Genes within 1Mb (chr1:47482069:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079277 MKNK1 865226 sc-eQTL 9.78e-01 0.00506 0.187 0.053 B L1
ENSG00000123472 ATPAF1 808202 sc-eQTL 8.30e-01 0.025 0.116 0.053 B L1
ENSG00000132122 SPATA6 -990139 sc-eQTL 4.90e-02 0.379 0.192 0.053 B L1
ENSG00000142961 MOB3C 865178 sc-eQTL 4.13e-01 0.146 0.179 0.053 B L1
ENSG00000159658 EFCAB14 762955 sc-eQTL 6.85e-01 0.0457 0.112 0.053 B L1
ENSG00000162368 CMPK1 148272 sc-eQTL 7.94e-01 0.035 0.134 0.053 B L1
ENSG00000079277 MKNK1 865226 sc-eQTL 2.25e-01 0.183 0.151 0.053 CD4T L1
ENSG00000123472 ATPAF1 808202 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00841 0.106 0.053 CD4T L1
ENSG00000132122 SPATA6 -990139 sc-eQTL 3.72e-01 0.165 0.184 0.053 CD4T L1
ENSG00000142961 MOB3C 865178 sc-eQTL 5.21e-01 0.0804 0.125 0.053 CD4T L1
ENSG00000159658 EFCAB14 762955 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0273 0.0956 0.053 CD4T L1
ENSG00000162368 CMPK1 148272 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0941 0.123 0.053 CD4T L1
ENSG00000079277 MKNK1 865226 sc-eQTL 2.24e-01 -0.204 0.167 0.053 CD8T L1
ENSG00000123472 ATPAF1 808202 sc-eQTL 4.09e-01 0.114 0.138 0.053 CD8T L1
ENSG00000142961 MOB3C 865178 sc-eQTL 4.28e-02 -0.303 0.149 0.053 CD8T L1
ENSG00000159658 EFCAB14 762955 sc-eQTL 4.69e-01 0.081 0.112 0.053 CD8T L1
ENSG00000162368 CMPK1 148272 sc-eQTL 9.78e-01 0.00322 0.116 0.053 CD8T L1
ENSG00000079277 MKNK1 865226 sc-eQTL 5.94e-01 -0.064 0.12 0.053 Mono L1
ENSG00000123472 ATPAF1 808202 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0185 0.152 0.053 Mono L1
ENSG00000132122 SPATA6 -990139 sc-eQTL 2.81e-01 -0.15 0.139 0.053 Mono L1
ENSG00000142961 MOB3C 865178 sc-eQTL 4.31e-01 -0.142 0.179 0.053 Mono L1
ENSG00000159658 EFCAB14 762955 sc-eQTL 1.41e-01 0.181 0.123 0.053 Mono L1
ENSG00000162368 CMPK1 148272 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0528 0.138 0.053 Mono L1
ENSG00000079277 MKNK1 865226 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0598 0.203 0.054 NK L1
ENSG00000123472 ATPAF1 808202 sc-eQTL 7.60e-02 0.263 0.148 0.054 NK L1
ENSG00000142961 MOB3C 865178 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0885 0.158 0.054 NK L1
ENSG00000159658 EFCAB14 762955 sc-eQTL 2.26e-01 -0.146 0.12 0.054 NK L1
ENSG00000162368 CMPK1 148272 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00645 0.116 0.054 NK L1
ENSG00000079277 MKNK1 865226 sc-eQTL 1.63e-01 0.241 0.172 0.053 Other_T L1
ENSG00000123472 ATPAF1 808202 sc-eQTL 2.21e-01 -0.152 0.124 0.053 Other_T L1
ENSG00000123473 STIL 167922 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0522 0.1 0.053 Other_T L1
ENSG00000142961 MOB3C 865178 sc-eQTL 4.25e-01 -0.14 0.175 0.053 Other_T L1
ENSG00000159658 EFCAB14 762955 sc-eQTL 1.82e-01 0.163 0.122 0.053 Other_T L1
ENSG00000162368 CMPK1 148272 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0386 0.159 0.053 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079277 MKNK1 865226 sc-eQTL 4.96e-01 0.151 0.221 0.059 B_Activated L2
ENSG00000123472 ATPAF1 808202 sc-eQTL 8.10e-01 0.0509 0.212 0.059 B_Activated L2
ENSG00000132122 SPATA6 -990139 sc-eQTL 2.67e-01 -0.192 0.172 0.059 B_Activated L2
ENSG00000142961 MOB3C 865178 sc-eQTL 7.86e-01 0.0487 0.179 0.059 B_Activated L2
ENSG00000159658 EFCAB14 762955 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0184 0.218 0.059 B_Activated L2
ENSG00000162368 CMPK1 148272 sc-eQTL 1.05e-01 -0.334 0.205 0.059 B_Activated L2
ENSG00000079277 MKNK1 865226 sc-eQTL 5.56e-01 -0.124 0.21 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000123472 ATPAF1 808202 sc-eQTL 8.01e-01 0.0433 0.172 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000132122 SPATA6 -990139 sc-eQTL 1.49e-01 0.282 0.195 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000142961 MOB3C 865178 sc-eQTL 6.68e-01 0.0851 0.198 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000159658 EFCAB14 762955 sc-eQTL 1.40e-01 0.251 0.169 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000162368 CMPK1 148272 sc-eQTL 3.19e-01 0.164 0.164 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000079277 MKNK1 865226 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0777 0.205 0.052 B_Memory L2
ENSG00000123472 ATPAF1 808202 sc-eQTL 4.00e-01 0.157 0.186 0.052 B_Memory L2
ENSG00000132122 SPATA6 -990139 sc-eQTL 2.91e-01 -0.186 0.175 0.052 B_Memory L2
ENSG00000142961 MOB3C 865178 sc-eQTL 4.92e-01 0.129 0.187 0.052 B_Memory L2
ENSG00000159658 EFCAB14 762955 sc-eQTL 3.59e-01 -0.161 0.176 0.052 B_Memory L2
ENSG00000162368 CMPK1 148272 sc-eQTL 9.35e-01 -0.014 0.172 0.052 B_Memory L2
ENSG00000079277 MKNK1 865226 sc-eQTL 2.55e-01 -0.22 0.193 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000123472 ATPAF1 808202 sc-eQTL 9.88e-01 0.00251 0.161 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000132122 SPATA6 -990139 sc-eQTL 4.54e-02 0.389 0.193 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000142961 MOB3C 865178 sc-eQTL 7.64e-01 0.0582 0.194 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000159658 EFCAB14 762955 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00246 0.137 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000162368 CMPK1 148272 sc-eQTL 1.71e-01 0.214 0.156 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000079277 MKNK1 865226 sc-eQTL 9.25e-02 0.333 0.197 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000123472 ATPAF1 808202 sc-eQTL 8.63e-01 0.0307 0.177 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000132122 SPATA6 -990139 sc-eQTL 4.07e-01 0.166 0.2 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000142961 MOB3C 865178 sc-eQTL 5.69e-01 0.103 0.181 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000159658 EFCAB14 762955 sc-eQTL 4.88e-01 -0.105 0.152 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000162368 CMPK1 148272 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0942 0.166 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000079277 MKNK1 865226 sc-eQTL 6.37e-01 0.0964 0.204 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000123472 ATPAF1 808202 sc-eQTL 2.77e-01 0.205 0.188 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000132122 SPATA6 -990139 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0515 0.168 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000142961 MOB3C 865178 sc-eQTL 8.37e-01 0.0379 0.184 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000159658 EFCAB14 762955 sc-eQTL 3.12e-01 0.187 0.184 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000162368 CMPK1 148272 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0461 0.19 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000079277 MKNK1 865226 sc-eQTL 1.54e-01 0.254 0.178 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000123472 ATPAF1 808202 sc-eQTL 2.09e-01 0.147 0.116 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000132122 SPATA6 -990139 sc-eQTL 2.45e-01 0.222 0.19 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000142961 MOB3C 865178 sc-eQTL 2.39e-01 0.161 0.136 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000159658 EFCAB14 762955 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0296 0.103 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000162368 CMPK1 148272 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0448 0.117 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000079277 MKNK1 865226 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00547 0.2 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 808202 sc-eQTL 7.46e-02 -0.268 0.15 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000132122 SPATA6 -990139 sc-eQTL 7.30e-01 0.0659 0.19 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000142961 MOB3C 865178 sc-eQTL 9.98e-01 0.000523 0.173 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 762955 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00819 0.129 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000162368 CMPK1 148272 sc-eQTL 3.87e-01 -0.114 0.132 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000079277 MKNK1 865226 sc-eQTL 9.42e-01 0.0142 0.195 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 808202 sc-eQTL 3.19e-01 -0.155 0.155 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000132122 SPATA6 -990139 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0694 0.204 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000142961 MOB3C 865178 sc-eQTL 8.06e-01 0.0481 0.195 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 762955 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0467 0.15 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000162368 CMPK1 148272 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0779 0.168 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000079277 MKNK1 865226 sc-eQTL 5.02e-01 -0.132 0.196 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000123472 ATPAF1 808202 sc-eQTL 3.30e-01 -0.149 0.153 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000142961 MOB3C 865178 sc-eQTL 1.53e-02 -0.43 0.176 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000159658 EFCAB14 762955 sc-eQTL 8.01e-01 0.0382 0.152 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000162368 CMPK1 148272 sc-eQTL 3.38e-01 -0.145 0.151 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000079277 MKNK1 865226 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0251 0.198 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000123472 ATPAF1 808202 sc-eQTL 1.98e-01 0.187 0.144 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000142961 MOB3C 865178 sc-eQTL 1.55e-01 -0.238 0.167 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000159658 EFCAB14 762955 sc-eQTL 7.07e-01 0.06 0.159 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000162368 CMPK1 148272 sc-eQTL 9.74e-01 0.00484 0.149 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000079277 MKNK1 865226 sc-eQTL 1.92e-02 -0.483 0.205 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 808202 sc-eQTL 4.93e-01 -0.131 0.19 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000142961 MOB3C 865178 sc-eQTL 7.96e-01 0.0491 0.19 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 762955 sc-eQTL 5.66e-01 0.108 0.189 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000162368 CMPK1 148272 sc-eQTL 7.83e-01 0.0518 0.188 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000079277 MKNK1 865226 sc-eQTL 2.57e-01 0.189 0.166 0.054 MAIT L2
ENSG00000123472 ATPAF1 808202 sc-eQTL 9.56e-01 0.009 0.163 0.054 MAIT L2
ENSG00000123473 STIL 167922 sc-eQTL 5.61e-01 -0.094 0.162 0.054 MAIT L2
ENSG00000142961 MOB3C 865178 sc-eQTL 2.10e-01 -0.219 0.174 0.054 MAIT L2
ENSG00000159658 EFCAB14 762955 sc-eQTL 7.29e-01 0.0551 0.159 0.054 MAIT L2
ENSG00000162368 CMPK1 148272 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0364 0.162 0.054 MAIT L2
ENSG00000079277 MKNK1 865226 sc-eQTL 9.69e-01 0.00781 0.2 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000123472 ATPAF1 808202 sc-eQTL 1.38e-01 0.269 0.181 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000142961 MOB3C 865178 sc-eQTL 6.38e-01 -0.088 0.187 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000159658 EFCAB14 762955 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0819 0.185 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000162368 CMPK1 148272 sc-eQTL 5.18e-01 -0.12 0.185 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000079277 MKNK1 865226 sc-eQTL 9.57e-01 0.0115 0.213 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000123472 ATPAF1 808202 sc-eQTL 2.83e-01 0.179 0.166 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000142961 MOB3C 865178 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0274 0.173 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000159658 EFCAB14 762955 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0247 0.139 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000162368 CMPK1 148272 sc-eQTL 4.94e-01 0.0972 0.142 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000079277 MKNK1 865226 sc-eQTL 5.16e-01 0.13 0.199 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000123472 ATPAF1 808202 sc-eQTL 2.36e-01 0.233 0.196 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000142961 MOB3C 865178 sc-eQTL 6.09e-01 0.0927 0.181 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000159658 EFCAB14 762955 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00671 0.164 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000162368 CMPK1 148272 sc-eQTL 4.71e-01 0.131 0.182 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000079277 MKNK1 865226 sc-eQTL 5.53e-01 -0.119 0.2 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000123472 ATPAF1 808202 sc-eQTL 9.10e-01 0.0188 0.165 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000142961 MOB3C 865178 sc-eQTL 7.18e-01 -0.065 0.179 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000159658 EFCAB14 762955 sc-eQTL 4.92e-01 -0.107 0.156 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000162368 CMPK1 148272 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0397 0.171 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000079277 MKNK1 865226 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0742 0.224 0.067 PB L2
ENSG00000123472 ATPAF1 808202 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0639 0.15 0.067 PB L2
ENSG00000132122 SPATA6 -990139 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0671 0.151 0.067 PB L2
ENSG00000142961 MOB3C 865178 sc-eQTL 3.48e-01 -0.19 0.202 0.067 PB L2
ENSG00000159658 EFCAB14 762955 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0614 0.195 0.067 PB L2
ENSG00000162368 CMPK1 148272 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0324 0.201 0.067 PB L2
ENSG00000079277 MKNK1 865226 sc-eQTL 3.04e-01 0.216 0.21 0.052 Pro_T L2
ENSG00000123472 ATPAF1 808202 sc-eQTL 1.42e-01 -0.242 0.164 0.052 Pro_T L2
ENSG00000123473 STIL 167922 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0454 0.128 0.052 Pro_T L2
ENSG00000142961 MOB3C 865178 sc-eQTL 5.21e-01 -0.122 0.189 0.052 Pro_T L2
ENSG00000159658 EFCAB14 762955 sc-eQTL 1.79e-01 0.227 0.169 0.052 Pro_T L2
ENSG00000162368 CMPK1 148272 sc-eQTL 3.52e-01 0.175 0.187 0.052 Pro_T L2
ENSG00000079277 MKNK1 865226 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00543 0.201 0.053 Treg L2
ENSG00000123472 ATPAF1 808202 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00456 0.169 0.053 Treg L2
ENSG00000132122 SPATA6 -990139 sc-eQTL 8.74e-01 0.0266 0.168 0.053 Treg L2
ENSG00000142961 MOB3C 865178 sc-eQTL 2.01e-01 -0.236 0.183 0.053 Treg L2
ENSG00000159658 EFCAB14 762955 sc-eQTL 5.30e-01 -0.105 0.167 0.053 Treg L2
ENSG00000162368 CMPK1 148272 sc-eQTL 1.48e-02 -0.371 0.151 0.053 Treg L2
ENSG00000079277 MKNK1 865226 sc-eQTL 7.99e-01 0.0482 0.189 0.051 cDC L2
ENSG00000123472 ATPAF1 808202 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0155 0.208 0.051 cDC L2
ENSG00000123473 STIL 167922 sc-eQTL 4.67e-01 -0.131 0.18 0.051 cDC L2
ENSG00000132122 SPATA6 -990139 sc-eQTL 1.43e-01 0.312 0.212 0.051 cDC L2
ENSG00000142961 MOB3C 865178 sc-eQTL 6.87e-01 0.0744 0.184 0.051 cDC L2
ENSG00000159658 EFCAB14 762955 sc-eQTL 4.83e-01 -0.146 0.208 0.051 cDC L2
ENSG00000162366 PDZK1IP1 291025 sc-eQTL 4.16e-01 -0.142 0.174 0.051 cDC L2
ENSG00000162368 CMPK1 148272 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0246 0.196 0.051 cDC L2
ENSG00000079277 MKNK1 865226 sc-eQTL 8.38e-01 0.0258 0.126 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000123472 ATPAF1 808202 sc-eQTL 8.77e-01 0.0252 0.162 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000132122 SPATA6 -990139 sc-eQTL 2.72e-01 -0.184 0.167 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000142961 MOB3C 865178 sc-eQTL 2.58e-01 -0.222 0.196 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000159658 EFCAB14 762955 sc-eQTL 3.77e-01 0.123 0.139 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000162368 CMPK1 148272 sc-eQTL 7.38e-01 0.0506 0.152 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000079277 MKNK1 865226 sc-eQTL 7.29e-01 0.0545 0.157 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000123472 ATPAF1 808202 sc-eQTL 4.18e-01 -0.149 0.184 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000132122 SPATA6 -990139 sc-eQTL 5.64e-01 -0.108 0.186 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000142961 MOB3C 865178 sc-eQTL 1.38e-01 0.291 0.195 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000159658 EFCAB14 762955 sc-eQTL 6.80e-01 0.0637 0.155 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000162368 CMPK1 148272 sc-eQTL 4.37e-01 0.139 0.179 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000079277 MKNK1 865226 sc-eQTL 4.26e-02 0.467 0.228 0.055 gdT L2
ENSG00000123472 ATPAF1 808202 sc-eQTL 5.67e-01 0.116 0.202 0.055 gdT L2
ENSG00000123473 STIL 167922 sc-eQTL 9.17e-02 -0.302 0.178 0.055 gdT L2
ENSG00000142961 MOB3C 865178 sc-eQTL 2.24e-01 -0.259 0.212 0.055 gdT L2
ENSG00000159658 EFCAB14 762955 sc-eQTL 7.52e-02 0.348 0.194 0.055 gdT L2
ENSG00000162368 CMPK1 148272 sc-eQTL 1.79e-01 0.28 0.207 0.055 gdT L2
ENSG00000079277 MKNK1 865226 sc-eQTL 4.17e-01 -0.144 0.177 0.051 intMono L2
ENSG00000123472 ATPAF1 808202 sc-eQTL 6.17e-02 0.391 0.208 0.051 intMono L2
ENSG00000132122 SPATA6 -990139 sc-eQTL 4.06e-01 -0.168 0.201 0.051 intMono L2
ENSG00000142961 MOB3C 865178 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0166 0.207 0.051 intMono L2
ENSG00000159658 EFCAB14 762955 sc-eQTL 6.58e-01 0.0766 0.173 0.051 intMono L2
ENSG00000162368 CMPK1 148272 sc-eQTL 3.00e-02 -0.43 0.197 0.051 intMono L2
ENSG00000079277 MKNK1 865226 sc-eQTL 1.83e-01 -0.2 0.15 0.054 ncMono L2
ENSG00000123472 ATPAF1 808202 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0616 0.185 0.054 ncMono L2
ENSG00000132122 SPATA6 -990139 sc-eQTL 7.80e-01 -0.043 0.154 0.054 ncMono L2
ENSG00000142961 MOB3C 865178 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0864 0.194 0.054 ncMono L2
ENSG00000159658 EFCAB14 762955 sc-eQTL 4.34e-01 0.143 0.183 0.054 ncMono L2
ENSG00000162368 CMPK1 148272 sc-eQTL 1.82e-01 -0.239 0.178 0.054 ncMono L2
ENSG00000079277 MKNK1 865226 sc-eQTL 6.91e-01 0.0883 0.222 0.051 pDC L2
ENSG00000123472 ATPAF1 808202 sc-eQTL 7.49e-01 0.0732 0.228 0.051 pDC L2
ENSG00000123473 STIL 167922 sc-eQTL 6.81e-01 0.077 0.187 0.051 pDC L2
ENSG00000132122 SPATA6 -990139 sc-eQTL 1.81e-01 0.283 0.211 0.051 pDC L2
ENSG00000142961 MOB3C 865178 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0403 0.215 0.051 pDC L2
ENSG00000159658 EFCAB14 762955 sc-eQTL 3.11e-01 -0.195 0.192 0.051 pDC L2
ENSG00000162366 PDZK1IP1 291025 sc-eQTL 2.04e-01 -0.219 0.171 0.051 pDC L2
ENSG00000162368 CMPK1 148272 sc-eQTL 9.56e-01 -0.0114 0.206 0.051 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079277 MKNK1 865226 sc-eQTL 5.03e-01 -0.138 0.205 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 808202 sc-eQTL 4.25e-01 0.122 0.152 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132122 SPATA6 -990139 sc-eQTL 4.36e-01 0.15 0.193 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 865178 sc-eQTL 5.99e-01 0.101 0.191 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 762955 sc-eQTL 3.42e-01 0.144 0.151 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 148272 sc-eQTL 6.34e-01 0.0737 0.154 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 865226 sc-eQTL 9.49e-01 -0.0123 0.193 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 808202 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00884 0.164 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132122 SPATA6 -990139 sc-eQTL 5.37e-02 0.385 0.198 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 865178 sc-eQTL 4.85e-01 0.129 0.185 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 762955 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0445 0.128 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 148272 sc-eQTL 6.28e-01 0.0758 0.156 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 865226 sc-eQTL 6.76e-01 0.0509 0.121 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 808202 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0667 0.154 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000132122 SPATA6 -990139 sc-eQTL 1.96e-01 -0.206 0.159 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 865178 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0626 0.181 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 762955 sc-eQTL 2.24e-01 0.155 0.127 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 148272 sc-eQTL 7.05e-01 0.0522 0.138 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 865226 sc-eQTL 4.31e-02 -0.256 0.126 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 808202 sc-eQTL 3.34e-01 0.17 0.175 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000132122 SPATA6 -990139 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0945 0.142 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 865178 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0581 0.195 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 762955 sc-eQTL 3.12e-01 0.167 0.165 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 148272 sc-eQTL 2.82e-02 -0.361 0.163 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 865226 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0521 0.207 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 808202 sc-eQTL 1.68e-01 0.208 0.15 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 865178 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0946 0.163 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 762955 sc-eQTL 2.20e-01 -0.154 0.125 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 148272 sc-eQTL 9.17e-01 0.0124 0.118 0.054 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079277 MKNK1 865226 eQTL 0.00867 0.0835 0.0317 0.00338 0.0 0.0353
ENSG00000132122 SPATA6 -990139 eQTL 0.0421 0.0942 0.0463 0.0 0.0 0.0353
ENSG00000142961 MOB3C 865178 eQTL 0.0024 0.146 0.0478 0.0 0.0 0.0353
ENSG00000269956 MKNK1-AS1 943373 eQTL 0.017 0.14 0.0586 0.00103 0.0 0.0353


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079277 MKNK1 865226 2.61e-07 1.1e-07 3.65e-08 1.79e-07 9.02e-08 9.3e-08 1.42e-07 5.49e-08 1.42e-07 4.24e-08 1.62e-07 8.03e-08 1.26e-07 6.21e-08 5.44e-08 7.89e-08 4.94e-08 1.1e-07 5.19e-08 4.03e-08 1.05e-07 1.3e-07 1.3e-07 4.53e-08 1.31e-07 1.15e-07 1.12e-07 8.71e-08 9.88e-08 1.1e-07 9.58e-08 3.98e-08 2.74e-08 8.21e-08 8.99e-08 3.99e-08 4.75e-08 9.44e-08 8.19e-08 3.18e-08 4.36e-08 1.37e-07 4.12e-08 1.71e-08 5.87e-08 1.7e-08 1.24e-07 4.09e-09 4.79e-08
ENSG00000132122 SPATA6 -990139 2.66e-07 1.06e-07 3.31e-08 1.78e-07 9.65e-08 9.32e-08 1.42e-07 5.35e-08 1.37e-07 4.24e-08 1.63e-07 7.58e-08 1.27e-07 6.21e-08 5.14e-08 8.01e-08 4.94e-08 1.07e-07 5.2e-08 3.88e-08 1.06e-07 1.33e-07 1.29e-07 4.82e-08 1.29e-07 1.13e-07 1.1e-07 8.71e-08 9.97e-08 1.1e-07 9.75e-08 4.1e-08 2.74e-08 8.3e-08 9.24e-08 3.87e-08 4.51e-08 9.25e-08 8.42e-08 3.01e-08 4e-08 1.36e-07 3.82e-08 2.55e-08 7.26e-08 1.74e-08 1.27e-07 4.26e-09 4.91e-08
ENSG00000142961 MOB3C 865178 2.61e-07 1.1e-07 3.65e-08 1.79e-07 9.02e-08 9.3e-08 1.42e-07 5.49e-08 1.42e-07 4.24e-08 1.62e-07 8.03e-08 1.26e-07 6.21e-08 5.44e-08 7.89e-08 4.94e-08 1.1e-07 5.19e-08 4.03e-08 1.05e-07 1.3e-07 1.3e-07 4.53e-08 1.31e-07 1.15e-07 1.12e-07 8.71e-08 9.88e-08 1.1e-07 9.58e-08 3.98e-08 2.74e-08 8.21e-08 8.99e-08 3.99e-08 4.75e-08 9.44e-08 8.19e-08 3.18e-08 4.36e-08 1.37e-07 4.12e-08 1.71e-08 5.87e-08 1.7e-08 1.24e-07 4.09e-09 4.79e-08