Genes within 1Mb (chr1:47515244:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079277 MKNK1 898401 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0307 0.0986 0.237 B L1
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 sc-eQTL 2.25e-01 0.0742 0.0609 0.237 B L1
ENSG00000132122 SPATA6 -956964 sc-eQTL 9.21e-01 0.0101 0.102 0.237 B L1
ENSG00000142961 MOB3C 898353 sc-eQTL 4.40e-01 0.0728 0.094 0.237 B L1
ENSG00000159658 EFCAB14 796130 sc-eQTL 2.87e-01 0.063 0.059 0.237 B L1
ENSG00000162368 CMPK1 181447 sc-eQTL 2.86e-01 0.0752 0.0704 0.237 B L1
ENSG00000079277 MKNK1 898401 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0625 0.0838 0.237 CD4T L1
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0311 0.0585 0.237 CD4T L1
ENSG00000132122 SPATA6 -956964 sc-eQTL 5.37e-01 0.0632 0.102 0.237 CD4T L1
ENSG00000142961 MOB3C 898353 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0386 0.0694 0.237 CD4T L1
ENSG00000159658 EFCAB14 796130 sc-eQTL 5.03e-01 0.0355 0.0529 0.237 CD4T L1
ENSG00000162368 CMPK1 181447 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0231 0.0684 0.237 CD4T L1
ENSG00000079277 MKNK1 898401 sc-eQTL 1.80e-02 -0.214 0.0898 0.237 CD8T L1
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 sc-eQTL 2.14e-01 -0.0935 0.075 0.237 CD8T L1
ENSG00000142961 MOB3C 898353 sc-eQTL 6.42e-01 0.0379 0.0815 0.237 CD8T L1
ENSG00000159658 EFCAB14 796130 sc-eQTL 3.46e-02 0.128 0.06 0.237 CD8T L1
ENSG00000162368 CMPK1 181447 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0695 0.0627 0.237 CD8T L1
ENSG00000079277 MKNK1 898401 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0473 0.0963 0.23 DC L1
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 sc-eQTL 1.94e-01 -0.134 0.103 0.23 DC L1
ENSG00000123473 STIL 201097 sc-eQTL 3.49e-01 0.0921 0.0981 0.23 DC L1
ENSG00000132122 SPATA6 -956964 sc-eQTL 9.44e-01 0.00775 0.11 0.23 DC L1
ENSG00000142961 MOB3C 898353 sc-eQTL 6.72e-01 0.0414 0.0977 0.23 DC L1
ENSG00000159658 EFCAB14 796130 sc-eQTL 6.99e-01 0.0373 0.0966 0.23 DC L1
ENSG00000162366 PDZK1IP1 324200 sc-eQTL 6.71e-01 0.0396 0.0932 0.23 DC L1
ENSG00000162368 CMPK1 181447 sc-eQTL 6.08e-02 0.172 0.0912 0.23 DC L1
ENSG00000079277 MKNK1 898401 sc-eQTL 9.30e-02 -0.112 0.0662 0.237 Mono L1
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0487 0.0846 0.237 Mono L1
ENSG00000132122 SPATA6 -956964 sc-eQTL 9.60e-01 0.00384 0.0773 0.237 Mono L1
ENSG00000142961 MOB3C 898353 sc-eQTL 5.30e-01 0.0627 0.0998 0.237 Mono L1
ENSG00000159658 EFCAB14 796130 sc-eQTL 4.58e-01 0.0509 0.0684 0.237 Mono L1
ENSG00000162368 CMPK1 181447 sc-eQTL 9.34e-01 0.00632 0.0767 0.237 Mono L1
ENSG00000079277 MKNK1 898401 sc-eQTL 8.72e-01 0.0181 0.112 0.238 NK L1
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 sc-eQTL 3.93e-01 0.0702 0.082 0.238 NK L1
ENSG00000142961 MOB3C 898353 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0279 0.0876 0.238 NK L1
ENSG00000159658 EFCAB14 796130 sc-eQTL 6.27e-02 0.124 0.0662 0.238 NK L1
ENSG00000162368 CMPK1 181447 sc-eQTL 6.82e-01 0.0263 0.0641 0.238 NK L1
ENSG00000079277 MKNK1 898401 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0524 0.0936 0.237 Other_T L1
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 sc-eQTL 9.69e-01 -0.0026 0.0673 0.237 Other_T L1
ENSG00000123473 STIL 201097 sc-eQTL 8.66e-01 -0.00916 0.0544 0.237 Other_T L1
ENSG00000142961 MOB3C 898353 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0764 0.0948 0.237 Other_T L1
ENSG00000159658 EFCAB14 796130 sc-eQTL 6.63e-01 -0.029 0.0664 0.237 Other_T L1
ENSG00000162368 CMPK1 181447 sc-eQTL 8.68e-01 0.0143 0.0862 0.237 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079277 MKNK1 898401 sc-eQTL 5.70e-01 0.0693 0.122 0.237 B_Activated L2
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 sc-eQTL 1.15e-01 -0.183 0.116 0.237 B_Activated L2
ENSG00000132122 SPATA6 -956964 sc-eQTL 3.09e-02 0.204 0.0938 0.237 B_Activated L2
ENSG00000142961 MOB3C 898353 sc-eQTL 3.43e-02 -0.207 0.097 0.237 B_Activated L2
ENSG00000159658 EFCAB14 796130 sc-eQTL 9.91e-01 0.0014 0.12 0.237 B_Activated L2
ENSG00000162368 CMPK1 181447 sc-eQTL 2.20e-01 -0.139 0.113 0.237 B_Activated L2
ENSG00000079277 MKNK1 898401 sc-eQTL 2.09e-01 -0.139 0.11 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0541 0.0903 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000132122 SPATA6 -956964 sc-eQTL 3.18e-01 0.103 0.103 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000142961 MOB3C 898353 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00214 0.104 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000159658 EFCAB14 796130 sc-eQTL 1.86e-02 0.21 0.0883 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000162368 CMPK1 181447 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000716 0.0866 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000079277 MKNK1 898401 sc-eQTL 2.49e-01 -0.127 0.11 0.235 B_Memory L2
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0266 0.0999 0.235 B_Memory L2
ENSG00000132122 SPATA6 -956964 sc-eQTL 7.53e-01 0.0296 0.0942 0.235 B_Memory L2
ENSG00000142961 MOB3C 898353 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0128 0.1 0.235 B_Memory L2
ENSG00000159658 EFCAB14 796130 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00685 0.0943 0.235 B_Memory L2
ENSG00000162368 CMPK1 181447 sc-eQTL 8.83e-01 0.0136 0.0924 0.235 B_Memory L2
ENSG00000079277 MKNK1 898401 sc-eQTL 7.29e-01 0.0371 0.107 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 sc-eQTL 6.94e-01 0.035 0.0887 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000132122 SPATA6 -956964 sc-eQTL 9.65e-02 -0.178 0.107 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000142961 MOB3C 898353 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0218 0.107 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000159658 EFCAB14 796130 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0416 0.0753 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000162368 CMPK1 181447 sc-eQTL 4.70e-01 0.0624 0.0863 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000079277 MKNK1 898401 sc-eQTL 3.88e-01 0.0947 0.11 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 sc-eQTL 2.55e-01 0.112 0.0977 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000132122 SPATA6 -956964 sc-eQTL 2.73e-01 0.121 0.11 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000142961 MOB3C 898353 sc-eQTL 1.77e-01 0.135 0.0997 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000159658 EFCAB14 796130 sc-eQTL 9.30e-01 0.00738 0.0841 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000162368 CMPK1 181447 sc-eQTL 7.66e-01 0.0273 0.0915 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000079277 MKNK1 898401 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00417 0.113 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 sc-eQTL 8.19e-02 0.181 0.103 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000132122 SPATA6 -956964 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0327 0.0929 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000142961 MOB3C 898353 sc-eQTL 7.69e-01 0.0299 0.102 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000159658 EFCAB14 796130 sc-eQTL 4.84e-01 0.0714 0.102 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000162368 CMPK1 181447 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0807 0.105 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000079277 MKNK1 898401 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0152 0.0988 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0612 0.0645 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000132122 SPATA6 -956964 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0873 0.105 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000142961 MOB3C 898353 sc-eQTL 5.44e-01 -0.046 0.0756 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000159658 EFCAB14 796130 sc-eQTL 5.32e-01 0.0356 0.0568 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000162368 CMPK1 181447 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0266 0.0649 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000079277 MKNK1 898401 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0973 0.111 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 sc-eQTL 9.93e-01 0.00074 0.0836 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000132122 SPATA6 -956964 sc-eQTL 6.20e-02 0.196 0.105 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000142961 MOB3C 898353 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0306 0.096 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 796130 sc-eQTL 6.85e-01 0.029 0.0714 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000162368 CMPK1 181447 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0562 0.073 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000079277 MKNK1 898401 sc-eQTL 4.65e-01 0.0793 0.108 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 sc-eQTL 5.36e-01 0.0535 0.0864 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000132122 SPATA6 -956964 sc-eQTL 2.40e-01 0.133 0.113 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000142961 MOB3C 898353 sc-eQTL 6.08e-01 0.0559 0.109 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 796130 sc-eQTL 9.20e-02 -0.14 0.0829 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000162368 CMPK1 181447 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0762 0.0936 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000079277 MKNK1 898401 sc-eQTL 1.01e-01 -0.174 0.106 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0836 0.0831 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000142961 MOB3C 898353 sc-eQTL 3.12e-01 0.0981 0.0968 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000159658 EFCAB14 796130 sc-eQTL 3.73e-02 0.171 0.0817 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000162368 CMPK1 181447 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0372 0.0823 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000079277 MKNK1 898401 sc-eQTL 2.31e-01 -0.129 0.107 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0498 0.0787 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000142961 MOB3C 898353 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0669 0.0912 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000159658 EFCAB14 796130 sc-eQTL 9.41e-02 0.145 0.086 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000162368 CMPK1 181447 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0184 0.081 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000079277 MKNK1 898401 sc-eQTL 5.39e-01 0.0713 0.116 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 sc-eQTL 5.13e-02 0.195 0.0992 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000142961 MOB3C 898353 sc-eQTL 1.82e-01 0.144 0.107 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 796130 sc-eQTL 2.09e-01 0.128 0.101 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000162368 CMPK1 181447 sc-eQTL 8.67e-01 0.0159 0.0953 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000079277 MKNK1 898401 sc-eQTL 8.49e-01 0.0213 0.111 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0478 0.102 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000142961 MOB3C 898353 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0147 0.102 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 796130 sc-eQTL 6.29e-01 -0.049 0.101 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000162368 CMPK1 181447 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00756 0.101 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000079277 MKNK1 898401 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0712 0.0911 0.236 MAIT L2
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 sc-eQTL 5.02e-01 0.0599 0.0891 0.236 MAIT L2
ENSG00000123473 STIL 201097 sc-eQTL 6.10e-01 0.0451 0.0883 0.236 MAIT L2
ENSG00000142961 MOB3C 898353 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0796 0.0953 0.236 MAIT L2
ENSG00000159658 EFCAB14 796130 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0351 0.0869 0.236 MAIT L2
ENSG00000162368 CMPK1 181447 sc-eQTL 1.79e-01 0.119 0.088 0.236 MAIT L2
ENSG00000079277 MKNK1 898401 sc-eQTL 4.22e-02 0.222 0.108 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 sc-eQTL 4.82e-01 0.07 0.0995 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000142961 MOB3C 898353 sc-eQTL 1.21e-01 -0.159 0.102 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000159658 EFCAB14 796130 sc-eQTL 3.40e-01 0.0968 0.101 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000162368 CMPK1 181447 sc-eQTL 5.44e-01 0.0617 0.102 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000079277 MKNK1 898401 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0206 0.116 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 sc-eQTL 8.92e-01 0.0123 0.0906 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000142961 MOB3C 898353 sc-eQTL 9.77e-01 0.00274 0.0941 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000159658 EFCAB14 796130 sc-eQTL 2.66e-02 0.167 0.0746 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000162368 CMPK1 181447 sc-eQTL 3.45e-01 0.0728 0.0769 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000079277 MKNK1 898401 sc-eQTL 3.25e-01 0.107 0.109 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 sc-eQTL 9.30e-01 0.00942 0.107 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000142961 MOB3C 898353 sc-eQTL 3.17e-01 0.099 0.0986 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000159658 EFCAB14 796130 sc-eQTL 6.17e-01 0.0448 0.0896 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000162368 CMPK1 181447 sc-eQTL 6.63e-02 0.182 0.0985 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000079277 MKNK1 898401 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0271 0.11 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 sc-eQTL 5.56e-01 0.0535 0.0906 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000142961 MOB3C 898353 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0394 0.0983 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000159658 EFCAB14 796130 sc-eQTL 5.48e-01 0.0515 0.0857 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000162368 CMPK1 181447 sc-eQTL 5.85e-01 0.0512 0.0936 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000079277 MKNK1 898401 sc-eQTL 5.54e-01 0.0786 0.132 0.233 PB L2
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 sc-eQTL 7.21e-01 0.0318 0.0889 0.233 PB L2
ENSG00000132122 SPATA6 -956964 sc-eQTL 2.39e-02 0.2 0.0875 0.233 PB L2
ENSG00000142961 MOB3C 898353 sc-eQTL 2.35e-01 0.142 0.119 0.233 PB L2
ENSG00000159658 EFCAB14 796130 sc-eQTL 6.77e-01 0.0484 0.116 0.233 PB L2
ENSG00000162368 CMPK1 181447 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0157 0.119 0.233 PB L2
ENSG00000079277 MKNK1 898401 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0492 0.112 0.237 Pro_T L2
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 sc-eQTL 9.31e-02 -0.147 0.0871 0.237 Pro_T L2
ENSG00000123473 STIL 201097 sc-eQTL 5.61e-01 0.0396 0.068 0.237 Pro_T L2
ENSG00000142961 MOB3C 898353 sc-eQTL 9.13e-01 -0.011 0.101 0.237 Pro_T L2
ENSG00000159658 EFCAB14 796130 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0438 0.0899 0.237 Pro_T L2
ENSG00000162368 CMPK1 181447 sc-eQTL 7.95e-01 0.026 0.0998 0.237 Pro_T L2
ENSG00000079277 MKNK1 898401 sc-eQTL 2.70e-01 -0.118 0.107 0.237 Treg L2
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0247 0.0903 0.237 Treg L2
ENSG00000132122 SPATA6 -956964 sc-eQTL 2.54e-02 0.2 0.0889 0.237 Treg L2
ENSG00000142961 MOB3C 898353 sc-eQTL 4.90e-01 -0.068 0.0983 0.237 Treg L2
ENSG00000159658 EFCAB14 796130 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0111 0.0892 0.237 Treg L2
ENSG00000162368 CMPK1 181447 sc-eQTL 9.49e-01 0.00528 0.0818 0.237 Treg L2
ENSG00000079277 MKNK1 898401 sc-eQTL 4.17e-01 0.0855 0.105 0.224 cDC L2
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 sc-eQTL 1.70e-01 -0.159 0.115 0.224 cDC L2
ENSG00000123473 STIL 201097 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0305 0.1 0.224 cDC L2
ENSG00000132122 SPATA6 -956964 sc-eQTL 1.80e-01 -0.159 0.118 0.224 cDC L2
ENSG00000142961 MOB3C 898353 sc-eQTL 7.11e-01 0.0381 0.103 0.224 cDC L2
ENSG00000159658 EFCAB14 796130 sc-eQTL 4.93e-01 0.0795 0.116 0.224 cDC L2
ENSG00000162366 PDZK1IP1 324200 sc-eQTL 1.76e-01 0.131 0.0966 0.224 cDC L2
ENSG00000162368 CMPK1 181447 sc-eQTL 5.09e-01 0.0722 0.109 0.224 cDC L2
ENSG00000079277 MKNK1 898401 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0763 0.0694 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00523 0.0893 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000132122 SPATA6 -956964 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0133 0.0922 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000142961 MOB3C 898353 sc-eQTL 3.68e-01 0.0975 0.108 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000159658 EFCAB14 796130 sc-eQTL 6.52e-01 0.0346 0.0767 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000162368 CMPK1 181447 sc-eQTL 3.44e-01 0.079 0.0834 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000079277 MKNK1 898401 sc-eQTL 2.80e-01 -0.092 0.0849 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00119 0.0996 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000132122 SPATA6 -956964 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0768 0.101 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000142961 MOB3C 898353 sc-eQTL 4.92e-01 0.0729 0.106 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000159658 EFCAB14 796130 sc-eQTL 2.07e-01 0.106 0.0834 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000162368 CMPK1 181447 sc-eQTL 7.62e-01 0.0294 0.0969 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000079277 MKNK1 898401 sc-eQTL 1.73e-01 0.179 0.131 0.245 gdT L2
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 sc-eQTL 9.43e-01 0.00825 0.115 0.245 gdT L2
ENSG00000123473 STIL 201097 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0519 0.102 0.245 gdT L2
ENSG00000142961 MOB3C 898353 sc-eQTL 8.64e-01 0.0208 0.121 0.245 gdT L2
ENSG00000159658 EFCAB14 796130 sc-eQTL 3.24e-01 0.11 0.111 0.245 gdT L2
ENSG00000162368 CMPK1 181447 sc-eQTL 8.35e-01 0.0248 0.119 0.245 gdT L2
ENSG00000079277 MKNK1 898401 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0395 0.0928 0.24 intMono L2
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0234 0.11 0.24 intMono L2
ENSG00000132122 SPATA6 -956964 sc-eQTL 4.42e-01 0.0813 0.106 0.24 intMono L2
ENSG00000142961 MOB3C 898353 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0277 0.109 0.24 intMono L2
ENSG00000159658 EFCAB14 796130 sc-eQTL 1.22e-01 0.14 0.0901 0.24 intMono L2
ENSG00000162368 CMPK1 181447 sc-eQTL 6.33e-01 0.05 0.104 0.24 intMono L2
ENSG00000079277 MKNK1 898401 sc-eQTL 4.39e-01 0.0635 0.0819 0.24 ncMono L2
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 sc-eQTL 2.00e-01 0.129 0.101 0.24 ncMono L2
ENSG00000132122 SPATA6 -956964 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0354 0.084 0.24 ncMono L2
ENSG00000142961 MOB3C 898353 sc-eQTL 6.46e-01 0.0487 0.106 0.24 ncMono L2
ENSG00000159658 EFCAB14 796130 sc-eQTL 8.63e-01 0.0173 0.1 0.24 ncMono L2
ENSG00000162368 CMPK1 181447 sc-eQTL 4.78e-01 0.0695 0.0978 0.24 ncMono L2
ENSG00000079277 MKNK1 898401 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0315 0.12 0.234 pDC L2
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0306 0.123 0.234 pDC L2
ENSG00000123473 STIL 201097 sc-eQTL 2.87e-01 0.108 0.101 0.234 pDC L2
ENSG00000132122 SPATA6 -956964 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00096 0.115 0.234 pDC L2
ENSG00000142961 MOB3C 898353 sc-eQTL 8.58e-01 0.0209 0.116 0.234 pDC L2
ENSG00000159658 EFCAB14 796130 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0398 0.104 0.234 pDC L2
ENSG00000162366 PDZK1IP1 324200 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0665 0.093 0.234 pDC L2
ENSG00000162368 CMPK1 181447 sc-eQTL 2.57e-01 0.126 0.111 0.234 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079277 MKNK1 898401 sc-eQTL 2.27e-01 -0.133 0.11 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0474 0.0818 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132122 SPATA6 -956964 sc-eQTL 2.85e-01 0.111 0.103 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 898353 sc-eQTL 2.83e-01 -0.11 0.102 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 796130 sc-eQTL 2.39e-01 0.0959 0.0812 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 181447 sc-eQTL 7.32e-01 0.0284 0.0829 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 898401 sc-eQTL 6.74e-01 0.0438 0.104 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 sc-eQTL 3.02e-01 0.0911 0.088 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132122 SPATA6 -956964 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0818 0.108 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 898353 sc-eQTL 4.86e-01 0.0696 0.0996 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 796130 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0242 0.069 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 181447 sc-eQTL 2.35e-01 0.1 0.084 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 898401 sc-eQTL 9.61e-02 -0.113 0.0677 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0253 0.0865 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000132122 SPATA6 -956964 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0114 0.0893 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 898353 sc-eQTL 2.34e-01 0.121 0.101 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 796130 sc-eQTL 5.31e-01 0.0447 0.0713 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 181447 sc-eQTL 9.52e-01 0.00468 0.0774 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 898401 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0143 0.0691 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00563 0.0955 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000132122 SPATA6 -956964 sc-eQTL 9.99e-01 0.000142 0.0769 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 898353 sc-eQTL 9.95e-01 0.000626 0.106 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 796130 sc-eQTL 4.50e-01 0.0678 0.0896 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 181447 sc-eQTL 3.57e-01 0.0827 0.0896 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 898401 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0283 0.115 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 sc-eQTL 8.70e-01 0.0137 0.0833 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 898353 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0228 0.0901 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 796130 sc-eQTL 7.00e-02 0.125 0.0687 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 181447 sc-eQTL 7.25e-01 0.023 0.0653 0.239 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 eQTL 0.00943 0.0587 0.0226 0.0 0.0 0.216
ENSG00000237424 FOXD2-AS1 80603 eQTL 0.00216 0.0877 0.0285 0.00538 0.00112 0.216


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000123472 ATPAF1 841377 4.37e-07 4e-07 5.82e-08 3.61e-07 1.05e-07 1.71e-07 4.25e-07 5.89e-08 2.35e-07 1.15e-07 3.92e-07 2.04e-07 5.09e-07 8.42e-08 7.79e-08 9.01e-08 6.63e-08 2.83e-07 9.71e-08 7.4e-08 1.33e-07 2.86e-07 2.04e-07 3.4e-08 3.41e-07 1.65e-07 1.37e-07 1.42e-07 1.76e-07 2.01e-07 1.59e-07 3.06e-08 4.16e-08 1.21e-07 2.61e-07 3.36e-08 8.75e-08 6.56e-08 4.78e-08 7.92e-08 4.53e-08 6.27e-07 4.7e-08 1.26e-08 3.41e-08 1.25e-08 1.19e-07 1.92e-09 4.94e-08
ENSG00000159658 \N 796130 5.37e-07 4.97e-07 6.26e-08 3.99e-07 1.05e-07 1.97e-07 5.01e-07 6.57e-08 2.66e-07 1.37e-07 4.64e-07 2.28e-07 6e-07 8.85e-08 9.12e-08 9.48e-08 8.64e-08 2.96e-07 1.5e-07 8.25e-08 1.35e-07 3.15e-07 2.33e-07 3.51e-08 4.11e-07 1.82e-07 1.72e-07 1.46e-07 2.11e-07 2.52e-07 1.78e-07 2.93e-08 4.86e-08 1.21e-07 3e-07 4.6e-08 1.1e-07 7.75e-08 5.77e-08 7.9e-08 5.03e-08 7.54e-07 3.99e-08 1.93e-08 3.07e-08 1.37e-08 1.21e-07 1.96e-09 4.88e-08