logo

Genes within 1Mb (chr1:34619913:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000020129 NCDN -937560 sc-eQTL 8.40e-01 0.0417 0.206 0.052 DC L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -309737 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0145 0.191 0.052 DC L1
ENSG00000116560 SFPQ -573232 sc-eQTL 8.96e-01 0.0155 0.119 0.052 DC L1
ENSG00000142687 KIAA0319L -938037 sc-eQTL 2.30e-01 -0.239 0.199 0.052 DC L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -648796 sc-eQTL 7.36e-01 0.0594 0.176 0.052 DC L1
ENSG00000163866 SMIM12 -239842 sc-eQTL 4.28e-01 -0.149 0.188 0.052 DC L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -412032 sc-eQTL 1.29e-01 0.27 0.177 0.052 DC L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -412259 sc-eQTL 2.46e-01 0.225 0.193 0.052 DC L1
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -746164 sc-eQTL 4.91e-01 -0.14 0.203 0.052 DC L1
ENSG00000239636 AC004865.2 -957816 sc-eQTL 6.77e-01 0.0836 0.201 0.052 DC L1
ENSG00000243749 TMEM35B -365440 sc-eQTL 4.04e-01 -0.143 0.171 0.052 DC L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000020129 NCDN -937560 sc-eQTL 4.05e-01 -0.179 0.214 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -309737 sc-eQTL 8.20e-01 0.0454 0.199 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000116560 SFPQ -573232 sc-eQTL 3.22e-01 0.142 0.143 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000142687 KIAA0319L -938037 sc-eQTL 6.01e-01 0.114 0.218 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -648796 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0377 0.216 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000163866 SMIM12 -239842 sc-eQTL 1.65e-01 0.282 0.203 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -412032 sc-eQTL 1.20e-01 0.343 0.219 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -412259 sc-eQTL 9.29e-01 0.0199 0.223 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -746164 sc-eQTL 4.55e-01 -0.15 0.2 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000239636 AC004865.2 -957816 sc-eQTL 6.02e-01 -0.104 0.2 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000243749 TMEM35B -365440 sc-eQTL 9.95e-01 0.00105 0.169 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000020129 NCDN -937560 sc-eQTL 3.51e-01 0.195 0.208 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -309737 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00806 0.205 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000116560 SFPQ -573232 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0529 0.117 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000142687 KIAA0319L -938037 sc-eQTL 3.57e-01 -0.173 0.188 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -648796 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0601 0.201 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -239842 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0889 0.2 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -412032 sc-eQTL 2.15e-01 0.271 0.218 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -412259 sc-eQTL 3.77e-01 0.177 0.2 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -746164 sc-eQTL 4.88e-01 -0.132 0.189 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000239636 AC004865.2 -957816 sc-eQTL 9.65e-02 0.328 0.196 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000243749 TMEM35B -365440 sc-eQTL 1.50e-01 0.232 0.16 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000020129 NCDN -937560 sc-eQTL 4.44e-01 0.167 0.218 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -309737 sc-eQTL 8.15e-03 -0.5 0.187 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000116560 SFPQ -573232 sc-eQTL 5.98e-01 0.0638 0.121 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000142687 KIAA0319L -938037 sc-eQTL 5.36e-01 0.127 0.206 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -648796 sc-eQTL 5.20e-01 0.138 0.214 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -239842 sc-eQTL 6.92e-02 -0.384 0.21 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -412032 sc-eQTL 4.45e-01 -0.161 0.21 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -412259 sc-eQTL 3.19e-01 0.196 0.196 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -746164 sc-eQTL 1.07e-01 -0.306 0.189 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000239636 AC004865.2 -957816 sc-eQTL 1.13e-01 0.318 0.199 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000243749 TMEM35B -365440 sc-eQTL 4.97e-01 -0.103 0.151 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000020129 NCDN -937560 sc-eQTL 3.06e-01 -0.202 0.197 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -309737 sc-eQTL 7.54e-01 0.0597 0.19 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000116560 SFPQ -573232 sc-eQTL 2.36e-01 -0.166 0.14 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000142687 KIAA0319L -938037 sc-eQTL 5.82e-01 0.112 0.203 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -648796 sc-eQTL 3.67e-01 0.174 0.192 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000163866 SMIM12 -239842 sc-eQTL 5.64e-01 -0.117 0.202 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -412032 sc-eQTL 5.08e-02 0.411 0.209 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -412259 sc-eQTL 7.59e-01 0.0611 0.199 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -746164 sc-eQTL 6.65e-02 -0.332 0.18 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000239636 AC004865.2 -957816 sc-eQTL 2.04e-01 0.263 0.206 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000243749 TMEM35B -365440 sc-eQTL 2.42e-01 0.194 0.166 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000020129 NCDN -937560 sc-eQTL 9.52e-01 -0.0118 0.197 0.05 Pro_T L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -309737 sc-eQTL 9.56e-01 -0.0101 0.184 0.05 Pro_T L2
ENSG00000116560 SFPQ -573232 sc-eQTL 1.28e-01 0.213 0.139 0.05 Pro_T L2
ENSG00000142687 KIAA0319L -938037 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0874 0.215 0.05 Pro_T L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -648796 sc-eQTL 1.61e-01 0.293 0.208 0.05 Pro_T L2
ENSG00000163866 SMIM12 -239842 sc-eQTL 7.93e-02 -0.352 0.199 0.05 Pro_T L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -412032 sc-eQTL 2.64e-01 0.243 0.217 0.05 Pro_T L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -412259 sc-eQTL 2.54e-01 -0.207 0.181 0.05 Pro_T L2
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -746164 sc-eQTL 6.42e-03 -0.521 0.189 0.05 Pro_T L2
ENSG00000239636 AC004865.2 -957816 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0655 0.195 0.05 Pro_T L2
ENSG00000243749 TMEM35B -365440 sc-eQTL 8.26e-01 -0.036 0.164 0.05 Pro_T L2
ENSG00000020129 NCDN -937560 sc-eQTL 6.73e-01 0.0875 0.207 0.054 cDC L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -309737 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0398 0.206 0.054 cDC L2
ENSG00000116560 SFPQ -573232 sc-eQTL 2.87e-01 -0.139 0.13 0.054 cDC L2
ENSG00000142687 KIAA0319L -938037 sc-eQTL 1.23e-01 -0.311 0.2 0.054 cDC L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -648796 sc-eQTL 5.26e-01 0.113 0.178 0.054 cDC L2
ENSG00000163866 SMIM12 -239842 sc-eQTL 3.65e-01 -0.177 0.195 0.054 cDC L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -412032 sc-eQTL 5.29e-01 0.129 0.204 0.054 cDC L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -412259 sc-eQTL 9.33e-02 0.324 0.192 0.054 cDC L2
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -746164 sc-eQTL 7.23e-01 0.0682 0.193 0.054 cDC L2
ENSG00000239636 AC004865.2 -957816 sc-eQTL 8.33e-01 0.0427 0.202 0.054 cDC L2
ENSG00000243749 TMEM35B -365440 sc-eQTL 3.90e-01 -0.164 0.191 0.054 cDC L2
ENSG00000020129 NCDN -937560 sc-eQTL 9.43e-01 0.0172 0.24 0.055 gdT L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -309737 sc-eQTL 2.18e-02 0.53 0.228 0.055 gdT L2
ENSG00000116560 SFPQ -573232 sc-eQTL 7.74e-01 0.044 0.153 0.055 gdT L2
ENSG00000142687 KIAA0319L -938037 sc-eQTL 5.27e-01 0.147 0.232 0.055 gdT L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -648796 sc-eQTL 9.50e-01 0.0142 0.224 0.055 gdT L2
ENSG00000163866 SMIM12 -239842 sc-eQTL 3.83e-01 -0.212 0.242 0.055 gdT L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -412032 sc-eQTL 7.55e-01 0.0787 0.252 0.055 gdT L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -412259 sc-eQTL 3.43e-01 0.214 0.225 0.055 gdT L2
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -746164 sc-eQTL 8.30e-01 0.046 0.214 0.055 gdT L2
ENSG00000239636 AC004865.2 -957816 sc-eQTL 7.63e-01 0.0631 0.209 0.055 gdT L2
ENSG00000243749 TMEM35B -365440 sc-eQTL 2.96e-01 -0.186 0.178 0.055 gdT L2
ENSG00000020129 NCDN -937560 sc-eQTL 7.91e-01 0.0559 0.211 0.059 pDC L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -309737 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0328 0.206 0.059 pDC L2
ENSG00000116560 SFPQ -573232 sc-eQTL 4.57e-01 0.101 0.135 0.059 pDC L2
ENSG00000142687 KIAA0319L -938037 sc-eQTL 6.74e-01 0.0961 0.228 0.059 pDC L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -648796 sc-eQTL 2.02e-01 -0.263 0.205 0.059 pDC L2
ENSG00000163866 SMIM12 -239842 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0778 0.215 0.059 pDC L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -412032 sc-eQTL 3.05e-02 0.413 0.189 0.059 pDC L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -412259 sc-eQTL 8.83e-01 0.0293 0.198 0.059 pDC L2
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -746164 sc-eQTL 1.18e-01 -0.311 0.198 0.059 pDC L2
ENSG00000239636 AC004865.2 -957816 sc-eQTL 2.52e-01 0.247 0.214 0.059 pDC L2
ENSG00000243749 TMEM35B -365440 sc-eQTL 2.84e-01 -0.189 0.176 0.059 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000230163 \N -230781 1.58e-06 1.48e-06 2.5e-07 1.27e-06 4.89e-07 6.46e-07 1.21e-06 4.25e-07 1.72e-06 7.18e-07 2.01e-06 1.3e-06 2.62e-06 3.95e-07 3.66e-07 1.04e-06 1.16e-06 1.16e-06 5.34e-07 5.9e-07 6.12e-07 1.83e-06 1.42e-06 8.29e-07 2.43e-06 9.84e-07 1.06e-06 1.05e-06 1.68e-06 1.26e-06 8.15e-07 2.31e-07 2.88e-07 7.05e-07 7.04e-07 6.22e-07 7.08e-07 3.63e-07 5.07e-07 2.29e-07 3.2e-07 2.01e-06 2.87e-07 1.38e-07 3.97e-07 2.73e-07 3.5e-07 1.43e-07 2.8e-07