logo

Genes within 1Mb (chr1:47494959:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079277 MKNK1 878116 sc-eQTL 5.81e-01 0.0554 0.1 0.207 B L1
ENSG00000123472 ATPAF1 821092 sc-eQTL 1.93e-01 0.0808 0.0619 0.207 B L1
ENSG00000132122 SPATA6 -977249 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0515 0.104 0.207 B L1
ENSG00000142961 MOB3C 878068 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0748 0.0957 0.207 B L1
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0244 0.0602 0.207 B L1
ENSG00000162368 CMPK1 161162 sc-eQTL 7.36e-01 0.0243 0.0718 0.207 B L1
ENSG00000079277 MKNK1 878116 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0512 0.084 0.207 CD4T L1
ENSG00000123472 ATPAF1 821092 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0161 0.0586 0.207 CD4T L1
ENSG00000132122 SPATA6 -977249 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0861 0.102 0.207 CD4T L1
ENSG00000142961 MOB3C 878068 sc-eQTL 4.47e-01 0.053 0.0695 0.207 CD4T L1
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00223 0.0531 0.207 CD4T L1
ENSG00000162368 CMPK1 161162 sc-eQTL 1.64e-01 0.0952 0.0682 0.207 CD4T L1
ENSG00000079277 MKNK1 878116 sc-eQTL 6.55e-01 0.0412 0.0919 0.207 CD8T L1
ENSG00000123472 ATPAF1 821092 sc-eQTL 5.76e-01 0.0425 0.076 0.207 CD8T L1
ENSG00000142961 MOB3C 878068 sc-eQTL 9.83e-01 0.00174 0.0824 0.207 CD8T L1
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 sc-eQTL 3.51e-01 0.0571 0.0611 0.207 CD8T L1
ENSG00000162368 CMPK1 161162 sc-eQTL 1.51e-01 0.0911 0.0632 0.207 CD8T L1
ENSG00000079277 MKNK1 878116 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0366 0.0951 0.212 DC L1
ENSG00000123472 ATPAF1 821092 sc-eQTL 4.56e-01 0.076 0.102 0.212 DC L1
ENSG00000123473 STIL 180812 sc-eQTL 6.23e-01 0.0478 0.0969 0.212 DC L1
ENSG00000132122 SPATA6 -977249 sc-eQTL 2.35e-01 -0.129 0.108 0.212 DC L1
ENSG00000142961 MOB3C 878068 sc-eQTL 2.85e-03 0.285 0.0943 0.212 DC L1
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 sc-eQTL 1.60e-01 -0.134 0.0948 0.212 DC L1
ENSG00000162366 PDZK1IP1 303915 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0127 0.092 0.212 DC L1
ENSG00000162368 CMPK1 161162 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0294 0.0907 0.212 DC L1
ENSG00000079277 MKNK1 878116 sc-eQTL 8.83e-01 -0.00973 0.0662 0.207 Mono L1
ENSG00000123472 ATPAF1 821092 sc-eQTL 5.66e-01 0.0483 0.084 0.207 Mono L1
ENSG00000132122 SPATA6 -977249 sc-eQTL 8.27e-01 0.0168 0.0768 0.207 Mono L1
ENSG00000142961 MOB3C 878068 sc-eQTL 5.65e-01 0.0572 0.0991 0.207 Mono L1
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 sc-eQTL 4.10e-01 0.0561 0.0679 0.207 Mono L1
ENSG00000162368 CMPK1 161162 sc-eQTL 2.87e-01 0.0811 0.076 0.207 Mono L1
ENSG00000079277 MKNK1 878116 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0808 0.113 0.208 NK L1
ENSG00000123472 ATPAF1 821092 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0529 0.0826 0.208 NK L1
ENSG00000142961 MOB3C 878068 sc-eQTL 8.57e-01 0.0159 0.0881 0.208 NK L1
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 sc-eQTL 7.65e-01 0.0201 0.0672 0.208 NK L1
ENSG00000162368 CMPK1 161162 sc-eQTL 5.35e-01 0.0401 0.0645 0.208 NK L1
ENSG00000079277 MKNK1 878116 sc-eQTL 5.48e-01 -0.058 0.0964 0.207 Other_T L1
ENSG00000123472 ATPAF1 821092 sc-eQTL 1.78e-01 0.0932 0.069 0.207 Other_T L1
ENSG00000123473 STIL 180812 sc-eQTL 3.17e-01 0.0561 0.0559 0.207 Other_T L1
ENSG00000142961 MOB3C 878068 sc-eQTL 4.61e-01 0.0721 0.0976 0.207 Other_T L1
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 sc-eQTL 7.20e-02 0.123 0.0679 0.207 Other_T L1
ENSG00000162368 CMPK1 161162 sc-eQTL 1.90e-01 0.116 0.0884 0.207 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079277 MKNK1 878116 sc-eQTL 8.75e-01 0.0195 0.124 0.207 B_Activated L2
ENSG00000123472 ATPAF1 821092 sc-eQTL 8.83e-01 0.0174 0.119 0.207 B_Activated L2
ENSG00000132122 SPATA6 -977249 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0897 0.0966 0.207 B_Activated L2
ENSG00000142961 MOB3C 878068 sc-eQTL 2.77e-01 0.109 0.0999 0.207 B_Activated L2
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 sc-eQTL 4.12e-01 -0.1 0.122 0.207 B_Activated L2
ENSG00000162368 CMPK1 161162 sc-eQTL 8.04e-03 0.305 0.114 0.207 B_Activated L2
ENSG00000079277 MKNK1 878116 sc-eQTL 1.74e-01 0.152 0.111 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000123472 ATPAF1 821092 sc-eQTL 6.78e-02 0.166 0.0906 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000132122 SPATA6 -977249 sc-eQTL 3.51e-01 -0.097 0.104 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000142961 MOB3C 878068 sc-eQTL 9.49e-01 0.00675 0.105 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0074 0.0904 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000162368 CMPK1 161162 sc-eQTL 5.97e-01 0.0463 0.0874 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000079277 MKNK1 878116 sc-eQTL 3.27e-01 -0.109 0.111 0.209 B_Memory L2
ENSG00000123472 ATPAF1 821092 sc-eQTL 3.22e-01 -0.101 0.101 0.209 B_Memory L2
ENSG00000132122 SPATA6 -977249 sc-eQTL 2.05e-01 -0.121 0.0954 0.209 B_Memory L2
ENSG00000142961 MOB3C 878068 sc-eQTL 2.91e-01 -0.108 0.102 0.209 B_Memory L2
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0299 0.0958 0.209 B_Memory L2
ENSG00000162368 CMPK1 161162 sc-eQTL 5.04e-01 0.0627 0.0938 0.209 B_Memory L2
ENSG00000079277 MKNK1 878116 sc-eQTL 1.94e-01 0.139 0.106 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000123472 ATPAF1 821092 sc-eQTL 1.26e-01 0.136 0.0883 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000132122 SPATA6 -977249 sc-eQTL 2.97e-01 0.112 0.107 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000142961 MOB3C 878068 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0635 0.107 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 sc-eQTL 9.86e-01 -0.0013 0.0754 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000162368 CMPK1 161162 sc-eQTL 6.97e-01 0.0337 0.0865 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000079277 MKNK1 878116 sc-eQTL 2.40e-01 -0.128 0.108 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000123472 ATPAF1 821092 sc-eQTL 8.66e-01 0.0164 0.0971 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000132122 SPATA6 -977249 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0473 0.109 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000142961 MOB3C 878068 sc-eQTL 5.13e-01 -0.065 0.0991 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 sc-eQTL 9.12e-02 0.14 0.0828 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000162368 CMPK1 161162 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0115 0.0907 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000079277 MKNK1 878116 sc-eQTL 3.58e-01 -0.103 0.112 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000123472 ATPAF1 821092 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0834 0.104 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000132122 SPATA6 -977249 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0349 0.0927 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000142961 MOB3C 878068 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0194 0.102 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 sc-eQTL 9.20e-02 -0.171 0.101 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000162368 CMPK1 161162 sc-eQTL 5.84e-02 0.198 0.104 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000079277 MKNK1 878116 sc-eQTL 3.04e-01 -0.102 0.0993 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000123472 ATPAF1 821092 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0346 0.0651 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000132122 SPATA6 -977249 sc-eQTL 2.69e-01 -0.118 0.106 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000142961 MOB3C 878068 sc-eQTL 1.53e-01 0.109 0.0759 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 sc-eQTL 3.68e-01 0.0516 0.0572 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000162368 CMPK1 161162 sc-eQTL 4.37e-02 0.131 0.0648 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000079277 MKNK1 878116 sc-eQTL 2.79e-01 0.12 0.111 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 821092 sc-eQTL 6.30e-01 0.0404 0.0838 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000132122 SPATA6 -977249 sc-eQTL 7.59e-01 0.0324 0.106 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000142961 MOB3C 878068 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0195 0.0962 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 sc-eQTL 4.18e-01 -0.058 0.0716 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000162368 CMPK1 161162 sc-eQTL 5.56e-02 0.14 0.0726 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000079277 MKNK1 878116 sc-eQTL 7.49e-01 0.0339 0.106 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 821092 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0981 0.084 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000132122 SPATA6 -977249 sc-eQTL 5.65e-01 0.0638 0.111 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000142961 MOB3C 878068 sc-eQTL 1.77e-01 -0.143 0.106 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0198 0.0813 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000162368 CMPK1 161162 sc-eQTL 3.07e-01 0.0934 0.0912 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000079277 MKNK1 878116 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0745 0.108 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000123472 ATPAF1 821092 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0315 0.0849 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000142961 MOB3C 878068 sc-eQTL 2.30e-01 -0.119 0.0986 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0443 0.0841 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000162368 CMPK1 161162 sc-eQTL 5.23e-04 0.288 0.0816 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000079277 MKNK1 878116 sc-eQTL 4.21e-01 0.0866 0.107 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000123472 ATPAF1 821092 sc-eQTL 2.92e-01 0.0832 0.0787 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000142961 MOB3C 878068 sc-eQTL 2.86e-01 0.0975 0.0912 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 sc-eQTL 3.83e-01 0.0756 0.0865 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000162368 CMPK1 161162 sc-eQTL 6.37e-02 0.15 0.0805 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000079277 MKNK1 878116 sc-eQTL 3.44e-01 0.106 0.112 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 821092 sc-eQTL 8.24e-01 0.0216 0.0972 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000142961 MOB3C 878068 sc-eQTL 4.97e-01 0.0712 0.104 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 sc-eQTL 7.07e-01 0.0371 0.0985 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000162368 CMPK1 161162 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0384 0.0924 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000079277 MKNK1 878116 sc-eQTL 5.73e-01 0.0651 0.115 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 821092 sc-eQTL 1.59e-01 0.149 0.105 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000142961 MOB3C 878068 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0443 0.106 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 sc-eQTL 8.26e-01 0.0231 0.105 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000162368 CMPK1 161162 sc-eQTL 3.75e-01 0.0928 0.104 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000079277 MKNK1 878116 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00226 0.0924 0.208 MAIT L2
ENSG00000123472 ATPAF1 821092 sc-eQTL 3.89e-01 0.0778 0.0901 0.208 MAIT L2
ENSG00000123473 STIL 180812 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0779 0.0893 0.208 MAIT L2
ENSG00000142961 MOB3C 878068 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000186 0.0966 0.208 MAIT L2
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 sc-eQTL 2.16e-02 0.201 0.0869 0.208 MAIT L2
ENSG00000162368 CMPK1 161162 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0197 0.0895 0.208 MAIT L2
ENSG00000079277 MKNK1 878116 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0151 0.11 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000123472 ATPAF1 821092 sc-eQTL 7.71e-01 0.0292 0.1 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000142961 MOB3C 878068 sc-eQTL 2.81e-01 -0.111 0.103 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 sc-eQTL 9.67e-01 -0.0042 0.102 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000162368 CMPK1 161162 sc-eQTL 4.22e-01 0.0823 0.102 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000079277 MKNK1 878116 sc-eQTL 5.96e-01 -0.063 0.119 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000123472 ATPAF1 821092 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0668 0.0928 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000142961 MOB3C 878068 sc-eQTL 3.71e-01 0.0864 0.0964 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000636 0.0774 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000162368 CMPK1 161162 sc-eQTL 8.90e-01 0.011 0.079 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000079277 MKNK1 878116 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0748 0.112 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000123472 ATPAF1 821092 sc-eQTL 3.57e-01 -0.102 0.11 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000142961 MOB3C 878068 sc-eQTL 3.14e-01 -0.103 0.102 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 sc-eQTL 3.68e-01 0.0832 0.0923 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000162368 CMPK1 161162 sc-eQTL 2.62e-01 -0.115 0.102 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000079277 MKNK1 878116 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0638 0.112 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000123472 ATPAF1 821092 sc-eQTL 5.47e-01 0.0558 0.0925 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000142961 MOB3C 878068 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0157 0.1 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 sc-eQTL 7.33e-01 0.0299 0.0875 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000162368 CMPK1 161162 sc-eQTL 2.18e-01 0.118 0.0953 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000079277 MKNK1 878116 sc-eQTL 8.42e-01 0.0291 0.146 0.185 PB L2
ENSG00000123472 ATPAF1 821092 sc-eQTL 7.46e-01 0.0318 0.0979 0.185 PB L2
ENSG00000132122 SPATA6 -977249 sc-eQTL 2.26e-01 -0.119 0.0979 0.185 PB L2
ENSG00000142961 MOB3C 878068 sc-eQTL 1.12e-01 0.209 0.13 0.185 PB L2
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 sc-eQTL 6.88e-01 0.0511 0.127 0.185 PB L2
ENSG00000162368 CMPK1 161162 sc-eQTL 2.47e-01 0.152 0.13 0.185 PB L2
ENSG00000079277 MKNK1 878116 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0658 0.114 0.204 Pro_T L2
ENSG00000123472 ATPAF1 821092 sc-eQTL 4.54e-01 0.0668 0.0892 0.204 Pro_T L2
ENSG00000123473 STIL 180812 sc-eQTL 6.38e-01 0.0326 0.0692 0.204 Pro_T L2
ENSG00000142961 MOB3C 878068 sc-eQTL 2.16e-01 0.127 0.102 0.204 Pro_T L2
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 sc-eQTL 7.67e-01 0.0272 0.0916 0.204 Pro_T L2
ENSG00000162368 CMPK1 161162 sc-eQTL 5.51e-01 0.0606 0.102 0.204 Pro_T L2
ENSG00000079277 MKNK1 878116 sc-eQTL 8.54e-01 0.0198 0.107 0.207 Treg L2
ENSG00000123472 ATPAF1 821092 sc-eQTL 2.27e-01 0.109 0.0902 0.207 Treg L2
ENSG00000132122 SPATA6 -977249 sc-eQTL 3.45e-01 0.0852 0.0899 0.207 Treg L2
ENSG00000142961 MOB3C 878068 sc-eQTL 1.29e-01 0.149 0.098 0.207 Treg L2
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 sc-eQTL 6.54e-01 0.0401 0.0893 0.207 Treg L2
ENSG00000162368 CMPK1 161162 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0232 0.0819 0.207 Treg L2
ENSG00000079277 MKNK1 878116 sc-eQTL 3.05e-01 -0.1 0.0975 0.215 cDC L2
ENSG00000123472 ATPAF1 821092 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00615 0.108 0.215 cDC L2
ENSG00000123473 STIL 180812 sc-eQTL 6.08e-01 0.0478 0.0931 0.215 cDC L2
ENSG00000132122 SPATA6 -977249 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0949 0.11 0.215 cDC L2
ENSG00000142961 MOB3C 878068 sc-eQTL 1.89e-01 0.125 0.0949 0.215 cDC L2
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 sc-eQTL 3.27e-01 -0.105 0.107 0.215 cDC L2
ENSG00000162366 PDZK1IP1 303915 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0162 0.0901 0.215 cDC L2
ENSG00000162368 CMPK1 161162 sc-eQTL 5.39e-01 0.0624 0.101 0.215 cDC L2
ENSG00000079277 MKNK1 878116 sc-eQTL 9.46e-01 0.00473 0.07 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000123472 ATPAF1 821092 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0556 0.0896 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000132122 SPATA6 -977249 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0671 0.0925 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000142961 MOB3C 878068 sc-eQTL 8.97e-01 0.0142 0.109 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 sc-eQTL 9.27e-01 0.00706 0.0771 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000162368 CMPK1 161162 sc-eQTL 1.87e-01 0.111 0.0837 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000079277 MKNK1 878116 sc-eQTL 9.48e-01 0.00545 0.0842 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000123472 ATPAF1 821092 sc-eQTL 4.47e-01 0.0749 0.0984 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000132122 SPATA6 -977249 sc-eQTL 3.83e-01 0.087 0.0996 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000142961 MOB3C 878068 sc-eQTL 5.90e-01 0.0567 0.105 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 sc-eQTL 6.58e-01 0.0366 0.0828 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000162368 CMPK1 161162 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0689 0.0958 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000079277 MKNK1 878116 sc-eQTL 4.07e-01 -0.108 0.129 0.212 gdT L2
ENSG00000123472 ATPAF1 821092 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0449 0.113 0.212 gdT L2
ENSG00000123473 STIL 180812 sc-eQTL 2.36e-01 0.119 0.1 0.212 gdT L2
ENSG00000142961 MOB3C 878068 sc-eQTL 3.92e-01 0.102 0.119 0.212 gdT L2
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 sc-eQTL 6.32e-01 0.0526 0.11 0.212 gdT L2
ENSG00000162368 CMPK1 161162 sc-eQTL 6.39e-01 0.055 0.117 0.212 gdT L2
ENSG00000079277 MKNK1 878116 sc-eQTL 7.88e-01 0.025 0.0927 0.209 intMono L2
ENSG00000123472 ATPAF1 821092 sc-eQTL 2.83e-01 -0.118 0.11 0.209 intMono L2
ENSG00000132122 SPATA6 -977249 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0479 0.106 0.209 intMono L2
ENSG00000142961 MOB3C 878068 sc-eQTL 1.71e-01 -0.149 0.108 0.209 intMono L2
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 sc-eQTL 3.84e-01 0.0789 0.0904 0.209 intMono L2
ENSG00000162368 CMPK1 161162 sc-eQTL 5.40e-01 0.0639 0.104 0.209 intMono L2
ENSG00000079277 MKNK1 878116 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0319 0.0825 0.213 ncMono L2
ENSG00000123472 ATPAF1 821092 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00671 0.102 0.213 ncMono L2
ENSG00000132122 SPATA6 -977249 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0255 0.0845 0.213 ncMono L2
ENSG00000142961 MOB3C 878068 sc-eQTL 8.55e-01 0.0194 0.107 0.213 ncMono L2
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0247 0.101 0.213 ncMono L2
ENSG00000162368 CMPK1 161162 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0363 0.0984 0.213 ncMono L2
ENSG00000079277 MKNK1 878116 sc-eQTL 3.26e-01 -0.111 0.113 0.229 pDC L2
ENSG00000123472 ATPAF1 821092 sc-eQTL 3.70e-01 0.104 0.116 0.229 pDC L2
ENSG00000123473 STIL 180812 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00494 0.0955 0.229 pDC L2
ENSG00000132122 SPATA6 -977249 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0163 0.108 0.229 pDC L2
ENSG00000142961 MOB3C 878068 sc-eQTL 1.46e-02 0.266 0.108 0.229 pDC L2
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0546 0.0983 0.229 pDC L2
ENSG00000162366 PDZK1IP1 303915 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0501 0.0877 0.229 pDC L2
ENSG00000162368 CMPK1 161162 sc-eQTL 2.31e-01 -0.125 0.104 0.229 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079277 MKNK1 878116 sc-eQTL 5.48e-01 0.0675 0.112 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 821092 sc-eQTL 4.96e-01 0.0568 0.0833 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132122 SPATA6 -977249 sc-eQTL 1.63e-01 -0.147 0.105 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 878068 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0258 0.104 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0304 0.083 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 161162 sc-eQTL 1.64e-01 0.117 0.0841 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 878116 sc-eQTL 2.77e-01 0.114 0.105 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 821092 sc-eQTL 1.95e-01 0.115 0.0887 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132122 SPATA6 -977249 sc-eQTL 5.28e-01 0.0688 0.109 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 878068 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0529 0.1 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 sc-eQTL 7.10e-01 0.0259 0.0696 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 161162 sc-eQTL 9.03e-01 0.0104 0.0851 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 878116 sc-eQTL 9.84e-01 0.00136 0.0678 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 821092 sc-eQTL 6.97e-01 0.0336 0.0861 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000132122 SPATA6 -977249 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0167 0.0889 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 878068 sc-eQTL 5.30e-01 0.0637 0.101 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 sc-eQTL 5.37e-01 0.0438 0.071 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 161162 sc-eQTL 2.15e-01 0.0955 0.0767 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 878116 sc-eQTL 8.91e-01 -0.00956 0.0694 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 821092 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0365 0.0959 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000132122 SPATA6 -977249 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0619 0.0772 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 878068 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000545 0.106 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 sc-eQTL 3.96e-01 0.0765 0.09 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 161162 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000894 0.0902 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 878116 sc-eQTL 3.87e-01 -0.1 0.116 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 821092 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0575 0.0842 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 878068 sc-eQTL 7.00e-01 0.0352 0.0912 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 sc-eQTL 8.30e-01 0.0151 0.0701 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 161162 sc-eQTL 7.59e-01 0.0203 0.0661 0.207 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 eQTL 0.0428 -0.0457 0.0225 0.0 0.0 0.224
ENSG00000162366 PDZK1IP1 303915 eQTL 3.79e-09 0.195 0.0328 0.0 0.0 0.224
ENSG00000162368 CMPK1 161162 eQTL 3.47e-05 0.0501 0.012 0.0 0.0 0.224
ENSG00000237424 FOXD2-AS1 60318 eQTL 0.0519 0.0565 0.029 0.00207 0.0 0.224
ENSG00000272491 AL109659.2 -734602 eQTL 0.0107 -0.095 0.0371 0.00189 0.0 0.224

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000159658 EFCAB14 775845 2.95e-07 1.33e-07 6.26e-08 2.01e-07 1.03e-07 8.45e-08 1.9e-07 5.56e-08 1.54e-07 7.6e-08 1.67e-07 1.2e-07 1.87e-07 7.95e-08 5.94e-08 7.89e-08 4.18e-08 1.64e-07 7.12e-08 5.33e-08 1.22e-07 1.39e-07 1.58e-07 3.07e-08 1.72e-07 1.31e-07 1.17e-07 1.06e-07 1.31e-07 1.07e-07 1.07e-07 3.78e-08 3.59e-08 9.76e-08 3.02e-08 2.74e-08 5.58e-08 8.2e-08 6.76e-08 3.6e-08 5.65e-08 1.46e-07 4.7e-08 1.58e-08 2.64e-08 1.68e-08 8.61e-08 2.02e-09 4.81e-08
ENSG00000162366 PDZK1IP1 303915 1.33e-06 9.1e-07 3.3e-07 6.38e-07 3.17e-07 4.82e-07 1.24e-06 3.65e-07 1.32e-06 4.19e-07 1.41e-06 6.36e-07 1.96e-06 2.83e-07 5.65e-07 8.25e-07 8.37e-07 6.13e-07 6.96e-07 6.9e-07 5.47e-07 1.28e-06 9.21e-07 6.51e-07 1.94e-06 4.36e-07 7.97e-07 7.26e-07 1.25e-06 1.19e-06 5.62e-07 2.07e-07 2.17e-07 6.8e-07 5.34e-07 4.5e-07 5.15e-07 1.69e-07 3.5e-07 2.46e-07 2.93e-07 1.54e-06 5.94e-08 2.67e-08 1.79e-07 1.34e-07 2.37e-07 5.45e-08 1.13e-07
ENSG00000162368 CMPK1 161162 3.47e-06 2.98e-06 5.59e-07 1.98e-06 7.76e-07 7.84e-07 2.25e-06 8.83e-07 2.37e-06 1.27e-06 2.65e-06 1.74e-06 4.01e-06 1.47e-06 8.99e-07 2.11e-06 1.57e-06 2.15e-06 1.54e-06 1.2e-06 1.39e-06 3.29e-06 2.87e-06 1.64e-06 4.05e-06 1.28e-06 1.53e-06 1.84e-06 2.91e-06 2.46e-06 1.96e-06 4.9e-07 6.45e-07 1.44e-06 1.65e-06 9.33e-07 8.92e-07 3.77e-07 1.23e-06 3.64e-07 3.2e-07 3.42e-06 5.92e-07 1.95e-07 3.97e-07 3.58e-07 8.3e-07 2.22e-07 1.78e-07
ENSG00000237424 FOXD2-AS1 60318 7.77e-06 9.28e-06 1.23e-06 4.32e-06 2.44e-06 4.02e-06 9.61e-06 1.81e-06 7.74e-06 4.46e-06 1.06e-05 4.97e-06 1.24e-05 3.9e-06 2.21e-06 6.06e-06 3.75e-06 6.49e-06 2.58e-06 2.85e-06 4.7e-06 8e-06 6.98e-06 3.38e-06 1.22e-05 3.62e-06 4.47e-06 3.19e-06 8.7e-06 7.93e-06 4.48e-06 9.59e-07 1.29e-06 3.24e-06 3.56e-06 2.65e-06 1.82e-06 1.94e-06 2.15e-06 9.56e-07 9.75e-07 1e-05 1.32e-06 2.09e-07 7.75e-07 1.62e-06 1.38e-06 7.02e-07 4.47e-07