Genes within 1Mb (chr1:34540057:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116544 DLGAP3 -389593 sc-eQTL 1.05e-01 -0.265 0.163 0.071 B L1
ENSG00000116560 SFPQ -653088 sc-eQTL 4.55e-01 0.0466 0.0622 0.071 B L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -728652 sc-eQTL 3.64e-01 0.0984 0.108 0.071 B L1
ENSG00000163866 SMIM12 -319698 sc-eQTL 3.06e-01 0.142 0.139 0.071 B L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -491888 sc-eQTL 5.55e-01 0.0901 0.152 0.071 B L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -492115 sc-eQTL 3.48e-01 -0.138 0.147 0.071 B L1
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -826020 sc-eQTL 4.16e-01 0.0987 0.121 0.071 B L1
ENSG00000243749 TMEM35B -445296 sc-eQTL 9.17e-01 0.0093 0.0889 0.071 B L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -389593 sc-eQTL 5.97e-01 0.0711 0.134 0.071 CD4T L1
ENSG00000116560 SFPQ -653088 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0475 0.0515 0.071 CD4T L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -728652 sc-eQTL 8.91e-01 0.0124 0.0905 0.071 CD4T L1
ENSG00000163866 SMIM12 -319698 sc-eQTL 9.64e-01 0.00515 0.113 0.071 CD4T L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -491888 sc-eQTL 3.13e-01 0.14 0.139 0.071 CD4T L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -492115 sc-eQTL 9.09e-01 0.0109 0.0955 0.071 CD4T L1
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -826020 sc-eQTL 5.53e-01 0.0621 0.104 0.071 CD4T L1
ENSG00000243749 TMEM35B -445296 sc-eQTL 4.31e-01 0.0488 0.0619 0.071 CD4T L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -389593 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0819 0.157 0.071 CD8T L1
ENSG00000116560 SFPQ -653088 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0604 0.0542 0.071 CD8T L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -728652 sc-eQTL 2.27e-01 -0.146 0.12 0.071 CD8T L1
ENSG00000163866 SMIM12 -319698 sc-eQTL 9.32e-01 0.0112 0.13 0.071 CD8T L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -491888 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0344 0.16 0.071 CD8T L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -492115 sc-eQTL 2.18e-01 -0.169 0.137 0.071 CD8T L1
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -826020 sc-eQTL 8.07e-01 0.0295 0.12 0.071 CD8T L1
ENSG00000243749 TMEM35B -445296 sc-eQTL 5.13e-01 0.0519 0.0791 0.071 CD8T L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -389593 sc-eQTL 1.16e-01 -0.245 0.155 0.068 DC L1
ENSG00000116560 SFPQ -653088 sc-eQTL 2.48e-01 -0.112 0.097 0.068 DC L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -728652 sc-eQTL 3.52e-01 0.134 0.144 0.068 DC L1
ENSG00000163866 SMIM12 -319698 sc-eQTL 6.06e-01 0.0798 0.154 0.068 DC L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -491888 sc-eQTL 9.54e-01 0.0085 0.146 0.068 DC L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -492115 sc-eQTL 3.98e-01 0.135 0.159 0.068 DC L1
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -826020 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0627 0.167 0.068 DC L1
ENSG00000243749 TMEM35B -445296 sc-eQTL 2.99e-01 0.146 0.14 0.068 DC L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -389593 sc-eQTL 4.87e-01 0.107 0.153 0.071 Mono L1
ENSG00000116560 SFPQ -653088 sc-eQTL 5.40e-01 0.0485 0.079 0.071 Mono L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -728652 sc-eQTL 7.48e-01 -0.031 0.0964 0.071 Mono L1
ENSG00000163866 SMIM12 -319698 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0976 0.116 0.071 Mono L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -491888 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0473 0.115 0.071 Mono L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -492115 sc-eQTL 2.46e-01 -0.152 0.131 0.071 Mono L1
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -826020 sc-eQTL 9.29e-01 0.0117 0.131 0.071 Mono L1
ENSG00000243749 TMEM35B -445296 sc-eQTL 3.66e-02 -0.231 0.11 0.071 Mono L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -389593 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0738 0.166 0.069 NK L1
ENSG00000116560 SFPQ -653088 sc-eQTL 6.90e-01 -0.03 0.075 0.069 NK L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -728652 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00844 0.0963 0.069 NK L1
ENSG00000163866 SMIM12 -319698 sc-eQTL 2.13e-02 0.331 0.143 0.069 NK L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -491888 sc-eQTL 8.15e-01 -0.037 0.158 0.069 NK L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -492115 sc-eQTL 1.95e-01 0.19 0.146 0.069 NK L1
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -826020 sc-eQTL 1.41e-02 0.314 0.127 0.069 NK L1
ENSG00000243749 TMEM35B -445296 sc-eQTL 2.09e-01 0.0947 0.0751 0.069 NK L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -389593 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0417 0.165 0.071 Other_T L1
ENSG00000116560 SFPQ -653088 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0911 0.0853 0.071 Other_T L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -728652 sc-eQTL 8.46e-01 0.0263 0.135 0.071 Other_T L1
ENSG00000163866 SMIM12 -319698 sc-eQTL 2.09e-01 0.175 0.139 0.071 Other_T L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -491888 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0575 0.167 0.071 Other_T L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -492115 sc-eQTL 2.24e-01 0.171 0.14 0.071 Other_T L1
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -826020 sc-eQTL 4.79e-01 -0.104 0.147 0.071 Other_T L1
ENSG00000243749 TMEM35B -445296 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00782 0.0921 0.071 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116544 DLGAP3 -389593 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0895 0.143 0.074 B_Activated L2
ENSG00000116560 SFPQ -653088 sc-eQTL 9.77e-01 -0.0032 0.111 0.074 B_Activated L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -728652 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0678 0.186 0.074 B_Activated L2
ENSG00000163866 SMIM12 -319698 sc-eQTL 1.98e-01 0.241 0.186 0.074 B_Activated L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -491888 sc-eQTL 3.51e-01 0.174 0.186 0.074 B_Activated L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -492115 sc-eQTL 1.14e-01 0.245 0.154 0.074 B_Activated L2
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -826020 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0227 0.155 0.074 B_Activated L2
ENSG00000243749 TMEM35B -445296 sc-eQTL 5.57e-01 0.0902 0.153 0.074 B_Activated L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -389593 sc-eQTL 2.62e-01 -0.182 0.162 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000116560 SFPQ -653088 sc-eQTL 8.24e-01 0.0198 0.0891 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -728652 sc-eQTL 5.62e-01 0.0828 0.142 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000163866 SMIM12 -319698 sc-eQTL 1.97e-01 0.217 0.167 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -491888 sc-eQTL 1.20e-01 -0.256 0.164 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -492115 sc-eQTL 8.93e-01 -0.023 0.171 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -826020 sc-eQTL 3.56e-01 -0.147 0.158 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000243749 TMEM35B -445296 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0699 0.127 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -389593 sc-eQTL 3.16e-01 -0.157 0.156 0.069 B_Memory L2
ENSG00000116560 SFPQ -653088 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0322 0.1 0.069 B_Memory L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -728652 sc-eQTL 4.33e-01 -0.122 0.155 0.069 B_Memory L2
ENSG00000163866 SMIM12 -319698 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0666 0.167 0.069 B_Memory L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -491888 sc-eQTL 1.88e-01 -0.229 0.174 0.069 B_Memory L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -492115 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0335 0.167 0.069 B_Memory L2
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -826020 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0368 0.159 0.069 B_Memory L2
ENSG00000243749 TMEM35B -445296 sc-eQTL 5.18e-01 0.0788 0.122 0.069 B_Memory L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -389593 sc-eQTL 1.94e-01 -0.212 0.162 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000116560 SFPQ -653088 sc-eQTL 8.10e-01 0.0181 0.0751 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -728652 sc-eQTL 1.61e-01 0.182 0.129 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000163866 SMIM12 -319698 sc-eQTL 1.90e-01 0.208 0.158 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -491888 sc-eQTL 6.30e-03 0.444 0.161 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -492115 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00243 0.154 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -826020 sc-eQTL 6.21e-01 0.0736 0.149 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000243749 TMEM35B -445296 sc-eQTL 9.95e-02 0.196 0.118 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -389593 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0138 0.183 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000116560 SFPQ -653088 sc-eQTL 1.46e-01 0.139 0.0949 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -728652 sc-eQTL 6.40e-01 0.0698 0.149 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000163866 SMIM12 -319698 sc-eQTL 9.77e-01 0.00506 0.179 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -491888 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0371 0.179 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -492115 sc-eQTL 4.69e-02 -0.335 0.167 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -826020 sc-eQTL 4.38e-01 0.117 0.151 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000243749 TMEM35B -445296 sc-eQTL 3.22e-01 0.121 0.122 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -389593 sc-eQTL 3.03e-01 -0.165 0.159 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000116560 SFPQ -653088 sc-eQTL 8.65e-01 0.0196 0.115 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -728652 sc-eQTL 8.25e-01 0.0383 0.173 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000163866 SMIM12 -319698 sc-eQTL 7.96e-02 0.286 0.162 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -491888 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0756 0.177 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -492115 sc-eQTL 3.01e-01 -0.185 0.178 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -826020 sc-eQTL 5.03e-01 -0.108 0.161 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000243749 TMEM35B -445296 sc-eQTL 2.10e-01 -0.17 0.135 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -389593 sc-eQTL 2.95e-01 0.163 0.155 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000116560 SFPQ -653088 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0202 0.0541 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -728652 sc-eQTL 5.20e-01 0.0631 0.098 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000163866 SMIM12 -319698 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00815 0.11 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -491888 sc-eQTL 3.50e-01 0.139 0.148 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -492115 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00421 0.113 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -826020 sc-eQTL 2.39e-01 0.137 0.116 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000243749 TMEM35B -445296 sc-eQTL 6.61e-02 0.124 0.0669 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -389593 sc-eQTL 6.88e-01 0.055 0.137 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000116560 SFPQ -653088 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0435 0.0647 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -728652 sc-eQTL 4.38e-01 0.0947 0.122 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -319698 sc-eQTL 7.48e-01 -0.046 0.143 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -491888 sc-eQTL 9.70e-01 0.00603 0.161 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -492115 sc-eQTL 9.97e-01 0.000534 0.129 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -826020 sc-eQTL 3.16e-01 -0.136 0.136 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000243749 TMEM35B -445296 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0809 0.0734 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -389593 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0919 0.169 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000116560 SFPQ -653088 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0897 0.0761 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -728652 sc-eQTL 4.72e-02 -0.309 0.155 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -319698 sc-eQTL 4.59e-01 -0.117 0.158 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -491888 sc-eQTL 3.43e-01 -0.155 0.163 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -492115 sc-eQTL 2.93e-01 0.167 0.159 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -826020 sc-eQTL 7.86e-02 -0.283 0.16 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000243749 TMEM35B -445296 sc-eQTL 2.90e-01 -0.107 0.101 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -389593 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0225 0.165 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000116560 SFPQ -653088 sc-eQTL 1.39e-01 -0.13 0.0875 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -728652 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0336 0.134 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000163866 SMIM12 -319698 sc-eQTL 9.08e-02 0.269 0.158 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -491888 sc-eQTL 7.35e-01 0.0574 0.169 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -492115 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0261 0.147 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -826020 sc-eQTL 6.35e-01 0.0725 0.152 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000243749 TMEM35B -445296 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0252 0.1 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -389593 sc-eQTL 9.01e-01 0.0212 0.171 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000116560 SFPQ -653088 sc-eQTL 9.06e-01 0.00804 0.0677 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -728652 sc-eQTL 2.52e-01 -0.142 0.124 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000163866 SMIM12 -319698 sc-eQTL 3.93e-01 -0.121 0.142 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -491888 sc-eQTL 6.74e-02 -0.304 0.165 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -492115 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00222 0.157 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -826020 sc-eQTL 9.74e-01 0.00441 0.136 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000243749 TMEM35B -445296 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0815 0.0917 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -389593 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0746 0.167 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000116560 SFPQ -653088 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0213 0.0948 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -728652 sc-eQTL 6.48e-01 0.0747 0.164 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -319698 sc-eQTL 4.21e-01 0.131 0.162 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -491888 sc-eQTL 5.62e-02 0.339 0.176 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -492115 sc-eQTL 8.36e-01 0.0339 0.163 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -826020 sc-eQTL 6.01e-01 0.0806 0.154 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000243749 TMEM35B -445296 sc-eQTL 4.97e-01 0.0891 0.131 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -389593 sc-eQTL 3.92e-01 -0.143 0.166 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000116560 SFPQ -653088 sc-eQTL 2.68e-01 -0.117 0.105 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -728652 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0791 0.187 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -319698 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0951 0.185 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -491888 sc-eQTL 5.68e-01 0.105 0.184 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -492115 sc-eQTL 6.96e-01 -0.067 0.172 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -826020 sc-eQTL 4.84e-01 0.116 0.166 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000243749 TMEM35B -445296 sc-eQTL 6.11e-01 -0.067 0.132 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -389593 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0465 0.161 0.071 MAIT L2
ENSG00000116560 SFPQ -653088 sc-eQTL 7.95e-01 -0.022 0.0847 0.071 MAIT L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -728652 sc-eQTL 7.20e-01 0.0543 0.152 0.071 MAIT L2
ENSG00000163866 SMIM12 -319698 sc-eQTL 6.29e-01 0.0783 0.162 0.071 MAIT L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -491888 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0701 0.168 0.071 MAIT L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -492115 sc-eQTL 1.41e-01 0.236 0.16 0.071 MAIT L2
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -826020 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0352 0.151 0.071 MAIT L2
ENSG00000243749 TMEM35B -445296 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0937 0.123 0.071 MAIT L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -389593 sc-eQTL 5.93e-01 0.089 0.166 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000116560 SFPQ -653088 sc-eQTL 5.90e-01 0.0588 0.109 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -728652 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0527 0.154 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000163866 SMIM12 -319698 sc-eQTL 6.20e-01 0.091 0.183 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -491888 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0374 0.182 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -492115 sc-eQTL 8.07e-03 0.427 0.16 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -826020 sc-eQTL 4.43e-02 0.318 0.157 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000243749 TMEM35B -445296 sc-eQTL 9.04e-01 0.0171 0.142 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -389593 sc-eQTL 2.45e-01 -0.188 0.161 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000116560 SFPQ -653088 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0098 0.0884 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -728652 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0199 0.117 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000163866 SMIM12 -319698 sc-eQTL 2.56e-02 0.346 0.154 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -491888 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00842 0.165 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -492115 sc-eQTL 9.76e-01 0.00463 0.156 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -826020 sc-eQTL 2.15e-01 0.171 0.138 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000243749 TMEM35B -445296 sc-eQTL 9.14e-02 0.152 0.0898 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -389593 sc-eQTL 9.04e-01 0.0193 0.16 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000116560 SFPQ -653088 sc-eQTL 3.76e-01 -0.105 0.118 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -728652 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0678 0.162 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000163866 SMIM12 -319698 sc-eQTL 3.15e-01 0.171 0.17 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -491888 sc-eQTL 3.73e-01 0.158 0.177 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -492115 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0456 0.168 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -826020 sc-eQTL 9.90e-01 -0.0019 0.153 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000243749 TMEM35B -445296 sc-eQTL 9.48e-03 0.361 0.138 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -389593 sc-eQTL 6.06e-01 0.0873 0.169 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000116560 SFPQ -653088 sc-eQTL 9.30e-01 0.0087 0.0991 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -728652 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0614 0.127 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000163866 SMIM12 -319698 sc-eQTL 9.21e-01 0.0153 0.153 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -491888 sc-eQTL 2.39e-01 -0.207 0.175 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -492115 sc-eQTL 5.00e-01 0.109 0.161 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -826020 sc-eQTL 9.81e-01 -0.0036 0.154 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000243749 TMEM35B -445296 sc-eQTL 2.41e-01 -0.107 0.0912 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -389593 sc-eQTL 5.28e-01 -0.165 0.261 0.052 PB L2
ENSG00000116560 SFPQ -653088 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00645 0.151 0.052 PB L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -728652 sc-eQTL 1.58e-01 -0.396 0.279 0.052 PB L2
ENSG00000163866 SMIM12 -319698 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0447 0.239 0.052 PB L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -491888 sc-eQTL 1.72e-01 -0.385 0.28 0.052 PB L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -492115 sc-eQTL 9.65e-02 -0.406 0.242 0.052 PB L2
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -826020 sc-eQTL 7.85e-01 0.0677 0.248 0.052 PB L2
ENSG00000243749 TMEM35B -445296 sc-eQTL 3.19e-01 -0.235 0.235 0.052 PB L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -389593 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00774 0.146 0.072 Pro_T L2
ENSG00000116560 SFPQ -653088 sc-eQTL 2.90e-01 -0.117 0.111 0.072 Pro_T L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -728652 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0215 0.165 0.072 Pro_T L2
ENSG00000163866 SMIM12 -319698 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0761 0.159 0.072 Pro_T L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -491888 sc-eQTL 8.88e-01 0.0244 0.172 0.072 Pro_T L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -492115 sc-eQTL 6.97e-01 -0.056 0.144 0.072 Pro_T L2
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -826020 sc-eQTL 4.12e-01 -0.125 0.152 0.072 Pro_T L2
ENSG00000243749 TMEM35B -445296 sc-eQTL 9.44e-01 0.00913 0.129 0.072 Pro_T L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -389593 sc-eQTL 6.22e-02 -0.313 0.167 0.071 Treg L2
ENSG00000116560 SFPQ -653088 sc-eQTL 2.19e-01 -0.101 0.0817 0.071 Treg L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -728652 sc-eQTL 5.80e-01 0.0824 0.149 0.071 Treg L2
ENSG00000163866 SMIM12 -319698 sc-eQTL 4.48e-01 -0.124 0.163 0.071 Treg L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -491888 sc-eQTL 3.15e-01 0.177 0.176 0.071 Treg L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -492115 sc-eQTL 8.02e-01 0.0377 0.15 0.071 Treg L2
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -826020 sc-eQTL 2.47e-01 -0.182 0.157 0.071 Treg L2
ENSG00000243749 TMEM35B -445296 sc-eQTL 3.45e-01 0.112 0.119 0.071 Treg L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -389593 sc-eQTL 3.86e-01 -0.157 0.181 0.068 cDC L2
ENSG00000116560 SFPQ -653088 sc-eQTL 1.07e-01 -0.185 0.114 0.068 cDC L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -728652 sc-eQTL 4.48e-01 0.119 0.157 0.068 cDC L2
ENSG00000163866 SMIM12 -319698 sc-eQTL 4.67e-01 0.125 0.171 0.068 cDC L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -491888 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0571 0.18 0.068 cDC L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -492115 sc-eQTL 4.66e-02 0.337 0.168 0.068 cDC L2
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -826020 sc-eQTL 2.80e-01 0.183 0.169 0.068 cDC L2
ENSG00000243749 TMEM35B -445296 sc-eQTL 2.07e-02 0.387 0.166 0.068 cDC L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -389593 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0347 0.165 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000116560 SFPQ -653088 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0355 0.0846 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -728652 sc-eQTL 2.94e-01 -0.116 0.11 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000163866 SMIM12 -319698 sc-eQTL 7.64e-01 0.0384 0.128 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -491888 sc-eQTL 9.12e-01 0.0144 0.13 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -492115 sc-eQTL 7.18e-02 -0.27 0.149 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -826020 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0349 0.146 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000243749 TMEM35B -445296 sc-eQTL 6.38e-02 -0.229 0.123 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -389593 sc-eQTL 7.99e-01 0.0425 0.167 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000116560 SFPQ -653088 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0151 0.0935 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -728652 sc-eQTL 9.83e-01 0.00271 0.125 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000163866 SMIM12 -319698 sc-eQTL 6.01e-02 -0.275 0.146 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -491888 sc-eQTL 4.85e-01 -0.108 0.155 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -492115 sc-eQTL 9.87e-01 0.00246 0.151 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -826020 sc-eQTL 4.73e-01 0.11 0.153 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000243749 TMEM35B -445296 sc-eQTL 9.53e-02 -0.221 0.132 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -389593 sc-eQTL 5.76e-01 -0.107 0.191 0.073 gdT L2
ENSG00000116560 SFPQ -653088 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0995 0.126 0.073 gdT L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -728652 sc-eQTL 2.23e-01 -0.225 0.183 0.073 gdT L2
ENSG00000163866 SMIM12 -319698 sc-eQTL 3.88e-01 0.172 0.199 0.073 gdT L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -491888 sc-eQTL 8.16e-01 0.0483 0.207 0.073 gdT L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -492115 sc-eQTL 2.95e-01 0.194 0.185 0.073 gdT L2
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -826020 sc-eQTL 8.16e-01 0.0411 0.176 0.073 gdT L2
ENSG00000243749 TMEM35B -445296 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00536 0.146 0.073 gdT L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -389593 sc-eQTL 2.57e-01 0.183 0.161 0.069 intMono L2
ENSG00000116560 SFPQ -653088 sc-eQTL 1.19e-01 0.193 0.123 0.069 intMono L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -728652 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0191 0.157 0.069 intMono L2
ENSG00000163866 SMIM12 -319698 sc-eQTL 5.22e-02 -0.32 0.164 0.069 intMono L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -491888 sc-eQTL 4.96e-01 -0.116 0.17 0.069 intMono L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -492115 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0403 0.15 0.069 intMono L2
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -826020 sc-eQTL 8.81e-01 0.023 0.154 0.069 intMono L2
ENSG00000243749 TMEM35B -445296 sc-eQTL 5.22e-01 0.0936 0.146 0.069 intMono L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -389593 sc-eQTL 3.80e-01 0.127 0.144 0.07 ncMono L2
ENSG00000116560 SFPQ -653088 sc-eQTL 6.32e-01 0.0631 0.131 0.07 ncMono L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -728652 sc-eQTL 6.28e-01 0.0682 0.141 0.07 ncMono L2
ENSG00000163866 SMIM12 -319698 sc-eQTL 1.55e-01 0.224 0.157 0.07 ncMono L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -491888 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0859 0.163 0.07 ncMono L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -492115 sc-eQTL 7.47e-01 0.05 0.155 0.07 ncMono L2
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -826020 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0158 0.151 0.07 ncMono L2
ENSG00000243749 TMEM35B -445296 sc-eQTL 2.77e-02 -0.329 0.148 0.07 ncMono L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -389593 sc-eQTL 7.21e-01 0.065 0.182 0.068 pDC L2
ENSG00000116560 SFPQ -653088 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0188 0.119 0.068 pDC L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -728652 sc-eQTL 3.69e-01 0.163 0.181 0.068 pDC L2
ENSG00000163866 SMIM12 -319698 sc-eQTL 5.89e-01 -0.102 0.189 0.068 pDC L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -491888 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0642 0.169 0.068 pDC L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -492115 sc-eQTL 5.41e-01 0.107 0.174 0.068 pDC L2
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -826020 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0308 0.176 0.068 pDC L2
ENSG00000243749 TMEM35B -445296 sc-eQTL 5.18e-01 0.1 0.155 0.068 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116544 DLGAP3 -389593 sc-eQTL 1.36e-01 -0.246 0.164 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116560 SFPQ -653088 sc-eQTL 7.68e-01 0.0224 0.0757 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146463 ZMYM4 -728652 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0206 0.129 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -319698 sc-eQTL 4.30e-01 0.127 0.161 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000163867 ZMYM6 -491888 sc-eQTL 8.42e-02 -0.268 0.155 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197056 ZMYM1 -492115 sc-eQTL 8.04e-01 0.0414 0.166 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -826020 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0287 0.149 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243749 TMEM35B -445296 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00333 0.105 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -389593 sc-eQTL 2.10e-01 -0.215 0.171 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116560 SFPQ -653088 sc-eQTL 4.14e-01 0.0597 0.0729 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146463 ZMYM4 -728652 sc-eQTL 1.75e-01 0.169 0.124 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -319698 sc-eQTL 3.98e-01 0.134 0.159 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000163867 ZMYM6 -491888 sc-eQTL 1.07e-01 0.27 0.167 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197056 ZMYM1 -492115 sc-eQTL 3.12e-01 -0.161 0.159 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -826020 sc-eQTL 4.82e-01 0.098 0.139 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243749 TMEM35B -445296 sc-eQTL 2.90e-01 0.105 0.0989 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -389593 sc-eQTL 9.62e-01 0.0078 0.163 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116560 SFPQ -653088 sc-eQTL 6.65e-01 0.0334 0.0772 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146463 ZMYM4 -728652 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0537 0.101 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -319698 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0948 0.118 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000163867 ZMYM6 -491888 sc-eQTL 9.77e-01 0.00349 0.122 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197056 ZMYM1 -492115 sc-eQTL 2.62e-01 -0.154 0.137 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -826020 sc-eQTL 9.77e-01 0.0039 0.134 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243749 TMEM35B -445296 sc-eQTL 1.70e-02 -0.272 0.113 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -389593 sc-eQTL 2.95e-01 0.139 0.132 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116560 SFPQ -653088 sc-eQTL 3.29e-01 0.105 0.107 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146463 ZMYM4 -728652 sc-eQTL 8.38e-01 0.0275 0.134 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -319698 sc-eQTL 3.49e-01 -0.136 0.145 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000163867 ZMYM6 -491888 sc-eQTL 1.00e-01 -0.258 0.156 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197056 ZMYM1 -492115 sc-eQTL 7.06e-01 0.0553 0.146 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -826020 sc-eQTL 8.19e-01 0.0358 0.157 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243749 TMEM35B -445296 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0785 0.135 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -389593 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0831 0.166 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116560 SFPQ -653088 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0575 0.0808 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146463 ZMYM4 -728652 sc-eQTL 9.50e-01 0.00662 0.105 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -319698 sc-eQTL 5.08e-02 0.285 0.145 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000163867 ZMYM6 -491888 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0329 0.159 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197056 ZMYM1 -492115 sc-eQTL 8.20e-01 0.0343 0.15 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 -826020 sc-eQTL 1.09e-01 0.215 0.134 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243749 TMEM35B -445296 sc-eQTL 1.86e-01 0.101 0.0759 0.069 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000163866 SMIM12 -319698 eQTL 0.00587 -0.116 0.0419 0.0 0.0 0.0942


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000163867 \N -491888 8.21e-07 4.78e-07 1.12e-07 3.48e-07 9.26e-08 1.74e-07 5.01e-07 1.48e-07 4.26e-07 2.28e-07 5.93e-07 3.36e-07 6.77e-07 1.07e-07 1.71e-07 2.45e-07 2.53e-07 3.74e-07 1.97e-07 1.41e-07 1.92e-07 3.71e-07 3.19e-07 1.58e-07 6.65e-07 2.7e-07 2.56e-07 2.24e-07 3.56e-07 4.72e-07 2.73e-07 7.79e-08 5.77e-08 1.57e-07 2.7e-07 1.09e-07 1.09e-07 7.98e-08 4e-08 2.56e-08 8.42e-08 4.55e-07 2.63e-08 1.9e-08 1.33e-07 1.91e-08 1.1e-07 3.25e-09 5.93e-08
ENSG00000230163 \N -310637 1.32e-06 9.29e-07 3.3e-07 7.35e-07 3.51e-07 4.82e-07 1.26e-06 3.69e-07 1.41e-06 4.36e-07 1.48e-06 6.02e-07 1.99e-06 2.54e-07 5.65e-07 9.13e-07 8.06e-07 6.8e-07 7.73e-07 6.88e-07 6.17e-07 1.36e-06 8.96e-07 6.44e-07 1.95e-06 5.67e-07 8.34e-07 7.68e-07 1.25e-06 1.25e-06 6.16e-07 1.72e-07 2.19e-07 6.69e-07 4.36e-07 4.47e-07 5.53e-07 1.55e-07 3.73e-07 3.01e-07 2.68e-07 1.47e-06 5.85e-08 6.53e-08 2.98e-07 1.26e-07 2.33e-07 8.25e-08 1.68e-07