logo

Genes within 1Mb (chr1:44481939:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066135 KDM4A 831790 sc-eQTL 5.77e-01 0.123 0.22 0.054 B_Activated L2
ENSG00000070785 EIF2B3 -504783 sc-eQTL 3.32e-01 -0.204 0.21 0.054 B_Activated L2
ENSG00000117408 IPO13 534989 sc-eQTL 6.16e-01 0.0984 0.196 0.054 B_Activated L2
ENSG00000117410 ATP6V0B 507452 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000687 0.194 0.054 B_Activated L2
ENSG00000117411 B4GALT2 502996 sc-eQTL 4.51e-01 -0.136 0.18 0.054 B_Activated L2
ENSG00000117419 ERI3 126679 sc-eQTL 6.67e-02 0.418 0.226 0.054 B_Activated L2
ENSG00000117425 PTCH2 -361314 sc-eQTL 3.99e-01 0.108 0.128 0.054 B_Activated L2
ENSG00000126088 UROD -529011 sc-eQTL 9.94e-01 0.00172 0.221 0.054 B_Activated L2
ENSG00000126091 ST3GAL3 776115 sc-eQTL 6.58e-01 0.0914 0.206 0.054 B_Activated L2
ENSG00000126106 TMEM53 -192542 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00732 0.187 0.054 B_Activated L2
ENSG00000126107 HECTD3 -529385 sc-eQTL 1.25e-01 -0.328 0.213 0.054 B_Activated L2
ENSG00000132768 DPH2 511939 sc-eQTL 2.37e-01 -0.256 0.215 0.054 B_Activated L2
ENSG00000132773 TOE1 -858113 sc-eQTL 2.11e-01 0.263 0.209 0.054 B_Activated L2
ENSG00000132781 MUTYH -858954 sc-eQTL 4.57e-01 0.164 0.219 0.054 B_Activated L2
ENSG00000142937 RPS8 -293312 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0813 0.11 0.054 B_Activated L2
ENSG00000159214 CCDC24 490580 sc-eQTL 7.00e-01 0.0714 0.185 0.054 B_Activated L2
ENSG00000173846 PLK3 -318438 sc-eQTL 7.69e-02 -0.353 0.198 0.054 B_Activated L2
ENSG00000178028 DMAP1 268484 sc-eQTL 9.25e-01 0.0212 0.226 0.054 B_Activated L2
ENSG00000187147 RNF220 76745 sc-eQTL 9.54e-01 -0.0118 0.205 0.054 B_Activated L2
ENSG00000198520 ARMH1 -192753 sc-eQTL 7.63e-01 0.0608 0.201 0.054 B_Activated L2
ENSG00000066135 KDM4A 831790 sc-eQTL 6.17e-01 -0.106 0.211 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000070785 EIF2B3 -504783 sc-eQTL 4.94e-01 0.139 0.203 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000117408 IPO13 534989 sc-eQTL 7.18e-01 0.0727 0.201 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000117410 ATP6V0B 507452 sc-eQTL 3.41e-01 0.185 0.194 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000117419 ERI3 126679 sc-eQTL 6.07e-01 -0.118 0.229 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000126088 UROD -529011 sc-eQTL 1.77e-01 -0.272 0.201 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000126091 ST3GAL3 776115 sc-eQTL 4.69e-01 -0.146 0.202 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000126107 HECTD3 -529385 sc-eQTL 4.64e-01 -0.153 0.208 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000132768 DPH2 511939 sc-eQTL 5.27e-03 0.57 0.202 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000132773 TOE1 -858113 sc-eQTL 6.63e-02 -0.374 0.202 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000132781 MUTYH -858954 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0456 0.211 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000142937 RPS8 -293312 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0635 0.121 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000162415 ZSWIM5 -824270 sc-eQTL 4.23e-01 0.168 0.209 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000173846 PLK3 -318438 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0291 0.142 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000178028 DMAP1 268484 sc-eQTL 1.35e-01 -0.327 0.218 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000187147 RNF220 76745 sc-eQTL 7.64e-01 0.0603 0.201 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000198520 ARMH1 -192753 sc-eQTL 4.47e-01 0.146 0.191 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000066135 KDM4A 831790 sc-eQTL 9.84e-02 -0.367 0.221 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000070785 EIF2B3 -504783 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0754 0.216 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000117408 IPO13 534989 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000206 0.203 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000117410 ATP6V0B 507452 sc-eQTL 5.67e-02 0.398 0.208 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000117411 B4GALT2 502996 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0501 0.195 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000117419 ERI3 126679 sc-eQTL 9.37e-01 0.0174 0.218 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000126088 UROD -529011 sc-eQTL 5.99e-01 -0.115 0.218 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000126091 ST3GAL3 776115 sc-eQTL 5.33e-01 -0.135 0.216 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000126106 TMEM53 -192542 sc-eQTL 5.91e-01 0.111 0.207 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000126107 HECTD3 -529385 sc-eQTL 7.12e-01 0.0853 0.231 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000132768 DPH2 511939 sc-eQTL 9.90e-01 0.00278 0.223 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000132773 TOE1 -858113 sc-eQTL 7.32e-01 0.0731 0.213 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000132781 MUTYH -858954 sc-eQTL 1.91e-01 -0.291 0.222 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000142937 RPS8 -293312 sc-eQTL 1.29e-01 -0.143 0.0939 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000159214 CCDC24 490580 sc-eQTL 8.02e-01 0.0503 0.2 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000162415 ZSWIM5 -824270 sc-eQTL 3.86e-01 -0.167 0.192 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000173846 PLK3 -318438 sc-eQTL 3.14e-01 -0.197 0.195 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000178028 DMAP1 268484 sc-eQTL 9.26e-01 0.0203 0.22 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000187147 RNF220 76745 sc-eQTL 1.05e-02 0.479 0.186 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000066135 KDM4A 831790 sc-eQTL 3.32e-01 0.234 0.24 0.056 PB L2
ENSG00000070785 EIF2B3 -504783 sc-eQTL 8.31e-01 0.0443 0.207 0.056 PB L2
ENSG00000117408 IPO13 534989 sc-eQTL 1.85e-01 0.348 0.261 0.056 PB L2
ENSG00000117410 ATP6V0B 507452 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0433 0.117 0.056 PB L2
ENSG00000117411 B4GALT2 502996 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0315 0.18 0.056 PB L2
ENSG00000117419 ERI3 126679 sc-eQTL 8.11e-01 0.0604 0.252 0.056 PB L2
ENSG00000117425 PTCH2 -361314 sc-eQTL 6.54e-02 0.436 0.234 0.056 PB L2
ENSG00000126088 UROD -529011 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0817 0.181 0.056 PB L2
ENSG00000126091 ST3GAL3 776115 sc-eQTL 3.67e-01 -0.225 0.248 0.056 PB L2
ENSG00000126106 TMEM53 -192542 sc-eQTL 9.98e-01 0.000738 0.242 0.056 PB L2
ENSG00000126107 HECTD3 -529385 sc-eQTL 9.53e-01 -0.012 0.2 0.056 PB L2
ENSG00000132768 DPH2 511939 sc-eQTL 8.30e-02 0.451 0.258 0.056 PB L2
ENSG00000132773 TOE1 -858113 sc-eQTL 4.61e-04 0.882 0.244 0.056 PB L2
ENSG00000132781 MUTYH -858954 sc-eQTL 6.15e-01 0.142 0.282 0.056 PB L2
ENSG00000142937 RPS8 -293312 sc-eQTL 3.97e-03 -0.383 0.13 0.056 PB L2
ENSG00000159214 CCDC24 490580 sc-eQTL 2.29e-01 -0.308 0.255 0.056 PB L2
ENSG00000173846 PLK3 -318438 sc-eQTL 2.73e-01 0.272 0.247 0.056 PB L2
ENSG00000178028 DMAP1 268484 sc-eQTL 3.27e-01 0.282 0.286 0.056 PB L2
ENSG00000187147 RNF220 76745 sc-eQTL 5.03e-01 0.16 0.239 0.056 PB L2
ENSG00000198520 ARMH1 -192753 sc-eQTL 1.53e-01 0.31 0.216 0.056 PB L2
ENSG00000066135 KDM4A 831790 sc-eQTL 2.65e-01 0.243 0.217 0.054 cDC L2
ENSG00000070785 EIF2B3 -504783 sc-eQTL 4.07e-01 0.172 0.207 0.054 cDC L2
ENSG00000117408 IPO13 534989 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0544 0.212 0.054 cDC L2
ENSG00000117410 ATP6V0B 507452 sc-eQTL 2.29e-02 -0.313 0.136 0.054 cDC L2
ENSG00000117419 ERI3 126679 sc-eQTL 3.28e-01 -0.22 0.224 0.054 cDC L2
ENSG00000117425 PTCH2 -361314 sc-eQTL 5.18e-01 0.12 0.185 0.054 cDC L2
ENSG00000126088 UROD -529011 sc-eQTL 4.01e-01 -0.177 0.21 0.054 cDC L2
ENSG00000126091 ST3GAL3 776115 sc-eQTL 3.67e-01 0.196 0.217 0.054 cDC L2
ENSG00000126106 TMEM53 -192542 sc-eQTL 4.31e-01 -0.159 0.202 0.054 cDC L2
ENSG00000126107 HECTD3 -529385 sc-eQTL 3.01e-01 0.247 0.238 0.054 cDC L2
ENSG00000132768 DPH2 511939 sc-eQTL 4.85e-01 -0.156 0.223 0.054 cDC L2
ENSG00000132773 TOE1 -858113 sc-eQTL 5.31e-01 -0.147 0.234 0.054 cDC L2
ENSG00000132781 MUTYH -858954 sc-eQTL 5.28e-01 0.138 0.218 0.054 cDC L2
ENSG00000142937 RPS8 -293312 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0324 0.101 0.054 cDC L2
ENSG00000159214 CCDC24 490580 sc-eQTL 5.33e-01 0.121 0.193 0.054 cDC L2
ENSG00000173846 PLK3 -318438 sc-eQTL 2.93e-01 -0.155 0.147 0.054 cDC L2
ENSG00000178028 DMAP1 268484 sc-eQTL 3.13e-01 -0.225 0.223 0.054 cDC L2
ENSG00000187147 RNF220 76745 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00363 0.195 0.054 cDC L2
ENSG00000198520 ARMH1 -192753 sc-eQTL 2.08e-01 0.288 0.228 0.054 cDC L2
ENSG00000222009 BTBD19 -326543 sc-eQTL 4.36e-01 0.16 0.204 0.054 cDC L2
ENSG00000066135 KDM4A 831790 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0612 0.222 0.051 intMono L2
ENSG00000070785 EIF2B3 -504783 sc-eQTL 9.09e-01 0.0256 0.223 0.051 intMono L2
ENSG00000117408 IPO13 534989 sc-eQTL 1.35e-01 0.31 0.206 0.051 intMono L2
ENSG00000117410 ATP6V0B 507452 sc-eQTL 4.14e-01 0.11 0.134 0.051 intMono L2
ENSG00000117419 ERI3 126679 sc-eQTL 1.29e-01 0.334 0.219 0.051 intMono L2
ENSG00000117425 PTCH2 -361314 sc-eQTL 4.95e-01 0.124 0.181 0.051 intMono L2
ENSG00000126088 UROD -529011 sc-eQTL 4.70e-01 0.157 0.217 0.051 intMono L2
ENSG00000126091 ST3GAL3 776115 sc-eQTL 9.26e-02 0.352 0.208 0.051 intMono L2
ENSG00000126106 TMEM53 -192542 sc-eQTL 2.14e-01 -0.255 0.205 0.051 intMono L2
ENSG00000126107 HECTD3 -529385 sc-eQTL 6.05e-01 0.111 0.214 0.051 intMono L2
ENSG00000132768 DPH2 511939 sc-eQTL 7.94e-02 -0.373 0.212 0.051 intMono L2
ENSG00000132773 TOE1 -858113 sc-eQTL 5.09e-01 -0.144 0.218 0.051 intMono L2
ENSG00000132781 MUTYH -858954 sc-eQTL 2.84e-01 -0.209 0.194 0.051 intMono L2
ENSG00000142937 RPS8 -293312 sc-eQTL 5.52e-01 0.0546 0.0916 0.051 intMono L2
ENSG00000159214 CCDC24 490580 sc-eQTL 6.09e-01 0.103 0.201 0.051 intMono L2
ENSG00000173846 PLK3 -318438 sc-eQTL 6.41e-01 0.0709 0.152 0.051 intMono L2
ENSG00000178028 DMAP1 268484 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0205 0.218 0.051 intMono L2
ENSG00000187147 RNF220 76745 sc-eQTL 2.56e-01 0.219 0.192 0.051 intMono L2
ENSG00000198520 ARMH1 -192753 sc-eQTL 8.71e-02 0.379 0.221 0.051 intMono L2
ENSG00000222009 BTBD19 -326543 sc-eQTL 9.33e-01 0.0172 0.204 0.051 intMono L2
ENSG00000066135 KDM4A 831790 sc-eQTL 2.84e-01 -0.216 0.201 0.052 ncMono L2
ENSG00000070785 EIF2B3 -504783 sc-eQTL 1.62e-01 0.269 0.192 0.052 ncMono L2
ENSG00000117408 IPO13 534989 sc-eQTL 9.78e-01 0.00573 0.208 0.052 ncMono L2
ENSG00000117410 ATP6V0B 507452 sc-eQTL 2.46e-01 0.176 0.151 0.052 ncMono L2
ENSG00000117419 ERI3 126679 sc-eQTL 1.82e-01 0.29 0.217 0.052 ncMono L2
ENSG00000117425 PTCH2 -361314 sc-eQTL 5.45e-03 0.542 0.193 0.052 ncMono L2
ENSG00000126088 UROD -529011 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0219 0.21 0.052 ncMono L2
ENSG00000126091 ST3GAL3 776115 sc-eQTL 6.01e-01 -0.111 0.211 0.052 ncMono L2
ENSG00000126106 TMEM53 -192542 sc-eQTL 3.90e-02 0.446 0.215 0.052 ncMono L2
ENSG00000126107 HECTD3 -529385 sc-eQTL 4.54e-01 0.163 0.218 0.052 ncMono L2
ENSG00000132768 DPH2 511939 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0638 0.22 0.052 ncMono L2
ENSG00000132773 TOE1 -858113 sc-eQTL 6.57e-01 0.0853 0.192 0.052 ncMono L2
ENSG00000132781 MUTYH -858954 sc-eQTL 8.14e-01 0.046 0.196 0.052 ncMono L2
ENSG00000142937 RPS8 -293312 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0733 0.0847 0.052 ncMono L2
ENSG00000159214 CCDC24 490580 sc-eQTL 2.61e-01 0.221 0.196 0.052 ncMono L2
ENSG00000173846 PLK3 -318438 sc-eQTL 5.93e-01 0.0716 0.134 0.052 ncMono L2
ENSG00000178028 DMAP1 268484 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0298 0.223 0.052 ncMono L2
ENSG00000187147 RNF220 76745 sc-eQTL 6.12e-01 0.0977 0.192 0.052 ncMono L2
ENSG00000198520 ARMH1 -192753 sc-eQTL 2.66e-02 0.35 0.157 0.052 ncMono L2
ENSG00000222009 BTBD19 -326543 sc-eQTL 7.58e-02 0.347 0.194 0.052 ncMono L2
ENSG00000066135 KDM4A 831790 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0626 0.219 0.051 pDC L2
ENSG00000070785 EIF2B3 -504783 sc-eQTL 1.72e-01 0.313 0.228 0.051 pDC L2
ENSG00000117408 IPO13 534989 sc-eQTL 4.75e-01 -0.162 0.226 0.051 pDC L2
ENSG00000117410 ATP6V0B 507452 sc-eQTL 3.18e-01 -0.157 0.156 0.051 pDC L2
ENSG00000117419 ERI3 126679 sc-eQTL 4.11e-01 0.18 0.219 0.051 pDC L2
ENSG00000117425 PTCH2 -361314 sc-eQTL 7.81e-01 0.0499 0.179 0.051 pDC L2
ENSG00000126088 UROD -529011 sc-eQTL 5.50e-01 0.13 0.216 0.051 pDC L2
ENSG00000126091 ST3GAL3 776115 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0552 0.214 0.051 pDC L2
ENSG00000126106 TMEM53 -192542 sc-eQTL 9.92e-01 0.00181 0.19 0.051 pDC L2
ENSG00000126107 HECTD3 -529385 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0357 0.226 0.051 pDC L2
ENSG00000132768 DPH2 511939 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0394 0.216 0.051 pDC L2
ENSG00000132773 TOE1 -858113 sc-eQTL 4.17e-01 -0.186 0.228 0.051 pDC L2
ENSG00000132781 MUTYH -858954 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0162 0.199 0.051 pDC L2
ENSG00000142937 RPS8 -293312 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0347 0.129 0.051 pDC L2
ENSG00000159214 CCDC24 490580 sc-eQTL 1.40e-01 -0.284 0.192 0.051 pDC L2
ENSG00000173846 PLK3 -318438 sc-eQTL 4.89e-01 -0.121 0.174 0.051 pDC L2
ENSG00000178028 DMAP1 268484 sc-eQTL 9.52e-01 0.0134 0.221 0.051 pDC L2
ENSG00000187147 RNF220 76745 sc-eQTL 1.31e-01 0.314 0.207 0.051 pDC L2
ENSG00000198520 ARMH1 -192753 sc-eQTL 1.62e-01 -0.281 0.2 0.051 pDC L2
ENSG00000222009 BTBD19 -326543 sc-eQTL 3.01e-01 -0.228 0.22 0.051 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000070785 EIF2B3 -504783 eQTL 0.0343 0.0787 0.0371 0.00118 0.0 0.051
ENSG00000126088 UROD -529011 pQTL 0.0476 0.0623 0.0314 0.0 0.0 0.0546
ENSG00000126088 UROD -529011 eQTL 0.00414 0.132 0.0459 0.0 0.0 0.051
ENSG00000159214 CCDC24 490580 eQTL 0.0156 -0.189 0.0782 0.0 0.0 0.051

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina