logo

Genes within 1Mb (chr1:44489526:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066135 KDM4A 839377 sc-eQTL 5.77e-01 0.123 0.22 0.054 B_Activated L2
ENSG00000070785 EIF2B3 -497196 sc-eQTL 3.32e-01 -0.204 0.21 0.054 B_Activated L2
ENSG00000117408 IPO13 542576 sc-eQTL 6.16e-01 0.0984 0.196 0.054 B_Activated L2
ENSG00000117410 ATP6V0B 515039 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000687 0.194 0.054 B_Activated L2
ENSG00000117411 B4GALT2 510583 sc-eQTL 4.51e-01 -0.136 0.18 0.054 B_Activated L2
ENSG00000117419 ERI3 134266 sc-eQTL 6.67e-02 0.418 0.226 0.054 B_Activated L2
ENSG00000117425 PTCH2 -353727 sc-eQTL 3.99e-01 0.108 0.128 0.054 B_Activated L2
ENSG00000126088 UROD -521424 sc-eQTL 9.94e-01 0.00172 0.221 0.054 B_Activated L2
ENSG00000126091 ST3GAL3 783702 sc-eQTL 6.58e-01 0.0914 0.206 0.054 B_Activated L2
ENSG00000126106 TMEM53 -184955 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00732 0.187 0.054 B_Activated L2
ENSG00000126107 HECTD3 -521798 sc-eQTL 1.25e-01 -0.328 0.213 0.054 B_Activated L2
ENSG00000132768 DPH2 519526 sc-eQTL 2.37e-01 -0.256 0.215 0.054 B_Activated L2
ENSG00000132773 TOE1 -850526 sc-eQTL 2.11e-01 0.263 0.209 0.054 B_Activated L2
ENSG00000132781 MUTYH -851367 sc-eQTL 4.57e-01 0.164 0.219 0.054 B_Activated L2
ENSG00000142937 RPS8 -285725 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0813 0.11 0.054 B_Activated L2
ENSG00000159214 CCDC24 498167 sc-eQTL 7.00e-01 0.0714 0.185 0.054 B_Activated L2
ENSG00000173846 PLK3 -310851 sc-eQTL 7.69e-02 -0.353 0.198 0.054 B_Activated L2
ENSG00000178028 DMAP1 276071 sc-eQTL 9.25e-01 0.0212 0.226 0.054 B_Activated L2
ENSG00000187147 RNF220 84332 sc-eQTL 9.54e-01 -0.0118 0.205 0.054 B_Activated L2
ENSG00000198520 ARMH1 -185166 sc-eQTL 7.63e-01 0.0608 0.201 0.054 B_Activated L2
ENSG00000066135 KDM4A 839377 sc-eQTL 6.17e-01 -0.106 0.211 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000070785 EIF2B3 -497196 sc-eQTL 4.94e-01 0.139 0.203 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000117408 IPO13 542576 sc-eQTL 7.18e-01 0.0727 0.201 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000117410 ATP6V0B 515039 sc-eQTL 3.41e-01 0.185 0.194 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000117419 ERI3 134266 sc-eQTL 6.07e-01 -0.118 0.229 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000126088 UROD -521424 sc-eQTL 1.77e-01 -0.272 0.201 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000126091 ST3GAL3 783702 sc-eQTL 4.69e-01 -0.146 0.202 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000126107 HECTD3 -521798 sc-eQTL 4.64e-01 -0.153 0.208 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000132768 DPH2 519526 sc-eQTL 5.27e-03 0.57 0.202 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000132773 TOE1 -850526 sc-eQTL 6.63e-02 -0.374 0.202 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000132781 MUTYH -851367 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0456 0.211 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000142937 RPS8 -285725 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0635 0.121 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000162415 ZSWIM5 -816683 sc-eQTL 4.23e-01 0.168 0.209 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000173846 PLK3 -310851 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0291 0.142 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000178028 DMAP1 276071 sc-eQTL 1.35e-01 -0.327 0.218 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000187147 RNF220 84332 sc-eQTL 7.64e-01 0.0603 0.201 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000198520 ARMH1 -185166 sc-eQTL 4.47e-01 0.146 0.191 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000066135 KDM4A 839377 sc-eQTL 9.84e-02 -0.367 0.221 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000070785 EIF2B3 -497196 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0754 0.216 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000117408 IPO13 542576 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000206 0.203 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000117410 ATP6V0B 515039 sc-eQTL 5.67e-02 0.398 0.208 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000117411 B4GALT2 510583 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0501 0.195 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000117419 ERI3 134266 sc-eQTL 9.37e-01 0.0174 0.218 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000126088 UROD -521424 sc-eQTL 5.99e-01 -0.115 0.218 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000126091 ST3GAL3 783702 sc-eQTL 5.33e-01 -0.135 0.216 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000126106 TMEM53 -184955 sc-eQTL 5.91e-01 0.111 0.207 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000126107 HECTD3 -521798 sc-eQTL 7.12e-01 0.0853 0.231 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000132768 DPH2 519526 sc-eQTL 9.90e-01 0.00278 0.223 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000132773 TOE1 -850526 sc-eQTL 7.32e-01 0.0731 0.213 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000132781 MUTYH -851367 sc-eQTL 1.91e-01 -0.291 0.222 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000142937 RPS8 -285725 sc-eQTL 1.29e-01 -0.143 0.0939 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000159214 CCDC24 498167 sc-eQTL 8.02e-01 0.0503 0.2 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000162415 ZSWIM5 -816683 sc-eQTL 3.86e-01 -0.167 0.192 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000173846 PLK3 -310851 sc-eQTL 3.14e-01 -0.197 0.195 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000178028 DMAP1 276071 sc-eQTL 9.26e-01 0.0203 0.22 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000187147 RNF220 84332 sc-eQTL 1.05e-02 0.479 0.186 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000066135 KDM4A 839377 sc-eQTL 3.32e-01 0.234 0.24 0.056 PB L2
ENSG00000070785 EIF2B3 -497196 sc-eQTL 8.31e-01 0.0443 0.207 0.056 PB L2
ENSG00000117408 IPO13 542576 sc-eQTL 1.85e-01 0.348 0.261 0.056 PB L2
ENSG00000117410 ATP6V0B 515039 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0433 0.117 0.056 PB L2
ENSG00000117411 B4GALT2 510583 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0315 0.18 0.056 PB L2
ENSG00000117419 ERI3 134266 sc-eQTL 8.11e-01 0.0604 0.252 0.056 PB L2
ENSG00000117425 PTCH2 -353727 sc-eQTL 6.54e-02 0.436 0.234 0.056 PB L2
ENSG00000126088 UROD -521424 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0817 0.181 0.056 PB L2
ENSG00000126091 ST3GAL3 783702 sc-eQTL 3.67e-01 -0.225 0.248 0.056 PB L2
ENSG00000126106 TMEM53 -184955 sc-eQTL 9.98e-01 0.000738 0.242 0.056 PB L2
ENSG00000126107 HECTD3 -521798 sc-eQTL 9.53e-01 -0.012 0.2 0.056 PB L2
ENSG00000132768 DPH2 519526 sc-eQTL 8.30e-02 0.451 0.258 0.056 PB L2
ENSG00000132773 TOE1 -850526 sc-eQTL 4.61e-04 0.882 0.244 0.056 PB L2
ENSG00000132781 MUTYH -851367 sc-eQTL 6.15e-01 0.142 0.282 0.056 PB L2
ENSG00000142937 RPS8 -285725 sc-eQTL 3.97e-03 -0.383 0.13 0.056 PB L2
ENSG00000159214 CCDC24 498167 sc-eQTL 2.29e-01 -0.308 0.255 0.056 PB L2
ENSG00000173846 PLK3 -310851 sc-eQTL 2.73e-01 0.272 0.247 0.056 PB L2
ENSG00000178028 DMAP1 276071 sc-eQTL 3.27e-01 0.282 0.286 0.056 PB L2
ENSG00000187147 RNF220 84332 sc-eQTL 5.03e-01 0.16 0.239 0.056 PB L2
ENSG00000198520 ARMH1 -185166 sc-eQTL 1.53e-01 0.31 0.216 0.056 PB L2
ENSG00000066135 KDM4A 839377 sc-eQTL 2.65e-01 0.243 0.217 0.054 cDC L2
ENSG00000070785 EIF2B3 -497196 sc-eQTL 4.07e-01 0.172 0.207 0.054 cDC L2
ENSG00000117408 IPO13 542576 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0544 0.212 0.054 cDC L2
ENSG00000117410 ATP6V0B 515039 sc-eQTL 2.29e-02 -0.313 0.136 0.054 cDC L2
ENSG00000117419 ERI3 134266 sc-eQTL 3.28e-01 -0.22 0.224 0.054 cDC L2
ENSG00000117425 PTCH2 -353727 sc-eQTL 5.18e-01 0.12 0.185 0.054 cDC L2
ENSG00000126088 UROD -521424 sc-eQTL 4.01e-01 -0.177 0.21 0.054 cDC L2
ENSG00000126091 ST3GAL3 783702 sc-eQTL 3.67e-01 0.196 0.217 0.054 cDC L2
ENSG00000126106 TMEM53 -184955 sc-eQTL 4.31e-01 -0.159 0.202 0.054 cDC L2
ENSG00000126107 HECTD3 -521798 sc-eQTL 3.01e-01 0.247 0.238 0.054 cDC L2
ENSG00000132768 DPH2 519526 sc-eQTL 4.85e-01 -0.156 0.223 0.054 cDC L2
ENSG00000132773 TOE1 -850526 sc-eQTL 5.31e-01 -0.147 0.234 0.054 cDC L2
ENSG00000132781 MUTYH -851367 sc-eQTL 5.28e-01 0.138 0.218 0.054 cDC L2
ENSG00000142937 RPS8 -285725 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0324 0.101 0.054 cDC L2
ENSG00000159214 CCDC24 498167 sc-eQTL 5.33e-01 0.121 0.193 0.054 cDC L2
ENSG00000173846 PLK3 -310851 sc-eQTL 2.93e-01 -0.155 0.147 0.054 cDC L2
ENSG00000178028 DMAP1 276071 sc-eQTL 3.13e-01 -0.225 0.223 0.054 cDC L2
ENSG00000187147 RNF220 84332 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00363 0.195 0.054 cDC L2
ENSG00000198520 ARMH1 -185166 sc-eQTL 2.08e-01 0.288 0.228 0.054 cDC L2
ENSG00000222009 BTBD19 -318956 sc-eQTL 4.36e-01 0.16 0.204 0.054 cDC L2
ENSG00000066135 KDM4A 839377 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0612 0.222 0.051 intMono L2
ENSG00000070785 EIF2B3 -497196 sc-eQTL 9.09e-01 0.0256 0.223 0.051 intMono L2
ENSG00000117408 IPO13 542576 sc-eQTL 1.35e-01 0.31 0.206 0.051 intMono L2
ENSG00000117410 ATP6V0B 515039 sc-eQTL 4.14e-01 0.11 0.134 0.051 intMono L2
ENSG00000117419 ERI3 134266 sc-eQTL 1.29e-01 0.334 0.219 0.051 intMono L2
ENSG00000117425 PTCH2 -353727 sc-eQTL 4.95e-01 0.124 0.181 0.051 intMono L2
ENSG00000126088 UROD -521424 sc-eQTL 4.70e-01 0.157 0.217 0.051 intMono L2
ENSG00000126091 ST3GAL3 783702 sc-eQTL 9.26e-02 0.352 0.208 0.051 intMono L2
ENSG00000126106 TMEM53 -184955 sc-eQTL 2.14e-01 -0.255 0.205 0.051 intMono L2
ENSG00000126107 HECTD3 -521798 sc-eQTL 6.05e-01 0.111 0.214 0.051 intMono L2
ENSG00000132768 DPH2 519526 sc-eQTL 7.94e-02 -0.373 0.212 0.051 intMono L2
ENSG00000132773 TOE1 -850526 sc-eQTL 5.09e-01 -0.144 0.218 0.051 intMono L2
ENSG00000132781 MUTYH -851367 sc-eQTL 2.84e-01 -0.209 0.194 0.051 intMono L2
ENSG00000142937 RPS8 -285725 sc-eQTL 5.52e-01 0.0546 0.0916 0.051 intMono L2
ENSG00000159214 CCDC24 498167 sc-eQTL 6.09e-01 0.103 0.201 0.051 intMono L2
ENSG00000173846 PLK3 -310851 sc-eQTL 6.41e-01 0.0709 0.152 0.051 intMono L2
ENSG00000178028 DMAP1 276071 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0205 0.218 0.051 intMono L2
ENSG00000187147 RNF220 84332 sc-eQTL 2.56e-01 0.219 0.192 0.051 intMono L2
ENSG00000198520 ARMH1 -185166 sc-eQTL 8.71e-02 0.379 0.221 0.051 intMono L2
ENSG00000222009 BTBD19 -318956 sc-eQTL 9.33e-01 0.0172 0.204 0.051 intMono L2
ENSG00000066135 KDM4A 839377 sc-eQTL 2.84e-01 -0.216 0.201 0.052 ncMono L2
ENSG00000070785 EIF2B3 -497196 sc-eQTL 1.62e-01 0.269 0.192 0.052 ncMono L2
ENSG00000117408 IPO13 542576 sc-eQTL 9.78e-01 0.00573 0.208 0.052 ncMono L2
ENSG00000117410 ATP6V0B 515039 sc-eQTL 2.46e-01 0.176 0.151 0.052 ncMono L2
ENSG00000117419 ERI3 134266 sc-eQTL 1.82e-01 0.29 0.217 0.052 ncMono L2
ENSG00000117425 PTCH2 -353727 sc-eQTL 5.45e-03 0.542 0.193 0.052 ncMono L2
ENSG00000126088 UROD -521424 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0219 0.21 0.052 ncMono L2
ENSG00000126091 ST3GAL3 783702 sc-eQTL 6.01e-01 -0.111 0.211 0.052 ncMono L2
ENSG00000126106 TMEM53 -184955 sc-eQTL 3.90e-02 0.446 0.215 0.052 ncMono L2
ENSG00000126107 HECTD3 -521798 sc-eQTL 4.54e-01 0.163 0.218 0.052 ncMono L2
ENSG00000132768 DPH2 519526 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0638 0.22 0.052 ncMono L2
ENSG00000132773 TOE1 -850526 sc-eQTL 6.57e-01 0.0853 0.192 0.052 ncMono L2
ENSG00000132781 MUTYH -851367 sc-eQTL 8.14e-01 0.046 0.196 0.052 ncMono L2
ENSG00000142937 RPS8 -285725 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0733 0.0847 0.052 ncMono L2
ENSG00000159214 CCDC24 498167 sc-eQTL 2.61e-01 0.221 0.196 0.052 ncMono L2
ENSG00000173846 PLK3 -310851 sc-eQTL 5.93e-01 0.0716 0.134 0.052 ncMono L2
ENSG00000178028 DMAP1 276071 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0298 0.223 0.052 ncMono L2
ENSG00000187147 RNF220 84332 sc-eQTL 6.12e-01 0.0977 0.192 0.052 ncMono L2
ENSG00000198520 ARMH1 -185166 sc-eQTL 2.66e-02 0.35 0.157 0.052 ncMono L2
ENSG00000222009 BTBD19 -318956 sc-eQTL 7.58e-02 0.347 0.194 0.052 ncMono L2
ENSG00000066135 KDM4A 839377 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0626 0.219 0.051 pDC L2
ENSG00000070785 EIF2B3 -497196 sc-eQTL 1.72e-01 0.313 0.228 0.051 pDC L2
ENSG00000117408 IPO13 542576 sc-eQTL 4.75e-01 -0.162 0.226 0.051 pDC L2
ENSG00000117410 ATP6V0B 515039 sc-eQTL 3.18e-01 -0.157 0.156 0.051 pDC L2
ENSG00000117419 ERI3 134266 sc-eQTL 4.11e-01 0.18 0.219 0.051 pDC L2
ENSG00000117425 PTCH2 -353727 sc-eQTL 7.81e-01 0.0499 0.179 0.051 pDC L2
ENSG00000126088 UROD -521424 sc-eQTL 5.50e-01 0.13 0.216 0.051 pDC L2
ENSG00000126091 ST3GAL3 783702 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0552 0.214 0.051 pDC L2
ENSG00000126106 TMEM53 -184955 sc-eQTL 9.92e-01 0.00181 0.19 0.051 pDC L2
ENSG00000126107 HECTD3 -521798 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0357 0.226 0.051 pDC L2
ENSG00000132768 DPH2 519526 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0394 0.216 0.051 pDC L2
ENSG00000132773 TOE1 -850526 sc-eQTL 4.17e-01 -0.186 0.228 0.051 pDC L2
ENSG00000132781 MUTYH -851367 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0162 0.199 0.051 pDC L2
ENSG00000142937 RPS8 -285725 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0347 0.129 0.051 pDC L2
ENSG00000159214 CCDC24 498167 sc-eQTL 1.40e-01 -0.284 0.192 0.051 pDC L2
ENSG00000173846 PLK3 -310851 sc-eQTL 4.89e-01 -0.121 0.174 0.051 pDC L2
ENSG00000178028 DMAP1 276071 sc-eQTL 9.52e-01 0.0134 0.221 0.051 pDC L2
ENSG00000187147 RNF220 84332 sc-eQTL 1.31e-01 0.314 0.207 0.051 pDC L2
ENSG00000198520 ARMH1 -185166 sc-eQTL 1.62e-01 -0.281 0.2 0.051 pDC L2
ENSG00000222009 BTBD19 -318956 sc-eQTL 3.01e-01 -0.228 0.22 0.051 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000070785 EIF2B3 -497196 eQTL 0.0431 0.0755 0.0373 0.00109 0.0 0.0505
ENSG00000126088 UROD -521424 eQTL 0.00362 0.134 0.0461 0.0 0.0 0.0505
ENSG00000159214 CCDC24 498167 eQTL 0.0241 -0.177 0.0786 0.0 0.0 0.0505

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina