logo

Genes within 1Mb (chr1:44500729:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066135 KDM4A 850580 sc-eQTL 2.19e-01 0.272 0.221 0.054 B_Activated L2
ENSG00000070759 TESK2 -990434 sc-eQTL 6.00e-01 0.114 0.218 0.054 B_Activated L2
ENSG00000070785 EIF2B3 -485993 sc-eQTL 3.98e-01 -0.179 0.212 0.054 B_Activated L2
ENSG00000117408 IPO13 553779 sc-eQTL 4.57e-01 -0.147 0.197 0.054 B_Activated L2
ENSG00000117410 ATP6V0B 526242 sc-eQTL 9.19e-02 0.328 0.193 0.054 B_Activated L2
ENSG00000117411 B4GALT2 521786 sc-eQTL 2.32e-01 -0.217 0.181 0.054 B_Activated L2
ENSG00000117419 ERI3 145469 sc-eQTL 9.43e-01 0.0163 0.23 0.054 B_Activated L2
ENSG00000117425 PTCH2 -342524 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0194 0.129 0.054 B_Activated L2
ENSG00000126088 UROD -510221 sc-eQTL 8.44e-01 0.0438 0.222 0.054 B_Activated L2
ENSG00000126091 ST3GAL3 794905 sc-eQTL 7.77e-01 0.0588 0.207 0.054 B_Activated L2
ENSG00000126106 TMEM53 -173752 sc-eQTL 4.47e-01 -0.143 0.187 0.054 B_Activated L2
ENSG00000126107 HECTD3 -510595 sc-eQTL 5.33e-02 -0.415 0.214 0.054 B_Activated L2
ENSG00000132768 DPH2 530729 sc-eQTL 8.14e-02 -0.378 0.215 0.054 B_Activated L2
ENSG00000132773 TOE1 -839323 sc-eQTL 5.04e-01 -0.142 0.211 0.054 B_Activated L2
ENSG00000132781 MUTYH -840164 sc-eQTL 7.82e-01 0.0612 0.221 0.054 B_Activated L2
ENSG00000142937 RPS8 -274522 sc-eQTL 5.76e-01 -0.062 0.111 0.054 B_Activated L2
ENSG00000159214 CCDC24 509370 sc-eQTL 8.09e-01 -0.045 0.186 0.054 B_Activated L2
ENSG00000173846 PLK3 -299648 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0419 0.201 0.054 B_Activated L2
ENSG00000178028 DMAP1 287274 sc-eQTL 4.15e-01 -0.185 0.227 0.054 B_Activated L2
ENSG00000187147 RNF220 95535 sc-eQTL 9.43e-01 0.0148 0.206 0.054 B_Activated L2
ENSG00000198520 ARMH1 -173963 sc-eQTL 5.01e-01 -0.136 0.202 0.054 B_Activated L2
ENSG00000280670 CCDC163 -999350 sc-eQTL 2.42e-01 -0.173 0.147 0.054 B_Activated L2
ENSG00000066135 KDM4A 850580 sc-eQTL 8.53e-01 -0.039 0.21 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000070759 TESK2 -990434 sc-eQTL 2.62e-01 0.229 0.204 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000070785 EIF2B3 -485993 sc-eQTL 2.50e-01 0.233 0.201 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000117408 IPO13 553779 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0847 0.199 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000117410 ATP6V0B 526242 sc-eQTL 9.81e-01 0.00458 0.193 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000117419 ERI3 145469 sc-eQTL 6.22e-01 -0.112 0.227 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000126088 UROD -510221 sc-eQTL 5.95e-02 -0.376 0.199 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000126091 ST3GAL3 794905 sc-eQTL 5.20e-01 0.129 0.2 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000126107 HECTD3 -510595 sc-eQTL 9.86e-01 0.00367 0.207 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000132768 DPH2 530729 sc-eQTL 9.57e-02 0.34 0.203 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000132773 TOE1 -839323 sc-eQTL 3.30e-01 0.197 0.202 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000132781 MUTYH -840164 sc-eQTL 8.66e-01 0.0353 0.21 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000142937 RPS8 -274522 sc-eQTL 9.24e-01 0.0115 0.12 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000162415 ZSWIM5 -805480 sc-eQTL 7.11e-01 0.0771 0.207 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000173846 PLK3 -299648 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00915 0.141 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000178028 DMAP1 287274 sc-eQTL 9.20e-02 -0.366 0.216 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000187147 RNF220 95535 sc-eQTL 9.87e-01 0.00316 0.199 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000198520 ARMH1 -173963 sc-eQTL 4.95e-01 0.13 0.19 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000066135 KDM4A 850580 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0641 0.225 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000070759 TESK2 -990434 sc-eQTL 3.93e-01 -0.182 0.212 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000070785 EIF2B3 -485993 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0933 0.218 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000117408 IPO13 553779 sc-eQTL 4.21e-01 0.165 0.205 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000117410 ATP6V0B 526242 sc-eQTL 4.46e-02 0.424 0.21 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000117411 B4GALT2 521786 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00165 0.198 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000117419 ERI3 145469 sc-eQTL 4.43e-01 -0.17 0.221 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000126088 UROD -510221 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0346 0.221 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000126091 ST3GAL3 794905 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0855 0.219 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000126106 TMEM53 -173752 sc-eQTL 2.26e-01 0.253 0.209 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000126107 HECTD3 -510595 sc-eQTL 4.07e-01 0.194 0.233 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000132768 DPH2 530729 sc-eQTL 6.64e-01 0.0982 0.225 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000132773 TOE1 -839323 sc-eQTL 6.44e-01 0.0999 0.216 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000132781 MUTYH -840164 sc-eQTL 3.48e-01 -0.212 0.225 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000142937 RPS8 -274522 sc-eQTL 2.31e-01 -0.114 0.0952 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000159214 CCDC24 509370 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0286 0.203 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000162415 ZSWIM5 -805480 sc-eQTL 5.61e-01 -0.114 0.195 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000173846 PLK3 -299648 sc-eQTL 1.57e-01 -0.279 0.197 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000178028 DMAP1 287274 sc-eQTL 3.10e-01 0.226 0.222 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000187147 RNF220 95535 sc-eQTL 9.84e-02 0.315 0.19 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000066135 KDM4A 850580 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0721 0.212 0.05 Pro_T L2
ENSG00000070759 TESK2 -990434 sc-eQTL 3.08e-01 -0.212 0.208 0.05 Pro_T L2
ENSG00000070785 EIF2B3 -485993 sc-eQTL 9.56e-03 0.476 0.182 0.05 Pro_T L2
ENSG00000117408 IPO13 553779 sc-eQTL 3.57e-01 0.194 0.21 0.05 Pro_T L2
ENSG00000117410 ATP6V0B 526242 sc-eQTL 2.23e-01 0.148 0.121 0.05 Pro_T L2
ENSG00000117411 B4GALT2 521786 sc-eQTL 4.33e-01 -0.124 0.159 0.05 Pro_T L2
ENSG00000117419 ERI3 145469 sc-eQTL 1.82e-01 -0.265 0.198 0.05 Pro_T L2
ENSG00000126088 UROD -510221 sc-eQTL 8.47e-02 -0.298 0.172 0.05 Pro_T L2
ENSG00000126091 ST3GAL3 794905 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00515 0.195 0.05 Pro_T L2
ENSG00000126106 TMEM53 -173752 sc-eQTL 3.81e-01 0.172 0.196 0.05 Pro_T L2
ENSG00000126107 HECTD3 -510595 sc-eQTL 2.62e-01 0.224 0.199 0.05 Pro_T L2
ENSG00000132768 DPH2 530729 sc-eQTL 2.29e-01 0.235 0.195 0.05 Pro_T L2
ENSG00000132773 TOE1 -839323 sc-eQTL 4.65e-01 -0.153 0.209 0.05 Pro_T L2
ENSG00000132781 MUTYH -840164 sc-eQTL 1.36e-01 0.315 0.211 0.05 Pro_T L2
ENSG00000142937 RPS8 -274522 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0538 0.0842 0.05 Pro_T L2
ENSG00000142945 KIF2C -239089 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0334 0.132 0.05 Pro_T L2
ENSG00000162415 ZSWIM5 -805480 sc-eQTL 3.98e-01 -0.141 0.166 0.05 Pro_T L2
ENSG00000173846 PLK3 -299648 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0894 0.179 0.05 Pro_T L2
ENSG00000178028 DMAP1 287274 sc-eQTL 5.02e-01 -0.146 0.217 0.05 Pro_T L2
ENSG00000186603 HPDL -826166 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0594 0.122 0.05 Pro_T L2
ENSG00000187147 RNF220 95535 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00948 0.162 0.05 Pro_T L2
ENSG00000198520 ARMH1 -173963 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0279 0.138 0.05 Pro_T L2
ENSG00000280670 CCDC163 -999350 sc-eQTL 2.15e-01 -0.202 0.163 0.05 Pro_T L2
ENSG00000066135 KDM4A 850580 sc-eQTL 3.14e-01 -0.257 0.255 0.055 gdT L2
ENSG00000070759 TESK2 -990434 sc-eQTL 5.03e-01 -0.155 0.231 0.055 gdT L2
ENSG00000070785 EIF2B3 -485993 sc-eQTL 5.59e-01 -0.141 0.241 0.055 gdT L2
ENSG00000117408 IPO13 553779 sc-eQTL 3.17e-01 -0.238 0.237 0.055 gdT L2
ENSG00000117410 ATP6V0B 526242 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0684 0.216 0.055 gdT L2
ENSG00000117411 B4GALT2 521786 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0746 0.223 0.055 gdT L2
ENSG00000117419 ERI3 145469 sc-eQTL 1.41e-01 -0.385 0.26 0.055 gdT L2
ENSG00000126088 UROD -510221 sc-eQTL 3.55e-01 0.204 0.22 0.055 gdT L2
ENSG00000126091 ST3GAL3 794905 sc-eQTL 1.69e-01 0.33 0.239 0.055 gdT L2
ENSG00000126106 TMEM53 -173752 sc-eQTL 9.71e-01 0.00828 0.225 0.055 gdT L2
ENSG00000126107 HECTD3 -510595 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0748 0.256 0.055 gdT L2
ENSG00000132768 DPH2 530729 sc-eQTL 8.45e-02 -0.406 0.234 0.055 gdT L2
ENSG00000132773 TOE1 -839323 sc-eQTL 4.40e-01 -0.175 0.225 0.055 gdT L2
ENSG00000132781 MUTYH -840164 sc-eQTL 8.01e-01 0.0607 0.24 0.055 gdT L2
ENSG00000142937 RPS8 -274522 sc-eQTL 2.36e-01 -0.112 0.0942 0.055 gdT L2
ENSG00000142945 KIF2C -239089 sc-eQTL 9.87e-01 0.00235 0.14 0.055 gdT L2
ENSG00000162415 ZSWIM5 -805480 sc-eQTL 2.98e-01 -0.229 0.22 0.055 gdT L2
ENSG00000173846 PLK3 -299648 sc-eQTL 1.21e-01 -0.248 0.159 0.055 gdT L2
ENSG00000178028 DMAP1 287274 sc-eQTL 5.06e-01 0.16 0.239 0.055 gdT L2
ENSG00000186603 HPDL -826166 sc-eQTL 9.62e-01 0.00917 0.193 0.055 gdT L2
ENSG00000187147 RNF220 95535 sc-eQTL 8.22e-01 0.0449 0.199 0.055 gdT L2
ENSG00000198520 ARMH1 -173963 sc-eQTL 2.74e-01 0.237 0.216 0.055 gdT L2
ENSG00000280670 CCDC163 -999350 sc-eQTL 1.62e-01 -0.311 0.221 0.055 gdT L2
ENSG00000066135 KDM4A 850580 sc-eQTL 7.84e-01 0.0599 0.218 0.051 pDC L2
ENSG00000070759 TESK2 -990434 sc-eQTL 8.08e-01 -0.054 0.222 0.051 pDC L2
ENSG00000070785 EIF2B3 -485993 sc-eQTL 2.42e-01 0.268 0.228 0.051 pDC L2
ENSG00000117408 IPO13 553779 sc-eQTL 9.69e-01 0.00865 0.226 0.051 pDC L2
ENSG00000117410 ATP6V0B 526242 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0602 0.156 0.051 pDC L2
ENSG00000117419 ERI3 145469 sc-eQTL 8.18e-01 0.0503 0.218 0.051 pDC L2
ENSG00000117425 PTCH2 -342524 sc-eQTL 9.91e-01 0.00207 0.179 0.051 pDC L2
ENSG00000126088 UROD -510221 sc-eQTL 5.93e-01 0.115 0.215 0.051 pDC L2
ENSG00000126091 ST3GAL3 794905 sc-eQTL 9.06e-01 0.0251 0.212 0.051 pDC L2
ENSG00000126106 TMEM53 -173752 sc-eQTL 3.49e-01 0.177 0.188 0.051 pDC L2
ENSG00000126107 HECTD3 -510595 sc-eQTL 5.35e-01 -0.14 0.225 0.051 pDC L2
ENSG00000132768 DPH2 530729 sc-eQTL 5.58e-01 -0.126 0.215 0.051 pDC L2
ENSG00000132773 TOE1 -839323 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0771 0.228 0.051 pDC L2
ENSG00000132781 MUTYH -840164 sc-eQTL 6.54e-01 -0.089 0.198 0.051 pDC L2
ENSG00000142937 RPS8 -274522 sc-eQTL 9.18e-01 0.0132 0.128 0.051 pDC L2
ENSG00000159214 CCDC24 509370 sc-eQTL 4.47e-02 -0.384 0.19 0.051 pDC L2
ENSG00000173846 PLK3 -299648 sc-eQTL 5.77e-01 0.0968 0.173 0.051 pDC L2
ENSG00000178028 DMAP1 287274 sc-eQTL 7.41e-01 0.0727 0.22 0.051 pDC L2
ENSG00000187147 RNF220 95535 sc-eQTL 4.29e-01 0.164 0.207 0.051 pDC L2
ENSG00000198520 ARMH1 -173963 sc-eQTL 1.78e-01 -0.27 0.199 0.051 pDC L2
ENSG00000222009 BTBD19 -307753 sc-eQTL 8.72e-02 -0.375 0.218 0.051 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000280670 CCDC163 -999350 eQTL 0.0701 -0.162 0.0893 0.00321 0.0 0.0451

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina