logo

Genes within 1Mb (chr1:41418962:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000010803 SCMH1 176808 sc-eQTL 3.02e-01 0.174 0.168 0.051 B L1
ENSG00000066136 NFYC 727314 sc-eQTL 6.54e-01 0.0632 0.141 0.051 B L1
ENSG00000117010 ZNF684 887389 sc-eQTL 4.14e-01 0.139 0.17 0.051 B L1
ENSG00000127124 HIVEP3 -616963 sc-eQTL 2.23e-01 0.177 0.144 0.051 B L1
ENSG00000164002 EXO5 910221 sc-eQTL 9.57e-01 -0.0106 0.195 0.051 B L1
ENSG00000171793 CTPS1 439274 sc-eQTL 3.20e-01 -0.125 0.126 0.051 B L1
ENSG00000179862 CITED4 556599 sc-eQTL 2.11e-01 -0.174 0.138 0.051 B L1
ENSG00000187815 ZFP69 941672 sc-eQTL 1.39e-01 0.238 0.16 0.051 B L1
ENSG00000198815 FOXJ3 -916915 sc-eQTL 4.27e-01 -0.104 0.13 0.051 B L1
ENSG00000272145 NFYC-AS1 726896 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00905 0.176 0.051 B L1
ENSG00000010803 SCMH1 176808 sc-eQTL 4.29e-01 -0.115 0.146 0.051 CD4T L1
ENSG00000066136 NFYC 727314 sc-eQTL 2.81e-01 0.163 0.151 0.051 CD4T L1
ENSG00000117010 ZNF684 887389 sc-eQTL 8.58e-01 0.0326 0.182 0.051 CD4T L1
ENSG00000127124 HIVEP3 -616963 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0402 0.165 0.051 CD4T L1
ENSG00000164002 EXO5 910221 sc-eQTL 1.58e-01 0.282 0.199 0.051 CD4T L1
ENSG00000171793 CTPS1 439274 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0468 0.0907 0.051 CD4T L1
ENSG00000179862 CITED4 556599 sc-eQTL 2.08e-01 -0.121 0.0957 0.051 CD4T L1
ENSG00000187801 ZFP69B 968860 sc-eQTL 8.74e-01 0.0268 0.169 0.051 CD4T L1
ENSG00000187815 ZFP69 941672 sc-eQTL 3.38e-01 -0.141 0.146 0.051 CD4T L1
ENSG00000198815 FOXJ3 -916915 sc-eQTL 2.59e-01 0.138 0.122 0.051 CD4T L1
ENSG00000272145 NFYC-AS1 726896 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0382 0.168 0.051 CD4T L1
ENSG00000010803 SCMH1 176808 sc-eQTL 2.30e-01 0.177 0.147 0.051 CD8T L1
ENSG00000066136 NFYC 727314 sc-eQTL 1.42e-01 -0.263 0.178 0.051 CD8T L1
ENSG00000117010 ZNF684 887389 sc-eQTL 8.24e-01 -0.038 0.171 0.051 CD8T L1
ENSG00000127124 HIVEP3 -616963 sc-eQTL 3.08e-01 0.105 0.102 0.051 CD8T L1
ENSG00000164002 EXO5 910221 sc-eQTL 8.16e-01 0.0437 0.187 0.051 CD8T L1
ENSG00000171793 CTPS1 439274 sc-eQTL 7.38e-01 0.0364 0.109 0.051 CD8T L1
ENSG00000179862 CITED4 556599 sc-eQTL 1.68e-01 -0.124 0.0894 0.051 CD8T L1
ENSG00000187801 ZFP69B 968860 sc-eQTL 3.52e-01 -0.148 0.159 0.051 CD8T L1
ENSG00000187815 ZFP69 941672 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00591 0.143 0.051 CD8T L1
ENSG00000198815 FOXJ3 -916915 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0797 0.128 0.051 CD8T L1
ENSG00000272145 NFYC-AS1 726896 sc-eQTL 8.88e-01 -0.029 0.205 0.051 CD8T L1
ENSG00000010803 SCMH1 176808 sc-eQTL 6.40e-01 0.0793 0.169 0.052 DC L1
ENSG00000066136 NFYC 727314 sc-eQTL 5.36e-02 0.337 0.173 0.052 DC L1
ENSG00000117010 ZNF684 887389 sc-eQTL 5.76e-01 -0.106 0.189 0.052 DC L1
ENSG00000117016 RIMS3 753280 sc-eQTL 1.68e-01 0.195 0.141 0.052 DC L1
ENSG00000127124 HIVEP3 -616963 sc-eQTL 1.48e-01 -0.262 0.18 0.052 DC L1
ENSG00000164002 EXO5 910221 sc-eQTL 4.10e-02 -0.342 0.166 0.052 DC L1
ENSG00000171793 CTPS1 439274 sc-eQTL 5.32e-01 0.0919 0.147 0.052 DC L1
ENSG00000179862 CITED4 556599 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0103 0.152 0.052 DC L1
ENSG00000187815 ZFP69 941672 sc-eQTL 6.40e-01 0.0809 0.173 0.052 DC L1
ENSG00000198815 FOXJ3 -916915 sc-eQTL 3.12e-01 -0.194 0.191 0.052 DC L1
ENSG00000272145 NFYC-AS1 726896 sc-eQTL 4.42e-01 -0.146 0.189 0.052 DC L1
ENSG00000010803 SCMH1 176808 sc-eQTL 1.29e-01 0.252 0.165 0.051 Mono L1
ENSG00000066136 NFYC 727314 sc-eQTL 2.39e-01 0.183 0.155 0.051 Mono L1
ENSG00000117010 ZNF684 887389 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0982 0.149 0.051 Mono L1
ENSG00000127124 HIVEP3 -616963 sc-eQTL 1.96e-01 0.145 0.112 0.051 Mono L1
ENSG00000171793 CTPS1 439274 sc-eQTL 2.12e-01 -0.235 0.188 0.051 Mono L1
ENSG00000179862 CITED4 556599 sc-eQTL 7.40e-02 -0.227 0.127 0.051 Mono L1
ENSG00000187815 ZFP69 941672 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00636 0.171 0.051 Mono L1
ENSG00000198815 FOXJ3 -916915 sc-eQTL 4.60e-01 0.111 0.15 0.051 Mono L1
ENSG00000272145 NFYC-AS1 726896 sc-eQTL 3.45e-01 -0.169 0.178 0.051 Mono L1
ENSG00000010803 SCMH1 176808 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00629 0.161 0.051 Other_T L1
ENSG00000066136 NFYC 727314 sc-eQTL 8.88e-02 0.269 0.158 0.051 Other_T L1
ENSG00000117010 ZNF684 887389 sc-eQTL 9.44e-03 -0.449 0.171 0.051 Other_T L1
ENSG00000127124 HIVEP3 -616963 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0583 0.136 0.051 Other_T L1
ENSG00000164002 EXO5 910221 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0154 0.195 0.051 Other_T L1
ENSG00000171793 CTPS1 439274 sc-eQTL 6.75e-01 0.0547 0.13 0.051 Other_T L1
ENSG00000179862 CITED4 556599 sc-eQTL 1.57e-02 0.357 0.147 0.051 Other_T L1
ENSG00000187801 ZFP69B 968860 sc-eQTL 7.41e-01 0.0607 0.184 0.051 Other_T L1
ENSG00000187815 ZFP69 941672 sc-eQTL 3.00e-01 0.18 0.173 0.051 Other_T L1
ENSG00000198815 FOXJ3 -916915 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0685 0.162 0.051 Other_T L1
ENSG00000272145 NFYC-AS1 726896 sc-eQTL 8.42e-02 0.353 0.203 0.051 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000010803 SCMH1 176808 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00245 0.189 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000066136 NFYC 727314 sc-eQTL 8.21e-01 0.0399 0.176 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000117010 ZNF684 887389 sc-eQTL 3.08e-01 0.186 0.182 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -616963 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0641 0.173 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000164002 EXO5 910221 sc-eQTL 4.12e-01 -0.161 0.196 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000171793 CTPS1 439274 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0938 0.17 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000179862 CITED4 556599 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0383 0.173 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000187815 ZFP69 941672 sc-eQTL 5.43e-02 0.336 0.174 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -916915 sc-eQTL 1.41e-01 -0.252 0.171 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000272145 NFYC-AS1 726896 sc-eQTL 1.48e-01 0.268 0.184 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000010803 SCMH1 176808 sc-eQTL 6.00e-01 0.1 0.191 0.052 B_Memory L2
ENSG00000066136 NFYC 727314 sc-eQTL 9.34e-01 0.0153 0.184 0.052 B_Memory L2
ENSG00000117010 ZNF684 887389 sc-eQTL 9.18e-02 0.33 0.195 0.052 B_Memory L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -616963 sc-eQTL 9.98e-02 0.308 0.186 0.052 B_Memory L2
ENSG00000164002 EXO5 910221 sc-eQTL 6.74e-01 0.084 0.2 0.052 B_Memory L2
ENSG00000171793 CTPS1 439274 sc-eQTL 2.19e-01 -0.22 0.178 0.052 B_Memory L2
ENSG00000179862 CITED4 556599 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0765 0.171 0.052 B_Memory L2
ENSG00000187815 ZFP69 941672 sc-eQTL 8.83e-01 -0.027 0.184 0.052 B_Memory L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -916915 sc-eQTL 2.16e-01 -0.228 0.184 0.052 B_Memory L2
ENSG00000272145 NFYC-AS1 726896 sc-eQTL 9.80e-01 0.00469 0.186 0.052 B_Memory L2
ENSG00000010803 SCMH1 176808 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0332 0.185 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000066136 NFYC 727314 sc-eQTL 6.72e-01 0.0743 0.175 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000117010 ZNF684 887389 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0838 0.182 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -616963 sc-eQTL 5.21e-01 0.119 0.185 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000164002 EXO5 910221 sc-eQTL 7.28e-01 0.0708 0.203 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000171793 CTPS1 439274 sc-eQTL 5.06e-01 -0.1 0.15 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000179862 CITED4 556599 sc-eQTL 1.47e-01 -0.216 0.148 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000187815 ZFP69 941672 sc-eQTL 4.96e-01 0.124 0.182 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -916915 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0772 0.158 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000272145 NFYC-AS1 726896 sc-eQTL 5.01e-01 -0.129 0.192 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000010803 SCMH1 176808 sc-eQTL 2.92e-01 0.205 0.194 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000066136 NFYC 727314 sc-eQTL 9.90e-01 0.00238 0.193 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000117010 ZNF684 887389 sc-eQTL 8.99e-01 0.025 0.197 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -616963 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0845 0.185 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000164002 EXO5 910221 sc-eQTL 8.68e-01 0.0329 0.198 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000171793 CTPS1 439274 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0967 0.179 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000179862 CITED4 556599 sc-eQTL 1.53e-01 -0.235 0.164 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000187815 ZFP69 941672 sc-eQTL 6.19e-01 0.0955 0.192 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -916915 sc-eQTL 9.94e-01 0.00132 0.176 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000272145 NFYC-AS1 726896 sc-eQTL 4.65e-01 0.14 0.191 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000010803 SCMH1 176808 sc-eQTL 1.09e-01 -0.302 0.188 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000066136 NFYC 727314 sc-eQTL 4.56e-01 -0.142 0.191 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000117010 ZNF684 887389 sc-eQTL 5.66e-01 0.0987 0.172 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -616963 sc-eQTL 6.53e-01 -0.069 0.153 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000164002 EXO5 910221 sc-eQTL 5.16e-01 -0.116 0.179 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000171793 CTPS1 439274 sc-eQTL 2.43e-01 0.205 0.175 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000179862 CITED4 556599 sc-eQTL 3.05e-02 -0.324 0.149 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000187801 ZFP69B 968860 sc-eQTL 2.02e-01 -0.207 0.162 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000187815 ZFP69 941672 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0597 0.176 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -916915 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0936 0.186 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000272145 NFYC-AS1 726896 sc-eQTL 4.99e-01 0.121 0.179 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000010803 SCMH1 176808 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0257 0.159 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000066136 NFYC 727314 sc-eQTL 2.63e-01 0.2 0.178 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000117010 ZNF684 887389 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0536 0.198 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -616963 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0759 0.193 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000164002 EXO5 910221 sc-eQTL 7.61e-01 0.0599 0.197 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000171793 CTPS1 439274 sc-eQTL 2.17e-01 -0.126 0.102 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000179862 CITED4 556599 sc-eQTL 1.97e-01 -0.142 0.109 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000187801 ZFP69B 968860 sc-eQTL 9.55e-01 0.0103 0.182 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000187815 ZFP69 941672 sc-eQTL 3.85e-01 -0.141 0.161 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -916915 sc-eQTL 3.68e-01 0.114 0.126 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000272145 NFYC-AS1 726896 sc-eQTL 9.23e-01 -0.018 0.186 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000010803 SCMH1 176808 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0511 0.178 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000066136 NFYC 727314 sc-eQTL 1.97e-01 0.227 0.175 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000117010 ZNF684 887389 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0796 0.206 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -616963 sc-eQTL 5.03e-01 -0.115 0.171 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000164002 EXO5 910221 sc-eQTL 3.78e-01 0.179 0.203 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000171793 CTPS1 439274 sc-eQTL 6.01e-01 0.0651 0.124 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000179862 CITED4 556599 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0539 0.105 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000187801 ZFP69B 968860 sc-eQTL 8.39e-01 0.0398 0.195 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000187815 ZFP69 941672 sc-eQTL 7.77e-01 0.0474 0.167 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -916915 sc-eQTL 8.57e-01 0.0247 0.137 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000272145 NFYC-AS1 726896 sc-eQTL 7.33e-01 0.0638 0.187 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000010803 SCMH1 176808 sc-eQTL 6.42e-01 0.0856 0.184 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000066136 NFYC 727314 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0286 0.2 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000117010 ZNF684 887389 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00203 0.187 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -616963 sc-eQTL 7.18e-02 0.352 0.194 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000164002 EXO5 910221 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0362 0.192 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000171793 CTPS1 439274 sc-eQTL 8.01e-01 0.041 0.163 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000179862 CITED4 556599 sc-eQTL 2.60e-02 -0.308 0.137 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000187801 ZFP69B 968860 sc-eQTL 7.68e-01 0.0533 0.18 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000187815 ZFP69 941672 sc-eQTL 1.32e-01 0.271 0.179 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -916915 sc-eQTL 4.15e-01 0.133 0.163 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000272145 NFYC-AS1 726896 sc-eQTL 6.79e-01 0.0766 0.185 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000010803 SCMH1 176808 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0931 0.181 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000066136 NFYC 727314 sc-eQTL 5.58e-01 0.112 0.19 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000117010 ZNF684 887389 sc-eQTL 2.56e-01 -0.217 0.191 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -616963 sc-eQTL 1.89e-01 0.222 0.169 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000164002 EXO5 910221 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0818 0.189 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000171793 CTPS1 439274 sc-eQTL 4.91e-01 0.0857 0.124 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000179862 CITED4 556599 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0558 0.156 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000187801 ZFP69B 968860 sc-eQTL 1.40e-01 -0.269 0.182 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000187815 ZFP69 941672 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0397 0.162 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -916915 sc-eQTL 9.16e-01 0.0186 0.177 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000272145 NFYC-AS1 726896 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0707 0.19 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000010803 SCMH1 176808 sc-eQTL 7.76e-02 0.301 0.17 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000066136 NFYC 727314 sc-eQTL 1.92e-02 -0.426 0.181 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000117010 ZNF684 887389 sc-eQTL 4.71e-01 0.139 0.192 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -616963 sc-eQTL 9.05e-01 -0.021 0.176 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000164002 EXO5 910221 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0426 0.198 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000171793 CTPS1 439274 sc-eQTL 5.38e-01 0.0897 0.146 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000179862 CITED4 556599 sc-eQTL 5.76e-02 -0.248 0.13 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000187801 ZFP69B 968860 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0341 0.176 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000187815 ZFP69 941672 sc-eQTL 6.91e-01 0.0702 0.176 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -916915 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00731 0.152 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000272145 NFYC-AS1 726896 sc-eQTL 4.12e-01 -0.166 0.202 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000010803 SCMH1 176808 sc-eQTL 8.55e-01 0.0361 0.198 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000066136 NFYC 727314 sc-eQTL 7.03e-01 0.0756 0.198 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000117010 ZNF684 887389 sc-eQTL 5.78e-01 0.105 0.188 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -616963 sc-eQTL 2.30e-01 0.224 0.185 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000164002 EXO5 910221 sc-eQTL 8.63e-01 -0.033 0.191 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000171793 CTPS1 439274 sc-eQTL 7.91e-01 0.0453 0.171 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000179862 CITED4 556599 sc-eQTL 3.59e-01 -0.134 0.146 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000187801 ZFP69B 968860 sc-eQTL 3.82e-01 -0.157 0.179 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000187815 ZFP69 941672 sc-eQTL 3.06e-01 -0.186 0.181 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -916915 sc-eQTL 1.48e-02 -0.422 0.172 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000272145 NFYC-AS1 726896 sc-eQTL 9.53e-01 0.0107 0.18 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000010803 SCMH1 176808 sc-eQTL 3.87e-01 0.172 0.199 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000066136 NFYC 727314 sc-eQTL 6.01e-01 -0.106 0.203 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000117010 ZNF684 887389 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0511 0.195 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -616963 sc-eQTL 2.60e-02 0.429 0.191 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000164002 EXO5 910221 sc-eQTL 3.97e-01 0.161 0.189 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000171793 CTPS1 439274 sc-eQTL 4.24e-01 0.144 0.18 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000179862 CITED4 556599 sc-eQTL 2.24e-01 -0.223 0.183 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000187801 ZFP69B 968860 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0405 0.178 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000187815 ZFP69 941672 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0498 0.193 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -916915 sc-eQTL 3.28e-01 -0.185 0.189 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000272145 NFYC-AS1 726896 sc-eQTL 1.85e-01 0.252 0.189 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000010803 SCMH1 176808 sc-eQTL 6.20e-01 0.087 0.175 0.052 MAIT L2
ENSG00000066136 NFYC 727314 sc-eQTL 9.26e-02 0.329 0.195 0.052 MAIT L2
ENSG00000117010 ZNF684 887389 sc-eQTL 2.94e-01 -0.2 0.19 0.052 MAIT L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -616963 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0581 0.184 0.052 MAIT L2
ENSG00000164002 EXO5 910221 sc-eQTL 6.83e-01 0.078 0.191 0.052 MAIT L2
ENSG00000171793 CTPS1 439274 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0934 0.169 0.052 MAIT L2
ENSG00000179862 CITED4 556599 sc-eQTL 9.02e-02 0.26 0.153 0.052 MAIT L2
ENSG00000187801 ZFP69B 968860 sc-eQTL 9.11e-01 0.02 0.179 0.052 MAIT L2
ENSG00000187815 ZFP69 941672 sc-eQTL 2.33e-01 0.218 0.182 0.052 MAIT L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -916915 sc-eQTL 4.37e-01 -0.138 0.176 0.052 MAIT L2
ENSG00000272145 NFYC-AS1 726896 sc-eQTL 3.21e-01 0.191 0.191 0.052 MAIT L2
ENSG00000010803 SCMH1 176808 sc-eQTL 3.89e-01 0.161 0.187 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000066136 NFYC 727314 sc-eQTL 8.42e-01 0.0408 0.204 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000117010 ZNF684 887389 sc-eQTL 3.30e-01 0.188 0.193 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -616963 sc-eQTL 1.40e-01 0.277 0.187 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000164002 EXO5 910221 sc-eQTL 4.02e-01 -0.157 0.187 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000171793 CTPS1 439274 sc-eQTL 3.41e-01 0.162 0.17 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000179862 CITED4 556599 sc-eQTL 1.20e-01 -0.276 0.177 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000187815 ZFP69 941672 sc-eQTL 1.26e-01 0.29 0.189 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -916915 sc-eQTL 2.94e-02 -0.388 0.177 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000272145 NFYC-AS1 726896 sc-eQTL 7.72e-01 0.0546 0.188 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000010803 SCMH1 176808 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0958 0.193 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000066136 NFYC 727314 sc-eQTL 5.80e-02 0.385 0.202 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000117010 ZNF684 887389 sc-eQTL 7.82e-01 0.055 0.199 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -616963 sc-eQTL 9.36e-01 0.016 0.199 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000164002 EXO5 910221 sc-eQTL 4.93e-01 0.138 0.2 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000171793 CTPS1 439274 sc-eQTL 2.25e-01 -0.214 0.176 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000179862 CITED4 556599 sc-eQTL 3.90e-01 -0.156 0.182 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000187815 ZFP69 941672 sc-eQTL 8.56e-01 0.0351 0.193 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -916915 sc-eQTL 3.02e-01 -0.196 0.189 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000272145 NFYC-AS1 726896 sc-eQTL 8.89e-01 0.0274 0.197 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000010803 SCMH1 176808 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0752 0.183 0.052 Pro_T L2
ENSG00000066136 NFYC 727314 sc-eQTL 5.51e-01 0.105 0.176 0.052 Pro_T L2
ENSG00000117010 ZNF684 887389 sc-eQTL 1.56e-02 -0.436 0.179 0.052 Pro_T L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -616963 sc-eQTL 4.08e-01 -0.13 0.157 0.052 Pro_T L2
ENSG00000164002 EXO5 910221 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0703 0.194 0.052 Pro_T L2
ENSG00000171793 CTPS1 439274 sc-eQTL 3.09e-01 0.175 0.172 0.052 Pro_T L2
ENSG00000179862 CITED4 556599 sc-eQTL 5.47e-01 0.0976 0.162 0.052 Pro_T L2
ENSG00000187801 ZFP69B 968860 sc-eQTL 4.05e-01 0.134 0.16 0.052 Pro_T L2
ENSG00000187815 ZFP69 941672 sc-eQTL 2.90e-01 0.194 0.182 0.052 Pro_T L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -916915 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0145 0.187 0.052 Pro_T L2
ENSG00000272145 NFYC-AS1 726896 sc-eQTL 8.55e-01 0.0328 0.179 0.052 Pro_T L2
ENSG00000010803 SCMH1 176808 sc-eQTL 2.81e-01 -0.198 0.183 0.051 Treg L2
ENSG00000066136 NFYC 727314 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0761 0.193 0.051 Treg L2
ENSG00000117010 ZNF684 887389 sc-eQTL 4.51e-01 0.148 0.195 0.051 Treg L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -616963 sc-eQTL 4.62e-01 -0.137 0.185 0.051 Treg L2
ENSG00000164002 EXO5 910221 sc-eQTL 3.84e-02 0.405 0.195 0.051 Treg L2
ENSG00000171793 CTPS1 439274 sc-eQTL 7.99e-01 0.0467 0.184 0.051 Treg L2
ENSG00000179862 CITED4 556599 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0214 0.117 0.051 Treg L2
ENSG00000187801 ZFP69B 968860 sc-eQTL 8.20e-01 -0.04 0.176 0.051 Treg L2
ENSG00000187815 ZFP69 941672 sc-eQTL 6.21e-01 -0.087 0.175 0.051 Treg L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -916915 sc-eQTL 6.95e-01 0.0639 0.163 0.051 Treg L2
ENSG00000272145 NFYC-AS1 726896 sc-eQTL 4.86e-01 -0.137 0.197 0.051 Treg L2
ENSG00000010803 SCMH1 176808 sc-eQTL 5.44e-01 0.109 0.179 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000066136 NFYC 727314 sc-eQTL 4.23e-01 0.134 0.167 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000117010 ZNF684 887389 sc-eQTL 3.56e-01 -0.151 0.163 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -616963 sc-eQTL 1.89e-01 0.156 0.119 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000171793 CTPS1 439274 sc-eQTL 2.79e-01 -0.208 0.192 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000179862 CITED4 556599 sc-eQTL 2.41e-01 -0.163 0.138 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000187815 ZFP69 941672 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0979 0.197 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -916915 sc-eQTL 6.54e-01 0.0783 0.175 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000272145 NFYC-AS1 726896 sc-eQTL 3.05e-01 -0.201 0.195 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000010803 SCMH1 176808 sc-eQTL 1.12e-01 0.297 0.186 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000066136 NFYC 727314 sc-eQTL 9.46e-02 0.299 0.178 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000117010 ZNF684 887389 sc-eQTL 2.08e-01 -0.213 0.169 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -616963 sc-eQTL 3.51e-01 0.124 0.132 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000171793 CTPS1 439274 sc-eQTL 2.36e-01 -0.228 0.192 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000179862 CITED4 556599 sc-eQTL 1.21e-01 -0.216 0.139 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000187815 ZFP69 941672 sc-eQTL 7.06e-01 0.0709 0.187 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -916915 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0891 0.183 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000272145 NFYC-AS1 726896 sc-eQTL 8.25e-01 0.0417 0.188 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000010803 SCMH1 176808 sc-eQTL 2.27e-01 0.276 0.227 0.055 gdT L2
ENSG00000066136 NFYC 727314 sc-eQTL 3.17e-01 0.253 0.252 0.055 gdT L2
ENSG00000117010 ZNF684 887389 sc-eQTL 5.83e-01 -0.125 0.227 0.055 gdT L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -616963 sc-eQTL 1.47e-01 0.325 0.223 0.055 gdT L2
ENSG00000164002 EXO5 910221 sc-eQTL 6.14e-01 0.117 0.231 0.055 gdT L2
ENSG00000171793 CTPS1 439274 sc-eQTL 1.43e-01 0.314 0.213 0.055 gdT L2
ENSG00000179862 CITED4 556599 sc-eQTL 1.53e-01 0.314 0.219 0.055 gdT L2
ENSG00000187801 ZFP69B 968860 sc-eQTL 1.96e-01 -0.278 0.214 0.055 gdT L2
ENSG00000187815 ZFP69 941672 sc-eQTL 3.78e-01 0.204 0.231 0.055 gdT L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -916915 sc-eQTL 9.37e-01 0.0176 0.222 0.055 gdT L2
ENSG00000272145 NFYC-AS1 726896 sc-eQTL 8.57e-03 0.59 0.221 0.055 gdT L2
ENSG00000010803 SCMH1 176808 sc-eQTL 3.47e-01 0.185 0.196 0.051 intMono L2
ENSG00000066136 NFYC 727314 sc-eQTL 3.31e-01 -0.2 0.205 0.051 intMono L2
ENSG00000117010 ZNF684 887389 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0326 0.192 0.051 intMono L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -616963 sc-eQTL 1.45e-01 0.228 0.156 0.051 intMono L2
ENSG00000171793 CTPS1 439274 sc-eQTL 7.40e-01 0.0673 0.202 0.051 intMono L2
ENSG00000179862 CITED4 556599 sc-eQTL 3.32e-01 0.162 0.167 0.051 intMono L2
ENSG00000187815 ZFP69 941672 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0581 0.184 0.051 intMono L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -916915 sc-eQTL 7.70e-01 0.0599 0.205 0.051 intMono L2
ENSG00000272145 NFYC-AS1 726896 sc-eQTL 5.35e-01 -0.121 0.194 0.051 intMono L2
ENSG00000010803 SCMH1 176808 sc-eQTL 6.37e-01 0.0962 0.204 0.051 pDC L2
ENSG00000066136 NFYC 727314 sc-eQTL 5.35e-01 0.143 0.23 0.051 pDC L2
ENSG00000117010 ZNF684 887389 sc-eQTL 9.40e-01 0.0161 0.212 0.051 pDC L2
ENSG00000117016 RIMS3 753280 sc-eQTL 1.80e-01 0.253 0.188 0.051 pDC L2
ENSG00000127124 HIVEP3 -616963 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0221 0.226 0.051 pDC L2
ENSG00000164002 EXO5 910221 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0967 0.188 0.051 pDC L2
ENSG00000171793 CTPS1 439274 sc-eQTL 2.37e-01 0.217 0.182 0.051 pDC L2
ENSG00000179862 CITED4 556599 sc-eQTL 4.32e-01 0.144 0.183 0.051 pDC L2
ENSG00000187815 ZFP69 941672 sc-eQTL 4.24e-01 -0.156 0.194 0.051 pDC L2
ENSG00000198815 FOXJ3 -916915 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0512 0.248 0.051 pDC L2
ENSG00000272145 NFYC-AS1 726896 sc-eQTL 5.99e-03 -0.538 0.193 0.051 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000010803 SCMH1 176808 sc-eQTL 5.92e-01 0.0989 0.184 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000066136 NFYC 727314 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0793 0.174 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000117010 ZNF684 887389 sc-eQTL 3.99e-02 0.401 0.194 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000127124 HIVEP3 -616963 sc-eQTL 4.91e-02 0.333 0.168 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164002 EXO5 910221 sc-eQTL 4.06e-01 -0.169 0.203 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171793 CTPS1 439274 sc-eQTL 3.62e-01 -0.149 0.163 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000179862 CITED4 556599 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0535 0.172 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187815 ZFP69 941672 sc-eQTL 7.65e-02 0.32 0.18 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198815 FOXJ3 -916915 sc-eQTL 2.28e-01 -0.183 0.152 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000272145 NFYC-AS1 726896 sc-eQTL 3.61e-01 0.174 0.19 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000010803 SCMH1 176808 sc-eQTL 3.28e-01 0.168 0.171 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000066136 NFYC 727314 sc-eQTL 3.61e-01 0.15 0.164 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000117010 ZNF684 887389 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0385 0.185 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000127124 HIVEP3 -616963 sc-eQTL 7.47e-01 0.0578 0.179 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164002 EXO5 910221 sc-eQTL 9.34e-01 0.0164 0.198 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171793 CTPS1 439274 sc-eQTL 2.23e-01 -0.169 0.138 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000179862 CITED4 556599 sc-eQTL 1.69e-01 -0.196 0.142 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187815 ZFP69 941672 sc-eQTL 3.24e-01 0.175 0.177 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198815 FOXJ3 -916915 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0667 0.152 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000272145 NFYC-AS1 726896 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0923 0.18 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000010803 SCMH1 176808 sc-eQTL 3.26e-01 0.163 0.165 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000066136 NFYC 727314 sc-eQTL 1.33e-01 0.239 0.158 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000117010 ZNF684 887389 sc-eQTL 1.28e-01 -0.239 0.156 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000127124 HIVEP3 -616963 sc-eQTL 2.04e-01 0.139 0.109 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171793 CTPS1 439274 sc-eQTL 1.16e-01 -0.288 0.183 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000179862 CITED4 556599 sc-eQTL 9.32e-02 -0.223 0.132 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000187815 ZFP69 941672 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0815 0.186 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198815 FOXJ3 -916915 sc-eQTL 8.98e-01 0.0207 0.161 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000272145 NFYC-AS1 726896 sc-eQTL 5.46e-01 -0.114 0.189 0.051 CD14_Mono LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000117013 KCNQ4 635175 eQTL 1.68e-02 -0.189 0.0789 0.00124 0.0 0.0496
ENSG00000117016 RIMS3 753280 eQTL 1.13e-02 -0.171 0.0672 0.0 0.0 0.0496

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000117013 KCNQ4 635175 3.07e-07 1.53e-07 4.98e-08 2.24e-07 9.25e-08 8.37e-08 2.24e-07 5.37e-08 1.45e-07 5.42e-08 1.61e-07 1.05e-07 3.18e-07 8e-08 7.98e-08 7.36e-08 4.45e-08 1.56e-07 6.07e-08 4.92e-08 1.19e-07 1.26e-07 1.58e-07 3.23e-08 1.98e-07 1.25e-07 1.1e-07 9.74e-08 1.31e-07 1.06e-07 1.09e-07 4.78e-08 4.34e-08 9.58e-08 3.12e-08 2.99e-08 4.28e-08 8.63e-08 6.67e-08 5.24e-08 3.92e-08 2.43e-07 3.53e-08 1.25e-08 7.26e-08 1.71e-08 1.21e-07 1.91e-09 4.79e-08
ENSG00000171793 \N 439627 9.36e-07 6.78e-07 8.9e-08 4.43e-07 1.11e-07 2.67e-07 6.19e-07 7.12e-08 2.81e-07 1.7e-07 8.58e-07 3.27e-07 1.48e-06 1.58e-07 4.37e-07 1.46e-07 3.75e-07 3.79e-07 1.5e-07 1.32e-07 1.35e-07 3.1e-07 3.45e-07 5.11e-08 8.33e-07 2.32e-07 1.97e-07 1.95e-07 3.86e-07 6.35e-07 3.38e-07 4.28e-08 4.83e-08 1.56e-07 3.55e-07 6.18e-08 1.11e-07 6.67e-08 6.29e-08 2.22e-08 4.42e-08 1.3e-06 6.24e-08 1.74e-08 3.41e-08 1.31e-08 1.03e-07 3.25e-09 4.61e-08
ENSG00000198815 \N -916915 2.64e-07 1.1e-07 3.69e-08 1.82e-07 9.65e-08 9.57e-08 1.42e-07 5.21e-08 1.42e-07 4.24e-08 1.56e-07 8.03e-08 1.41e-07 6.21e-08 5.99e-08 8.01e-08 4.63e-08 1.14e-07 5.19e-08 4.03e-08 1.05e-07 1.3e-07 1.26e-07 4.67e-08 1.31e-07 1.15e-07 1.12e-07 8.7e-08 1.02e-07 1.12e-07 9.58e-08 3.87e-08 3.56e-08 8.65e-08 8.99e-08 4.02e-08 4.89e-08 9.44e-08 7.92e-08 3.18e-08 3.8e-08 1.35e-07 5.08e-08 1.76e-08 1.01e-07 1.68e-08 1.26e-07 4.09e-09 4.85e-08