212 0.11 0.09 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000078618 NRDC -894465 sc-eQTL 5.76e-01 -0.102 0.182 0.099 B_Activated L2
ENSG00000085832 EPS15 -534794 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0494 0.172 0.099 B_Activated L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -592707 sc-eQTL 6.01e-01 -0.094 0.179 0.099 B_Activated L2
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0916 0.131 0.099 B_Activated L2
ENSG00000123091 RNF11 -251801 sc-eQTL 4.28e-01 0.128 0.161 0.099 B_Activated L2
ENSG00000185104 FAF1 24205 sc-eQTL 1.31e-01 0.245 0.162 0.099 B_Activated L2
ENSG00000078618 NRDC -894465 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0731 0.149 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000085832 EPS15 -534794 sc-eQTL 4.01e-01 0.104 0.123 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -592707 sc-eQTL 8.33e-01 0.0353 0.167 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 sc-eQTL 4.32e-01 -0.108 0.137 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000123091 RNF11 -251801 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0765 0.123 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000185104 FAF1 24205 sc-eQTL 9.05e-01 0.0163 0.136 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000078618 NRDC -894465 sc-eQTL 2.86e-01 -0.161 0.15 0.091 B_Memory L2
ENSG00000085832 EPS15 -534794 sc-eQTL 7.43e-01 0.0407 0.124 0.091 B_Memory L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -592707 sc-eQTL 2.57e-01 -0.175 0.155 0.091 B_Memory L2
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 sc-eQTL 9.44e-01 0.00994 0.14 0.091 B_Memory L2
ENSG00000123091 RNF11 -251801 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0319 0.139 0.091 B_Memory L2
ENSG00000185104 FAF1 24205 sc-eQTL 1.93e-01 0.184 0.141 0.091 B_Memory L2
ENSG00000078618 NRDC -894465 sc-eQTL 4.25e-01 0.102 0.128 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000085832 EPS15 -534794 sc-eQTL 7.70e-01 0.0333 0.114 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -592707 sc-eQTL 1.87e-01 -0.21 0.158 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 sc-eQTL 7.98e-03 0.397 0.148 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000123091 RNF11 -251801 sc-eQTL 9.72e-02 0.209 0.125 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000185104 FAF1 24205 sc-eQTL 5.71e-01 0.0693 0.122 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000078618 NRDC -894465 sc-eQTL 9.61e-01 0.00716 0.147 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000085832 EPS15 -534794 sc-eQTL 5.34e-01 0.0862 0.138 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -592707 sc-eQTL 1.09e-01 -0.254 0.158 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 sc-eQTL 1.93e-01 -0.16 0.123 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000123091 RNF11 -251801 sc-eQTL 4.76e-01 0.105 0.147 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000185104 FAF1 24205 sc-eQTL 3.14e-01 0.136 0.135 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000078618 NRDC -894465 sc-eQTL 2.69e-01 0.194 0.175 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000085832 EPS15 -534794 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0864 0.156 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -592707 sc-eQTL 6.92e-01 0.072 0.181 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 sc-eQTL 3.39e-01 0.166 0.174 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000123091 RNF11 -251801 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0449 0.164 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000185104 FAF1 24205 sc-eQTL 9.09e-01 0.0168 0.147 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000078618 NRDC -894465 sc-eQTL 3.46e-01 -0.105 0.112 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000085832 EPS15 -534794 sc-eQTL 8.63e-01 0.018 0.104 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -592707 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0164 0.136 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0884 0.139 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000123091 RNF11 -251801 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0183 0.0986 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000185104 FAF1 24205 sc-eQTL 9.95e-01 0.000682 0.1 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000078618 NRDC -894465 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0534 0.126 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000085832 EPS15 -534794 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0751 0.0973 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -592707 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00297 0.147 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 sc-eQTL 5.85e-01 -0.082 0.15 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000123091 RNF11 -251801 sc-eQTL 2.64e-01 -0.136 0.121 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000185104 FAF1 24205 sc-eQTL 2.57e-01 -0.141 0.124 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000078618 NRDC -894465 sc-eQTL 3.76e-01 -0.135 0.152 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000085832 EPS15 -534794 sc-eQTL 3.73e-01 0.112 0.126 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -592707 sc-eQTL 6.23e-01 0.0789 0.16 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 sc-eQTL 9.57e-01 0.00853 0.16 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000123091 RNF11 -251801 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0498 0.128 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000185104 FAF1 24205 sc-eQTL 1.56e-02 0.301 0.124 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000078618 NRDC -894465 sc-eQTL 2.60e-01 0.152 0.135 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000085832 EPS15 -534794 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0248 0.116 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -592707 sc-eQTL 5.22e-01 -0.099 0.154 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 sc-eQTL 2.29e-01 -0.181 0.15 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000123091 RNF11 -251801 sc-eQTL 3.27e-01 0.132 0.134 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000185104 FAF1 24205 sc-eQTL 4.46e-02 0.247 0.122 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000078618 NRDC -894465 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0715 0.133 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000085832 EPS15 -534794 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0633 0.12 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -592707 sc-eQTL 3.91e-01 -0.125 0.146 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 sc-eQTL 2.85e-01 -0.171 0.16 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000123091 RNF11 -251801 sc-eQTL 8.31e-01 0.026 0.121 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000185104 FAF1 24205 sc-eQTL 1.54e-01 -0.177 0.124 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000078618 NRDC -894465 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0511 0.159 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000085832 EPS15 -534794 sc-eQTL 8.68e-01 0.0261 0.157 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -592707 sc-eQTL 4.10e-01 -0.14 0.17 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 sc-eQTL 2.22e-01 0.185 0.151 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000123091 RNF11 -251801 sc-eQTL 3.94e-01 -0.135 0.158 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000185104 FAF1 24205 sc-eQTL 7.66e-02 -0.251 0.141 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000078618 NRDC -894465 sc-eQTL 3.44e-01 -0.163 0.171 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000085832 EPS15 -534794 sc-eQTL 2.54e-01 0.178 0.156 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -592707 sc-eQTL 1.11e-01 0.293 0.183 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 sc-eQTL 8.03e-01 0.0434 0.174 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000123091 RNF11 -251801 sc-eQTL 3.39e-01 -0.169 0.176 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000185104 FAF1 24205 sc-eQTL 4.85e-01 0.122 0.174 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000078618 NRDC -894465 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0915 0.156 0.091 MAIT L2
ENSG00000085832 EPS15 -534794 sc-eQTL 3.08e-01 0.14 0.137 0.091 MAIT L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -592707 sc-eQTL 1.29e-01 -0.247 0.162 0.091 MAIT L2
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 sc-eQTL 7.94e-02 0.286 0.162 0.091 MAIT L2
ENSG00000123091 RNF11 -251801 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0426 0.144 0.091 MAIT L2
ENSG00000185104 FAF1 24205 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0723 0.14 0.091 MAIT L2
ENSG00000078618 NRDC -894465 sc-eQTL 1.05e-01 -0.24 0.147 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000085832 EPS15 -534794 sc-eQTL 8.44e-01 0.0291 0.147 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -592707 sc-eQTL 9.96e-01 0.000799 0.163 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 sc-eQTL 6.04e-02 0.284 0.151 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000123091 RNF11 -251801 sc-eQTL 1.97e-01 -0.195 0.151 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000185104 FAF1 24205 sc-eQTL 6.40e-01 0.0661 0.141 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000078618 NRDC -894465 sc-eQTL 9.02e-01 0.0152 0.124 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000085832 EPS15 -534794 sc-eQTL 5.53e-02 -0.187 0.097 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -592707 sc-eQTL 3.45e-01 -0.128 0.135 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 sc-eQTL 6.74e-01 0.0558 0.132 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000123091 RNF11 -251801 sc-eQTL 2.86e-02 0.295 0.134 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000185104 FAF1 24205 sc-eQTL 7.36e-04 0.39 0.114 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000078618 NRDC -894465 sc-eQTL 2.67e-01 -0.196 0.176 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000085832 EPS15 -534794 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0685 0.135 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -592707 sc-eQTL 6.85e-01 0.0664 0.164 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 sc-eQTL 3.23e-01 0.16 0.161 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000123091 RNF11 -251801 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0594 0.16 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000185104 FAF1 24205 sc-eQTL 1.48e-01 -0.22 0.151 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000078618 NRDC -894465 sc-eQTL 2.78e-01 -0.151 0.139 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000085832 EPS15 -534794 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0853 0.107 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -592707 sc-eQTL 9.75e-02 -0.245 0.147 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 sc-eQTL 1.79e-01 0.175 0.13 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000123091 RNF11 -251801 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0968 0.142 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000185104 FAF1 24205 sc-eQTL 3.34e-02 -0.241 0.113 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000078618 NRDC -894465 sc-eQTL 1.35e-01 0.201 0.133 0.096 PB L2
ENSG00000085832 EPS15 -534794 sc-eQTL 1.72e-01 -0.263 0.191 0.096 PB L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -592707 sc-eQTL 4.98e-01 -0.109 0.16 0.096 PB L2
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0962 0.137 0.096 PB L2
ENSG00000123091 RNF11 -251801 sc-eQTL 7.96e-01 0.0488 0.188 0.096 PB L2
ENSG00000185104 FAF1 24205 sc-eQTL 4.54e-01 0.137 0.183 0.096 PB L2
ENSG00000078618 NRDC -894465 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00179 0.135 0.089 Pro_T L2
ENSG00000085832 EPS15 -534794 sc-eQTL 1.96e-01 -0.204 0.157 0.089 Pro_T L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -592707 sc-eQTL 3.30e-01 -0.148 0.152 0.089 Pro_T L2
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0254 0.122 0.089 Pro_T L2
ENSG00000123091 RNF11 -251801 sc-eQTL 1.18e-01 -0.241 0.154 0.089 Pro_T L2
ENSG00000185104 FAF1 24205 sc-eQTL 8.65e-01 0.0215 0.127 0.089 Pro_T L2
ENSG00000078618 NRDC -894465 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0431 0.142 0.09 Treg L2
ENSG00000085832 EPS15 -534794 sc-eQTL 6.93e-01 0.046 0.116 0.09 Treg L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -592707 sc-eQTL 4.24e-01 -0.129 0.161 0.09 Treg L2
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0785 0.142 0.09 Treg L2
ENSG00000123091 RNF11 -251801 sc-eQTL 9.75e-01 0.00475 0.151 0.09 Treg L2
ENSG00000185104 FAF1 24205 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0085 0.135 0.09 Treg L2
ENSG00000078618 NRDC -894465 sc-eQTL 6.28e-01 0.0727 0.15 0.095 cDC L2
ENSG00000085831 TTC39A -360644 sc-eQTL 5.27e-01 -0.031 0.0489 0.095 cDC L2
ENSG00000085832 EPS15 -534794 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0597 0.167 0.095 cDC L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -592707 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0753 0.154 0.095 cDC L2
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0545 0.158 0.095 cDC L2
ENSG00000123091 RNF11 -251801 sc-eQTL 1.23e-01 0.251 0.162 0.095 cDC L2
ENSG00000185104 FAF1 24205 sc-eQTL 9.40e-01 0.011 0.147 0.095 cDC L2
ENSG00000078618 NRDC -894465 sc-eQTL 7.92e-01 0.031 0.118 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000085832 EPS15 -534794 sc-eQTL 3.06e-01 -0.117 0.114 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -592707 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0493 0.131 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0442 0.143 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000123091 RNF11 -251801 sc-eQTL 2.43e-02 -0.21 0.0927 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000185104 FAF1 24205 sc-eQTL 1.17e-01 -0.204 0.13 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000078618 NRDC -894465 sc-eQTL 1.38e-01 -0.184 0.124 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000085832 EPS15 -534794 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0451 0.133 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -592707 sc-eQTL 7.94e-01 0.0381 0.145 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0236 0.158 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000123091 RNF11 -251801 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0657 0.125 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000185104 FAF1 24205 sc-eQTL 3.30e-01 -0.146 0.15 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000078618 NRDC -894465 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00646 0.193 0.082 gdT L2
ENSG00000085832 EPS15 -534794 sc-eQTL 7.68e-01 0.0624 0.211 0.082 gdT L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -592707 sc-eQTL 9.07e-01 0.0247 0.212 0.082 gdT L2
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 sc-eQTL 3.50e-01 0.196 0.209 0.082 gdT L2
ENSG00000123091 RNF11 -251801 sc-eQTL 2.36e-01 -0.246 0.207 0.082 gdT L2
ENSG00000185104 FAF1 24205 sc-eQTL 5.38e-02 0.388 0.2 0.082 gdT L2
ENSG00000078618 NRDC -894465 sc-eQTL 8.18e-01 0.0337 0.146 0.089 intMono L2
ENSG00000085832 EPS15 -534794 sc-eQTL 4.28e-01 -0.116 0.147 0.089 intMono L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -592707 sc-eQTL 9.60e-01 0.00839 0.166 0.089 intMono L2
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0138 0.145 0.089 intMono L2
ENSG00000123091 RNF11 -251801 sc-eQTL 9.02e-01 0.0177 0.143 0.089 intMono L2
ENSG00000185104 FAF1 24205 sc-eQTL 3.73e-01 -0.135 0.152 0.089 intMono L2
ENSG00000078618 NRDC -894465 sc-eQTL 3.09e-01 0.158 0.155 0.084 ncMono L2
ENSG00000085832 EPS15 -534794 sc-eQTL 7.45e-02 -0.254 0.142 0.084 ncMono L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -592707 sc-eQTL 2.82e-01 0.173 0.16 0.084 ncMono L2
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 sc-eQTL 6.25e-01 0.0773 0.158 0.084 ncMono L2
ENSG00000123091 RNF11 -251801 sc-eQTL 6.29e-02 -0.278 0.149 0.084 ncMono L2
ENSG00000185104 FAF1 24205 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0594 0.134 0.084 ncMono L2
ENSG00000078618 NRDC -894465 sc-eQTL 4.47e-01 0.113 0.148 0.088 pDC L2
ENSG00000085831 TTC39A -360644 sc-eQTL 3.04e-01 -0.147 0.142 0.088 pDC L2
ENSG00000085832 EPS15 -534794 sc-eQTL 5.37e-01 0.113 0.183 0.088 pDC L2
ENSG00000117859 OSBPL9 -592707 sc-eQTL 7.22e-01 0.0635 0.178 0.088 pDC L2
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 sc-eQTL 4.38e-01 -0.118 0.152 0.088 pDC L2
ENSG00000123091 RNF11 -251801 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000391 0.132 0.088 pDC L2
ENSG00000185104 FAF1 24205 sc-eQTL 9.93e-01 0.00164 0.181 0.088 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000078618 NRDC -894465 sc-eQTL 7.43e-01 -0.046 0.14 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000085832 EPS15 -534794 sc-eQTL 1.20e-01 0.173 0.111 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000117859 OSBPL9 -592707 sc-eQTL 7.03e-01 -0.059 0.155 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 sc-eQTL 9.54e-01 -0.0085 0.148 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000123091 RNF11 -251801 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0454 0.105 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185104 FAF1 24205 sc-eQTL 2.21e-01 0.161 0.131 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000078618 NRDC -894465 sc-eQTL 9.56e-01 0.00632 0.114 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000085832 EPS15 -534794 sc-eQTL 6.50e-01 0.0487 0.107 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000117859 OSBPL9 -592707 sc-eQTL 4.01e-02 -0.305 0.148 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 sc-eQTL 6.83e-02 0.267 0.146 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000123091 RNF11 -251801 sc-eQTL 1.08e-01 0.198 0.122 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185104 FAF1 24205 sc-eQTL 2.15e-01 0.147 0.118 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000078618 NRDC -894465 sc-eQTL 5.48e-01 -0.063 0.105 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000085832 EPS15 -534794 sc-eQTL 2.62e-01 -0.118 0.105 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000117859 OSBPL9 -592707 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0916 0.12 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0398 0.137 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000123091 RNF11 -251801 sc-eQTL 8.54e-02 -0.154 0.089 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000185104 FAF1 24205 sc-eQTL 3.81e-02 -0.26 0.124 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000078618 NRDC -894465 sc-eQTL 8.17e-01 0.0303 0.13 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000085832 EPS15 -534794 sc-eQTL 7.55e-02 -0.227 0.127 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000117859 OSBPL9 -592707 sc-eQTL 5.10e-01 0.103 0.156 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 sc-eQTL 4.94e-01 0.103 0.15 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000123091 RNF11 -251801 sc-eQTL 4.66e-01 -0.095 0.13 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000185104 FAF1 24205 sc-eQTL 5.66e-01 -0.068 0.118 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000078618 NRDC -894465 sc-eQTL 9.61e-01 0.00568 0.116 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000085832 EPS15 -534794 sc-eQTL 6.55e-02 -0.139 0.0752 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000117859 OSBPL9 -592707 sc-eQTL 2.78e-01 -0.13 0.12 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 sc-eQTL 6.15e-02 0.23 0.122 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000123091 RNF11 -251801 sc-eQTL 9.10e-02 0.191 0.113 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185104 FAF1 24205 sc-eQTL 1.10e-01 0.16 0.0995 0.091 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000117859 OSBPL9 -592707 eQTL 0.000742 -0.0819 0.0242 0.00108 0.0 0.081
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 eQTL 7.04e-95 0.875 0.0377 0.0 0.00219 0.081
ENSG00000185104 FAF1 24205 eQTL 3.29e-05 -0.102 0.0245 0.0028 0.00267 0.081


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000123080 CDKN2C 23727 1.31e-05 1.51e-05 2.64e-06 8.75e-06 2.54e-06 6.44e-06 2.03e-05 2.44e-06 1.45e-05 7.3e-06 1.88e-05 7.38e-06 2.57e-05 5.79e-06 4.47e-06 9.01e-06 8.14e-06 1.22e-05 4.22e-06 4.09e-06 7.4e-06 1.39e-05 1.49e-05 5.03e-06 2.52e-05 5.19e-06 7.65e-06 6.29e-06 1.62e-05 1.68e-05 1.01e-05 1.11e-06 1.51e-06 4.13e-06 6.38e-06 3.83e-06 1.84e-06 2.45e-06 2.95e-06 2.03e-06 1.5e-06 1.86e-05 2.27e-06 2.73e-07 1.67e-06 2.44e-06 2.4e-06 1.11e-06 8.91e-07
ENSG00000185104 FAF1 24205 1.3e-05 1.51e-05 2.59e-06 8.67e-06 2.57e-06 6.33e-06 2.01e-05 2.48e-06 1.42e-05 7.13e-06 1.86e-05 7.21e-06 2.55e-05 5.67e-06 4.5e-06 8.95e-06 8.14e-06 1.21e-05 4.25e-06 4.04e-06 7.22e-06 1.36e-05 1.47e-05 4.96e-06 2.48e-05 5.09e-06 7.67e-06 6.17e-06 1.61e-05 1.65e-05 1e-05 1.1e-06 1.49e-06 4.09e-06 6.33e-06 3.73e-06 1.81e-06 2.49e-06 2.94e-06 2e-06 1.44e-06 1.85e-05 2.24e-06 2.69e-07 1.58e-06 2.36e-06 2.33e-06 1.06e-06 8.3e-07