logo

Genes within 1Mb (chr1:43605947:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000065978 YBX1 923529 sc-eQTL 9.48e-01 -0.011 0.168 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000066135 KDM4A -44202 sc-eQTL 6.34e-01 0.103 0.215 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000066322 ELOVL1 237873 sc-eQTL 6.48e-01 0.092 0.201 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000117385 P3H1 838863 sc-eQTL 6.99e-02 -0.36 0.197 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000117394 SLC2A1 647079 sc-eQTL 5.65e-02 -0.383 0.2 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000117395 EBNA1BP2 335011 sc-eQTL 1.25e-01 -0.338 0.219 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000117408 IPO13 -341003 sc-eQTL 3.04e-01 0.207 0.2 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000117410 ATP6V0B -368540 sc-eQTL 6.02e-01 0.107 0.204 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000117419 ERI3 -749313 sc-eQTL 9.26e-02 -0.365 0.216 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000126091 ST3GAL3 -99877 sc-eQTL 5.35e-01 0.134 0.216 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000132768 DPH2 -364053 sc-eQTL 8.66e-01 0.0359 0.212 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000159479 MED8 216139 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0572 0.205 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000164008 C1orf50 838698 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0212 0.218 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000164010 ERMAP 788825 sc-eQTL 5.42e-01 0.117 0.191 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000164011 ZNF691 759374 sc-eQTL 6.84e-01 0.074 0.182 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000171960 PPIH 947524 sc-eQTL 4.24e-01 0.149 0.186 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000177868 SVBP 788550 sc-eQTL 1.01e-01 -0.355 0.215 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000178028 DMAP1 -607508 sc-eQTL 1.15e-02 0.557 0.218 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000178922 HYI 151958 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0316 0.189 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000187147 RNF220 -799247 sc-eQTL 5.21e-01 0.113 0.175 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000198198 SZT2 216065 sc-eQTL 6.12e-01 0.103 0.204 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000065978 YBX1 923529 sc-eQTL 2.49e-01 0.214 0.185 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000066135 KDM4A -44202 sc-eQTL 5.75e-01 0.124 0.221 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000066322 ELOVL1 237873 sc-eQTL 1.84e-02 -0.485 0.204 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000117385 P3H1 838863 sc-eQTL 6.21e-01 0.113 0.228 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000117394 SLC2A1 647079 sc-eQTL 5.57e-01 -0.132 0.225 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000117395 EBNA1BP2 335011 sc-eQTL 1.64e-03 -0.661 0.207 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000117408 IPO13 -341003 sc-eQTL 3.49e-01 -0.198 0.21 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000117410 ATP6V0B -368540 sc-eQTL 6.13e-01 -0.103 0.204 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000117419 ERI3 -749313 sc-eQTL 5.79e-01 -0.133 0.24 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000126091 ST3GAL3 -99877 sc-eQTL 2.93e-01 -0.223 0.211 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000132768 DPH2 -364053 sc-eQTL 3.83e-02 0.446 0.214 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000159479 MED8 216139 sc-eQTL 2.06e-01 -0.263 0.208 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000164008 C1orf50 838698 sc-eQTL 4.82e-01 -0.156 0.221 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000164010 ERMAP 788825 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0199 0.204 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000164011 ZNF691 759374 sc-eQTL 2.26e-01 -0.233 0.192 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000171960 PPIH 947524 sc-eQTL 8.39e-01 0.0457 0.224 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000177868 SVBP 788550 sc-eQTL 4.12e-01 -0.173 0.21 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000178028 DMAP1 -607508 sc-eQTL 5.88e-01 -0.125 0.23 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000178922 HYI 151958 sc-eQTL 8.14e-03 0.556 0.208 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000187147 RNF220 -799247 sc-eQTL 1.51e-02 0.508 0.207 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000198198 SZT2 216065 sc-eQTL 6.27e-01 -0.107 0.219 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000065978 YBX1 923529 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0467 0.174 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000066135 KDM4A -44202 sc-eQTL 8.89e-02 -0.383 0.224 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000066322 ELOVL1 237873 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0253 0.215 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000117385 P3H1 838863 sc-eQTL 1.80e-01 0.296 0.22 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000117394 SLC2A1 647079 sc-eQTL 3.07e-01 0.2 0.195 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000117395 EBNA1BP2 335011 sc-eQTL 2.22e-01 0.283 0.231 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000117408 IPO13 -341003 sc-eQTL 3.12e-01 0.207 0.205 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000117410 ATP6V0B -368540 sc-eQTL 2.76e-01 -0.231 0.211 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000117411 B4GALT2 -372996 sc-eQTL 2.43e-01 0.231 0.197 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000117419 ERI3 -749313 sc-eQTL 8.79e-01 0.0338 0.221 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000126091 ST3GAL3 -99877 sc-eQTL 6.98e-01 0.085 0.219 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000132768 DPH2 -364053 sc-eQTL 1.70e-01 -0.309 0.224 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000159214 CCDC24 -385412 sc-eQTL 3.00e-01 -0.21 0.202 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000159479 MED8 216139 sc-eQTL 5.74e-01 -0.132 0.235 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000164008 C1orf50 838698 sc-eQTL 5.23e-01 0.146 0.228 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000164010 ERMAP 788825 sc-eQTL 2.83e-01 -0.224 0.208 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000164011 ZNF691 759374 sc-eQTL 1.30e-01 0.297 0.195 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000171960 PPIH 947524 sc-eQTL 8.98e-01 0.0281 0.218 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000177868 SVBP 788550 sc-eQTL 9.08e-01 0.0236 0.204 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000178028 DMAP1 -607508 sc-eQTL 2.80e-01 0.24 0.222 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000178922 HYI 151958 sc-eQTL 2.61e-02 0.47 0.21 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000187147 RNF220 -799247 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0185 0.191 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000198198 SZT2 216065 sc-eQTL 8.56e-01 0.0343 0.188 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000065978 YBX1 923529 sc-eQTL 1.34e-01 0.273 0.181 0.052 PB L2
ENSG00000066135 KDM4A -44202 sc-eQTL 4.17e-01 -0.207 0.253 0.052 PB L2
ENSG00000066322 ELOVL1 237873 sc-eQTL 6.52e-01 0.122 0.27 0.052 PB L2
ENSG00000117385 P3H1 838863 sc-eQTL 1.70e-01 0.301 0.218 0.052 PB L2
ENSG00000117394 SLC2A1 647079 sc-eQTL 8.68e-01 0.0433 0.259 0.052 PB L2
ENSG00000117395 EBNA1BP2 335011 sc-eQTL 7.78e-01 0.0597 0.212 0.052 PB L2
ENSG00000117408 IPO13 -341003 sc-eQTL 9.78e-01 0.00751 0.277 0.052 PB L2
ENSG00000117410 ATP6V0B -368540 sc-eQTL 9.15e-01 0.0132 0.124 0.052 PB L2
ENSG00000117411 B4GALT2 -372996 sc-eQTL 4.92e-02 -0.37 0.186 0.052 PB L2
ENSG00000117419 ERI3 -749313 sc-eQTL 3.35e-01 -0.256 0.265 0.052 PB L2
ENSG00000126091 ST3GAL3 -99877 sc-eQTL 6.01e-01 0.138 0.262 0.052 PB L2
ENSG00000132768 DPH2 -364053 sc-eQTL 9.61e-01 -0.0135 0.275 0.052 PB L2
ENSG00000159214 CCDC24 -385412 sc-eQTL 7.07e-01 0.102 0.27 0.052 PB L2
ENSG00000159479 MED8 216139 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0122 0.198 0.052 PB L2
ENSG00000164008 C1orf50 838698 sc-eQTL 1.71e-01 -0.372 0.27 0.052 PB L2
ENSG00000164010 ERMAP 788825 sc-eQTL 6.58e-01 0.124 0.28 0.052 PB L2
ENSG00000164011 ZNF691 759374 sc-eQTL 4.74e-01 0.16 0.223 0.052 PB L2
ENSG00000171960 PPIH 947524 sc-eQTL 3.82e-01 -0.196 0.224 0.052 PB L2
ENSG00000177868 SVBP 788550 sc-eQTL 6.37e-01 -0.131 0.277 0.052 PB L2
ENSG00000178028 DMAP1 -607508 sc-eQTL 4.21e-01 -0.244 0.302 0.052 PB L2
ENSG00000178922 HYI 151958 sc-eQTL 2.79e-02 -0.442 0.198 0.052 PB L2
ENSG00000187147 RNF220 -799247 sc-eQTL 1.46e-01 -0.366 0.25 0.052 PB L2
ENSG00000198198 SZT2 216065 sc-eQTL 3.93e-01 0.226 0.264 0.052 PB L2
ENSG00000065978 YBX1 923529 sc-eQTL 1.85e-01 -0.255 0.192 0.055 gdT L2
ENSG00000066135 KDM4A -44202 sc-eQTL 1.99e-01 -0.318 0.246 0.055 gdT L2
ENSG00000066322 ELOVL1 237873 sc-eQTL 6.20e-01 -0.121 0.243 0.055 gdT L2
ENSG00000117385 P3H1 838863 sc-eQTL 9.07e-01 0.0261 0.223 0.055 gdT L2
ENSG00000117394 SLC2A1 647079 sc-eQTL 3.24e-01 0.206 0.209 0.055 gdT L2
ENSG00000117395 EBNA1BP2 335011 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0724 0.244 0.055 gdT L2
ENSG00000117399 CDC20 246966 sc-eQTL 1.77e-01 0.223 0.164 0.055 gdT L2
ENSG00000117408 IPO13 -341003 sc-eQTL 2.28e-01 -0.278 0.23 0.055 gdT L2
ENSG00000117410 ATP6V0B -368540 sc-eQTL 9.65e-01 -0.0093 0.21 0.055 gdT L2
ENSG00000117411 B4GALT2 -372996 sc-eQTL 9.78e-01 0.00595 0.216 0.055 gdT L2
ENSG00000117419 ERI3 -749313 sc-eQTL 7.58e-01 0.0785 0.254 0.055 gdT L2
ENSG00000126091 ST3GAL3 -99877 sc-eQTL 4.65e-01 -0.17 0.233 0.055 gdT L2
ENSG00000132768 DPH2 -364053 sc-eQTL 2.16e-01 0.283 0.228 0.055 gdT L2
ENSG00000159479 MED8 216139 sc-eQTL 3.32e-01 0.224 0.231 0.055 gdT L2
ENSG00000164008 C1orf50 838698 sc-eQTL 7.76e-03 0.604 0.224 0.055 gdT L2
ENSG00000164010 ERMAP 788825 sc-eQTL 3.68e-01 0.193 0.213 0.055 gdT L2
ENSG00000164011 ZNF691 759374 sc-eQTL 1.93e-01 0.256 0.196 0.055 gdT L2
ENSG00000171960 PPIH 947524 sc-eQTL 5.74e-01 0.124 0.219 0.055 gdT L2
ENSG00000177868 SVBP 788550 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0556 0.235 0.055 gdT L2
ENSG00000178028 DMAP1 -607508 sc-eQTL 4.99e-01 -0.157 0.232 0.055 gdT L2
ENSG00000178922 HYI 151958 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0377 0.24 0.055 gdT L2
ENSG00000187147 RNF220 -799247 sc-eQTL 7.60e-01 0.0589 0.193 0.055 gdT L2
ENSG00000198198 SZT2 216065 sc-eQTL 3.58e-01 0.202 0.219 0.055 gdT L2
ENSG00000065978 YBX1 923529 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0206 0.145 0.051 intMono L2
ENSG00000066135 KDM4A -44202 sc-eQTL 3.50e-02 0.464 0.218 0.051 intMono L2
ENSG00000066322 ELOVL1 237873 sc-eQTL 4.01e-02 0.398 0.192 0.051 intMono L2
ENSG00000117385 P3H1 838863 sc-eQTL 1.97e-02 0.49 0.208 0.051 intMono L2
ENSG00000117394 SLC2A1 647079 sc-eQTL 6.18e-01 0.0958 0.192 0.051 intMono L2
ENSG00000117395 EBNA1BP2 335011 sc-eQTL 5.03e-01 0.148 0.221 0.051 intMono L2
ENSG00000117408 IPO13 -341003 sc-eQTL 1.01e-01 -0.339 0.205 0.051 intMono L2
ENSG00000117410 ATP6V0B -368540 sc-eQTL 8.93e-02 -0.227 0.133 0.051 intMono L2
ENSG00000117419 ERI3 -749313 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0774 0.219 0.051 intMono L2
ENSG00000126091 ST3GAL3 -99877 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0398 0.209 0.051 intMono L2
ENSG00000132768 DPH2 -364053 sc-eQTL 8.94e-02 0.36 0.211 0.051 intMono L2
ENSG00000159214 CCDC24 -385412 sc-eQTL 9.43e-01 0.0144 0.2 0.051 intMono L2
ENSG00000159479 MED8 216139 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00426 0.173 0.051 intMono L2
ENSG00000164008 C1orf50 838698 sc-eQTL 2.20e-01 -0.272 0.221 0.051 intMono L2
ENSG00000164010 ERMAP 788825 sc-eQTL 5.97e-02 -0.405 0.214 0.051 intMono L2
ENSG00000171960 PPIH 947524 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0595 0.211 0.051 intMono L2
ENSG00000177868 SVBP 788550 sc-eQTL 5.82e-01 0.112 0.203 0.051 intMono L2
ENSG00000178028 DMAP1 -607508 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0204 0.218 0.051 intMono L2
ENSG00000178922 HYI 151958 sc-eQTL 5.92e-01 0.108 0.201 0.051 intMono L2
ENSG00000187147 RNF220 -799247 sc-eQTL 1.65e-01 0.267 0.191 0.051 intMono L2
ENSG00000198198 SZT2 216065 sc-eQTL 8.18e-02 -0.361 0.206 0.051 intMono L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000117407 ARTN -327373 eQTL 0.038 -0.185 0.0891 0.0 0.0 0.0491
ENSG00000117411 B4GALT2 -372996 eQTL 0.0168 -0.135 0.0566 0.00191 0.0 0.0491
ENSG00000142949 PTPRF 80760 eQTL 9.04e-08 -0.333 0.0619 0.0 0.0 0.0491
ENSG00000159214 CCDC24 -385412 eQTL 0.00193 -0.25 0.0803 0.0 0.0 0.0491
ENSG00000178922 HYI 151958 eQTL 1.69e-03 0.147 0.0466 0.0 0.0 0.0491
ENSG00000228192 AL512353.1 759525 eQTL 0.0351 0.202 0.0956 0.0 0.0 0.0491

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000142949 PTPRF 80760 8.64e-06 1.13e-05 1.28e-06 6.18e-06 2.22e-06 4.42e-06 1.09e-05 1.92e-06 9.95e-06 4.92e-06 1.33e-05 5.59e-06 1.68e-05 3.56e-06 2.18e-06 6.35e-06 4.22e-06 7.32e-06 2.62e-06 2.79e-06 4.94e-06 8.99e-06 8e-06 3.03e-06 1.58e-05 3.33e-06 4.7e-06 3.75e-06 1.03e-05 7.98e-06 5.62e-06 8.22e-07 1.07e-06 2.99e-06 4.54e-06 2.18e-06 1.71e-06 1.45e-06 1.63e-06 1e-06 1.02e-06 1.3e-05 1.32e-06 1.9e-07 6.87e-07 1.29e-06 1.06e-06 6.99e-07 6e-07
ENSG00000159214 CCDC24 -385412 1.22e-06 9.35e-07 2.52e-07 4.72e-07 9.9e-08 4.39e-07 9.92e-07 2.64e-07 8.66e-07 3.09e-07 1.26e-06 5.55e-07 1.37e-06 2.54e-07 4.43e-07 4.79e-07 7.62e-07 5.66e-07 4.95e-07 4.13e-07 3.24e-07 6.2e-07 6.26e-07 4.22e-07 1.86e-06 2.94e-07 5.43e-07 5.31e-07 8.56e-07 8.47e-07 4.61e-07 4.97e-08 2.31e-07 2.97e-07 3.27e-07 2.59e-07 4.77e-07 1.39e-07 1.33e-07 8.72e-09 1.99e-07 1.02e-06 5.45e-08 1.06e-07 1.89e-07 4.38e-08 1.85e-07 7.69e-08 5.77e-08
ENSG00000178922 HYI 151958 4.64e-06 5.26e-06 7.32e-07 3.42e-06 1.2e-06 1.54e-06 5.64e-06 9.23e-07 5e-06 2.5e-06 6.52e-06 3.34e-06 7.69e-06 1.92e-06 1.43e-06 3.41e-06 1.87e-06 3.83e-06 1.55e-06 1.09e-06 3.11e-06 4.91e-06 4.58e-06 1.4e-06 8.16e-06 1.93e-06 2.43e-06 1.6e-06 4.44e-06 4.18e-06 2.85e-06 5.58e-07 6.31e-07 1.55e-06 2.02e-06 9.77e-07 9.78e-07 4.76e-07 9.26e-07 4.28e-07 4.94e-07 5.6e-06 3.65e-07 1.52e-07 3.58e-07 4.13e-07 9.78e-07 5.06e-07 3.53e-07