Genes within 1Mb (chr1:34287031:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116544 DLGAP3 -642619 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00582 0.0959 0.254 B L1
ENSG00000116560 SFPQ -906114 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0119 0.0365 0.254 B L1
ENSG00000134686 PHC2 855979 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0555 0.0769 0.254 B L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -981678 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0258 0.0635 0.254 B L1
ENSG00000163866 SMIM12 -572724 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0333 0.0813 0.254 B L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -744914 sc-eQTL 1.64e-01 0.124 0.0889 0.254 B L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -745141 sc-eQTL 6.21e-01 0.0426 0.0861 0.254 B L1
ENSG00000243749 TMEM35B -698322 sc-eQTL 1.39e-01 0.077 0.0518 0.254 B L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -642619 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0843 0.0803 0.254 CD4T L1
ENSG00000116560 SFPQ -906114 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0145 0.0309 0.254 CD4T L1
ENSG00000134686 PHC2 855979 sc-eQTL 9.84e-01 0.00132 0.0647 0.254 CD4T L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -981678 sc-eQTL 3.97e-01 0.0459 0.0541 0.254 CD4T L1
ENSG00000163866 SMIM12 -572724 sc-eQTL 8.84e-01 -0.00991 0.0677 0.254 CD4T L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -744914 sc-eQTL 9.60e-01 0.00419 0.0833 0.254 CD4T L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -745141 sc-eQTL 3.04e-01 0.0588 0.0571 0.254 CD4T L1
ENSG00000243749 TMEM35B -698322 sc-eQTL 2.13e-01 0.0462 0.037 0.254 CD4T L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -642619 sc-eQTL 2.91e-03 0.277 0.0921 0.254 CD8T L1
ENSG00000116560 SFPQ -906114 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0391 0.0325 0.254 CD8T L1
ENSG00000134686 PHC2 855979 sc-eQTL 7.65e-01 0.022 0.0737 0.254 CD8T L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -981678 sc-eQTL 1.72e-01 -0.0988 0.0721 0.254 CD8T L1
ENSG00000163866 SMIM12 -572724 sc-eQTL 5.41e-01 0.0478 0.0782 0.254 CD8T L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -744914 sc-eQTL 6.60e-02 0.177 0.0955 0.254 CD8T L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -745141 sc-eQTL 2.46e-01 0.0954 0.082 0.254 CD8T L1
ENSG00000243749 TMEM35B -698322 sc-eQTL 5.57e-01 0.028 0.0475 0.254 CD8T L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -642619 sc-eQTL 4.13e-01 0.0773 0.0942 0.257 DC L1
ENSG00000116560 SFPQ -906114 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0087 0.0588 0.257 DC L1
ENSG00000134686 PHC2 855979 sc-eQTL 1.09e-01 0.11 0.068 0.257 DC L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -981678 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0722 0.0871 0.257 DC L1
ENSG00000163866 SMIM12 -572724 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0294 0.0932 0.257 DC L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -744914 sc-eQTL 6.52e-01 0.0399 0.0883 0.257 DC L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -745141 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0512 0.0959 0.257 DC L1
ENSG00000243749 TMEM35B -698322 sc-eQTL 8.88e-01 -0.012 0.0847 0.257 DC L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -642619 sc-eQTL 5.12e-01 0.0603 0.0919 0.254 Mono L1
ENSG00000116560 SFPQ -906114 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00125 0.0473 0.254 Mono L1
ENSG00000134686 PHC2 855979 sc-eQTL 2.62e-01 0.0549 0.0487 0.254 Mono L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -981678 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0364 0.0577 0.254 Mono L1
ENSG00000163866 SMIM12 -572724 sc-eQTL 1.83e-01 -0.0929 0.0695 0.254 Mono L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -744914 sc-eQTL 8.02e-02 0.12 0.0684 0.254 Mono L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -745141 sc-eQTL 1.10e-01 0.125 0.0781 0.254 Mono L1
ENSG00000243749 TMEM35B -698322 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0109 0.0665 0.254 Mono L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -642619 sc-eQTL 4.81e-02 0.196 0.0986 0.255 NK L1
ENSG00000116560 SFPQ -906114 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0154 0.0448 0.255 NK L1
ENSG00000134686 PHC2 855979 sc-eQTL 1.14e-01 0.12 0.0757 0.255 NK L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -981678 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0357 0.0575 0.255 NK L1
ENSG00000163866 SMIM12 -572724 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0684 0.0863 0.255 NK L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -744914 sc-eQTL 3.97e-01 0.08 0.0942 0.255 NK L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -745141 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0804 0.0877 0.255 NK L1
ENSG00000243749 TMEM35B -698322 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0462 0.045 0.255 NK L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -642619 sc-eQTL 1.48e-01 -0.145 0.1 0.254 Other_T L1
ENSG00000116560 SFPQ -906114 sc-eQTL 7.56e-01 0.0162 0.0521 0.254 Other_T L1
ENSG00000134686 PHC2 855979 sc-eQTL 2.07e-01 -0.0992 0.0783 0.254 Other_T L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -981678 sc-eQTL 1.00e-01 -0.135 0.0819 0.254 Other_T L1
ENSG00000163866 SMIM12 -572724 sc-eQTL 8.94e-01 0.0114 0.0853 0.254 Other_T L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -744914 sc-eQTL 4.26e-01 0.081 0.101 0.254 Other_T L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -745141 sc-eQTL 6.19e-01 0.0425 0.0855 0.254 Other_T L1
ENSG00000243749 TMEM35B -698322 sc-eQTL 1.10e-01 -0.0895 0.0558 0.254 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116544 DLGAP3 -642619 sc-eQTL 1.06e-01 -0.148 0.0909 0.253 B_Activated L2
ENSG00000116560 SFPQ -906114 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0169 0.0709 0.253 B_Activated L2
ENSG00000134686 PHC2 855979 sc-eQTL 3.37e-01 0.105 0.109 0.253 B_Activated L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -981678 sc-eQTL 7.82e-01 0.0329 0.119 0.253 B_Activated L2
ENSG00000163866 SMIM12 -572724 sc-eQTL 4.01e-01 0.1 0.119 0.253 B_Activated L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -744914 sc-eQTL 4.84e-01 0.0833 0.119 0.253 B_Activated L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -745141 sc-eQTL 3.22e-01 0.0981 0.0987 0.253 B_Activated L2
ENSG00000243749 TMEM35B -698322 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0113 0.0981 0.253 B_Activated L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -642619 sc-eQTL 3.19e-01 0.0962 0.0962 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000116560 SFPQ -906114 sc-eQTL 9.85e-01 0.000987 0.0531 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000134686 PHC2 855979 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00872 0.0842 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -981678 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0294 0.0849 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000163866 SMIM12 -572724 sc-eQTL 1.02e-01 -0.163 0.0993 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -744914 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0153 0.0983 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -745141 sc-eQTL 2.14e-01 -0.126 0.101 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000243749 TMEM35B -698322 sc-eQTL 4.65e-01 0.0552 0.0753 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -642619 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0198 0.0931 0.254 B_Memory L2
ENSG00000116560 SFPQ -906114 sc-eQTL 8.40e-01 -0.012 0.0595 0.254 B_Memory L2
ENSG00000134686 PHC2 855979 sc-eQTL 2.19e-02 -0.204 0.0885 0.254 B_Memory L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -981678 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0139 0.0923 0.254 B_Memory L2
ENSG00000163866 SMIM12 -572724 sc-eQTL 4.77e-01 0.0706 0.0991 0.254 B_Memory L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -744914 sc-eQTL 4.72e-01 0.0744 0.103 0.254 B_Memory L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -745141 sc-eQTL 2.69e-01 -0.11 0.099 0.254 B_Memory L2
ENSG00000243749 TMEM35B -698322 sc-eQTL 8.42e-01 0.0144 0.0724 0.254 B_Memory L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -642619 sc-eQTL 4.55e-01 0.0721 0.0964 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000116560 SFPQ -906114 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0278 0.0445 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000134686 PHC2 855979 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0134 0.0809 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -981678 sc-eQTL 9.06e-01 0.00914 0.077 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000163866 SMIM12 -572724 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0136 0.0943 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -744914 sc-eQTL 4.10e-01 0.08 0.0969 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -745141 sc-eQTL 6.06e-01 0.0471 0.0912 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000243749 TMEM35B -698322 sc-eQTL 5.07e-01 0.0469 0.0706 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -642619 sc-eQTL 2.09e-01 -0.135 0.107 0.253 B_Naive2 L2
ENSG00000116560 SFPQ -906114 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0158 0.0562 0.253 B_Naive2 L2
ENSG00000134686 PHC2 855979 sc-eQTL 4.09e-01 0.0738 0.0892 0.253 B_Naive2 L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -981678 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0399 0.0878 0.253 B_Naive2 L2
ENSG00000163866 SMIM12 -572724 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0201 0.105 0.253 B_Naive2 L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -744914 sc-eQTL 8.07e-01 0.0258 0.105 0.253 B_Naive2 L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -745141 sc-eQTL 2.32e-01 0.119 0.0991 0.253 B_Naive2 L2
ENSG00000243749 TMEM35B -698322 sc-eQTL 3.67e-01 0.0648 0.0717 0.253 B_Naive2 L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -642619 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0843 0.101 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000116560 SFPQ -906114 sc-eQTL 9.12e-01 0.00813 0.0732 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000134686 PHC2 855979 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0284 0.0975 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -981678 sc-eQTL 2.58e-01 0.125 0.11 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000163866 SMIM12 -572724 sc-eQTL 8.32e-01 0.0221 0.104 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -744914 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0177 0.113 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -745141 sc-eQTL 7.22e-01 0.0406 0.114 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000243749 TMEM35B -698322 sc-eQTL 9.30e-01 0.00764 0.0864 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -642619 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0513 0.0932 0.254 CD4_Naive L2
ENSG00000116560 SFPQ -906114 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0196 0.0325 0.254 CD4_Naive L2
ENSG00000134686 PHC2 855979 sc-eQTL 9.94e-01 0.000521 0.0674 0.254 CD4_Naive L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -981678 sc-eQTL 4.33e-01 0.0462 0.0588 0.254 CD4_Naive L2
ENSG00000163866 SMIM12 -572724 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0281 0.0662 0.254 CD4_Naive L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -744914 sc-eQTL 9.95e-01 0.000588 0.0891 0.254 CD4_Naive L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -745141 sc-eQTL 5.06e-01 0.0454 0.0681 0.254 CD4_Naive L2
ENSG00000243749 TMEM35B -698322 sc-eQTL 2.67e-01 0.0449 0.0404 0.254 CD4_Naive L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -642619 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0232 0.0821 0.254 CD4_TCM L2
ENSG00000116560 SFPQ -906114 sc-eQTL 6.62e-01 -0.017 0.0389 0.254 CD4_TCM L2
ENSG00000134686 PHC2 855979 sc-eQTL 5.99e-01 0.04 0.0759 0.254 CD4_TCM L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -981678 sc-eQTL 4.41e-01 0.0566 0.0732 0.254 CD4_TCM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -572724 sc-eQTL 4.73e-01 0.0618 0.086 0.254 CD4_TCM L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -744914 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0252 0.0964 0.254 CD4_TCM L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -745141 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0557 0.0777 0.254 CD4_TCM L2
ENSG00000243749 TMEM35B -698322 sc-eQTL 3.03e-01 0.0455 0.0441 0.254 CD4_TCM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -642619 sc-eQTL 1.26e-01 -0.155 0.101 0.254 CD4_TEM L2
ENSG00000116560 SFPQ -906114 sc-eQTL 6.31e-01 0.022 0.0457 0.254 CD4_TEM L2
ENSG00000134686 PHC2 855979 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0511 0.0903 0.254 CD4_TEM L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -981678 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0908 0.0934 0.254 CD4_TEM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -572724 sc-eQTL 2.32e-01 -0.114 0.0948 0.254 CD4_TEM L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -744914 sc-eQTL 1.37e-01 -0.145 0.0973 0.254 CD4_TEM L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -745141 sc-eQTL 2.85e-01 0.102 0.0952 0.254 CD4_TEM L2
ENSG00000243749 TMEM35B -698322 sc-eQTL 8.05e-01 0.015 0.0608 0.254 CD4_TEM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -642619 sc-eQTL 9.66e-01 0.00424 0.1 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000116560 SFPQ -906114 sc-eQTL 7.41e-01 0.0177 0.0534 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000134686 PHC2 855979 sc-eQTL 8.07e-01 0.0202 0.0826 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -981678 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0813 0.0809 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000163866 SMIM12 -572724 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0702 0.0965 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -744914 sc-eQTL 9.56e-01 0.00563 0.103 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -745141 sc-eQTL 8.87e-01 0.0127 0.0891 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000243749 TMEM35B -698322 sc-eQTL 9.41e-01 0.00448 0.0608 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -642619 sc-eQTL 1.15e-01 0.159 0.101 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000116560 SFPQ -906114 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0305 0.04 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000134686 PHC2 855979 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0545 0.0834 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -981678 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0457 0.0732 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000163866 SMIM12 -572724 sc-eQTL 1.53e-01 0.12 0.0837 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -744914 sc-eQTL 3.29e-02 0.209 0.0974 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -745141 sc-eQTL 8.48e-02 0.16 0.0922 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000243749 TMEM35B -698322 sc-eQTL 6.13e-01 0.0275 0.0543 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -642619 sc-eQTL 2.64e-02 0.237 0.106 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000116560 SFPQ -906114 sc-eQTL 5.19e-01 0.0394 0.0609 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000134686 PHC2 855979 sc-eQTL 1.18e-01 0.137 0.0875 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -981678 sc-eQTL 1.21e-01 0.163 0.105 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -572724 sc-eQTL 1.96e-01 0.135 0.104 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -744914 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0407 0.114 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -745141 sc-eQTL 3.18e-01 -0.105 0.105 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000243749 TMEM35B -698322 sc-eQTL 2.62e-01 0.0946 0.084 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -642619 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00109 0.0972 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000116560 SFPQ -906114 sc-eQTL 6.10e-02 -0.115 0.0612 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000134686 PHC2 855979 sc-eQTL 2.41e-01 0.121 0.103 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -981678 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0862 0.109 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -572724 sc-eQTL 1.13e-01 0.171 0.107 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -744914 sc-eQTL 1.47e-01 0.156 0.107 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -745141 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0156 0.1 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000243749 TMEM35B -698322 sc-eQTL 6.39e-01 0.0361 0.0769 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -642619 sc-eQTL 3.89e-03 -0.289 0.099 0.251 MAIT L2
ENSG00000116560 SFPQ -906114 sc-eQTL 9.52e-01 -0.0032 0.0533 0.251 MAIT L2
ENSG00000134686 PHC2 855979 sc-eQTL 5.70e-01 0.0506 0.0888 0.251 MAIT L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -981678 sc-eQTL 3.29e-01 -0.093 0.0952 0.251 MAIT L2
ENSG00000163866 SMIM12 -572724 sc-eQTL 8.14e-01 0.024 0.102 0.251 MAIT L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -744914 sc-eQTL 3.60e-02 0.221 0.105 0.251 MAIT L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -745141 sc-eQTL 6.74e-01 0.0425 0.101 0.251 MAIT L2
ENSG00000243749 TMEM35B -698322 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0809 0.0775 0.251 MAIT L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -642619 sc-eQTL 1.92e-01 -0.133 0.101 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000116560 SFPQ -906114 sc-eQTL 2.36e-01 0.079 0.0664 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000134686 PHC2 855979 sc-eQTL 1.20e-01 -0.147 0.094 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -981678 sc-eQTL 9.62e-01 0.00451 0.094 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000163866 SMIM12 -572724 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0266 0.112 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -744914 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00864 0.112 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -745141 sc-eQTL 8.60e-01 0.0176 0.0995 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000243749 TMEM35B -698322 sc-eQTL 7.61e-01 0.0264 0.0866 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -642619 sc-eQTL 1.75e-01 0.132 0.0974 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000116560 SFPQ -906114 sc-eQTL 7.64e-01 0.0161 0.0534 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000134686 PHC2 855979 sc-eQTL 2.70e-02 0.186 0.0834 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -981678 sc-eQTL 1.83e-01 -0.0937 0.0702 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000163866 SMIM12 -572724 sc-eQTL 4.76e-01 -0.067 0.094 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -744914 sc-eQTL 2.95e-01 0.105 0.0997 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -745141 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0627 0.0944 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000243749 TMEM35B -698322 sc-eQTL 5.23e-01 -0.035 0.0546 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -642619 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0551 0.0957 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000116560 SFPQ -906114 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0398 0.0706 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000134686 PHC2 855979 sc-eQTL 2.60e-02 0.201 0.0897 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -981678 sc-eQTL 6.36e-02 0.18 0.0963 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000163866 SMIM12 -572724 sc-eQTL 2.86e-01 0.109 0.102 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -744914 sc-eQTL 6.26e-01 0.0519 0.106 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -745141 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0962 0.1 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000243749 TMEM35B -698322 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0872 0.0836 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -642619 sc-eQTL 4.12e-02 0.205 0.1 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000116560 SFPQ -906114 sc-eQTL 9.34e-01 0.0049 0.0592 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000134686 PHC2 855979 sc-eQTL 8.64e-01 0.0147 0.086 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -981678 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0197 0.0756 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000163866 SMIM12 -572724 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0727 0.0913 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -744914 sc-eQTL 8.44e-01 0.0206 0.105 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -745141 sc-eQTL 9.00e-01 0.0122 0.0962 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000243749 TMEM35B -698322 sc-eQTL 8.94e-01 -0.00729 0.0546 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -642619 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0176 0.123 0.278 PB L2
ENSG00000116560 SFPQ -906114 sc-eQTL 8.86e-01 0.0102 0.0708 0.278 PB L2
ENSG00000134686 PHC2 855979 sc-eQTL 7.88e-01 0.0321 0.119 0.278 PB L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -981678 sc-eQTL 7.51e-01 -0.042 0.132 0.278 PB L2
ENSG00000163866 SMIM12 -572724 sc-eQTL 1.70e-01 0.154 0.111 0.278 PB L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -744914 sc-eQTL 8.86e-01 0.0191 0.133 0.278 PB L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -745141 sc-eQTL 8.99e-01 0.0147 0.115 0.278 PB L2
ENSG00000243749 TMEM35B -698322 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0177 0.111 0.278 PB L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -642619 sc-eQTL 5.96e-01 -0.048 0.0903 0.254 Pro_T L2
ENSG00000116560 SFPQ -906114 sc-eQTL 2.93e-01 0.0723 0.0685 0.254 Pro_T L2
ENSG00000134686 PHC2 855979 sc-eQTL 8.52e-01 -0.015 0.0802 0.254 Pro_T L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -981678 sc-eQTL 2.03e-01 -0.13 0.102 0.254 Pro_T L2
ENSG00000163866 SMIM12 -572724 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0233 0.0984 0.254 Pro_T L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -744914 sc-eQTL 1.34e-01 -0.16 0.106 0.254 Pro_T L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -745141 sc-eQTL 9.90e-01 0.00116 0.0891 0.254 Pro_T L2
ENSG00000243749 TMEM35B -698322 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0497 0.0802 0.254 Pro_T L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -642619 sc-eQTL 9.46e-01 0.00703 0.103 0.254 Treg L2
ENSG00000116560 SFPQ -906114 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0359 0.05 0.254 Treg L2
ENSG00000134686 PHC2 855979 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0435 0.0911 0.254 Treg L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -981678 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0164 0.0909 0.254 Treg L2
ENSG00000163866 SMIM12 -572724 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0203 0.0996 0.254 Treg L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -744914 sc-eQTL 1.64e-02 0.257 0.106 0.254 Treg L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -745141 sc-eQTL 3.70e-01 0.0823 0.0916 0.254 Treg L2
ENSG00000243749 TMEM35B -698322 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0741 0.0724 0.254 Treg L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -642619 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00664 0.107 0.256 cDC L2
ENSG00000116560 SFPQ -906114 sc-eQTL 1.09e-01 -0.108 0.0672 0.256 cDC L2
ENSG00000134686 PHC2 855979 sc-eQTL 5.25e-02 0.143 0.0732 0.256 cDC L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -981678 sc-eQTL 1.44e-01 -0.135 0.0922 0.256 cDC L2
ENSG00000163866 SMIM12 -572724 sc-eQTL 2.08e-01 -0.128 0.101 0.256 cDC L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -744914 sc-eQTL 3.85e-01 0.0923 0.106 0.256 cDC L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -745141 sc-eQTL 1.01e-01 -0.164 0.0997 0.256 cDC L2
ENSG00000243749 TMEM35B -698322 sc-eQTL 5.23e-01 0.0635 0.0992 0.256 cDC L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -642619 sc-eQTL 7.11e-01 0.0367 0.0991 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000116560 SFPQ -906114 sc-eQTL 3.96e-01 0.0431 0.0506 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000134686 PHC2 855979 sc-eQTL 3.74e-01 0.0445 0.05 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -981678 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0265 0.0662 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000163866 SMIM12 -572724 sc-eQTL 8.05e-02 -0.134 0.0761 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -744914 sc-eQTL 3.19e-02 0.166 0.077 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -745141 sc-eQTL 2.15e-01 0.112 0.0899 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000243749 TMEM35B -698322 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00316 0.0743 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -642619 sc-eQTL 5.04e-01 0.0671 0.1 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000116560 SFPQ -906114 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0612 0.0561 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000134686 PHC2 855979 sc-eQTL 1.49e-01 0.0766 0.0529 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -981678 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0346 0.0754 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000163866 SMIM12 -572724 sc-eQTL 4.15e-01 0.0721 0.0882 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -744914 sc-eQTL 6.19e-01 0.0463 0.0931 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -745141 sc-eQTL 2.90e-01 0.0962 0.0907 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000243749 TMEM35B -698322 sc-eQTL 4.92e-01 0.055 0.08 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -642619 sc-eQTL 3.63e-01 0.115 0.126 0.258 gdT L2
ENSG00000116560 SFPQ -906114 sc-eQTL 7.12e-02 0.149 0.0822 0.258 gdT L2
ENSG00000134686 PHC2 855979 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0109 0.111 0.258 gdT L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -981678 sc-eQTL 5.63e-01 0.0703 0.121 0.258 gdT L2
ENSG00000163866 SMIM12 -572724 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0579 0.132 0.258 gdT L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -744914 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00977 0.136 0.258 gdT L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -745141 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0437 0.122 0.258 gdT L2
ENSG00000243749 TMEM35B -698322 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0931 0.0963 0.258 gdT L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -642619 sc-eQTL 3.73e-01 0.0886 0.0992 0.256 intMono L2
ENSG00000116560 SFPQ -906114 sc-eQTL 2.46e-01 0.0884 0.0759 0.256 intMono L2
ENSG00000134686 PHC2 855979 sc-eQTL 5.93e-02 -0.112 0.0589 0.256 intMono L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -981678 sc-eQTL 2.41e-01 -0.113 0.0965 0.256 intMono L2
ENSG00000163866 SMIM12 -572724 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0651 0.102 0.256 intMono L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -744914 sc-eQTL 6.70e-01 0.0447 0.105 0.256 intMono L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -745141 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0638 0.0922 0.256 intMono L2
ENSG00000243749 TMEM35B -698322 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0252 0.0899 0.256 intMono L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -642619 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0848 0.0865 0.253 ncMono L2
ENSG00000116560 SFPQ -906114 sc-eQTL 2.10e-01 -0.0989 0.0787 0.253 ncMono L2
ENSG00000134686 PHC2 855979 sc-eQTL 9.75e-02 0.113 0.0677 0.253 ncMono L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -981678 sc-eQTL 9.79e-01 0.00225 0.0845 0.253 ncMono L2
ENSG00000163866 SMIM12 -572724 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0594 0.0945 0.253 ncMono L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -744914 sc-eQTL 6.98e-01 0.0381 0.0978 0.253 ncMono L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -745141 sc-eQTL 6.75e-01 0.039 0.0928 0.253 ncMono L2
ENSG00000243749 TMEM35B -698322 sc-eQTL 7.63e-01 0.0273 0.0902 0.253 ncMono L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -642619 sc-eQTL 5.41e-01 0.071 0.116 0.243 pDC L2
ENSG00000116560 SFPQ -906114 sc-eQTL 1.63e-01 0.106 0.0758 0.243 pDC L2
ENSG00000134686 PHC2 855979 sc-eQTL 7.52e-01 0.0303 0.0958 0.243 pDC L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -981678 sc-eQTL 7.68e-01 0.0343 0.116 0.243 pDC L2
ENSG00000163866 SMIM12 -572724 sc-eQTL 6.29e-01 0.0586 0.121 0.243 pDC L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -744914 sc-eQTL 8.72e-01 0.0174 0.108 0.243 pDC L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -745141 sc-eQTL 2.32e-01 0.133 0.111 0.243 pDC L2
ENSG00000243749 TMEM35B -698322 sc-eQTL 1.27e-01 -0.151 0.0983 0.243 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116544 DLGAP3 -642619 sc-eQTL 8.36e-01 0.0204 0.0984 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116560 SFPQ -906114 sc-eQTL 5.64e-01 -0.026 0.0451 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 855979 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0592 0.0823 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146463 ZMYM4 -981678 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0417 0.077 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -572724 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0525 0.096 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000163867 ZMYM6 -744914 sc-eQTL 1.37e-01 0.138 0.0923 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197056 ZMYM1 -745141 sc-eQTL 1.69e-01 -0.136 0.0987 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243749 TMEM35B -698322 sc-eQTL 3.14e-01 0.0629 0.0623 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -642619 sc-eQTL 8.91e-01 0.0139 0.101 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116560 SFPQ -906114 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0323 0.043 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 855979 sc-eQTL 6.89e-01 0.0327 0.0815 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146463 ZMYM4 -981678 sc-eQTL 5.95e-01 -0.039 0.0734 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -572724 sc-eQTL 8.81e-01 -0.014 0.0939 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000163867 ZMYM6 -744914 sc-eQTL 5.88e-01 0.0537 0.099 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197056 ZMYM1 -745141 sc-eQTL 3.18e-01 0.0937 0.0937 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243749 TMEM35B -698322 sc-eQTL 3.65e-01 0.053 0.0584 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -642619 sc-eQTL 5.20e-01 0.063 0.0978 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116560 SFPQ -906114 sc-eQTL 9.45e-01 0.0032 0.0464 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 855979 sc-eQTL 1.64e-01 0.0683 0.0489 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146463 ZMYM4 -981678 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0275 0.0607 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -572724 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0586 0.0707 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000163867 ZMYM6 -744914 sc-eQTL 1.16e-01 0.115 0.073 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197056 ZMYM1 -745141 sc-eQTL 1.39e-01 0.122 0.0821 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243749 TMEM35B -698322 sc-eQTL 8.28e-01 0.015 0.0689 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -642619 sc-eQTL 6.97e-01 0.031 0.0795 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116560 SFPQ -906114 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0106 0.0643 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 855979 sc-eQTL 7.26e-01 0.0203 0.0577 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146463 ZMYM4 -981678 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0686 0.0803 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -572724 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0234 0.0872 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000163867 ZMYM6 -744914 sc-eQTL 8.80e-01 0.0143 0.0944 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197056 ZMYM1 -745141 sc-eQTL 8.11e-01 -0.021 0.0877 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243749 TMEM35B -698322 sc-eQTL 6.59e-01 0.0358 0.081 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -642619 sc-eQTL 2.80e-02 0.217 0.098 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116560 SFPQ -906114 sc-eQTL 6.19e-01 -0.024 0.0483 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 855979 sc-eQTL 2.38e-02 0.174 0.0762 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146463 ZMYM4 -981678 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0436 0.0625 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -572724 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0877 0.0874 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000163867 ZMYM6 -744914 sc-eQTL 2.77e-01 0.103 0.0949 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197056 ZMYM1 -745141 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0975 0.0897 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243749 TMEM35B -698322 sc-eQTL 1.92e-01 -0.0594 0.0454 0.254 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000222112 \N 950167 2.76e-07 1.27e-07 5.35e-08 1.82e-07 9.87e-08 9.05e-08 1.6e-07 5.66e-08 1.47e-07 6.08e-08 1.52e-07 1.08e-07 1.59e-07 7.37e-08 6.25e-08 7.23e-08 4.24e-08 1.44e-07 6.32e-08 4.78e-08 1.26e-07 1.26e-07 1.44e-07 2.91e-08 1.55e-07 1.22e-07 1.13e-07 9.92e-08 1.23e-07 1e-07 1.02e-07 2.96e-08 4.02e-08 8.72e-08 4.92e-08 3.14e-08 5.45e-08 8.76e-08 6.71e-08 4.19e-08 5.34e-08 1.4e-07 5.27e-08 1.23e-08 3.84e-08 1.92e-08 1.15e-07 1.9e-09 4.99e-08