Genes within 1Mb (chr1:34295763:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116544 DLGAP3 -633887 sc-eQTL 7.77e-01 0.0317 0.112 0.175 B L1
ENSG00000116560 SFPQ -897382 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0242 0.0425 0.175 B L1
ENSG00000134686 PHC2 864711 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0721 0.0895 0.175 B L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -972946 sc-eQTL 2.06e-01 -0.0936 0.0737 0.175 B L1
ENSG00000163866 SMIM12 -563992 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0212 0.0948 0.175 B L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -736182 sc-eQTL 2.90e-01 0.11 0.104 0.175 B L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -736409 sc-eQTL 7.23e-01 0.0356 0.1 0.175 B L1
ENSG00000243749 TMEM35B -689590 sc-eQTL 1.06e-02 0.154 0.0597 0.175 B L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -633887 sc-eQTL 1.74e-01 -0.127 0.0933 0.175 CD4T L1
ENSG00000116560 SFPQ -897382 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0242 0.036 0.175 CD4T L1
ENSG00000134686 PHC2 864711 sc-eQTL 9.03e-01 -0.00918 0.0753 0.175 CD4T L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -972946 sc-eQTL 1.44e-01 0.092 0.0628 0.175 CD4T L1
ENSG00000163866 SMIM12 -563992 sc-eQTL 7.02e-01 0.0302 0.0788 0.175 CD4T L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -736182 sc-eQTL 6.67e-01 0.0418 0.097 0.175 CD4T L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -736409 sc-eQTL 3.38e-01 0.0638 0.0664 0.175 CD4T L1
ENSG00000243749 TMEM35B -689590 sc-eQTL 3.69e-02 0.0899 0.0428 0.175 CD4T L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -633887 sc-eQTL 2.75e-02 0.24 0.108 0.175 CD8T L1
ENSG00000116560 SFPQ -897382 sc-eQTL 1.61e-01 -0.0531 0.0377 0.175 CD8T L1
ENSG00000134686 PHC2 864711 sc-eQTL 9.32e-01 0.00734 0.0856 0.175 CD8T L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -972946 sc-eQTL 1.49e-01 -0.121 0.0837 0.175 CD8T L1
ENSG00000163866 SMIM12 -563992 sc-eQTL 3.53e-01 0.0844 0.0907 0.175 CD8T L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -736182 sc-eQTL 2.11e-02 0.256 0.11 0.175 CD8T L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -736409 sc-eQTL 3.60e-01 0.0874 0.0953 0.175 CD8T L1
ENSG00000243749 TMEM35B -689590 sc-eQTL 4.96e-01 0.0376 0.0551 0.175 CD8T L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -633887 sc-eQTL 4.37e-01 0.0831 0.107 0.178 DC L1
ENSG00000116560 SFPQ -897382 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00141 0.0666 0.178 DC L1
ENSG00000134686 PHC2 864711 sc-eQTL 3.62e-01 0.0708 0.0774 0.178 DC L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -972946 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0499 0.0988 0.178 DC L1
ENSG00000163866 SMIM12 -563992 sc-eQTL 4.61e-01 -0.078 0.106 0.178 DC L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -736182 sc-eQTL 8.85e-01 0.0144 0.1 0.178 DC L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -736409 sc-eQTL 3.41e-01 -0.104 0.109 0.178 DC L1
ENSG00000243749 TMEM35B -689590 sc-eQTL 9.92e-01 0.000981 0.096 0.178 DC L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -633887 sc-eQTL 9.79e-01 0.00281 0.107 0.175 Mono L1
ENSG00000116560 SFPQ -897382 sc-eQTL 7.63e-01 0.0166 0.0549 0.175 Mono L1
ENSG00000134686 PHC2 864711 sc-eQTL 8.71e-01 0.0092 0.0567 0.175 Mono L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -972946 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0743 0.0669 0.175 Mono L1
ENSG00000163866 SMIM12 -563992 sc-eQTL 2.12e-01 -0.101 0.0807 0.175 Mono L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -736182 sc-eQTL 1.50e-01 0.115 0.0796 0.175 Mono L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -736409 sc-eQTL 7.11e-02 0.164 0.0905 0.175 Mono L1
ENSG00000243749 TMEM35B -689590 sc-eQTL 4.88e-01 0.0536 0.0771 0.175 Mono L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -633887 sc-eQTL 1.52e-01 0.163 0.114 0.176 NK L1
ENSG00000116560 SFPQ -897382 sc-eQTL 4.96e-01 -0.035 0.0513 0.176 NK L1
ENSG00000134686 PHC2 864711 sc-eQTL 1.86e-01 0.115 0.0869 0.176 NK L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -972946 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0253 0.066 0.176 NK L1
ENSG00000163866 SMIM12 -563992 sc-eQTL 9.48e-01 0.00644 0.0991 0.176 NK L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -736182 sc-eQTL 1.27e-01 0.165 0.108 0.176 NK L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -736409 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0894 0.101 0.176 NK L1
ENSG00000243749 TMEM35B -689590 sc-eQTL 6.88e-01 0.0208 0.0517 0.176 NK L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -633887 sc-eQTL 3.13e-01 -0.117 0.116 0.175 Other_T L1
ENSG00000116560 SFPQ -897382 sc-eQTL 3.02e-01 0.0622 0.0601 0.175 Other_T L1
ENSG00000134686 PHC2 864711 sc-eQTL 1.09e-02 -0.23 0.0895 0.175 Other_T L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -972946 sc-eQTL 1.12e-01 -0.151 0.0947 0.175 Other_T L1
ENSG00000163866 SMIM12 -563992 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0393 0.0985 0.175 Other_T L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -736182 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0424 0.117 0.175 Other_T L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -736409 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0252 0.0988 0.175 Other_T L1
ENSG00000243749 TMEM35B -689590 sc-eQTL 1.59e-01 -0.0914 0.0646 0.175 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116544 DLGAP3 -633887 sc-eQTL 1.86e-01 -0.139 0.105 0.171 B_Activated L2
ENSG00000116560 SFPQ -897382 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0392 0.0815 0.171 B_Activated L2
ENSG00000134686 PHC2 864711 sc-eQTL 9.51e-01 0.0078 0.126 0.171 B_Activated L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -972946 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00615 0.136 0.171 B_Activated L2
ENSG00000163866 SMIM12 -563992 sc-eQTL 7.44e-02 0.245 0.136 0.171 B_Activated L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -736182 sc-eQTL 4.32e-01 0.108 0.136 0.171 B_Activated L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -736409 sc-eQTL 8.63e-01 0.0196 0.114 0.171 B_Activated L2
ENSG00000243749 TMEM35B -689590 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00121 0.113 0.171 B_Activated L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -633887 sc-eQTL 5.36e-01 0.0708 0.114 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000116560 SFPQ -897382 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0192 0.0629 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000134686 PHC2 864711 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0265 0.0998 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -972946 sc-eQTL 5.73e-01 0.0568 0.101 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000163866 SMIM12 -563992 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0611 0.118 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -736182 sc-eQTL 3.89e-01 0.1 0.116 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -736409 sc-eQTL 3.54e-01 -0.112 0.12 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000243749 TMEM35B -689590 sc-eQTL 1.12e-01 0.142 0.0888 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -633887 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0118 0.109 0.175 B_Memory L2
ENSG00000116560 SFPQ -897382 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0122 0.0698 0.175 B_Memory L2
ENSG00000134686 PHC2 864711 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0511 0.105 0.175 B_Memory L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -972946 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00686 0.108 0.175 B_Memory L2
ENSG00000163866 SMIM12 -563992 sc-eQTL 1.47e-01 0.169 0.116 0.175 B_Memory L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -736182 sc-eQTL 3.38e-01 0.116 0.121 0.175 B_Memory L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -736409 sc-eQTL 9.23e-02 -0.196 0.116 0.175 B_Memory L2
ENSG00000243749 TMEM35B -689590 sc-eQTL 9.09e-01 0.00968 0.0849 0.175 B_Memory L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -633887 sc-eQTL 2.23e-01 0.139 0.113 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000116560 SFPQ -897382 sc-eQTL 2.37e-01 -0.062 0.0523 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000134686 PHC2 864711 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0422 0.0954 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -972946 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0962 0.0906 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000163866 SMIM12 -563992 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0158 0.111 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -736182 sc-eQTL 7.80e-01 0.032 0.114 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -736409 sc-eQTL 5.19e-01 0.0694 0.108 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000243749 TMEM35B -689590 sc-eQTL 3.15e-01 0.0838 0.0831 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -633887 sc-eQTL 6.73e-01 -0.054 0.128 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000116560 SFPQ -897382 sc-eQTL 9.89e-01 -0.000904 0.0667 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000134686 PHC2 864711 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0813 0.106 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -972946 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0661 0.104 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000163866 SMIM12 -563992 sc-eQTL 2.70e-01 -0.138 0.125 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -736182 sc-eQTL 8.79e-01 -0.019 0.125 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -736409 sc-eQTL 9.37e-02 0.198 0.117 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000243749 TMEM35B -689590 sc-eQTL 7.94e-02 0.149 0.0847 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -633887 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0885 0.113 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000116560 SFPQ -897382 sc-eQTL 2.56e-01 0.0925 0.0812 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000134686 PHC2 864711 sc-eQTL 2.58e-02 -0.241 0.107 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -972946 sc-eQTL 1.97e-01 0.158 0.122 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000163866 SMIM12 -563992 sc-eQTL 6.22e-01 0.0572 0.116 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -736182 sc-eQTL 5.88e-01 0.0681 0.125 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -736409 sc-eQTL 9.78e-01 0.00357 0.127 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000243749 TMEM35B -689590 sc-eQTL 1.77e-01 0.13 0.0957 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -633887 sc-eQTL 8.59e-01 0.0193 0.108 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000116560 SFPQ -897382 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0171 0.0377 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000134686 PHC2 864711 sc-eQTL 6.99e-01 0.0304 0.0784 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -972946 sc-eQTL 2.45e-01 0.0796 0.0682 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000163866 SMIM12 -563992 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0237 0.0769 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -736182 sc-eQTL 8.67e-01 0.0174 0.103 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -736409 sc-eQTL 3.63e-01 0.0721 0.079 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000243749 TMEM35B -689590 sc-eQTL 5.73e-01 0.0266 0.047 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -633887 sc-eQTL 1.78e-01 -0.129 0.0952 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000116560 SFPQ -897382 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0458 0.0452 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000134686 PHC2 864711 sc-eQTL 8.34e-01 0.0186 0.0884 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -972946 sc-eQTL 2.30e-01 0.102 0.0851 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -563992 sc-eQTL 2.62e-01 0.113 0.1 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -736182 sc-eQTL 9.11e-01 0.0126 0.112 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -736409 sc-eQTL 2.19e-01 -0.111 0.0902 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000243749 TMEM35B -689590 sc-eQTL 9.84e-03 0.132 0.0506 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -633887 sc-eQTL 1.39e-01 -0.173 0.116 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000116560 SFPQ -897382 sc-eQTL 5.85e-01 0.0288 0.0527 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000134686 PHC2 864711 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0133 0.104 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -972946 sc-eQTL 9.00e-01 0.0136 0.108 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -563992 sc-eQTL 1.03e-01 -0.178 0.109 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -736182 sc-eQTL 3.20e-01 -0.112 0.112 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -736409 sc-eQTL 6.14e-02 0.205 0.109 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000243749 TMEM35B -689590 sc-eQTL 3.46e-01 0.066 0.0699 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -633887 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0087 0.114 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000116560 SFPQ -897382 sc-eQTL 7.15e-01 0.0223 0.0611 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000134686 PHC2 864711 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0236 0.0946 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -972946 sc-eQTL 1.54e-01 -0.132 0.0924 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000163866 SMIM12 -563992 sc-eQTL 3.42e-01 -0.105 0.11 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -736182 sc-eQTL 9.58e-01 0.00616 0.118 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -736409 sc-eQTL 8.69e-01 0.0168 0.102 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000243749 TMEM35B -689590 sc-eQTL 7.04e-01 0.0265 0.0696 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -633887 sc-eQTL 2.91e-01 0.123 0.116 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000116560 SFPQ -897382 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0226 0.0461 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000134686 PHC2 864711 sc-eQTL 8.32e-01 0.0204 0.0962 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -972946 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0465 0.0843 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000163866 SMIM12 -563992 sc-eQTL 9.94e-02 0.159 0.0963 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -736182 sc-eQTL 3.70e-02 0.236 0.112 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -736409 sc-eQTL 3.40e-02 0.226 0.106 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000243749 TMEM35B -689590 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0383 0.0625 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -633887 sc-eQTL 2.57e-01 0.136 0.12 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000116560 SFPQ -897382 sc-eQTL 1.40e-01 0.101 0.0678 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000134686 PHC2 864711 sc-eQTL 2.57e-01 0.112 0.0982 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -972946 sc-eQTL 6.52e-02 0.216 0.117 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -563992 sc-eQTL 9.50e-02 0.195 0.116 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -736182 sc-eQTL 2.73e-01 -0.14 0.128 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -736409 sc-eQTL 1.09e-01 -0.187 0.116 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000243749 TMEM35B -689590 sc-eQTL 3.88e-01 0.0814 0.0941 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -633887 sc-eQTL 8.50e-01 0.0223 0.117 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000116560 SFPQ -897382 sc-eQTL 7.81e-02 -0.131 0.0739 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000134686 PHC2 864711 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00851 0.125 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -972946 sc-eQTL 1.07e-01 -0.211 0.131 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -563992 sc-eQTL 6.80e-02 0.237 0.129 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -736182 sc-eQTL 5.73e-02 0.246 0.128 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -736409 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0394 0.121 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000243749 TMEM35B -689590 sc-eQTL 1.27e-01 0.142 0.0923 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -633887 sc-eQTL 1.80e-02 -0.271 0.114 0.173 MAIT L2
ENSG00000116560 SFPQ -897382 sc-eQTL 5.12e-01 0.0399 0.0606 0.173 MAIT L2
ENSG00000134686 PHC2 864711 sc-eQTL 9.53e-01 0.00596 0.101 0.173 MAIT L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -972946 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0599 0.109 0.173 MAIT L2
ENSG00000163866 SMIM12 -563992 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0665 0.116 0.173 MAIT L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -736182 sc-eQTL 5.47e-01 0.0728 0.121 0.173 MAIT L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -736409 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0944 0.115 0.173 MAIT L2
ENSG00000243749 TMEM35B -689590 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0563 0.0884 0.173 MAIT L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -633887 sc-eQTL 1.99e-01 -0.146 0.114 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000116560 SFPQ -897382 sc-eQTL 3.49e-01 0.0699 0.0744 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000134686 PHC2 864711 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0581 0.106 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -972946 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0191 0.105 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000163866 SMIM12 -563992 sc-eQTL 7.36e-01 0.0423 0.125 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -736182 sc-eQTL 2.68e-01 -0.139 0.125 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -736409 sc-eQTL 4.61e-01 0.0822 0.111 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000243749 TMEM35B -689590 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0684 0.0969 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -633887 sc-eQTL 3.61e-01 0.101 0.111 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000116560 SFPQ -897382 sc-eQTL 8.38e-01 0.0124 0.0605 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000134686 PHC2 864711 sc-eQTL 2.31e-01 0.114 0.0952 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -972946 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0478 0.0798 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000163866 SMIM12 -563992 sc-eQTL 3.05e-01 -0.109 0.106 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -736182 sc-eQTL 3.18e-01 0.113 0.113 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -736409 sc-eQTL 1.76e-01 -0.144 0.107 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000243749 TMEM35B -689590 sc-eQTL 4.72e-01 0.0446 0.0619 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -633887 sc-eQTL 8.37e-01 0.0227 0.11 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000116560 SFPQ -897382 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0103 0.0813 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000134686 PHC2 864711 sc-eQTL 1.04e-01 0.17 0.104 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -972946 sc-eQTL 1.42e-01 0.164 0.111 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000163866 SMIM12 -563992 sc-eQTL 3.08e-01 0.12 0.117 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -736182 sc-eQTL 6.40e-01 0.0573 0.122 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -736409 sc-eQTL 3.29e-01 -0.113 0.115 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000243749 TMEM35B -689590 sc-eQTL 7.56e-01 0.03 0.0965 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -633887 sc-eQTL 2.58e-02 0.257 0.115 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000116560 SFPQ -897382 sc-eQTL 8.72e-01 0.011 0.068 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000134686 PHC2 864711 sc-eQTL 5.99e-01 0.052 0.0987 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -972946 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0195 0.0869 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000163866 SMIM12 -563992 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0245 0.105 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -736182 sc-eQTL 2.56e-01 0.137 0.12 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -736409 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00721 0.111 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000243749 TMEM35B -689590 sc-eQTL 3.21e-01 0.0622 0.0626 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -633887 sc-eQTL 1.36e-01 -0.216 0.144 0.193 PB L2
ENSG00000116560 SFPQ -897382 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0506 0.0836 0.193 PB L2
ENSG00000134686 PHC2 864711 sc-eQTL 8.70e-01 -0.023 0.141 0.193 PB L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -972946 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0279 0.156 0.193 PB L2
ENSG00000163866 SMIM12 -563992 sc-eQTL 2.08e-01 0.167 0.132 0.193 PB L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -736182 sc-eQTL 7.46e-01 0.051 0.157 0.193 PB L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -736409 sc-eQTL 3.89e-01 0.117 0.136 0.193 PB L2
ENSG00000243749 TMEM35B -689590 sc-eQTL 6.55e-01 0.0586 0.131 0.193 PB L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -633887 sc-eQTL 9.54e-01 0.00597 0.104 0.176 Pro_T L2
ENSG00000116560 SFPQ -897382 sc-eQTL 1.75e-01 0.107 0.0784 0.176 Pro_T L2
ENSG00000134686 PHC2 864711 sc-eQTL 5.52e-02 -0.176 0.091 0.176 Pro_T L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -972946 sc-eQTL 8.96e-02 -0.199 0.116 0.176 Pro_T L2
ENSG00000163866 SMIM12 -563992 sc-eQTL 2.64e-01 -0.126 0.112 0.176 Pro_T L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -736182 sc-eQTL 6.16e-02 -0.228 0.121 0.176 Pro_T L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -736409 sc-eQTL 7.88e-01 0.0274 0.102 0.176 Pro_T L2
ENSG00000243749 TMEM35B -689590 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0553 0.0919 0.176 Pro_T L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -633887 sc-eQTL 3.41e-01 -0.112 0.117 0.175 Treg L2
ENSG00000116560 SFPQ -897382 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0462 0.0571 0.175 Treg L2
ENSG00000134686 PHC2 864711 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0308 0.104 0.175 Treg L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -972946 sc-eQTL 9.23e-01 -0.01 0.104 0.175 Treg L2
ENSG00000163866 SMIM12 -563992 sc-eQTL 6.11e-01 0.058 0.114 0.175 Treg L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -736182 sc-eQTL 5.50e-02 0.236 0.122 0.175 Treg L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -736409 sc-eQTL 4.74e-01 0.0752 0.105 0.175 Treg L2
ENSG00000243749 TMEM35B -689590 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0189 0.0829 0.175 Treg L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -633887 sc-eQTL 8.60e-01 0.0216 0.122 0.176 cDC L2
ENSG00000116560 SFPQ -897382 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0279 0.0772 0.176 cDC L2
ENSG00000134686 PHC2 864711 sc-eQTL 6.16e-02 0.157 0.0835 0.176 cDC L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -972946 sc-eQTL 2.52e-01 -0.121 0.105 0.176 cDC L2
ENSG00000163866 SMIM12 -563992 sc-eQTL 1.45e-01 -0.168 0.115 0.176 cDC L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -736182 sc-eQTL 6.99e-01 0.0469 0.121 0.176 cDC L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -736409 sc-eQTL 4.86e-02 -0.225 0.113 0.176 cDC L2
ENSG00000243749 TMEM35B -689590 sc-eQTL 7.33e-01 0.0387 0.113 0.176 cDC L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -633887 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0203 0.114 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000116560 SFPQ -897382 sc-eQTL 5.99e-01 0.0308 0.0584 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000134686 PHC2 864711 sc-eQTL 8.99e-01 -0.00735 0.0578 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -972946 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0691 0.0762 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000163866 SMIM12 -563992 sc-eQTL 1.16e-01 -0.139 0.0878 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -736182 sc-eQTL 1.67e-01 0.124 0.0894 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -736409 sc-eQTL 4.04e-01 0.0869 0.104 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000243749 TMEM35B -689590 sc-eQTL 3.14e-01 0.0863 0.0854 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -633887 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00672 0.116 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000116560 SFPQ -897382 sc-eQTL 4.42e-01 -0.05 0.0648 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000134686 PHC2 864711 sc-eQTL 4.14e-01 0.0501 0.0612 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -972946 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0648 0.0869 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000163866 SMIM12 -563992 sc-eQTL 5.55e-01 0.0601 0.102 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -736182 sc-eQTL 7.03e-01 0.0409 0.107 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -736409 sc-eQTL 4.62e-02 0.208 0.104 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000243749 TMEM35B -689590 sc-eQTL 5.79e-01 0.0513 0.0923 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -633887 sc-eQTL 1.07e-01 0.23 0.142 0.17 gdT L2
ENSG00000116560 SFPQ -897382 sc-eQTL 7.21e-03 0.25 0.0918 0.17 gdT L2
ENSG00000134686 PHC2 864711 sc-eQTL 3.99e-01 -0.106 0.125 0.17 gdT L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -972946 sc-eQTL 7.01e-01 0.053 0.138 0.17 gdT L2
ENSG00000163866 SMIM12 -563992 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0551 0.149 0.17 gdT L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -736182 sc-eQTL 9.65e-01 0.00687 0.154 0.17 gdT L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -736409 sc-eQTL 8.58e-01 0.0248 0.139 0.17 gdT L2
ENSG00000243749 TMEM35B -689590 sc-eQTL 7.65e-01 0.0327 0.109 0.17 gdT L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -633887 sc-eQTL 2.84e-01 0.122 0.114 0.173 intMono L2
ENSG00000116560 SFPQ -897382 sc-eQTL 2.11e-01 0.109 0.087 0.173 intMono L2
ENSG00000134686 PHC2 864711 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0749 0.0679 0.173 intMono L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -972946 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0655 0.111 0.173 intMono L2
ENSG00000163866 SMIM12 -563992 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0353 0.117 0.173 intMono L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -736182 sc-eQTL 7.97e-01 0.031 0.12 0.173 intMono L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -736409 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0815 0.106 0.173 intMono L2
ENSG00000243749 TMEM35B -689590 sc-eQTL 9.15e-01 0.011 0.103 0.173 intMono L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -633887 sc-eQTL 3.11e-01 -0.102 0.0999 0.174 ncMono L2
ENSG00000116560 SFPQ -897382 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0784 0.0911 0.174 ncMono L2
ENSG00000134686 PHC2 864711 sc-eQTL 2.33e-01 0.0939 0.0785 0.174 ncMono L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -972946 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0833 0.0975 0.174 ncMono L2
ENSG00000163866 SMIM12 -563992 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0845 0.109 0.174 ncMono L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -736182 sc-eQTL 4.94e-01 0.0773 0.113 0.174 ncMono L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -736409 sc-eQTL 3.35e-01 0.104 0.107 0.174 ncMono L2
ENSG00000243749 TMEM35B -689590 sc-eQTL 1.51e-01 0.149 0.104 0.174 ncMono L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -633887 sc-eQTL 3.16e-01 0.133 0.132 0.161 pDC L2
ENSG00000116560 SFPQ -897382 sc-eQTL 1.76e-01 0.118 0.0865 0.161 pDC L2
ENSG00000134686 PHC2 864711 sc-eQTL 3.04e-01 -0.112 0.109 0.161 pDC L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -972946 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00389 0.132 0.161 pDC L2
ENSG00000163866 SMIM12 -563992 sc-eQTL 8.43e-01 0.0273 0.138 0.161 pDC L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -736182 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00224 0.123 0.161 pDC L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -736409 sc-eQTL 4.84e-01 0.0892 0.127 0.161 pDC L2
ENSG00000243749 TMEM35B -689590 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0864 0.113 0.161 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116544 DLGAP3 -633887 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000515 0.116 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116560 SFPQ -897382 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0211 0.0532 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 864711 sc-eQTL 8.28e-01 0.0212 0.0971 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146463 ZMYM4 -972946 sc-eQTL 8.23e-01 0.0203 0.0908 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -563992 sc-eQTL 5.41e-01 0.0693 0.113 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000163867 ZMYM6 -736182 sc-eQTL 4.51e-02 0.218 0.108 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197056 ZMYM1 -736409 sc-eQTL 1.48e-01 -0.169 0.116 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243749 TMEM35B -689590 sc-eQTL 1.22e-01 0.114 0.0732 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -633887 sc-eQTL 4.81e-01 0.0847 0.12 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116560 SFPQ -897382 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0505 0.051 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 864711 sc-eQTL 5.91e-01 -0.052 0.0965 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146463 ZMYM4 -972946 sc-eQTL 1.26e-01 -0.133 0.0865 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -563992 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0945 0.111 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000163867 ZMYM6 -736182 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0285 0.117 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197056 ZMYM1 -736409 sc-eQTL 1.74e-01 0.151 0.111 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243749 TMEM35B -689590 sc-eQTL 3.99e-02 0.142 0.0687 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -633887 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0212 0.113 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116560 SFPQ -897382 sc-eQTL 8.88e-01 0.00752 0.0535 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 864711 sc-eQTL 7.20e-01 0.0203 0.0566 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146463 ZMYM4 -972946 sc-eQTL 2.89e-01 -0.074 0.0697 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -563992 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0756 0.0813 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000163867 ZMYM6 -736182 sc-eQTL 3.09e-01 0.086 0.0843 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197056 ZMYM1 -736409 sc-eQTL 1.14e-01 0.15 0.0945 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243749 TMEM35B -689590 sc-eQTL 4.31e-01 0.0625 0.0792 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -633887 sc-eQTL 5.09e-01 0.0614 0.0927 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116560 SFPQ -897382 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0173 0.0751 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 864711 sc-eQTL 8.82e-01 0.00999 0.0674 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146463 ZMYM4 -972946 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0807 0.0937 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -563992 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0617 0.102 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000163867 ZMYM6 -736182 sc-eQTL 7.08e-01 0.0412 0.11 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197056 ZMYM1 -736409 sc-eQTL 6.47e-01 0.0469 0.102 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243749 TMEM35B -689590 sc-eQTL 1.64e-01 0.132 0.0942 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -633887 sc-eQTL 9.39e-02 0.19 0.113 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116560 SFPQ -897382 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0403 0.0553 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 864711 sc-eQTL 1.36e-01 0.132 0.088 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146463 ZMYM4 -972946 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0114 0.0717 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -563992 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0357 0.1 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000163867 ZMYM6 -736182 sc-eQTL 3.86e-02 0.225 0.108 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197056 ZMYM1 -736409 sc-eQTL 2.10e-01 -0.129 0.103 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243749 TMEM35B -689590 sc-eQTL 6.59e-01 0.023 0.0522 0.175 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000134686 \N 864711 2.77e-07 1.35e-07 5.93e-08 2.05e-07 1.03e-07 8.21e-08 2.1e-07 5.43e-08 1.54e-07 6.75e-08 1.59e-07 1.01e-07 1.95e-07 7.64e-08 6.18e-08 8.08e-08 4.31e-08 1.64e-07 7.12e-08 4.8e-08 1.18e-07 1.31e-07 1.58e-07 2.91e-08 1.85e-07 1.23e-07 1.17e-07 1.12e-07 1.31e-07 1.1e-07 1.07e-07 3.06e-08 4.02e-08 8.23e-08 4.92e-08 2.99e-08 5.45e-08 8.68e-08 6.71e-08 4.19e-08 5.28e-08 1.5e-07 3.08e-08 1.55e-08 2.64e-08 1.8e-08 8.46e-08 1.89e-09 5.02e-08