Genes within 1Mb (chr1:34334157:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116544 DLGAP3 -595493 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0392 0.159 0.083 B L1
ENSG00000116560 SFPQ -858988 sc-eQTL 3.75e-01 0.0538 0.0604 0.083 B L1
ENSG00000134686 PHC2 903105 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0324 0.128 0.083 B L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -934552 sc-eQTL 8.30e-01 0.0226 0.105 0.083 B L1
ENSG00000163866 SMIM12 -525598 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0166 0.135 0.083 B L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -697788 sc-eQTL 6.80e-02 -0.27 0.147 0.083 B L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -698015 sc-eQTL 5.03e-01 0.0959 0.143 0.083 B L1
ENSG00000243749 TMEM35B -651196 sc-eQTL 8.30e-01 0.0186 0.0864 0.083 B L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -595493 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0512 0.133 0.083 CD4T L1
ENSG00000116560 SFPQ -858988 sc-eQTL 8.82e-01 -0.00758 0.0509 0.083 CD4T L1
ENSG00000134686 PHC2 903105 sc-eQTL 3.87e-01 0.0922 0.106 0.083 CD4T L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -934552 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0616 0.0891 0.083 CD4T L1
ENSG00000163866 SMIM12 -525598 sc-eQTL 8.52e-02 -0.191 0.111 0.083 CD4T L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -697788 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0257 0.137 0.083 CD4T L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -698015 sc-eQTL 3.94e-01 0.0803 0.0941 0.083 CD4T L1
ENSG00000243749 TMEM35B -651196 sc-eQTL 9.15e-01 0.00651 0.0612 0.083 CD4T L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -595493 sc-eQTL 3.62e-01 0.143 0.157 0.083 CD8T L1
ENSG00000116560 SFPQ -858988 sc-eQTL 8.98e-01 0.00701 0.0545 0.083 CD8T L1
ENSG00000134686 PHC2 903105 sc-eQTL 5.23e-02 0.238 0.122 0.083 CD8T L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -934552 sc-eQTL 2.34e-01 0.144 0.12 0.083 CD8T L1
ENSG00000163866 SMIM12 -525598 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0242 0.131 0.083 CD8T L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -697788 sc-eQTL 1.06e-01 -0.259 0.16 0.083 CD8T L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -698015 sc-eQTL 3.17e-01 0.138 0.137 0.083 CD8T L1
ENSG00000243749 TMEM35B -651196 sc-eQTL 3.19e-01 0.0791 0.0791 0.083 CD8T L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -595493 sc-eQTL 7.95e-01 0.0416 0.16 0.081 DC L1
ENSG00000116560 SFPQ -858988 sc-eQTL 4.38e-01 -0.077 0.0992 0.081 DC L1
ENSG00000134686 PHC2 903105 sc-eQTL 3.93e-01 0.0988 0.115 0.081 DC L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -934552 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0634 0.147 0.081 DC L1
ENSG00000163866 SMIM12 -525598 sc-eQTL 7.41e-01 0.0522 0.158 0.081 DC L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -697788 sc-eQTL 2.68e-02 0.329 0.147 0.081 DC L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -698015 sc-eQTL 2.54e-01 0.185 0.162 0.081 DC L1
ENSG00000243749 TMEM35B -651196 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0885 0.143 0.081 DC L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -595493 sc-eQTL 2.16e-01 0.186 0.15 0.083 Mono L1
ENSG00000116560 SFPQ -858988 sc-eQTL 8.25e-01 0.0172 0.0775 0.083 Mono L1
ENSG00000134686 PHC2 903105 sc-eQTL 5.43e-02 0.154 0.0793 0.083 Mono L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -934552 sc-eQTL 2.17e-01 0.117 0.0943 0.083 Mono L1
ENSG00000163866 SMIM12 -525598 sc-eQTL 5.06e-01 0.0761 0.114 0.083 Mono L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -697788 sc-eQTL 7.68e-01 0.0333 0.113 0.083 Mono L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -698015 sc-eQTL 7.75e-02 0.227 0.128 0.083 Mono L1
ENSG00000243749 TMEM35B -651196 sc-eQTL 9.91e-02 0.179 0.108 0.083 Mono L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -595493 sc-eQTL 2.91e-01 0.173 0.163 0.082 NK L1
ENSG00000116560 SFPQ -858988 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00111 0.0737 0.082 NK L1
ENSG00000134686 PHC2 903105 sc-eQTL 2.34e-01 -0.149 0.125 0.082 NK L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -934552 sc-eQTL 5.36e-01 0.0586 0.0946 0.082 NK L1
ENSG00000163866 SMIM12 -525598 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0722 0.142 0.082 NK L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -697788 sc-eQTL 5.02e-01 -0.104 0.155 0.082 NK L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -698015 sc-eQTL 4.22e-01 0.116 0.144 0.082 NK L1
ENSG00000243749 TMEM35B -651196 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0754 0.074 0.082 NK L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -595493 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0414 0.166 0.083 Other_T L1
ENSG00000116560 SFPQ -858988 sc-eQTL 1.09e-01 0.137 0.0853 0.083 Other_T L1
ENSG00000134686 PHC2 903105 sc-eQTL 4.83e-01 0.0909 0.129 0.083 Other_T L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -934552 sc-eQTL 1.15e-01 0.213 0.135 0.083 Other_T L1
ENSG00000163866 SMIM12 -525598 sc-eQTL 1.36e-01 -0.209 0.14 0.083 Other_T L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -697788 sc-eQTL 3.75e-02 0.347 0.166 0.083 Other_T L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -698015 sc-eQTL 1.12e-01 0.223 0.14 0.083 Other_T L1
ENSG00000243749 TMEM35B -651196 sc-eQTL 7.04e-01 0.0351 0.0924 0.083 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116544 DLGAP3 -595493 sc-eQTL 4.13e-02 0.31 0.151 0.079 B_Activated L2
ENSG00000116560 SFPQ -858988 sc-eQTL 4.17e-01 0.0959 0.118 0.079 B_Activated L2
ENSG00000134686 PHC2 903105 sc-eQTL 7.06e-01 0.0689 0.182 0.079 B_Activated L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -934552 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0642 0.197 0.079 B_Activated L2
ENSG00000163866 SMIM12 -525598 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0854 0.199 0.079 B_Activated L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -697788 sc-eQTL 5.95e-01 -0.105 0.198 0.079 B_Activated L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -698015 sc-eQTL 1.33e-01 -0.247 0.164 0.079 B_Activated L2
ENSG00000243749 TMEM35B -651196 sc-eQTL 6.80e-01 0.0674 0.163 0.079 B_Activated L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -595493 sc-eQTL 1.79e-01 -0.214 0.159 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000116560 SFPQ -858988 sc-eQTL 1.20e-01 0.136 0.0873 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000134686 PHC2 903105 sc-eQTL 4.29e-01 -0.11 0.139 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -934552 sc-eQTL 7.12e-01 0.0519 0.14 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000163866 SMIM12 -525598 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0409 0.165 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -697788 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0773 0.163 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -698015 sc-eQTL 1.58e-01 0.237 0.167 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000243749 TMEM35B -651196 sc-eQTL 8.28e-01 0.0271 0.125 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -595493 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0222 0.156 0.084 B_Memory L2
ENSG00000116560 SFPQ -858988 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0559 0.0994 0.084 B_Memory L2
ENSG00000134686 PHC2 903105 sc-eQTL 3.63e-01 0.136 0.149 0.084 B_Memory L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -934552 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0879 0.154 0.084 B_Memory L2
ENSG00000163866 SMIM12 -525598 sc-eQTL 2.29e-01 -0.199 0.165 0.084 B_Memory L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -697788 sc-eQTL 5.37e-01 0.107 0.173 0.084 B_Memory L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -698015 sc-eQTL 1.74e-01 0.225 0.165 0.084 B_Memory L2
ENSG00000243749 TMEM35B -651196 sc-eQTL 4.32e-02 -0.244 0.12 0.084 B_Memory L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -595493 sc-eQTL 6.46e-01 0.0725 0.158 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000116560 SFPQ -858988 sc-eQTL 1.56e-01 0.103 0.0724 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000134686 PHC2 903105 sc-eQTL 4.69e-01 0.096 0.132 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -934552 sc-eQTL 9.99e-01 0.000159 0.126 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000163866 SMIM12 -525598 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000526 0.154 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -697788 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0873 0.159 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -698015 sc-eQTL 5.05e-01 0.0996 0.149 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000243749 TMEM35B -651196 sc-eQTL 3.19e-01 0.115 0.115 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -595493 sc-eQTL 6.09e-01 0.0906 0.177 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000116560 SFPQ -858988 sc-eQTL 5.07e-02 0.18 0.0915 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000134686 PHC2 903105 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0903 0.147 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -934552 sc-eQTL 8.40e-01 0.0292 0.144 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000163866 SMIM12 -525598 sc-eQTL 3.35e-01 0.167 0.173 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -697788 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0713 0.173 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -698015 sc-eQTL 8.98e-01 0.0209 0.163 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000243749 TMEM35B -651196 sc-eQTL 8.83e-01 0.0175 0.118 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -595493 sc-eQTL 1.19e-01 0.252 0.161 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000116560 SFPQ -858988 sc-eQTL 6.38e-02 -0.216 0.116 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000134686 PHC2 903105 sc-eQTL 3.45e-01 0.147 0.155 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -934552 sc-eQTL 4.41e-01 -0.136 0.176 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000163866 SMIM12 -525598 sc-eQTL 8.24e-01 0.0371 0.166 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -697788 sc-eQTL 4.12e-01 0.148 0.18 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -698015 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0157 0.182 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000243749 TMEM35B -651196 sc-eQTL 4.25e-01 -0.11 0.138 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -595493 sc-eQTL 5.03e-01 -0.103 0.154 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000116560 SFPQ -858988 sc-eQTL 5.51e-01 0.0321 0.0537 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000134686 PHC2 903105 sc-eQTL 5.76e-01 0.0624 0.112 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -934552 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0617 0.0973 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000163866 SMIM12 -525598 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0997 0.109 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -697788 sc-eQTL 8.56e-01 0.0268 0.147 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -698015 sc-eQTL 7.83e-01 0.0311 0.113 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000243749 TMEM35B -651196 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0166 0.067 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -595493 sc-eQTL 7.10e-01 0.0514 0.138 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000116560 SFPQ -858988 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0182 0.0654 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000134686 PHC2 903105 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0328 0.128 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -934552 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0907 0.123 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -525598 sc-eQTL 1.13e-02 -0.365 0.143 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -697788 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0729 0.162 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -698015 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00188 0.131 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000243749 TMEM35B -651196 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0633 0.0742 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -595493 sc-eQTL 8.07e-01 0.0415 0.17 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000116560 SFPQ -858988 sc-eQTL 8.00e-01 0.0194 0.0764 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000134686 PHC2 903105 sc-eQTL 9.27e-01 0.0139 0.151 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -934552 sc-eQTL 6.21e-01 0.0773 0.156 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -525598 sc-eQTL 5.28e-01 0.1 0.159 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -697788 sc-eQTL 2.23e-01 -0.199 0.163 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -698015 sc-eQTL 2.65e-01 -0.178 0.159 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000243749 TMEM35B -651196 sc-eQTL 9.04e-01 0.0123 0.102 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -595493 sc-eQTL 5.43e-01 0.1 0.164 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000116560 SFPQ -858988 sc-eQTL 6.37e-01 0.0414 0.0876 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000134686 PHC2 903105 sc-eQTL 2.03e-01 0.172 0.135 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -934552 sc-eQTL 4.34e-01 -0.104 0.133 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000163866 SMIM12 -525598 sc-eQTL 4.55e-01 -0.119 0.158 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -697788 sc-eQTL 7.49e-01 -0.054 0.169 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -698015 sc-eQTL 4.18e-01 0.119 0.146 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000243749 TMEM35B -651196 sc-eQTL 6.35e-01 0.0474 0.0998 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -595493 sc-eQTL 8.62e-01 0.0298 0.171 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000116560 SFPQ -858988 sc-eQTL 4.69e-01 0.0492 0.0678 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000134686 PHC2 903105 sc-eQTL 5.96e-01 0.0752 0.141 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -934552 sc-eQTL 3.12e-01 0.126 0.124 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000163866 SMIM12 -525598 sc-eQTL 2.99e-01 -0.148 0.142 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -697788 sc-eQTL 1.31e-01 -0.252 0.166 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -698015 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0264 0.157 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000243749 TMEM35B -651196 sc-eQTL 1.10e-01 0.147 0.0915 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -595493 sc-eQTL 4.99e-01 -0.121 0.178 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000116560 SFPQ -858988 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0113 0.101 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000134686 PHC2 903105 sc-eQTL 3.11e-01 0.148 0.146 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -934552 sc-eQTL 3.07e-01 0.178 0.174 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -525598 sc-eQTL 4.72e-01 -0.125 0.173 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -697788 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0405 0.19 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -698015 sc-eQTL 2.13e-02 0.398 0.171 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000243749 TMEM35B -651196 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0382 0.14 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -595493 sc-eQTL 7.71e-01 0.0451 0.154 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000116560 SFPQ -858988 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0363 0.0981 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000134686 PHC2 903105 sc-eQTL 2.17e-01 0.203 0.164 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -934552 sc-eQTL 1.96e-02 0.402 0.171 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -525598 sc-eQTL 9.00e-01 0.0216 0.172 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -697788 sc-eQTL 1.38e-01 -0.253 0.17 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -698015 sc-eQTL 3.14e-01 -0.16 0.159 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000243749 TMEM35B -651196 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0209 0.122 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -595493 sc-eQTL 4.52e-01 -0.124 0.164 0.082 MAIT L2
ENSG00000116560 SFPQ -858988 sc-eQTL 6.11e-01 0.0441 0.0867 0.082 MAIT L2
ENSG00000134686 PHC2 903105 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0643 0.145 0.082 MAIT L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -934552 sc-eQTL 3.79e-02 0.321 0.154 0.082 MAIT L2
ENSG00000163866 SMIM12 -525598 sc-eQTL 9.43e-01 0.0119 0.166 0.082 MAIT L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -697788 sc-eQTL 2.65e-02 0.381 0.171 0.082 MAIT L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -698015 sc-eQTL 1.48e-01 0.238 0.164 0.082 MAIT L2
ENSG00000243749 TMEM35B -651196 sc-eQTL 4.26e-01 -0.101 0.126 0.082 MAIT L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -595493 sc-eQTL 2.04e-01 0.212 0.166 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000116560 SFPQ -858988 sc-eQTL 4.38e-01 0.0848 0.109 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000134686 PHC2 903105 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0508 0.155 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -934552 sc-eQTL 2.29e-01 0.186 0.154 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000163866 SMIM12 -525598 sc-eQTL 8.48e-01 0.0352 0.184 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -697788 sc-eQTL 3.30e-01 0.178 0.183 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -698015 sc-eQTL 2.33e-01 0.195 0.163 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000243749 TMEM35B -651196 sc-eQTL 3.86e-01 0.123 0.142 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -595493 sc-eQTL 4.41e-01 0.122 0.158 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000116560 SFPQ -858988 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00322 0.0863 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000134686 PHC2 903105 sc-eQTL 4.82e-01 0.096 0.136 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -934552 sc-eQTL 9.41e-01 0.00843 0.114 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000163866 SMIM12 -525598 sc-eQTL 7.61e-01 0.0463 0.152 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -697788 sc-eQTL 3.86e-01 -0.14 0.161 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -698015 sc-eQTL 3.99e-01 0.129 0.152 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000243749 TMEM35B -651196 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0415 0.0883 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -595493 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0581 0.157 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000116560 SFPQ -858988 sc-eQTL 1.27e-01 -0.176 0.115 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000134686 PHC2 903105 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0899 0.149 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -934552 sc-eQTL 6.71e-01 0.0677 0.159 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000163866 SMIM12 -525598 sc-eQTL 5.41e-01 -0.102 0.167 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -697788 sc-eQTL 4.70e-01 -0.126 0.174 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -698015 sc-eQTL 6.44e-01 0.076 0.164 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000243749 TMEM35B -651196 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0799 0.137 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -595493 sc-eQTL 8.04e-01 0.0416 0.168 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000116560 SFPQ -858988 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0245 0.0983 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000134686 PHC2 903105 sc-eQTL 3.89e-02 -0.294 0.141 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -934552 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0117 0.126 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000163866 SMIM12 -525598 sc-eQTL 7.45e-01 0.0495 0.152 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -697788 sc-eQTL 2.48e-01 -0.201 0.173 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -698015 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0108 0.16 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000243749 TMEM35B -651196 sc-eQTL 2.29e-01 -0.109 0.0904 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -595493 sc-eQTL 9.55e-01 0.012 0.214 0.089 PB L2
ENSG00000116560 SFPQ -858988 sc-eQTL 4.41e-01 0.095 0.123 0.089 PB L2
ENSG00000134686 PHC2 903105 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0416 0.207 0.089 PB L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -934552 sc-eQTL 3.87e-01 0.199 0.229 0.089 PB L2
ENSG00000163866 SMIM12 -525598 sc-eQTL 2.94e-01 -0.205 0.194 0.089 PB L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -697788 sc-eQTL 7.40e-01 0.0767 0.231 0.089 PB L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -698015 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0997 0.2 0.089 PB L2
ENSG00000243749 TMEM35B -651196 sc-eQTL 3.83e-01 0.168 0.192 0.089 PB L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -595493 sc-eQTL 5.43e-01 0.0894 0.147 0.083 Pro_T L2
ENSG00000116560 SFPQ -858988 sc-eQTL 3.11e-01 0.113 0.111 0.083 Pro_T L2
ENSG00000134686 PHC2 903105 sc-eQTL 7.88e-01 0.0351 0.13 0.083 Pro_T L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -934552 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0109 0.166 0.083 Pro_T L2
ENSG00000163866 SMIM12 -525598 sc-eQTL 8.22e-01 0.0361 0.16 0.083 Pro_T L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -697788 sc-eQTL 3.08e-01 0.177 0.173 0.083 Pro_T L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -698015 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0235 0.145 0.083 Pro_T L2
ENSG00000243749 TMEM35B -651196 sc-eQTL 5.42e-03 0.359 0.128 0.083 Pro_T L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -595493 sc-eQTL 7.07e-01 0.063 0.168 0.083 Treg L2
ENSG00000116560 SFPQ -858988 sc-eQTL 1.26e-01 -0.125 0.0811 0.083 Treg L2
ENSG00000134686 PHC2 903105 sc-eQTL 4.02e-01 0.124 0.148 0.083 Treg L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -934552 sc-eQTL 2.41e-01 0.174 0.148 0.083 Treg L2
ENSG00000163866 SMIM12 -525598 sc-eQTL 6.03e-01 0.0846 0.162 0.083 Treg L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -697788 sc-eQTL 7.40e-01 0.0584 0.176 0.083 Treg L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -698015 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00346 0.149 0.083 Treg L2
ENSG00000243749 TMEM35B -651196 sc-eQTL 8.27e-01 0.0259 0.118 0.083 Treg L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -595493 sc-eQTL 4.53e-01 0.134 0.178 0.083 cDC L2
ENSG00000116560 SFPQ -858988 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0462 0.113 0.083 cDC L2
ENSG00000134686 PHC2 903105 sc-eQTL 6.51e-02 0.227 0.122 0.083 cDC L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -934552 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0917 0.155 0.083 cDC L2
ENSG00000163866 SMIM12 -525598 sc-eQTL 9.70e-01 0.00627 0.169 0.083 cDC L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -697788 sc-eQTL 1.29e-02 0.437 0.174 0.083 cDC L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -698015 sc-eQTL 1.23e-01 0.258 0.166 0.083 cDC L2
ENSG00000243749 TMEM35B -651196 sc-eQTL 9.42e-01 0.0121 0.166 0.083 cDC L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -595493 sc-eQTL 7.68e-01 0.0483 0.164 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000116560 SFPQ -858988 sc-eQTL 5.33e-01 0.0524 0.0838 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000134686 PHC2 903105 sc-eQTL 1.36e-01 0.123 0.0825 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -934552 sc-eQTL 4.33e-01 0.086 0.109 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000163866 SMIM12 -525598 sc-eQTL 3.94e-01 0.108 0.127 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -697788 sc-eQTL 9.94e-01 0.000898 0.129 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -698015 sc-eQTL 9.15e-01 -0.016 0.149 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000243749 TMEM35B -651196 sc-eQTL 1.80e-01 0.165 0.122 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -595493 sc-eQTL 4.60e-01 0.123 0.166 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000116560 SFPQ -858988 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0769 0.0931 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000134686 PHC2 903105 sc-eQTL 6.57e-01 0.0391 0.088 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -934552 sc-eQTL 4.31e-01 0.0985 0.125 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000163866 SMIM12 -525598 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0756 0.146 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -697788 sc-eQTL 4.02e-01 -0.13 0.154 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -698015 sc-eQTL 6.89e-02 0.273 0.149 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000243749 TMEM35B -651196 sc-eQTL 8.25e-01 0.0294 0.133 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -595493 sc-eQTL 1.86e-01 0.281 0.211 0.067 gdT L2
ENSG00000116560 SFPQ -858988 sc-eQTL 6.30e-01 0.0676 0.14 0.067 gdT L2
ENSG00000134686 PHC2 903105 sc-eQTL 8.44e-01 0.0367 0.186 0.067 gdT L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -934552 sc-eQTL 5.34e-01 -0.128 0.205 0.067 gdT L2
ENSG00000163866 SMIM12 -525598 sc-eQTL 1.29e-01 -0.335 0.22 0.067 gdT L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -697788 sc-eQTL 3.00e-01 0.238 0.229 0.067 gdT L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -698015 sc-eQTL 4.03e-01 0.172 0.206 0.067 gdT L2
ENSG00000243749 TMEM35B -651196 sc-eQTL 7.51e-02 0.289 0.161 0.067 gdT L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -595493 sc-eQTL 6.49e-01 0.0767 0.168 0.078 intMono L2
ENSG00000116560 SFPQ -858988 sc-eQTL 9.41e-01 0.00958 0.129 0.078 intMono L2
ENSG00000134686 PHC2 903105 sc-eQTL 5.70e-02 0.191 0.0995 0.078 intMono L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -934552 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0285 0.164 0.078 intMono L2
ENSG00000163866 SMIM12 -525598 sc-eQTL 5.24e-01 0.11 0.172 0.078 intMono L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -697788 sc-eQTL 8.23e-01 0.0396 0.177 0.078 intMono L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -698015 sc-eQTL 7.37e-03 0.415 0.153 0.078 intMono L2
ENSG00000243749 TMEM35B -651196 sc-eQTL 1.47e-01 -0.22 0.151 0.078 intMono L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -595493 sc-eQTL 6.28e-01 0.0695 0.143 0.084 ncMono L2
ENSG00000116560 SFPQ -858988 sc-eQTL 1.81e-01 -0.174 0.13 0.084 ncMono L2
ENSG00000134686 PHC2 903105 sc-eQTL 1.23e-02 0.28 0.111 0.084 ncMono L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -934552 sc-eQTL 4.94e-02 -0.273 0.138 0.084 ncMono L2
ENSG00000163866 SMIM12 -525598 sc-eQTL 1.54e-01 -0.223 0.156 0.084 ncMono L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -697788 sc-eQTL 9.63e-01 0.0076 0.162 0.084 ncMono L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -698015 sc-eQTL 1.86e-01 0.203 0.153 0.084 ncMono L2
ENSG00000243749 TMEM35B -651196 sc-eQTL 1.68e-01 0.205 0.148 0.084 ncMono L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -595493 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0331 0.187 0.088 pDC L2
ENSG00000116560 SFPQ -858988 sc-eQTL 6.67e-01 -0.053 0.123 0.088 pDC L2
ENSG00000134686 PHC2 903105 sc-eQTL 4.90e-01 -0.107 0.154 0.088 pDC L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -934552 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0137 0.187 0.088 pDC L2
ENSG00000163866 SMIM12 -525598 sc-eQTL 4.17e-02 0.395 0.192 0.088 pDC L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -697788 sc-eQTL 9.60e-01 0.00867 0.174 0.088 pDC L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -698015 sc-eQTL 5.45e-01 0.109 0.18 0.088 pDC L2
ENSG00000243749 TMEM35B -651196 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0155 0.16 0.088 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116544 DLGAP3 -595493 sc-eQTL 2.10e-01 -0.205 0.163 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116560 SFPQ -858988 sc-eQTL 4.71e-01 0.0542 0.075 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 903105 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0363 0.137 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146463 ZMYM4 -934552 sc-eQTL 9.58e-01 0.00674 0.128 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -525598 sc-eQTL 1.98e-01 -0.206 0.159 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000163867 ZMYM6 -697788 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0222 0.154 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197056 ZMYM1 -698015 sc-eQTL 2.59e-01 0.186 0.164 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243749 TMEM35B -651196 sc-eQTL 3.36e-01 -0.1 0.104 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -595493 sc-eQTL 5.55e-01 0.0983 0.166 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116560 SFPQ -858988 sc-eQTL 7.65e-02 0.125 0.0702 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 903105 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0204 0.134 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146463 ZMYM4 -934552 sc-eQTL 5.84e-01 0.066 0.12 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -525598 sc-eQTL 4.42e-01 0.119 0.154 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000163867 ZMYM6 -697788 sc-eQTL 4.89e-01 -0.113 0.163 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197056 ZMYM1 -698015 sc-eQTL 6.09e-01 0.0789 0.154 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243749 TMEM35B -651196 sc-eQTL 4.42e-01 0.074 0.096 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -595493 sc-eQTL 2.51e-01 0.184 0.16 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116560 SFPQ -858988 sc-eQTL 8.26e-01 0.0168 0.0763 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 903105 sc-eQTL 1.93e-01 0.105 0.0804 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146463 ZMYM4 -934552 sc-eQTL 1.07e-01 0.16 0.0991 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -525598 sc-eQTL 6.03e-01 0.0605 0.116 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000163867 ZMYM6 -697788 sc-eQTL 8.53e-01 0.0223 0.121 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197056 ZMYM1 -698015 sc-eQTL 2.00e-01 0.174 0.135 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243749 TMEM35B -651196 sc-eQTL 1.77e-01 0.153 0.113 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -595493 sc-eQTL 6.32e-01 0.0635 0.132 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116560 SFPQ -858988 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0631 0.107 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 903105 sc-eQTL 9.35e-03 0.248 0.0946 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146463 ZMYM4 -934552 sc-eQTL 7.09e-02 -0.241 0.133 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -525598 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0569 0.145 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000163867 ZMYM6 -697788 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0301 0.157 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197056 ZMYM1 -698015 sc-eQTL 5.05e-03 0.406 0.143 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243749 TMEM35B -651196 sc-eQTL 5.65e-01 0.0777 0.135 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -595493 sc-eQTL 6.91e-01 0.0645 0.162 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116560 SFPQ -858988 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00434 0.0791 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 903105 sc-eQTL 2.73e-01 -0.138 0.126 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146463 ZMYM4 -934552 sc-eQTL 7.53e-01 0.0322 0.102 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -525598 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00216 0.143 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000163867 ZMYM6 -697788 sc-eQTL 2.31e-01 -0.186 0.155 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197056 ZMYM1 -698015 sc-eQTL 6.38e-01 0.0693 0.147 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243749 TMEM35B -651196 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0848 0.0743 0.082 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116560 \N -858988 2.74e-07 1.3e-07 3.69e-08 1.81e-07 8.92e-08 9.65e-08 1.49e-07 5.33e-08 1.44e-07 4.57e-08 1.6e-07 8.36e-08 1.41e-07 6.56e-08 5.99e-08 7.3e-08 3.94e-08 1.26e-07 5.82e-08 4.07e-08 1.05e-07 1.23e-07 1.39e-07 3.68e-08 1.37e-07 1.16e-07 1.06e-07 9.57e-08 1.08e-07 1.07e-07 9.64e-08 3.94e-08 3.35e-08 8.49e-08 8.21e-08 3.94e-08 5.03e-08 9.65e-08 6.56e-08 3.77e-08 5.13e-08 1.35e-07 4.52e-08 1.86e-08 5.7e-08 1.66e-08 1.19e-07 3.89e-09 4.81e-08
ENSG00000163867 \N -697788 3.02e-07 1.42e-07 5.03e-08 2.15e-07 9.16e-08 9.05e-08 1.81e-07 5.4e-08 1.47e-07 6.08e-08 1.63e-07 1.05e-07 1.71e-07 7.64e-08 5.98e-08 7.97e-08 4.12e-08 1.51e-07 6.92e-08 4.3e-08 1.21e-07 1.26e-07 1.58e-07 2.79e-08 1.65e-07 1.25e-07 1.13e-07 1.01e-07 1.22e-07 1.05e-07 1.08e-07 3.08e-08 3.43e-08 8.23e-08 3.52e-08 2.99e-08 5.61e-08 9.23e-08 6.43e-08 3.82e-08 5.33e-08 1.46e-07 5.21e-08 1.27e-08 3.42e-08 1.86e-08 1.21e-07 1.88e-09 5e-08