Genes within 1Mb (chr1:47495958:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079277 MKNK1 879115 sc-eQTL 4.47e-01 0.0808 0.106 0.184 B L1
ENSG00000123472 ATPAF1 822091 sc-eQTL 2.85e-01 0.0703 0.0656 0.184 B L1
ENSG00000132122 SPATA6 -976250 sc-eQTL 9.07e-01 0.0128 0.11 0.184 B L1
ENSG00000142961 MOB3C 879067 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0634 0.101 0.184 B L1
ENSG00000159658 EFCAB14 776844 sc-eQTL 9.38e-01 0.00499 0.0638 0.184 B L1
ENSG00000162368 CMPK1 162161 sc-eQTL 5.98e-01 0.0401 0.0759 0.184 B L1
ENSG00000079277 MKNK1 879115 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0534 0.0893 0.184 CD4T L1
ENSG00000123472 ATPAF1 822091 sc-eQTL 9.03e-01 0.00763 0.0623 0.184 CD4T L1
ENSG00000132122 SPATA6 -976250 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0597 0.109 0.184 CD4T L1
ENSG00000142961 MOB3C 879067 sc-eQTL 3.45e-01 0.0698 0.0738 0.184 CD4T L1
ENSG00000159658 EFCAB14 776844 sc-eQTL 9.52e-01 0.00337 0.0565 0.184 CD4T L1
ENSG00000162368 CMPK1 162161 sc-eQTL 2.17e-01 0.0899 0.0726 0.184 CD4T L1
ENSG00000079277 MKNK1 879115 sc-eQTL 6.95e-01 0.0381 0.0972 0.184 CD8T L1
ENSG00000123472 ATPAF1 822091 sc-eQTL 5.42e-01 0.049 0.0803 0.184 CD8T L1
ENSG00000142961 MOB3C 879067 sc-eQTL 9.18e-01 0.00895 0.0872 0.184 CD8T L1
ENSG00000159658 EFCAB14 776844 sc-eQTL 1.63e-01 0.0903 0.0645 0.184 CD8T L1
ENSG00000162368 CMPK1 162161 sc-eQTL 2.21e-01 0.0823 0.067 0.184 CD8T L1
ENSG00000079277 MKNK1 879115 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0754 0.101 0.187 DC L1
ENSG00000123472 ATPAF1 822091 sc-eQTL 3.02e-01 0.112 0.108 0.187 DC L1
ENSG00000123473 STIL 181811 sc-eQTL 8.96e-01 0.0135 0.103 0.187 DC L1
ENSG00000132122 SPATA6 -976250 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0761 0.115 0.187 DC L1
ENSG00000142961 MOB3C 879067 sc-eQTL 7.40e-03 0.272 0.101 0.187 DC L1
ENSG00000159658 EFCAB14 776844 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0963 0.101 0.187 DC L1
ENSG00000162366 PDZK1IP1 304914 sc-eQTL 9.37e-01 0.00772 0.0977 0.187 DC L1
ENSG00000162368 CMPK1 162161 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0361 0.0964 0.187 DC L1
ENSG00000079277 MKNK1 879115 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0336 0.0697 0.184 Mono L1
ENSG00000123472 ATPAF1 822091 sc-eQTL 4.32e-01 0.0697 0.0885 0.184 Mono L1
ENSG00000132122 SPATA6 -976250 sc-eQTL 9.16e-01 0.00856 0.0809 0.184 Mono L1
ENSG00000142961 MOB3C 879067 sc-eQTL 5.59e-01 0.0612 0.105 0.184 Mono L1
ENSG00000159658 EFCAB14 776844 sc-eQTL 3.71e-01 0.0641 0.0716 0.184 Mono L1
ENSG00000162368 CMPK1 162161 sc-eQTL 5.09e-01 0.053 0.0802 0.184 Mono L1
ENSG00000079277 MKNK1 879115 sc-eQTL 5.78e-01 -0.067 0.12 0.185 NK L1
ENSG00000123472 ATPAF1 822091 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0259 0.0882 0.185 NK L1
ENSG00000142961 MOB3C 879067 sc-eQTL 8.57e-01 0.017 0.0941 0.185 NK L1
ENSG00000159658 EFCAB14 776844 sc-eQTL 7.15e-01 0.0262 0.0717 0.185 NK L1
ENSG00000162368 CMPK1 162161 sc-eQTL 6.50e-01 0.0313 0.0688 0.185 NK L1
ENSG00000079277 MKNK1 879115 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0509 0.102 0.184 Other_T L1
ENSG00000123472 ATPAF1 822091 sc-eQTL 1.84e-01 0.0973 0.073 0.184 Other_T L1
ENSG00000123473 STIL 181811 sc-eQTL 1.86e-01 0.0783 0.059 0.184 Other_T L1
ENSG00000142961 MOB3C 879067 sc-eQTL 7.93e-01 0.0271 0.103 0.184 Other_T L1
ENSG00000159658 EFCAB14 776844 sc-eQTL 1.32e-01 0.109 0.072 0.184 Other_T L1
ENSG00000162368 CMPK1 162161 sc-eQTL 2.02e-01 0.12 0.0935 0.184 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079277 MKNK1 879115 sc-eQTL 6.57e-01 0.0579 0.13 0.181 B_Activated L2
ENSG00000123472 ATPAF1 822091 sc-eQTL 8.18e-01 0.0286 0.124 0.181 B_Activated L2
ENSG00000132122 SPATA6 -976250 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0916 0.101 0.181 B_Activated L2
ENSG00000142961 MOB3C 879067 sc-eQTL 3.57e-01 0.0968 0.105 0.181 B_Activated L2
ENSG00000159658 EFCAB14 776844 sc-eQTL 9.86e-01 0.00218 0.128 0.181 B_Activated L2
ENSG00000162368 CMPK1 162161 sc-eQTL 8.20e-03 0.319 0.119 0.181 B_Activated L2
ENSG00000079277 MKNK1 879115 sc-eQTL 8.18e-02 0.205 0.117 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000123472 ATPAF1 822091 sc-eQTL 3.72e-02 0.2 0.0956 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000132122 SPATA6 -976250 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0774 0.11 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000142961 MOB3C 879067 sc-eQTL 8.46e-01 0.0217 0.111 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000159658 EFCAB14 776844 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00493 0.0956 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000162368 CMPK1 162161 sc-eQTL 2.01e-01 0.118 0.0922 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000079277 MKNK1 879115 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0488 0.118 0.185 B_Memory L2
ENSG00000123472 ATPAF1 822091 sc-eQTL 2.23e-01 -0.131 0.107 0.185 B_Memory L2
ENSG00000132122 SPATA6 -976250 sc-eQTL 5.47e-01 -0.061 0.101 0.185 B_Memory L2
ENSG00000142961 MOB3C 879067 sc-eQTL 3.14e-01 -0.108 0.107 0.185 B_Memory L2
ENSG00000159658 EFCAB14 776844 sc-eQTL 7.33e-01 0.0345 0.101 0.185 B_Memory L2
ENSG00000162368 CMPK1 162161 sc-eQTL 4.17e-01 0.0806 0.099 0.185 B_Memory L2
ENSG00000079277 MKNK1 879115 sc-eQTL 3.77e-01 0.1 0.113 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000123472 ATPAF1 822091 sc-eQTL 2.89e-01 0.0998 0.0939 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000132122 SPATA6 -976250 sc-eQTL 2.04e-01 0.145 0.114 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000142961 MOB3C 879067 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0269 0.113 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000159658 EFCAB14 776844 sc-eQTL 6.90e-01 0.032 0.08 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000162368 CMPK1 162161 sc-eQTL 7.38e-01 0.0307 0.0917 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000079277 MKNK1 879115 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0258 0.115 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000123472 ATPAF1 822091 sc-eQTL 9.62e-01 0.00486 0.103 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000132122 SPATA6 -976250 sc-eQTL 9.55e-01 0.00652 0.116 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000142961 MOB3C 879067 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0956 0.105 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000159658 EFCAB14 776844 sc-eQTL 6.61e-02 0.162 0.0875 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000162368 CMPK1 162161 sc-eQTL 9.20e-01 0.00971 0.096 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000079277 MKNK1 879115 sc-eQTL 3.34e-01 -0.116 0.119 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000123472 ATPAF1 822091 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0542 0.11 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000132122 SPATA6 -976250 sc-eQTL 9.90e-01 -0.0012 0.0987 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000142961 MOB3C 879067 sc-eQTL 9.97e-01 -0.00046 0.108 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000159658 EFCAB14 776844 sc-eQTL 6.82e-02 -0.197 0.107 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000162368 CMPK1 162161 sc-eQTL 2.59e-02 0.248 0.11 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000079277 MKNK1 879115 sc-eQTL 3.27e-01 -0.104 0.106 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000123472 ATPAF1 822091 sc-eQTL 9.00e-01 -0.00874 0.0693 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000132122 SPATA6 -976250 sc-eQTL 2.79e-01 -0.122 0.113 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000142961 MOB3C 879067 sc-eQTL 1.44e-01 0.118 0.0806 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000159658 EFCAB14 776844 sc-eQTL 2.08e-01 0.0767 0.0607 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000162368 CMPK1 162161 sc-eQTL 6.54e-02 0.128 0.069 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000079277 MKNK1 879115 sc-eQTL 2.63e-01 0.131 0.117 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 822091 sc-eQTL 7.19e-01 0.0319 0.0886 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000132122 SPATA6 -976250 sc-eQTL 2.91e-01 0.118 0.112 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000142961 MOB3C 879067 sc-eQTL 8.65e-01 0.0174 0.102 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 776844 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0349 0.0758 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000162368 CMPK1 162161 sc-eQTL 8.33e-02 0.134 0.077 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000079277 MKNK1 879115 sc-eQTL 7.98e-01 0.0285 0.111 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 822091 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0366 0.0889 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000132122 SPATA6 -976250 sc-eQTL 1.92e-01 0.152 0.116 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000142961 MOB3C 879067 sc-eQTL 2.27e-01 -0.135 0.112 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 776844 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0273 0.0858 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000162368 CMPK1 162161 sc-eQTL 5.73e-01 0.0544 0.0964 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000079277 MKNK1 879115 sc-eQTL 3.15e-01 -0.115 0.115 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000123472 ATPAF1 822091 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0543 0.0899 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000142961 MOB3C 879067 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0339 0.105 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000159658 EFCAB14 776844 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0144 0.0891 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000162368 CMPK1 162161 sc-eQTL 4.86e-03 0.248 0.0873 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000079277 MKNK1 879115 sc-eQTL 2.48e-01 0.132 0.114 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000123472 ATPAF1 822091 sc-eQTL 1.63e-01 0.117 0.0833 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000142961 MOB3C 879067 sc-eQTL 5.45e-01 0.0587 0.0968 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000159658 EFCAB14 776844 sc-eQTL 1.97e-01 0.119 0.0915 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000162368 CMPK1 162161 sc-eQTL 3.78e-02 0.178 0.0852 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000079277 MKNK1 879115 sc-eQTL 3.25e-01 0.117 0.119 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 822091 sc-eQTL 5.20e-01 0.0662 0.103 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000142961 MOB3C 879067 sc-eQTL 4.14e-01 0.0906 0.111 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 776844 sc-eQTL 5.48e-01 0.0628 0.104 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000162368 CMPK1 162161 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0247 0.0978 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000079277 MKNK1 879115 sc-eQTL 9.34e-01 0.01 0.121 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 822091 sc-eQTL 2.73e-01 0.122 0.111 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000142961 MOB3C 879067 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0117 0.111 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 776844 sc-eQTL 6.08e-01 0.0567 0.11 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000162368 CMPK1 162161 sc-eQTL 5.19e-01 0.071 0.11 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000079277 MKNK1 879115 sc-eQTL 9.80e-01 0.00248 0.0979 0.184 MAIT L2
ENSG00000123472 ATPAF1 822091 sc-eQTL 3.41e-01 0.0911 0.0955 0.184 MAIT L2
ENSG00000123473 STIL 181811 sc-eQTL 2.59e-01 -0.107 0.0946 0.184 MAIT L2
ENSG00000142961 MOB3C 879067 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0534 0.102 0.184 MAIT L2
ENSG00000159658 EFCAB14 776844 sc-eQTL 3.47e-02 0.196 0.0923 0.184 MAIT L2
ENSG00000162368 CMPK1 162161 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0196 0.0949 0.184 MAIT L2
ENSG00000079277 MKNK1 879115 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0261 0.117 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000123472 ATPAF1 822091 sc-eQTL 8.30e-01 0.0228 0.106 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000142961 MOB3C 879067 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0996 0.109 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000159658 EFCAB14 776844 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0304 0.108 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000162368 CMPK1 162161 sc-eQTL 6.14e-01 0.0547 0.108 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000079277 MKNK1 879115 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0465 0.126 0.183 NK_CD56dim L2
ENSG00000123472 ATPAF1 822091 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0343 0.099 0.183 NK_CD56dim L2
ENSG00000142961 MOB3C 879067 sc-eQTL 6.79e-01 0.0427 0.103 0.183 NK_CD56dim L2
ENSG00000159658 EFCAB14 776844 sc-eQTL 8.14e-01 0.0194 0.0825 0.183 NK_CD56dim L2
ENSG00000162368 CMPK1 162161 sc-eQTL 7.43e-01 0.0276 0.0842 0.183 NK_CD56dim L2
ENSG00000079277 MKNK1 879115 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0856 0.118 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000123472 ATPAF1 822091 sc-eQTL 1.53e-01 -0.165 0.115 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000142961 MOB3C 879067 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0852 0.107 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000159658 EFCAB14 776844 sc-eQTL 4.18e-01 0.0786 0.0968 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000162368 CMPK1 162161 sc-eQTL 3.40e-01 -0.103 0.107 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000079277 MKNK1 879115 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0318 0.12 0.183 NK_cytokine L2
ENSG00000123472 ATPAF1 822091 sc-eQTL 4.75e-01 0.0708 0.0989 0.183 NK_cytokine L2
ENSG00000142961 MOB3C 879067 sc-eQTL 7.33e-01 0.0367 0.107 0.183 NK_cytokine L2
ENSG00000159658 EFCAB14 776844 sc-eQTL 6.78e-01 0.0389 0.0936 0.183 NK_cytokine L2
ENSG00000162368 CMPK1 162161 sc-eQTL 2.91e-01 0.108 0.102 0.183 NK_cytokine L2
ENSG00000079277 MKNK1 879115 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0491 0.152 0.17 PB L2
ENSG00000123472 ATPAF1 822091 sc-eQTL 8.48e-01 0.0196 0.102 0.17 PB L2
ENSG00000132122 SPATA6 -976250 sc-eQTL 2.71e-01 -0.113 0.102 0.17 PB L2
ENSG00000142961 MOB3C 879067 sc-eQTL 7.15e-02 0.246 0.135 0.17 PB L2
ENSG00000159658 EFCAB14 776844 sc-eQTL 4.95e-01 0.0903 0.132 0.17 PB L2
ENSG00000162368 CMPK1 162161 sc-eQTL 2.06e-01 0.172 0.135 0.17 PB L2
ENSG00000079277 MKNK1 879115 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0379 0.12 0.18 Pro_T L2
ENSG00000123472 ATPAF1 822091 sc-eQTL 3.45e-01 0.0893 0.0944 0.18 Pro_T L2
ENSG00000123473 STIL 181811 sc-eQTL 3.68e-01 0.066 0.0732 0.18 Pro_T L2
ENSG00000142961 MOB3C 879067 sc-eQTL 2.98e-01 0.113 0.108 0.18 Pro_T L2
ENSG00000159658 EFCAB14 776844 sc-eQTL 5.82e-01 0.0534 0.097 0.18 Pro_T L2
ENSG00000162368 CMPK1 162161 sc-eQTL 7.46e-01 0.0349 0.108 0.18 Pro_T L2
ENSG00000079277 MKNK1 879115 sc-eQTL 9.38e-01 0.00892 0.114 0.184 Treg L2
ENSG00000123472 ATPAF1 822091 sc-eQTL 2.76e-01 0.105 0.0957 0.184 Treg L2
ENSG00000132122 SPATA6 -976250 sc-eQTL 3.82e-01 0.0835 0.0954 0.184 Treg L2
ENSG00000142961 MOB3C 879067 sc-eQTL 2.08e-01 0.132 0.104 0.184 Treg L2
ENSG00000159658 EFCAB14 776844 sc-eQTL 8.26e-01 0.0208 0.0947 0.184 Treg L2
ENSG00000162368 CMPK1 162161 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0355 0.0868 0.184 Treg L2
ENSG00000079277 MKNK1 879115 sc-eQTL 2.04e-01 -0.132 0.103 0.188 cDC L2
ENSG00000123472 ATPAF1 822091 sc-eQTL 9.81e-01 0.00278 0.114 0.188 cDC L2
ENSG00000123473 STIL 181811 sc-eQTL 8.35e-01 0.0207 0.0989 0.188 cDC L2
ENSG00000132122 SPATA6 -976250 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0756 0.117 0.188 cDC L2
ENSG00000142961 MOB3C 879067 sc-eQTL 1.67e-01 0.14 0.101 0.188 cDC L2
ENSG00000159658 EFCAB14 776844 sc-eQTL 3.39e-01 -0.109 0.114 0.188 cDC L2
ENSG00000162366 PDZK1IP1 304914 sc-eQTL 8.03e-01 0.0239 0.0956 0.188 cDC L2
ENSG00000162368 CMPK1 162161 sc-eQTL 4.11e-01 0.0887 0.107 0.188 cDC L2
ENSG00000079277 MKNK1 879115 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0387 0.074 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000123472 ATPAF1 822091 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0203 0.095 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000132122 SPATA6 -976250 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0918 0.0979 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000142961 MOB3C 879067 sc-eQTL 6.16e-01 0.0579 0.115 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000159658 EFCAB14 776844 sc-eQTL 8.83e-01 0.012 0.0816 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000162368 CMPK1 162161 sc-eQTL 3.57e-01 0.0819 0.0888 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000079277 MKNK1 879115 sc-eQTL 7.99e-01 0.0227 0.0891 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000123472 ATPAF1 822091 sc-eQTL 2.67e-01 0.116 0.104 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000132122 SPATA6 -976250 sc-eQTL 3.93e-01 0.0901 0.105 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000142961 MOB3C 879067 sc-eQTL 5.89e-01 0.0601 0.111 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000159658 EFCAB14 776844 sc-eQTL 4.65e-01 0.0641 0.0875 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000162368 CMPK1 162161 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0683 0.101 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000079277 MKNK1 879115 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0282 0.138 0.188 gdT L2
ENSG00000123472 ATPAF1 822091 sc-eQTL 9.63e-01 0.00558 0.12 0.188 gdT L2
ENSG00000123473 STIL 181811 sc-eQTL 1.93e-01 0.139 0.106 0.188 gdT L2
ENSG00000142961 MOB3C 879067 sc-eQTL 3.39e-01 0.121 0.126 0.188 gdT L2
ENSG00000159658 EFCAB14 776844 sc-eQTL 8.06e-01 0.0287 0.117 0.188 gdT L2
ENSG00000162368 CMPK1 162161 sc-eQTL 5.05e-01 0.0829 0.124 0.188 gdT L2
ENSG00000079277 MKNK1 879115 sc-eQTL 9.79e-01 0.00264 0.0985 0.184 intMono L2
ENSG00000123472 ATPAF1 822091 sc-eQTL 3.85e-01 -0.102 0.117 0.184 intMono L2
ENSG00000132122 SPATA6 -976250 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0143 0.112 0.184 intMono L2
ENSG00000142961 MOB3C 879067 sc-eQTL 2.23e-01 -0.14 0.115 0.184 intMono L2
ENSG00000159658 EFCAB14 776844 sc-eQTL 2.24e-01 0.117 0.0959 0.184 intMono L2
ENSG00000162368 CMPK1 162161 sc-eQTL 8.05e-01 0.0274 0.111 0.184 intMono L2
ENSG00000079277 MKNK1 879115 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0658 0.0872 0.188 ncMono L2
ENSG00000123472 ATPAF1 822091 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0304 0.107 0.188 ncMono L2
ENSG00000132122 SPATA6 -976250 sc-eQTL 8.58e-01 -0.016 0.0894 0.188 ncMono L2
ENSG00000142961 MOB3C 879067 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00454 0.113 0.188 ncMono L2
ENSG00000159658 EFCAB14 776844 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00528 0.106 0.188 ncMono L2
ENSG00000162368 CMPK1 162161 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0288 0.104 0.188 ncMono L2
ENSG00000079277 MKNK1 879115 sc-eQTL 1.51e-01 -0.171 0.118 0.198 pDC L2
ENSG00000123472 ATPAF1 822091 sc-eQTL 3.60e-01 0.112 0.122 0.198 pDC L2
ENSG00000123473 STIL 181811 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00475 0.1 0.198 pDC L2
ENSG00000132122 SPATA6 -976250 sc-eQTL 6.62e-01 0.0498 0.114 0.198 pDC L2
ENSG00000142961 MOB3C 879067 sc-eQTL 1.17e-01 0.18 0.114 0.198 pDC L2
ENSG00000159658 EFCAB14 776844 sc-eQTL 5.98e-01 0.0546 0.103 0.198 pDC L2
ENSG00000162366 PDZK1IP1 304914 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0425 0.0922 0.198 pDC L2
ENSG00000162368 CMPK1 162161 sc-eQTL 4.90e-02 -0.216 0.109 0.198 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079277 MKNK1 879115 sc-eQTL 2.48e-01 0.137 0.118 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 822091 sc-eQTL 4.31e-01 0.0694 0.0881 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132122 SPATA6 -976250 sc-eQTL 3.36e-01 -0.107 0.111 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 879067 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0439 0.11 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 776844 sc-eQTL 8.95e-01 0.0116 0.0878 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 162161 sc-eQTL 7.37e-02 0.159 0.0887 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 879115 sc-eQTL 3.31e-01 0.108 0.111 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 822091 sc-eQTL 4.09e-01 0.0779 0.0941 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132122 SPATA6 -976250 sc-eQTL 2.47e-01 0.134 0.115 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 879067 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0282 0.106 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 776844 sc-eQTL 5.00e-01 0.0498 0.0736 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 162161 sc-eQTL 7.83e-01 0.0249 0.0901 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 879115 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0176 0.0717 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 822091 sc-eQTL 3.70e-01 0.0817 0.0909 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000132122 SPATA6 -976250 sc-eQTL 7.50e-01 -0.03 0.094 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 879067 sc-eQTL 3.72e-01 0.0956 0.107 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 776844 sc-eQTL 5.11e-01 0.0495 0.075 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 162161 sc-eQTL 3.62e-01 0.0743 0.0813 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 879115 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0448 0.0735 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 822091 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0432 0.102 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000132122 SPATA6 -976250 sc-eQTL 4.95e-01 -0.056 0.0818 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 879067 sc-eQTL 9.63e-01 0.00528 0.113 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 776844 sc-eQTL 1.99e-01 0.123 0.0951 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 162161 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00288 0.0957 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 879115 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0793 0.124 0.183 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 822091 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0247 0.09 0.183 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 879067 sc-eQTL 7.35e-01 0.0331 0.0974 0.183 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 776844 sc-eQTL 6.81e-01 0.0308 0.0748 0.183 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 162161 sc-eQTL 8.17e-01 0.0163 0.0706 0.183 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079277 MKNK1 879115 eQTL 0.0452 -0.0306 0.0153 0.0 0.0 0.199
ENSG00000132122 SPATA6 -976250 eQTL 0.12 -0.0347 0.0223 0.00125 0.0 0.199
ENSG00000162366 PDZK1IP1 304914 eQTL 2.76e-10 0.216 0.0338 0.0 0.0 0.199
ENSG00000162368 CMPK1 162161 eQTL 8.89e-06 0.0556 0.0124 0.0 0.0 0.199
ENSG00000224805 LINC00853 316708 eQTL 0.00277 0.0733 0.0244 0.0 0.0 0.199
ENSG00000237424 FOXD2-AS1 61317 eQTL 0.0217 0.069 0.03 0.0 0.0 0.199
ENSG00000272491 AL109659.2 -733603 eQTL 0.0156 -0.0931 0.0384 0.00131 0.0 0.199


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162366 PDZK1IP1 304914 1.26e-06 9.45e-07 2.75e-07 3.65e-07 2.28e-07 3.69e-07 8.96e-07 3.34e-07 1.14e-06 3.28e-07 1.25e-06 6.07e-07 1.46e-06 2.4e-07 4.55e-07 5.87e-07 7.68e-07 5.67e-07 3.71e-07 4.68e-07 3.6e-07 8.19e-07 6.93e-07 4.83e-07 1.79e-06 2.98e-07 6.38e-07 5.67e-07 8.81e-07 9.49e-07 4.59e-07 4.94e-08 1.82e-07 3.66e-07 3.93e-07 3.47e-07 3.64e-07 1.23e-07 1.44e-07 7.62e-08 2.78e-07 1.26e-06 6.53e-08 4.11e-08 1.81e-07 7.77e-08 1.6e-07 8.81e-08 8.09e-08
ENSG00000162368 CMPK1 162161 2.38e-06 2.44e-06 3.17e-07 1.76e-06 4.78e-07 8.14e-07 1.82e-06 6.83e-07 1.86e-06 9.48e-07 2.45e-06 1.26e-06 3.47e-06 1.36e-06 8.27e-07 1.54e-06 1.09e-06 2.23e-06 9.61e-07 1.27e-06 1.14e-06 2.76e-06 2.32e-06 1.07e-06 3.46e-06 1.33e-06 1.26e-06 1.78e-06 2.1e-06 1.84e-06 1.64e-06 3.22e-07 5.43e-07 1.18e-06 1.13e-06 9.71e-07 7.72e-07 4.75e-07 1.11e-06 3.97e-07 2.54e-07 3.29e-06 4.6e-07 1.96e-07 2.74e-07 3.11e-07 8.08e-07 2.32e-07 1.9e-07
ENSG00000237424 FOXD2-AS1 61317 6.97e-06 9.04e-06 1.3e-06 4e-06 2.22e-06 3.26e-06 9.71e-06 1.64e-06 6.18e-06 4.42e-06 9.71e-06 4.15e-06 1.14e-05 3.85e-06 1.73e-06 5.71e-06 3.68e-06 5.1e-06 2.64e-06 2.62e-06 4.46e-06 7.44e-06 6.71e-06 2.84e-06 1.18e-05 2.92e-06 4.19e-06 3e-06 7.67e-06 7.9e-06 4.1e-06 8.14e-07 1.19e-06 2.98e-06 3.01e-06 2.19e-06 1.62e-06 1.85e-06 1.63e-06 1.02e-06 9.75e-07 9.28e-06 1.02e-06 1.92e-07 6.82e-07 1.48e-06 1.19e-06 6.93e-07 4.67e-07