Genes within 1Mb (chr1:47292512:CAG:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079277 MKNK1 675669 sc-eQTL 3.37e-01 -0.151 0.157 0.075 B L1
ENSG00000117481 NSUN4 952335 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0404 0.141 0.075 B L1
ENSG00000123472 ATPAF1 618645 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0789 0.0973 0.075 B L1
ENSG00000132128 LRRC41 988904 sc-eQTL 3.17e-01 -0.126 0.126 0.075 B L1
ENSG00000142961 MOB3C 675621 sc-eQTL 4.76e-01 -0.107 0.15 0.075 B L1
ENSG00000159658 EFCAB14 573398 sc-eQTL 2.24e-01 0.115 0.0941 0.075 B L1
ENSG00000162368 CMPK1 -41285 sc-eQTL 2.13e-06 0.52 0.107 0.075 B L1
ENSG00000173660 UQCRH 988814 sc-eQTL 3.77e-01 0.0813 0.0919 0.075 B L1
ENSG00000079277 MKNK1 675669 sc-eQTL 9.03e-01 -0.016 0.132 0.075 CD4T L1
ENSG00000117481 NSUN4 952335 sc-eQTL 1.14e-01 0.154 0.0972 0.075 CD4T L1
ENSG00000123472 ATPAF1 618645 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0999 0.0916 0.075 CD4T L1
ENSG00000132128 LRRC41 988904 sc-eQTL 8.03e-01 0.0264 0.106 0.075 CD4T L1
ENSG00000142961 MOB3C 675621 sc-eQTL 6.62e-02 0.2 0.108 0.075 CD4T L1
ENSG00000159658 EFCAB14 573398 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0588 0.0831 0.075 CD4T L1
ENSG00000162368 CMPK1 -41285 sc-eQTL 1.83e-04 0.395 0.104 0.075 CD4T L1
ENSG00000173660 UQCRH 988814 sc-eQTL 5.15e-01 0.0642 0.0985 0.075 CD4T L1
ENSG00000079277 MKNK1 675669 sc-eQTL 2.96e-01 -0.151 0.144 0.075 CD8T L1
ENSG00000117481 NSUN4 952335 sc-eQTL 2.92e-01 -0.143 0.136 0.075 CD8T L1
ENSG00000123472 ATPAF1 618645 sc-eQTL 9.33e-01 0.01 0.12 0.075 CD8T L1
ENSG00000132128 LRRC41 988904 sc-eQTL 3.84e-01 0.118 0.135 0.075 CD8T L1
ENSG00000142961 MOB3C 675621 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0254 0.13 0.075 CD8T L1
ENSG00000159658 EFCAB14 573398 sc-eQTL 2.75e-02 0.212 0.0954 0.075 CD8T L1
ENSG00000162368 CMPK1 -41285 sc-eQTL 1.03e-02 0.255 0.0985 0.075 CD8T L1
ENSG00000173660 UQCRH 988814 sc-eQTL 2.51e-01 0.0989 0.086 0.075 CD8T L1
ENSG00000079277 MKNK1 675669 sc-eQTL 3.51e-01 0.136 0.145 0.077 DC L1
ENSG00000117480 FAAH 898195 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0486 0.121 0.077 DC L1
ENSG00000117481 NSUN4 952335 sc-eQTL 1.38e-01 0.229 0.153 0.077 DC L1
ENSG00000123472 ATPAF1 618645 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0131 0.156 0.077 DC L1
ENSG00000123473 STIL -21635 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0634 0.148 0.077 DC L1
ENSG00000132128 LRRC41 988904 sc-eQTL 8.86e-01 0.0212 0.148 0.077 DC L1
ENSG00000142961 MOB3C 675621 sc-eQTL 7.45e-01 0.0479 0.147 0.077 DC L1
ENSG00000159658 EFCAB14 573398 sc-eQTL 2.84e-01 0.156 0.145 0.077 DC L1
ENSG00000162366 PDZK1IP1 101468 sc-eQTL 3.80e-01 -0.123 0.14 0.077 DC L1
ENSG00000162368 CMPK1 -41285 sc-eQTL 5.91e-01 0.0746 0.138 0.077 DC L1
ENSG00000173660 UQCRH 988814 sc-eQTL 3.06e-01 0.0848 0.0825 0.077 DC L1
ENSG00000079277 MKNK1 675669 sc-eQTL 4.23e-01 0.0827 0.103 0.075 Mono L1
ENSG00000117480 FAAH 898195 sc-eQTL 3.64e-01 0.117 0.129 0.075 Mono L1
ENSG00000117481 NSUN4 952335 sc-eQTL 1.77e-01 -0.207 0.153 0.075 Mono L1
ENSG00000123472 ATPAF1 618645 sc-eQTL 2.05e-01 -0.166 0.131 0.075 Mono L1
ENSG00000132128 LRRC41 988904 sc-eQTL 5.77e-01 0.0783 0.14 0.075 Mono L1
ENSG00000142961 MOB3C 675621 sc-eQTL 1.81e-01 0.207 0.154 0.075 Mono L1
ENSG00000159658 EFCAB14 573398 sc-eQTL 9.25e-01 -0.01 0.106 0.075 Mono L1
ENSG00000162368 CMPK1 -41285 sc-eQTL 4.84e-01 0.0832 0.119 0.075 Mono L1
ENSG00000173660 UQCRH 988814 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0703 0.0823 0.075 Mono L1
ENSG00000079277 MKNK1 675669 sc-eQTL 5.27e-01 0.112 0.176 0.075 NK L1
ENSG00000117481 NSUN4 952335 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0183 0.136 0.075 NK L1
ENSG00000123472 ATPAF1 618645 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0853 0.129 0.075 NK L1
ENSG00000132128 LRRC41 988904 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0668 0.119 0.075 NK L1
ENSG00000142961 MOB3C 675621 sc-eQTL 4.98e-02 0.27 0.137 0.075 NK L1
ENSG00000159658 EFCAB14 573398 sc-eQTL 6.01e-01 -0.055 0.105 0.075 NK L1
ENSG00000162368 CMPK1 -41285 sc-eQTL 4.22e-01 0.0812 0.101 0.075 NK L1
ENSG00000173660 UQCRH 988814 sc-eQTL 8.77e-01 0.0168 0.108 0.075 NK L1
ENSG00000079277 MKNK1 675669 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0895 0.148 0.075 Other_T L1
ENSG00000117481 NSUN4 952335 sc-eQTL 6.00e-01 0.0831 0.158 0.075 Other_T L1
ENSG00000123472 ATPAF1 618645 sc-eQTL 4.59e-01 0.0791 0.107 0.075 Other_T L1
ENSG00000123473 STIL -21635 sc-eQTL 8.90e-01 -0.012 0.0863 0.075 Other_T L1
ENSG00000132128 LRRC41 988904 sc-eQTL 7.90e-01 0.0374 0.14 0.075 Other_T L1
ENSG00000142961 MOB3C 675621 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0965 0.15 0.075 Other_T L1
ENSG00000159658 EFCAB14 573398 sc-eQTL 2.15e-01 0.131 0.105 0.075 Other_T L1
ENSG00000162368 CMPK1 -41285 sc-eQTL 6.60e-02 0.25 0.136 0.075 Other_T L1
ENSG00000173660 UQCRH 988814 sc-eQTL 2.30e-01 0.109 0.0902 0.075 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079277 MKNK1 675669 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0811 0.183 0.084 B_Activated L2
ENSG00000117481 NSUN4 952335 sc-eQTL 8.83e-01 0.0255 0.173 0.084 B_Activated L2
ENSG00000123472 ATPAF1 618645 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0151 0.174 0.084 B_Activated L2
ENSG00000132128 LRRC41 988904 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0886 0.168 0.084 B_Activated L2
ENSG00000142961 MOB3C 675621 sc-eQTL 1.48e-01 -0.213 0.146 0.084 B_Activated L2
ENSG00000159658 EFCAB14 573398 sc-eQTL 1.32e-01 0.271 0.179 0.084 B_Activated L2
ENSG00000162368 CMPK1 -41285 sc-eQTL 8.14e-02 0.296 0.169 0.084 B_Activated L2
ENSG00000173660 UQCRH 988814 sc-eQTL 9.77e-01 0.00426 0.149 0.084 B_Activated L2
ENSG00000079277 MKNK1 675669 sc-eQTL 6.97e-01 0.0687 0.176 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000117481 NSUN4 952335 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0356 0.161 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000123472 ATPAF1 618645 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0666 0.144 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000132128 LRRC41 988904 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0892 0.168 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000142961 MOB3C 675621 sc-eQTL 1.71e-01 -0.227 0.165 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000159658 EFCAB14 573398 sc-eQTL 2.17e-01 0.176 0.142 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000162368 CMPK1 -41285 sc-eQTL 6.04e-03 0.375 0.135 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000173660 UQCRH 988814 sc-eQTL 4.30e-01 0.102 0.129 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000079277 MKNK1 675669 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0642 0.172 0.075 B_Memory L2
ENSG00000117481 NSUN4 952335 sc-eQTL 1.57e-01 -0.234 0.165 0.075 B_Memory L2
ENSG00000123472 ATPAF1 618645 sc-eQTL 4.33e-01 0.123 0.156 0.075 B_Memory L2
ENSG00000132128 LRRC41 988904 sc-eQTL 2.06e-01 0.204 0.161 0.075 B_Memory L2
ENSG00000142961 MOB3C 675621 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0788 0.157 0.075 B_Memory L2
ENSG00000159658 EFCAB14 573398 sc-eQTL 6.86e-01 0.0597 0.148 0.075 B_Memory L2
ENSG00000162368 CMPK1 -41285 sc-eQTL 6.78e-03 0.388 0.142 0.075 B_Memory L2
ENSG00000173660 UQCRH 988814 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0714 0.136 0.075 B_Memory L2
ENSG00000079277 MKNK1 675669 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0411 0.167 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000117481 NSUN4 952335 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00975 0.145 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000123472 ATPAF1 618645 sc-eQTL 9.14e-01 -0.015 0.139 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000132128 LRRC41 988904 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0386 0.162 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000142961 MOB3C 675621 sc-eQTL 5.50e-01 -0.1 0.167 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000159658 EFCAB14 573398 sc-eQTL 7.15e-01 0.0431 0.118 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000162368 CMPK1 -41285 sc-eQTL 2.09e-04 0.494 0.131 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000173660 UQCRH 988814 sc-eQTL 5.93e-01 0.063 0.118 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000079277 MKNK1 675669 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0872 0.172 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000117481 NSUN4 952335 sc-eQTL 1.37e-01 0.235 0.157 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000123472 ATPAF1 618645 sc-eQTL 3.46e-01 -0.145 0.154 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000132128 LRRC41 988904 sc-eQTL 1.61e-01 -0.245 0.174 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000142961 MOB3C 675621 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0295 0.157 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000159658 EFCAB14 573398 sc-eQTL 3.63e-02 0.276 0.131 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000162368 CMPK1 -41285 sc-eQTL 4.96e-03 0.401 0.141 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000173660 UQCRH 988814 sc-eQTL 5.95e-01 0.0697 0.131 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000079277 MKNK1 675669 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0408 0.188 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000117481 NSUN4 952335 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0886 0.175 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000123472 ATPAF1 618645 sc-eQTL 5.54e-01 -0.103 0.174 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000132128 LRRC41 988904 sc-eQTL 1.38e-01 -0.27 0.181 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000142961 MOB3C 675621 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0597 0.17 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000159658 EFCAB14 573398 sc-eQTL 3.74e-01 0.151 0.17 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000162368 CMPK1 -41285 sc-eQTL 1.50e-03 0.551 0.171 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000173660 UQCRH 988814 sc-eQTL 1.91e-01 0.211 0.16 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000079277 MKNK1 675669 sc-eQTL 5.92e-01 0.0832 0.155 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000117481 NSUN4 952335 sc-eQTL 4.72e-01 0.0843 0.117 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000123472 ATPAF1 618645 sc-eQTL 1.92e-01 -0.132 0.101 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000132128 LRRC41 988904 sc-eQTL 9.95e-01 0.000797 0.119 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000142961 MOB3C 675621 sc-eQTL 1.04e-01 0.193 0.118 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000159658 EFCAB14 573398 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0175 0.0893 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000162368 CMPK1 -41285 sc-eQTL 3.93e-04 0.356 0.0989 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000173660 UQCRH 988814 sc-eQTL 2.50e-01 0.115 0.0994 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000079277 MKNK1 675669 sc-eQTL 7.99e-01 0.0439 0.172 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000117481 NSUN4 952335 sc-eQTL 3.62e-01 0.113 0.124 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 618645 sc-eQTL 8.90e-01 -0.018 0.13 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000132128 LRRC41 988904 sc-eQTL 1.03e-01 0.222 0.135 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000142961 MOB3C 675621 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0447 0.149 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 573398 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0683 0.111 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000162368 CMPK1 -41285 sc-eQTL 1.75e-04 0.42 0.11 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000173660 UQCRH 988814 sc-eQTL 9.66e-01 0.00463 0.108 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000079277 MKNK1 675669 sc-eQTL 8.34e-01 0.0353 0.168 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000117481 NSUN4 952335 sc-eQTL 3.25e-02 0.314 0.146 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 618645 sc-eQTL 6.35e-01 0.0637 0.134 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000132128 LRRC41 988904 sc-eQTL 6.10e-01 0.0829 0.162 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000142961 MOB3C 675621 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0546 0.169 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 573398 sc-eQTL 3.44e-01 -0.122 0.129 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000162368 CMPK1 -41285 sc-eQTL 6.81e-01 0.0599 0.145 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000173660 UQCRH 988814 sc-eQTL 3.11e-01 0.139 0.137 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000079277 MKNK1 675669 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0692 0.172 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000117481 NSUN4 952335 sc-eQTL 2.14e-01 -0.204 0.164 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000123472 ATPAF1 618645 sc-eQTL 5.54e-01 0.0798 0.135 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000132128 LRRC41 988904 sc-eQTL 2.22e-01 -0.191 0.156 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000142961 MOB3C 675621 sc-eQTL 9.56e-01 0.00871 0.157 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000159658 EFCAB14 573398 sc-eQTL 6.98e-01 0.0518 0.133 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000162368 CMPK1 -41285 sc-eQTL 2.47e-01 0.154 0.133 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000173660 UQCRH 988814 sc-eQTL 1.16e-01 0.191 0.121 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000079277 MKNK1 675669 sc-eQTL 4.96e-01 -0.116 0.17 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000117481 NSUN4 952335 sc-eQTL 5.70e-01 0.0859 0.151 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000123472 ATPAF1 618645 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0763 0.125 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000132128 LRRC41 988904 sc-eQTL 7.29e-01 0.0504 0.145 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000142961 MOB3C 675621 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0902 0.144 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000159658 EFCAB14 573398 sc-eQTL 8.45e-03 0.358 0.135 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000162368 CMPK1 -41285 sc-eQTL 4.76e-03 0.359 0.126 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000173660 UQCRH 988814 sc-eQTL 4.29e-02 0.237 0.116 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000079277 MKNK1 675669 sc-eQTL 2.77e-01 0.193 0.176 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000117481 NSUN4 952335 sc-eQTL 4.89e-01 -0.121 0.174 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 618645 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0755 0.153 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000132128 LRRC41 988904 sc-eQTL 4.35e-02 0.343 0.169 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000142961 MOB3C 675621 sc-eQTL 6.45e-01 0.076 0.165 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 573398 sc-eQTL 3.73e-01 0.138 0.155 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000162368 CMPK1 -41285 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0675 0.145 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000173660 UQCRH 988814 sc-eQTL 5.49e-01 -0.093 0.155 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000079277 MKNK1 675669 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0423 0.19 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000117481 NSUN4 952335 sc-eQTL 8.00e-01 0.0471 0.185 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 618645 sc-eQTL 8.76e-01 0.0273 0.174 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000132128 LRRC41 988904 sc-eQTL 8.43e-02 0.307 0.177 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000142961 MOB3C 675621 sc-eQTL 7.68e-01 0.0514 0.174 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 573398 sc-eQTL 6.24e-01 0.085 0.173 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000162368 CMPK1 -41285 sc-eQTL 2.30e-01 0.207 0.172 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000173660 UQCRH 988814 sc-eQTL 4.73e-01 -0.117 0.162 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000079277 MKNK1 675669 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0401 0.146 0.076 MAIT L2
ENSG00000117481 NSUN4 952335 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0141 0.167 0.076 MAIT L2
ENSG00000123472 ATPAF1 618645 sc-eQTL 2.86e-01 0.153 0.143 0.076 MAIT L2
ENSG00000123473 STIL -21635 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00184 0.142 0.076 MAIT L2
ENSG00000132128 LRRC41 988904 sc-eQTL 6.72e-01 0.0703 0.166 0.076 MAIT L2
ENSG00000142961 MOB3C 675621 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0359 0.153 0.076 MAIT L2
ENSG00000159658 EFCAB14 573398 sc-eQTL 3.97e-01 0.118 0.139 0.076 MAIT L2
ENSG00000162368 CMPK1 -41285 sc-eQTL 1.01e-01 0.232 0.141 0.076 MAIT L2
ENSG00000173660 UQCRH 988814 sc-eQTL 5.78e-01 0.0782 0.14 0.076 MAIT L2
ENSG00000079277 MKNK1 675669 sc-eQTL 7.53e-01 0.0572 0.181 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000117481 NSUN4 952335 sc-eQTL 3.64e-01 -0.15 0.165 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000123472 ATPAF1 618645 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0214 0.165 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000132128 LRRC41 988904 sc-eQTL 1.09e-01 0.275 0.171 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000142961 MOB3C 675621 sc-eQTL 3.47e-01 0.159 0.169 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000159658 EFCAB14 573398 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0788 0.168 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000162368 CMPK1 -41285 sc-eQTL 1.90e-01 0.221 0.168 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000173660 UQCRH 988814 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0466 0.145 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000079277 MKNK1 675669 sc-eQTL 9.91e-01 0.00207 0.185 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000117481 NSUN4 952335 sc-eQTL 4.67e-01 -0.122 0.167 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000123472 ATPAF1 618645 sc-eQTL 3.28e-01 -0.142 0.145 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000132128 LRRC41 988904 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0979 0.15 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000142961 MOB3C 675621 sc-eQTL 7.92e-02 0.264 0.15 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000159658 EFCAB14 573398 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0665 0.121 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000162368 CMPK1 -41285 sc-eQTL 9.16e-01 0.013 0.123 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000173660 UQCRH 988814 sc-eQTL 6.28e-01 0.0602 0.124 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000079277 MKNK1 675669 sc-eQTL 2.60e-01 0.207 0.183 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000117481 NSUN4 952335 sc-eQTL 9.33e-01 0.0154 0.182 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000123472 ATPAF1 618645 sc-eQTL 5.81e-02 0.342 0.179 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000132128 LRRC41 988904 sc-eQTL 4.68e-01 -0.132 0.182 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000142961 MOB3C 675621 sc-eQTL 2.35e-01 -0.198 0.166 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000159658 EFCAB14 573398 sc-eQTL 1.08e-01 0.243 0.15 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000162368 CMPK1 -41285 sc-eQTL 8.02e-02 0.293 0.166 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000173660 UQCRH 988814 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0244 0.163 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000079277 MKNK1 675669 sc-eQTL 9.85e-01 -0.0033 0.176 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000117481 NSUN4 952335 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0575 0.158 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000123472 ATPAF1 618645 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00509 0.145 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000132128 LRRC41 988904 sc-eQTL 9.63e-01 0.00661 0.144 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000142961 MOB3C 675621 sc-eQTL 4.91e-01 0.109 0.157 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000159658 EFCAB14 573398 sc-eQTL 6.17e-01 0.0687 0.137 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000162368 CMPK1 -41285 sc-eQTL 7.76e-01 0.0428 0.15 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000173660 UQCRH 988814 sc-eQTL 5.10e-01 0.0836 0.127 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000079277 MKNK1 675669 sc-eQTL 6.48e-01 0.0947 0.207 0.078 PB L2
ENSG00000117481 NSUN4 952335 sc-eQTL 2.38e-01 0.264 0.223 0.078 PB L2
ENSG00000123472 ATPAF1 618645 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0787 0.139 0.078 PB L2
ENSG00000132128 LRRC41 988904 sc-eQTL 4.77e-01 0.127 0.178 0.078 PB L2
ENSG00000142961 MOB3C 675621 sc-eQTL 1.68e-01 0.258 0.186 0.078 PB L2
ENSG00000159658 EFCAB14 573398 sc-eQTL 8.63e-01 0.0313 0.181 0.078 PB L2
ENSG00000162368 CMPK1 -41285 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0758 0.186 0.078 PB L2
ENSG00000173660 UQCRH 988814 sc-eQTL 2.19e-01 0.135 0.11 0.078 PB L2
ENSG00000079277 MKNK1 675669 sc-eQTL 5.45e-01 0.11 0.181 0.074 Pro_T L2
ENSG00000117481 NSUN4 952335 sc-eQTL 1.89e-01 0.232 0.176 0.074 Pro_T L2
ENSG00000123472 ATPAF1 618645 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0871 0.142 0.074 Pro_T L2
ENSG00000123473 STIL -21635 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0171 0.11 0.074 Pro_T L2
ENSG00000132128 LRRC41 988904 sc-eQTL 4.58e-01 -0.12 0.161 0.074 Pro_T L2
ENSG00000142961 MOB3C 675621 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0525 0.164 0.074 Pro_T L2
ENSG00000159658 EFCAB14 573398 sc-eQTL 3.33e-02 0.31 0.144 0.074 Pro_T L2
ENSG00000162368 CMPK1 -41285 sc-eQTL 2.78e-01 0.176 0.162 0.074 Pro_T L2
ENSG00000173660 UQCRH 988814 sc-eQTL 9.83e-01 0.00219 0.106 0.074 Pro_T L2
ENSG00000079277 MKNK1 675669 sc-eQTL 4.44e-01 0.131 0.17 0.075 Treg L2
ENSG00000117481 NSUN4 952335 sc-eQTL 2.90e-01 0.164 0.154 0.075 Treg L2
ENSG00000123472 ATPAF1 618645 sc-eQTL 3.13e-02 0.308 0.142 0.075 Treg L2
ENSG00000132128 LRRC41 988904 sc-eQTL 3.05e-01 0.163 0.158 0.075 Treg L2
ENSG00000142961 MOB3C 675621 sc-eQTL 9.25e-02 0.263 0.156 0.075 Treg L2
ENSG00000159658 EFCAB14 573398 sc-eQTL 4.14e-01 -0.116 0.142 0.075 Treg L2
ENSG00000162368 CMPK1 -41285 sc-eQTL 6.60e-01 0.0573 0.13 0.075 Treg L2
ENSG00000173660 UQCRH 988814 sc-eQTL 2.82e-01 -0.147 0.136 0.075 Treg L2
ENSG00000079277 MKNK1 675669 sc-eQTL 3.04e-01 0.156 0.152 0.078 cDC L2
ENSG00000117480 FAAH 898195 sc-eQTL 3.02e-01 -0.171 0.165 0.078 cDC L2
ENSG00000117481 NSUN4 952335 sc-eQTL 4.49e-02 0.343 0.17 0.078 cDC L2
ENSG00000123472 ATPAF1 618645 sc-eQTL 6.56e-01 0.0747 0.167 0.078 cDC L2
ENSG00000123473 STIL -21635 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0408 0.145 0.078 cDC L2
ENSG00000132128 LRRC41 988904 sc-eQTL 7.16e-01 0.0611 0.167 0.078 cDC L2
ENSG00000142961 MOB3C 675621 sc-eQTL 5.74e-01 0.0836 0.148 0.078 cDC L2
ENSG00000159658 EFCAB14 573398 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0905 0.167 0.078 cDC L2
ENSG00000162366 PDZK1IP1 101468 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0246 0.14 0.078 cDC L2
ENSG00000162368 CMPK1 -41285 sc-eQTL 3.22e-01 0.156 0.158 0.078 cDC L2
ENSG00000173660 UQCRH 988814 sc-eQTL 3.81e-01 0.0928 0.106 0.078 cDC L2
ENSG00000079277 MKNK1 675669 sc-eQTL 4.79e-01 0.0779 0.11 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000117480 FAAH 898195 sc-eQTL 7.76e-01 0.0372 0.131 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000117481 NSUN4 952335 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0396 0.166 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000123472 ATPAF1 618645 sc-eQTL 3.57e-01 -0.13 0.141 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000132128 LRRC41 988904 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0133 0.144 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000142961 MOB3C 675621 sc-eQTL 6.36e-01 0.0809 0.171 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000159658 EFCAB14 573398 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0249 0.121 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000162368 CMPK1 -41285 sc-eQTL 7.19e-01 0.0475 0.132 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000173660 UQCRH 988814 sc-eQTL 8.29e-01 0.0172 0.0797 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000079277 MKNK1 675669 sc-eQTL 4.08e-01 0.11 0.133 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000117480 FAAH 898195 sc-eQTL 5.30e-01 0.0916 0.146 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000117481 NSUN4 952335 sc-eQTL 1.92e-01 -0.214 0.163 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000123472 ATPAF1 618645 sc-eQTL 9.09e-02 -0.263 0.155 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000132128 LRRC41 988904 sc-eQTL 9.30e-01 0.0155 0.177 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000142961 MOB3C 675621 sc-eQTL 9.02e-02 0.28 0.165 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000159658 EFCAB14 573398 sc-eQTL 8.80e-01 0.0198 0.131 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000162368 CMPK1 -41285 sc-eQTL 8.74e-01 0.024 0.151 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000173660 UQCRH 988814 sc-eQTL 2.91e-01 -0.106 0.1 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000079277 MKNK1 675669 sc-eQTL 4.20e-01 0.17 0.21 0.082 gdT L2
ENSG00000117481 NSUN4 952335 sc-eQTL 8.62e-02 0.358 0.207 0.082 gdT L2
ENSG00000123472 ATPAF1 618645 sc-eQTL 3.64e-01 -0.167 0.183 0.082 gdT L2
ENSG00000123473 STIL -21635 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0225 0.163 0.082 gdT L2
ENSG00000132128 LRRC41 988904 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0429 0.204 0.082 gdT L2
ENSG00000142961 MOB3C 675621 sc-eQTL 7.36e-01 0.0655 0.194 0.082 gdT L2
ENSG00000159658 EFCAB14 573398 sc-eQTL 1.45e-01 0.259 0.177 0.082 gdT L2
ENSG00000162368 CMPK1 -41285 sc-eQTL 2.21e-01 0.232 0.189 0.082 gdT L2
ENSG00000173660 UQCRH 988814 sc-eQTL 1.26e-01 0.281 0.183 0.082 gdT L2
ENSG00000079277 MKNK1 675669 sc-eQTL 3.85e-02 0.299 0.143 0.076 intMono L2
ENSG00000117480 FAAH 898195 sc-eQTL 9.47e-01 -0.0108 0.162 0.076 intMono L2
ENSG00000117481 NSUN4 952335 sc-eQTL 5.48e-03 -0.464 0.165 0.076 intMono L2
ENSG00000123472 ATPAF1 618645 sc-eQTL 1.93e-01 0.224 0.171 0.076 intMono L2
ENSG00000132128 LRRC41 988904 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0899 0.177 0.076 intMono L2
ENSG00000142961 MOB3C 675621 sc-eQTL 5.43e-01 -0.103 0.17 0.076 intMono L2
ENSG00000159658 EFCAB14 573398 sc-eQTL 1.09e-01 0.226 0.141 0.076 intMono L2
ENSG00000162368 CMPK1 -41285 sc-eQTL 7.23e-01 0.0578 0.163 0.076 intMono L2
ENSG00000173660 UQCRH 988814 sc-eQTL 7.60e-01 -0.037 0.121 0.076 intMono L2
ENSG00000079277 MKNK1 675669 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0524 0.139 0.072 ncMono L2
ENSG00000117480 FAAH 898195 sc-eQTL 6.48e-01 0.0813 0.178 0.072 ncMono L2
ENSG00000117481 NSUN4 952335 sc-eQTL 5.69e-01 -0.104 0.182 0.072 ncMono L2
ENSG00000123472 ATPAF1 618645 sc-eQTL 2.30e-01 -0.206 0.171 0.072 ncMono L2
ENSG00000132128 LRRC41 988904 sc-eQTL 5.35e-01 -0.117 0.188 0.072 ncMono L2
ENSG00000142961 MOB3C 675621 sc-eQTL 5.38e-01 -0.111 0.18 0.072 ncMono L2
ENSG00000159658 EFCAB14 573398 sc-eQTL 3.41e-01 0.162 0.17 0.072 ncMono L2
ENSG00000162368 CMPK1 -41285 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0458 0.166 0.072 ncMono L2
ENSG00000173660 UQCRH 988814 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0582 0.113 0.072 ncMono L2
ENSG00000079277 MKNK1 675669 sc-eQTL 3.30e-01 -0.188 0.193 0.071 pDC L2
ENSG00000117480 FAAH 898195 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0413 0.154 0.071 pDC L2
ENSG00000117481 NSUN4 952335 sc-eQTL 8.82e-01 0.0276 0.185 0.071 pDC L2
ENSG00000123472 ATPAF1 618645 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0464 0.199 0.071 pDC L2
ENSG00000123473 STIL -21635 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0425 0.163 0.071 pDC L2
ENSG00000132128 LRRC41 988904 sc-eQTL 6.65e-01 0.0852 0.196 0.071 pDC L2
ENSG00000142961 MOB3C 675621 sc-eQTL 5.29e-01 -0.118 0.187 0.071 pDC L2
ENSG00000159658 EFCAB14 573398 sc-eQTL 1.04e-01 0.273 0.167 0.071 pDC L2
ENSG00000162366 PDZK1IP1 101468 sc-eQTL 2.78e-01 -0.163 0.15 0.071 pDC L2
ENSG00000162368 CMPK1 -41285 sc-eQTL 3.96e-01 0.153 0.179 0.071 pDC L2
ENSG00000173660 UQCRH 988814 sc-eQTL 2.06e-01 0.192 0.151 0.071 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079277 MKNK1 675669 sc-eQTL 6.48e-01 0.08 0.175 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000117481 NSUN4 952335 sc-eQTL 3.23e-01 -0.157 0.158 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 618645 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00619 0.13 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132128 LRRC41 988904 sc-eQTL 9.53e-01 0.00917 0.156 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 675621 sc-eQTL 1.27e-01 -0.248 0.162 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 573398 sc-eQTL 2.01e-01 0.165 0.129 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 -41285 sc-eQTL 1.70e-04 0.488 0.127 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173660 UQCRH 988814 sc-eQTL 6.92e-01 0.0466 0.117 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 675669 sc-eQTL 4.57e-01 -0.122 0.163 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000117481 NSUN4 952335 sc-eQTL 9.29e-01 0.0125 0.14 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 618645 sc-eQTL 4.36e-01 -0.108 0.139 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132128 LRRC41 988904 sc-eQTL 3.47e-01 -0.152 0.161 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 675621 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00709 0.157 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 573398 sc-eQTL 2.66e-01 0.121 0.108 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 -41285 sc-eQTL 1.25e-05 0.568 0.127 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173660 UQCRH 988814 sc-eQTL 4.43e-01 0.0871 0.113 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 675669 sc-eQTL 6.10e-01 0.0543 0.106 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000117480 FAAH 898195 sc-eQTL 4.34e-01 0.0982 0.125 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000117481 NSUN4 952335 sc-eQTL 2.02e-01 -0.2 0.156 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 618645 sc-eQTL 5.56e-02 -0.258 0.134 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000132128 LRRC41 988904 sc-eQTL 7.77e-01 0.0405 0.143 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 675621 sc-eQTL 1.74e-01 0.216 0.158 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 573398 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0478 0.111 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 -41285 sc-eQTL 7.49e-01 0.0387 0.121 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173660 UQCRH 988814 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0403 0.0808 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 675669 sc-eQTL 3.00e-01 0.114 0.11 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000117480 FAAH 898195 sc-eQTL 4.83e-01 0.113 0.16 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000117481 NSUN4 952335 sc-eQTL 4.74e-02 -0.324 0.162 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 618645 sc-eQTL 4.15e-01 0.124 0.152 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000132128 LRRC41 988904 sc-eQTL 9.65e-01 0.00758 0.173 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 675621 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0632 0.169 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 573398 sc-eQTL 8.14e-02 0.249 0.142 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 -41285 sc-eQTL 4.07e-01 0.119 0.143 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173660 UQCRH 988814 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0756 0.0998 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 675669 sc-eQTL 5.71e-01 0.103 0.182 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000117481 NSUN4 952335 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0559 0.146 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 618645 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0626 0.132 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132128 LRRC41 988904 sc-eQTL 2.75e-01 -0.136 0.124 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 675621 sc-eQTL 1.27e-01 0.218 0.142 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 573398 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0279 0.11 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 -41285 sc-eQTL 7.40e-01 0.0344 0.104 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173660 UQCRH 988814 sc-eQTL 7.10e-01 0.0415 0.112 0.075 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162366 PDZK1IP1 101468 eQTL 0.000183 0.209 0.0555 0.0 0.0 0.0677
ENSG00000162367 TAL1 60292 eQTL 0.0292 -0.0587 0.0269 0.0 0.0 0.0677
ENSG00000237424 FOXD2-AS1 -142129 eQTL 0.41 -0.0401 0.0487 0.0109 0.0 0.0677


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000132128 \N 988904 1.29e-06 8.81e-07 1.04e-07 5.11e-07 9.82e-08 3.3e-07 1.26e-06 5.82e-08 7.15e-07 1.11e-07 1.08e-06 3.21e-07 1.46e-06 1.49e-07 6.27e-08 2.23e-07 1.85e-07 4.22e-07 1.62e-07 6.16e-08 2.83e-07 3.8e-07 7.76e-07 3.4e-08 8.33e-07 2.01e-07 1.97e-07 1.17e-07 7.07e-07 8.48e-07 4.08e-07 3.95e-08 3.61e-08 2.04e-07 3.8e-07 3.43e-08 4.06e-08 8.17e-08 4.75e-08 8.06e-08 4.83e-08 2.12e-06 5.2e-08 4.2e-08 3.83e-08 6.68e-09 7.8e-08 4.41e-09 4.81e-08