Genes within 1Mb (chr1:47601321:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079277 MKNK1 984478 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0114 0.186 0.06 B L1
ENSG00000123472 ATPAF1 927454 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0401 0.115 0.06 B L1
ENSG00000132122 SPATA6 -870887 sc-eQTL 6.49e-01 0.0875 0.192 0.06 B L1
ENSG00000142961 MOB3C 984430 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0161 0.178 0.06 B L1
ENSG00000159658 EFCAB14 882207 sc-eQTL 8.74e-01 0.0177 0.112 0.06 B L1
ENSG00000162368 CMPK1 267524 sc-eQTL 3.31e-01 -0.13 0.133 0.06 B L1
ENSG00000079277 MKNK1 984478 sc-eQTL 3.96e-01 0.133 0.157 0.06 CD4T L1
ENSG00000123472 ATPAF1 927454 sc-eQTL 4.07e-01 -0.091 0.109 0.06 CD4T L1
ENSG00000132122 SPATA6 -870887 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0201 0.192 0.06 CD4T L1
ENSG00000142961 MOB3C 984430 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0774 0.13 0.06 CD4T L1
ENSG00000159658 EFCAB14 882207 sc-eQTL 5.73e-01 -0.056 0.0992 0.06 CD4T L1
ENSG00000162368 CMPK1 267524 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0712 0.128 0.06 CD4T L1
ENSG00000079277 MKNK1 984478 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0989 0.176 0.06 CD8T L1
ENSG00000123472 ATPAF1 927454 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0838 0.145 0.06 CD8T L1
ENSG00000142961 MOB3C 984430 sc-eQTL 4.52e-01 0.119 0.157 0.06 CD8T L1
ENSG00000159658 EFCAB14 882207 sc-eQTL 1.30e-01 -0.177 0.117 0.06 CD8T L1
ENSG00000162368 CMPK1 267524 sc-eQTL 9.11e-02 -0.205 0.121 0.06 CD8T L1
ENSG00000079277 MKNK1 984478 sc-eQTL 3.97e-02 -0.351 0.17 0.061 DC L1
ENSG00000123472 ATPAF1 927454 sc-eQTL 2.95e-02 0.398 0.181 0.061 DC L1
ENSG00000123473 STIL 287174 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0474 0.175 0.061 DC L1
ENSG00000132122 SPATA6 -870887 sc-eQTL 2.95e-01 -0.205 0.195 0.061 DC L1
ENSG00000142961 MOB3C 984430 sc-eQTL 8.00e-01 0.0441 0.174 0.061 DC L1
ENSG00000159658 EFCAB14 882207 sc-eQTL 7.26e-01 0.0603 0.172 0.061 DC L1
ENSG00000162366 PDZK1IP1 410277 sc-eQTL 3.78e-02 -0.343 0.164 0.061 DC L1
ENSG00000162368 CMPK1 267524 sc-eQTL 2.91e-01 -0.173 0.163 0.061 DC L1
ENSG00000079277 MKNK1 984478 sc-eQTL 4.09e-01 -0.102 0.124 0.06 Mono L1
ENSG00000123472 ATPAF1 927454 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0844 0.157 0.06 Mono L1
ENSG00000132122 SPATA6 -870887 sc-eQTL 5.04e-01 0.0961 0.144 0.06 Mono L1
ENSG00000142961 MOB3C 984430 sc-eQTL 3.86e-01 0.161 0.186 0.06 Mono L1
ENSG00000159658 EFCAB14 882207 sc-eQTL 3.20e-01 0.127 0.127 0.06 Mono L1
ENSG00000162368 CMPK1 267524 sc-eQTL 6.53e-01 0.0642 0.143 0.06 Mono L1
ENSG00000079277 MKNK1 984478 sc-eQTL 4.69e-01 -0.155 0.214 0.06 NK L1
ENSG00000123472 ATPAF1 927454 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0311 0.157 0.06 NK L1
ENSG00000142961 MOB3C 984430 sc-eQTL 8.82e-02 -0.284 0.166 0.06 NK L1
ENSG00000159658 EFCAB14 882207 sc-eQTL 6.67e-01 0.0549 0.127 0.06 NK L1
ENSG00000162368 CMPK1 267524 sc-eQTL 1.62e-01 -0.171 0.122 0.06 NK L1
ENSG00000079277 MKNK1 984478 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0699 0.183 0.06 Other_T L1
ENSG00000123472 ATPAF1 927454 sc-eQTL 9.32e-01 0.0112 0.132 0.06 Other_T L1
ENSG00000123473 STIL 287174 sc-eQTL 1.76e-01 0.144 0.106 0.06 Other_T L1
ENSG00000142961 MOB3C 984430 sc-eQTL 3.72e-01 -0.166 0.186 0.06 Other_T L1
ENSG00000159658 EFCAB14 882207 sc-eQTL 1.24e-01 -0.2 0.129 0.06 Other_T L1
ENSG00000162368 CMPK1 267524 sc-eQTL 9.62e-02 -0.28 0.168 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079277 MKNK1 984478 sc-eQTL 6.39e-01 0.108 0.229 0.061 B_Activated L2
ENSG00000123472 ATPAF1 927454 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0559 0.219 0.061 B_Activated L2
ENSG00000132122 SPATA6 -870887 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0148 0.179 0.061 B_Activated L2
ENSG00000142961 MOB3C 984430 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0122 0.185 0.061 B_Activated L2
ENSG00000159658 EFCAB14 882207 sc-eQTL 8.12e-01 0.0537 0.226 0.061 B_Activated L2
ENSG00000162368 CMPK1 267524 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0311 0.214 0.061 B_Activated L2
ENSG00000079277 MKNK1 984478 sc-eQTL 5.23e-01 -0.133 0.208 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000123472 ATPAF1 927454 sc-eQTL 2.20e-01 -0.209 0.17 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000132122 SPATA6 -870887 sc-eQTL 9.65e-02 0.322 0.193 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000142961 MOB3C 984430 sc-eQTL 3.65e-01 0.178 0.196 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000159658 EFCAB14 882207 sc-eQTL 6.79e-01 -0.07 0.169 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000162368 CMPK1 267524 sc-eQTL 6.77e-02 -0.298 0.162 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000079277 MKNK1 984478 sc-eQTL 5.47e-01 0.13 0.215 0.06 B_Memory L2
ENSG00000123472 ATPAF1 927454 sc-eQTL 9.47e-01 0.0131 0.196 0.06 B_Memory L2
ENSG00000132122 SPATA6 -870887 sc-eQTL 4.78e-01 -0.131 0.185 0.06 B_Memory L2
ENSG00000142961 MOB3C 984430 sc-eQTL 6.84e-01 0.0801 0.197 0.06 B_Memory L2
ENSG00000159658 EFCAB14 882207 sc-eQTL 2.20e-01 0.227 0.184 0.06 B_Memory L2
ENSG00000162368 CMPK1 267524 sc-eQTL 7.37e-01 -0.061 0.181 0.06 B_Memory L2
ENSG00000079277 MKNK1 984478 sc-eQTL 7.86e-01 0.0525 0.193 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000123472 ATPAF1 927454 sc-eQTL 2.20e-01 -0.197 0.16 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000132122 SPATA6 -870887 sc-eQTL 4.92e-01 0.134 0.195 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000142961 MOB3C 984430 sc-eQTL 3.11e-01 -0.196 0.193 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000159658 EFCAB14 882207 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0772 0.136 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000162368 CMPK1 267524 sc-eQTL 4.50e-01 -0.118 0.156 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000079277 MKNK1 984478 sc-eQTL 7.52e-01 0.0632 0.2 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000123472 ATPAF1 927454 sc-eQTL 1.97e-01 0.23 0.178 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000132122 SPATA6 -870887 sc-eQTL 5.94e-01 -0.108 0.201 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000142961 MOB3C 984430 sc-eQTL 5.10e-02 -0.355 0.181 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000159658 EFCAB14 882207 sc-eQTL 4.22e-01 0.123 0.153 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000162368 CMPK1 267524 sc-eQTL 2.36e-01 0.198 0.166 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000079277 MKNK1 984478 sc-eQTL 2.07e-01 -0.28 0.221 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000123472 ATPAF1 927454 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0478 0.205 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000132122 SPATA6 -870887 sc-eQTL 7.61e-01 0.0558 0.183 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000142961 MOB3C 984430 sc-eQTL 7.66e-01 0.0597 0.201 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000159658 EFCAB14 882207 sc-eQTL 1.14e-01 0.316 0.199 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000162368 CMPK1 267524 sc-eQTL 9.95e-01 -0.00123 0.207 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000079277 MKNK1 984478 sc-eQTL 5.62e-01 0.109 0.187 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000123472 ATPAF1 927454 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0623 0.122 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000132122 SPATA6 -870887 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0458 0.2 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000142961 MOB3C 984430 sc-eQTL 9.64e-02 -0.237 0.142 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000159658 EFCAB14 882207 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0565 0.107 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000162368 CMPK1 267524 sc-eQTL 3.68e-01 -0.11 0.122 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000079277 MKNK1 984478 sc-eQTL 4.47e-02 0.41 0.203 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 927454 sc-eQTL 2.07e-01 -0.195 0.154 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000132122 SPATA6 -870887 sc-eQTL 8.26e-01 -0.043 0.195 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000142961 MOB3C 984430 sc-eQTL 5.67e-01 -0.102 0.178 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 882207 sc-eQTL 4.21e-01 -0.107 0.132 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000162368 CMPK1 267524 sc-eQTL 1.75e-01 -0.184 0.135 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000079277 MKNK1 984478 sc-eQTL 4.65e-01 0.146 0.199 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 927454 sc-eQTL 1.42e-01 -0.233 0.158 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000132122 SPATA6 -870887 sc-eQTL 9.27e-01 0.019 0.209 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000142961 MOB3C 984430 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0895 0.2 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 882207 sc-eQTL 6.12e-01 0.0777 0.153 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000162368 CMPK1 267524 sc-eQTL 5.50e-01 -0.103 0.172 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000079277 MKNK1 984478 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0359 0.202 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000123472 ATPAF1 927454 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0311 0.158 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000142961 MOB3C 984430 sc-eQTL 2.29e-01 -0.221 0.183 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000159658 EFCAB14 882207 sc-eQTL 8.79e-01 0.0237 0.156 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000162368 CMPK1 267524 sc-eQTL 1.22e-01 -0.24 0.155 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000079277 MKNK1 984478 sc-eQTL 9.25e-01 0.0191 0.201 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000123472 ATPAF1 927454 sc-eQTL 9.04e-01 0.0178 0.147 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000142961 MOB3C 984430 sc-eQTL 8.12e-02 0.297 0.17 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000159658 EFCAB14 882207 sc-eQTL 9.09e-02 -0.273 0.161 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000162368 CMPK1 267524 sc-eQTL 1.56e-01 -0.215 0.151 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000079277 MKNK1 984478 sc-eQTL 1.63e-01 -0.3 0.214 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 927454 sc-eQTL 4.01e-01 0.156 0.186 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000142961 MOB3C 984430 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0839 0.2 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 882207 sc-eQTL 1.89e-01 0.247 0.188 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000162368 CMPK1 267524 sc-eQTL 2.69e-01 -0.196 0.176 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000079277 MKNK1 984478 sc-eQTL 2.48e-01 0.245 0.211 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 927454 sc-eQTL 5.25e-01 -0.124 0.194 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000142961 MOB3C 984430 sc-eQTL 3.72e-01 0.173 0.194 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 882207 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0509 0.193 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000162368 CMPK1 267524 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0291 0.192 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000079277 MKNK1 984478 sc-eQTL 6.05e-01 0.0917 0.177 0.061 MAIT L2
ENSG00000123472 ATPAF1 927454 sc-eQTL 1.24e-01 -0.265 0.172 0.061 MAIT L2
ENSG00000123473 STIL 287174 sc-eQTL 3.62e-01 0.156 0.171 0.061 MAIT L2
ENSG00000142961 MOB3C 984430 sc-eQTL 1.95e-02 -0.43 0.183 0.061 MAIT L2
ENSG00000159658 EFCAB14 882207 sc-eQTL 6.66e-01 0.0728 0.169 0.061 MAIT L2
ENSG00000162368 CMPK1 267524 sc-eQTL 1.24e-01 -0.263 0.171 0.061 MAIT L2
ENSG00000079277 MKNK1 984478 sc-eQTL 1.59e-01 0.295 0.209 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000123472 ATPAF1 927454 sc-eQTL 6.09e-02 0.356 0.189 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000142961 MOB3C 984430 sc-eQTL 9.56e-01 -0.0107 0.196 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000159658 EFCAB14 882207 sc-eQTL 5.41e-01 0.119 0.194 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000162368 CMPK1 267524 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0902 0.195 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000079277 MKNK1 984478 sc-eQTL 2.41e-01 -0.26 0.221 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000123472 ATPAF1 927454 sc-eQTL 4.20e-01 -0.14 0.174 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000142961 MOB3C 984430 sc-eQTL 2.51e-01 -0.207 0.18 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000159658 EFCAB14 882207 sc-eQTL 8.63e-01 -0.025 0.145 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000162368 CMPK1 267524 sc-eQTL 1.06e-02 -0.376 0.146 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000079277 MKNK1 984478 sc-eQTL 3.52e-01 -0.195 0.209 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000123472 ATPAF1 927454 sc-eQTL 7.44e-01 0.0676 0.206 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000142961 MOB3C 984430 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0372 0.19 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000159658 EFCAB14 882207 sc-eQTL 6.90e-01 0.069 0.173 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000162368 CMPK1 267524 sc-eQTL 4.86e-02 0.376 0.189 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000079277 MKNK1 984478 sc-eQTL 7.53e-01 0.0658 0.208 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000123472 ATPAF1 927454 sc-eQTL 5.12e-01 -0.113 0.172 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000142961 MOB3C 984430 sc-eQTL 3.58e-01 -0.172 0.187 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000159658 EFCAB14 882207 sc-eQTL 8.76e-01 0.0254 0.163 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000162368 CMPK1 267524 sc-eQTL 5.22e-01 -0.114 0.178 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000079277 MKNK1 984478 sc-eQTL 5.58e-01 -0.147 0.251 0.059 PB L2
ENSG00000123472 ATPAF1 927454 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0731 0.168 0.059 PB L2
ENSG00000132122 SPATA6 -870887 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0305 0.17 0.059 PB L2
ENSG00000142961 MOB3C 984430 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0952 0.227 0.059 PB L2
ENSG00000159658 EFCAB14 882207 sc-eQTL 4.16e-01 -0.178 0.218 0.059 PB L2
ENSG00000162368 CMPK1 267524 sc-eQTL 5.30e-01 -0.142 0.225 0.059 PB L2
ENSG00000079277 MKNK1 984478 sc-eQTL 8.38e-01 0.0431 0.211 0.059 Pro_T L2
ENSG00000123472 ATPAF1 927454 sc-eQTL 1.68e-02 0.394 0.163 0.059 Pro_T L2
ENSG00000123473 STIL 287174 sc-eQTL 3.42e-01 -0.122 0.128 0.059 Pro_T L2
ENSG00000142961 MOB3C 984430 sc-eQTL 8.35e-01 0.0397 0.19 0.059 Pro_T L2
ENSG00000159658 EFCAB14 882207 sc-eQTL 1.50e-01 -0.245 0.169 0.059 Pro_T L2
ENSG00000162368 CMPK1 267524 sc-eQTL 1.23e-01 -0.291 0.187 0.059 Pro_T L2
ENSG00000079277 MKNK1 984478 sc-eQTL 5.63e-01 -0.115 0.199 0.06 Treg L2
ENSG00000123472 ATPAF1 927454 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0542 0.168 0.06 Treg L2
ENSG00000132122 SPATA6 -870887 sc-eQTL 8.41e-01 0.0334 0.167 0.06 Treg L2
ENSG00000142961 MOB3C 984430 sc-eQTL 3.03e-01 0.188 0.182 0.06 Treg L2
ENSG00000159658 EFCAB14 882207 sc-eQTL 8.56e-01 0.0301 0.165 0.06 Treg L2
ENSG00000162368 CMPK1 267524 sc-eQTL 4.50e-01 -0.115 0.152 0.06 Treg L2
ENSG00000079277 MKNK1 984478 sc-eQTL 3.81e-02 -0.379 0.182 0.061 cDC L2
ENSG00000123472 ATPAF1 927454 sc-eQTL 6.30e-02 0.375 0.2 0.061 cDC L2
ENSG00000123473 STIL 287174 sc-eQTL 6.38e-01 0.0825 0.175 0.061 cDC L2
ENSG00000132122 SPATA6 -870887 sc-eQTL 2.57e-01 -0.235 0.206 0.061 cDC L2
ENSG00000142961 MOB3C 984430 sc-eQTL 9.92e-01 0.00189 0.179 0.061 cDC L2
ENSG00000159658 EFCAB14 882207 sc-eQTL 5.42e-01 0.123 0.202 0.061 cDC L2
ENSG00000162366 PDZK1IP1 410277 sc-eQTL 1.89e-01 -0.222 0.169 0.061 cDC L2
ENSG00000162368 CMPK1 267524 sc-eQTL 1.32e-01 -0.287 0.19 0.061 cDC L2
ENSG00000079277 MKNK1 984478 sc-eQTL 9.03e-01 0.0159 0.131 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000123472 ATPAF1 927454 sc-eQTL 5.32e-01 -0.105 0.167 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000132122 SPATA6 -870887 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0464 0.173 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000142961 MOB3C 984430 sc-eQTL 6.17e-01 0.102 0.203 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000159658 EFCAB14 882207 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0383 0.144 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000162368 CMPK1 267524 sc-eQTL 4.98e-01 0.106 0.157 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000079277 MKNK1 984478 sc-eQTL 8.33e-01 0.0334 0.158 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000123472 ATPAF1 927454 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0681 0.185 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000132122 SPATA6 -870887 sc-eQTL 6.54e-01 0.084 0.187 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000142961 MOB3C 984430 sc-eQTL 1.27e-01 0.3 0.196 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000159658 EFCAB14 882207 sc-eQTL 3.27e-01 0.152 0.155 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000162368 CMPK1 267524 sc-eQTL 3.81e-01 -0.158 0.179 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000079277 MKNK1 984478 sc-eQTL 5.02e-01 -0.172 0.256 0.055 gdT L2
ENSG00000123472 ATPAF1 927454 sc-eQTL 9.69e-01 0.00858 0.224 0.055 gdT L2
ENSG00000123473 STIL 287174 sc-eQTL 5.22e-03 0.548 0.193 0.055 gdT L2
ENSG00000142961 MOB3C 984430 sc-eQTL 9.28e-01 0.0214 0.236 0.055 gdT L2
ENSG00000159658 EFCAB14 882207 sc-eQTL 1.86e-02 -0.506 0.213 0.055 gdT L2
ENSG00000162368 CMPK1 267524 sc-eQTL 6.52e-01 -0.104 0.231 0.055 gdT L2
ENSG00000079277 MKNK1 984478 sc-eQTL 2.12e-02 -0.391 0.168 0.062 intMono L2
ENSG00000123472 ATPAF1 927454 sc-eQTL 7.47e-01 0.0653 0.202 0.062 intMono L2
ENSG00000132122 SPATA6 -870887 sc-eQTL 4.71e-01 -0.14 0.194 0.062 intMono L2
ENSG00000142961 MOB3C 984430 sc-eQTL 4.10e-01 -0.165 0.199 0.062 intMono L2
ENSG00000159658 EFCAB14 882207 sc-eQTL 2.83e-01 0.179 0.166 0.062 intMono L2
ENSG00000162368 CMPK1 267524 sc-eQTL 9.56e-01 0.0106 0.192 0.062 intMono L2
ENSG00000079277 MKNK1 984478 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0399 0.155 0.063 ncMono L2
ENSG00000123472 ATPAF1 927454 sc-eQTL 4.93e-01 0.131 0.19 0.063 ncMono L2
ENSG00000132122 SPATA6 -870887 sc-eQTL 7.67e-01 0.0469 0.158 0.063 ncMono L2
ENSG00000142961 MOB3C 984430 sc-eQTL 2.93e-01 0.21 0.199 0.063 ncMono L2
ENSG00000159658 EFCAB14 882207 sc-eQTL 9.23e-01 0.0183 0.189 0.063 ncMono L2
ENSG00000162368 CMPK1 267524 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0437 0.184 0.063 ncMono L2
ENSG00000079277 MKNK1 984478 sc-eQTL 5.12e-01 0.147 0.224 0.054 pDC L2
ENSG00000123472 ATPAF1 927454 sc-eQTL 2.10e-01 0.288 0.229 0.054 pDC L2
ENSG00000123473 STIL 287174 sc-eQTL 9.30e-01 0.0167 0.189 0.054 pDC L2
ENSG00000132122 SPATA6 -870887 sc-eQTL 8.22e-01 0.0484 0.214 0.054 pDC L2
ENSG00000142961 MOB3C 984430 sc-eQTL 1.43e-01 0.318 0.216 0.054 pDC L2
ENSG00000159658 EFCAB14 882207 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0558 0.195 0.054 pDC L2
ENSG00000162366 PDZK1IP1 410277 sc-eQTL 6.32e-02 -0.322 0.172 0.054 pDC L2
ENSG00000162368 CMPK1 267524 sc-eQTL 9.33e-01 0.0175 0.208 0.054 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079277 MKNK1 984478 sc-eQTL 4.23e-01 0.168 0.209 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 927454 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0717 0.155 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132122 SPATA6 -870887 sc-eQTL 7.71e-02 0.347 0.195 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 984430 sc-eQTL 4.40e-01 0.15 0.194 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 882207 sc-eQTL 9.60e-01 0.00769 0.155 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 267524 sc-eQTL 1.12e-01 -0.25 0.156 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 984478 sc-eQTL 6.49e-01 0.0869 0.191 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 927454 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0314 0.162 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132122 SPATA6 -870887 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00578 0.198 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 984430 sc-eQTL 6.20e-02 -0.341 0.182 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 882207 sc-eQTL 8.94e-01 -0.017 0.127 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 267524 sc-eQTL 8.45e-01 0.0303 0.155 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 984478 sc-eQTL 9.25e-01 0.0121 0.127 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 927454 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0625 0.162 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000132122 SPATA6 -870887 sc-eQTL 8.90e-01 0.0232 0.167 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 984430 sc-eQTL 2.17e-01 0.234 0.189 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 882207 sc-eQTL 6.62e-01 0.0584 0.133 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 267524 sc-eQTL 5.08e-01 0.0958 0.144 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 984478 sc-eQTL 8.25e-02 -0.222 0.127 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 927454 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0156 0.177 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000132122 SPATA6 -870887 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0662 0.143 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 984430 sc-eQTL 2.96e-01 -0.205 0.196 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 882207 sc-eQTL 2.30e-01 0.2 0.166 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 267524 sc-eQTL 2.91e-01 -0.176 0.166 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 984478 sc-eQTL 3.49e-01 -0.207 0.22 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 927454 sc-eQTL 3.58e-01 -0.148 0.16 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 984430 sc-eQTL 1.42e-01 -0.255 0.173 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 882207 sc-eQTL 7.08e-01 0.05 0.133 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 267524 sc-eQTL 1.76e-01 -0.17 0.125 0.06 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000224805 LINC00853 422071 eQTL 0.00718 -0.104 0.0385 0.0 0.0 0.0707
ENSG00000272491 AL109659.2 -628240 eQTL 0.034 0.128 0.0605 0.0 0.0 0.0707


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000142961 \N 984430 2.64e-07 1.19e-07 3.69e-08 1.8e-07 8.83e-08 9.87e-08 1.42e-07 5.49e-08 1.4e-07 4.4e-08 1.59e-07 7.88e-08 1.33e-07 6.21e-08 5.84e-08 7.26e-08 3.9e-08 1.14e-07 5.36e-08 4.21e-08 1.05e-07 1.27e-07 1.32e-07 4.16e-08 1.32e-07 1.16e-07 1.11e-07 9.32e-08 1.05e-07 1.12e-07 9.73e-08 3.7e-08 3.28e-08 8.65e-08 8.82e-08 3.77e-08 5.01e-08 9.22e-08 6.78e-08 3.55e-08 4.46e-08 1.33e-07 4.89e-08 7.56e-09 5.75e-08 1.83e-08 1.22e-07 3.99e-09 4.94e-08
ENSG00000224805 LINC00853 422071 8.21e-07 6.81e-07 1.24e-07 4.31e-07 9.33e-08 2.42e-07 5.8e-07 1.09e-07 4.3e-07 2.34e-07 5.93e-07 3.3e-07 7.93e-07 1.41e-07 2.77e-07 2.45e-07 3.93e-07 3.95e-07 2.65e-07 1.73e-07 2.05e-07 3.87e-07 3.81e-07 1.58e-07 9.71e-07 2.56e-07 2.72e-07 2.7e-07 3.99e-07 5.17e-07 3.32e-07 5.77e-08 5.39e-08 1.36e-07 3e-07 1.02e-07 8.43e-08 1.09e-07 6.58e-08 2.65e-08 6.31e-08 6.27e-07 6.11e-08 4.16e-08 1.45e-07 1.42e-08 1.04e-07 1.77e-08 5.95e-08