Genes within 1Mb (chr1:45428245:GCA:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070759 TESK2 -62918 sc-eQTL 1.37e-03 0.635 0.196 0.052 DC L1
ENSG00000070785 EIF2B3 441523 sc-eQTL 7.24e-01 0.062 0.175 0.052 DC L1
ENSG00000085998 POMGNT1 -792060 sc-eQTL 4.93e-01 0.102 0.149 0.052 DC L1
ENSG00000086015 MAST2 -358742 sc-eQTL 9.95e-01 -0.00121 0.176 0.052 DC L1
ENSG00000117425 PTCH2 584992 sc-eQTL 2.29e-01 0.216 0.179 0.052 DC L1
ENSG00000117448 AKR1A1 -122298 sc-eQTL 3.37e-02 -0.36 0.168 0.052 DC L1
ENSG00000117450 PRDX1 -94802 sc-eQTL 9.55e-02 0.232 0.139 0.052 DC L1
ENSG00000117480 FAAH -966072 sc-eQTL 3.78e-01 -0.129 0.146 0.052 DC L1
ENSG00000117481 NSUN4 -911932 sc-eQTL 6.12e-01 0.0947 0.186 0.052 DC L1
ENSG00000126088 UROD 417295 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0678 0.172 0.052 DC L1
ENSG00000126106 TMEM53 753764 sc-eQTL 2.21e-01 0.2 0.163 0.052 DC L1
ENSG00000126107 HECTD3 416921 sc-eQTL 2.34e-01 -0.233 0.195 0.052 DC L1
ENSG00000132128 LRRC41 -875363 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0819 0.179 0.052 DC L1
ENSG00000132773 TOE1 88193 sc-eQTL 3.26e-01 0.194 0.197 0.052 DC L1
ENSG00000132780 NASP -155601 sc-eQTL 8.06e-01 0.0386 0.157 0.052 DC L1
ENSG00000132781 MUTYH 87352 sc-eQTL 3.43e-01 0.181 0.191 0.052 DC L1
ENSG00000142937 RPS8 652994 sc-eQTL 8.77e-02 0.174 0.101 0.052 DC L1
ENSG00000159592 GPBP1L1 -259868 sc-eQTL 4.79e-01 0.135 0.19 0.052 DC L1
ENSG00000159596 TMEM69 -259936 sc-eQTL 7.73e-03 -0.496 0.184 0.052 DC L1
ENSG00000173660 UQCRH -875453 sc-eQTL 1.33e-01 -0.15 0.0994 0.052 DC L1
ENSG00000173846 PLK3 627868 sc-eQTL 9.66e-01 0.00573 0.135 0.052 DC L1
ENSG00000197429 IPP -322408 sc-eQTL 4.24e-01 -0.146 0.182 0.052 DC L1
ENSG00000198520 ARMH1 753553 sc-eQTL 2.34e-01 0.204 0.171 0.052 DC L1
ENSG00000222009 BTBD19 619763 sc-eQTL 5.38e-01 -0.124 0.202 0.052 DC L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070759 TESK2 -62918 sc-eQTL 4.59e-01 0.168 0.226 0.051 B_Activated L2
ENSG00000070785 EIF2B3 441523 sc-eQTL 3.59e-01 -0.203 0.22 0.051 B_Activated L2
ENSG00000085998 POMGNT1 -792060 sc-eQTL 1.98e-01 0.284 0.22 0.051 B_Activated L2
ENSG00000086015 MAST2 -358742 sc-eQTL 1.82e-03 0.605 0.191 0.051 B_Activated L2
ENSG00000117425 PTCH2 584992 sc-eQTL 3.50e-01 -0.125 0.133 0.051 B_Activated L2
ENSG00000117448 AKR1A1 -122298 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0167 0.223 0.051 B_Activated L2
ENSG00000117450 PRDX1 -94802 sc-eQTL 1.51e-01 -0.25 0.173 0.051 B_Activated L2
ENSG00000117481 NSUN4 -911932 sc-eQTL 6.44e-01 0.103 0.224 0.051 B_Activated L2
ENSG00000126088 UROD 417295 sc-eQTL 6.04e-01 -0.12 0.231 0.051 B_Activated L2
ENSG00000126106 TMEM53 753764 sc-eQTL 5.14e-01 -0.127 0.195 0.051 B_Activated L2
ENSG00000126107 HECTD3 416921 sc-eQTL 4.25e-01 0.179 0.224 0.051 B_Activated L2
ENSG00000132128 LRRC41 -875363 sc-eQTL 2.14e-01 0.27 0.216 0.051 B_Activated L2
ENSG00000132773 TOE1 88193 sc-eQTL 9.56e-01 -0.0123 0.22 0.051 B_Activated L2
ENSG00000132780 NASP -155601 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0228 0.217 0.051 B_Activated L2
ENSG00000132781 MUTYH 87352 sc-eQTL 3.81e-01 -0.202 0.229 0.051 B_Activated L2
ENSG00000142937 RPS8 652994 sc-eQTL 4.08e-01 0.0953 0.115 0.051 B_Activated L2
ENSG00000159592 GPBP1L1 -259868 sc-eQTL 3.05e-01 -0.239 0.232 0.051 B_Activated L2
ENSG00000159596 TMEM69 -259936 sc-eQTL 1.66e-01 -0.294 0.211 0.051 B_Activated L2
ENSG00000173660 UQCRH -875453 sc-eQTL 4.08e-01 0.16 0.192 0.051 B_Activated L2
ENSG00000173846 PLK3 627868 sc-eQTL 9.28e-02 0.351 0.208 0.051 B_Activated L2
ENSG00000197429 IPP -322408 sc-eQTL 3.21e-01 -0.21 0.211 0.051 B_Activated L2
ENSG00000198520 ARMH1 753553 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0791 0.21 0.051 B_Activated L2
ENSG00000280670 CCDC163 -71834 sc-eQTL 4.85e-01 0.108 0.154 0.051 B_Activated L2
ENSG00000070759 TESK2 -62918 sc-eQTL 7.16e-01 0.072 0.197 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000070785 EIF2B3 441523 sc-eQTL 3.26e-01 0.214 0.217 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000085998 POMGNT1 -792060 sc-eQTL 7.09e-01 0.0763 0.204 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000086015 MAST2 -358742 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0361 0.193 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000117448 AKR1A1 -122298 sc-eQTL 5.80e-01 0.124 0.224 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000117450 PRDX1 -94802 sc-eQTL 2.89e-01 0.174 0.163 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000117481 NSUN4 -911932 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0662 0.202 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000126088 UROD 417295 sc-eQTL 2.16e-01 0.268 0.216 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000126107 HECTD3 416921 sc-eQTL 4.44e-01 0.16 0.208 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000132128 LRRC41 -875363 sc-eQTL 5.47e-01 0.127 0.211 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000132773 TOE1 88193 sc-eQTL 3.86e-01 -0.18 0.207 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000132780 NASP -155601 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0413 0.196 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000132781 MUTYH 87352 sc-eQTL 8.01e-01 0.0536 0.213 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000142937 RPS8 652994 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0707 0.0886 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000159592 GPBP1L1 -259868 sc-eQTL 5.23e-01 -0.132 0.206 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000159596 TMEM69 -259936 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0207 0.204 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000162415 ZSWIM5 122036 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0191 0.188 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000173660 UQCRH -875453 sc-eQTL 4.75e-01 -0.134 0.187 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000173846 PLK3 627868 sc-eQTL 3.04e-01 0.161 0.156 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000197429 IPP -322408 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00918 0.217 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000198520 ARMH1 753553 sc-eQTL 7.82e-01 0.0445 0.161 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000070759 TESK2 -62918 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0463 0.213 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000070785 EIF2B3 441523 sc-eQTL 8.99e-01 0.0278 0.218 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000085998 POMGNT1 -792060 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0911 0.208 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000086015 MAST2 -358742 sc-eQTL 1.47e-01 -0.295 0.203 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000117448 AKR1A1 -122298 sc-eQTL 5.54e-03 -0.566 0.202 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000117450 PRDX1 -94802 sc-eQTL 5.09e-01 -0.102 0.155 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000117461 PIK3R3 -704791 sc-eQTL 3.51e-01 0.165 0.176 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000117481 NSUN4 -911932 sc-eQTL 3.52e-01 -0.2 0.215 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000126088 UROD 417295 sc-eQTL 2.48e-01 -0.244 0.211 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000126107 HECTD3 416921 sc-eQTL 5.36e-01 0.138 0.223 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000132128 LRRC41 -875363 sc-eQTL 1.69e-01 -0.29 0.21 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000132773 TOE1 88193 sc-eQTL 7.19e-02 -0.356 0.197 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000132780 NASP -155601 sc-eQTL 2.71e-01 0.189 0.171 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000132781 MUTYH 87352 sc-eQTL 8.75e-01 0.0359 0.227 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000142937 RPS8 652994 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00313 0.112 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000159592 GPBP1L1 -259868 sc-eQTL 1.68e-01 -0.282 0.204 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000159596 TMEM69 -259936 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0228 0.217 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000162415 ZSWIM5 122036 sc-eQTL 7.00e-01 0.0759 0.196 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000173660 UQCRH -875453 sc-eQTL 4.40e-01 0.148 0.191 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000173846 PLK3 627868 sc-eQTL 3.84e-01 0.129 0.148 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000197429 IPP -322408 sc-eQTL 8.75e-01 0.0334 0.213 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000198520 ARMH1 753553 sc-eQTL 5.49e-01 -0.107 0.178 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000070759 TESK2 -62918 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0614 0.203 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000070785 EIF2B3 441523 sc-eQTL 2.28e-02 -0.455 0.198 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000085998 POMGNT1 -792060 sc-eQTL 1.77e-02 0.489 0.204 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000086015 MAST2 -358742 sc-eQTL 7.61e-01 0.0618 0.203 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000117448 AKR1A1 -122298 sc-eQTL 3.29e-02 -0.432 0.201 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000117450 PRDX1 -94802 sc-eQTL 2.20e-01 0.221 0.179 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000117461 PIK3R3 -704791 sc-eQTL 9.67e-01 0.00784 0.189 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000117481 NSUN4 -911932 sc-eQTL 3.59e-04 0.727 0.2 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000126088 UROD 417295 sc-eQTL 2.69e-01 0.22 0.198 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000126107 HECTD3 416921 sc-eQTL 3.31e-01 -0.2 0.205 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000132128 LRRC41 -875363 sc-eQTL 5.29e-01 0.125 0.198 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000132773 TOE1 88193 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0385 0.201 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000132780 NASP -155601 sc-eQTL 5.64e-01 0.0868 0.15 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000132781 MUTYH 87352 sc-eQTL 2.59e-01 0.235 0.208 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000142937 RPS8 652994 sc-eQTL 1.92e-01 -0.155 0.119 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000159592 GPBP1L1 -259868 sc-eQTL 3.46e-01 -0.203 0.215 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000159596 TMEM69 -259936 sc-eQTL 9.51e-01 0.0111 0.179 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000162415 ZSWIM5 122036 sc-eQTL 1.58e-01 -0.291 0.205 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000173660 UQCRH -875453 sc-eQTL 5.41e-02 -0.348 0.18 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000173846 PLK3 627868 sc-eQTL 3.54e-01 0.13 0.14 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000197429 IPP -322408 sc-eQTL 5.30e-01 -0.132 0.21 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000198520 ARMH1 753553 sc-eQTL 2.08e-01 -0.238 0.188 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000070759 TESK2 -62918 sc-eQTL 3.91e-01 0.169 0.197 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000070785 EIF2B3 441523 sc-eQTL 3.66e-02 0.438 0.208 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000085998 POMGNT1 -792060 sc-eQTL 4.17e-01 0.168 0.207 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000086015 MAST2 -358742 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0288 0.198 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000117448 AKR1A1 -122298 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0671 0.192 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000117450 PRDX1 -94802 sc-eQTL 5.40e-01 -0.112 0.183 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000117461 PIK3R3 -704791 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0139 0.191 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000117481 NSUN4 -911932 sc-eQTL 2.91e-01 -0.201 0.19 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000126088 UROD 417295 sc-eQTL 3.01e-01 -0.187 0.18 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000126106 TMEM53 753764 sc-eQTL 5.02e-01 -0.135 0.201 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000126107 HECTD3 416921 sc-eQTL 8.42e-01 0.0409 0.205 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000132128 LRRC41 -875363 sc-eQTL 1.45e-01 0.289 0.198 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000132773 TOE1 88193 sc-eQTL 7.55e-01 0.0591 0.189 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000132780 NASP -155601 sc-eQTL 1.02e-01 -0.294 0.179 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000132781 MUTYH 87352 sc-eQTL 4.06e-01 -0.185 0.222 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000142937 RPS8 652994 sc-eQTL 2.13e-01 -0.122 0.0979 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000159592 GPBP1L1 -259868 sc-eQTL 3.51e-01 -0.194 0.207 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000159596 TMEM69 -259936 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0427 0.196 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000162415 ZSWIM5 122036 sc-eQTL 7.66e-01 0.0535 0.18 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000173660 UQCRH -875453 sc-eQTL 5.25e-01 0.107 0.168 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000173846 PLK3 627868 sc-eQTL 5.71e-01 -0.105 0.185 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000197429 IPP -322408 sc-eQTL 1.56e-02 -0.501 0.206 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000070759 TESK2 -62918 sc-eQTL 2.12e-01 -0.256 0.205 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000070785 EIF2B3 441523 sc-eQTL 4.90e-01 0.146 0.211 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000085998 POMGNT1 -792060 sc-eQTL 7.07e-01 0.071 0.188 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000086015 MAST2 -358742 sc-eQTL 1.82e-01 0.281 0.21 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000117448 AKR1A1 -122298 sc-eQTL 6.64e-01 0.0924 0.213 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000117450 PRDX1 -94802 sc-eQTL 6.05e-02 -0.34 0.18 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000117461 PIK3R3 -704791 sc-eQTL 2.65e-01 0.224 0.201 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000117481 NSUN4 -911932 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0619 0.21 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000126088 UROD 417295 sc-eQTL 7.95e-01 0.0554 0.213 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000126106 TMEM53 753764 sc-eQTL 4.39e-01 0.157 0.202 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000126107 HECTD3 416921 sc-eQTL 2.04e-01 0.286 0.225 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000132128 LRRC41 -875363 sc-eQTL 3.16e-01 0.21 0.209 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000132773 TOE1 88193 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00373 0.209 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000132780 NASP -155601 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0271 0.21 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000132781 MUTYH 87352 sc-eQTL 2.17e-01 -0.269 0.217 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000142937 RPS8 652994 sc-eQTL 5.64e-02 -0.176 0.0915 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000159592 GPBP1L1 -259868 sc-eQTL 9.47e-01 0.0125 0.19 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000159596 TMEM69 -259936 sc-eQTL 4.70e-01 -0.149 0.206 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000162415 ZSWIM5 122036 sc-eQTL 5.31e-01 0.118 0.188 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000173660 UQCRH -875453 sc-eQTL 4.36e-01 -0.146 0.187 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000173846 PLK3 627868 sc-eQTL 8.55e-01 0.035 0.191 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000197429 IPP -322408 sc-eQTL 5.50e-01 -0.124 0.207 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000070759 TESK2 -62918 sc-eQTL 7.84e-03 0.514 0.191 0.056 cDC L2
ENSG00000070785 EIF2B3 441523 sc-eQTL 1.48e-01 0.271 0.187 0.056 cDC L2
ENSG00000085998 POMGNT1 -792060 sc-eQTL 1.99e-01 0.253 0.196 0.056 cDC L2
ENSG00000086015 MAST2 -358742 sc-eQTL 7.38e-01 0.0587 0.175 0.056 cDC L2
ENSG00000117425 PTCH2 584992 sc-eQTL 3.67e-01 0.152 0.168 0.056 cDC L2
ENSG00000117448 AKR1A1 -122298 sc-eQTL 2.67e-01 -0.208 0.186 0.056 cDC L2
ENSG00000117450 PRDX1 -94802 sc-eQTL 8.57e-02 0.238 0.138 0.056 cDC L2
ENSG00000117480 FAAH -966072 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0332 0.194 0.056 cDC L2
ENSG00000117481 NSUN4 -911932 sc-eQTL 1.56e-01 -0.286 0.2 0.056 cDC L2
ENSG00000126088 UROD 417295 sc-eQTL 8.95e-01 0.0253 0.191 0.056 cDC L2
ENSG00000126106 TMEM53 753764 sc-eQTL 7.04e-01 0.0699 0.184 0.056 cDC L2
ENSG00000126107 HECTD3 416921 sc-eQTL 1.30e-01 -0.327 0.215 0.056 cDC L2
ENSG00000132128 LRRC41 -875363 sc-eQTL 5.09e-01 -0.13 0.197 0.056 cDC L2
ENSG00000132773 TOE1 88193 sc-eQTL 7.98e-01 0.0545 0.213 0.056 cDC L2
ENSG00000132780 NASP -155601 sc-eQTL 9.85e-02 0.318 0.192 0.056 cDC L2
ENSG00000132781 MUTYH 87352 sc-eQTL 8.01e-01 0.0501 0.198 0.056 cDC L2
ENSG00000142937 RPS8 652994 sc-eQTL 3.18e-01 0.0914 0.0913 0.056 cDC L2
ENSG00000159592 GPBP1L1 -259868 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0441 0.199 0.056 cDC L2
ENSG00000159596 TMEM69 -259936 sc-eQTL 1.11e-01 -0.319 0.199 0.056 cDC L2
ENSG00000173660 UQCRH -875453 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0613 0.124 0.056 cDC L2
ENSG00000173846 PLK3 627868 sc-eQTL 2.50e-01 0.154 0.133 0.056 cDC L2
ENSG00000197429 IPP -322408 sc-eQTL 4.48e-02 -0.334 0.165 0.056 cDC L2
ENSG00000198520 ARMH1 753553 sc-eQTL 9.26e-01 0.0194 0.208 0.056 cDC L2
ENSG00000222009 BTBD19 619763 sc-eQTL 6.94e-01 0.0732 0.186 0.056 cDC L2
ENSG00000070759 TESK2 -62918 sc-eQTL 2.72e-01 -0.219 0.199 0.051 intMono L2
ENSG00000070785 EIF2B3 441523 sc-eQTL 7.43e-01 0.0695 0.211 0.051 intMono L2
ENSG00000085998 POMGNT1 -792060 sc-eQTL 3.26e-01 0.191 0.194 0.051 intMono L2
ENSG00000086015 MAST2 -358742 sc-eQTL 5.33e-02 -0.358 0.184 0.051 intMono L2
ENSG00000117425 PTCH2 584992 sc-eQTL 4.15e-01 -0.14 0.172 0.051 intMono L2
ENSG00000117448 AKR1A1 -122298 sc-eQTL 9.20e-01 0.0195 0.194 0.051 intMono L2
ENSG00000117450 PRDX1 -94802 sc-eQTL 4.91e-01 0.0806 0.117 0.051 intMono L2
ENSG00000117480 FAAH -966072 sc-eQTL 1.93e-01 0.255 0.195 0.051 intMono L2
ENSG00000117481 NSUN4 -911932 sc-eQTL 4.21e-02 0.411 0.201 0.051 intMono L2
ENSG00000126088 UROD 417295 sc-eQTL 5.95e-01 -0.11 0.206 0.051 intMono L2
ENSG00000126106 TMEM53 753764 sc-eQTL 1.91e-01 -0.254 0.194 0.051 intMono L2
ENSG00000126107 HECTD3 416921 sc-eQTL 5.09e-01 0.134 0.203 0.051 intMono L2
ENSG00000132128 LRRC41 -875363 sc-eQTL 3.31e-01 0.208 0.213 0.051 intMono L2
ENSG00000132773 TOE1 88193 sc-eQTL 8.92e-01 -0.028 0.206 0.051 intMono L2
ENSG00000132780 NASP -155601 sc-eQTL 2.74e-01 -0.21 0.192 0.051 intMono L2
ENSG00000132781 MUTYH 87352 sc-eQTL 5.27e-01 0.117 0.185 0.051 intMono L2
ENSG00000142937 RPS8 652994 sc-eQTL 2.43e-01 0.101 0.0866 0.051 intMono L2
ENSG00000159592 GPBP1L1 -259868 sc-eQTL 7.63e-02 -0.371 0.208 0.051 intMono L2
ENSG00000159596 TMEM69 -259936 sc-eQTL 1.35e-01 -0.294 0.196 0.051 intMono L2
ENSG00000173660 UQCRH -875453 sc-eQTL 3.04e-01 0.15 0.146 0.051 intMono L2
ENSG00000173846 PLK3 627868 sc-eQTL 2.18e-02 -0.329 0.142 0.051 intMono L2
ENSG00000198520 ARMH1 753553 sc-eQTL 8.38e-01 0.0432 0.211 0.051 intMono L2
ENSG00000222009 BTBD19 619763 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0788 0.193 0.051 intMono L2
ENSG00000070759 TESK2 -62918 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0327 0.188 0.052 ncMono L2
ENSG00000070785 EIF2B3 441523 sc-eQTL 8.30e-01 0.0389 0.181 0.052 ncMono L2
ENSG00000085998 POMGNT1 -792060 sc-eQTL 4.26e-01 -0.149 0.187 0.052 ncMono L2
ENSG00000086015 MAST2 -358742 sc-eQTL 5.26e-01 -0.114 0.18 0.052 ncMono L2
ENSG00000117425 PTCH2 584992 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00977 0.184 0.052 ncMono L2
ENSG00000117448 AKR1A1 -122298 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0278 0.184 0.052 ncMono L2
ENSG00000117450 PRDX1 -94802 sc-eQTL 2.86e-01 0.168 0.157 0.052 ncMono L2
ENSG00000117480 FAAH -966072 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0697 0.202 0.052 ncMono L2
ENSG00000117481 NSUN4 -911932 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0662 0.206 0.052 ncMono L2
ENSG00000126088 UROD 417295 sc-eQTL 8.36e-01 -0.041 0.197 0.052 ncMono L2
ENSG00000126106 TMEM53 753764 sc-eQTL 3.19e-01 -0.203 0.203 0.052 ncMono L2
ENSG00000126107 HECTD3 416921 sc-eQTL 7.40e-01 0.0678 0.204 0.052 ncMono L2
ENSG00000132128 LRRC41 -875363 sc-eQTL 7.69e-01 0.0626 0.213 0.052 ncMono L2
ENSG00000132773 TOE1 88193 sc-eQTL 1.33e-01 -0.27 0.179 0.052 ncMono L2
ENSG00000132780 NASP -155601 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00475 0.173 0.052 ncMono L2
ENSG00000132781 MUTYH 87352 sc-eQTL 8.78e-01 0.0282 0.184 0.052 ncMono L2
ENSG00000142937 RPS8 652994 sc-eQTL 1.88e-01 0.105 0.0792 0.052 ncMono L2
ENSG00000159592 GPBP1L1 -259868 sc-eQTL 5.67e-01 -0.104 0.181 0.052 ncMono L2
ENSG00000159596 TMEM69 -259936 sc-eQTL 4.01e-02 -0.396 0.191 0.052 ncMono L2
ENSG00000173660 UQCRH -875453 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00194 0.128 0.052 ncMono L2
ENSG00000173846 PLK3 627868 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00657 0.126 0.052 ncMono L2
ENSG00000198520 ARMH1 753553 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0273 0.149 0.052 ncMono L2
ENSG00000222009 BTBD19 619763 sc-eQTL 3.74e-03 -0.527 0.18 0.052 ncMono L2
ENSG00000070759 TESK2 -62918 sc-eQTL 1.37e-01 0.33 0.221 0.051 pDC L2
ENSG00000070785 EIF2B3 441523 sc-eQTL 4.62e-01 0.168 0.229 0.051 pDC L2
ENSG00000085998 POMGNT1 -792060 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0502 0.183 0.051 pDC L2
ENSG00000086015 MAST2 -358742 sc-eQTL 1.26e-01 -0.276 0.18 0.051 pDC L2
ENSG00000117425 PTCH2 584992 sc-eQTL 3.58e-01 -0.164 0.178 0.051 pDC L2
ENSG00000117448 AKR1A1 -122298 sc-eQTL 1.24e-01 -0.298 0.193 0.051 pDC L2
ENSG00000117450 PRDX1 -94802 sc-eQTL 1.92e-01 0.227 0.173 0.051 pDC L2
ENSG00000117480 FAAH -966072 sc-eQTL 3.32e-01 -0.172 0.176 0.051 pDC L2
ENSG00000117481 NSUN4 -911932 sc-eQTL 8.39e-01 0.0435 0.213 0.051 pDC L2
ENSG00000126088 UROD 417295 sc-eQTL 3.28e-01 -0.211 0.215 0.051 pDC L2
ENSG00000126106 TMEM53 753764 sc-eQTL 1.67e-01 0.261 0.188 0.051 pDC L2
ENSG00000126107 HECTD3 416921 sc-eQTL 2.63e-01 -0.252 0.224 0.051 pDC L2
ENSG00000132128 LRRC41 -875363 sc-eQTL 5.87e-01 -0.123 0.226 0.051 pDC L2
ENSG00000132773 TOE1 88193 sc-eQTL 8.17e-01 0.0528 0.228 0.051 pDC L2
ENSG00000132780 NASP -155601 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0263 0.183 0.051 pDC L2
ENSG00000132781 MUTYH 87352 sc-eQTL 6.37e-01 0.0938 0.199 0.051 pDC L2
ENSG00000142937 RPS8 652994 sc-eQTL 3.18e-01 0.128 0.128 0.051 pDC L2
ENSG00000159592 GPBP1L1 -259868 sc-eQTL 1.08e-01 0.35 0.217 0.051 pDC L2
ENSG00000159596 TMEM69 -259936 sc-eQTL 1.25e-02 -0.51 0.202 0.051 pDC L2
ENSG00000173660 UQCRH -875453 sc-eQTL 7.67e-02 -0.308 0.173 0.051 pDC L2
ENSG00000173846 PLK3 627868 sc-eQTL 8.31e-01 0.037 0.173 0.051 pDC L2
ENSG00000197429 IPP -322408 sc-eQTL 2.76e-01 -0.225 0.205 0.051 pDC L2
ENSG00000198520 ARMH1 753553 sc-eQTL 3.00e-01 0.208 0.2 0.051 pDC L2
ENSG00000222009 BTBD19 619763 sc-eQTL 5.70e-01 -0.125 0.22 0.051 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000070759 TESK2 -62918 eQTL 0.00185 0.107 0.0343 0.0 0.0 0.0496
ENSG00000086015 MAST2 -358742 eQTL 3.15e-12 0.313 0.0443 0.0 0.0 0.0496
ENSG00000117448 AKR1A1 -122298 eQTL 0.00477 -0.0733 0.0259 0.0 0.0 0.0496
ENSG00000117480 FAAH -966072 eQTL 0.0107 0.125 0.0488 0.0 0.0 0.0496
ENSG00000117481 NSUN4 -911932 eQTL 1.55e-05 0.242 0.0556 0.0 0.0 0.0496
ENSG00000126088 UROD 417295 pQTL 0.0296 0.0733 0.0337 0.0 0.0 0.0484
ENSG00000132773 TOE1 88193 eQTL 0.000835 -0.102 0.0304 0.00442 0.00354 0.0496
ENSG00000132780 NASP -155601 eQTL 3.64e-08 -0.203 0.0366 0.0 0.0 0.0496
ENSG00000132781 MUTYH 87775 eQTL 0.0232 0.0689 0.0303 0.0 0.0 0.0496
ENSG00000159588 CCDC17 -195812 eQTL 1.49e-21 -0.305 0.0312 0.0 0.0 0.0496
ENSG00000159592 GPBP1L1 -259868 eQTL 0.0174 0.0587 0.0246 0.0 0.0 0.0496
ENSG00000162415 ZSWIM5 122036 eQTL 0.0345 -0.102 0.0483 0.0 0.0 0.0496
ENSG00000197429 IPP -322405 eQTL 0.00229 -0.143 0.0466 0.0 0.0 0.0496
ENSG00000222009 BTBD19 619763 eQTL 0.0331 -0.0723 0.0339 0.0 0.0 0.0496
ENSG00000281912 LINC01144 124335 eQTL 0.00154 0.245 0.0773 0.001 0.0 0.0496


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000070759 TESK2 -62918 1.6e-05 2.05e-05 3.07e-06 1.26e-05 3.23e-06 9.27e-06 3.29e-05 3.36e-06 1.74e-05 9.85e-06 2.88e-05 9.22e-06 3.24e-05 6.95e-06 5.23e-06 1.09e-05 1.29e-05 1.39e-05 4.11e-06 3.24e-06 9.45e-06 1.87e-05 1.85e-05 4.82e-06 3.46e-05 6.14e-06 8.23e-06 9.24e-06 2.21e-05 1.63e-05 1.18e-05 1.05e-06 1.21e-06 6.16e-06 8.46e-06 4.06e-06 1.7e-06 2.41e-06 2.84e-06 2.82e-06 1.21e-06 2.49e-05 2.65e-06 3.99e-07 1.91e-06 3.29e-06 3.74e-06 1.35e-06 4.72e-07
ENSG00000086015 MAST2 -358742 1.26e-06 9.09e-07 3.08e-07 1.28e-06 4.25e-07 6.28e-07 1.27e-06 3.02e-07 1.68e-06 5.63e-07 1.93e-06 5.82e-07 2.63e-06 2.12e-07 3.31e-07 9.92e-07 8.95e-07 6.5e-07 4.95e-07 1.87e-07 4.39e-07 1.63e-06 9.28e-07 2.6e-07 2.49e-06 8.11e-07 9.78e-07 6e-07 1.6e-06 1.66e-06 7.58e-07 7.71e-08 4.35e-08 6.78e-07 5.42e-07 4.42e-07 8.52e-08 1.36e-07 8.35e-08 8.88e-08 4.72e-08 1.52e-06 5.66e-08 3.55e-07 4.91e-08 2.31e-07 1.68e-07 1.18e-08 5.04e-08
ENSG00000117425 \N 584992 4.21e-07 1.56e-07 5.72e-08 3.62e-07 1.07e-07 2.09e-07 6.02e-07 5.75e-08 4.43e-07 1.37e-07 8.58e-07 1.52e-07 9.97e-07 8e-08 6.18e-08 1.76e-07 5.57e-08 2.75e-07 7.36e-08 4.16e-08 1.34e-07 2.3e-07 2.11e-07 3.03e-08 4.67e-07 2.33e-07 2.58e-07 1.12e-07 2.76e-07 7.79e-07 2.19e-07 3.98e-08 3.56e-08 1.15e-07 2.15e-07 4.77e-08 5.03e-08 7.49e-08 6.71e-08 5.13e-08 4e-08 2.8e-07 3.19e-08 1.61e-07 8.16e-08 9.49e-09 1.21e-07 3.95e-09 4.61e-08
ENSG00000117448 AKR1A1 -122298 6.92e-06 9.64e-06 1.67e-06 8.12e-06 2.4e-06 4.19e-06 1.19e-05 2.14e-06 9.4e-06 5.41e-06 1.68e-05 5.63e-06 1.46e-05 3.22e-06 1.7e-06 6.62e-06 6.45e-06 6.51e-06 2.55e-06 1.55e-06 4.63e-06 8.85e-06 7.06e-06 2.56e-06 1.7e-05 5.1e-06 6.39e-06 5.2e-06 1.08e-05 8.12e-06 4.69e-06 4.19e-07 8.03e-07 3.39e-06 4.9e-06 2.19e-06 1.12e-06 1.35e-06 1.37e-06 9.98e-07 4.32e-07 1.24e-05 9.28e-07 5.98e-07 8.02e-07 1.75e-06 2.32e-06 6.45e-07 1.89e-07
ENSG00000117481 NSUN4 -911932 2.67e-07 1.11e-07 3.69e-08 2.05e-07 9.25e-08 8.45e-08 2.4e-07 5.35e-08 1.71e-07 4.94e-08 1.76e-07 8.55e-08 2.74e-07 6.38e-08 5.44e-08 7.5e-08 3.88e-08 1.26e-07 5.21e-08 3.59e-08 1.08e-07 1.24e-07 1.44e-07 4.82e-08 1.55e-07 1.25e-07 1.12e-07 9.15e-08 1.23e-07 1.46e-07 1.08e-07 3.72e-08 2.74e-08 8.25e-08 4.92e-08 3.93e-08 5.26e-08 9.62e-08 8.3e-08 3.01e-08 3.46e-08 1.46e-07 4.19e-08 1.91e-07 1.12e-07 1.84e-08 1.34e-07 4.6e-09 4.72e-08
ENSG00000132773 TOE1 88193 1.09e-05 1.38e-05 2.51e-06 1.07e-05 2.47e-06 6.21e-06 2.11e-05 2.51e-06 1.31e-05 7.65e-06 2.19e-05 7.03e-06 2.33e-05 3.92e-06 3.8e-06 9.02e-06 8.8e-06 9.83e-06 3.32e-06 2.88e-06 6.76e-06 1.27e-05 1.2e-05 3.4e-06 2.61e-05 5.36e-06 7.58e-06 7.73e-06 1.56e-05 1.18e-05 7.67e-06 9.81e-07 1.24e-06 4.35e-06 6.48e-06 2.85e-06 1.87e-06 1.93e-06 2.17e-06 2.11e-06 1.03e-06 1.74e-05 1.64e-06 5.03e-07 1.04e-06 2.61e-06 3.4e-06 6.45e-07 4.38e-07
ENSG00000132780 NASP -155601 5.08e-06 6.19e-06 1.36e-06 5.99e-06 2.25e-06 3.28e-06 9.6e-06 1.46e-06 5.86e-06 4.81e-06 1.25e-05 3.74e-06 1.14e-05 1.97e-06 1.17e-06 5.75e-06 4.04e-06 3.81e-06 1.87e-06 9.86e-07 2.51e-06 7.4e-06 5.02e-06 1.71e-06 1.25e-05 4.39e-06 4.65e-06 3.42e-06 7.34e-06 7.75e-06 3.35e-06 4.73e-07 6.1e-07 2.75e-06 3.58e-06 1.68e-06 9.63e-07 4.51e-07 9.07e-07 9.76e-07 1.96e-07 8.05e-06 5.97e-07 6.9e-07 5.92e-07 1.63e-06 1.74e-06 7.35e-07 2.57e-07
ENSG00000132781 MUTYH 87775 1.09e-05 1.38e-05 2.5e-06 1.07e-05 2.45e-06 6.2e-06 2.14e-05 2.46e-06 1.31e-05 7.65e-06 2.22e-05 7.07e-06 2.36e-05 3.96e-06 3.87e-06 9.01e-06 8.88e-06 9.99e-06 3.32e-06 2.85e-06 6.73e-06 1.26e-05 1.21e-05 3.39e-06 2.63e-05 5.39e-06 7.7e-06 7.76e-06 1.57e-05 1.18e-05 7.69e-06 9.9e-07 1.25e-06 4.39e-06 6.48e-06 2.81e-06 1.84e-06 1.93e-06 2.17e-06 2.17e-06 1.03e-06 1.74e-05 1.61e-06 5.02e-07 1.07e-06 2.61e-06 3.39e-06 6.06e-07 4.53e-07
ENSG00000159588 CCDC17 -195812 4.24e-06 4.6e-06 6.36e-07 3.85e-06 1.51e-06 1.54e-06 8.05e-06 9.61e-07 5.09e-06 3.17e-06 8.96e-06 3.6e-06 8.72e-06 1.24e-06 1e-06 3.99e-06 2.94e-06 3.69e-06 1.45e-06 1.42e-06 2.69e-06 4.78e-06 3.82e-06 1.82e-06 9.13e-06 2.97e-06 3.09e-06 1.8e-06 5e-06 6.32e-06 2.79e-06 2.35e-07 5.97e-07 1.69e-06 1.97e-06 1.18e-06 8.38e-07 4.74e-07 1.31e-06 5.82e-07 3.4e-07 5.65e-06 3.82e-07 6.24e-07 3.06e-07 9.91e-07 1e-06 2.26e-07 9.59e-08
ENSG00000159592 GPBP1L1 -259868 1.88e-06 2.1e-06 5.11e-07 2.14e-06 1e-06 8.22e-07 2.84e-06 5.79e-07 2.36e-06 1.46e-06 4.65e-06 1.42e-06 6.07e-06 4.82e-07 4.26e-07 2.07e-06 1.59e-06 2.25e-06 6.96e-07 5.13e-07 9.18e-07 3.09e-06 2.16e-06 6.41e-07 4.55e-06 1.62e-06 1.84e-06 1.79e-06 3.55e-06 3.86e-06 1.9e-06 1.85e-07 3e-07 1.22e-06 1.82e-06 1.01e-06 6.91e-07 3.15e-07 4.58e-07 3.96e-07 1.98e-07 3.35e-06 4.6e-07 5.28e-07 1.86e-07 3.22e-07 7.75e-07 1.44e-07 5.15e-08
ENSG00000281912 LINC01144 124335 6.87e-06 9.52e-06 1.61e-06 7.82e-06 2.38e-06 4.25e-06 1.18e-05 2.12e-06 9.26e-06 5.48e-06 1.64e-05 5.47e-06 1.44e-05 3.18e-06 1.67e-06 6.43e-06 6.1e-06 6.49e-06 2.53e-06 1.51e-06 4.52e-06 8.59e-06 6.89e-06 2.42e-06 1.65e-05 5.17e-06 6.2e-06 5e-06 1.02e-05 8e-06 4.53e-06 4.37e-07 7.9e-07 3.37e-06 4.88e-06 2.22e-06 1.1e-06 1.25e-06 1.42e-06 9.42e-07 4.63e-07 1.23e-05 9.01e-07 6.17e-07 7.38e-07 1.76e-06 2.15e-06 6.19e-07 2e-07