Genes within 1Mb (chr1:34315350:CT:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116544 DLGAP3 -614300 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00127 0.0934 0.276 B L1
ENSG00000116560 SFPQ -877795 sc-eQTL 9.72e-01 0.00123 0.0355 0.276 B L1
ENSG00000134686 PHC2 884298 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0654 0.0747 0.276 B L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -953359 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0757 0.0615 0.276 B L1
ENSG00000163866 SMIM12 -544405 sc-eQTL 7.36e-01 0.0267 0.0792 0.276 B L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -716595 sc-eQTL 2.89e-01 0.0921 0.0866 0.276 B L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -716822 sc-eQTL 6.25e-01 0.0411 0.0838 0.276 B L1
ENSG00000243749 TMEM35B -670003 sc-eQTL 2.24e-01 0.0616 0.0505 0.276 B L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -614300 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0719 0.078 0.276 CD4T L1
ENSG00000116560 SFPQ -877795 sc-eQTL 8.15e-01 -0.00705 0.03 0.276 CD4T L1
ENSG00000134686 PHC2 884298 sc-eQTL 4.61e-01 0.0463 0.0627 0.276 CD4T L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -953359 sc-eQTL 1.18e-01 0.0821 0.0523 0.276 CD4T L1
ENSG00000163866 SMIM12 -544405 sc-eQTL 9.08e-01 0.0076 0.0658 0.276 CD4T L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -716595 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0302 0.0809 0.276 CD4T L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -716822 sc-eQTL 6.66e-01 0.024 0.0556 0.276 CD4T L1
ENSG00000243749 TMEM35B -670003 sc-eQTL 1.78e-01 0.0486 0.0359 0.276 CD4T L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -614300 sc-eQTL 5.17e-03 0.255 0.0903 0.276 CD8T L1
ENSG00000116560 SFPQ -877795 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0138 0.0319 0.276 CD8T L1
ENSG00000134686 PHC2 884298 sc-eQTL 7.01e-01 0.0277 0.0721 0.276 CD8T L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -953359 sc-eQTL 1.79e-01 -0.0951 0.0706 0.276 CD8T L1
ENSG00000163866 SMIM12 -544405 sc-eQTL 3.45e-01 0.0723 0.0764 0.276 CD8T L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -716595 sc-eQTL 1.32e-01 0.142 0.0937 0.276 CD8T L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -716822 sc-eQTL 6.79e-01 0.0333 0.0805 0.276 CD8T L1
ENSG00000243749 TMEM35B -670003 sc-eQTL 6.39e-01 0.0218 0.0465 0.276 CD8T L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -614300 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0276 0.0916 0.279 DC L1
ENSG00000116560 SFPQ -877795 sc-eQTL 8.49e-01 0.0109 0.057 0.279 DC L1
ENSG00000134686 PHC2 884298 sc-eQTL 1.61e-01 0.0931 0.0661 0.279 DC L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -953359 sc-eQTL 7.77e-01 -0.024 0.0846 0.279 DC L1
ENSG00000163866 SMIM12 -544405 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0147 0.0905 0.279 DC L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -716595 sc-eQTL 5.08e-01 0.0568 0.0856 0.279 DC L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -716822 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0134 0.0931 0.279 DC L1
ENSG00000243749 TMEM35B -670003 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0112 0.0822 0.279 DC L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -614300 sc-eQTL 5.29e-01 0.0559 0.0887 0.276 Mono L1
ENSG00000116560 SFPQ -877795 sc-eQTL 8.96e-01 0.00595 0.0457 0.276 Mono L1
ENSG00000134686 PHC2 884298 sc-eQTL 2.30e-01 0.0566 0.047 0.276 Mono L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -953359 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0267 0.0557 0.276 Mono L1
ENSG00000163866 SMIM12 -544405 sc-eQTL 6.88e-02 -0.122 0.0668 0.276 Mono L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -716595 sc-eQTL 8.28e-02 0.115 0.066 0.276 Mono L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -716822 sc-eQTL 2.32e-01 0.0907 0.0756 0.276 Mono L1
ENSG00000243749 TMEM35B -670003 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0293 0.0642 0.276 Mono L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -614300 sc-eQTL 9.75e-02 0.159 0.0957 0.277 NK L1
ENSG00000116560 SFPQ -877795 sc-eQTL 8.26e-01 0.00955 0.0434 0.277 NK L1
ENSG00000134686 PHC2 884298 sc-eQTL 1.85e-01 0.0976 0.0734 0.277 NK L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -953359 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0198 0.0557 0.277 NK L1
ENSG00000163866 SMIM12 -544405 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0147 0.0837 0.277 NK L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -716595 sc-eQTL 3.28e-01 0.0893 0.0911 0.277 NK L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -716822 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0943 0.0848 0.277 NK L1
ENSG00000243749 TMEM35B -670003 sc-eQTL 1.86e-01 -0.0577 0.0434 0.277 NK L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -614300 sc-eQTL 1.34e-01 -0.147 0.0979 0.276 Other_T L1
ENSG00000116560 SFPQ -877795 sc-eQTL 4.03e-01 0.0427 0.0509 0.276 Other_T L1
ENSG00000134686 PHC2 884298 sc-eQTL 1.30e-01 -0.116 0.0764 0.276 Other_T L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -953359 sc-eQTL 1.69e-01 -0.111 0.0802 0.276 Other_T L1
ENSG00000163866 SMIM12 -544405 sc-eQTL 4.33e-01 0.0653 0.0832 0.276 Other_T L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -716595 sc-eQTL 7.83e-01 0.0274 0.0993 0.276 Other_T L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -716822 sc-eQTL 7.24e-01 0.0295 0.0836 0.276 Other_T L1
ENSG00000243749 TMEM35B -670003 sc-eQTL 1.20e-01 -0.0852 0.0546 0.276 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116544 DLGAP3 -614300 sc-eQTL 1.32e-01 -0.132 0.0874 0.273 B_Activated L2
ENSG00000116560 SFPQ -877795 sc-eQTL 7.87e-01 0.0184 0.0681 0.273 B_Activated L2
ENSG00000134686 PHC2 884298 sc-eQTL 2.94e-01 0.11 0.105 0.273 B_Activated L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -953359 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0082 0.114 0.273 B_Activated L2
ENSG00000163866 SMIM12 -544405 sc-eQTL 5.84e-01 0.0629 0.115 0.273 B_Activated L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -716595 sc-eQTL 6.97e-01 0.0445 0.114 0.273 B_Activated L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -716822 sc-eQTL 7.33e-01 0.0325 0.095 0.273 B_Activated L2
ENSG00000243749 TMEM35B -670003 sc-eQTL 6.16e-01 0.0473 0.0941 0.273 B_Activated L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -614300 sc-eQTL 3.82e-01 0.082 0.0936 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000116560 SFPQ -877795 sc-eQTL 3.78e-01 0.0455 0.0515 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000134686 PHC2 884298 sc-eQTL 9.34e-01 0.0068 0.0818 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -953359 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0405 0.0824 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000163866 SMIM12 -544405 sc-eQTL 2.54e-01 -0.111 0.0968 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -716595 sc-eQTL 8.55e-01 0.0174 0.0955 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -716822 sc-eQTL 2.25e-01 -0.12 0.0984 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000243749 TMEM35B -670003 sc-eQTL 5.06e-01 0.0488 0.0732 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -614300 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0401 0.0904 0.276 B_Memory L2
ENSG00000116560 SFPQ -877795 sc-eQTL 7.43e-01 0.019 0.0578 0.276 B_Memory L2
ENSG00000134686 PHC2 884298 sc-eQTL 4.14e-03 -0.247 0.0854 0.276 B_Memory L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -953359 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0438 0.0896 0.276 B_Memory L2
ENSG00000163866 SMIM12 -544405 sc-eQTL 1.52e-01 0.138 0.096 0.276 B_Memory L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -716595 sc-eQTL 8.10e-01 0.0242 0.101 0.276 B_Memory L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -716822 sc-eQTL 3.84e-01 -0.084 0.0963 0.276 B_Memory L2
ENSG00000243749 TMEM35B -670003 sc-eQTL 9.14e-01 -0.00757 0.0703 0.276 B_Memory L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -614300 sc-eQTL 6.12e-01 0.0475 0.0935 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000116560 SFPQ -877795 sc-eQTL 4.87e-01 -0.03 0.0431 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000134686 PHC2 884298 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0277 0.0784 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -953359 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0221 0.0747 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000163866 SMIM12 -544405 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00936 0.0914 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -716595 sc-eQTL 3.37e-01 0.0904 0.0939 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -716822 sc-eQTL 2.86e-01 0.0944 0.0882 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000243749 TMEM35B -670003 sc-eQTL 7.27e-01 0.0239 0.0685 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -614300 sc-eQTL 2.25e-01 -0.127 0.104 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000116560 SFPQ -877795 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0439 0.0544 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000134686 PHC2 884298 sc-eQTL 3.56e-01 0.0798 0.0864 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -953359 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0644 0.085 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000163866 SMIM12 -544405 sc-eQTL 4.01e-01 0.0858 0.102 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -716595 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0399 0.102 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -716822 sc-eQTL 1.67e-01 0.133 0.096 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000243749 TMEM35B -670003 sc-eQTL 2.42e-01 0.0815 0.0694 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -614300 sc-eQTL 2.46e-01 -0.115 0.0986 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000116560 SFPQ -877795 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0109 0.0713 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000134686 PHC2 884298 sc-eQTL 6.94e-01 0.0373 0.0949 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -953359 sc-eQTL 3.71e-01 0.0961 0.107 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000163866 SMIM12 -544405 sc-eQTL 8.77e-01 0.0157 0.101 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -716595 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0301 0.11 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -716822 sc-eQTL 4.18e-01 0.0898 0.111 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000243749 TMEM35B -670003 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0218 0.0841 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -614300 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0415 0.0908 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000116560 SFPQ -877795 sc-eQTL 8.72e-01 -0.00508 0.0316 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000134686 PHC2 884298 sc-eQTL 6.00e-01 0.0345 0.0656 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -953359 sc-eQTL 1.69e-01 0.0787 0.0571 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000163866 SMIM12 -544405 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0272 0.0644 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -716595 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0575 0.0866 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -716822 sc-eQTL 9.20e-01 0.00667 0.0663 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000243749 TMEM35B -670003 sc-eQTL 1.14e-01 0.0623 0.0392 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -614300 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0459 0.08 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000116560 SFPQ -877795 sc-eQTL 9.27e-01 0.00349 0.0379 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000134686 PHC2 884298 sc-eQTL 4.89e-01 0.0512 0.0739 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -953359 sc-eQTL 3.18e-01 0.0713 0.0713 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -544405 sc-eQTL 2.22e-01 0.103 0.0836 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -716595 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0121 0.094 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -716822 sc-eQTL 2.57e-01 -0.0859 0.0755 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000243749 TMEM35B -670003 sc-eQTL 3.12e-01 0.0435 0.0429 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -614300 sc-eQTL 8.38e-02 -0.171 0.0982 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000116560 SFPQ -877795 sc-eQTL 9.46e-01 0.00301 0.0445 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000134686 PHC2 884298 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0189 0.0879 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -953359 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0693 0.0909 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -544405 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0832 0.0924 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -716595 sc-eQTL 9.15e-02 -0.16 0.0945 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -716822 sc-eQTL 1.20e-01 0.144 0.0923 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000243749 TMEM35B -670003 sc-eQTL 6.54e-01 0.0265 0.0592 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -614300 sc-eQTL 7.90e-01 -0.026 0.0973 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000116560 SFPQ -877795 sc-eQTL 2.66e-01 0.0578 0.0518 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000134686 PHC2 884298 sc-eQTL 6.55e-01 0.036 0.0804 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -953359 sc-eQTL 2.93e-01 -0.083 0.0788 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000163866 SMIM12 -544405 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0217 0.0941 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -716595 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0655 0.1 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -716822 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0295 0.0868 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000243749 TMEM35B -670003 sc-eQTL 9.87e-01 -0.000955 0.0592 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -614300 sc-eQTL 2.07e-01 0.124 0.0978 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000116560 SFPQ -877795 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0191 0.0388 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000134686 PHC2 884298 sc-eQTL 2.24e-01 -0.0985 0.0808 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -953359 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0176 0.0711 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000163866 SMIM12 -544405 sc-eQTL 4.10e-02 0.166 0.0809 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -716595 sc-eQTL 1.83e-02 0.224 0.0943 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -716822 sc-eQTL 1.52e-01 0.129 0.0897 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000243749 TMEM35B -670003 sc-eQTL 5.72e-01 0.0298 0.0527 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -614300 sc-eQTL 2.38e-02 0.234 0.102 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000116560 SFPQ -877795 sc-eQTL 2.95e-01 0.0618 0.0588 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000134686 PHC2 884298 sc-eQTL 1.22e-01 0.131 0.0847 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -953359 sc-eQTL 1.14e-01 0.16 0.101 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -544405 sc-eQTL 5.54e-02 0.193 0.1 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -716595 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0412 0.111 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -716822 sc-eQTL 2.33e-01 -0.121 0.101 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000243749 TMEM35B -670003 sc-eQTL 3.40e-01 0.0779 0.0813 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -614300 sc-eQTL 2.13e-01 0.117 0.094 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000116560 SFPQ -877795 sc-eQTL 2.13e-01 -0.0747 0.0597 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000134686 PHC2 884298 sc-eQTL 4.20e-01 0.081 0.1 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -953359 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0672 0.106 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -544405 sc-eQTL 2.03e-01 0.133 0.104 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -716595 sc-eQTL 6.01e-02 0.196 0.103 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -716822 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0226 0.0973 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000243749 TMEM35B -670003 sc-eQTL 4.92e-01 0.0514 0.0747 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -614300 sc-eQTL 2.93e-03 -0.291 0.0965 0.271 MAIT L2
ENSG00000116560 SFPQ -877795 sc-eQTL 4.90e-01 0.0359 0.0519 0.271 MAIT L2
ENSG00000134686 PHC2 884298 sc-eQTL 4.24e-01 0.0694 0.0867 0.271 MAIT L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -953359 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0676 0.093 0.271 MAIT L2
ENSG00000163866 SMIM12 -544405 sc-eQTL 3.82e-01 0.0868 0.0992 0.271 MAIT L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -716595 sc-eQTL 3.13e-01 0.104 0.103 0.271 MAIT L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -716822 sc-eQTL 7.55e-01 0.0308 0.0985 0.271 MAIT L2
ENSG00000243749 TMEM35B -670003 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0881 0.0756 0.271 MAIT L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -614300 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0965 0.0971 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000116560 SFPQ -877795 sc-eQTL 1.41e-01 0.0936 0.0633 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000134686 PHC2 884298 sc-eQTL 1.87e-01 -0.119 0.09 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -953359 sc-eQTL 8.30e-01 0.0194 0.0899 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000163866 SMIM12 -544405 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0432 0.107 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -716595 sc-eQTL 8.72e-01 0.0172 0.107 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -716822 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0633 0.095 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000243749 TMEM35B -670003 sc-eQTL 6.87e-01 0.0334 0.0828 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -614300 sc-eQTL 1.98e-01 0.121 0.094 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000116560 SFPQ -877795 sc-eQTL 3.18e-01 0.0515 0.0515 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000134686 PHC2 884298 sc-eQTL 1.12e-01 0.129 0.0809 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -953359 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0772 0.0678 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000163866 SMIM12 -544405 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00893 0.0908 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -716595 sc-eQTL 1.46e-01 0.14 0.096 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -716822 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0381 0.0911 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000243749 TMEM35B -670003 sc-eQTL 1.69e-01 -0.0726 0.0525 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -614300 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0615 0.0917 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000116560 SFPQ -877795 sc-eQTL 6.64e-01 0.0295 0.0677 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000134686 PHC2 884298 sc-eQTL 4.15e-02 0.177 0.0862 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -953359 sc-eQTL 2.01e-01 0.119 0.0927 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000163866 SMIM12 -544405 sc-eQTL 3.15e-01 0.0982 0.0975 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -716595 sc-eQTL 7.53e-01 0.0322 0.102 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -716822 sc-eQTL 6.05e-02 -0.18 0.0953 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000243749 TMEM35B -670003 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0215 0.0804 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -614300 sc-eQTL 9.75e-02 0.162 0.0974 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000116560 SFPQ -877795 sc-eQTL 7.25e-01 0.0203 0.0575 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000134686 PHC2 884298 sc-eQTL 9.14e-01 0.00899 0.0835 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -953359 sc-eQTL 8.20e-01 0.0167 0.0735 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000163866 SMIM12 -544405 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0455 0.0887 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -716595 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0129 0.102 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -716822 sc-eQTL 8.16e-01 0.0218 0.0935 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000243749 TMEM35B -670003 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00382 0.0531 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -614300 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0872 0.12 0.3 PB L2
ENSG00000116560 SFPQ -877795 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00223 0.0695 0.3 PB L2
ENSG00000134686 PHC2 884298 sc-eQTL 9.29e-01 0.0105 0.117 0.3 PB L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -953359 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0631 0.13 0.3 PB L2
ENSG00000163866 SMIM12 -544405 sc-eQTL 4.50e-01 0.0834 0.11 0.3 PB L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -716595 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0321 0.13 0.3 PB L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -716822 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0222 0.113 0.3 PB L2
ENSG00000243749 TMEM35B -670003 sc-eQTL 7.06e-01 -0.041 0.109 0.3 PB L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -614300 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0638 0.0873 0.276 Pro_T L2
ENSG00000116560 SFPQ -877795 sc-eQTL 3.21e-01 0.0659 0.0663 0.276 Pro_T L2
ENSG00000134686 PHC2 884298 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0862 0.0773 0.276 Pro_T L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -953359 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0768 0.0988 0.276 Pro_T L2
ENSG00000163866 SMIM12 -544405 sc-eQTL 1.83e-01 -0.127 0.0948 0.276 Pro_T L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -716595 sc-eQTL 5.01e-02 -0.202 0.102 0.276 Pro_T L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -716822 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0111 0.0862 0.276 Pro_T L2
ENSG00000243749 TMEM35B -670003 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00356 0.0776 0.276 Pro_T L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -614300 sc-eQTL 6.43e-01 0.046 0.099 0.276 Treg L2
ENSG00000116560 SFPQ -877795 sc-eQTL 8.55e-01 -0.00879 0.0482 0.276 Treg L2
ENSG00000134686 PHC2 884298 sc-eQTL 9.92e-01 0.000838 0.0878 0.276 Treg L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -953359 sc-eQTL 8.42e-01 0.0175 0.0876 0.276 Treg L2
ENSG00000163866 SMIM12 -544405 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0231 0.0959 0.276 Treg L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -716595 sc-eQTL 1.06e-02 0.264 0.102 0.276 Treg L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -716822 sc-eQTL 6.55e-01 0.0395 0.0883 0.276 Treg L2
ENSG00000243749 TMEM35B -670003 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0688 0.0697 0.276 Treg L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -614300 sc-eQTL 2.86e-01 -0.111 0.104 0.28 cDC L2
ENSG00000116560 SFPQ -877795 sc-eQTL 1.64e-01 -0.092 0.0659 0.28 cDC L2
ENSG00000134686 PHC2 884298 sc-eQTL 1.01e-01 0.118 0.0718 0.28 cDC L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -953359 sc-eQTL 3.72e-01 -0.081 0.0905 0.28 cDC L2
ENSG00000163866 SMIM12 -544405 sc-eQTL 1.34e-01 -0.148 0.0985 0.28 cDC L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -716595 sc-eQTL 6.53e-01 0.0468 0.104 0.28 cDC L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -716822 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0963 0.098 0.28 cDC L2
ENSG00000243749 TMEM35B -670003 sc-eQTL 1.32e-01 0.146 0.0966 0.28 cDC L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -614300 sc-eQTL 7.12e-01 0.0355 0.0958 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000116560 SFPQ -877795 sc-eQTL 4.56e-01 0.0366 0.049 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000134686 PHC2 884298 sc-eQTL 3.64e-01 0.044 0.0484 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -953359 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0204 0.064 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000163866 SMIM12 -544405 sc-eQTL 5.73e-02 -0.14 0.0735 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -716595 sc-eQTL 3.68e-02 0.157 0.0745 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -716822 sc-eQTL 4.48e-01 0.0662 0.0871 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000243749 TMEM35B -670003 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0594 0.0717 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -614300 sc-eQTL 8.88e-01 0.0136 0.0967 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000116560 SFPQ -877795 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0545 0.0541 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000134686 PHC2 884298 sc-eQTL 2.26e-01 0.062 0.051 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -953359 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0366 0.0727 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000163866 SMIM12 -544405 sc-eQTL 9.25e-01 0.00803 0.0851 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -716595 sc-eQTL 8.72e-01 0.0145 0.0898 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -716822 sc-eQTL 2.50e-01 0.101 0.0874 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000243749 TMEM35B -670003 sc-eQTL 4.44e-01 0.059 0.0771 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -614300 sc-eQTL 2.26e-01 0.149 0.123 0.276 gdT L2
ENSG00000116560 SFPQ -877795 sc-eQTL 7.10e-02 0.146 0.0803 0.276 gdT L2
ENSG00000134686 PHC2 884298 sc-eQTL 9.95e-01 0.000737 0.108 0.276 gdT L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -953359 sc-eQTL 8.17e-01 0.0275 0.119 0.276 gdT L2
ENSG00000163866 SMIM12 -544405 sc-eQTL 8.79e-01 0.0197 0.129 0.276 gdT L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -716595 sc-eQTL 5.12e-01 0.0874 0.133 0.276 gdT L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -716822 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0837 0.119 0.276 gdT L2
ENSG00000243749 TMEM35B -670003 sc-eQTL 1.27e-01 -0.144 0.0937 0.276 gdT L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -614300 sc-eQTL 8.31e-02 0.166 0.0952 0.278 intMono L2
ENSG00000116560 SFPQ -877795 sc-eQTL 3.41e-01 0.07 0.0733 0.278 intMono L2
ENSG00000134686 PHC2 884298 sc-eQTL 2.62e-02 -0.127 0.0566 0.278 intMono L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -953359 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0933 0.0932 0.278 intMono L2
ENSG00000163866 SMIM12 -544405 sc-eQTL 6.54e-01 -0.044 0.098 0.278 intMono L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -716595 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0361 0.101 0.278 intMono L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -716822 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0458 0.089 0.278 intMono L2
ENSG00000243749 TMEM35B -670003 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0221 0.0867 0.278 intMono L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -614300 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0634 0.0844 0.276 ncMono L2
ENSG00000116560 SFPQ -877795 sc-eQTL 2.42e-01 -0.0899 0.0767 0.276 ncMono L2
ENSG00000134686 PHC2 884298 sc-eQTL 5.56e-02 0.127 0.0659 0.276 ncMono L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -953359 sc-eQTL 5.24e-01 0.0526 0.0823 0.276 ncMono L2
ENSG00000163866 SMIM12 -544405 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0609 0.0921 0.276 ncMono L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -716595 sc-eQTL 2.87e-01 0.102 0.0951 0.276 ncMono L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -716822 sc-eQTL 8.08e-01 0.022 0.0905 0.276 ncMono L2
ENSG00000243749 TMEM35B -670003 sc-eQTL 8.76e-01 0.0138 0.0879 0.276 ncMono L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -614300 sc-eQTL 7.70e-01 0.0324 0.11 0.277 pDC L2
ENSG00000116560 SFPQ -877795 sc-eQTL 3.28e-02 0.154 0.0715 0.277 pDC L2
ENSG00000134686 PHC2 884298 sc-eQTL 4.06e-01 0.0759 0.091 0.277 pDC L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -953359 sc-eQTL 2.07e-01 0.139 0.11 0.277 pDC L2
ENSG00000163866 SMIM12 -544405 sc-eQTL 7.91e-01 0.0306 0.115 0.277 pDC L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -716595 sc-eQTL 3.60e-01 0.0941 0.102 0.277 pDC L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -716822 sc-eQTL 3.57e-01 0.0978 0.106 0.277 pDC L2
ENSG00000243749 TMEM35B -670003 sc-eQTL 1.81e-02 -0.221 0.0926 0.277 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116544 DLGAP3 -614300 sc-eQTL 8.29e-01 0.0208 0.0962 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116560 SFPQ -877795 sc-eQTL 7.81e-01 0.0123 0.0441 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 884298 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0952 0.0803 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146463 ZMYM4 -953359 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0681 0.0752 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -544405 sc-eQTL 8.72e-01 0.0152 0.094 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000163867 ZMYM6 -716595 sc-eQTL 3.96e-01 0.0771 0.0906 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197056 ZMYM1 -716822 sc-eQTL 1.57e-01 -0.137 0.0965 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243749 TMEM35B -670003 sc-eQTL 2.71e-01 0.0673 0.0609 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -614300 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00224 0.098 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116560 SFPQ -877795 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0468 0.0415 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 884298 sc-eQTL 8.74e-01 0.0125 0.0788 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146463 ZMYM4 -953359 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0664 0.0708 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -544405 sc-eQTL 6.08e-01 0.0466 0.0907 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000163867 ZMYM6 -716595 sc-eQTL 6.16e-01 0.048 0.0957 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197056 ZMYM1 -716822 sc-eQTL 1.66e-01 0.125 0.0903 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243749 TMEM35B -670003 sc-eQTL 3.54e-01 0.0524 0.0564 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -614300 sc-eQTL 6.95e-01 0.0371 0.0945 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116560 SFPQ -877795 sc-eQTL 8.77e-01 0.00695 0.0448 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 884298 sc-eQTL 1.67e-01 0.0655 0.0472 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146463 ZMYM4 -953359 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0286 0.0585 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -544405 sc-eQTL 1.44e-01 -0.0998 0.068 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000163867 ZMYM6 -716595 sc-eQTL 1.61e-01 0.0993 0.0705 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197056 ZMYM1 -716822 sc-eQTL 2.18e-01 0.098 0.0794 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243749 TMEM35B -670003 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0127 0.0665 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -614300 sc-eQTL 2.34e-01 0.0917 0.0769 0.276 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116560 SFPQ -877795 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00282 0.0624 0.276 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 884298 sc-eQTL 8.13e-01 0.0133 0.056 0.276 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146463 ZMYM4 -953359 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0206 0.078 0.276 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -544405 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0116 0.0847 0.276 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000163867 ZMYM6 -716595 sc-eQTL 8.99e-01 0.0116 0.0916 0.276 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197056 ZMYM1 -716822 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0496 0.085 0.276 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243749 TMEM35B -670003 sc-eQTL 9.20e-01 0.00789 0.0787 0.276 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -614300 sc-eQTL 7.15e-02 0.172 0.095 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116560 SFPQ -877795 sc-eQTL 9.32e-01 0.004 0.0467 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 884298 sc-eQTL 6.43e-02 0.138 0.074 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146463 ZMYM4 -953359 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0375 0.0604 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -544405 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0348 0.0846 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000163867 ZMYM6 -716595 sc-eQTL 2.47e-01 0.107 0.0917 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197056 ZMYM1 -716822 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0832 0.0868 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243749 TMEM35B -670003 sc-eQTL 1.14e-01 -0.0694 0.0438 0.276 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000222112 \N 978486 2.64e-07 1.06e-07 4.69e-08 1.78e-07 9.91e-08 9.13e-08 1.39e-07 5.29e-08 1.37e-07 4.23e-08 1.6e-07 7.6e-08 1.23e-07 6.21e-08 4.77e-08 7.87e-08 5.15e-08 1.1e-07 5.22e-08 2.88e-08 1.03e-07 1.33e-07 1.29e-07 5.19e-08 1.32e-07 1.09e-07 1.11e-07 8.45e-08 1.05e-07 1.1e-07 9.75e-08 3.29e-08 2.6e-08 8e-08 9.56e-08 3.93e-08 4.7e-08 8.48e-08 8.44e-08 3.87e-08 2.6e-08 1.35e-07 4.36e-08 0.0 1.15e-07 1.8e-08 1.47e-07 4.96e-09 4.72e-08