logo

Genes within 1Mb (chr1:44489998:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066135 KDM4A 839849 sc-eQTL 5.77e-01 0.123 0.22 0.054 B_Activated L2
ENSG00000070785 EIF2B3 -496724 sc-eQTL 3.32e-01 -0.204 0.21 0.054 B_Activated L2
ENSG00000117408 IPO13 543048 sc-eQTL 6.16e-01 0.0984 0.196 0.054 B_Activated L2
ENSG00000117410 ATP6V0B 515511 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000687 0.194 0.054 B_Activated L2
ENSG00000117411 B4GALT2 511055 sc-eQTL 4.51e-01 -0.136 0.18 0.054 B_Activated L2
ENSG00000117419 ERI3 134738 sc-eQTL 6.67e-02 0.418 0.226 0.054 B_Activated L2
ENSG00000117425 PTCH2 -353255 sc-eQTL 3.99e-01 0.108 0.128 0.054 B_Activated L2
ENSG00000126088 UROD -520952 sc-eQTL 9.94e-01 0.00172 0.221 0.054 B_Activated L2
ENSG00000126091 ST3GAL3 784174 sc-eQTL 6.58e-01 0.0914 0.206 0.054 B_Activated L2
ENSG00000126106 TMEM53 -184483 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00732 0.187 0.054 B_Activated L2
ENSG00000126107 HECTD3 -521326 sc-eQTL 1.25e-01 -0.328 0.213 0.054 B_Activated L2
ENSG00000132768 DPH2 519998 sc-eQTL 2.37e-01 -0.256 0.215 0.054 B_Activated L2
ENSG00000132773 TOE1 -850054 sc-eQTL 2.11e-01 0.263 0.209 0.054 B_Activated L2
ENSG00000132781 MUTYH -850895 sc-eQTL 4.57e-01 0.164 0.219 0.054 B_Activated L2
ENSG00000142937 RPS8 -285253 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0813 0.11 0.054 B_Activated L2
ENSG00000159214 CCDC24 498639 sc-eQTL 7.00e-01 0.0714 0.185 0.054 B_Activated L2
ENSG00000173846 PLK3 -310379 sc-eQTL 7.69e-02 -0.353 0.198 0.054 B_Activated L2
ENSG00000178028 DMAP1 276543 sc-eQTL 9.25e-01 0.0212 0.226 0.054 B_Activated L2
ENSG00000187147 RNF220 84804 sc-eQTL 9.54e-01 -0.0118 0.205 0.054 B_Activated L2
ENSG00000198520 ARMH1 -184694 sc-eQTL 7.63e-01 0.0608 0.201 0.054 B_Activated L2
ENSG00000066135 KDM4A 839849 sc-eQTL 6.17e-01 -0.106 0.211 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000070785 EIF2B3 -496724 sc-eQTL 4.94e-01 0.139 0.203 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000117408 IPO13 543048 sc-eQTL 7.18e-01 0.0727 0.201 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000117410 ATP6V0B 515511 sc-eQTL 3.41e-01 0.185 0.194 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000117419 ERI3 134738 sc-eQTL 6.07e-01 -0.118 0.229 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000126088 UROD -520952 sc-eQTL 1.77e-01 -0.272 0.201 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000126091 ST3GAL3 784174 sc-eQTL 4.69e-01 -0.146 0.202 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000126107 HECTD3 -521326 sc-eQTL 4.64e-01 -0.153 0.208 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000132768 DPH2 519998 sc-eQTL 5.27e-03 0.57 0.202 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000132773 TOE1 -850054 sc-eQTL 6.63e-02 -0.374 0.202 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000132781 MUTYH -850895 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0456 0.211 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000142937 RPS8 -285253 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0635 0.121 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000162415 ZSWIM5 -816211 sc-eQTL 4.23e-01 0.168 0.209 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000173846 PLK3 -310379 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0291 0.142 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000178028 DMAP1 276543 sc-eQTL 1.35e-01 -0.327 0.218 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000187147 RNF220 84804 sc-eQTL 7.64e-01 0.0603 0.201 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000198520 ARMH1 -184694 sc-eQTL 4.47e-01 0.146 0.191 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000066135 KDM4A 839849 sc-eQTL 9.84e-02 -0.367 0.221 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000070785 EIF2B3 -496724 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0754 0.216 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000117408 IPO13 543048 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000206 0.203 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000117410 ATP6V0B 515511 sc-eQTL 5.67e-02 0.398 0.208 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000117411 B4GALT2 511055 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0501 0.195 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000117419 ERI3 134738 sc-eQTL 9.37e-01 0.0174 0.218 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000126088 UROD -520952 sc-eQTL 5.99e-01 -0.115 0.218 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000126091 ST3GAL3 784174 sc-eQTL 5.33e-01 -0.135 0.216 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000126106 TMEM53 -184483 sc-eQTL 5.91e-01 0.111 0.207 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000126107 HECTD3 -521326 sc-eQTL 7.12e-01 0.0853 0.231 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000132768 DPH2 519998 sc-eQTL 9.90e-01 0.00278 0.223 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000132773 TOE1 -850054 sc-eQTL 7.32e-01 0.0731 0.213 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000132781 MUTYH -850895 sc-eQTL 1.91e-01 -0.291 0.222 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000142937 RPS8 -285253 sc-eQTL 1.29e-01 -0.143 0.0939 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000159214 CCDC24 498639 sc-eQTL 8.02e-01 0.0503 0.2 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000162415 ZSWIM5 -816211 sc-eQTL 3.86e-01 -0.167 0.192 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000173846 PLK3 -310379 sc-eQTL 3.14e-01 -0.197 0.195 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000178028 DMAP1 276543 sc-eQTL 9.26e-01 0.0203 0.22 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000187147 RNF220 84804 sc-eQTL 1.05e-02 0.479 0.186 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000066135 KDM4A 839849 sc-eQTL 3.32e-01 0.234 0.24 0.056 PB L2
ENSG00000070785 EIF2B3 -496724 sc-eQTL 8.31e-01 0.0443 0.207 0.056 PB L2
ENSG00000117408 IPO13 543048 sc-eQTL 1.85e-01 0.348 0.261 0.056 PB L2
ENSG00000117410 ATP6V0B 515511 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0433 0.117 0.056 PB L2
ENSG00000117411 B4GALT2 511055 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0315 0.18 0.056 PB L2
ENSG00000117419 ERI3 134738 sc-eQTL 8.11e-01 0.0604 0.252 0.056 PB L2
ENSG00000117425 PTCH2 -353255 sc-eQTL 6.54e-02 0.436 0.234 0.056 PB L2
ENSG00000126088 UROD -520952 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0817 0.181 0.056 PB L2
ENSG00000126091 ST3GAL3 784174 sc-eQTL 3.67e-01 -0.225 0.248 0.056 PB L2
ENSG00000126106 TMEM53 -184483 sc-eQTL 9.98e-01 0.000738 0.242 0.056 PB L2
ENSG00000126107 HECTD3 -521326 sc-eQTL 9.53e-01 -0.012 0.2 0.056 PB L2
ENSG00000132768 DPH2 519998 sc-eQTL 8.30e-02 0.451 0.258 0.056 PB L2
ENSG00000132773 TOE1 -850054 sc-eQTL 4.61e-04 0.882 0.244 0.056 PB L2
ENSG00000132781 MUTYH -850895 sc-eQTL 6.15e-01 0.142 0.282 0.056 PB L2
ENSG00000142937 RPS8 -285253 sc-eQTL 3.97e-03 -0.383 0.13 0.056 PB L2
ENSG00000159214 CCDC24 498639 sc-eQTL 2.29e-01 -0.308 0.255 0.056 PB L2
ENSG00000173846 PLK3 -310379 sc-eQTL 2.73e-01 0.272 0.247 0.056 PB L2
ENSG00000178028 DMAP1 276543 sc-eQTL 3.27e-01 0.282 0.286 0.056 PB L2
ENSG00000187147 RNF220 84804 sc-eQTL 5.03e-01 0.16 0.239 0.056 PB L2
ENSG00000198520 ARMH1 -184694 sc-eQTL 1.53e-01 0.31 0.216 0.056 PB L2
ENSG00000066135 KDM4A 839849 sc-eQTL 2.65e-01 0.243 0.217 0.054 cDC L2
ENSG00000070785 EIF2B3 -496724 sc-eQTL 4.07e-01 0.172 0.207 0.054 cDC L2
ENSG00000117408 IPO13 543048 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0544 0.212 0.054 cDC L2
ENSG00000117410 ATP6V0B 515511 sc-eQTL 2.29e-02 -0.313 0.136 0.054 cDC L2
ENSG00000117419 ERI3 134738 sc-eQTL 3.28e-01 -0.22 0.224 0.054 cDC L2
ENSG00000117425 PTCH2 -353255 sc-eQTL 5.18e-01 0.12 0.185 0.054 cDC L2
ENSG00000126088 UROD -520952 sc-eQTL 4.01e-01 -0.177 0.21 0.054 cDC L2
ENSG00000126091 ST3GAL3 784174 sc-eQTL 3.67e-01 0.196 0.217 0.054 cDC L2
ENSG00000126106 TMEM53 -184483 sc-eQTL 4.31e-01 -0.159 0.202 0.054 cDC L2
ENSG00000126107 HECTD3 -521326 sc-eQTL 3.01e-01 0.247 0.238 0.054 cDC L2
ENSG00000132768 DPH2 519998 sc-eQTL 4.85e-01 -0.156 0.223 0.054 cDC L2
ENSG00000132773 TOE1 -850054 sc-eQTL 5.31e-01 -0.147 0.234 0.054 cDC L2
ENSG00000132781 MUTYH -850895 sc-eQTL 5.28e-01 0.138 0.218 0.054 cDC L2
ENSG00000142937 RPS8 -285253 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0324 0.101 0.054 cDC L2
ENSG00000159214 CCDC24 498639 sc-eQTL 5.33e-01 0.121 0.193 0.054 cDC L2
ENSG00000173846 PLK3 -310379 sc-eQTL 2.93e-01 -0.155 0.147 0.054 cDC L2
ENSG00000178028 DMAP1 276543 sc-eQTL 3.13e-01 -0.225 0.223 0.054 cDC L2
ENSG00000187147 RNF220 84804 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00363 0.195 0.054 cDC L2
ENSG00000198520 ARMH1 -184694 sc-eQTL 2.08e-01 0.288 0.228 0.054 cDC L2
ENSG00000222009 BTBD19 -318484 sc-eQTL 4.36e-01 0.16 0.204 0.054 cDC L2
ENSG00000066135 KDM4A 839849 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0612 0.222 0.051 intMono L2
ENSG00000070785 EIF2B3 -496724 sc-eQTL 9.09e-01 0.0256 0.223 0.051 intMono L2
ENSG00000117408 IPO13 543048 sc-eQTL 1.35e-01 0.31 0.206 0.051 intMono L2
ENSG00000117410 ATP6V0B 515511 sc-eQTL 4.14e-01 0.11 0.134 0.051 intMono L2
ENSG00000117419 ERI3 134738 sc-eQTL 1.29e-01 0.334 0.219 0.051 intMono L2
ENSG00000117425 PTCH2 -353255 sc-eQTL 4.95e-01 0.124 0.181 0.051 intMono L2
ENSG00000126088 UROD -520952 sc-eQTL 4.70e-01 0.157 0.217 0.051 intMono L2
ENSG00000126091 ST3GAL3 784174 sc-eQTL 9.26e-02 0.352 0.208 0.051 intMono L2
ENSG00000126106 TMEM53 -184483 sc-eQTL 2.14e-01 -0.255 0.205 0.051 intMono L2
ENSG00000126107 HECTD3 -521326 sc-eQTL 6.05e-01 0.111 0.214 0.051 intMono L2
ENSG00000132768 DPH2 519998 sc-eQTL 7.94e-02 -0.373 0.212 0.051 intMono L2
ENSG00000132773 TOE1 -850054 sc-eQTL 5.09e-01 -0.144 0.218 0.051 intMono L2
ENSG00000132781 MUTYH -850895 sc-eQTL 2.84e-01 -0.209 0.194 0.051 intMono L2
ENSG00000142937 RPS8 -285253 sc-eQTL 5.52e-01 0.0546 0.0916 0.051 intMono L2
ENSG00000159214 CCDC24 498639 sc-eQTL 6.09e-01 0.103 0.201 0.051 intMono L2
ENSG00000173846 PLK3 -310379 sc-eQTL 6.41e-01 0.0709 0.152 0.051 intMono L2
ENSG00000178028 DMAP1 276543 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0205 0.218 0.051 intMono L2
ENSG00000187147 RNF220 84804 sc-eQTL 2.56e-01 0.219 0.192 0.051 intMono L2
ENSG00000198520 ARMH1 -184694 sc-eQTL 8.71e-02 0.379 0.221 0.051 intMono L2
ENSG00000222009 BTBD19 -318484 sc-eQTL 9.33e-01 0.0172 0.204 0.051 intMono L2
ENSG00000066135 KDM4A 839849 sc-eQTL 2.84e-01 -0.216 0.201 0.052 ncMono L2
ENSG00000070785 EIF2B3 -496724 sc-eQTL 1.62e-01 0.269 0.192 0.052 ncMono L2
ENSG00000117408 IPO13 543048 sc-eQTL 9.78e-01 0.00573 0.208 0.052 ncMono L2
ENSG00000117410 ATP6V0B 515511 sc-eQTL 2.46e-01 0.176 0.151 0.052 ncMono L2
ENSG00000117419 ERI3 134738 sc-eQTL 1.82e-01 0.29 0.217 0.052 ncMono L2
ENSG00000117425 PTCH2 -353255 sc-eQTL 5.45e-03 0.542 0.193 0.052 ncMono L2
ENSG00000126088 UROD -520952 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0219 0.21 0.052 ncMono L2
ENSG00000126091 ST3GAL3 784174 sc-eQTL 6.01e-01 -0.111 0.211 0.052 ncMono L2
ENSG00000126106 TMEM53 -184483 sc-eQTL 3.90e-02 0.446 0.215 0.052 ncMono L2
ENSG00000126107 HECTD3 -521326 sc-eQTL 4.54e-01 0.163 0.218 0.052 ncMono L2
ENSG00000132768 DPH2 519998 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0638 0.22 0.052 ncMono L2
ENSG00000132773 TOE1 -850054 sc-eQTL 6.57e-01 0.0853 0.192 0.052 ncMono L2
ENSG00000132781 MUTYH -850895 sc-eQTL 8.14e-01 0.046 0.196 0.052 ncMono L2
ENSG00000142937 RPS8 -285253 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0733 0.0847 0.052 ncMono L2
ENSG00000159214 CCDC24 498639 sc-eQTL 2.61e-01 0.221 0.196 0.052 ncMono L2
ENSG00000173846 PLK3 -310379 sc-eQTL 5.93e-01 0.0716 0.134 0.052 ncMono L2
ENSG00000178028 DMAP1 276543 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0298 0.223 0.052 ncMono L2
ENSG00000187147 RNF220 84804 sc-eQTL 6.12e-01 0.0977 0.192 0.052 ncMono L2
ENSG00000198520 ARMH1 -184694 sc-eQTL 2.66e-02 0.35 0.157 0.052 ncMono L2
ENSG00000222009 BTBD19 -318484 sc-eQTL 7.58e-02 0.347 0.194 0.052 ncMono L2
ENSG00000066135 KDM4A 839849 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0626 0.219 0.051 pDC L2
ENSG00000070785 EIF2B3 -496724 sc-eQTL 1.72e-01 0.313 0.228 0.051 pDC L2
ENSG00000117408 IPO13 543048 sc-eQTL 4.75e-01 -0.162 0.226 0.051 pDC L2
ENSG00000117410 ATP6V0B 515511 sc-eQTL 3.18e-01 -0.157 0.156 0.051 pDC L2
ENSG00000117419 ERI3 134738 sc-eQTL 4.11e-01 0.18 0.219 0.051 pDC L2
ENSG00000117425 PTCH2 -353255 sc-eQTL 7.81e-01 0.0499 0.179 0.051 pDC L2
ENSG00000126088 UROD -520952 sc-eQTL 5.50e-01 0.13 0.216 0.051 pDC L2
ENSG00000126091 ST3GAL3 784174 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0552 0.214 0.051 pDC L2
ENSG00000126106 TMEM53 -184483 sc-eQTL 9.92e-01 0.00181 0.19 0.051 pDC L2
ENSG00000126107 HECTD3 -521326 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0357 0.226 0.051 pDC L2
ENSG00000132768 DPH2 519998 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0394 0.216 0.051 pDC L2
ENSG00000132773 TOE1 -850054 sc-eQTL 4.17e-01 -0.186 0.228 0.051 pDC L2
ENSG00000132781 MUTYH -850895 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0162 0.199 0.051 pDC L2
ENSG00000142937 RPS8 -285253 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0347 0.129 0.051 pDC L2
ENSG00000159214 CCDC24 498639 sc-eQTL 1.40e-01 -0.284 0.192 0.051 pDC L2
ENSG00000173846 PLK3 -310379 sc-eQTL 4.89e-01 -0.121 0.174 0.051 pDC L2
ENSG00000178028 DMAP1 276543 sc-eQTL 9.52e-01 0.0134 0.221 0.051 pDC L2
ENSG00000187147 RNF220 84804 sc-eQTL 1.31e-01 0.314 0.207 0.051 pDC L2
ENSG00000198520 ARMH1 -184694 sc-eQTL 1.62e-01 -0.281 0.2 0.051 pDC L2
ENSG00000222009 BTBD19 -318484 sc-eQTL 3.01e-01 -0.228 0.22 0.051 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000070785 EIF2B3 -496724 eQTL 0.0546 0.0717 0.0372 0.00102 0.0 0.0505
ENSG00000126088 UROD -520952 eQTL 0.00483 0.13 0.046 0.0 0.0 0.0505
ENSG00000159214 CCDC24 498639 eQTL 0.0285 -0.172 0.0785 0.0 0.0 0.0505
ENSG00000186603 HPDL -836907 eQTL 8.20e-02 -0.105 0.0604 0.00101 0.0 0.0505

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina