Genes within 1Mb (chr1:47247955:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079277 MKNK1 631112 sc-eQTL 1.00e+00 3.84e-05 0.114 0.175 B L1
ENSG00000117481 NSUN4 907778 sc-eQTL 7.68e-02 -0.18 0.101 0.175 B L1
ENSG00000123472 ATPAF1 574088 sc-eQTL 3.37e-01 0.0678 0.0705 0.175 B L1
ENSG00000132128 LRRC41 944347 sc-eQTL 6.48e-01 0.0418 0.0913 0.175 B L1
ENSG00000142961 MOB3C 631064 sc-eQTL 8.17e-01 0.0252 0.109 0.175 B L1
ENSG00000159658 EFCAB14 528841 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0593 0.0683 0.175 B L1
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 sc-eQTL 4.30e-03 -0.231 0.08 0.175 B L1
ENSG00000173660 UQCRH 944257 sc-eQTL 8.85e-01 -0.00966 0.0668 0.175 B L1
ENSG00000079277 MKNK1 631112 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00742 0.0932 0.175 CD4T L1
ENSG00000117481 NSUN4 907778 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0743 0.069 0.175 CD4T L1
ENSG00000123472 ATPAF1 574088 sc-eQTL 2.99e-01 0.0675 0.0648 0.175 CD4T L1
ENSG00000132128 LRRC41 944347 sc-eQTL 3.97e-01 0.0634 0.0746 0.175 CD4T L1
ENSG00000142961 MOB3C 631064 sc-eQTL 2.63e-01 0.0864 0.0769 0.175 CD4T L1
ENSG00000159658 EFCAB14 528841 sc-eQTL 9.78e-02 0.0972 0.0585 0.175 CD4T L1
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 sc-eQTL 1.88e-06 -0.353 0.072 0.175 CD4T L1
ENSG00000173660 UQCRH 944257 sc-eQTL 7.78e-01 0.0197 0.0698 0.175 CD4T L1
ENSG00000079277 MKNK1 631112 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0974 0.101 0.175 CD8T L1
ENSG00000117481 NSUN4 907778 sc-eQTL 4.64e-02 -0.19 0.0946 0.175 CD8T L1
ENSG00000123472 ATPAF1 574088 sc-eQTL 2.25e-01 0.102 0.0838 0.175 CD8T L1
ENSG00000132128 LRRC41 944347 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0282 0.095 0.175 CD8T L1
ENSG00000142961 MOB3C 631064 sc-eQTL 8.77e-03 -0.237 0.0897 0.175 CD8T L1
ENSG00000159658 EFCAB14 528841 sc-eQTL 1.41e-01 0.0995 0.0674 0.175 CD8T L1
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 sc-eQTL 5.66e-04 -0.239 0.0683 0.175 CD8T L1
ENSG00000173660 UQCRH 944257 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0222 0.0606 0.175 CD8T L1
ENSG00000079277 MKNK1 631112 sc-eQTL 5.83e-01 0.0574 0.104 0.18 DC L1
ENSG00000117480 FAAH 853638 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0623 0.0871 0.18 DC L1
ENSG00000117481 NSUN4 907778 sc-eQTL 9.62e-01 0.00531 0.111 0.18 DC L1
ENSG00000123472 ATPAF1 574088 sc-eQTL 9.96e-01 0.000622 0.112 0.18 DC L1
ENSG00000123473 STIL -66192 sc-eQTL 4.73e-01 0.0764 0.106 0.18 DC L1
ENSG00000132128 LRRC41 944347 sc-eQTL 2.41e-01 -0.125 0.106 0.18 DC L1
ENSG00000142961 MOB3C 631064 sc-eQTL 6.74e-01 0.0445 0.106 0.18 DC L1
ENSG00000159658 EFCAB14 528841 sc-eQTL 2.73e-01 -0.115 0.104 0.18 DC L1
ENSG00000162366 PDZK1IP1 56911 sc-eQTL 7.52e-01 0.0319 0.101 0.18 DC L1
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 sc-eQTL 5.25e-01 0.0634 0.0994 0.18 DC L1
ENSG00000173660 UQCRH 944257 sc-eQTL 2.66e-01 -0.066 0.0592 0.18 DC L1
ENSG00000079277 MKNK1 631112 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0272 0.0737 0.175 Mono L1
ENSG00000117480 FAAH 853638 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0352 0.0923 0.175 Mono L1
ENSG00000117481 NSUN4 907778 sc-eQTL 1.86e-01 0.145 0.109 0.175 Mono L1
ENSG00000123472 ATPAF1 574088 sc-eQTL 2.91e-01 0.0988 0.0934 0.175 Mono L1
ENSG00000132128 LRRC41 944347 sc-eQTL 5.52e-01 0.0595 0.1 0.175 Mono L1
ENSG00000142961 MOB3C 631064 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000601 0.11 0.175 Mono L1
ENSG00000159658 EFCAB14 528841 sc-eQTL 9.45e-01 0.00519 0.0757 0.175 Mono L1
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 sc-eQTL 4.18e-04 -0.295 0.0823 0.175 Mono L1
ENSG00000173660 UQCRH 944257 sc-eQTL 5.47e-01 0.0355 0.0588 0.175 Mono L1
ENSG00000079277 MKNK1 631112 sc-eQTL 7.83e-01 0.034 0.123 0.176 NK L1
ENSG00000117481 NSUN4 907778 sc-eQTL 9.57e-01 0.0051 0.0951 0.176 NK L1
ENSG00000123472 ATPAF1 574088 sc-eQTL 9.65e-02 0.149 0.0895 0.176 NK L1
ENSG00000132128 LRRC41 944347 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0316 0.0831 0.176 NK L1
ENSG00000142961 MOB3C 631064 sc-eQTL 1.11e-02 -0.242 0.0946 0.176 NK L1
ENSG00000159658 EFCAB14 528841 sc-eQTL 2.94e-01 0.0768 0.073 0.176 NK L1
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 sc-eQTL 1.44e-01 -0.103 0.07 0.176 NK L1
ENSG00000173660 UQCRH 944257 sc-eQTL 9.03e-01 0.00922 0.0754 0.176 NK L1
ENSG00000079277 MKNK1 631112 sc-eQTL 7.37e-01 0.0356 0.106 0.175 Other_T L1
ENSG00000117481 NSUN4 907778 sc-eQTL 9.84e-01 0.00224 0.113 0.175 Other_T L1
ENSG00000123472 ATPAF1 574088 sc-eQTL 4.70e-02 -0.151 0.0754 0.175 Other_T L1
ENSG00000123473 STIL -66192 sc-eQTL 9.49e-01 0.00396 0.0616 0.175 Other_T L1
ENSG00000132128 LRRC41 944347 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00712 0.1 0.175 Other_T L1
ENSG00000142961 MOB3C 631064 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0197 0.107 0.175 Other_T L1
ENSG00000159658 EFCAB14 528841 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0222 0.0752 0.175 Other_T L1
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 sc-eQTL 2.12e-02 -0.223 0.0962 0.175 Other_T L1
ENSG00000173660 UQCRH 944257 sc-eQTL 6.76e-01 -0.027 0.0645 0.175 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079277 MKNK1 631112 sc-eQTL 9.34e-01 0.0114 0.137 0.168 B_Activated L2
ENSG00000117481 NSUN4 907778 sc-eQTL 5.37e-01 0.0797 0.129 0.168 B_Activated L2
ENSG00000123472 ATPAF1 574088 sc-eQTL 2.15e-01 0.162 0.13 0.168 B_Activated L2
ENSG00000132128 LRRC41 944347 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0891 0.125 0.168 B_Activated L2
ENSG00000142961 MOB3C 631064 sc-eQTL 6.70e-02 -0.201 0.109 0.168 B_Activated L2
ENSG00000159658 EFCAB14 528841 sc-eQTL 2.06e-01 -0.17 0.134 0.168 B_Activated L2
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 sc-eQTL 9.71e-02 -0.211 0.126 0.168 B_Activated L2
ENSG00000173660 UQCRH 944257 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0492 0.111 0.168 B_Activated L2
ENSG00000079277 MKNK1 631112 sc-eQTL 6.23e-01 0.0625 0.127 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000117481 NSUN4 907778 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0926 0.116 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000123472 ATPAF1 574088 sc-eQTL 2.51e-01 0.119 0.103 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000132128 LRRC41 944347 sc-eQTL 1.14e-01 0.191 0.121 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000142961 MOB3C 631064 sc-eQTL 6.64e-01 0.0521 0.12 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000159658 EFCAB14 528841 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0276 0.103 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 sc-eQTL 2.11e-02 -0.228 0.0982 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000173660 UQCRH 944257 sc-eQTL 8.24e-01 0.0208 0.0933 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000079277 MKNK1 631112 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0122 0.128 0.172 B_Memory L2
ENSG00000117481 NSUN4 907778 sc-eQTL 8.67e-01 0.0205 0.123 0.172 B_Memory L2
ENSG00000123472 ATPAF1 574088 sc-eQTL 7.15e-01 0.0425 0.116 0.172 B_Memory L2
ENSG00000132128 LRRC41 944347 sc-eQTL 3.35e-01 -0.116 0.12 0.172 B_Memory L2
ENSG00000142961 MOB3C 631064 sc-eQTL 3.86e-01 -0.101 0.116 0.172 B_Memory L2
ENSG00000159658 EFCAB14 528841 sc-eQTL 4.14e-01 0.0895 0.109 0.172 B_Memory L2
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0333 0.107 0.172 B_Memory L2
ENSG00000173660 UQCRH 944257 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0603 0.101 0.172 B_Memory L2
ENSG00000079277 MKNK1 631112 sc-eQTL 3.13e-01 -0.121 0.12 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000117481 NSUN4 907778 sc-eQTL 1.12e-01 -0.165 0.103 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000123472 ATPAF1 574088 sc-eQTL 7.33e-01 0.034 0.0996 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000132128 LRRC41 944347 sc-eQTL 3.19e-01 -0.116 0.116 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000142961 MOB3C 631064 sc-eQTL 3.64e-01 -0.109 0.12 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000159658 EFCAB14 528841 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0845 0.0844 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 sc-eQTL 5.69e-02 -0.184 0.0962 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000173660 UQCRH 944257 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0497 0.0845 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000079277 MKNK1 631112 sc-eQTL 2.28e-01 0.148 0.122 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000117481 NSUN4 907778 sc-eQTL 5.04e-01 0.0752 0.112 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000123472 ATPAF1 574088 sc-eQTL 4.24e-01 0.0876 0.109 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000132128 LRRC41 944347 sc-eQTL 5.32e-01 0.0779 0.124 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000142961 MOB3C 631064 sc-eQTL 1.05e-01 0.181 0.111 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000159658 EFCAB14 528841 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0261 0.094 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 sc-eQTL 2.76e-01 -0.111 0.102 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000173660 UQCRH 944257 sc-eQTL 3.87e-01 0.0805 0.0929 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000079277 MKNK1 631112 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0177 0.124 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000117481 NSUN4 907778 sc-eQTL 9.28e-01 0.0104 0.115 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000123472 ATPAF1 574088 sc-eQTL 2.23e-03 0.348 0.112 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000132128 LRRC41 944347 sc-eQTL 7.66e-03 0.319 0.118 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000142961 MOB3C 631064 sc-eQTL 6.40e-01 0.0526 0.112 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000159658 EFCAB14 528841 sc-eQTL 7.78e-01 0.0318 0.113 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 sc-eQTL 1.34e-01 -0.174 0.115 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000173660 UQCRH 944257 sc-eQTL 8.16e-02 0.185 0.106 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000079277 MKNK1 631112 sc-eQTL 6.28e-01 0.0533 0.11 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000117481 NSUN4 907778 sc-eQTL 8.59e-02 -0.142 0.0824 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000123472 ATPAF1 574088 sc-eQTL 4.31e-01 0.0567 0.0718 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000132128 LRRC41 944347 sc-eQTL 6.50e-01 0.0384 0.0845 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000142961 MOB3C 631064 sc-eQTL 8.22e-01 0.019 0.0841 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000159658 EFCAB14 528841 sc-eQTL 5.88e-01 0.0343 0.0632 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 sc-eQTL 9.89e-06 -0.312 0.0689 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000173660 UQCRH 944257 sc-eQTL 8.60e-01 0.0124 0.0706 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000079277 MKNK1 631112 sc-eQTL 2.32e-01 -0.147 0.123 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000117481 NSUN4 907778 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0396 0.0889 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 574088 sc-eQTL 9.00e-01 0.0117 0.093 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000132128 LRRC41 944347 sc-eQTL 2.66e-01 -0.109 0.0973 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000142961 MOB3C 631064 sc-eQTL 1.18e-01 0.167 0.106 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 528841 sc-eQTL 5.66e-02 0.151 0.0789 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 sc-eQTL 5.79e-04 -0.276 0.0791 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000173660 UQCRH 944257 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0235 0.0771 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000079277 MKNK1 631112 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0667 0.119 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000117481 NSUN4 907778 sc-eQTL 9.43e-01 0.00749 0.104 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 574088 sc-eQTL 8.18e-01 0.0218 0.0946 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000132128 LRRC41 944347 sc-eQTL 1.36e-01 0.171 0.114 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000142961 MOB3C 631064 sc-eQTL 7.59e-01 0.0366 0.119 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 528841 sc-eQTL 2.88e-01 0.097 0.0911 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 sc-eQTL 2.99e-02 -0.222 0.101 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000173660 UQCRH 944257 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0812 0.0967 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000079277 MKNK1 631112 sc-eQTL 3.82e-01 -0.105 0.12 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000117481 NSUN4 907778 sc-eQTL 8.48e-01 -0.022 0.115 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000123472 ATPAF1 574088 sc-eQTL 1.35e-01 0.14 0.0932 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000132128 LRRC41 944347 sc-eQTL 2.07e-01 -0.137 0.108 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000142961 MOB3C 631064 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0658 0.109 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000159658 EFCAB14 528841 sc-eQTL 7.87e-01 0.0251 0.0928 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 sc-eQTL 6.89e-02 -0.168 0.092 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000173660 UQCRH 944257 sc-eQTL 5.78e-01 0.0471 0.0845 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000079277 MKNK1 631112 sc-eQTL 7.94e-01 0.0318 0.122 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000117481 NSUN4 907778 sc-eQTL 1.93e-01 -0.141 0.108 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000123472 ATPAF1 574088 sc-eQTL 3.04e-01 0.0917 0.0891 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000132128 LRRC41 944347 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0519 0.104 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000142961 MOB3C 631064 sc-eQTL 1.45e-01 -0.151 0.103 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000159658 EFCAB14 528841 sc-eQTL 2.61e-02 0.217 0.0969 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 sc-eQTL 4.18e-03 -0.261 0.09 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000173660 UQCRH 944257 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0789 0.0838 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000079277 MKNK1 631112 sc-eQTL 8.76e-01 -0.02 0.128 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000117481 NSUN4 907778 sc-eQTL 9.94e-02 -0.208 0.125 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 574088 sc-eQTL 1.13e-01 0.175 0.11 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000132128 LRRC41 944347 sc-eQTL 5.84e-01 0.0677 0.124 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000142961 MOB3C 631064 sc-eQTL 2.51e-01 -0.137 0.119 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 528841 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0902 0.112 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 sc-eQTL 1.36e-01 -0.157 0.105 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000173660 UQCRH 944257 sc-eQTL 2.39e-01 -0.132 0.112 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000079277 MKNK1 631112 sc-eQTL 7.55e-02 -0.229 0.128 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000117481 NSUN4 907778 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0427 0.126 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000123472 ATPAF1 574088 sc-eQTL 3.37e-01 0.114 0.118 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000132128 LRRC41 944347 sc-eQTL 2.63e-01 0.135 0.121 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000142961 MOB3C 631064 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0283 0.118 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000159658 EFCAB14 528841 sc-eQTL 7.59e-01 0.0361 0.118 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 sc-eQTL 1.13e-01 -0.185 0.116 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000173660 UQCRH 944257 sc-eQTL 1.00e-01 0.181 0.11 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000079277 MKNK1 631112 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0179 0.102 0.173 MAIT L2
ENSG00000117481 NSUN4 907778 sc-eQTL 1.53e-01 -0.166 0.116 0.173 MAIT L2
ENSG00000123472 ATPAF1 574088 sc-eQTL 1.44e-01 -0.145 0.0991 0.173 MAIT L2
ENSG00000123473 STIL -66192 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0297 0.0987 0.173 MAIT L2
ENSG00000132128 LRRC41 944347 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0217 0.115 0.173 MAIT L2
ENSG00000142961 MOB3C 631064 sc-eQTL 7.64e-01 -0.032 0.107 0.173 MAIT L2
ENSG00000159658 EFCAB14 528841 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0339 0.097 0.173 MAIT L2
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 sc-eQTL 6.52e-03 -0.267 0.097 0.173 MAIT L2
ENSG00000173660 UQCRH 944257 sc-eQTL 8.95e-01 0.013 0.0977 0.173 MAIT L2
ENSG00000079277 MKNK1 631112 sc-eQTL 7.93e-01 0.0319 0.122 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000117481 NSUN4 907778 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0343 0.111 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000123472 ATPAF1 574088 sc-eQTL 1.46e-01 0.161 0.11 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000132128 LRRC41 944347 sc-eQTL 1.22e-01 -0.179 0.115 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000142961 MOB3C 631064 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0645 0.114 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000159658 EFCAB14 528841 sc-eQTL 7.82e-01 0.0313 0.113 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 sc-eQTL 1.61e-01 -0.159 0.113 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000173660 UQCRH 944257 sc-eQTL 7.47e-01 0.0315 0.0978 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000079277 MKNK1 631112 sc-eQTL 9.12e-01 0.0142 0.129 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000117481 NSUN4 907778 sc-eQTL 9.59e-01 0.00597 0.117 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000123472 ATPAF1 574088 sc-eQTL 2.73e-01 0.111 0.101 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000132128 LRRC41 944347 sc-eQTL 7.03e-01 0.04 0.105 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000142961 MOB3C 631064 sc-eQTL 3.24e-02 -0.224 0.104 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000159658 EFCAB14 528841 sc-eQTL 3.47e-01 0.0793 0.0842 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0643 0.086 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000173660 UQCRH 944257 sc-eQTL 3.96e-01 0.0737 0.0867 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000079277 MKNK1 631112 sc-eQTL 1.82e-01 -0.167 0.125 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000117481 NSUN4 907778 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0398 0.124 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000123472 ATPAF1 574088 sc-eQTL 5.39e-01 0.0759 0.123 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000132128 LRRC41 944347 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0852 0.124 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000142961 MOB3C 631064 sc-eQTL 5.61e-01 0.0662 0.114 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000159658 EFCAB14 528841 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000216 0.103 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 sc-eQTL 8.30e-01 0.0246 0.114 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000173660 UQCRH 944257 sc-eQTL 2.35e-01 0.132 0.111 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000079277 MKNK1 631112 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0175 0.122 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000117481 NSUN4 907778 sc-eQTL 8.27e-01 0.024 0.11 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000123472 ATPAF1 574088 sc-eQTL 3.18e-01 0.1 0.1 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000132128 LRRC41 944347 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0386 0.0994 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000142961 MOB3C 631064 sc-eQTL 1.26e-01 -0.167 0.108 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000159658 EFCAB14 528841 sc-eQTL 2.28e-01 0.115 0.0948 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 sc-eQTL 2.10e-01 -0.13 0.103 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000173660 UQCRH 944257 sc-eQTL 3.62e-01 0.0801 0.0877 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000079277 MKNK1 631112 sc-eQTL 4.31e-01 -0.123 0.156 0.178 PB L2
ENSG00000117481 NSUN4 907778 sc-eQTL 1.20e-02 -0.42 0.165 0.178 PB L2
ENSG00000123472 ATPAF1 574088 sc-eQTL 5.79e-02 0.198 0.103 0.178 PB L2
ENSG00000132128 LRRC41 944347 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0948 0.135 0.178 PB L2
ENSG00000142961 MOB3C 631064 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0466 0.142 0.178 PB L2
ENSG00000159658 EFCAB14 528841 sc-eQTL 9.94e-01 0.001 0.137 0.178 PB L2
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 sc-eQTL 7.02e-01 0.0541 0.141 0.178 PB L2
ENSG00000173660 UQCRH 944257 sc-eQTL 9.80e-01 0.00206 0.0834 0.178 PB L2
ENSG00000079277 MKNK1 631112 sc-eQTL 4.12e-01 0.106 0.129 0.176 Pro_T L2
ENSG00000117481 NSUN4 907778 sc-eQTL 7.01e-02 0.227 0.125 0.176 Pro_T L2
ENSG00000123472 ATPAF1 574088 sc-eQTL 1.16e-01 -0.159 0.1 0.176 Pro_T L2
ENSG00000123473 STIL -66192 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0546 0.0784 0.176 Pro_T L2
ENSG00000132128 LRRC41 944347 sc-eQTL 4.63e-01 -0.084 0.114 0.176 Pro_T L2
ENSG00000142961 MOB3C 631064 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00637 0.116 0.176 Pro_T L2
ENSG00000159658 EFCAB14 528841 sc-eQTL 2.29e-01 -0.125 0.103 0.176 Pro_T L2
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 sc-eQTL 3.39e-01 0.11 0.115 0.176 Pro_T L2
ENSG00000173660 UQCRH 944257 sc-eQTL 4.27e-02 -0.151 0.0743 0.176 Pro_T L2
ENSG00000079277 MKNK1 631112 sc-eQTL 9.95e-01 0.000811 0.121 0.175 Treg L2
ENSG00000117481 NSUN4 907778 sc-eQTL 1.59e-01 -0.154 0.109 0.175 Treg L2
ENSG00000123472 ATPAF1 574088 sc-eQTL 5.01e-01 0.0685 0.102 0.175 Treg L2
ENSG00000132128 LRRC41 944347 sc-eQTL 5.96e-01 0.0597 0.112 0.175 Treg L2
ENSG00000142961 MOB3C 631064 sc-eQTL 7.48e-01 0.0356 0.111 0.175 Treg L2
ENSG00000159658 EFCAB14 528841 sc-eQTL 2.23e-02 0.228 0.0993 0.175 Treg L2
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 sc-eQTL 1.91e-03 -0.283 0.0901 0.175 Treg L2
ENSG00000173660 UQCRH 944257 sc-eQTL 9.17e-02 0.163 0.0962 0.175 Treg L2
ENSG00000079277 MKNK1 631112 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0514 0.111 0.18 cDC L2
ENSG00000117480 FAAH 853638 sc-eQTL 9.20e-01 0.0122 0.12 0.18 cDC L2
ENSG00000117481 NSUN4 907778 sc-eQTL 7.89e-01 0.0334 0.125 0.18 cDC L2
ENSG00000123472 ATPAF1 574088 sc-eQTL 3.73e-01 0.109 0.122 0.18 cDC L2
ENSG00000123473 STIL -66192 sc-eQTL 6.59e-01 0.0467 0.106 0.18 cDC L2
ENSG00000132128 LRRC41 944347 sc-eQTL 2.70e-01 -0.134 0.121 0.18 cDC L2
ENSG00000142961 MOB3C 631064 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0102 0.108 0.18 cDC L2
ENSG00000159658 EFCAB14 528841 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0796 0.122 0.18 cDC L2
ENSG00000162366 PDZK1IP1 56911 sc-eQTL 1.86e-01 0.135 0.102 0.18 cDC L2
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 sc-eQTL 8.23e-01 0.0257 0.115 0.18 cDC L2
ENSG00000173660 UQCRH 944257 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0443 0.077 0.18 cDC L2
ENSG00000079277 MKNK1 631112 sc-eQTL 9.58e-01 0.00409 0.0773 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000117480 FAAH 853638 sc-eQTL 4.20e-01 -0.074 0.0917 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000117481 NSUN4 907778 sc-eQTL 5.68e-02 0.221 0.116 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000123472 ATPAF1 574088 sc-eQTL 1.21e-01 0.154 0.0986 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000132128 LRRC41 944347 sc-eQTL 7.09e-01 0.0378 0.101 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000142961 MOB3C 631064 sc-eQTL 8.68e-01 0.0201 0.12 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000159658 EFCAB14 528841 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0451 0.0852 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 sc-eQTL 2.18e-03 -0.282 0.0908 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000173660 UQCRH 944257 sc-eQTL 4.98e-01 0.038 0.056 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000079277 MKNK1 631112 sc-eQTL 7.28e-01 0.0326 0.0936 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000117480 FAAH 853638 sc-eQTL 9.77e-01 0.00291 0.103 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000117481 NSUN4 907778 sc-eQTL 8.72e-01 0.0186 0.115 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000123472 ATPAF1 574088 sc-eQTL 4.45e-01 0.0837 0.109 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000132128 LRRC41 944347 sc-eQTL 6.48e-01 0.0568 0.124 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000142961 MOB3C 631064 sc-eQTL 6.02e-01 0.0609 0.117 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000159658 EFCAB14 528841 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0192 0.092 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0859 0.106 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000173660 UQCRH 944257 sc-eQTL 3.20e-01 0.0701 0.0704 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000079277 MKNK1 631112 sc-eQTL 4.50e-01 0.11 0.145 0.164 gdT L2
ENSG00000117481 NSUN4 907778 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0151 0.144 0.164 gdT L2
ENSG00000123472 ATPAF1 574088 sc-eQTL 9.13e-01 0.0139 0.126 0.164 gdT L2
ENSG00000123473 STIL -66192 sc-eQTL 3.50e-01 -0.105 0.112 0.164 gdT L2
ENSG00000132128 LRRC41 944347 sc-eQTL 9.15e-02 0.235 0.139 0.164 gdT L2
ENSG00000142961 MOB3C 631064 sc-eQTL 3.87e-01 -0.115 0.133 0.164 gdT L2
ENSG00000159658 EFCAB14 528841 sc-eQTL 9.01e-01 0.0153 0.123 0.164 gdT L2
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 sc-eQTL 1.30e-01 -0.197 0.129 0.164 gdT L2
ENSG00000173660 UQCRH 944257 sc-eQTL 2.56e-01 0.144 0.126 0.164 gdT L2
ENSG00000079277 MKNK1 631112 sc-eQTL 5.13e-01 0.0675 0.103 0.173 intMono L2
ENSG00000117480 FAAH 853638 sc-eQTL 5.69e-02 -0.219 0.114 0.173 intMono L2
ENSG00000117481 NSUN4 907778 sc-eQTL 3.70e-01 0.107 0.12 0.173 intMono L2
ENSG00000123472 ATPAF1 574088 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0249 0.122 0.173 intMono L2
ENSG00000132128 LRRC41 944347 sc-eQTL 3.93e-01 0.108 0.126 0.173 intMono L2
ENSG00000142961 MOB3C 631064 sc-eQTL 1.56e-01 -0.171 0.12 0.173 intMono L2
ENSG00000159658 EFCAB14 528841 sc-eQTL 5.24e-02 0.195 0.0998 0.173 intMono L2
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 sc-eQTL 5.98e-02 -0.218 0.115 0.173 intMono L2
ENSG00000173660 UQCRH 944257 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0532 0.0861 0.173 intMono L2
ENSG00000079277 MKNK1 631112 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0381 0.0929 0.179 ncMono L2
ENSG00000117480 FAAH 853638 sc-eQTL 5.13e-01 0.0777 0.118 0.179 ncMono L2
ENSG00000117481 NSUN4 907778 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0411 0.121 0.179 ncMono L2
ENSG00000123472 ATPAF1 574088 sc-eQTL 7.43e-01 0.0375 0.114 0.179 ncMono L2
ENSG00000132128 LRRC41 944347 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0491 0.125 0.179 ncMono L2
ENSG00000142961 MOB3C 631064 sc-eQTL 6.71e-01 0.051 0.12 0.179 ncMono L2
ENSG00000159658 EFCAB14 528841 sc-eQTL 1.87e-01 0.149 0.113 0.179 ncMono L2
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 sc-eQTL 1.41e-01 -0.163 0.11 0.179 ncMono L2
ENSG00000173660 UQCRH 944257 sc-eQTL 9.54e-01 0.00435 0.0754 0.179 ncMono L2
ENSG00000079277 MKNK1 631112 sc-eQTL 7.12e-01 0.0483 0.131 0.169 pDC L2
ENSG00000117480 FAAH 853638 sc-eQTL 2.38e-01 -0.122 0.103 0.169 pDC L2
ENSG00000117481 NSUN4 907778 sc-eQTL 1.25e-01 -0.191 0.124 0.169 pDC L2
ENSG00000123472 ATPAF1 574088 sc-eQTL 4.16e-01 -0.109 0.134 0.169 pDC L2
ENSG00000123473 STIL -66192 sc-eQTL 6.15e-02 0.205 0.109 0.169 pDC L2
ENSG00000132128 LRRC41 944347 sc-eQTL 3.71e-01 -0.119 0.132 0.169 pDC L2
ENSG00000142961 MOB3C 631064 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0707 0.127 0.169 pDC L2
ENSG00000159658 EFCAB14 528841 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0632 0.114 0.169 pDC L2
ENSG00000162366 PDZK1IP1 56911 sc-eQTL 6.04e-01 0.0527 0.101 0.169 pDC L2
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 sc-eQTL 1.08e-01 0.194 0.12 0.169 pDC L2
ENSG00000173660 UQCRH 944257 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0954 0.102 0.169 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079277 MKNK1 631112 sc-eQTL 6.04e-01 0.0652 0.125 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000117481 NSUN4 907778 sc-eQTL 3.75e-01 -0.101 0.113 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 574088 sc-eQTL 1.50e-01 0.134 0.0927 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132128 LRRC41 944347 sc-eQTL 6.04e-01 0.0581 0.112 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 631064 sc-eQTL 3.84e-01 -0.102 0.116 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 528841 sc-eQTL 5.63e-01 0.0537 0.0927 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 sc-eQTL 7.53e-02 -0.168 0.0937 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173660 UQCRH 944257 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0259 0.0841 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 631112 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00924 0.118 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000117481 NSUN4 907778 sc-eQTL 3.04e-01 -0.104 0.1 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 574088 sc-eQTL 3.78e-01 0.0881 0.0997 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132128 LRRC41 944347 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0523 0.116 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 631064 sc-eQTL 8.36e-01 0.0233 0.113 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 528841 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0698 0.0779 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 sc-eQTL 2.97e-02 -0.206 0.0943 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173660 UQCRH 944257 sc-eQTL 7.32e-01 -0.028 0.0815 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 631112 sc-eQTL 8.01e-01 0.019 0.0754 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000117480 FAAH 853638 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0122 0.089 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000117481 NSUN4 907778 sc-eQTL 1.32e-01 0.167 0.111 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 574088 sc-eQTL 2.82e-01 0.103 0.0955 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000132128 LRRC41 944347 sc-eQTL 7.72e-01 0.0294 0.101 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 631064 sc-eQTL 7.28e-01 0.0392 0.112 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 528841 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0473 0.0789 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 sc-eQTL 4.88e-04 -0.295 0.0832 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173660 UQCRH 944257 sc-eQTL 3.35e-01 0.0553 0.0573 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 631112 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00292 0.0781 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000117480 FAAH 853638 sc-eQTL 2.47e-01 -0.131 0.113 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000117481 NSUN4 907778 sc-eQTL 6.88e-01 0.0465 0.116 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 574088 sc-eQTL 6.38e-01 0.0507 0.108 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000132128 LRRC41 944347 sc-eQTL 7.86e-01 0.0331 0.122 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 631064 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00938 0.119 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 528841 sc-eQTL 4.13e-02 0.206 0.1 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 sc-eQTL 1.98e-01 -0.131 0.101 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173660 UQCRH 944257 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0282 0.0707 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079277 MKNK1 631112 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00981 0.126 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000117481 NSUN4 907778 sc-eQTL 8.61e-01 0.0178 0.101 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000123472 ATPAF1 574088 sc-eQTL 1.43e-01 0.134 0.0915 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132128 LRRC41 944347 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00797 0.0866 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142961 MOB3C 631064 sc-eQTL 1.25e-02 -0.247 0.0981 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000159658 EFCAB14 528841 sc-eQTL 1.84e-01 0.102 0.0761 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 sc-eQTL 1.28e-01 -0.11 0.0718 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173660 UQCRH 944257 sc-eQTL 8.05e-01 0.0192 0.0777 0.175 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000117480 FAAH 853638 eQTL 0.0349 0.0637 0.0302 0.0 0.0 0.146
ENSG00000159658 EFCAB14 528841 pQTL 0.0175 0.0557 0.0234 0.00124 0.0 0.142
ENSG00000162366 PDZK1IP1 56911 eQTL 0.87 -0.00659 0.0402 0.00115 0.0 0.146
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 eQTL 1.04e-09 -0.0884 0.0143 0.0234 0.0221 0.146


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162368 CMPK1 -85842 5.53e-06 5.09e-06 7.87e-07 3.15e-06 1.35e-06 1.55e-06 5.25e-06 9.94e-07 4.97e-06 2.4e-06 5.32e-06 3.5e-06 7.69e-06 1.9e-06 1.49e-06 3.81e-06 1.74e-06 3.79e-06 1.45e-06 9.86e-07 3.04e-06 4.9e-06 4.46e-06 1.4e-06 8.44e-06 1.63e-06 2.49e-06 1.82e-06 4.3e-06 4.27e-06 2.83e-06 5.09e-07 8.13e-07 1.46e-06 2.02e-06 9.61e-07 8.96e-07 4.92e-07 1.19e-06 5.17e-07 2.79e-07 6.63e-06 6.3e-07 2.06e-07 3.58e-07 7.09e-07 9.33e-07 2.26e-07 2.72e-07