logo

Genes within 1Mb (chr1:47323307:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079277 MKNK1 706464 sc-eQTL 1.89e-02 0.237 0.1 0.203 B L1
ENSG00000117481 NSUN4 983130 sc-eQTL 1.31e-01 0.137 0.0901 0.203 B L1
ENSG00000123472 ATPAF1 649440 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00297 0.0627 0.203 B L1
ENSG00000142961 MOB3C 706416 sc-eQTL 2.87e-01 -0.103 0.0964 0.203 B L1
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 sc-eQTL 4.51e-02 0.121 0.0602 0.203 B L1
ENSG00000162368 CMPK1 -10490 sc-eQTL 3.58e-04 -0.255 0.0703 0.203 B L1
ENSG00000079277 MKNK1 706464 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00855 0.0842 0.203 CD4T L1
ENSG00000117481 NSUN4 983130 sc-eQTL 2.42e-01 0.0731 0.0623 0.203 CD4T L1
ENSG00000123472 ATPAF1 649440 sc-eQTL 6.22e-01 -0.029 0.0587 0.203 CD4T L1
ENSG00000142961 MOB3C 706416 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0116 0.0697 0.203 CD4T L1
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 sc-eQTL 6.19e-02 -0.099 0.0527 0.203 CD4T L1
ENSG00000162368 CMPK1 -10490 sc-eQTL 2.08e-06 -0.318 0.0651 0.203 CD4T L1
ENSG00000079277 MKNK1 706464 sc-eQTL 5.18e-01 0.0602 0.093 0.203 CD8T L1
ENSG00000117481 NSUN4 983130 sc-eQTL 3.63e-01 0.0795 0.0872 0.203 CD8T L1
ENSG00000123472 ATPAF1 649440 sc-eQTL 8.58e-01 0.0138 0.0769 0.203 CD8T L1
ENSG00000142961 MOB3C 706416 sc-eQTL 1.71e-02 0.198 0.0823 0.203 CD8T L1
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 sc-eQTL 1.51e-01 -0.0889 0.0617 0.203 CD8T L1
ENSG00000162368 CMPK1 -10490 sc-eQTL 1.61e-04 -0.239 0.0622 0.203 CD8T L1
ENSG00000079277 MKNK1 706464 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0224 0.0933 0.203 DC L1
ENSG00000117480 FAAH 928990 sc-eQTL 2.52e-01 0.0893 0.0778 0.203 DC L1
ENSG00000117481 NSUN4 983130 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0256 0.0991 0.203 DC L1
ENSG00000123472 ATPAF1 649440 sc-eQTL 9.49e-01 0.00644 0.1 0.203 DC L1
ENSG00000123473 STIL 9160 sc-eQTL 4.46e-01 0.0726 0.095 0.203 DC L1
ENSG00000142961 MOB3C 706416 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0425 0.0946 0.203 DC L1
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 sc-eQTL 8.93e-01 0.0126 0.0935 0.203 DC L1
ENSG00000162366 PDZK1IP1 132263 sc-eQTL 9.95e-02 0.148 0.0897 0.203 DC L1
ENSG00000162368 CMPK1 -10490 sc-eQTL 1.03e-01 -0.145 0.0885 0.203 DC L1
ENSG00000079277 MKNK1 706464 sc-eQTL 8.68e-01 0.0112 0.0672 0.203 Mono L1
ENSG00000117480 FAAH 928990 sc-eQTL 2.30e-01 -0.101 0.0839 0.203 Mono L1
ENSG00000117481 NSUN4 983130 sc-eQTL 5.65e-01 0.0575 0.0999 0.203 Mono L1
ENSG00000123472 ATPAF1 649440 sc-eQTL 1.83e-01 0.113 0.085 0.203 Mono L1
ENSG00000142961 MOB3C 706416 sc-eQTL 2.93e-01 0.106 0.1 0.203 Mono L1
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0565 0.069 0.203 Mono L1
ENSG00000162368 CMPK1 -10490 sc-eQTL 7.33e-01 0.0264 0.0773 0.203 Mono L1
ENSG00000079277 MKNK1 706464 sc-eQTL 5.13e-01 0.0723 0.11 0.202 NK L1
ENSG00000117481 NSUN4 983130 sc-eQTL 1.16e-01 0.134 0.085 0.202 NK L1
ENSG00000123472 ATPAF1 649440 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00471 0.081 0.202 NK L1
ENSG00000142961 MOB3C 706416 sc-eQTL 5.18e-02 -0.167 0.0856 0.202 NK L1
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 sc-eQTL 9.99e-01 0.000112 0.0658 0.202 NK L1
ENSG00000162368 CMPK1 -10490 sc-eQTL 4.24e-04 -0.22 0.0614 0.202 NK L1
ENSG00000079277 MKNK1 706464 sc-eQTL 6.25e-01 0.0469 0.0957 0.203 Other_T L1
ENSG00000117481 NSUN4 983130 sc-eQTL 3.14e-01 -0.103 0.102 0.203 Other_T L1
ENSG00000123472 ATPAF1 649440 sc-eQTL 3.81e-01 0.0604 0.0687 0.203 Other_T L1
ENSG00000123473 STIL 9160 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0314 0.0556 0.203 Other_T L1
ENSG00000142961 MOB3C 706416 sc-eQTL 3.70e-02 -0.202 0.0961 0.203 Other_T L1
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0627 0.0678 0.203 Other_T L1
ENSG00000162368 CMPK1 -10490 sc-eQTL 3.88e-02 -0.181 0.0872 0.203 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079277 MKNK1 706464 sc-eQTL 7.63e-01 0.0378 0.125 0.191 B_Activated L2
ENSG00000117481 NSUN4 983130 sc-eQTL 3.69e-01 -0.106 0.118 0.191 B_Activated L2
ENSG00000123472 ATPAF1 649440 sc-eQTL 3.04e-01 -0.123 0.119 0.191 B_Activated L2
ENSG00000142961 MOB3C 706416 sc-eQTL 4.67e-01 0.0735 0.101 0.191 B_Activated L2
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 sc-eQTL 5.45e-01 0.0747 0.123 0.191 B_Activated L2
ENSG00000162368 CMPK1 -10490 sc-eQTL 1.66e-01 -0.161 0.116 0.191 B_Activated L2
ENSG00000079277 MKNK1 706464 sc-eQTL 7.21e-02 0.201 0.111 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000117481 NSUN4 983130 sc-eQTL 1.54e-01 0.146 0.102 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000123472 ATPAF1 649440 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00647 0.0914 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000142961 MOB3C 706416 sc-eQTL 9.74e-01 -0.0035 0.105 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 sc-eQTL 9.77e-01 -0.0026 0.0905 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000162368 CMPK1 -10490 sc-eQTL 3.85e-04 -0.307 0.085 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000079277 MKNK1 706464 sc-eQTL 2.59e-01 0.128 0.113 0.205 B_Memory L2
ENSG00000117481 NSUN4 983130 sc-eQTL 1.70e-01 0.149 0.108 0.205 B_Memory L2
ENSG00000123472 ATPAF1 649440 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0413 0.103 0.205 B_Memory L2
ENSG00000142961 MOB3C 706416 sc-eQTL 3.98e-01 0.0873 0.103 0.205 B_Memory L2
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 sc-eQTL 2.95e-01 0.102 0.0969 0.205 B_Memory L2
ENSG00000162368 CMPK1 -10490 sc-eQTL 4.89e-03 -0.266 0.0934 0.205 B_Memory L2
ENSG00000079277 MKNK1 706464 sc-eQTL 3.18e-01 0.106 0.106 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000117481 NSUN4 983130 sc-eQTL 8.49e-01 0.0176 0.0924 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000123472 ATPAF1 649440 sc-eQTL 2.97e-01 0.0922 0.0882 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000142961 MOB3C 706416 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00144 0.107 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 sc-eQTL 4.69e-01 0.0544 0.075 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000162368 CMPK1 -10490 sc-eQTL 6.43e-03 -0.233 0.0847 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000079277 MKNK1 706464 sc-eQTL 6.32e-02 0.202 0.108 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000117481 NSUN4 983130 sc-eQTL 9.83e-01 0.00218 0.0998 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000123472 ATPAF1 649440 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0608 0.0971 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000142961 MOB3C 706416 sc-eQTL 4.48e-02 -0.199 0.0984 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 sc-eQTL 5.01e-01 0.0562 0.0833 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000162368 CMPK1 -10490 sc-eQTL 1.02e-01 -0.148 0.0903 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000079277 MKNK1 706464 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00899 0.114 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000117481 NSUN4 983130 sc-eQTL 5.54e-03 -0.29 0.103 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000123472 ATPAF1 649440 sc-eQTL 1.35e-01 0.157 0.104 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000142961 MOB3C 706416 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0266 0.103 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0165 0.103 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000162368 CMPK1 -10490 sc-eQTL 1.27e-01 -0.162 0.105 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000079277 MKNK1 706464 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0652 0.0999 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000117481 NSUN4 983130 sc-eQTL 3.80e-01 0.0662 0.0753 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000123472 ATPAF1 649440 sc-eQTL 7.03e-01 0.025 0.0654 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000142961 MOB3C 706416 sc-eQTL 6.45e-01 0.0353 0.0765 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0597 0.0574 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000162368 CMPK1 -10490 sc-eQTL 1.00e-05 -0.284 0.0627 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000079277 MKNK1 706464 sc-eQTL 5.44e-01 0.0664 0.109 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000117481 NSUN4 983130 sc-eQTL 3.49e-01 0.0738 0.0786 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 649440 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0749 0.0822 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000142961 MOB3C 706416 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00151 0.0946 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 sc-eQTL 4.37e-02 -0.142 0.0698 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000162368 CMPK1 -10490 sc-eQTL 4.05e-06 -0.324 0.0685 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000079277 MKNK1 706464 sc-eQTL 6.27e-01 0.0514 0.106 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000117481 NSUN4 983130 sc-eQTL 6.04e-01 -0.048 0.0925 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 649440 sc-eQTL 3.66e-01 0.0762 0.0841 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000142961 MOB3C 706416 sc-eQTL 2.07e-01 -0.134 0.106 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 sc-eQTL 7.84e-01 0.0224 0.0813 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000162368 CMPK1 -10490 sc-eQTL 9.60e-04 -0.298 0.089 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000079277 MKNK1 706464 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0287 0.107 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000117481 NSUN4 983130 sc-eQTL 1.72e-01 0.139 0.102 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000123472 ATPAF1 649440 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00769 0.0834 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000142961 MOB3C 706416 sc-eQTL 2.63e-02 0.215 0.096 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 sc-eQTL 6.53e-01 0.0372 0.0826 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000162368 CMPK1 -10490 sc-eQTL 1.18e-02 -0.206 0.0813 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000079277 MKNK1 706464 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0542 0.11 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000117481 NSUN4 983130 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0132 0.0977 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000123472 ATPAF1 649440 sc-eQTL 9.62e-01 0.00384 0.0806 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000142961 MOB3C 706416 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0221 0.0933 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 sc-eQTL 5.57e-03 -0.243 0.0869 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000162368 CMPK1 -10490 sc-eQTL 1.28e-02 -0.205 0.0816 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000079277 MKNK1 706464 sc-eQTL 8.78e-01 0.0174 0.113 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000117481 NSUN4 983130 sc-eQTL 3.94e-03 0.319 0.109 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 649440 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0107 0.0981 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000142961 MOB3C 706416 sc-eQTL 4.17e-01 0.0857 0.105 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0533 0.0994 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000162368 CMPK1 -10490 sc-eQTL 1.03e-01 -0.152 0.0926 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000079277 MKNK1 706464 sc-eQTL 3.30e-01 0.109 0.111 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000117481 NSUN4 983130 sc-eQTL 7.55e-02 -0.193 0.108 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 649440 sc-eQTL 2.33e-01 0.122 0.102 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000142961 MOB3C 706416 sc-eQTL 5.14e-02 0.199 0.101 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 sc-eQTL 4.00e-01 0.0856 0.101 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000162368 CMPK1 -10490 sc-eQTL 4.05e-02 -0.207 0.1 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000079277 MKNK1 706464 sc-eQTL 5.95e-01 0.049 0.092 0.203 MAIT L2
ENSG00000117481 NSUN4 983130 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0139 0.105 0.203 MAIT L2
ENSG00000123472 ATPAF1 649440 sc-eQTL 1.69e-01 -0.124 0.0896 0.203 MAIT L2
ENSG00000123473 STIL 9160 sc-eQTL 1.54e-01 0.127 0.0888 0.203 MAIT L2
ENSG00000142961 MOB3C 706416 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0864 0.0962 0.203 MAIT L2
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 sc-eQTL 1.02e-01 -0.143 0.0872 0.203 MAIT L2
ENSG00000162368 CMPK1 -10490 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0832 0.0891 0.203 MAIT L2
ENSG00000079277 MKNK1 706464 sc-eQTL 7.08e-01 0.0417 0.111 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000117481 NSUN4 983130 sc-eQTL 2.19e-01 0.124 0.101 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000123472 ATPAF1 649440 sc-eQTL 7.21e-01 0.0361 0.101 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000142961 MOB3C 706416 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0857 0.104 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 sc-eQTL 2.43e-02 0.23 0.102 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000162368 CMPK1 -10490 sc-eQTL 5.37e-01 0.0637 0.103 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000079277 MKNK1 706464 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0406 0.116 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000117481 NSUN4 983130 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0329 0.105 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000123472 ATPAF1 649440 sc-eQTL 7.97e-01 0.0235 0.0912 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000142961 MOB3C 706416 sc-eQTL 1.55e-01 -0.135 0.0943 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 sc-eQTL 4.92e-01 0.0522 0.0759 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000162368 CMPK1 -10490 sc-eQTL 3.89e-03 -0.222 0.076 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000079277 MKNK1 706464 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0293 0.109 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000117481 NSUN4 983130 sc-eQTL 2.24e-02 0.245 0.106 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000123472 ATPAF1 649440 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0334 0.107 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000142961 MOB3C 706416 sc-eQTL 1.06e-01 -0.159 0.0979 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0241 0.0894 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000162368 CMPK1 -10490 sc-eQTL 2.60e-01 -0.112 0.0987 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000079277 MKNK1 706464 sc-eQTL 6.00e-02 0.206 0.109 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000117481 NSUN4 983130 sc-eQTL 2.07e-01 0.125 0.0986 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000123472 ATPAF1 649440 sc-eQTL 2.44e-01 -0.106 0.0905 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000142961 MOB3C 706416 sc-eQTL 1.72e-01 -0.134 0.098 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 sc-eQTL 7.95e-02 -0.15 0.0852 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000162368 CMPK1 -10490 sc-eQTL 8.26e-03 -0.246 0.0921 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000079277 MKNK1 706464 sc-eQTL 3.58e-01 -0.12 0.13 0.211 PB L2
ENSG00000117481 NSUN4 983130 sc-eQTL 9.44e-01 0.00989 0.141 0.211 PB L2
ENSG00000123472 ATPAF1 649440 sc-eQTL 2.89e-01 0.0928 0.0872 0.211 PB L2
ENSG00000142961 MOB3C 706416 sc-eQTL 2.11e-01 -0.147 0.117 0.211 PB L2
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0479 0.114 0.211 PB L2
ENSG00000162368 CMPK1 -10490 sc-eQTL 1.33e-01 -0.176 0.116 0.211 PB L2
ENSG00000079277 MKNK1 706464 sc-eQTL 2.98e-01 0.12 0.115 0.2 Pro_T L2
ENSG00000117481 NSUN4 983130 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0617 0.113 0.2 Pro_T L2
ENSG00000123472 ATPAF1 649440 sc-eQTL 2.53e-03 0.271 0.0888 0.2 Pro_T L2
ENSG00000123473 STIL 9160 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0245 0.0704 0.2 Pro_T L2
ENSG00000142961 MOB3C 706416 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0516 0.104 0.2 Pro_T L2
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 sc-eQTL 5.07e-01 0.0619 0.093 0.2 Pro_T L2
ENSG00000162368 CMPK1 -10490 sc-eQTL 1.79e-01 -0.139 0.103 0.2 Pro_T L2
ENSG00000079277 MKNK1 706464 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0467 0.107 0.203 Treg L2
ENSG00000117481 NSUN4 983130 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00926 0.0969 0.203 Treg L2
ENSG00000123472 ATPAF1 649440 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0876 0.0897 0.203 Treg L2
ENSG00000142961 MOB3C 706416 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0484 0.0979 0.203 Treg L2
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 sc-eQTL 8.80e-01 0.0135 0.0888 0.203 Treg L2
ENSG00000162368 CMPK1 -10490 sc-eQTL 1.64e-02 -0.194 0.0803 0.203 Treg L2
ENSG00000079277 MKNK1 706464 sc-eQTL 9.72e-01 0.00354 0.1 0.198 cDC L2
ENSG00000117480 FAAH 928990 sc-eQTL 5.42e-01 0.0663 0.108 0.198 cDC L2
ENSG00000117481 NSUN4 983130 sc-eQTL 1.23e-01 -0.174 0.112 0.198 cDC L2
ENSG00000123472 ATPAF1 649440 sc-eQTL 8.89e-01 0.0154 0.11 0.198 cDC L2
ENSG00000123473 STIL 9160 sc-eQTL 3.64e-01 0.0867 0.0953 0.198 cDC L2
ENSG00000142961 MOB3C 706416 sc-eQTL 5.02e-01 0.0656 0.0976 0.198 cDC L2
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 sc-eQTL 3.85e-01 0.0958 0.11 0.198 cDC L2
ENSG00000162366 PDZK1IP1 132263 sc-eQTL 1.82e-01 0.123 0.0918 0.198 cDC L2
ENSG00000162368 CMPK1 -10490 sc-eQTL 1.36e-01 -0.155 0.103 0.198 cDC L2
ENSG00000079277 MKNK1 706464 sc-eQTL 6.60e-01 0.0315 0.0714 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000117480 FAAH 928990 sc-eQTL 8.90e-01 0.0117 0.0849 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000117481 NSUN4 983130 sc-eQTL 9.00e-01 0.0136 0.108 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000123472 ATPAF1 649440 sc-eQTL 3.21e-01 0.091 0.0914 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000142961 MOB3C 706416 sc-eQTL 5.81e-01 0.0614 0.111 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000189 0.0788 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000162368 CMPK1 -10490 sc-eQTL 1.78e-01 0.116 0.0854 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000079277 MKNK1 706464 sc-eQTL 2.40e-01 -0.101 0.0859 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000117480 FAAH 928990 sc-eQTL 1.95e-02 -0.22 0.0933 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000117481 NSUN4 983130 sc-eQTL 5.21e-01 0.0682 0.106 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000123472 ATPAF1 649440 sc-eQTL 4.95e-01 0.0688 0.101 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000142961 MOB3C 706416 sc-eQTL 2.49e-01 0.124 0.107 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0456 0.0846 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000162368 CMPK1 -10490 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0489 0.098 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000079277 MKNK1 706464 sc-eQTL 7.86e-01 0.0378 0.139 0.209 gdT L2
ENSG00000117481 NSUN4 983130 sc-eQTL 6.79e-01 -0.057 0.137 0.209 gdT L2
ENSG00000123472 ATPAF1 649440 sc-eQTL 6.28e-01 0.0588 0.121 0.209 gdT L2
ENSG00000123473 STIL 9160 sc-eQTL 3.03e-01 0.11 0.107 0.209 gdT L2
ENSG00000142961 MOB3C 706416 sc-eQTL 3.63e-01 -0.116 0.127 0.209 gdT L2
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00397 0.117 0.209 gdT L2
ENSG00000162368 CMPK1 -10490 sc-eQTL 2.54e-01 -0.142 0.124 0.209 gdT L2
ENSG00000079277 MKNK1 706464 sc-eQTL 6.50e-01 0.0426 0.0939 0.202 intMono L2
ENSG00000117480 FAAH 928990 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0124 0.105 0.202 intMono L2
ENSG00000117481 NSUN4 983130 sc-eQTL 1.57e-01 0.154 0.109 0.202 intMono L2
ENSG00000123472 ATPAF1 649440 sc-eQTL 3.04e-01 0.115 0.111 0.202 intMono L2
ENSG00000142961 MOB3C 706416 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0107 0.11 0.202 intMono L2
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0399 0.0917 0.202 intMono L2
ENSG00000162368 CMPK1 -10490 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0872 0.105 0.202 intMono L2
ENSG00000079277 MKNK1 706464 sc-eQTL 7.38e-01 0.0281 0.084 0.204 ncMono L2
ENSG00000117480 FAAH 928990 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0789 0.107 0.204 ncMono L2
ENSG00000117481 NSUN4 983130 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0526 0.109 0.204 ncMono L2
ENSG00000123472 ATPAF1 649440 sc-eQTL 4.02e-01 0.0868 0.103 0.204 ncMono L2
ENSG00000142961 MOB3C 706416 sc-eQTL 7.05e-01 0.0412 0.108 0.204 ncMono L2
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0877 0.102 0.204 ncMono L2
ENSG00000162368 CMPK1 -10490 sc-eQTL 5.96e-01 0.0532 0.1 0.204 ncMono L2
ENSG00000079277 MKNK1 706464 sc-eQTL 7.52e-01 0.0371 0.117 0.218 pDC L2
ENSG00000117480 FAAH 928990 sc-eQTL 1.05e-01 0.151 0.0925 0.218 pDC L2
ENSG00000117481 NSUN4 983130 sc-eQTL 2.39e-01 0.132 0.112 0.218 pDC L2
ENSG00000123472 ATPAF1 649440 sc-eQTL 9.22e-01 0.0118 0.121 0.218 pDC L2
ENSG00000123473 STIL 9160 sc-eQTL 2.95e-01 0.104 0.0987 0.218 pDC L2
ENSG00000142961 MOB3C 706416 sc-eQTL 2.24e-01 -0.138 0.113 0.218 pDC L2
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 sc-eQTL 7.53e-01 0.0322 0.102 0.218 pDC L2
ENSG00000162366 PDZK1IP1 132263 sc-eQTL 3.45e-01 0.0861 0.0909 0.218 pDC L2
ENSG00000162368 CMPK1 -10490 sc-eQTL 1.38e-01 -0.161 0.108 0.218 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079277 MKNK1 706464 sc-eQTL 1.52e-01 0.161 0.112 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000117481 NSUN4 983130 sc-eQTL 1.23e-01 0.157 0.102 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 649440 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0434 0.0838 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 706416 sc-eQTL 6.09e-01 0.0538 0.105 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 sc-eQTL 3.51e-01 0.0778 0.0833 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 -10490 sc-eQTL 5.50e-04 -0.29 0.0825 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 706464 sc-eQTL 1.02e-01 0.171 0.104 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000117481 NSUN4 983130 sc-eQTL 6.37e-01 0.0423 0.0896 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 649440 sc-eQTL 2.98e-01 0.0925 0.0886 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 706416 sc-eQTL 1.94e-01 -0.13 0.0999 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 sc-eQTL 2.19e-01 0.0854 0.0692 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 -10490 sc-eQTL 1.09e-02 -0.215 0.0836 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 706464 sc-eQTL 9.63e-01 0.00324 0.069 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000117480 FAAH 928990 sc-eQTL 1.67e-01 -0.112 0.0811 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000117481 NSUN4 983130 sc-eQTL 5.81e-01 0.0562 0.102 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 649440 sc-eQTL 1.82e-01 0.117 0.0873 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 706416 sc-eQTL 1.52e-01 0.147 0.102 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0259 0.0723 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 -10490 sc-eQTL 6.97e-01 0.0306 0.0784 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 706464 sc-eQTL 8.55e-01 0.0129 0.0703 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000117480 FAAH 928990 sc-eQTL 9.13e-01 0.0112 0.102 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000117481 NSUN4 983130 sc-eQTL 6.85e-01 0.0424 0.104 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 649440 sc-eQTL 3.31e-01 0.0944 0.0968 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 706416 sc-eQTL 7.15e-01 0.0392 0.107 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0774 0.091 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 -10490 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0573 0.0912 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 706464 sc-eQTL 5.71e-01 0.0644 0.114 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000117481 NSUN4 983130 sc-eQTL 2.73e-01 0.0998 0.0908 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 649440 sc-eQTL 4.76e-01 -0.059 0.0825 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 706416 sc-eQTL 6.57e-02 -0.164 0.0887 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0419 0.0687 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 -10490 sc-eQTL 7.92e-05 -0.252 0.0625 0.203 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000123473 STIL 9160 eQTL 9.55e-04 -0.0727 0.0219 0.0046 0.00428 0.219
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 eQTL 0.0172 -0.0533 0.0223 0.0 0.0 0.219
ENSG00000162366 PDZK1IP1 132263 eQTL 4.64e-06 0.151 0.0327 0.0 0.0 0.219
ENSG00000237424 FOXD2-AS1 -111334 eQTL 0.0161 -0.0692 0.0287 0.0 0.0 0.219

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079277 \N 706464 3.07e-07 1.83e-07 5.93e-08 2.53e-07 1.02e-07 8.75e-08 2.5e-07 5.62e-08 1.54e-07 6.75e-08 1.61e-07 1.22e-07 3.4e-07 8.55e-08 5.62e-08 7.97e-08 5.42e-08 1.64e-07 7.09e-08 6.03e-08 1.27e-07 1.47e-07 1.69e-07 4.07e-08 2.59e-07 1.26e-07 1.19e-07 1.1e-07 1.32e-07 1.17e-07 1.21e-07 5.24e-08 3.46e-08 9.5e-08 5.5e-08 2.79e-08 5.54e-08 8.57e-08 6.21e-08 6.07e-08 5.1e-08 1.59e-07 5.39e-08 2.03e-08 2.64e-08 1.77e-08 1.2e-07 1.91e-09 4.82e-08
ENSG00000123473 STIL 9160 3.44e-05 3.22e-05 6.31e-06 1.55e-05 5.81e-06 1.41e-05 4.44e-05 4.49e-06 3.01e-05 1.54e-05 3.78e-05 1.74e-05 4.74e-05 1.4e-05 6.95e-06 1.88e-05 1.77e-05 2.52e-05 7.63e-06 6.77e-06 1.52e-05 3.3e-05 3.2e-05 9.09e-06 4.38e-05 7.99e-06 1.39e-05 1.28e-05 3.15e-05 2.59e-05 1.96e-05 1.64e-06 2.61e-06 7.07e-06 1.16e-05 5.84e-06 3.11e-06 3.11e-06 4.84e-06 3.36e-06 1.75e-06 3.78e-05 3.55e-06 3.62e-07 2.55e-06 3.84e-06 4.07e-06 1.6e-06 1.52e-06
ENSG00000142961 \N 706416 3.07e-07 1.83e-07 5.93e-08 2.53e-07 1.02e-07 8.75e-08 2.5e-07 5.62e-08 1.54e-07 6.75e-08 1.61e-07 1.22e-07 3.4e-07 8.55e-08 5.62e-08 7.97e-08 5.42e-08 1.64e-07 7.09e-08 6.03e-08 1.27e-07 1.47e-07 1.69e-07 4.07e-08 2.59e-07 1.26e-07 1.19e-07 1.1e-07 1.32e-07 1.17e-07 1.21e-07 5.24e-08 3.46e-08 9.5e-08 5.5e-08 2.79e-08 5.54e-08 8.57e-08 6.21e-08 6.07e-08 5.1e-08 1.59e-07 5.39e-08 2.03e-08 2.64e-08 1.77e-08 1.2e-07 1.91e-09 4.82e-08
ENSG00000159658 EFCAB14 604193 3.92e-07 3.23e-07 6.57e-08 3.56e-07 1.03e-07 1.28e-07 3.44e-07 6.2e-08 1.98e-07 1.05e-07 2.18e-07 1.57e-07 5.39e-07 9.15e-08 7.79e-08 9.6e-08 9.53e-08 2.15e-07 7.53e-08 8.1e-08 1.24e-07 2.06e-07 2.2e-07 5.01e-08 4.27e-07 1.31e-07 1.33e-07 1.44e-07 1.48e-07 1.85e-07 1.52e-07 8.25e-08 4.86e-08 1.02e-07 1.39e-07 3.57e-08 9.11e-08 6.78e-08 4.74e-08 8.61e-08 3.64e-08 2.15e-07 3.19e-08 1.9e-08 3.61e-08 8.31e-09 8.61e-08 2.1e-09 4.72e-08
ENSG00000162366 PDZK1IP1 132263 3.97e-06 5.09e-06 5.96e-07 2.96e-06 1.08e-06 1.21e-06 4e-06 1.02e-06 3.58e-06 1.41e-06 4.34e-06 2.87e-06 7.67e-06 2.39e-06 1.05e-06 2e-06 1.92e-06 2.66e-06 1.43e-06 9.85e-07 1.8e-06 3.89e-06 3.63e-06 1.84e-06 5.39e-06 1.24e-06 1.79e-06 1.38e-06 4.18e-06 4.19e-06 2.13e-06 5.93e-07 7.09e-07 1.85e-06 2.06e-06 8.85e-07 9.46e-07 4.76e-07 1.06e-06 3.88e-07 4.36e-07 5.22e-06 4.44e-07 1.6e-07 3.13e-07 3.67e-07 7.71e-07 1.98e-07 1.77e-07
ENSG00000162368 \N -10490 3.32e-05 3.14e-05 6.15e-06 1.54e-05 5.74e-06 1.37e-05 4.33e-05 4.44e-06 2.93e-05 1.47e-05 3.69e-05 1.7e-05 4.65e-05 1.35e-05 6.69e-06 1.81e-05 1.7e-05 2.44e-05 7.56e-06 6.66e-06 1.46e-05 3.17e-05 3.11e-05 8.8e-06 4.3e-05 7.81e-06 1.33e-05 1.26e-05 3.09e-05 2.57e-05 1.9e-05 1.64e-06 2.6e-06 7.07e-06 1.12e-05 5.77e-06 3.16e-06 3.16e-06 4.75e-06 3.3e-06 1.74e-06 3.66e-05 3.58e-06 3.55e-07 2.49e-06 3.72e-06 4.13e-06 1.58e-06 1.5e-06
ENSG00000237424 FOXD2-AS1 -111334 4.51e-06 5.78e-06 8.3e-07 3.36e-06 1.64e-06 1.66e-06 6.11e-06 1.03e-06 5.25e-06 2.07e-06 5.32e-06 3.28e-06 1.01e-05 1.77e-06 1.35e-06 2.78e-06 2.16e-06 3.49e-06 1.45e-06 1.33e-06 2.91e-06 4.85e-06 4.6e-06 1.39e-06 7.98e-06 1.33e-06 2.68e-06 1.85e-06 4.51e-06 4.99e-06 2.81e-06 4.2e-07 6.12e-07 1.64e-06 2.09e-06 8.84e-07 1.04e-06 4.39e-07 8.67e-07 6.39e-07 6.55e-07 6.04e-06 3.83e-07 1.63e-07 3.58e-07 3.22e-07 7.99e-07 2.26e-07 3.41e-07