Genes within 1Mb (chr1:47297480:A:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079277 MKNK1 680637 sc-eQTL 2.21e-01 0.221 0.18 0.06 B L1
ENSG00000117481 NSUN4 957303 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0102 0.162 0.06 B L1
ENSG00000123472 ATPAF1 623613 sc-eQTL 1.49e-01 -0.161 0.111 0.06 B L1
ENSG00000132128 LRRC41 993872 sc-eQTL 9.55e-01 0.00814 0.145 0.06 B L1
ENSG00000142961 MOB3C 680589 sc-eQTL 5.41e-01 -0.105 0.172 0.06 B L1
ENSG00000159658 EFCAB14 578366 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0834 0.108 0.06 B L1
ENSG00000162368 CMPK1 -36317 sc-eQTL 2.26e-01 -0.157 0.129 0.06 B L1
ENSG00000173660 UQCRH 993782 sc-eQTL 5.94e-01 0.0565 0.106 0.06 B L1
ENSG00000079277 MKNK1 680637 sc-eQTL 3.02e-01 0.156 0.151 0.06 CD4T L1
ENSG00000117481 NSUN4 957303 sc-eQTL 9.82e-01 0.00248 0.112 0.06 CD4T L1
ENSG00000123472 ATPAF1 623613 sc-eQTL 9.45e-02 0.176 0.105 0.06 CD4T L1
ENSG00000132128 LRRC41 993872 sc-eQTL 4.37e-01 0.0943 0.121 0.06 CD4T L1
ENSG00000142961 MOB3C 680589 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0596 0.125 0.06 CD4T L1
ENSG00000159658 EFCAB14 578366 sc-eQTL 6.24e-01 0.0469 0.0956 0.06 CD4T L1
ENSG00000162368 CMPK1 -36317 sc-eQTL 5.72e-01 0.0698 0.123 0.06 CD4T L1
ENSG00000173660 UQCRH 993782 sc-eQTL 8.86e-01 0.0163 0.113 0.06 CD4T L1
ENSG00000079277 MKNK1 680637 sc-eQTL 6.29e-03 0.452 0.164 0.06 CD8T L1
ENSG00000117481 NSUN4 957303 sc-eQTL 3.02e-01 -0.162 0.156 0.06 CD8T L1
ENSG00000123472 ATPAF1 623613 sc-eQTL 4.93e-01 0.0945 0.138 0.06 CD8T L1
ENSG00000132128 LRRC41 993872 sc-eQTL 2.20e-01 -0.191 0.155 0.06 CD8T L1
ENSG00000142961 MOB3C 680589 sc-eQTL 2.73e-02 -0.328 0.148 0.06 CD8T L1
ENSG00000159658 EFCAB14 578366 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00256 0.111 0.06 CD8T L1
ENSG00000162368 CMPK1 -36317 sc-eQTL 1.02e-01 0.188 0.114 0.06 CD8T L1
ENSG00000173660 UQCRH 993782 sc-eQTL 5.87e-01 0.054 0.0993 0.06 CD8T L1
ENSG00000079277 MKNK1 680637 sc-eQTL 8.31e-01 0.0366 0.171 0.056 DC L1
ENSG00000117480 FAAH 903163 sc-eQTL 9.21e-02 0.24 0.142 0.056 DC L1
ENSG00000117481 NSUN4 957303 sc-eQTL 3.13e-01 0.183 0.181 0.056 DC L1
ENSG00000123472 ATPAF1 623613 sc-eQTL 2.73e-01 -0.201 0.183 0.056 DC L1
ENSG00000123473 STIL -16667 sc-eQTL 1.54e-01 -0.248 0.174 0.056 DC L1
ENSG00000132128 LRRC41 993872 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000553 0.174 0.056 DC L1
ENSG00000142961 MOB3C 680589 sc-eQTL 2.19e-01 -0.213 0.173 0.056 DC L1
ENSG00000159658 EFCAB14 578366 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0839 0.171 0.056 DC L1
ENSG00000162366 PDZK1IP1 106436 sc-eQTL 3.24e-01 -0.163 0.165 0.056 DC L1
ENSG00000162368 CMPK1 -36317 sc-eQTL 1.93e-01 0.212 0.163 0.056 DC L1
ENSG00000173660 UQCRH 993782 sc-eQTL 9.04e-01 0.0118 0.0975 0.056 DC L1
ENSG00000079277 MKNK1 680637 sc-eQTL 3.21e-01 0.118 0.118 0.06 Mono L1
ENSG00000117480 FAAH 903163 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0345 0.148 0.06 Mono L1
ENSG00000117481 NSUN4 957303 sc-eQTL 3.95e-01 -0.15 0.176 0.06 Mono L1
ENSG00000123472 ATPAF1 623613 sc-eQTL 5.73e-02 -0.285 0.149 0.06 Mono L1
ENSG00000132128 LRRC41 993872 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0859 0.161 0.06 Mono L1
ENSG00000142961 MOB3C 680589 sc-eQTL 3.69e-01 -0.16 0.177 0.06 Mono L1
ENSG00000159658 EFCAB14 578366 sc-eQTL 4.93e-02 0.239 0.121 0.06 Mono L1
ENSG00000162368 CMPK1 -36317 sc-eQTL 5.31e-01 0.0855 0.136 0.06 Mono L1
ENSG00000173660 UQCRH 993782 sc-eQTL 6.26e-02 0.176 0.0938 0.06 Mono L1
ENSG00000079277 MKNK1 680637 sc-eQTL 4.67e-01 0.148 0.203 0.06 NK L1
ENSG00000117481 NSUN4 957303 sc-eQTL 8.39e-01 -0.032 0.157 0.06 NK L1
ENSG00000123472 ATPAF1 623613 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0201 0.149 0.06 NK L1
ENSG00000132128 LRRC41 993872 sc-eQTL 7.01e-01 0.0529 0.138 0.06 NK L1
ENSG00000142961 MOB3C 680589 sc-eQTL 9.63e-01 0.00742 0.159 0.06 NK L1
ENSG00000159658 EFCAB14 578366 sc-eQTL 6.64e-01 0.0527 0.121 0.06 NK L1
ENSG00000162368 CMPK1 -36317 sc-eQTL 3.19e-01 -0.116 0.116 0.06 NK L1
ENSG00000173660 UQCRH 993782 sc-eQTL 5.14e-01 0.0815 0.125 0.06 NK L1
ENSG00000079277 MKNK1 680637 sc-eQTL 1.97e-01 0.219 0.169 0.06 Other_T L1
ENSG00000117481 NSUN4 957303 sc-eQTL 1.22e-02 -0.451 0.178 0.06 Other_T L1
ENSG00000123472 ATPAF1 623613 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0167 0.122 0.06 Other_T L1
ENSG00000123473 STIL -16667 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0638 0.0987 0.06 Other_T L1
ENSG00000132128 LRRC41 993872 sc-eQTL 2.24e-01 -0.195 0.16 0.06 Other_T L1
ENSG00000142961 MOB3C 680589 sc-eQTL 7.30e-01 0.0596 0.172 0.06 Other_T L1
ENSG00000159658 EFCAB14 578366 sc-eQTL 3.58e-01 0.111 0.12 0.06 Other_T L1
ENSG00000162368 CMPK1 -36317 sc-eQTL 1.95e-01 -0.202 0.156 0.06 Other_T L1
ENSG00000173660 UQCRH 993782 sc-eQTL 9.47e-01 0.00686 0.104 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079277 MKNK1 680637 sc-eQTL 5.34e-01 0.138 0.222 0.061 B_Activated L2
ENSG00000117481 NSUN4 957303 sc-eQTL 6.20e-01 0.104 0.21 0.061 B_Activated L2
ENSG00000123472 ATPAF1 623613 sc-eQTL 2.00e-01 0.272 0.211 0.061 B_Activated L2
ENSG00000132128 LRRC41 993872 sc-eQTL 3.78e-01 0.18 0.204 0.061 B_Activated L2
ENSG00000142961 MOB3C 680589 sc-eQTL 6.44e-01 0.0829 0.179 0.061 B_Activated L2
ENSG00000159658 EFCAB14 578366 sc-eQTL 6.03e-01 -0.114 0.219 0.061 B_Activated L2
ENSG00000162368 CMPK1 -36317 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0688 0.207 0.061 B_Activated L2
ENSG00000173660 UQCRH 993782 sc-eQTL 2.46e-01 0.21 0.18 0.061 B_Activated L2
ENSG00000079277 MKNK1 680637 sc-eQTL 9.70e-02 0.343 0.206 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000117481 NSUN4 957303 sc-eQTL 3.87e-01 0.164 0.189 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000123472 ATPAF1 623613 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0143 0.169 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000132128 LRRC41 993872 sc-eQTL 8.37e-01 0.0408 0.198 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000142961 MOB3C 680589 sc-eQTL 9.97e-01 0.000718 0.195 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000159658 EFCAB14 578366 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0275 0.168 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000162368 CMPK1 -36317 sc-eQTL 2.14e-01 -0.201 0.162 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000173660 UQCRH 993782 sc-eQTL 1.71e-01 0.208 0.152 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000079277 MKNK1 680637 sc-eQTL 3.16e-01 0.208 0.207 0.06 B_Memory L2
ENSG00000117481 NSUN4 957303 sc-eQTL 5.33e-01 0.125 0.199 0.06 B_Memory L2
ENSG00000123472 ATPAF1 623613 sc-eQTL 5.63e-01 -0.109 0.189 0.06 B_Memory L2
ENSG00000132128 LRRC41 993872 sc-eQTL 4.67e-01 0.142 0.195 0.06 B_Memory L2
ENSG00000142961 MOB3C 680589 sc-eQTL 7.97e-01 0.0488 0.189 0.06 B_Memory L2
ENSG00000159658 EFCAB14 578366 sc-eQTL 3.62e-01 -0.162 0.178 0.06 B_Memory L2
ENSG00000162368 CMPK1 -36317 sc-eQTL 4.24e-01 -0.14 0.174 0.06 B_Memory L2
ENSG00000173660 UQCRH 993782 sc-eQTL 6.01e-01 0.0858 0.164 0.06 B_Memory L2
ENSG00000079277 MKNK1 680637 sc-eQTL 2.11e-01 -0.238 0.19 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000117481 NSUN4 957303 sc-eQTL 5.53e-01 0.0984 0.165 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000123472 ATPAF1 623613 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0436 0.158 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000132128 LRRC41 993872 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0784 0.185 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000142961 MOB3C 680589 sc-eQTL 2.59e-01 -0.216 0.19 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000159658 EFCAB14 578366 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0263 0.135 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000162368 CMPK1 -36317 sc-eQTL 9.40e-01 0.0116 0.154 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000173660 UQCRH 993782 sc-eQTL 5.76e-01 0.0753 0.134 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000079277 MKNK1 680637 sc-eQTL 4.75e-01 0.138 0.193 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000117481 NSUN4 957303 sc-eQTL 5.31e-02 -0.341 0.175 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000123472 ATPAF1 623613 sc-eQTL 3.79e-01 -0.152 0.172 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000132128 LRRC41 993872 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0954 0.196 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000142961 MOB3C 680589 sc-eQTL 4.10e-01 -0.145 0.176 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000159658 EFCAB14 578366 sc-eQTL 2.52e-01 -0.17 0.147 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000162368 CMPK1 -36317 sc-eQTL 1.84e-01 -0.214 0.16 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000173660 UQCRH 993782 sc-eQTL 3.79e-01 0.129 0.146 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000079277 MKNK1 680637 sc-eQTL 5.44e-01 0.123 0.202 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000117481 NSUN4 957303 sc-eQTL 1.84e-01 -0.249 0.187 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000123472 ATPAF1 623613 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0669 0.187 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000132128 LRRC41 993872 sc-eQTL 7.95e-01 -0.051 0.196 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000142961 MOB3C 680589 sc-eQTL 2.88e-01 -0.194 0.182 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000159658 EFCAB14 578366 sc-eQTL 7.30e-02 0.327 0.181 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000162368 CMPK1 -36317 sc-eQTL 3.67e-01 -0.17 0.188 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000173660 UQCRH 993782 sc-eQTL 2.71e-01 0.19 0.172 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000079277 MKNK1 680637 sc-eQTL 4.77e-01 0.129 0.18 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000117481 NSUN4 957303 sc-eQTL 5.44e-01 0.0827 0.136 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000123472 ATPAF1 623613 sc-eQTL 3.67e-02 0.246 0.117 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000132128 LRRC41 993872 sc-eQTL 3.39e-01 0.133 0.139 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000142961 MOB3C 680589 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0387 0.138 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000159658 EFCAB14 578366 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0473 0.104 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000162368 CMPK1 -36317 sc-eQTL 7.26e-01 0.0416 0.119 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000173660 UQCRH 993782 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0272 0.116 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000079277 MKNK1 680637 sc-eQTL 5.89e-01 0.108 0.2 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000117481 NSUN4 957303 sc-eQTL 7.14e-01 0.053 0.144 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 623613 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0556 0.151 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000132128 LRRC41 993872 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0912 0.158 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000142961 MOB3C 680589 sc-eQTL 9.27e-01 0.0159 0.173 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 578366 sc-eQTL 2.98e-01 0.134 0.129 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000162368 CMPK1 -36317 sc-eQTL 2.60e-01 0.149 0.132 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000173660 UQCRH 993782 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0424 0.125 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000079277 MKNK1 680637 sc-eQTL 2.34e-01 0.226 0.189 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000117481 NSUN4 957303 sc-eQTL 5.68e-01 -0.095 0.166 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 623613 sc-eQTL 5.73e-01 0.0854 0.151 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000132128 LRRC41 993872 sc-eQTL 8.85e-02 0.312 0.182 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000142961 MOB3C 680589 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0643 0.191 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 578366 sc-eQTL 2.54e-01 0.167 0.146 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000162368 CMPK1 -36317 sc-eQTL 6.88e-01 0.0659 0.164 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000173660 UQCRH 993782 sc-eQTL 2.60e-02 0.343 0.153 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000079277 MKNK1 680637 sc-eQTL 1.43e-01 0.292 0.198 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000117481 NSUN4 957303 sc-eQTL 1.21e-01 -0.295 0.189 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000123472 ATPAF1 623613 sc-eQTL 2.16e-01 -0.193 0.155 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000132128 LRRC41 993872 sc-eQTL 5.08e-02 -0.352 0.179 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000142961 MOB3C 680589 sc-eQTL 2.22e-01 -0.222 0.181 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000159658 EFCAB14 578366 sc-eQTL 3.63e-01 0.14 0.154 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000162368 CMPK1 -36317 sc-eQTL 4.25e-01 -0.123 0.154 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000173660 UQCRH 993782 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0735 0.14 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000079277 MKNK1 680637 sc-eQTL 2.41e-01 0.226 0.193 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000117481 NSUN4 957303 sc-eQTL 3.11e-01 -0.174 0.171 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000123472 ATPAF1 623613 sc-eQTL 4.79e-01 0.1 0.142 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000132128 LRRC41 993872 sc-eQTL 8.11e-01 0.0393 0.165 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000142961 MOB3C 680589 sc-eQTL 7.44e-02 -0.292 0.163 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000159658 EFCAB14 578366 sc-eQTL 2.77e-01 -0.169 0.155 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000162368 CMPK1 -36317 sc-eQTL 2.15e-01 0.181 0.145 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000173660 UQCRH 993782 sc-eQTL 2.59e-01 0.151 0.133 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000079277 MKNK1 680637 sc-eQTL 5.87e-01 -0.115 0.211 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000117481 NSUN4 957303 sc-eQTL 2.82e-01 -0.223 0.207 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 623613 sc-eQTL 3.30e-01 0.178 0.182 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000132128 LRRC41 993872 sc-eQTL 2.64e-01 -0.227 0.203 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000142961 MOB3C 680589 sc-eQTL 5.42e-01 -0.12 0.196 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 578366 sc-eQTL 6.66e-01 0.0797 0.185 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000162368 CMPK1 -36317 sc-eQTL 5.00e-01 0.117 0.173 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000173660 UQCRH 993782 sc-eQTL 6.26e-01 0.09 0.184 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000079277 MKNK1 680637 sc-eQTL 5.94e-01 -0.109 0.204 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000117481 NSUN4 957303 sc-eQTL 2.33e-01 0.238 0.199 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 623613 sc-eQTL 5.97e-01 0.0993 0.187 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000132128 LRRC41 993872 sc-eQTL 2.63e-01 -0.214 0.191 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000142961 MOB3C 680589 sc-eQTL 1.50e-01 -0.269 0.186 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 578366 sc-eQTL 9.92e-01 0.00185 0.186 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000162368 CMPK1 -36317 sc-eQTL 5.31e-01 0.116 0.185 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000173660 UQCRH 993782 sc-eQTL 4.64e-01 0.128 0.175 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000079277 MKNK1 680637 sc-eQTL 6.70e-01 0.0707 0.166 0.058 MAIT L2
ENSG00000117481 NSUN4 957303 sc-eQTL 1.12e-01 -0.3 0.188 0.058 MAIT L2
ENSG00000123472 ATPAF1 623613 sc-eQTL 4.10e-01 -0.134 0.162 0.058 MAIT L2
ENSG00000123473 STIL -16667 sc-eQTL 8.14e-02 -0.279 0.159 0.058 MAIT L2
ENSG00000132128 LRRC41 993872 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0696 0.187 0.058 MAIT L2
ENSG00000142961 MOB3C 680589 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0314 0.173 0.058 MAIT L2
ENSG00000159658 EFCAB14 578366 sc-eQTL 3.12e-01 0.159 0.157 0.058 MAIT L2
ENSG00000162368 CMPK1 -36317 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0291 0.161 0.058 MAIT L2
ENSG00000173660 UQCRH 993782 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0163 0.159 0.058 MAIT L2
ENSG00000079277 MKNK1 680637 sc-eQTL 1.65e-01 -0.274 0.197 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000117481 NSUN4 957303 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0436 0.18 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000123472 ATPAF1 623613 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00153 0.18 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000132128 LRRC41 993872 sc-eQTL 6.06e-01 0.0971 0.188 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000142961 MOB3C 680589 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0383 0.185 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000159658 EFCAB14 578366 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0163 0.183 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000162368 CMPK1 -36317 sc-eQTL 1.34e-01 -0.275 0.183 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000173660 UQCRH 993782 sc-eQTL 1.60e-01 0.223 0.158 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000079277 MKNK1 680637 sc-eQTL 4.26e-01 0.169 0.212 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000117481 NSUN4 957303 sc-eQTL 7.25e-01 0.0675 0.192 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000123472 ATPAF1 623613 sc-eQTL 3.89e-01 0.143 0.166 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000132128 LRRC41 993872 sc-eQTL 7.39e-01 0.0574 0.172 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000142961 MOB3C 680589 sc-eQTL 9.33e-01 0.0146 0.173 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000159658 EFCAB14 578366 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0586 0.139 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000162368 CMPK1 -36317 sc-eQTL 2.37e-01 -0.167 0.141 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000173660 UQCRH 993782 sc-eQTL 9.06e-01 0.017 0.143 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000079277 MKNK1 680637 sc-eQTL 7.50e-01 0.0652 0.204 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000117481 NSUN4 957303 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0529 0.203 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000123472 ATPAF1 623613 sc-eQTL 1.18e-01 -0.314 0.2 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000132128 LRRC41 993872 sc-eQTL 9.17e-01 0.0212 0.202 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000142961 MOB3C 680589 sc-eQTL 7.61e-01 0.0566 0.186 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000159658 EFCAB14 578366 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0343 0.168 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000162368 CMPK1 -36317 sc-eQTL 5.91e-01 -0.1 0.186 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000173660 UQCRH 993782 sc-eQTL 9.46e-01 0.0124 0.182 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000079277 MKNK1 680637 sc-eQTL 3.30e-01 0.193 0.198 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000117481 NSUN4 957303 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0113 0.179 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000123472 ATPAF1 623613 sc-eQTL 5.03e-01 -0.11 0.164 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000132128 LRRC41 993872 sc-eQTL 3.42e-01 -0.154 0.162 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000142961 MOB3C 680589 sc-eQTL 7.04e-01 0.0677 0.178 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000159658 EFCAB14 578366 sc-eQTL 6.23e-01 0.0764 0.155 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000162368 CMPK1 -36317 sc-eQTL 3.27e-01 -0.166 0.169 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000173660 UQCRH 993782 sc-eQTL 5.28e-01 0.0905 0.143 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000079277 MKNK1 680637 sc-eQTL 3.84e-01 -0.205 0.234 0.063 PB L2
ENSG00000117481 NSUN4 957303 sc-eQTL 3.07e-01 -0.26 0.253 0.063 PB L2
ENSG00000123472 ATPAF1 623613 sc-eQTL 5.60e-03 -0.431 0.152 0.063 PB L2
ENSG00000132128 LRRC41 993872 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0642 0.203 0.063 PB L2
ENSG00000142961 MOB3C 680589 sc-eQTL 6.28e-01 -0.103 0.212 0.063 PB L2
ENSG00000159658 EFCAB14 578366 sc-eQTL 6.30e-01 0.0991 0.205 0.063 PB L2
ENSG00000162368 CMPK1 -36317 sc-eQTL 8.69e-02 0.361 0.209 0.063 PB L2
ENSG00000173660 UQCRH 993782 sc-eQTL 6.49e-01 0.057 0.125 0.063 PB L2
ENSG00000079277 MKNK1 680637 sc-eQTL 1.77e-01 0.279 0.206 0.059 Pro_T L2
ENSG00000117481 NSUN4 957303 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0497 0.201 0.059 Pro_T L2
ENSG00000123472 ATPAF1 623613 sc-eQTL 5.92e-01 0.0869 0.162 0.059 Pro_T L2
ENSG00000123473 STIL -16667 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0393 0.126 0.059 Pro_T L2
ENSG00000132128 LRRC41 993872 sc-eQTL 3.79e-01 -0.162 0.183 0.059 Pro_T L2
ENSG00000142961 MOB3C 680589 sc-eQTL 8.45e-01 0.0364 0.186 0.059 Pro_T L2
ENSG00000159658 EFCAB14 578366 sc-eQTL 9.62e-01 0.00796 0.166 0.059 Pro_T L2
ENSG00000162368 CMPK1 -36317 sc-eQTL 1.63e-01 -0.257 0.184 0.059 Pro_T L2
ENSG00000173660 UQCRH 993782 sc-eQTL 4.30e-01 0.0949 0.12 0.059 Pro_T L2
ENSG00000079277 MKNK1 680637 sc-eQTL 5.51e-01 -0.114 0.191 0.06 Treg L2
ENSG00000117481 NSUN4 957303 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0968 0.174 0.06 Treg L2
ENSG00000123472 ATPAF1 623613 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0375 0.161 0.06 Treg L2
ENSG00000132128 LRRC41 993872 sc-eQTL 2.95e-02 -0.386 0.176 0.06 Treg L2
ENSG00000142961 MOB3C 680589 sc-eQTL 2.73e-01 -0.193 0.175 0.06 Treg L2
ENSG00000159658 EFCAB14 578366 sc-eQTL 4.56e-01 -0.119 0.159 0.06 Treg L2
ENSG00000162368 CMPK1 -36317 sc-eQTL 6.68e-01 0.0626 0.146 0.06 Treg L2
ENSG00000173660 UQCRH 993782 sc-eQTL 8.77e-01 0.0238 0.154 0.06 Treg L2
ENSG00000079277 MKNK1 680637 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00683 0.187 0.054 cDC L2
ENSG00000117480 FAAH 903163 sc-eQTL 8.93e-01 0.0273 0.203 0.054 cDC L2
ENSG00000117481 NSUN4 957303 sc-eQTL 4.45e-02 0.421 0.208 0.054 cDC L2
ENSG00000123472 ATPAF1 623613 sc-eQTL 4.61e-01 -0.152 0.205 0.054 cDC L2
ENSG00000123473 STIL -16667 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0504 0.178 0.054 cDC L2
ENSG00000132128 LRRC41 993872 sc-eQTL 2.48e-01 0.237 0.205 0.054 cDC L2
ENSG00000142961 MOB3C 680589 sc-eQTL 3.95e-01 -0.155 0.182 0.054 cDC L2
ENSG00000159658 EFCAB14 578366 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0971 0.206 0.054 cDC L2
ENSG00000162366 PDZK1IP1 106436 sc-eQTL 2.92e-01 -0.182 0.172 0.054 cDC L2
ENSG00000162368 CMPK1 -36317 sc-eQTL 7.97e-01 0.05 0.194 0.054 cDC L2
ENSG00000173660 UQCRH 993782 sc-eQTL 4.47e-01 0.0989 0.13 0.054 cDC L2
ENSG00000079277 MKNK1 680637 sc-eQTL 4.75e-01 0.0905 0.127 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000117480 FAAH 903163 sc-eQTL 2.47e-01 -0.174 0.15 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000117481 NSUN4 957303 sc-eQTL 2.97e-01 -0.199 0.19 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000123472 ATPAF1 623613 sc-eQTL 2.88e-01 -0.173 0.162 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000132128 LRRC41 993872 sc-eQTL 3.88e-01 0.143 0.166 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000142961 MOB3C 680589 sc-eQTL 3.05e-01 -0.202 0.197 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000159658 EFCAB14 578366 sc-eQTL 3.49e-02 0.293 0.138 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000162368 CMPK1 -36317 sc-eQTL 7.28e-01 0.0529 0.152 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000173660 UQCRH 993782 sc-eQTL 1.47e-01 0.133 0.0913 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000079277 MKNK1 680637 sc-eQTL 1.70e-01 0.211 0.153 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000117480 FAAH 903163 sc-eQTL 6.41e-01 0.0788 0.169 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000117481 NSUN4 957303 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0748 0.19 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000123472 ATPAF1 623613 sc-eQTL 1.15e-01 -0.284 0.179 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000132128 LRRC41 993872 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0468 0.204 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000142961 MOB3C 680589 sc-eQTL 5.90e-01 0.103 0.192 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000159658 EFCAB14 578366 sc-eQTL 6.15e-01 0.0761 0.151 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000162368 CMPK1 -36317 sc-eQTL 4.80e-02 0.345 0.174 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000173660 UQCRH 993782 sc-eQTL 1.68e-01 0.16 0.115 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000079277 MKNK1 680637 sc-eQTL 6.18e-02 0.448 0.238 0.058 gdT L2
ENSG00000117481 NSUN4 957303 sc-eQTL 5.97e-01 -0.127 0.239 0.058 gdT L2
ENSG00000123472 ATPAF1 623613 sc-eQTL 2.55e-01 0.24 0.21 0.058 gdT L2
ENSG00000123473 STIL -16667 sc-eQTL 1.18e-01 -0.292 0.185 0.058 gdT L2
ENSG00000132128 LRRC41 993872 sc-eQTL 3.80e-01 -0.205 0.232 0.058 gdT L2
ENSG00000142961 MOB3C 680589 sc-eQTL 5.35e-01 0.138 0.222 0.058 gdT L2
ENSG00000159658 EFCAB14 578366 sc-eQTL 3.96e-01 0.173 0.204 0.058 gdT L2
ENSG00000162368 CMPK1 -36317 sc-eQTL 1.98e-02 -0.502 0.213 0.058 gdT L2
ENSG00000173660 UQCRH 993782 sc-eQTL 8.73e-01 0.0337 0.211 0.058 gdT L2
ENSG00000079277 MKNK1 680637 sc-eQTL 8.28e-01 0.0378 0.174 0.053 intMono L2
ENSG00000117480 FAAH 903163 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0503 0.195 0.053 intMono L2
ENSG00000117481 NSUN4 957303 sc-eQTL 7.35e-01 0.0687 0.202 0.053 intMono L2
ENSG00000123472 ATPAF1 623613 sc-eQTL 5.81e-01 0.114 0.207 0.053 intMono L2
ENSG00000132128 LRRC41 993872 sc-eQTL 9.05e-01 0.0254 0.213 0.053 intMono L2
ENSG00000142961 MOB3C 680589 sc-eQTL 2.96e-01 0.213 0.204 0.053 intMono L2
ENSG00000159658 EFCAB14 578366 sc-eQTL 3.77e-01 -0.15 0.17 0.053 intMono L2
ENSG00000162368 CMPK1 -36317 sc-eQTL 5.04e-01 0.131 0.196 0.053 intMono L2
ENSG00000173660 UQCRH 993782 sc-eQTL 4.26e-01 0.116 0.145 0.053 intMono L2
ENSG00000079277 MKNK1 680637 sc-eQTL 3.55e-01 -0.137 0.148 0.059 ncMono L2
ENSG00000117480 FAAH 903163 sc-eQTL 5.04e-01 0.127 0.189 0.059 ncMono L2
ENSG00000117481 NSUN4 957303 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0462 0.193 0.059 ncMono L2
ENSG00000123472 ATPAF1 623613 sc-eQTL 3.38e-01 -0.175 0.182 0.059 ncMono L2
ENSG00000132128 LRRC41 993872 sc-eQTL 5.14e-01 -0.13 0.199 0.059 ncMono L2
ENSG00000142961 MOB3C 680589 sc-eQTL 6.72e-01 0.0811 0.191 0.059 ncMono L2
ENSG00000159658 EFCAB14 578366 sc-eQTL 5.68e-01 0.103 0.181 0.059 ncMono L2
ENSG00000162368 CMPK1 -36317 sc-eQTL 7.95e-01 -0.046 0.177 0.059 ncMono L2
ENSG00000173660 UQCRH 993782 sc-eQTL 2.50e-01 0.138 0.12 0.059 ncMono L2
ENSG00000079277 MKNK1 680637 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0236 0.231 0.051 pDC L2
ENSG00000117480 FAAH 903163 sc-eQTL 1.60e-01 0.257 0.182 0.051 pDC L2
ENSG00000117481 NSUN4 957303 sc-eQTL 1.68e-01 -0.304 0.22 0.051 pDC L2
ENSG00000123472 ATPAF1 623613 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0821 0.237 0.051 pDC L2
ENSG00000123473 STIL -16667 sc-eQTL 4.61e-02 -0.387 0.192 0.051 pDC L2
ENSG00000132128 LRRC41 993872 sc-eQTL 7.86e-01 0.0636 0.234 0.051 pDC L2
ENSG00000142961 MOB3C 680589 sc-eQTL 4.56e-01 -0.167 0.223 0.051 pDC L2
ENSG00000159658 EFCAB14 578366 sc-eQTL 2.15e-01 -0.249 0.2 0.051 pDC L2
ENSG00000162366 PDZK1IP1 106436 sc-eQTL 8.84e-01 0.0263 0.179 0.051 pDC L2
ENSG00000162368 CMPK1 -36317 sc-eQTL 5.14e-01 0.14 0.214 0.051 pDC L2
ENSG00000173660 UQCRH 993782 sc-eQTL 2.81e-01 -0.195 0.18 0.051 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079277 MKNK1 680637 sc-eQTL 9.41e-02 0.344 0.204 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000117481 NSUN4 957303 sc-eQTL 4.25e-01 0.149 0.186 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 623613 sc-eQTL 9.19e-01 0.0156 0.153 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132128 LRRC41 993872 sc-eQTL 6.35e-01 0.087 0.183 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 680589 sc-eQTL 8.17e-01 0.0442 0.191 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 578366 sc-eQTL 4.59e-01 -0.113 0.152 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 -36317 sc-eQTL 1.98e-01 -0.199 0.154 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173660 UQCRH 993782 sc-eQTL 2.12e-01 0.172 0.137 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 680637 sc-eQTL 3.67e-01 -0.17 0.188 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000117481 NSUN4 957303 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0731 0.161 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 623613 sc-eQTL 4.63e-01 -0.117 0.159 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132128 LRRC41 993872 sc-eQTL 4.37e-01 -0.144 0.185 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 680589 sc-eQTL 3.61e-01 -0.165 0.18 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 578366 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0994 0.125 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 -36317 sc-eQTL 2.64e-01 -0.17 0.152 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173660 UQCRH 993782 sc-eQTL 5.75e-01 0.073 0.13 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 680637 sc-eQTL 1.61e-01 0.171 0.121 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000117480 FAAH 903163 sc-eQTL 4.32e-01 -0.113 0.144 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000117481 NSUN4 957303 sc-eQTL 5.23e-01 -0.115 0.179 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 623613 sc-eQTL 4.71e-02 -0.306 0.153 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000132128 LRRC41 993872 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00856 0.164 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 680589 sc-eQTL 5.19e-01 -0.117 0.182 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 578366 sc-eQTL 5.81e-02 0.241 0.127 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 -36317 sc-eQTL 3.97e-01 0.117 0.138 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173660 UQCRH 993782 sc-eQTL 6.69e-02 0.169 0.092 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 680637 sc-eQTL 3.58e-01 -0.116 0.125 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000117480 FAAH 903163 sc-eQTL 4.33e-01 0.143 0.182 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000117481 NSUN4 957303 sc-eQTL 8.19e-01 0.0427 0.186 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 623613 sc-eQTL 5.27e-01 -0.11 0.173 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000132128 LRRC41 993872 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0243 0.196 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 680589 sc-eQTL 8.91e-01 0.0265 0.192 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 578366 sc-eQTL 8.55e-01 0.0299 0.163 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 -36317 sc-eQTL 9.61e-01 0.00795 0.163 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173660 UQCRH 993782 sc-eQTL 1.69e-01 0.156 0.113 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 680637 sc-eQTL 3.69e-01 0.188 0.208 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000117481 NSUN4 957303 sc-eQTL 9.43e-01 -0.012 0.167 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 623613 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0224 0.152 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132128 LRRC41 993872 sc-eQTL 8.17e-01 0.0331 0.143 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 680589 sc-eQTL 8.20e-01 0.0374 0.164 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 578366 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00557 0.126 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 -36317 sc-eQTL 2.68e-01 -0.132 0.119 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173660 UQCRH 993782 sc-eQTL 5.76e-01 0.0718 0.128 0.06 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079277 MKNK1 680637 eQTL 0.00151 0.0869 0.0273 0.0026 0.0 0.053
ENSG00000159658 EFCAB14 578366 eQTL 0.033 0.0894 0.0419 0.0 0.0 0.053
ENSG00000162366 PDZK1IP1 106436 eQTL 1.13e-19 -0.551 0.0594 0.0 0.0 0.053


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162366 PDZK1IP1 106436 5.61e-06 5.64e-06 5.93e-07 3.6e-06 1.74e-06 1.61e-06 7.23e-06 1.25e-06 4.67e-06 3.1e-06 7.5e-06 3.03e-06 9.33e-06 1.95e-06 9.47e-07 4.41e-06 2.13e-06 3.84e-06 1.65e-06 1.7e-06 2.89e-06 6.14e-06 4.7e-06 1.95e-06 8.97e-06 2.34e-06 3.41e-06 1.78e-06 5.87e-06 5.36e-06 2.63e-06 4.81e-07 8.1e-07 2.61e-06 2.01e-06 1.55e-06 1.27e-06 5.43e-07 9.61e-07 7.61e-07 8.59e-07 7.41e-06 6.73e-07 1.64e-07 6.85e-07 9.68e-07 1.04e-06 6.73e-07 5.97e-07