logo

Genes within 1Mb (chr1:41699958:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000010803 SCMH1 457804 sc-eQTL 9.89e-01 0.00138 0.0989 0.212 B L1
ENSG00000065978 YBX1 -982460 sc-eQTL 8.64e-01 0.011 0.0639 0.212 B L1
ENSG00000127124 HIVEP3 -335967 sc-eQTL 4.64e-01 0.0624 0.085 0.212 B L1
ENSG00000127125 PPCS -756159 sc-eQTL 7.39e-02 -0.155 0.0865 0.212 B L1
ENSG00000171793 CTPS1 720270 sc-eQTL 8.75e-02 -0.126 0.0734 0.212 B L1
ENSG00000171960 PPIH -958465 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0602 0.08 0.212 B L1
ENSG00000179862 CITED4 837595 sc-eQTL 3.61e-01 0.0746 0.0814 0.212 B L1
ENSG00000186409 CCDC30 -763263 sc-eQTL 3.94e-02 -0.208 0.1 0.212 B L1
ENSG00000198815 FOXJ3 -635919 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0836 0.0765 0.212 B L1
ENSG00000010803 SCMH1 457804 sc-eQTL 1.33e-01 -0.128 0.0848 0.212 CD4T L1
ENSG00000065978 YBX1 -982460 sc-eQTL 6.70e-01 0.0271 0.0633 0.212 CD4T L1
ENSG00000127124 HIVEP3 -335967 sc-eQTL 4.19e-01 -0.078 0.0963 0.212 CD4T L1
ENSG00000127125 PPCS -756159 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0388 0.0659 0.212 CD4T L1
ENSG00000171793 CTPS1 720270 sc-eQTL 2.73e-01 0.0582 0.053 0.212 CD4T L1
ENSG00000171960 PPIH -958465 sc-eQTL 5.89e-02 -0.139 0.0733 0.212 CD4T L1
ENSG00000179862 CITED4 837595 sc-eQTL 8.30e-01 0.0121 0.0562 0.212 CD4T L1
ENSG00000186409 CCDC30 -763263 sc-eQTL 3.42e-01 0.0946 0.0994 0.212 CD4T L1
ENSG00000198815 FOXJ3 -635919 sc-eQTL 9.89e-01 -0.000982 0.0718 0.212 CD4T L1
ENSG00000010803 SCMH1 457804 sc-eQTL 5.19e-02 0.167 0.0854 0.212 CD8T L1
ENSG00000065978 YBX1 -982460 sc-eQTL 1.53e-01 0.0948 0.0661 0.212 CD8T L1
ENSG00000127124 HIVEP3 -335967 sc-eQTL 7.84e-01 0.0165 0.06 0.212 CD8T L1
ENSG00000127125 PPCS -756159 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0862 0.0885 0.212 CD8T L1
ENSG00000171793 CTPS1 720270 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00503 0.0635 0.212 CD8T L1
ENSG00000171960 PPIH -958465 sc-eQTL 6.92e-02 -0.147 0.0804 0.212 CD8T L1
ENSG00000179862 CITED4 837595 sc-eQTL 7.79e-01 0.0147 0.0524 0.212 CD8T L1
ENSG00000186409 CCDC30 -763263 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0509 0.0999 0.212 CD8T L1
ENSG00000198815 FOXJ3 -635919 sc-eQTL 6.26e-01 0.0365 0.0746 0.212 CD8T L1
ENSG00000010803 SCMH1 457804 sc-eQTL 9.96e-02 -0.165 0.1 0.209 DC L1
ENSG00000065978 YBX1 -982460 sc-eQTL 5.75e-01 0.039 0.0694 0.209 DC L1
ENSG00000127124 HIVEP3 -335967 sc-eQTL 2.52e-01 -0.123 0.107 0.209 DC L1
ENSG00000127125 PPCS -756159 sc-eQTL 8.33e-01 0.0207 0.0984 0.209 DC L1
ENSG00000171793 CTPS1 720270 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00589 0.0873 0.209 DC L1
ENSG00000171960 PPIH -958465 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0164 0.108 0.209 DC L1
ENSG00000179862 CITED4 837595 sc-eQTL 5.46e-01 0.0544 0.09 0.209 DC L1
ENSG00000186409 CCDC30 -763263 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0979 0.0931 0.209 DC L1
ENSG00000198815 FOXJ3 -635919 sc-eQTL 8.60e-01 0.0202 0.114 0.209 DC L1
ENSG00000010803 SCMH1 457804 sc-eQTL 4.47e-01 0.0741 0.0973 0.212 Mono L1
ENSG00000065978 YBX1 -982460 sc-eQTL 3.54e-01 0.052 0.056 0.212 Mono L1
ENSG00000127124 HIVEP3 -335967 sc-eQTL 4.42e-01 0.0505 0.0657 0.212 Mono L1
ENSG00000127125 PPCS -756159 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0417 0.0695 0.212 Mono L1
ENSG00000171793 CTPS1 720270 sc-eQTL 3.15e-01 -0.111 0.11 0.212 Mono L1
ENSG00000171960 PPIH -958465 sc-eQTL 2.02e-01 -0.121 0.0941 0.212 Mono L1
ENSG00000179862 CITED4 837595 sc-eQTL 8.00e-01 -0.019 0.0747 0.212 Mono L1
ENSG00000198815 FOXJ3 -635919 sc-eQTL 2.71e-01 0.0967 0.0876 0.212 Mono L1
ENSG00000010803 SCMH1 457804 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0314 0.096 0.212 NK L1
ENSG00000065978 YBX1 -982460 sc-eQTL 7.87e-01 0.0179 0.0661 0.212 NK L1
ENSG00000127124 HIVEP3 -335967 sc-eQTL 8.13e-01 0.0222 0.0937 0.212 NK L1
ENSG00000127125 PPCS -756159 sc-eQTL 5.73e-01 0.0484 0.0856 0.212 NK L1
ENSG00000171793 CTPS1 720270 sc-eQTL 7.51e-01 0.0223 0.0702 0.212 NK L1
ENSG00000171960 PPIH -958465 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0378 0.0881 0.212 NK L1
ENSG00000179862 CITED4 837595 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0581 0.0869 0.212 NK L1
ENSG00000186409 CCDC30 -763263 sc-eQTL 2.88e-01 -0.115 0.108 0.212 NK L1
ENSG00000198815 FOXJ3 -635919 sc-eQTL 5.07e-01 0.0487 0.0733 0.212 NK L1
ENSG00000010803 SCMH1 457804 sc-eQTL 8.42e-03 -0.249 0.0936 0.212 Other_T L1
ENSG00000065978 YBX1 -982460 sc-eQTL 9.20e-01 0.00579 0.0575 0.212 Other_T L1
ENSG00000127124 HIVEP3 -335967 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0669 0.0805 0.212 Other_T L1
ENSG00000127125 PPCS -756159 sc-eQTL 7.90e-01 0.0249 0.0931 0.212 Other_T L1
ENSG00000171793 CTPS1 720270 sc-eQTL 2.49e-01 0.0889 0.0769 0.212 Other_T L1
ENSG00000171960 PPIH -958465 sc-eQTL 6.86e-01 0.0292 0.0721 0.212 Other_T L1
ENSG00000179862 CITED4 837595 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0514 0.0878 0.212 Other_T L1
ENSG00000198815 FOXJ3 -635919 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0501 0.0955 0.212 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000010803 SCMH1 457804 sc-eQTL 3.21e-01 -0.119 0.119 0.204 B_Activated L2
ENSG00000065978 YBX1 -982460 sc-eQTL 2.82e-01 0.108 0.0998 0.204 B_Activated L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -335967 sc-eQTL 9.08e-03 0.329 0.125 0.204 B_Activated L2
ENSG00000127125 PPCS -756159 sc-eQTL 3.80e-01 0.105 0.12 0.204 B_Activated L2
ENSG00000171793 CTPS1 720270 sc-eQTL 7.90e-02 -0.209 0.118 0.204 B_Activated L2
ENSG00000171960 PPIH -958465 sc-eQTL 6.97e-01 0.0499 0.128 0.204 B_Activated L2
ENSG00000179862 CITED4 837595 sc-eQTL 5.76e-01 0.055 0.098 0.204 B_Activated L2
ENSG00000186409 CCDC30 -763263 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0126 0.0994 0.204 B_Activated L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -635919 sc-eQTL 9.41e-01 0.00951 0.128 0.204 B_Activated L2
ENSG00000010803 SCMH1 457804 sc-eQTL 1.21e-01 -0.177 0.114 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000065978 YBX1 -982460 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0153 0.078 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -335967 sc-eQTL 1.35e-01 -0.156 0.104 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000127125 PPCS -756159 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0678 0.106 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000171793 CTPS1 720270 sc-eQTL 6.83e-01 -0.042 0.103 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000171960 PPIH -958465 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0665 0.0991 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000179862 CITED4 837595 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0561 0.104 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000186409 CCDC30 -763263 sc-eQTL 1.99e-01 -0.151 0.117 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -635919 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0908 0.104 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000010803 SCMH1 457804 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0493 0.112 0.213 B_Memory L2
ENSG00000065978 YBX1 -982460 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0359 0.079 0.213 B_Memory L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -335967 sc-eQTL 4.59e-01 0.0816 0.11 0.213 B_Memory L2
ENSG00000127125 PPCS -756159 sc-eQTL 8.44e-01 0.0224 0.113 0.213 B_Memory L2
ENSG00000171793 CTPS1 720270 sc-eQTL 6.91e-02 -0.19 0.104 0.213 B_Memory L2
ENSG00000171960 PPIH -958465 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0129 0.108 0.213 B_Memory L2
ENSG00000179862 CITED4 837595 sc-eQTL 3.18e-02 0.214 0.0992 0.213 B_Memory L2
ENSG00000186409 CCDC30 -763263 sc-eQTL 4.36e-01 0.0788 0.101 0.213 B_Memory L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -635919 sc-eQTL 5.09e-01 0.0715 0.108 0.213 B_Memory L2
ENSG00000010803 SCMH1 457804 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0473 0.106 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000065978 YBX1 -982460 sc-eQTL 8.72e-01 0.0108 0.0668 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -335967 sc-eQTL 5.97e-01 0.0558 0.105 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000127125 PPCS -756159 sc-eQTL 1.35e-01 -0.143 0.0954 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000171793 CTPS1 720270 sc-eQTL 2.34e-01 -0.102 0.0855 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000171960 PPIH -958465 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0395 0.0925 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000179862 CITED4 837595 sc-eQTL 8.56e-01 0.0154 0.0851 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000186409 CCDC30 -763263 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0468 0.106 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -635919 sc-eQTL 2.01e-02 -0.208 0.0889 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000010803 SCMH1 457804 sc-eQTL 1.99e-01 0.146 0.113 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000065978 YBX1 -982460 sc-eQTL 2.28e-01 0.101 0.0837 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -335967 sc-eQTL 2.73e-01 -0.118 0.108 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000127125 PPCS -756159 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0859 0.115 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000171793 CTPS1 720270 sc-eQTL 3.59e-01 0.0957 0.104 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000171960 PPIH -958465 sc-eQTL 4.50e-02 -0.219 0.109 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000179862 CITED4 837595 sc-eQTL 1.98e-01 0.123 0.0955 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000186409 CCDC30 -763263 sc-eQTL 8.12e-02 -0.192 0.11 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -635919 sc-eQTL 3.43e-01 -0.097 0.102 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000010803 SCMH1 457804 sc-eQTL 9.04e-01 0.0143 0.118 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000065978 YBX1 -982460 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00617 0.0953 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -335967 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0968 0.0957 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000127125 PPCS -756159 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0557 0.11 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000171793 CTPS1 720270 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0808 0.109 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000171960 PPIH -958465 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0729 0.106 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000179862 CITED4 837595 sc-eQTL 9.62e-01 0.00444 0.0939 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000186409 CCDC30 -763263 sc-eQTL 6.72e-01 0.0408 0.0962 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -635919 sc-eQTL 1.85e-01 -0.154 0.116 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000010803 SCMH1 457804 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0697 0.0925 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000065978 YBX1 -982460 sc-eQTL 4.47e-01 0.0478 0.0627 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -335967 sc-eQTL 3.62e-01 -0.103 0.112 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000127125 PPCS -756159 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00294 0.0752 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000171793 CTPS1 720270 sc-eQTL 4.65e-02 0.118 0.0589 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000171960 PPIH -958465 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0625 0.0854 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000179862 CITED4 837595 sc-eQTL 1.00e+00 4.29e-06 0.0638 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000186409 CCDC30 -763263 sc-eQTL 2.45e-01 0.121 0.104 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -635919 sc-eQTL 8.88e-01 0.0103 0.0735 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000010803 SCMH1 457804 sc-eQTL 2.89e-01 -0.11 0.104 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000065978 YBX1 -982460 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0127 0.0628 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -335967 sc-eQTL 2.67e-01 -0.111 0.1 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000127125 PPCS -756159 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0945 0.082 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000171793 CTPS1 720270 sc-eQTL 4.12e-01 0.0597 0.0727 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000171960 PPIH -958465 sc-eQTL 8.65e-02 -0.155 0.0902 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000179862 CITED4 837595 sc-eQTL 6.47e-01 0.0283 0.0617 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000186409 CCDC30 -763263 sc-eQTL 8.79e-01 0.0174 0.114 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -635919 sc-eQTL 5.26e-01 0.051 0.0802 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000010803 SCMH1 457804 sc-eQTL 3.79e-02 -0.225 0.108 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000065978 YBX1 -982460 sc-eQTL 3.37e-02 0.144 0.0673 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -335967 sc-eQTL 3.64e-01 -0.105 0.115 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000127125 PPCS -756159 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00777 0.101 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000171793 CTPS1 720270 sc-eQTL 3.03e-02 0.207 0.0949 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000171960 PPIH -958465 sc-eQTL 1.25e-01 -0.159 0.103 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000179862 CITED4 837595 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0254 0.0819 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000186409 CCDC30 -763263 sc-eQTL 3.45e-02 -0.227 0.107 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -635919 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00677 0.0961 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000010803 SCMH1 457804 sc-eQTL 2.35e-03 0.331 0.107 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000065978 YBX1 -982460 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0062 0.0762 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -335967 sc-eQTL 8.38e-01 0.0211 0.103 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000127125 PPCS -756159 sc-eQTL 9.13e-01 0.01 0.0915 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000171793 CTPS1 720270 sc-eQTL 4.60e-01 0.0558 0.0754 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000171960 PPIH -958465 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0624 0.108 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000179862 CITED4 837595 sc-eQTL 6.14e-01 0.0479 0.0948 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000186409 CCDC30 -763263 sc-eQTL 4.76e-01 0.0838 0.117 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -635919 sc-eQTL 9.12e-01 0.0119 0.107 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000010803 SCMH1 457804 sc-eQTL 5.48e-01 0.0602 0.1 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000065978 YBX1 -982460 sc-eQTL 9.35e-01 0.00655 0.0797 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -335967 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0788 0.103 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000127125 PPCS -756159 sc-eQTL 9.62e-01 0.00495 0.104 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000171793 CTPS1 720270 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00729 0.0853 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000171960 PPIH -958465 sc-eQTL 2.63e-01 -0.103 0.0916 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000179862 CITED4 837595 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00187 0.0766 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000186409 CCDC30 -763263 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0265 0.114 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -635919 sc-eQTL 8.54e-01 0.0163 0.0888 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000010803 SCMH1 457804 sc-eQTL 7.01e-01 -0.046 0.12 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000065978 YBX1 -982460 sc-eQTL 2.03e-02 0.204 0.0872 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -335967 sc-eQTL 2.17e-01 -0.139 0.112 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000127125 PPCS -756159 sc-eQTL 8.90e-02 -0.191 0.112 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000171793 CTPS1 720270 sc-eQTL 7.98e-01 0.0266 0.104 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000171960 PPIH -958465 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0845 0.112 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000179862 CITED4 837595 sc-eQTL 6.84e-01 -0.036 0.0883 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000186409 CCDC30 -763263 sc-eQTL 1.83e-01 0.147 0.11 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -635919 sc-eQTL 2.38e-01 0.125 0.105 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000010803 SCMH1 457804 sc-eQTL 4.39e-01 0.0974 0.126 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000065978 YBX1 -982460 sc-eQTL 1.16e-01 -0.166 0.105 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -335967 sc-eQTL 7.10e-02 0.22 0.121 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000127125 PPCS -756159 sc-eQTL 9.78e-01 0.00323 0.119 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000171793 CTPS1 720270 sc-eQTL 1.83e-01 -0.151 0.113 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000171960 PPIH -958465 sc-eQTL 5.66e-01 0.0733 0.127 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000179862 CITED4 837595 sc-eQTL 4.37e-01 0.09 0.116 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000186409 CCDC30 -763263 sc-eQTL 9.73e-01 0.00364 0.107 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -635919 sc-eQTL 5.44e-02 0.229 0.118 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000010803 SCMH1 457804 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0846 0.104 0.212 MAIT L2
ENSG00000065978 YBX1 -982460 sc-eQTL 4.03e-01 0.0651 0.0776 0.212 MAIT L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -335967 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0738 0.109 0.212 MAIT L2
ENSG00000127125 PPCS -756159 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0348 0.102 0.212 MAIT L2
ENSG00000171793 CTPS1 720270 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0397 0.101 0.212 MAIT L2
ENSG00000171960 PPIH -958465 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0265 0.109 0.212 MAIT L2
ENSG00000179862 CITED4 837595 sc-eQTL 2.67e-01 -0.101 0.091 0.212 MAIT L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -635919 sc-eQTL 5.81e-03 -0.287 0.103 0.212 MAIT L2
ENSG00000010803 SCMH1 457804 sc-eQTL 9.07e-01 0.0128 0.109 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000065978 YBX1 -982460 sc-eQTL 9.43e-01 0.00589 0.0828 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -335967 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0842 0.109 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000127125 PPCS -756159 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0633 0.114 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000171793 CTPS1 720270 sc-eQTL 7.28e-02 -0.178 0.0988 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000171960 PPIH -958465 sc-eQTL 5.46e-01 0.0679 0.112 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000179862 CITED4 837595 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0585 0.104 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000186409 CCDC30 -763263 sc-eQTL 5.63e-01 0.0596 0.103 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -635919 sc-eQTL 4.99e-01 0.0707 0.105 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000010803 SCMH1 457804 sc-eQTL 7.30e-02 -0.185 0.103 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000065978 YBX1 -982460 sc-eQTL 9.01e-01 -0.00934 0.0747 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -335967 sc-eQTL 6.27e-01 0.0493 0.101 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000127125 PPCS -756159 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0623 0.101 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000171793 CTPS1 720270 sc-eQTL 4.39e-01 0.0567 0.0731 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000171960 PPIH -958465 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0883 0.0929 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000179862 CITED4 837595 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0969 0.0916 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000186409 CCDC30 -763263 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0748 0.109 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -635919 sc-eQTL 7.55e-01 0.0259 0.0828 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000010803 SCMH1 457804 sc-eQTL 5.41e-01 0.0703 0.115 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000065978 YBX1 -982460 sc-eQTL 3.86e-01 -0.082 0.0943 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -335967 sc-eQTL 1.36e-01 -0.177 0.118 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000127125 PPCS -756159 sc-eQTL 5.83e-02 0.216 0.113 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000171793 CTPS1 720270 sc-eQTL 5.70e-01 0.0597 0.105 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000171960 PPIH -958465 sc-eQTL 4.76e-01 0.0845 0.118 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000179862 CITED4 837595 sc-eQTL 9.47e-01 -0.0072 0.108 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000186409 CCDC30 -763263 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0297 0.105 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -635919 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0256 0.113 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000010803 SCMH1 457804 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0871 0.108 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000065978 YBX1 -982460 sc-eQTL 2.28e-01 0.0899 0.0744 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -335967 sc-eQTL 3.65e-01 0.1 0.11 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000127125 PPCS -756159 sc-eQTL 4.81e-02 0.191 0.0961 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000171793 CTPS1 720270 sc-eQTL 5.12e-01 0.0546 0.0832 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000171960 PPIH -958465 sc-eQTL 9.67e-01 0.00455 0.11 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000179862 CITED4 837595 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0713 0.0964 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000186409 CCDC30 -763263 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0991 0.112 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -635919 sc-eQTL 5.56e-01 0.0572 0.0968 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000010803 SCMH1 457804 sc-eQTL 4.91e-02 -0.33 0.166 0.204 PB L2
ENSG00000065978 YBX1 -982460 sc-eQTL 8.84e-01 0.0144 0.0979 0.204 PB L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -335967 sc-eQTL 8.90e-01 0.0207 0.149 0.204 PB L2
ENSG00000127125 PPCS -756159 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0439 0.15 0.204 PB L2
ENSG00000171793 CTPS1 720270 sc-eQTL 5.77e-01 0.0821 0.147 0.204 PB L2
ENSG00000171960 PPIH -958465 sc-eQTL 1.82e-01 0.16 0.119 0.204 PB L2
ENSG00000179862 CITED4 837595 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0424 0.13 0.204 PB L2
ENSG00000186409 CCDC30 -763263 sc-eQTL 7.40e-01 0.0412 0.124 0.204 PB L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -635919 sc-eQTL 8.55e-01 0.03 0.164 0.204 PB L2
ENSG00000010803 SCMH1 457804 sc-eQTL 3.42e-01 -0.104 0.109 0.213 Pro_T L2
ENSG00000065978 YBX1 -982460 sc-eQTL 8.19e-01 -0.017 0.0745 0.213 Pro_T L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -335967 sc-eQTL 9.21e-01 0.00929 0.0934 0.213 Pro_T L2
ENSG00000127125 PPCS -756159 sc-eQTL 3.31e-01 0.113 0.116 0.213 Pro_T L2
ENSG00000171793 CTPS1 720270 sc-eQTL 3.88e-02 0.211 0.101 0.213 Pro_T L2
ENSG00000171960 PPIH -958465 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0125 0.0876 0.213 Pro_T L2
ENSG00000179862 CITED4 837595 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0793 0.0962 0.213 Pro_T L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -635919 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0143 0.111 0.213 Pro_T L2
ENSG00000010803 SCMH1 457804 sc-eQTL 9.46e-01 0.00745 0.11 0.212 Treg L2
ENSG00000065978 YBX1 -982460 sc-eQTL 3.57e-01 0.0753 0.0815 0.212 Treg L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -335967 sc-eQTL 8.45e-01 0.0218 0.111 0.212 Treg L2
ENSG00000127125 PPCS -756159 sc-eQTL 2.03e-01 -0.148 0.116 0.212 Treg L2
ENSG00000171793 CTPS1 720270 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0551 0.11 0.212 Treg L2
ENSG00000171960 PPIH -958465 sc-eQTL 2.78e-01 -0.12 0.11 0.212 Treg L2
ENSG00000179862 CITED4 837595 sc-eQTL 8.73e-01 0.0112 0.07 0.212 Treg L2
ENSG00000186409 CCDC30 -763263 sc-eQTL 8.98e-01 0.0132 0.103 0.212 Treg L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -635919 sc-eQTL 8.02e-01 0.0246 0.0976 0.212 Treg L2
ENSG00000010803 SCMH1 457804 sc-eQTL 1.05e-01 -0.191 0.117 0.212 cDC L2
ENSG00000065978 YBX1 -982460 sc-eQTL 4.60e-01 0.0666 0.0899 0.212 cDC L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -335967 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0598 0.107 0.212 cDC L2
ENSG00000127125 PPCS -756159 sc-eQTL 1.74e-01 0.143 0.105 0.212 cDC L2
ENSG00000171793 CTPS1 720270 sc-eQTL 6.66e-01 0.0494 0.114 0.212 cDC L2
ENSG00000171960 PPIH -958465 sc-eQTL 3.57e-01 -0.104 0.112 0.212 cDC L2
ENSG00000179862 CITED4 837595 sc-eQTL 9.41e-01 0.0077 0.103 0.212 cDC L2
ENSG00000186409 CCDC30 -763263 sc-eQTL 3.40e-01 -0.099 0.104 0.212 cDC L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -635919 sc-eQTL 6.04e-01 0.0613 0.118 0.212 cDC L2
ENSG00000010803 SCMH1 457804 sc-eQTL 7.43e-01 0.0345 0.105 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000065978 YBX1 -982460 sc-eQTL 6.69e-01 0.0282 0.0661 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -335967 sc-eQTL 2.45e-01 0.0812 0.0697 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000127125 PPCS -756159 sc-eQTL 8.98e-01 0.00959 0.0745 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000171793 CTPS1 720270 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0449 0.113 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000171960 PPIH -958465 sc-eQTL 3.15e-01 -0.103 0.103 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000179862 CITED4 837595 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0721 0.0814 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -635919 sc-eQTL 1.76e-01 0.139 0.102 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000010803 SCMH1 457804 sc-eQTL 6.70e-01 0.0471 0.11 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000065978 YBX1 -982460 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0236 0.0692 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -335967 sc-eQTL 8.28e-01 0.017 0.0779 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000127125 PPCS -756159 sc-eQTL 1.87e-01 -0.129 0.0977 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000171793 CTPS1 720270 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00207 0.113 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000171960 PPIH -958465 sc-eQTL 7.83e-02 -0.195 0.11 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000179862 CITED4 837595 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00211 0.082 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -635919 sc-eQTL 9.04e-01 0.0131 0.108 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000010803 SCMH1 457804 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0349 0.134 0.236 gdT L2
ENSG00000065978 YBX1 -982460 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0764 0.113 0.236 gdT L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -335967 sc-eQTL 7.49e-01 0.0422 0.132 0.236 gdT L2
ENSG00000127125 PPCS -756159 sc-eQTL 7.98e-01 0.0354 0.138 0.236 gdT L2
ENSG00000171793 CTPS1 720270 sc-eQTL 7.00e-02 0.227 0.124 0.236 gdT L2
ENSG00000171960 PPIH -958465 sc-eQTL 3.56e-02 0.27 0.127 0.236 gdT L2
ENSG00000179862 CITED4 837595 sc-eQTL 8.84e-01 0.0189 0.129 0.236 gdT L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -635919 sc-eQTL 1.21e-01 0.201 0.129 0.236 gdT L2
ENSG00000010803 SCMH1 457804 sc-eQTL 4.56e-03 0.321 0.112 0.211 intMono L2
ENSG00000065978 YBX1 -982460 sc-eQTL 3.00e-01 0.0815 0.0785 0.211 intMono L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -335967 sc-eQTL 4.36e-01 0.071 0.091 0.211 intMono L2
ENSG00000127125 PPCS -756159 sc-eQTL 2.18e-01 -0.127 0.103 0.211 intMono L2
ENSG00000171793 CTPS1 720270 sc-eQTL 7.87e-01 0.0319 0.118 0.211 intMono L2
ENSG00000171960 PPIH -958465 sc-eQTL 9.83e-01 -0.0024 0.115 0.211 intMono L2
ENSG00000179862 CITED4 837595 sc-eQTL 3.51e-01 0.0906 0.0969 0.211 intMono L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -635919 sc-eQTL 2.57e-01 -0.135 0.119 0.211 intMono L2
ENSG00000010803 SCMH1 457804 sc-eQTL 9.93e-01 0.000939 0.108 0.213 ncMono L2
ENSG00000065978 YBX1 -982460 sc-eQTL 4.28e-01 0.0552 0.0695 0.213 ncMono L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -335967 sc-eQTL 2.15e-01 0.123 0.0986 0.213 ncMono L2
ENSG00000127125 PPCS -756159 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0821 0.107 0.213 ncMono L2
ENSG00000171793 CTPS1 720270 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0611 0.123 0.213 ncMono L2
ENSG00000171960 PPIH -958465 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0363 0.118 0.213 ncMono L2
ENSG00000179862 CITED4 837595 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00685 0.0862 0.213 ncMono L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -635919 sc-eQTL 3.24e-01 0.105 0.106 0.213 ncMono L2
ENSG00000010803 SCMH1 457804 sc-eQTL 2.89e-01 -0.124 0.117 0.218 pDC L2
ENSG00000065978 YBX1 -982460 sc-eQTL 6.13e-01 0.0438 0.0865 0.218 pDC L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -335967 sc-eQTL 4.41e-01 -0.1 0.13 0.218 pDC L2
ENSG00000127125 PPCS -756159 sc-eQTL 9.26e-01 0.0116 0.124 0.218 pDC L2
ENSG00000171793 CTPS1 720270 sc-eQTL 1.56e-01 -0.149 0.105 0.218 pDC L2
ENSG00000171960 PPIH -958465 sc-eQTL 9.20e-01 0.0125 0.125 0.218 pDC L2
ENSG00000179862 CITED4 837595 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0295 0.105 0.218 pDC L2
ENSG00000186409 CCDC30 -763263 sc-eQTL 6.70e-01 0.0465 0.109 0.218 pDC L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -635919 sc-eQTL 3.47e-01 -0.134 0.142 0.218 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000010803 SCMH1 457804 sc-eQTL 3.42e-01 -0.103 0.108 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000065978 YBX1 -982460 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00173 0.0733 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000127124 HIVEP3 -335967 sc-eQTL 9.43e-01 0.00717 0.1 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000127125 PPCS -756159 sc-eQTL 9.81e-01 0.00243 0.0998 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171793 CTPS1 720270 sc-eQTL 4.88e-02 -0.189 0.0954 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171960 PPIH -958465 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0273 0.0939 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000179862 CITED4 837595 sc-eQTL 5.78e-01 0.0564 0.101 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186409 CCDC30 -763263 sc-eQTL 3.40e-01 -0.11 0.115 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198815 FOXJ3 -635919 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0324 0.0897 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000010803 SCMH1 457804 sc-eQTL 3.51e-01 0.0923 0.0988 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000065978 YBX1 -982460 sc-eQTL 6.66e-01 0.0277 0.064 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000127124 HIVEP3 -335967 sc-eQTL 9.28e-01 0.0094 0.103 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000127125 PPCS -756159 sc-eQTL 1.51e-01 -0.136 0.0945 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171793 CTPS1 720270 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0675 0.0799 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171960 PPIH -958465 sc-eQTL 1.59e-01 -0.126 0.0894 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000179862 CITED4 837595 sc-eQTL 5.30e-01 0.0517 0.0822 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186409 CCDC30 -763263 sc-eQTL 7.92e-02 -0.187 0.106 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198815 FOXJ3 -635919 sc-eQTL 9.78e-02 -0.145 0.0871 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000010803 SCMH1 457804 sc-eQTL 7.20e-01 0.0349 0.0974 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000065978 YBX1 -982460 sc-eQTL 7.75e-01 0.018 0.0627 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000127124 HIVEP3 -335967 sc-eQTL 4.87e-01 0.0446 0.0642 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000127125 PPCS -756159 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0299 0.0713 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171793 CTPS1 720270 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0597 0.108 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171960 PPIH -958465 sc-eQTL 1.57e-01 -0.138 0.0974 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000179862 CITED4 837595 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0551 0.078 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198815 FOXJ3 -635919 sc-eQTL 2.51e-01 0.109 0.0942 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000010803 SCMH1 457804 sc-eQTL 5.94e-02 0.209 0.11 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000065978 YBX1 -982460 sc-eQTL 4.85e-01 0.0486 0.0695 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000127124 HIVEP3 -335967 sc-eQTL 2.09e-01 0.111 0.0883 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000127125 PPCS -756159 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0869 0.101 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171793 CTPS1 720270 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0768 0.121 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171960 PPIH -958465 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0774 0.11 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000179862 CITED4 837595 sc-eQTL 7.89e-01 0.0205 0.0763 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198815 FOXJ3 -635919 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0403 0.106 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000010803 SCMH1 457804 sc-eQTL 1.50e-01 -0.145 0.1 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000065978 YBX1 -982460 sc-eQTL 6.17e-01 0.0341 0.068 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000127124 HIVEP3 -335967 sc-eQTL 7.56e-01 0.03 0.0962 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000127125 PPCS -756159 sc-eQTL 3.45e-01 0.0822 0.0868 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000171793 CTPS1 720270 sc-eQTL 3.69e-01 0.0646 0.0716 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000171960 PPIH -958465 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0542 0.0877 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000179862 CITED4 837595 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0877 0.0891 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186409 CCDC30 -763263 sc-eQTL 1.30e-01 -0.162 0.107 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198815 FOXJ3 -635919 sc-eQTL 4.47e-01 0.0557 0.0732 0.211 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000117013 KCNQ4 916171 eQTL 1.42e-02 0.109 0.0442 0.0 0.0 0.204
ENSG00000197273 GUCA2A -464787 pQTL 0.0497 0.0516 0.0263 0.0 0.0 0.206

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina