logo

Genes within 1Mb (chr1:43552203:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000065978 YBX1 869785 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0275 0.175 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000066135 KDM4A -97946 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0733 0.225 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000066322 ELOVL1 184129 sc-eQTL 2.30e-01 -0.253 0.21 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000117385 P3H1 785119 sc-eQTL 5.31e-01 -0.13 0.208 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000117394 SLC2A1 593335 sc-eQTL 3.88e-01 0.182 0.21 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000117395 EBNA1BP2 281267 sc-eQTL 8.95e-01 0.0304 0.23 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000117408 IPO13 -394747 sc-eQTL 4.44e-01 -0.161 0.21 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000117410 ATP6V0B -422284 sc-eQTL 6.21e-01 -0.106 0.213 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000117419 ERI3 -803057 sc-eQTL 8.99e-01 -0.029 0.227 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000126091 ST3GAL3 -153621 sc-eQTL 5.91e-01 0.121 0.226 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000132768 DPH2 -417797 sc-eQTL 1.01e-01 -0.362 0.22 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000159479 MED8 162395 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0567 0.214 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000164008 C1orf50 784954 sc-eQTL 6.20e-01 -0.113 0.228 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000164010 ERMAP 735081 sc-eQTL 8.89e-01 0.028 0.2 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000164011 ZNF691 705630 sc-eQTL 6.73e-01 -0.08 0.19 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000171960 PPIH 893780 sc-eQTL 5.25e-01 -0.124 0.195 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000177868 SVBP 734806 sc-eQTL 2.28e-01 0.273 0.226 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000178028 DMAP1 -661252 sc-eQTL 6.19e-01 -0.116 0.232 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000178922 HYI 98214 sc-eQTL 5.33e-01 -0.123 0.198 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000187147 RNF220 -852991 sc-eQTL 1.71e-01 0.251 0.183 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000198198 SZT2 162321 sc-eQTL 3.92e-03 -0.609 0.209 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000065978 YBX1 869785 sc-eQTL 6.59e-01 0.072 0.163 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000066135 KDM4A -97946 sc-eQTL 5.76e-01 0.12 0.215 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000066322 ELOVL1 184129 sc-eQTL 1.67e-02 0.519 0.215 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000117385 P3H1 785119 sc-eQTL 6.44e-01 0.0975 0.21 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000117394 SLC2A1 593335 sc-eQTL 9.60e-01 0.011 0.219 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000117395 EBNA1BP2 281267 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0951 0.219 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000117408 IPO13 -394747 sc-eQTL 4.27e-02 -0.415 0.204 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000117410 ATP6V0B -422284 sc-eQTL 3.83e-01 0.158 0.18 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000117419 ERI3 -803057 sc-eQTL 9.67e-02 -0.371 0.222 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000126091 ST3GAL3 -153621 sc-eQTL 2.12e-01 -0.274 0.218 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000132768 DPH2 -417797 sc-eQTL 6.58e-01 0.096 0.216 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000159479 MED8 162395 sc-eQTL 2.91e-01 0.218 0.206 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000164008 C1orf50 784954 sc-eQTL 4.57e-01 0.163 0.219 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000164010 ERMAP 735081 sc-eQTL 3.97e-01 0.175 0.206 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000164011 ZNF691 705630 sc-eQTL 1.61e-01 -0.257 0.182 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000171960 PPIH 893780 sc-eQTL 9.80e-01 0.00531 0.206 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000177868 SVBP 734806 sc-eQTL 1.40e-01 -0.323 0.218 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000178028 DMAP1 -661252 sc-eQTL 8.73e-01 0.0359 0.225 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000178922 HYI 98214 sc-eQTL 4.99e-02 -0.393 0.199 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000187147 RNF220 -852991 sc-eQTL 3.78e-01 0.165 0.187 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000198198 SZT2 162321 sc-eQTL 2.61e-01 0.225 0.2 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000065978 YBX1 869785 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0362 0.183 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000066135 KDM4A -97946 sc-eQTL 9.32e-01 0.0185 0.218 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000066322 ELOVL1 184129 sc-eQTL 2.18e-01 0.25 0.202 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000117385 P3H1 785119 sc-eQTL 4.41e-01 -0.172 0.223 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000117394 SLC2A1 593335 sc-eQTL 6.06e-01 0.114 0.221 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000117395 EBNA1BP2 281267 sc-eQTL 8.59e-02 -0.357 0.207 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000117408 IPO13 -394747 sc-eQTL 5.72e-03 0.567 0.203 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000117410 ATP6V0B -422284 sc-eQTL 5.23e-01 0.128 0.2 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000117419 ERI3 -803057 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0381 0.236 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000126091 ST3GAL3 -153621 sc-eQTL 2.19e-01 -0.256 0.207 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000132768 DPH2 -417797 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0651 0.212 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000159479 MED8 162395 sc-eQTL 7.89e-01 0.0549 0.205 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000164008 C1orf50 784954 sc-eQTL 4.18e-01 0.176 0.217 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000164010 ERMAP 735081 sc-eQTL 5.69e-01 -0.114 0.2 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000164011 ZNF691 705630 sc-eQTL 1.98e-01 0.244 0.189 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000171960 PPIH 893780 sc-eQTL 9.90e-01 0.00268 0.22 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000177868 SVBP 734806 sc-eQTL 5.69e-01 0.118 0.207 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000178028 DMAP1 -661252 sc-eQTL 6.26e-01 -0.11 0.226 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000178922 HYI 98214 sc-eQTL 5.15e-01 0.135 0.207 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000187147 RNF220 -852991 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0352 0.207 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000198198 SZT2 162321 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0293 0.215 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000065978 YBX1 869785 sc-eQTL 7.76e-01 0.0554 0.195 0.052 gdT L2
ENSG00000066135 KDM4A -97946 sc-eQTL 2.76e-01 0.272 0.249 0.052 gdT L2
ENSG00000066322 ELOVL1 184129 sc-eQTL 2.90e-01 0.26 0.244 0.052 gdT L2
ENSG00000117385 P3H1 785119 sc-eQTL 3.21e-01 -0.223 0.224 0.052 gdT L2
ENSG00000117394 SLC2A1 593335 sc-eQTL 6.87e-01 0.085 0.211 0.052 gdT L2
ENSG00000117395 EBNA1BP2 281267 sc-eQTL 4.19e-01 0.199 0.246 0.052 gdT L2
ENSG00000117399 CDC20 193222 sc-eQTL 5.03e-01 -0.111 0.166 0.052 gdT L2
ENSG00000117408 IPO13 -394747 sc-eQTL 5.77e-01 -0.13 0.232 0.052 gdT L2
ENSG00000117410 ATP6V0B -422284 sc-eQTL 3.97e-01 0.179 0.211 0.052 gdT L2
ENSG00000117411 B4GALT2 -426740 sc-eQTL 8.54e-01 0.0401 0.218 0.052 gdT L2
ENSG00000117419 ERI3 -803057 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0685 0.256 0.052 gdT L2
ENSG00000126091 ST3GAL3 -153621 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0676 0.235 0.052 gdT L2
ENSG00000132768 DPH2 -417797 sc-eQTL 1.89e-01 -0.303 0.23 0.052 gdT L2
ENSG00000159479 MED8 162395 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0981 0.233 0.052 gdT L2
ENSG00000164008 C1orf50 784954 sc-eQTL 9.34e-01 0.0193 0.231 0.052 gdT L2
ENSG00000164010 ERMAP 735081 sc-eQTL 6.80e-01 0.089 0.216 0.052 gdT L2
ENSG00000164011 ZNF691 705630 sc-eQTL 4.10e-01 0.164 0.198 0.052 gdT L2
ENSG00000171960 PPIH 893780 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0536 0.221 0.052 gdT L2
ENSG00000177868 SVBP 734806 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0787 0.237 0.052 gdT L2
ENSG00000178028 DMAP1 -661252 sc-eQTL 9.98e-02 -0.385 0.232 0.052 gdT L2
ENSG00000178922 HYI 98214 sc-eQTL 1.21e-01 -0.374 0.24 0.052 gdT L2
ENSG00000187147 RNF220 -852991 sc-eQTL 2.28e-01 0.234 0.193 0.052 gdT L2
ENSG00000198198 SZT2 162321 sc-eQTL 5.32e-01 0.138 0.221 0.052 gdT L2
ENSG00000065978 YBX1 869785 sc-eQTL 4.78e-01 0.109 0.154 0.051 pDC L2
ENSG00000066135 KDM4A -97946 sc-eQTL 3.07e-01 -0.228 0.222 0.051 pDC L2
ENSG00000066322 ELOVL1 184129 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0311 0.229 0.051 pDC L2
ENSG00000117385 P3H1 785119 sc-eQTL 2.36e-01 0.295 0.247 0.051 pDC L2
ENSG00000117394 SLC2A1 593335 sc-eQTL 8.17e-01 -0.037 0.159 0.051 pDC L2
ENSG00000117395 EBNA1BP2 281267 sc-eQTL 4.98e-01 0.155 0.228 0.051 pDC L2
ENSG00000117408 IPO13 -394747 sc-eQTL 8.03e-01 0.0574 0.23 0.051 pDC L2
ENSG00000117410 ATP6V0B -422284 sc-eQTL 2.81e-01 0.171 0.159 0.051 pDC L2
ENSG00000117419 ERI3 -803057 sc-eQTL 1.50e-01 -0.32 0.221 0.051 pDC L2
ENSG00000126091 ST3GAL3 -153621 sc-eQTL 4.90e-01 0.15 0.217 0.051 pDC L2
ENSG00000132768 DPH2 -417797 sc-eQTL 4.60e-01 -0.163 0.22 0.051 pDC L2
ENSG00000159214 CCDC24 -439156 sc-eQTL 5.46e-01 0.118 0.196 0.051 pDC L2
ENSG00000159479 MED8 162395 sc-eQTL 4.54e-01 -0.151 0.201 0.051 pDC L2
ENSG00000164008 C1orf50 784954 sc-eQTL 5.13e-01 0.154 0.235 0.051 pDC L2
ENSG00000164010 ERMAP 735081 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00723 0.221 0.051 pDC L2
ENSG00000164011 ZNF691 705630 sc-eQTL 1.35e-01 0.278 0.185 0.051 pDC L2
ENSG00000171960 PPIH 893780 sc-eQTL 8.91e-01 0.0304 0.222 0.051 pDC L2
ENSG00000177868 SVBP 734806 sc-eQTL 3.72e-01 -0.205 0.228 0.051 pDC L2
ENSG00000178028 DMAP1 -661252 sc-eQTL 9.54e-01 -0.013 0.225 0.051 pDC L2
ENSG00000178922 HYI 98214 sc-eQTL 1.36e-01 0.267 0.178 0.051 pDC L2
ENSG00000187147 RNF220 -852991 sc-eQTL 7.47e-01 0.0684 0.212 0.051 pDC L2
ENSG00000198198 SZT2 162321 sc-eQTL 1.97e-01 -0.29 0.223 0.051 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000117407 ARTN -381117 eQTL 0.000723 -0.327 0.0965 0.0 0.0 0.0412
ENSG00000117408 IPO13 -394747 eQTL 0.279 0.042 0.0388 0.0011 0.0 0.0412
ENSG00000159214 CCDC24 -439156 eQTL 3.59e-05 -0.361 0.087 0.0 0.0 0.0412
ENSG00000159479 MED8 162395 eQTL 0.0048 -0.089 0.0315 0.0 0.0 0.0412
ENSG00000164011 ZNF691 705630 eQTL 1.23e-02 0.12 0.0479 0.00227 0.0 0.0412
ENSG00000178922 HYI 98214 eQTL 5.99e-04 -0.174 0.0505 0.0 0.0 0.0412
ENSG00000198198 SZT2 162321 eQTL 0.0286 -0.0638 0.0291 0.00109 0.0 0.0412
ENSG00000283580 AC098484.3 784897 eQTL 0.0287 0.15 0.0686 0.0 0.0 0.0412

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina